View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15826_low_2 (Length: 390)

Name: NF15826_low_2
Description: NF15826
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15826_low_2
NF15826_low_2
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (7-374)||(22256827-22257193)
chr7 (7-374)||(22232810-22233185)
chr7 (7-374)||(22253554-22253929)
chr7 (127-374)||(20100331-20100579)
chr7 (129-374)||(748224-748471)
chr7 (128-374)||(5826891-5827138)
chr7 (88-374)||(11825538-11825828)
chr7 (88-374)||(8397504-8397780)
chr7 (129-374)||(26460157-26460401)
chr7 (129-334)||(2349164-2349368)
chr7 (129-374)||(23598946-23599189)
chr7 (151-374)||(26182014-26182237)
chr7 (129-374)||(710200-710444)
chr7 (129-374)||(2251563-2251806)
chr7 (200-374)||(3541351-3541524)
chr7 (200-374)||(22083626-22083798)
chr7 (202-374)||(44017975-44018146)
chr7 (200-374)||(38431155-38431328)
chr7 (200-374)||(12803448-12803620)
chr7 (200-374)||(6964049-6964222)
chr7 (200-374)||(26152913-26153086)
chr7 (200-374)||(43548955-43549128)
chr7 (86-200)||(23467442-23467558)
chr7 (145-229)||(42606060-42606142)
chr7 (252-339)||(23467349-23467437)
chr7 (13-78)||(8276580-8276644)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (6-374)||(1503616-1503982)
chr2 (16-374)||(1506820-1507177)
chr2 (127-374)||(18011637-18011886)
chr2 (110-374)||(13517972-13518240)
chr2 (110-374)||(11059464-11059735)
chr2 (86-374)||(29435397-29435686)
chr2 (103-374)||(38326454-38326726)
chr2 (37-374)||(15704153-15704493)
chr2 (129-374)||(18938586-18938830)
chr2 (103-343)||(38326033-38326274)
chr2 (129-374)||(22592206-22592450)
chr2 (25-311)||(15719470-15719759)
chr2 (86-374)||(4577498-4577787)
chr2 (200-374)||(40677955-40678128)
chr2 (196-374)||(30719535-30719710)
chr2 (200-374)||(38316230-38316403)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (7-374)||(11702770-11703137)
chr4 (88-374)||(18859424-18859714)
chr4 (129-374)||(3734005-3734249)
chr4 (129-374)||(49636706-49636950)
chr4 (129-374)||(49639999-49640243)
chr4 (129-374)||(3719679-3719923)
chr4 (129-374)||(14701597-14701841)
chr4 (135-325)||(17670099-17670304)
chr4 (86-374)||(10385611-10385880)
chr4 (88-374)||(10247452-10247756)
chr4 (200-374)||(56089497-56089670)
chr4 (200-374)||(13978896-13979069)
chr4 (86-343)||(33400546-33400790)
chr4 (200-374)||(26703674-26703847)
chr4 (127-350)||(23652968-23653195)
chr4 (200-370)||(15850935-15851104)
chr4 (127-343)||(11560500-11560718)
chr4 (200-337)||(19928666-19928802)
chr4 (87-133)||(5670226-5670272)
chr4 (25-78)||(33410412-33410465)
chr4 (86-133)||(27013926-27013973)
chr4 (87-133)||(5672545-5672591)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (7-374)||(42354594-42354961)
chr3 (127-374)||(10963095-10963343)
chr3 (127-374)||(10966604-10966852)
chr3 (88-374)||(30158214-30158509)
chr3 (127-374)||(10959588-10959836)
chr3 (110-374)||(2783789-2784057)
chr3 (11-374)||(9154387-9154751)
chr3 (108-374)||(9157658-9157924)
chr3 (129-374)||(29233769-29234013)
chr3 (89-374)||(2279801-2280085)
chr3 (112-374)||(44508481-44508744)
chr3 (129-374)||(5887165-5887409)
chr3 (127-374)||(18882901-18883149)
chr3 (129-374)||(5897149-5897393)
chr3 (129-374)||(23374911-23375155)
chr3 (129-374)||(6173534-6173778)
chr3 (129-374)||(16414937-16415180)
chr3 (129-374)||(18515911-18516154)
chr3 (129-374)||(16314771-16315014)
chr3 (129-374)||(18495765-18496008)
chr3 (200-374)||(19868744-19868918)
chr3 (86-242)||(25888727-25888884)
chr3 (200-374)||(4250148-4250321)
chr3 (200-374)||(28327206-28327379)
chr3 (200-374)||(28330531-28330704)
chr3 (128-350)||(20536784-20537004)
chr3 (200-374)||(3305612-3305785)
chr3 (200-374)||(27054633-27054806)
chr3 (286-374)||(4226034-4226122)
chr3 (281-374)||(54736313-54736406)
chr3 (175-374)||(18551406-18551604)
chr3 (304-374)||(25888651-25888727)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (88-374)||(37641513-37641803)
chr1 (131-374)||(28918065-28918310)
chr1 (127-374)||(17902970-17903217)
chr1 (86-374)||(49719500-49719790)
chr1 (86-361)||(49716017-49716293)
chr1 (129-374)||(16839116-16839360)
chr1 (129-374)||(16849046-16849290)
chr1 (129-371)||(20964148-20964389)
chr1 (129-374)||(24200427-24200670)
chr1 (129-374)||(20981051-20981295)
chr1 (200-374)||(23441467-23441640)
chr1 (200-374)||(33898088-33898261)
chr1 (200-374)||(34552867-34553040)
chr1 (200-374)||(18392155-18392328)
chr1 (247-374)||(3087908-3088035)
chr1 (200-374)||(6195580-6195753)
chr1 (287-374)||(50197143-50197230)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (127-374)||(22653949-22654198)
chr8 (127-374)||(14187688-14187937)
chr8 (88-374)||(5963902-5964192)
chr8 (127-370)||(27863741-27863986)
chr8 (128-374)||(20262246-20262491)
chr8 (128-374)||(21048876-21049121)
chr8 (86-374)||(30645120-30645409)
chr8 (129-374)||(24434723-24434967)
chr8 (129-374)||(24444769-24445013)
chr8 (129-374)||(17543742-17543986)
chr8 (129-374)||(24903667-24903910)
chr8 (129-374)||(17013215-17013459)
chr8 (37-311)||(18696171-18696449)
chr8 (118-374)||(31981038-31981284)
chr8 (37-374)||(31984592-31984925)
chr8 (199-374)||(9466889-9467063)
chr8 (200-374)||(5827789-5827962)
chr8 (200-369)||(39660145-39660313)
chr8 (200-374)||(13331851-13332024)
chr8 (127-248)||(452843-452954)
chr8 (25-133)||(23613140-23613248)
chr8 (37-133)||(18721693-18721790)
chr8 (37-133)||(25595069-25595166)
chr8 (43-128)||(25591890-25591976)
chr8 (269-316)||(452959-453006)
chr8 (86-123)||(45155692-45155729)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (88-374)||(26547739-26548029)
chr5 (88-374)||(26551298-26551588)
chr5 (127-374)||(4732014-4732263)
chr5 (110-374)||(28562542-28562810)
chr5 (110-374)||(28566110-28566378)
chr5 (86-374)||(34652938-34653225)
chr5 (127-374)||(25185073-25185322)
chr5 (127-374)||(19685855-19686105)
chr5 (127-374)||(19689238-19689488)
chr5 (129-374)||(26726638-26726881)
chr5 (196-374)||(17944409-17944586)
chr5 (200-374)||(33920904-33921077)
chr5 (239-371)||(40800102-40800234)
chr5 (200-374)||(1810591-1810765)
chr5 (110-292)||(2453008-2453186)
chr5 (200-374)||(26337745-26337918)
chr5 (200-377)||(9690525-9690701)
chr5 (202-370)||(2500195-2500362)
chr5 (204-374)||(33321107-33321276)
chr5 (222-343)||(3194943-3195063)
chr5 (86-165)||(3194845-3194925)
chr5 (13-78)||(21333149-21333213)
chr5 (13-78)||(21336165-21336229)
chr5 (41-78)||(39192043-39192080)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (107-374)||(14969334-14969603)
