View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1580_low_8 (Length: 491)

Name: NF1580_low_8
Description: NF1580
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1580_low_8
NF1580_low_8
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (84-474)||(67009-67401)
chr2 (82-474)||(27261002-27261396)
chr2 (82-353)||(12727503-12727775)
chr2 (82-363)||(34823533-34823814)
chr2 (82-363)||(16900598-16900879)
chr2 (82-363)||(16993989-16994270)
chr2 (82-363)||(19887320-19887600)
chr2 (95-363)||(21141210-21141478)
chr2 (82-267)||(24686643-24686828)
chr2 (95-264)||(5889313-5889483)
chr2 (82-264)||(11232258-11232440)
chr2 (82-264)||(22514105-22514287)
chr2 (82-264)||(28776707-28776888)
chr2 (82-225)||(22273943-22274086)
chr2 (82-225)||(22283176-22283319)
chr2 (8-86)||(29899568-29899646)
chr2 (20-86)||(40614273-40614339)
chr2 (85-267)||(23773532-23773717)
chr2 (23-86)||(21831507-21831570)
chr2 (37-86)||(31508991-31509040)
chr2 (115-163)||(15855450-15855498)
chr2 (82-158)||(21154793-21154869)
chr2 (82-146)||(22105778-22105842)
chr2 (82-146)||(32214716-32214780)
chr2 (15-72)||(34457416-34457473)
chr2 (82-159)||(45027690-45027767)
chr2 (82-146)||(20261532-20261596)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (82-474)||(580-974)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (82-474)||(8237-8630)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (82-474)||(1168837-1169231)
chr5 (82-472)||(27183214-27183606)
chr5 (84-474)||(23506173-23506565)
chr5 (82-363)||(11687-11967)
chr5 (82-363)||(10778837-10779119)
chr5 (82-353)||(25425970-25426241)
chr5 (82-353)||(35791770-35792040)
chr5 (82-363)||(11341973-11342254)
chr5 (84-353)||(18778653-18778921)
chr5 (82-363)||(21074254-21074534)
chr5 (82-345)||(22367140-22367403)
chr5 (82-328)||(11212739-11212985)
chr5 (82-363)||(22883949-22884230)
chr5 (82-322)||(43444054-43444295)
chr5 (82-321)||(1220389-1220629)
chr5 (82-306)||(19499268-19499492)
chr5 (82-263)||(36990684-36990865)
chr5 (82-264)||(35581223-35581404)
chr5 (82-264)||(21933288-21933469)
chr5 (82-264)||(21939458-21939639)
chr5 (82-225)||(23511048-23511191)
chr5 (82-225)||(32950134-32950277)
chr5 (82-267)||(7424755-7424941)
chr5 (8-82)||(19870923-19870997)
chr5 (85-267)||(23327952-23328136)
chr5 (8-86)||(9041934-9042012)
chr5 (109-267)||(24595499-24595660)
chr5 (283-353)||(29191481-29191551)
chr5 (37-86)||(10826595-10826644)
chr5 (37-86)||(23062680-23062729)
chr5 (37-86)||(42449549-42449598)
chr5 (82-146)||(39363697-39363761)
chr5 (82-146)||(296060-296124)
chr5 (82-146)||(2154417-2154481)
chr5 (85-153)||(24615680-24615748)
chr5 (85-153)||(24712078-24712146)
chr5 (85-153)||(24745074-24745142)
chr5 (82-146)||(29346292-29346356)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (82-474)||(118611-119005)
scaffold0035 (82-228)||(110110-110256)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (82-474)||(43281731-43282125)
chr4 (86-474)||(16731346-16731736)
chr4 (82-421)||(14950995-14951334)
chr4 (84-353)||(18293703-18293972)
chr4 (82-353)||(17146325-17146596)
chr4 (82-363)||(55377231-55377512)
chr4 (94-353)||(19698030-19698289)
chr4 (94-353)||(19708615-19708874)
chr4 (82-353)||(22355105-22355376)
chr4 (82-363)||(5683401-5683681)
chr4 (82-363)||(18247524-18247803)
chr4 (83-336)||(8373851-8374103)
chr4 (82-363)||(14995427-14995708)
chr4 (82-322)||(47357006-47357247)
chr4 (82-306)||(10643586-10643810)
chr4 (82-345)||(19019811-19020073)
chr4 (82-229)||(18168210-18168357)
chr4 (82-225)||(25120080-25120223)
chr4 (82-267)||(15287904-15288091)
chr4 (82-267)||(15295014-15295201)
chr4 (85-279)||(22737655-22737850)
chr4 (8-86)||(39390433-39390511)
chr4 (85-267)||(26338417-26338602)
chr4 (273-363)||(18250785-18250874)
chr4 (276-353)||(18168137-18168214)
chr4 (7-78)||(55740995-55741066)
chr4 (37-86)||(54603734-54603783)
chr4 (82-158)||(14970492-14970568)
chr4 (82-146)||(19857891-19857955)
chr4 (37-86)||(12027884-12027933)
chr4 (82-159)||(49547559-49547636)
chr4 (82-146)||(3515320-3515384)
chr4 (120-160)||(9610862-9610902)
chr4 (82-146)||(15534494-15534558)
chr4 (82-146)||(52872858-52872922)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (82-474)||(45118-45512)
scaffold0034 (82-474)||(39635-40029)
scaffold0034 (82-353)||(78796-79067)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (95-474)||(23152706-23153086)
chr6 (82-440)||(35016049-35016409)
chr6 (82-474)||(22593627-22594022)
chr6 (82-363)||(16826413-16826694)
chr6 (82-353)||(1555320-1555591)
chr6 (82-363)||(25174896-25175176)
chr6 (82-353)||(27654642-27654913)
chr6 (82-319)||(16240122-16240360)
chr6 (82-363)||(25904258-25904539)
chr6 (85-353)||(19628676-19628944)
chr6 (82-306)||(21776141-21776365)
chr6 (82-363)||(33315121-33315402)
chr6 (82-267)||(16633546-16633731)
chr6 (82-267)||(16650220-16650405)
chr6 (82-267)||(16556990-16557175)
chr6 (82-267)||(22226614-22226800)
chr6 (82-264)||(10487853-10488035)
chr6 (82-225)||(19984164-19984306)
chr6 (82-264)||(16377293-16377474)
chr6 (82-264)||(16384617-16384798)
chr6 (82-267)||(19609457-19609644)
chr6 (109-267)||(29870474-29870634)
chr6 (8-86)||(5614277-5614355)
chr6 (8-86)||(1259600-1259678)
chr6 (8-74)||(19273255-19273321)
chr6 (82-225)||(29665295-29665438)
chr6 (283-353)||(14627347-14627417)
chr6 (82-152)||(34963680-34963750)
chr6 (82-158)||(22782527-22782603)
chr6 (82-146)||(25535720-25535784)
chr6 (82-146)||(26924426-26924490)
chr6 (82-146)||(30676495-30676559)
chr6 (82-146)||(17377633-17377697)
chr6 (82-146)||(19005464-19005528)
chr6 (119-163)||(23225154-23225198)
chr6 (82-146)||(28289122-28289186)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (82-474)||(12526-12919)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (82-474)||(396-789)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (82-474)||(11286647-11287040)
chr7 (82-353)||(10001030-10001301)
chr7 (82-353)||(15760784-15761055)
chr7 (83-363)||(32495097-32495376)
chr7 (82-363)||(15951639-15951919)
chr7 (95-363)||(16417802-16418070)
chr7 (222-475)||(17985310-17985565)
chr7 (83-282)||(15851840-15852039)
chr7 (82-264)||(27102557-27102739)
chr7 (82-264)||(27109905-27110087)
chr7 (82-264)||(27175587-27175769)
chr7 (82-264)||(38784649-38784831)
chr7 (82-264)||(7821895-7822077)
chr7 (82-264)||(7829206-7829388)
chr7 (82-225)||(125886-126029)
chr7 (83-228)||(1937833-1937978)
chr7 (8-86)||(41958173-41958251)
chr7 (8-78)||(46529032-46529102)
chr7 (15-74)||(3938921-3938980)
chr7 (8-86)||(13953002-13953080)
chr7 (37-86)||(31592835-31592884)
chr7 (84-146)||(8469048-8469110)
chr7 (37-86)||(17733605-17733654)
chr7 (82-146)||(15081627-15081691)
chr7 (82-145)||(14156671-14156734)
chr7 (8-71)||(28510321-28510384)
chr7 (190-264)||(10501286-10501360)
chr7 (190-264)||(14156967-14157041)
chr7 (100-150)||(16108492-16108542)
chr7 (8-86)||(45414717-45414795)
chr7 (8-57)||(1804622-1804671)
chr7 (82-146)||(8940592-8940656)
chr7 (82-142)||(16214001-16214061)
chr7 (82-146)||(24702541-24702605)
chr7 (82-146)||(24704988-24705052)
chr7 (82-146)||(29796923-29796987)
chr7 (82-146)||(29800742-29800806)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (82-474)||(51158689-51159086)
chr3 (82-422)||(14528670-14529010)
chr3 (82-363)||(17956874-17957155)
chr3 (82-363)||(54039172-54039452)
chr3 (82-363)||(49231551-49231832)
chr3 (82-337)||(16820271-16820526)
chr3 (85-322)||(27840282-27840520)
chr3 (82-363)||(25058081-25058362)
chr3 (115-363)||(12808288-12808536)
chr3 (82-352)||(28557171-28557434)
chr3 (82-267)||(30152330-30152514)
chr3 (95-264)||(44228398-44228567)
chr3 (83-475)||(17392901-17393284)
chr3 (82-264)||(8276519-8276701)
chr3 (82-264)||(8269408-8269590)
chr3 (82-264)||(1468659-1468841)
chr3 (85-267)||(12265468-12265649)
chr3 (82-267)||(16934856-16935040)
chr3 (85-267)||(18897675-18897856)
chr3 (142-267)||(5227711-5227836)
chr3 (8-86)||(55147019-55147097)
chr3 (8-86)||(30716333-30716411)
chr3 (374-472)||(24892312-24892412)
chr3 (428-474)||(14521966-14522012)
chr3 (37-86)||(18895636-18895685)
chr3 (8-78)||(183357-183427)
chr3 (23-73)||(48161960-48162010)
chr3 (8-57)||(18946092-18946141)
chr3 (82-146)||(6468920-6468984)
chr3 (82-146)||(7781132-7781196)
chr3 (82-146)||(10247509-10247573)
chr3 (82-146)||(12567872-12567936)
chr3 (82-146)||(15977845-15977909)
chr3 (82-146)||(20629977-20630041)
chr3 (82-146)||(27165565-27165629)
chr3 (82-146)||(29544627-29544691)
chr3 (82-146)||(46822574-46822638)
chr3 (82-146)||(54521135-54521199)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (84-466)||(40935-41319)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (82-474)||(22366198-22366591)
chr1 (84-353)||(15862088-15862358)
chr1 (139-363)||(22249665-22249889)
chr1 (85-353)||(20253651-20253919)
chr1 (82-264)||(18060620-18060802)
chr1 (95-264)||(7641618-7641788)
chr1 (82-228)||(21858510-21858656)
chr1 (82-264)||(17003791-17003973)
chr1 (82-235)||(44035864-44036018)
chr1 (82-267)||(21650915-21651102)
chr1 (84-267)||(22029692-22029877)
chr1 (85-267)||(22034843-22035028)
chr1 (37-86)||(42464873-42464922)
chr1 (15-86)||(15292326-15292397)
chr1 (37-83)||(18239941-18239987)
chr1 (37-86)||(42058172-42058221)
chr1 (115-159)||(38056031-38056075)
chr1 (41-78)||(31385815-31385852)
chr1 (82-146)||(27161372-27161436)
chr1 (82-150)||(29535360-29535428)
chr1 (37-86)||(46200712-46200761)
chr1 (82-150)||(13227172-13227240)
chr1 (82-146)||(21841079-21841143)
chr1 (82-146)||(31612871-31612935)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (84-474)||(24717758-24718134)
chr8 (82-363)||(13663134-13663414)
chr8 (94-353)||(18611745-18612004)
chr8 (84-363)||(39114199-39114477)
chr8 (82-363)||(18618614-18618894)
chr8 (94-353)||(22146770-22147029)
chr8 (82-363)||(22007131-22007413)
chr8 (82-353)||(17150661-17150931)
chr8 (82-322)||(223350-223591)
chr8 (82-322)||(736973-737214)
chr8 (82-322)||(860868-861109)
chr8 (115-322)||(699796-700004)
chr8 (82-267)||(15320034-15320219)
chr8 (82-267)||(15500403-15500588)
chr8 (82-268)||(688121-688307)
chr8 (82-267)||(22089418-22089603)
chr8 (82-264)||(272209-272391)
chr8 (82-264)||(643458-643640)
chr8 (82-264)||(829264-829446)
chr8 (222-451)||(3844641-3844864)
chr8 (82-225)||(29759350-29759493)
chr8 (26-86)||(8319142-8319202)
chr8 (37-86)||(20495069-20495118)
chr8 (8-74)||(23718255-23718321)
chr8 (82-146)||(14397526-14397590)
chr8 (82-146)||(24048923-24048987)
chr8 (40-84)||(44118955-44118999)
chr8 (37-70)||(42100301-42100334)
chr8 (82-146)||(15202771-15202835)
chr8 (82-146)||(15202964-15203028)
chr8 (82-146)||(19896827-19896891)
chr8 (8-72)||(21551296-21551360)
chr8 (8-72)||(21552342-21552406)
chr8 (82-146)||(22002065-22002129)
chr8 (82-146)||(32122041-32122105)
chr8 (82-146)||(45290427-45290491)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (84-363)||(15562-15840)
scaffold0269 (228-363)||(1306-1440)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (94-353)||(1752-2011)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (84-358)||(28257-28531)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (82-340)||(19945-20203)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (82-363)||(1301-1581)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (82-363)||(652-932)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (82-363)||(17989-18269)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (95-363)||(6514-6782)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (82-322)||(1199-1439)
[»] scaffold1849 (1 HSPs)
scaffold1849 (261-474)||(710-926)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (86-353)||(8132-8400)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (85-363)||(2272-2551)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (82-279)||(6241-6438)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (82-363)||(154897-155177)
scaffold0023 (82-146)||(17225-17289)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (82-267)||(30349-30534)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (82-256)||(37750-37923)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (84-401)||(113073-113391)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (82-264)||(38257-38439)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (82-235)||(32152-32305)
scaffold0184 (37-86)||(28183-28232)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (82-235)||(40539-40692)
scaffold0078 (37-86)||(44612-44661)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (115-281)||(34802-34970)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (83-229)||(53862-54009)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (85-267)||(11015-11196)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (116-225)||(167168-167276)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (109-267)||(5993-6153)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (280-448)||(534-706)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (8-86)||(685-763)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (82-153)||(6975-7046)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (82-146)||(501378-501442)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (8-74)||(86463-86528)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (82-159)||(889-966)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (37-78)||(1599-1640)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (82-146)||(520-584)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (82-158)||(4088-4164)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (82-146)||(23316-23380)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (82-159)||(6751-6828)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (8-73)||(140467-140532)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (82-146)||(1741-1805)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (82-146)||(309-373)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (82-146)||(3336-3400)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (82-146)||(21060-21124)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (82-146)||(38441-38505)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (82-150)||(68270-68338)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 67401 - 67009
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67401 tttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatca 67302  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67301 taac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 67203  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67202 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggtttttaactaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataa 67103  T
Q  383 gctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67102 gctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 67009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27261396 - 27261002
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27261396 gctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 27261297  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27261296 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaattaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 27261198  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27261197 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgagttttgagctaaaatgtccttttaagtgatcacgtgaaat 27261098  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261097 aagctatgttttggaaattgaacttgagatgttatagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatattttttctggaacatattttac 27261002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12727775 - 12727503
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga--tttttgtgaaaactta 179  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  12727775 gctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgcggattttttgtgaaaactta 12727676  T
Q  180 tcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgg 279  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727675 tcataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgg 12727577  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12727576 gaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggctgagttgaatcggtgaaaacgggtttttagctaaa 12727503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34823814 - 34823533
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34823814 gctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 34823715  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34823714 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 34823616  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  34823615 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtggagtagaatcggtgaaaacgagttttgagct-aaatgtcgtttt 34823533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16900879 - 16900598
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16900879 gctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtaaaaacttat 16900780  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16900779 cataac-tttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 16900681  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || |||| ||| ||||||| |||||    
T  16900680 aatttgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgggcggagttgactcggtgaaaatgggttttgagc-aaaatgttgtttt 16900598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16994270 - 16993989
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16994270 gctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtaaaaacttat 16994171  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16994170 cataac-tttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 16994072  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || |||| ||| ||||||| |||||    
T  16994071 aatttgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgggcggagttgactcggtgaaaatgggttttgagc-aaaatgttgtttt 16993989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 19887320 - 19887600
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19887320 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 19887419  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19887420 cataac-tttctctatgagccatgaaatttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatctggg 19887518  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  19887519 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 19887600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21141478 - 21141210
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttc 193  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21141478 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaaatactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaatttatcgtaac-tttttc 21141380  T
Q  194 tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgt 293  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21141379 tatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgagaatgtgaatgtgt 21141280  T
Q  294 tgatggtttgagaaatatttt-gggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21141279 tgatggttcaagaaatattttggggcggagttgcatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 21141210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 24686643 - 24686828