chr6 (86-374)||(11410411-11410700)
chr6 (127-374)||(17231545-17231791)
chr6 (129-374)||(22920220-22920464)
chr6 (142-374)||(13095881-13096112)
chr6 (127-374)||(34502024-34502278)
chr6 (128-374)||(2330318-2330565)
chr6 (86-374)||(31262427-31262706)
chr6 (127-374)||(17696276-17696525)
chr6 (149-342)||(3827018-3827225)
chr6 (196-374)||(9313968-9314145)
chr6 (196-374)||(28117598-28117775)
chr6 (200-374)||(12746568-12746741)
chr6 (200-374)||(35027316-35027489)
chr6 (208-374)||(5618492-5618656)
chr6 (200-374)||(28894664-28894837)
chr6 (128-374)||(2330981-2331217)
chr6 (200-371)||(33679375-33679544)
chr6 (127-343)||(31123117-31123334)
chr6 (128-297)||(7560435-7560605)
chr6 (314-374)||(5618397-5618457)
chr6 (286-374)||(15579098-15579186)
chr6 (37-133)||(23388511-23388608)
chr6 (196-264)||(22464173-22464240)
chr6 (25-133)||(9953572-9953679)
chr6 (322-375)||(11296320-11296373)
chr6 (86-133)||(5738496-5738543)
chr6 (110-155)||(20189837-20189882)
chr6 (110-155)||(22146109-22146154)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (37-374)||(53065-53405)
scaffold0062 (25-311)||(68027-68316)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (86-372)||(19704-19989)
scaffold0214 (86-374)||(13254-13542)
scaffold0214 (86-374)||(27270-27558)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (129-374)||(27053-27297)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (129-374)||(28843-29087)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (151-374)||(27062-27285)
scaffold0012 (129-275)||(31347-31492)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (43-374)||(5913-6221)
scaffold0360 (35-374)||(2075-2384)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (196-374)||(6996-7173)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (200-374)||(13354-13527)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (200-374)||(4021-4194)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (227-374)||(1192-1337)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (37-374)||(226950-227283)
[»] scaffold0911 (1 HSPs)
scaffold0911 (200-374)||(4327-4498)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (200-374)||(52881-53054)
scaffold0083 (200-374)||(29084-29257)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (270-368)||(2022-2120)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (38-78)||(26803-26843)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (86-133)||(5811-5858)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (89-133)||(62183-62227)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Original strand, 22256827 - 22257193
Alignment:
Q  7 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttcttt-att 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||        | |||||||||| ||| |||    
T  22256827 agagtgaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccg---tcgacgaaactctatcggtttattttctttattatgttgttttttttatt 22256923  T
Q  105 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtct 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22256924 taatcatgtctagttaatttcctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaacgttattcagtct 22257023  T
Q  205 ttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257024 ttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattga 22257123  T
Q  305 atgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257124 atgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 22257193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22233185 - 22232810
Alignment:
Q  7 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttcttt-att 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| ||| |||    
T  22233185 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccgatatcgatgaaactctatcggtttattttttttattatgttgttttttttatt 22233086  T
Q  105 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat------gtagttgatactctctttattattaatgttatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22233085 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatatgaatgtagttgatactctctttactattaatgttatt 22232986  T
Q  199 cagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232985 tagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagg 22232886  T
Q  299 aattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22232885 aattaaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacatagaaacctagagat 22232810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Original strand, 22253554 - 22253929
Alignment:
Q  7 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttcttt-att 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| ||| |||    
T  22253554 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccgatatcgatgaaactctatcggtttattttttttattatgttgttttttttatt 22253653  T
Q  105 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatat------gaatgtagttgatactctctttattattaatgttatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22253654 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatatgaatgtagttgatactctctttactattaatgttatt 22253753  T
Q  199 cagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagg 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253754 tagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagg 22253853  T
Q  299 aattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22253854 aattaaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacatagaaacctagagat 22253929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 20100331 - 20100579
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20100331 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 20100430  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20100431 tcattgctttt-atataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagaaattgaatgactattaaccctagctt 20100529  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20100530 ttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 20100579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 748471 - 748224
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  748471 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattctgtctttattcagaattacttgtgttc 748372  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  748371 attgttttttatatgactgctttgtatgacttttaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 748272  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  748271 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacatagatacctagagat 748224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5827138 - 5826891
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5827138 ttgattaagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 5827039  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5827038 cattg-ttttcaaataattgctttgtatgactattaaccatagcttcgtgcaattacatgaattgatattatgaattgaatgactgttaaccctaacttt 5826940  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5826939 taatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 5826891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11825828 - 11825538
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11825828 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 11825729  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11825728 attattaatgttattcaatctttattcagaattacttgtgttcattacttttcacataattgttttatatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 11825629  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11825628 tgtctcgatatcaggaattgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacatagaaacctagagat 11825538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 8397504 - 8397780
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttat 185  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||            |  |  ||    
T  8397504 tatgttgtttattcctttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagtcatgatgaacctattgtaatatatgaat------------cagtaaat 8397591  T
Q  186 tattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8397592 tattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgtttttcagataattgttttgtatgattattaaccctagcttcgtgcaattacatg 8397691  T
Q  286 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8397692 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagat 8397780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 26460157 - 26460401
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26460157 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 26460255  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26460256 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 26460353  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26460354 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 26460401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 129 - 334
Target Start/End: Original strand, 2349164 - 2349368
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2349164 tgattgagccatgataaacctattgtaatatgtaaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 2349263  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||| ||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2349264 atttctttttatat---tgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagaaattgaatgactattaaccctagctttt 2349360  T
Q  327 aatcctga 334  Q
    ||||||||    
T  2349361 aatcctga 2349368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23599189 - 23598946
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  23599189 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 23599091  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23599090 attgccttc-atataattgctt-gtatgactattaaccatagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 23598994  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598993 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 23598946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 151 - 374
Target Start/End: Original strand, 26182014 - 26182237
Alignment:
Q  151 ttgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctt 248  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26182014 ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctt 26182113  T
Q  249 tgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgt 348  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  26182114 -gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaagaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattttgt 26182211  T
Q  349 ttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26182212 ttgattcaacataggaacctagagat 26182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 710444 - 710200
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  710444 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 710346  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  710345 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaattgaatgactactaaccctagatttt 710248  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  710247 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 710200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 2251563 - 2251806
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  2251563 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtggttgatactctcttatttaataatattattcagcctttattcagaatcacttgtgttt 2251661  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2251662 attgctttc-atataattgcttt-tatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagttttt 2251758  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2251759 aatcctgaattactaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 2251806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3541524 - 3541351
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  3541524 agtcttcattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgaatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 3541426  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3541425 attaaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 3541351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22083798 - 22083626
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  22083798 agtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttagga 22083700  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22083699 attgaatgactactaatc-tagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 22083626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44018146 - 44017975
Alignment:
Q  202 tctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaat 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||    
T  44018146 tctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaat 44018048  T
Q  302 tgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44018047 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 44017975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 38431155 - 38431328