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24686643 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 24686742  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24686743 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgagatacttagagtgaataattgagtatgcat 24686828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Original strand, 5889313 - 5889483
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttg-tgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5889313 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttggtgaaaacttatcataac-ttttt 5889411  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5889412 ctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatg 5889483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 11232258 - 11232440
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11232258 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 11232357  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11232358 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 11232440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 22514105 - 22514287
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22514105 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 22514204  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22514205 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 22514287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 28776707 - 28776888
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28776707 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 28776806  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28776807 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttagagggaataattgagtatg 28776888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22274086 - 22273943
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  22274086 gctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattactaaacatgggtcatatggatttttgagaaaacttat 22273987  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22273986 cataa-catttcctttgagcagtgaaacttttccaaacttgatat 22273943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22283319 - 22283176
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  22283319 gctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattactaaacatgggtcatatggatttttgagaaaacttat 22283220  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22283219 cataa-cttttcctttgagctgtgaaacttttccaaacttgatat 22283176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 29899568 - 29899646
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29899568 aaataacactaattgtgctcctaatttagaatgcgcataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttacttt 29899646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40614339 - 40614273
Alignment:
Q  20 ttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40614339 ttgtgctcctaatttagaatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatattgcttt 40614273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23773717 - 23773532
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatt-tttgtgaaaacttatca 182  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  23773717 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatca 23773618  T
Q  183 taacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||   |||||  | | | |||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23773617 taaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 23773532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Original strand, 21831507 - 21831570
Alignment:
Q  23 tgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21831507 tgctactaatttagaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagataatcttgcttt 21831570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31509040 - 31508991
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31509040 aatgcacataaggtgtttgatgaaattcctaagtgagaaaatcttgcttt 31508991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15855498 - 15855450
Alignment:
Q  115 atttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15855498 atttttagaacttgagttatggtcaaattactacacatcggtcatgtga 15855450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Original strand, 21154793 - 21154869
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtca 158  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  21154793 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtca 21154869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22105842 - 22105778
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22105842 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 22105778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 32214716 - 32214780
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32214716 gctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 32214780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Original strand, 34457416 - 34457473
Alignment:
Q  15 actagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtga 72  Q
    |||| |||||||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34457416 actaattgtgctagtattttaaaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtga 34457473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 45027690 - 45027767
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat 159  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||    
T  45027690 gctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcat 45027767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20261596 - 20261532
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20261596 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 20261532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 580
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  974 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaattattacacatgggtcatgtgcatttttgtgaaaacttat 875  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  874 cataac-ttcttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattggttttaatgaagtacttcgagtgaataattcagtatgcatttatgtatttggg 776  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  775 aatgtgaatgtgttgatagtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggtttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 676  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  675 aagctatgttttagcgattttacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8630 - 8237
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8630 gctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 8531  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8530 cataac-tttttctatgagccgtggaacttt-ccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 8433  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8432 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgagttttgagctaaaatgtcgttttaggtgatcacgtgaaat 8333  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8332 aagctatgttttggcaattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctattttgattcatatttttgctggaacatattttac 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 1168837 - 1169231
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1168837 gctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattactacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttat 1168936  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1168937 cataac-tttttctatgagctgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 1169035  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169036 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggtttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 1169135  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169136 aagctatgttttagtgatcgaaattgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 1169231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 82 - 472
Target Start/End: Original strand, 27183214 - 27183606
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27183214 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 27183313  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27183314 cataac-tttttctatgagttgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaattacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 27183412  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27183413 aatgtgaatgtgttgatggtttgagataaattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgttttaagtgattacgtgaaat 27183512  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatatttt 472  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27183513 aagctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgaagtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatatttt 27183606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 84 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23506565 - 23506173
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23506565 tttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattactacacgtgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatca 23506466  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23506465 taac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 23506367  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23506366 tgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagttaaaatgttgttttaagtgattacgtgaaataa 23506267  T
Q  383 gctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  23506266 gctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgaagtgttattttgctgttttgattcatattttttctagaacgtattttac 23506173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11967 - 11687
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11967 gctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 11868  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11867 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 11769  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11768 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 11687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 10778837 - 10779119
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10778837 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 10778936  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgta-tttgg 279  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10778937 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgg 10779035  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  10779036 gaatgtgaatgtgttgataatttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgagttttgagctaaaatgtcgtttt 10779119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25426241 - 25425970
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25426241 gctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 25426142  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25426141 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 25426043  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  25426042 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 25425970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 35791770 - 35792040
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35791770 gctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 35791869  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35791870 cataac-tttttctttgagccgtggatcttttccaaactt-atattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 35791967  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35791968 aatgtgaatgtgttgatggtttcgaaaatattttgggcggagtcgaatcggtgaaaacggattttgagctaaa 35792040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11342254 - 11341973
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11342254 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 11342155  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11342154 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 11342056  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  11342055 aatgtgaatgtgttgatgttttaagaaaatattttgggcggagtagaatcggtgaaaacgagttttgagct-aaatgtcgtttt 11341973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Original strand, 18778653 - 18778921
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18778653 tttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatca 18778752  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18778753 taac-tttttctttgagccgtagaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgta-ttgggaa 18778850  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18778851 ggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacggattttgagctaaa 18778921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 21074254 - 21074534
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21074254 gctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 21074353  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21074354 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgga 21074452  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21074453 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 21074534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Original strand, 22367140 - 22367403
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22367140 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 22367239  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22367240 cataac-ttttcctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattggatttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 22367338  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  22367339 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcagtgaaaacgggtttt 22367403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 328
Target Start/End: Original strand, 11212739 - 11212985
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11212739 gctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 11212838  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11212839 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaaggaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgag 11212937  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaat 328  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  11212938 gatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaat 11212985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 22883949 - 22884230
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22883949 gctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 22884048  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22884049 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttggg 22884147  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  22884148 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagttgagtagaatcggtgaaaacgagttttgagct-aaatgtcgtttt 22884230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Original strand, 43444054 - 43444295
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43444054 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 43444153  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43444154 cataac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgga 43444252  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  43444253 aatgtgaatttgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 43444295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 321
Target Start/End: Original strand, 1220389 - 1220629
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1220389 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 1220488  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1220489 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtactcagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 1220587  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtgga 321  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  1220588 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtgga 1220629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19499492 - 19499268
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19499492 gctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 19499393  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||    
T  19499392 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgcattgggg 19499294  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19499293 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 19499268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 263
Target Start/End: Original strand, 36990684 - 36990865
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36990684 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 36990783  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtat 263  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36990784 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtat 36990865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35581404 - 35581223
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35581404 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 35581305  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35581304 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttagagggaataattgagtatg 35581223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 21933288 - 21933469
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  21933288 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacaggggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 21933387  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  21933388 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttagaggaaataattgagtatg 21933469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 21939458 - 21939639
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  21939458 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacaggggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 21939557  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  21939558 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttagaggaaataattgagtatg 21939639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23511191 - 23511048
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23511191 gctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 23511092  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23511091 cataa-ctttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttaatat 23511048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32950277 - 32950134
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32950277 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattactaaatatggatcatgtggatttttgtgaaaacttat 32950178  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32950177 cataa-ctttttctttgagccgtgaaactttttcaaacttgatat 32950134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7424941 - 7424755
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7424941 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttat 7424842  T
Q  181 cataacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||   |||||  | | | ||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7424841 cataaatgttttctttataaaccgtgaaac-tttccaaacttggtaatggg-ttaatgaggtaattagagtgaataattgaatatgcat 7424755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 19870923 - 19870997