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  38431155 agtctttattcagaattatttgtgcttactgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagaa 38431253  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38431254 attgaatgactaccaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 38431328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12803620 - 12803448
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  12803620 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttatatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 12803522  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12803521 attgaatgactacta-ccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagat 12803448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 6964049 - 6964222
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | | || ||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  6964049 agtctttattcagaattattggtgcttaatgtttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaccttctttcaatcacataaattgatcttagga 6964147  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6964148 attgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagat 6964222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 26152913 - 26153086
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |  ||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  26152913 agtctttattcataattatttgtgcttaacgctttttttatgatt-ctttttatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 26153011  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26153012 attgaatgactactaaccctagcttttaatcttgaaatagtaattctgttttattcaacataggaacttagagat 26153086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 43548955 - 43549128
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||    
T  43548955 agtctttattcaaaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgaacttagga 43549053  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  43549054 attgattgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaatctaaagat 43549128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23467558 - 23467442
Alignment:
Q  86 actatgtt-gtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctt 182  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23467558 actatgttagtttatttctttaattatgtctagctaattcc-tttgattgagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctctt 23467460  T
Q  183 tattattaatgttattca 200  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  23467459 tattatcaatattattca 23467442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42606142 - 42606060
Alignment:
Q  145 aacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcatt 229  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42606142 aacctattgtaacatatgaat-tagttgatactctctttattgttaatgtaattcaatctttattcagaatta-ttgtgttcatt 42606060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23467437 - 23467349
Alignment:
Q  252 atgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaa-ttgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatag 339  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23467437 atgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaaatttaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatag 23467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 8276580 - 8276644
Alignment:
Q  13 aagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||||| |||||    
T  8276580 aagaacaacaccgattgaaagaaaattgaggagcaa-gccggcaacgacggaactctatcagttta 8276644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1503982 - 1503616
Alignment:
Q  6 gagagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnnactatgttgtttctttattt 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||| |||||||    
T  1503982 gagagagaa-aacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccgacatcgacgaaactctatcgatttattttcttactatgttgtttatttattt 1503884  T
Q  106 aatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1503883 aatcatgtctagctaattctctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctt 1503784  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  1503783 tattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgc-ttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 1503685  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1503684 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 1503616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1507177 - 1506820
Alignment:
Q  16 aacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1507177 aacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccgacatcgacgaaactctatcggtttattttcttactatgttgtttatttatttaatcatgtct 1507078  T
Q  116 agctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaat 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1507077 agctaattctctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctttattcagaat 1506978  T
Q  216 tacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaa 315  Q
    || |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1506977 tatttgtgttcattgtttttcatatgattgc-ttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaa 1506879  T
Q  316 ccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1506878 ccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 1506820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 18011637 - 18011886
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18011637 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatataaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttatttataattacttgtgt 18011736  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18011737 tcattgctttttatatagttgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctaactt 18011836  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18011837 ttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 18011886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 13517972 - 13518240
Alignment:
Q  110 atgtctagctaatt-ccct-ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517972 atgtctagctaatttccctcttgattaagctatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagtttatcctctctttattattaatgttattcagtctt 13518071  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518072 tattcaaaattacttgtgttcatagcttttcaaataattgatttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 13518171  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13518172 tgactattaaccctagcttttaatcatgaaatagtaatcctgtttgattcaacataagaacctagagat 13518240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 11059464 - 11059735
Alignment:
Q  110 atgtctagctaatt-ccct-ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttat---tcagt 202  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  11059464 atgtctagctaatttccctcttgattaagccatgatgaacctattgtaataaatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattattcagt 11059563  T
Q  203 ctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaatt 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11059564 ctttattcagagttacttgtgttcattgtttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaatt 11059663  T
Q  303 gaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11059664 gaatgactattaacactaacttttaatcatgaaatagtaatcctgtttgattcaacataagaacctagagat 11059735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 29435397 - 29435686
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctc 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  29435397 actatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaaactcttagtttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatattctc 29435495  T
Q  181 tttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaatt 280  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29435496 tt-attaataatgctattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaatt 29435592  T
Q  281 acatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29435593 acatgaattgatattaggaattgattgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgtttcaacataggaacctagagat 29435686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38326726 - 38326454
Alignment:
Q  103 tttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||     
T  38326726 tttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattggaatatatgaatcagtagttgaaactttctttattatcaatattattcc 38326627  T
Q  201 gtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaa 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  38326626 gtctttattcagaattatttgtgttcattacttttgatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 38326528  T
Q  301 ttgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38326527 ttgaatgactaccaaccctagcttttaatcctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagat 38326454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15704493 - 15704153
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgat 132  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | |   || ||    
T  15704493 attgaggagcaaagtcatcaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattcttagtttcat 15704394  T
Q  133 tgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15704393 tgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagaagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttatttagaattatttgtgttcattg 15704295  T
Q  231 ctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatc 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15704294 -tttttatataattgctt-gtatgactattaaccctaacttcctgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatc 15704197  T
Q  331 ctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15704196 ttgaaatagtaatagtgtttgattcaatatgggaacctagagat 15704153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 18938586 - 18938830
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18938586 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 18938684  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18938685 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 18938782  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18938783 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 18938830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 343
Target Start/End: Original strand, 38326033 - 38326274
Alignment:
Q  103 tttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||     
T  38326033 tttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattggaatatatgaatcagtagttgaaactttctttattatcaatattattcc 38326132  T
Q  201 gtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaa 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  38326133 gtctttattcagaattatttgtgttcattacttttgatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 38326231  T
Q  301 ttgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaat 343  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38326232 ttgaatgactaccaaccctagcttttaatcctgaaataataat 38326274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 22592206 - 22592450
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  22592206 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacatgtgttt 22592304  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22592305 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgagattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 22592402  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22592403 aatcatgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacttagagat 22592450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15719759 - 15719470
Alignment:
Q  25 gattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaatt 123  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  15719759 gattgagaaaagattgaggagcaaagtcatcaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaat 15719660  T
Q  124 ccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattac 218  Q
       |   || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719659 tattagtttcattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattac 15719561  T
Q  219 ttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgacta 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15719560 ttgtgttcattg-tttttatataattgc-ttatatgactattaaccctaacttcttgaaatcacatgaattgatattaggagttgaatgacta 15719470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 4577498 - 4577787
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctat---------tgtaatatatgaatgtagttgatac 176  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||||| |||||   ||| ||    
T  4577498 actatgttgtttatttctttaattatgtctagctaattccctttgattgagtcatgatgaacctatattacctattgtaatatataaatgt---tgacac 4577594  T
Q  177 tctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgc 276  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| |    
T  4577595 tctttttattatcaatattattcagt---tattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattg-tttgcatgactattaaccctatcttcttac 4577690  T