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttg 82  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870923 aaataacactagttgtgcccctattttagaatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttg 19870997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23328136 - 23327952
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23328136 ttctaatggctttggtttgatattcaaaggatttttagaacttgggttatgatcaaattaatacacatgagttatgtggatttttgtgaaaacttatcat 23328037  T
Q  184 aacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    ||   |||||  | | | |||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23328036 aaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 23327952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9042012 - 9041934
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  9042012 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgcacataaggtgtttgataaaatgcataagtgaggaaatcttgcttt 9041934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24595660 - 24595499
Alignment:
Q  109 caaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-att-tttgtgaaaacttatcataacctttttctctg--agccgtg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||   |||||| |   | |||||    
T  24595660 caaatgatttttagaacttgggttaggatctaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttgtcataaatattttctttataaaccgtg 24595561  T
Q  205 gaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
      ||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24595560 agacttttccaaacttagtaatgggtt-aatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 24595499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Original strand, 29191481 - 29191551
Alignment:
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| | || |||||||    
T  29191481 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggagaaaacgggtattgagctaaa 29191551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10826644 - 10826595
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10826644 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgataaaatcttgcttt 10826595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 23062680 - 23062729
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23062680 aatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatattgcttt 23062729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42449598 - 42449549
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42449598 aatgcacataaggtgtttgatggaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 42449549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39363761 - 39363697
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39363761 gctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 39363697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 296060 - 296124
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  296060 gctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattact 296124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 2154417 - 2154481
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2154417 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 2154481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24615748 - 24615680
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatg 153  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  24615748 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatg 24615680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24712146 - 24712078
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatg 153  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  24712146 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatg 24712078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24745142 - 24745074
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatg 153  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  24745142 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatg 24745074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29346356 - 29346292
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  29346356 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattact 29346292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 118611 - 119005
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  118611 gctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacttgggtcatgtggctttttgtgataacttat 118710  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  118711 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggcgtaattaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 118809  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  118810 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtcttaagtgatcacgtgaaat 118909  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118910 aagctatgttttggcaattgaacttgagatcttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 119005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 110110 - 110256
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  110110 gctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacttgggtcatgtggctttttgtgataacttat 110209  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 228  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110210 cataa-ctttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 110256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 43281731 - 43282125
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43281731 gctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 43281830  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43281831 cataaa-tttatctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattggatttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 43281929  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281930 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaataggtgaaaacgggttttaaactaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 43282029  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43282030 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttgaaaataatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 43282125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 86 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16731736 - 16731346
Alignment:
Q  86 tctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcata 184  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16731736 tctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttatcataaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcata 16731637  T
Q  185 acctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatg 284  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16731636 ac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatg 16731538  T
Q  285 tgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataagc 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16731537 tgaatgtgttgattgtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgttgtaagtgatcacgtgatataagc 16731438  T
Q  385 tatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16731437 tatgttttggcaattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgttggaacatattttac 16731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 82 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14951334 - 14950995
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14951334 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 14951235  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  14951234 cataac-tttttctatgagccgggaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatacatttatgtatttgag 14951136  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14951135 agtgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggtttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcgcgtgaaat 14951036  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttga 421  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14951035 aagctatgttttatcgattgaacttgagatgttagagttga 14950995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Original strand, 18293703 - 18293972
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18293703 tttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcg 18293802  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18293803 taac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 18293901  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18293902 tgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 18293972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 17146325 - 17146596
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17146325 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttat 17146424  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17146425 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 17146523  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  17146524 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 17146596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 55377231 - 55377512
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55377231 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattattacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 55377330  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  55377331 cataac-tttttctaggagctgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtgcttagagtaaataattgagtatgcatttatgtatttgag 55377429  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  55377430 aatgtgaatgtgttgatggcttgagaaatattttgggcgaagttgaatcggtgaaaacgggttttgtgctaaaatgtcgtttt 55377512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Original strand, 19698030 - 19698289
Alignment:
Q  94 ctttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19698030 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataac-ttttt 19698128  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19698129 ctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 19698228  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19698229 ttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 19698289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Original strand, 19708615 - 19708874
Alignment:
Q  94 ctttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19708615 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataac-ttttt 19708713  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19708714 ctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 19708813  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19708814 ttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 19708874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 22355105 - 22355376
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22355105 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 22355204  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22355205 cataac-tttttctttgagccgtggaacctttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtattcatttatgtatttggg 22355303  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  22355304 aatgtgaatgtgtcgatggtttaagaaatattttgggcggatttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 22355376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 5683401 - 5683681
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||| ||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5683401 gctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 5683500  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5683501 cataac-tttttctacgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 5683599  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  5683600 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 5683681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18247803 - 18247524
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18247803 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 18247704  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18247703 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgta-ttggg 18247606  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18247605 aaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 18247524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8374103 - 8373851
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatc 181  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8374103 ctttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatc 8374004  T
Q  182 ataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggga 281  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8374003 ataac-tttttctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgagcttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatgcatttatgta-ttggga 8373906  T
Q  282 atgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaa 336  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  8373905 aggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaa 8373851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14995708 - 14995427
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14995708 gctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 14995609  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgta-tttgg 279  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14995608 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaaattttccaaacttgatattgggtttaataaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgg 14995510  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
     |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14995509 aaatgtgaatgtgttcatggtttaggaaatattttgggcggagttgaattggtgaaaacggattttgagct-aaatgtcgtttt 14995427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 47357247 - 47357006
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47357247 gctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 47357148  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  47357147 cataac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcacttatgtatttgga 47357049  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  47357048 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 47357006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10643810 - 10643586
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10643810 gctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 10643711  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  10643710 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagcacttagagtgaataattgagtatgcatttacgtattgggg 10643612  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10643611 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 10643586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19020073 - 19019811
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||     
T  19020073 gctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacacgagtcatgtggatttttgtgaaaacttag 19019974  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19019973 cataactttttt-tatgagtcgtgagacttttccaaacttgatattggatttaatgaagtgcttagagtgaataattgagtatgcatttatgta-ttggg 19019876  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  19019875 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcagtgaaaacgggtttt 19019811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18168357 - 18168210
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18168357 gctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcatgtggagttttgtgaaaacttat 18168258  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 229  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18168257 cataa-ctttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 18168210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 25120080 - 25120223
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25120080 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggccatgtggatttttgtgaaaacttat 25120179  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25120180 cataa-ctttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatat 25120223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 15287904 - 15288091
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15287904 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaattaatacacatgagtcatgtggaattttgtgaaaacttat 15288003  T
Q  181 cataacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||   |||||  | | | ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15288004 cataaatgttttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttggtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 15288091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 15295014 - 15295201
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15295014 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttat 15295113  T
Q  181 cataacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||   |||||  | | | ||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15295114 cataaatgttttctttataaaccgtgaaagttttccaaacttggtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 15295201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22737850 - 22737655
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtgat-ttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||| | ||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| |||    
T  22737850 ttctaatggctttggtttgacattcaaatgatttttataacttaagttatgagtaatttactacacgtgggtcatgtgaacttttgttaaaacttaacat 22737751  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaactt-gatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgg 279  Q
    ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  22737750 aac-tttttctatgagtcgtgaaacctttacaaactttgttattgggtttaataaagtatttagagtgaatgattgagtatgtattaatggatttgg 22737655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39390511 - 39390433
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  39390511 aaataacactagttgtgctcctaatttagaatgcagataaggtgtttgatgaaatgcctaagtaacaacatgttgcttt 39390433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26338602 - 26338417
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatt-tttgtgaaaacttatca 182  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  26338602 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatca 26338503  T
Q  183 taacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||   |||||  | | | |||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26338502 taaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 26338417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 363
Target Start/End: Original strand, 18250785 - 18250874
Alignment:
Q  273 tatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18250785 tatttgagaatgtgaatgtgttgatgccttgagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 18250874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18168214 - 18168137
Alignment:
Q  276 ttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18168214 ttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcaaagttgaatcggtgaaaacgggttttcagctaaa 18168137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 55741066 - 55740995
Alignment:
Q  7 taaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 78  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55741066 taaataacactaattgtgctagtaatttataatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 55740995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 54603783 - 54603734