Q  277 aattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4577691 aatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaacc-tagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 4577787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40678128 - 40677955
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||    
T  40678128 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctagga 40678030  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40678029 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 40677955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 30719535 - 30719710
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatatt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  30719535 attcagtttttattcagaattatttaagttcattgctttttatatgatt---ttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatctt 30719631  T
Q  296 aggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30719632 aggaattgaatgactactaactctaacttttaatcctaaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 30719710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38316403 - 38316230
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  38316403 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgtttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccgtagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 38316305  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38316304 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacttagagat 38316230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11703137 - 11702770
Alignment:
Q  7 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttattt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||| |||||||    
T  11703137 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgccgacatcgacgaaattctatcggtttattttctttactatgttgtttatttattt 11703038  T
Q  106 aatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11703037 aatcatgtctagctaattctctttgattgagccatgataaacctattgtaatatatgaatgtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctt 11702938  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  11702937 tattcagaataatttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 11702839  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11702838 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 11702770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 18859424 - 18859714
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18859424 tatgttgtttattcgtttgatcatgtttagctaatttccttgttgattaagccatgatgaacctattgtaatatatgaattagtagttgatactctcttt 18859523  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18859524 attattaaaattattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcaaataattgatttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 18859623  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859624 tgaattgatattaggaattgaatgactattaacactagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 18859714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 3734005 - 3734249
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3734005 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 3734103  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3734104 attgcttttcatataattgctcgg-ataactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 3734201  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3734202 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 3734249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49636950 - 49636706
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49636950 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 49636852  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  49636851 attgcttttcatataattgctc-gtataactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 49636754  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49636753 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 49636706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49640243 - 49639999
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49640243 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 49640145  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  49640144 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 49640047  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49640046 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 49639999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3719923 - 3719679
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3719923 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 3719825  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3719824 attgatttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 3719727  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3719726 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 3719679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 14701597 - 14701841
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14701597 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttaatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 14701695  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14701696 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaattgaatgactactaaccctagctttt 14701793  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14701794 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 14701841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Original strand, 17670099 - 17670304
Alignment:
Q  135 agccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaat-------------tact 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  17670099 agccatgatgaacgtattgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaatctttattcaaaattact 17670198  T
Q  220 tgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccct 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670199 tgtgttcattgctttttaaataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccct 17670298  T
Q  320 agcttt 325  Q
    | ||||    
T  17670299 accttt 17670304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 10385611 - 10385880