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54603783 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 54603734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Original strand, 14970492 - 14970568
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtca 158  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  14970492 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtca 14970568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19857955 - 19857891
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19857955 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattact 19857891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12027933 - 12027884
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12027933 aatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgaaataatcttgcttt 12027884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 49547559 - 49547636
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat 159  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  49547559 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcat 49547636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3515384 - 3515320
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3515384 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattact 3515320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9610902 - 9610862
Alignment:
Q  120 tagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatg 160  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9610902 tagaacttgagttatgatcaaaatactacacataggtcatg 9610862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15534558 - 15534494
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15534558 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 15534494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 52872858 - 52872922
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  52872858 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 52872922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 45512 - 45118
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45512 gctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggattttcgtgaaaacttat 45413  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45412 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtaattggg 45314  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45313 aatgtgaatgtgttgattgtttaagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgttttaagtgatcacatgaaat 45214  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45213 aagctatgttttggcaattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattgtgcctttttgattcatatttttgctggaacatattttac 45118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 40029 - 39635
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40029 gctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggattttcgtgaaaacttat 39930  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39929 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtaattggg 39831  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39830 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgttgttttaagtgatcacatgaaat 39731  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39730 aagctatgttttggcaattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattgtgcctttttgattcatatttttgctggaacatattttac 39635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 79067 - 78796
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  79067 gctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaaattat 78968  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  78967 cgtaac-tttttctatgagccatgaaacttttccaaacttgatattgggtataatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgag 78869  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  78868 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttgtgagctaaa 78796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 95 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23153086 - 23152706
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttc 193  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23153086 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgataaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttttc 23152988  T
Q  194 tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgt 293  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23152987 tatgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgt 23152888  T
Q  294 tgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataagctatgttttg 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23152887 tgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtg-aaacgggttttgagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataagctatgtttta 23152789  T
Q  394 gcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152788 gcgattgaatttgagatgttagagttgaaaatgaagtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 23152706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 82 - 440
Target Start/End: Original strand, 35016049 - 35016409
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016049 gctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 35016148  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35016149 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttctaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 35016247  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35016248 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaattggtgaaaacgggttttcagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 35016347  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctg 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  35016348 aagctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgaagtgttattttgctg 35016409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 22593627 - 22594022
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtgat-ttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22593627 gctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaaattttgtgaaaaattat 22593726  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22593727 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 22593825  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22593826 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatgttttgggtagaattgaatcggtgaaaatgggtttttgagttaaaatgttgttttaagtgatcacgtgaaa 22593925  T
Q  380 taagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22593926 taagctatgttttggctattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttatttttttgttttgattcatatttttgcggtaacatattttac 22594022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 16826413 - 16826694
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16826413 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 16826512  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16826513 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaaattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgg 16826611  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16826612 aatgtgaatgtattgatggtttaagaaatattttgggcggagtttaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 16826694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1555591 - 1555320
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1555591 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 1555492  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1555491 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaattacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 1555393  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1555392 aatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 1555320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25175176 - 25174896
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25175176 gctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 25175077  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25175076 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 25174978  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  25174977 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 25174896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 27654642 - 27654913
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27654642 gctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 27654741  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27654742 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataatttagtatgcatttatgtatttggg 27654840  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  27654841 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaatgggttttgagctaaa 27654913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16240360 - 16240122
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16240360 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 16240261  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16240260 cataac-tttatctatgagccgtgaaacatttccaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 16240162  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16240161 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgggtg 16240122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25904539 - 25904258
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataattttt-agaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaactta 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25904539 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaactta 25904440  T
Q  180 tcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgg 279  Q
    ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25904439 tcataat-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttagtgaagaacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttg 25904341  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  25904340 gaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggaggagttgaatcggtgaaaacgggttttgag-ttaaatgtcgtttt 25904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19628944 - 19628676
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| |||| | | ||||| ||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  19628944 ttctaatggctttggtttggcattcaaatgatttttataacttgagttatgactaatttactacacatgggtcatgttgatttttgggaaaacttaacat 19628845  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaat 283  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19628844 aac-tttttctatgagccgtgagacttttccaaacttggtattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaat 19628746  T
Q  284 gtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19628745 gtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 19628676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 306
Target Start/End: Original strand, 21776141 - 21776365
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21776141 gctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 21776240  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  21776241 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgcattgggg 21776339  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21776340 aatgtgaatgtgttgatggtttgaga 21776365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 33315121 - 33315402
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33315121 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 33315220  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgg- 279  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  33315221 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgataatgggtt-aatgaggtacttaaagtgaataattgagtatgcatttatgtattttga 33315318  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33315319 gaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggcggggttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 33315402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 16633546 - 16633731
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16633546 gctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 16633645  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16633646 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 16633731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 16650220 - 16650405
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16650220 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 16650319  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16650320 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 16650405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 16556990 - 16557175
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16556990 gctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaanttttgtgaaaacttat 16557089  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
     ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16557090 tata-cttttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 16557175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 22226614 - 22226800
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataattttt-agaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaactta 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22226614 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaactta 22226713  T
Q  180 tcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22226714 tcataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaacaaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 22226800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10488035 - 10487853
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10488035 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 10487936  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10487935 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 10487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 19984164 - 19984306
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19984164 gctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaagttat 19984263  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19984264 cataa-ctttttctatgagccgt-gaacttttccaaacttgatat 19984306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 16377293 - 16377474
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16377293 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 16377392  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16377393 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttaaagggaataattgagtatg 16377474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 16384617 - 16384798
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16384617 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 16384716  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16384717 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagta-ttaaagggaataattgagtatg 16384798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19609644 - 19609457
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19609644 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatgatcaaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttat 19609545  T
Q  181 cataacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||   |||||  | | | ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19609544 cataaatgttttctttataaaccgtgaaacttttccaaacttggtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 19609457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 29870474 - 29870634
Alignment:
Q  109 caaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcataacctttttc--tctgagccgtgg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||  | | | |||||     
T  29870474 caaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattaatatacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtga 29870573  T
Q  206 aacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29870574 aacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 29870634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 5614277 - 5614355
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5614277 aaataacactagttgtgctcctaatttataatgcacataaggtgtttgatgaaatgcttaagtgagaaaatgttgcttt 5614355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1259678 - 1259600
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1259678 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgcacataaggtgtttgatgaaatgcgtaagtgagaaaatgttgcttt 1259600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19273321 - 19273255
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgaga 74  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19273321 aaataacactaattgtgctcctaatttagaatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgaga 19273255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29665438 - 29665295
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||   || ||||||| |||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  29665438 gctttctattggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatgagagttatgattaaattactaagtgtgggttatgtggattttcgtgaaaacttac 29665339  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29665338 cgtaac-tttttctttgagccgtgaaacctttccaaacttgatat 29665295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Original strand, 14627347 - 14627417
Alignment:
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  14627347 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagtttaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 14627417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34963750 - 34963680
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacat 152  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  34963750 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacat 34963680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22782603 - 22782527
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtca 158  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22782603 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtca 22782527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25535784 - 25535720
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25535784 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 25535720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 26924426 - 26924490
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26924426 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 26924490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 30676495 - 30676559
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30676495 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattact 30676559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 17377633 - 17377697
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17377633 gctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatggtcaaattact 17377697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19005528 - 19005464
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19005528 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 19005464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 163
Target Start/End: Original strand, 23225154 - 23225198
Alignment:
Q  119 ttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga 163  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  23225154 ttagaacttgatttatggtcaaattactacacacaggtcatgtga 23225198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 28289122 - 28289186
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28289122 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 28289186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 12526 - 12919
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12526 gctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 12625  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12626 cataac-tttttctatgagccgttggacttttccaaacatgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 12724  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12725 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggt-aaaacgggtttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 12823  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12824 aagctattctttagcgattgaacttgagaatgtagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatattattgctagaacatattttac 12919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 789 - 396
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  789 gctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtaatgtggatttttgtgaaaacttat 690  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  689 cataac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagattgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 591  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  590 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 491  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  490 aacctatgttttagcgtttgaacttgatatgttagagttgaaaatgatgtgttatttttctgttttgattcatattttt-ctggaacatattttac 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11287040 - 11286647
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11287040 gctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatggatcatgtagatttttgtgaaaacttat 11286941  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11286940 cataac-tttttctatgagccatggaacttttccaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgtataatttagtatgcatttatgtatttggg 11286842  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11286841 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtgaaattgaat-ggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgttttaattgatcacgtgaaat 11286743  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11286742 aatctatgttttggcaattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgttggaacatattttac 11286647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 10001030 - 10001301
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10001030 gctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgggatatgattaagttactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 10001129  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10001130 cataac-tttttctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 10001228  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10001229 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 10001301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 15760784 - 15761055
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15760784 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 15760883  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15760884 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaattacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 15760982  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15760983 aatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 15761055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 363
Target Start/End: Original strand, 32495097 - 32495376
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatc 181  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32495097 ctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatc 32495196  T
Q  182 ataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggga 281  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32495197 gtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaatttgatattaggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggga 32495295  T
Q  282 atgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  32495296 atgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 32495376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 15951639 - 15951919
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15951639 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 15951738  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  15951739 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttgga 15951837  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15951838 aatgtgaatgtgttgatgggttgagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 15951919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 95 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16418070 - 16417802
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataattttt-agaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16418070 tttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttct 16417972  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16417971 ctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 16417872  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16417871 ttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 16417802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 222 - 475
Target Start/End: Original strand, 17985310 - 17985565
Alignment:
Q  222 atattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtgga 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  17985310 atattgggtttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatgtaattatggatttgagaatatgaatgtgttgatggcttgagaaata-tttaggtgga 17985408  T
Q  322 attgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagtt- 419  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  17985409 attgaatcggagaaaacgggtttttgagctaaaatgttgttttaagtgattacgtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgaggtgtttgagttt 17985508  T
Q  420 -gaatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttact 475  Q
      |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17985509 aaaatgatgtgttatttttctgttttgattcatatttttgctggaacatattctact 17985565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15852039 - 15851840
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatc 181  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15852039 ctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagatattattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatc 15851940  T
Q  182 ataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggga 281  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15851939 ataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggga 15851841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 27102557 - 27102739
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27102557 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 27102656  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27102657 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 27102739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 27109905 - 27110087
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27109905 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 27110004  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27110005 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 27110087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27175769 - 27175587
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27175769 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 27175670  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27175669 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 27175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 38784649 - 38784831
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38784649 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 38784748  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38784749 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 38784831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7822077 - 7821895
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7822077 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 7821978  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7821977 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatacttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 7821895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7829388 - 7829206
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7829388 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 7829289  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7829288 cataa-ctttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatacttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 7829206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 126029 - 125886
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  126029 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 125930  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  125929 cataa-ctttttctatgagccgtgaaacttttccaaaattgatat 125886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 1937833 - 1937978
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatc 181  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1937833 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaattttagttatgatcaaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatc 1937932  T
Q  182 ataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 228  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937933 ataa-ctttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 1937978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 41958173 - 41958251
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  41958173 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgcacataagttgtttgataaaatgcataagtgagtaaatcttgcttt 41958251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 46529102 - 46529032
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 78  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46529102 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgctcataaggtgtttgataaaatgcataagtgagaaaat 46529032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 3938921 - 3938980
Alignment:
Q  15 actagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgaga 74  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3938921 actaattgtgctagtaatttagaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgaga 3938980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13953080 - 13953002
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13953080 aaataacactaattgtgctagtaatttgaaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagagagaaaatcttgcttt 13953002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 31592835 - 31592884
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31592835 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaaccttgcttt 31592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8469110 - 8469048
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8469110 tttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 8469048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17733654 - 17733605
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17733654 aatgcacataaggtgattgatgaaatgtctaagtgagaaaatcttgcttt 17733605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 15081627 - 15081691
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15081627 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattact 15081691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 14156671 - 14156734
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattac 145  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14156671 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattac 14156734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28510384 - 28510321
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtg 71  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28510384 aaataacactaattgtgttagtaatttagaatgcacttaaggtgtttcatgaaatgcctaagtg 28510321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Original strand, 10501286 - 10501360
Alignment:
Q  190 tttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  10501286 tttctatgaaccgtgaaactttctcaaaattaatattgggtttaatgaagtctttaaagtgaataattgaatatg 10501360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Original strand, 14156967 - 14157041
Alignment:
Q  190 tttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  14156967 tttctatgaaccgtgaaactttctcaaaattaatattgggtttaatgaagtctttaaagtgaataattgaatatg 14157041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 150
Target Start/End: Original strand, 16108492 - 16108542
Alignment:
Q  100 tttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacac 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16108492 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacac 16108542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 45414717 - 45414795
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| |||||||  || |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  45414717 aaataacactaattgtgctagtattttaaaatgcacttaaagtgtttgatgaaatgcctaagtgaaataatcttgcttt 45414795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1804671 - 1804622
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgat 57  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1804671 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgcacataaagtgtttgat 1804622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8940656 - 8940592
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8940656 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 8940592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16214061 - 16214001
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaat 142  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16214061 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaat 16214001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24702605 - 24702541
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24702605 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 24702541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24705052 - 24704988
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24705052 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 24704988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29796987 - 29796923
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29796987 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattact 29796923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29800806 - 29800742
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29800806 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattact 29800742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Original strand, 51158689 - 51159086
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51158689 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatggttcatgtggatttttgtgaaaacttat 51158788  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51158789 cataac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggttcaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 51158887  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtgg-aattgaatcg--atgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtga 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||  |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158888 aatatgaatgtgttgatggtttgagatatattttggatggaaagtgaaaggttgtgaaaacggattttgagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtga 51158987  T
Q  378 aataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158988 aataagctatgttttagcgattgcacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 51159086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 82 - 422
Target Start/End: Original strand, 14528670 - 14529010
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14528670 gctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 14528769  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14528770 cataac-tttttctataagccgtgaaacttttccaaacatgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatccatttatgtatttggg 14528868  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14528869 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgagtttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 14528968  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttgaa 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14528969 aagctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaa 14529010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 17956874 - 17957155
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17956874 gctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 17956973  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17956974 cataacatttt-ctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgag 17957072  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17957073 gatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 17957155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 54039172 - 54039452
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54039172 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaattaatacacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttat 54039271  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54039272 cataac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgaatttatgtatttggg 54039370  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  54039371 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttggacggagttgaatcggtgaaaacgagttttgagct-aaatgtcgtttt 54039452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49231832 - 49231551
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49231832 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 49231733  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49231732 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaacgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 49231634  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgag-aaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  49231633 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaaatattttgagtggagtagaatcggtgaaaacgagttttgagct-aaatgtcgtttt 49231551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 82 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16820526 - 16820271
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||||   ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16820526 gctttctaatggcattggtttggtgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 16820427  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16820426 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 16820328  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  16820327 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaatcggtgaaaa 16820271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27840520 - 27840282
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27840520 ttctaatgactttggtttgacgtccaaataattattagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcat 27840421  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaat 283  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27840420 aac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaacaattgagtatgcatttatgtatttggaaat 27840322  T
Q  284 gtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  27840321 gtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 27840282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25058362 - 25058081
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25058362 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacataggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 25058263  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgta-tttgg 279  Q
    | |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  25058262 cgtaac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaataaagtacttagagtgaatgattgagtatgcatttatgtattttgg 25058164  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  25058163 gaatgtgaatgtgttgatggtttaggaaatattttgggcggagttgaataagtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 25058081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12808536 - 12808288
Alignment:
Q  115 atttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttttc 213  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12808536 atttttagaacttgagatatgattaaattactacatatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttttctttgagctgtggaacttttc 12808438  T
Q  214 caaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattt 313  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  12808437 caaacttgatattttgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttggaatgtgaatgggttgatgatttaagaaatattt 12808338  T
Q  314 tgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||  || || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12808337 tgggcagagtttaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 12808288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28557434 - 28557171
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28557434 gctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 28557335  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28557334 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattaaatataatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 28557236  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaa 352  Q
    ||      |||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28557235 aa------tgtgttgatggtttaag-aatattttgggcagagttgaatcggtgaaaacggattttgagctaa 28557171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30152514 - 30152330
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30152514 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 30152415  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    ||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152414 cataa-ctttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttaataatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 30152330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44228567 - 44228398
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttc 193  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44228567 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttttc 44228469  T
Q  194 tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44228468 tataagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatg 44228398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17393284 - 17392901
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat-gtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||| | |||| ||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  | |     
T  17393284 ctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaatttttatgaaatttcag 17393185  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    || ||| ||| ||| ||| ||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||    ||||| ||| ||| |||||||    
T  17393184 cacaac-tttctctatgaaccgtgaaactttctcaaaattaatattgggtttaatgaattctttagagtggttaa----gtatgtatttatggatttggg 17393090  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaa 379  Q
    |||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17393089 aatgtgaatgt---------ttgagaaatgttttgggtggaattgaatcggagaaaatgggtttttgagctaaaatgtcgttttaagtgattacgtgaaa 17392999  T
Q  380 taagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagtt--gaatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttact 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   || ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17392998 taagctatgttttggcgatttaacttgagatgtttgagtttaaaaggatgtgttatttttctatttttattcatatttttgctggaacatattttact 17392901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 8276519 - 8276701
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8276519 gctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 8276618  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8276619 cataac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatttcgggcttaatgaagtatttagagtgaataactgagtatg 8276701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 8269408 - 8269590
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8269408 gctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 8269507  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8269508 cgtaac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatttcgggcttaatgaagtatttagagtgaataactgagtatg 8269590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 1468659 - 1468841
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1468659 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 1468758  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1468759 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 1468841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 12265468 - 12265649
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| |||| | | ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12265468 ttctaatggctttggtttggcattcaaatgagttttagaatttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttgtcat 12265567  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12265568 aa-ctttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaatgatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 12265649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 16934856 - 16935040
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatg-tgatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16934856 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgcggatttttgtgaaaacttat 16934955  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||  | ||| | | ||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16934956 cataa-atatttttataagccgtgaaacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 16935040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 18897675 - 18897856
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| | ||||| | ||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18897675 ttctaatggctttggtctgacattcaaatgattttcataacttaagttatgaataatttattacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttataat 18897774  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897775 aac-tttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaataatgggtt-aatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 18897856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5227836 - 5227711
Alignment:
Q  142 ttactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaa-cttgatattgggtttaatgaag 239  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  5227836 ttactgcacatgagtcatgtggatttttgttaaaaattatcataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaaacttaataatgggtt-aatgaag 5227739  T
Q  240 tacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227738 tacttagagtgaataattgagtatgcat 5227711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 55147019 - 55147097
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55147019 aaataacactagttgtgctcctaatttagaacgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 55147097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 30716333 - 30716411
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30716333 aaataacactagctgtgctcctaatttagagtgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 30716411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 472
Target Start/End: Original strand, 24892312 - 24892412
Alignment:
Q  374 gtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttgaa--tgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  24892312 gtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgaggtatttaagttgaaaatgatttgttattttgctgttttgattcatatctttgctagaacatgttt 24892411  T
Q  472 t 472  Q
    |    
T  24892412 t 24892412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 474
Target Start/End: Original strand, 14521966 - 14522012
Alignment:
Q  428 tgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14521966 tgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 14522012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 18895636 - 18895685
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18895636 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 18895685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 183427 - 183357
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 78  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  183427 aaataacactaattatgctcttaatttagaatgcacataaggtgtttgataaaatgcataagtgaggaaat 183357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 48161960 - 48162010
Alignment:
Q  23 tgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgag 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  48161960 tgctcctaatttagaatgcacataaggtgtttgataaaatgcataagtgag 48162010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18946141 - 18946092
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgat 57  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18946141 aaataacactaattatgctcctaatttagaatgctcataaggtgtttgat 18946092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 6468920 - 6468984
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  6468920 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattact 6468984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 7781132 - 7781196
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7781132 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 7781196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 10247509 - 10247573
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10247509 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattact 10247573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12567936 - 12567872
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12567936 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattact 12567872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15977909 - 15977845
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15977909 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattact 15977845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 20629977 - 20630041
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20629977 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 20630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27165629 - 27165565
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27165629 gctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 27165565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 29544627 - 29544691
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29544627 gctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattact 29544691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46822638 - 46822574
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46822638 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 46822574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54521199 - 54521135
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54521199 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 54521135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 84 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41319 - 40935
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41319 tttctaatggctttggcttgacttccaaattatttttagaacttgcattatgatcaaattaatacacatgggtcacgtggatttttgtgaaaacttatca 41220  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41219 taac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgatgtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 41121  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataa 382  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41120 tgggaatgtgttgagggtttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgagttttgagctaaaatgttgttttaagtgatcatgtgaaataa 41021  T
Q  383 gctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaaca 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41020 gctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatgtgttattttgctattttgattcatatttttactggaaca 40935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 82 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22366591 - 22366198
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22366591 gctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 22366492  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22366491 cataac-tttttctataagccgtgaaacttttccaaacttaataatgggtt-aatgaagtacttagagttaataatttagtatgcatttatgtatttggg 22366394  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366393 aatgtgaatgtgttgatgggttgagatatattttgggtggaattgaatcggtgaaaacgggtttttagctaaaatgtctttttaagtgatcacgtgaaat 22366294  T
Q  381 aagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22366293 aagctatgttttagcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgaagtgttattttgctgctttgattcatatttttgttggaacatattttac 22366198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 353
Target Start/End: Original strand, 15862088 - 15862358
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15862088 tttctaatggcttgggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatca 15862187  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgca-ttcatgtatttggga 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15862188 taac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatatcgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattttatgtatttggga 15862286  T
Q  282 atgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15862287 atgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcgaagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 15862358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 139 - 363
Target Start/End: Original strand, 22249665 - 22249889
Alignment:
Q  139 aaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatga 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249665 aaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatga 22249763  T
Q  238 agtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22249764 agtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtctaagatatattttgggcggagttgaatcggtgaaaa 22249863  T
Q  338 cggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22249864 cgggttttgagctaaaatgtcgtttt 22249889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20253919 - 20253651
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||  |||||| ||||||  || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20253919 ttctaatggctttgatttggcattcaaacaatttttatgacttgagttatgactaatttattacacatgggacatgtggatttttgtgaaaacttatcat 20253820  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaat 283  Q
    ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20253819 aac-tttttctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaat 20253721  T
Q  284 gtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  20253720 gtgaatgtgttaagggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggttaaaacgggttttgagctaaa 20253651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 18060620 - 18060802
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18060620 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 18060719  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18060720 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatattggacttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatg 18060802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Original strand, 7641618 - 7641788
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcataacctttttc 193  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7641618 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataa-ctttttc 7641716  T
Q  194 tctgagccgtggaacttttccaaacttgatatt-gggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7641717 tatgagccgtgaaacttttccaaacttgattttggggcttaatgaagtatttagagtgaataattgagtatg 7641788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21858656 - 21858510
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21858656 gctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 21858557  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 228  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858556 cataa-ctttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgg 21858510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17003973 - 17003791
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17003973 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 17003874  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17003873 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 17003791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Original strand, 44035864 - 44036018
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga--tttttgtgaaaactta 179  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44035864 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaattttttgtgaaaactta 44035963  T
Q  180 tcataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 235  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  44035964 tcataa-ctttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 44036018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 21650915 - 21651102
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatg-tgatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21650915 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattactacacatgggtcatgcggatttttgtgaaaacttat 21651014  T
Q  181 cataa--cctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||    ||||| | | ||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651015 cataaatattttttttataagccgtgaaacttttccaaacttaacaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 21651102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22029877 - 22029692
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatg-tgatttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22029877 tttctaatggctttggtttgatatacaaatgattttttgaacttgagttatgatcaaattaatacacatgagtcatgaggatttttgtgaaaacttatca 22029778  T
Q  183 taacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||   |||||  | | | | |||  ||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22029777 taaatattttctttataaactgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 22029692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22035028 - 22034843
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatt-tttgtgaaaacttatca 182  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  22035028 ttctaatggctttggtttgatattcaaatgatttttagaacttgggttaggatcaaattaatacacatgagttatgtggattctttgtgaaaacttatca 22034929  T
Q  183 taacctttttc--tctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||   |||||  | | | |||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22034928 taaatattttctttataaaccgtgagacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 22034843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42464922 - 42464873
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42464922 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 42464873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15292397 - 15292326
Alignment:
Q  15 actagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||| |||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15292397 actaattgtgctagtattttaaaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatattgcttt 15292326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 83
Target Start/End: Original strand, 18239941 - 18239987
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgc 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18239941 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgc 18239987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42058221 - 42058172
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42058221 aatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatattgcttt 42058172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 159
Target Start/End: Original strand, 38056031 - 38056075
Alignment:
Q  115 atttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat 159  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38056031 atttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 38056075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 78
Target Start/End: Original strand, 31385815 - 31385852
Alignment:
Q  41 cacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31385815 cacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 31385852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 27161372 - 27161436
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27161372 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 27161436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29535428 - 29535360
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacac 150  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29535428 gctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacac 29535360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 46200761 - 46200712
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  46200761 aatgcactttagatgtttgatgaaatgcctaagtgaaataatcttgcttt 46200712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13227240 - 13227172
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacac 150  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13227240 gctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacac 13227172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21841143 - 21841079
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  21841143 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattact 21841079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31612935 - 31612871
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31612935 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 31612871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 84 - 474
Target Start/End: Original strand, 24717758 - 24718134
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24717758 tttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcg 24717857  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  24717858 taac-tttttcttttagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgtgtattcatttatgtatttgggaa 24717956  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||| |               |||||||||||||||||||    
T  24717957 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatatttttggcggagttgaatcggtgaaaacgggtttttgg---------------aagtgatcacgtgaaataa 24718041  T
Q  383 gctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatatttttgctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24718042 gctatgttttagcgattgaatttgatatgttagagttgataatgatgtgttatttttctgttttgattcatatttttgct-gaacatattttac 24718134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 13663134 - 13663414
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13663134 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 13663233  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13663234 cataac-tttttctttaagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgag 13663332  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13663333 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 13663414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18612004 - 18611745
Alignment:
Q  94 ctttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18612004 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttagcataac-ttttt 18611906  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18611905 ctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 18611806  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18611805 ttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 18611745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 84 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39114477 - 39114199
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  39114477 tttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattactacacatgagtcatgtagatttttgtgaaaacttatcg 39114378  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39114377 taac-tttttctatgagccgtgaaactttttcaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 39114279  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  39114278 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 39114199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18618894 - 18618614
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18618894 gctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatggatcatgtggatttttgtaaaaacttat 18618795  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18618794 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgaatatgcatttatgtatttggg 18618696  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18618695 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 18618614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22147029 - 22146770
Alignment:
Q  94 ctttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22147029 ctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttaccataac-ttttt 22146931  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22146930 ctatgagccgtgagacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtaaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 22146831  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  22146830 ttgatggtttaagaaatattttgtgcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 22146770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 22007131 - 22007413
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22007131 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 22007230  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgta-tttgg 279  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22007231 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaacgaagtacttagaggggataattgagtatgcatttatgtattttgg 22007329  T
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22007330 gaatgtgaatgtgttgatggttcaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 22007413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 353
Target Start/End: Original strand, 17150661 - 17150931
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17150661 gctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatggatcatgtggatttttgtgaaaacttat 17150760  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17150761 cataac-tttttctatgatccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatatatgta-ttggg 17150858  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  17150859 aaggtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 17150931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Original strand, 223350 - 223591
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  223350 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 223449  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  223450 cataac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgga 223548  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  223549 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 223591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Original strand, 736973 - 737214
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  736973 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 737072  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  737073 cataac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgga 737171  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  737172 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 737214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Original strand, 860868 - 861109
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  860868 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 860967  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  860968 cataac-tttttctttgagctgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgga 861066  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  861067 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatataattttgagtggaa 861109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 115 - 322
Target Start/End: Original strand, 699796 - 700004
Alignment:
Q  115 atttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttttc 213  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  699796 atttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttttctttgagctgtggaacttttc 699894  T
Q  214 caaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-att 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  699895 caaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggaaatgtgaatgtgttgatggtttgagatataatt 699994  T
Q  313 ttgggtggaa 322  Q
    ||| ||||||    
T  699995 ttgagtggaa 700004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 15320034 - 15320219
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15320034 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 15320133  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15320134 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgattttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 15320219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 15500403 - 15500588
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15500403 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 15500502  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15500503 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgattttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 15500588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Original strand, 688121 - 688307
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  688121 gctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 688220  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatt 268  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  688221 cataac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatt 688307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 22089418 - 22089603
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22089418 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 22089517  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089518 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 22089603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 272209 - 272391
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  272209 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 272308  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  272309 cataac-tttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 272391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 643640 - 643458
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  643640 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 643541  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  643540 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 643458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 829446 - 829264
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  829446 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 829347  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  829346 cataac-tttttctataagtcgtgaaacttttccaaacttgatattgggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 829264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 451
Target Start/End: Original strand, 3844641 - 3844864
Alignment:
Q  222 atattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtgga 321  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||    
T  3844641 atattgggttaaatgaagtatttatagtgaataattgagtatgtatttatggatttgggaatgtgaatgt---------ttgagaaatgttttgggtgga 3844731  T
Q  322 attgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagtt- 419  Q
    | |||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||     
T  3844732 agtgaatcggagaaaacgagtttttgagctaaaatgtcgttttaagtgattacatgaaataagctatgttttggcgatttaactcgagatgtttgagttt 3844831  T
Q  420 -gaatgatatgttattttgctgttttgattcat 451  Q
      |||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  3844832 aaaatgatgtattatttttctgttttgattcat 3844864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29759493 - 29759350
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29759493 gctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactaaacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 29759394  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatat 225  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29759393 cataa-ctttttctatgaaccgtgaaacttttacaaacttgatat 29759350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8319202 - 8319142
Alignment:
Q  26 tcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8319202 tcctaatttagaatgcacgtaaggtgtttgatgaaatgtctaagtgagaaaatgttgcttt 8319142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20495118 - 20495069
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20495118 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgaggaaatcttgcttt 20495069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23718321 - 23718255
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgaga 74  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23718321 aaataacactaattatgctcctaatttaaaatgtacttaaggtgtttgatgaaatgcctaagagaga 23718255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 14397526 - 14397590
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14397526 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattact 14397590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24048987 - 24048923
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24048987 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattact 24048923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 44118999 - 44118955
Alignment:
Q  40 gcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgct 84  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44118999 gcacaaaaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgct 44118955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42100334 - 42100301
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagt 70  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42100334 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagt 42100301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 15202771 - 15202835
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15202771 gctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattact 15202835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 15202964 - 15203028
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15202964 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattact 15203028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19896891 - 19896827
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19896891 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 19896827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21551360 - 21551296
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtga 72  Q
    |||||| ||||  ||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21551360 aaataacactaactgtgctagtaatttggaatgcactcaaggtgtttgatgaaatgcctaagtga 21551296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21552406 - 21552342
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtga 72  Q
    |||||| ||||  ||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21552406 aaataacactaactgtgctagtaatttggaatgcactcaaggtgtttgatgaaatgcctaagtga 21552342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22002129 - 22002065
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22002129 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattact 22002065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32122105 - 32122041
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32122105 gctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 32122041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 45290427 - 45290491
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45290427 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 45290491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 84 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15840 - 15562
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15840 tttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattaatacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcg 15741  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15740 taac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagaatgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaa 15642  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15641 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 15562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 228 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1306
Alignment:
Q  228 ggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaa 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  1440 ggtttaatgaagtacttagaatgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaa 1341  T
Q  328 tcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1340 tcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2011 - 1752
Alignment:
Q  94 ctttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2011 ctttggtttgacgtccaaattatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-ttttt 1913  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1912 ctttgagtcgtggaacttttccaaacttgatattgggtctaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 1813  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1812 ttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaa 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 84 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28531 - 28257
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatca 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  28531 tttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcg 28432  T
Q  183 taacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaa 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28431 taac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaagtacttagagtgaaaaattgagtatgcatttatgtatttgagaa 28333  T
Q  283 tgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtc 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28332 tgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtc 28257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20203
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||| |||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19945 gctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 20044  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20045 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttggg 20143  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacgg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20144 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgg 20203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 1301 - 1581
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1301 gctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 1400  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1401 cgtaac-tttctctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtggataattgagtatgcatttatgtatttggg 1499  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1500 aatgtgaatgtattgatggtttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 1581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 932 - 652
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  932 gctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 833  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  832 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgag 734  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  733 aatgtgaatgtgttgatggtttaagaattattttgggcggagttgaattggtgaaaacgggttttgaact-aaatgtcgtttt 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18269 - 17989
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18269 gctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatttgtatttttgtgaaaacttat 18170  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18169 cgtaac-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttgatatttggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtattttgg 18071  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18070 aacgtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttgggcagagttgaatcgatgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 17989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 95 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6782 - 6514
Alignment:
Q  95 tttgatttgacttccaaataattttt-agaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcataaccttttt 192  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6782 tttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataac-tttct 6684  T
Q  193 ctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtg 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6683 ctatgagccgtggaacttttccaaacttgatattgtgtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgggaatgtgaatgtg 6584  T
Q  293 ttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6583 ttgatggtttaagaaatatttcgggcggagttgaatcggtgaaaacgggttttgagct-aaatgtcgtttt 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1199
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1439 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatatgaatttttatgaaaacttat 1340  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1339 cataac-tttttctttgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtacttggg 1241  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1240 aatgtgaatgtgttgatggtttgagatatattttgagtggaa 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1849 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1849
Description:

Target: scaffold1849; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 261 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 926 - 710
Alignment:
Q  261 tatgcattcatgtatttgggaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcg 359  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  926 tatgcatttatgtatttggcaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatgttttgggtggaattgaatcagtgaaaacgggtttttgaggtaaaatgtcg 827  T
Q  360 ttttaagtgatcacgtgaaataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttg--aatgatatgttattttgctgttttgattcatattttt 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826 ttttaagtgatctcgtgaaataaggtatgttttggcgattgaacttgagatgttagagttgaaaatgatatgttattttgctgttttgattcatattttt 727  T
Q  458 gctggaacatattttac 474  Q
    |||||||||||||||||    
T  726 gctggaacatattttac 710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 86 - 353
Target Start/End: Original strand, 8132 - 8400
Alignment:
Q  86 tctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttatcata 184  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8132 tctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttatcata 8231  T
Q  185 acctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgta-tttgggaat 283  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  8232 ac-ttttactttgagccgtggaacttttccaaacttgatattggatttgatgaagtacttagagtgaataattgagtaagcatttatgtattttgggaat 8330  T
Q  284 gtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  8331 gtgaatgtgttgatggtttaagaaatattttaggcggagttgaatcggtaaaaacgggttttgagctaaa 8400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 363
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2551
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||||| ||||| | ||||||  || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2272 ttctaatggctttggtctgacattcaaatgatttttataacttcagttatgaataatttactatacatggatcatgtagatttttgtgaaaacttatcat 2371  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgggaat 283  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  2372 aac-tttttctatgagccgtgaaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatctatttgagaat 2470  T
Q  284 gtgaatgtgttgatggtttgagaaatatttt-gggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2471 gtgaatgtgttgatggtctaagaaatattttggggcggagttaaatcggtgaaaacgggttttgagctaaaatgtcgtttt 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 279
Target Start/End: Original strand, 6241 - 6438
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtg-atttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6241 gctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtaatgtggatttttgtgaaaacttat 6340  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttgg 279  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6341 cataac-tttttctaagagccgtggaacttttcaaaacttgatattgagtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcatttatgtatttgg 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 363
Target Start/End: Original strand, 154897 - 155177
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  154897 gctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 154996  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggg 280  Q
    |||||  ||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||    
T  154997 cataatttttttttataagccgtgaaacttttccaaacttaataatggg-ttaacgaggtacttatggtgaatgattgagtttgcatttatgtattttgg 155095  T
Q  281 aatgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggatttttagctaaaatgtcgtttt 363  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  155096 aatgtgaatgtgttgttgg-ttaagaaatattttgggcggagttgaatcggtgaaaacggattttgagctcaaatgtcgtttt 155177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 17225 - 17289
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17225 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 17289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30534 - 30349
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30534 gctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 30435  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30434 cataac-tttttctttgagccgtggaacttttccaaacttgaatttgggtttaatgaggtacttagagtgaataattgagtatgcat 30349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37923 - 37750
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37923 gctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt-agaacttgagttatgatcaaattactacacataggtcatgtgaatttttgtgaaaacttat 37825  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataat 256  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37824 cataaa-tttttctatgagccgtggaacttttccaaacttaatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataat 37750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 113391 - 113073
Alignment:
Q  84 tttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat-gtgatttttgtgaaaactt-atc 181  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| || |  |||   |||| || | |    
T  113391 tttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcatagtaaagttttataaaatttcagc 113292  T
Q  182 ataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggga 281  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||| || | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  113291 acaac-tttttctctgaaccgtgaaactttctcaaaattaa-attgggtttaatcaagtctttagagtgaataattgagtatgtatttatggatttggga 113194  T
Q  282 atgtgaatgtgttgatggtttgagaaatattttgggtggaattgaatcgatgaaaacggattttt-agctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtgaaat 380  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  113193 atatgaatgtgttgatggtttgagaaattttttgggtggaattgaatcggagaaaaggggtttttgagctaaaatatcgttttaggtgattacgtgaaat 113094  T
Q  381 aagctatgttttggcgattga 401  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  113093 aaactatgttttcgcgattga 113073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38439 - 38257
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga-tttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38439 gctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtgaatttttgtgaaaacttag 38340  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38339 cataac-tttttctatgagtcgtgaaacttttccaaacttgatatttggcttaatgaagtatttagagggaataattgagtatg 38257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Original strand, 32152 - 32305
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32152 gctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 32251  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 235  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  32252 cataa-ctttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28232 - 28183
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28232 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 28183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40692 - 40539
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40692 gctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcatgtggatttttgtgaaaacttat 40593  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaat 235  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  40592 cataa-ctttttctttgagccgtgaaacttttctaaacttgatatgggttttaat 40539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 44612 - 44661
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44612 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatcttgcttt 44661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 281
Target Start/End: Original strand, 34802 - 34970
Alignment:
Q  115 atttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgtga---tttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttt 211  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||    
T  34802 atttttataacttgagttatgattaatttactacacatgtgtcatttgaatttttttgtgaaaacttatcataac-tttctctaagagccgtgaaacttt 34900  T
Q  212 tccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcattcatgtatttggga 281  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  34901 tctaaacttgatattgaatttaatgaagtacttagagcgaataattgagtatgtaatgatgtatttggga 34970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54009 - 53862
Alignment:
Q  83 ctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtg-aaaacttat 180  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||     
T  54009 ctttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcatgtggattattgtgaaaaacatag 53910  T
Q  181 cataacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattggg 229  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53909 cataa-ctttttctatgaaccgtggaacttttccaaactggatattggg 53862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 267
Target Start/End: Original strand, 11015 - 11196
Alignment:
Q  85 ttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcat 183  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11015 ttctaatggctttggtttggctttcaaatgatttttataacttaagttatgaataatttactacacatgggtcatgtggatttttgttaaaacttatcat 11114  T
Q  184 aacctttttctctgagccgtggaacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    || |||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  11115 aa-ctttttatttgagccgtagaacttttcaaaacttaataatggg-ttaatgaagtacttggggtgaatgattgtgtatgcat 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Original strand, 167168 - 167276
Alignment:
Q  116 tttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcataacctttttctctgagccgtggaacttttcc 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  167168 tttttagaacttgagttatgatcaaattactacacacgggtcatgtggatttttgtg-aaacttatcataa-ctttttctatgagccgtgaaacttttcc 167265  T
Q  215 aaacttgatat 225  Q
    |||||||||||    
T  167266 aaacttgatat 167276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6153 - 5993
Alignment:
Q  109 caaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcatgt-gatttttgtgaaaacttatcataacctttttc--tctgagccgtgg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||  | | | |||||     
T  6153 caaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattaatatacatgagtcatgtggatttttgtgaaaacttatcataaatattttctttataaaccgtga 6054  T
Q  206 aacttttccaaacttgatattgggtttaatgaagtacttagagtgaataattgagtatgcat 267  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6053 aacttttccaaacttagtaatggg-ttaatgaggtacttagagtgaataattgaatatgcat 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 448
Target Start/End: Original strand, 534 - 706
Alignment:
Q  280 gaatgtgaatgtgttgatggtttgagaaat-attttgggtggaattgaatcgatgaaaa-cggatttttag-ctaaaatgtcgttttaagtgatcacgtg 376  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||| | | |||    
T  534 gaatatgaatatgttgattgtttgagaaatgattttgggtggaattgaattggagaaaaactaatttttaaactaaaa-gtcgttttaagtggttatgtg 632  T
Q  377 aaataagctatgttttggcgattgaacttgagatgttagagtt--gaatgatatgttattttgctgttttgatt 448  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  633 aaataagctatgttttgatgattgaatttgagatgtttgagttcaaaatgatatgttaatttactgttttgatt 706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 685 - 763
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaatgttgcttt 86  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  685 aaataacactaattgtgctagtaatttagaatgcacttaaggtgtttgatgaaatgcctaaatgagaaaatcttgcttt 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 153
Target Start/End: Original strand, 6975 - 7046
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatg 153  Q
    ||||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6975 gctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatg 7046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 501442 - 501378
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  501442 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattact 501378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 86528 - 86463
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgaga 74  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  86528 aaataacactaattgtgctagtaatttagaatgcacttaaggtgttt-atgaaatgcctaagtgaga 86463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 889
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat 159  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  966 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcat 889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1640 - 1599
Alignment:
Q  37 aatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgagaaaat 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1640 aatgcacataaggtgtttgatgaaatgcctaagtgcgaaaat 1599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 584 - 520
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  584 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Original strand, 4088 - 4164
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtca 158  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  4088 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtca 4164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 23316 - 23380
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23316 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 23380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6828 - 6751
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacacatgggtcat 159  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  6828 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcat 6751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 140532 - 140467
Alignment:
Q  8 aaataatactagttgtgctcctaatttagaatgcacataagatgtttgatgaaatgcctaagtgag 73  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  140532 aaataacactaattatgctcttaatttaaaatgcacataaggtgtttgataaaatgtataagtgag 140467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1805 - 1741
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1805 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 1741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 309 - 373
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  309 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3400 - 3336
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3400 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 3336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21124 - 21060
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21124 gctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 21060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 38441 - 38505
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattact 146  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  38441 gctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattact 38505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 68338 - 68270
Alignment:
Q  82 gctttctaatgactttgatttgacttccaaataatttttagaacttgaattatgatcaaattactacac 150  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  68338 gctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacac 68270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University