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||              ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  10385611 actatgttgtttgtttctttattcatgtctagttaattctctttgattgagccatgat--------------atatgaattagtagttgaaactctcttt 10385696  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10385697 attatcaatattattcagtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgctt-gcatgactattaaccctagcttcttgcaatcaca 10385795  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||      ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10385796 taaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgatatagta------tttaattcaacataggaacctagagat 10385880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 10247452 - 10247756
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttat 185  Q
    |||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||    
T  10247452 tatgttgtttattcctttaat-atgtctagttaattccatttgattgagtcacgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttaaaactctttttat 10247550  T
Q  186 tattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctt-----------------tgtatgactattaaccttag 268  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||| ||                 || ||||||||||||| ||     
T  10247551 tatcaatattattcagtctttattcagaattatctgtgttcattgcctttcatatgattgtttgcattgtttgcattgtttgcatgactattaaccctaa 10247650  T
Q  269 cttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacct 368  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10247651 cttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacct 10247750  T
Q  369 agagat 374  Q
    ||||||    
T  10247751 agagat 10247756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 56089670 - 56089497
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  56089670 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 56089572  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56089571 attgaatgaccactaaccctagcttttaatcttgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 56089497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 13978896 - 13979069
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  13978896 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttctgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 13978994  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13978995 attgaatgaccactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 13979069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33400790 - 33400546
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttat 185  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  |||           |||||||| |    
T  33400790 actatgttgtttattc-tttaatcatgtctatctaattccctttgattgaaccataatgaacctattataaaattggaa-----------ctctctttgt 33400703  T
Q  186 tattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatg 285  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  33400702 tatcaatattattcggtctttattcagaattatttatgttaattgcttttcatatgattg-tttgcttgactattaaccctagcttcttgcaatcacata 33400604  T
Q  286 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaat 343  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  33400603 aattgatcttagtaattgaatgactactaaccctaacttttaattctgaaatagtaat 33400546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26703847 - 26703674
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  26703847 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcatataaattgatcttagga 26703749  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26703748 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagat 26703674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 350
Target Start/End: Original strand, 23652968 - 23653195
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat---gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23652968 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatgtgaaccaagtagttga-actctctttattatcaatgttattcaatctttattcagaattatttgtg 23653066  T
Q  224 ttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagg---aattgaatgactattaacccta 320  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| | || |||||| |||| |  | ||||||| | |||    ||| | |||||| ||||||||    
T  23653067 ttcattgcttttattatgattg-tttgcatgactattaaacctaacttctttcaatcatgttaattgatctcaggtattattaattgactactaacccta 23653165  T
Q  321 gctttcaatcctgaaatagtaatcctgttt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23653166 gcttttaatcctgaaatagtaattctgttt 23653195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 370
Target Start/End: Original strand, 15850935 - 15851104
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| |||| || ||||||    
T  15850935 agtctttattcaaaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactaataaccctaacttctttcaatcacataaatttatcttagga 15851033  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15851034 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctag 15851104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 343
Target Start/End: Original strand, 11560500 - 11560718
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatga---atgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtg 223  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||   | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  11560500 tttgattgagacatgatgaatctattgtaatatgtgatccaagtagttgaaactctctttattatcaatgttatacaatctttattcaaaattatttgtg 11560599  T
Q  224 ttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagct 323  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||  | | |  | ||||||  ||||| ||| | |||||| |||||||| ||    
T  11560600 ttcattgcttttattatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttttagtcatgttaattgaccttaggtattaattgactagtaaccctatct 11560698  T
Q  324 ttcaatcctgaaatagtaat 343  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  11560699 tttaatcctaaaatagtaat 11560718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 337
Target Start/End: Original strand, 19928666 - 19928802
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  19928666 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttctgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 19928764  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaat 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  19928765 attgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaat 19928802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Original strand, 5670226 - 5670272
Alignment:
Q  87 ctatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5670226 ctatgttgtttatttctttaatcatgtctagctaatttcctttgatt 5670272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33410465 - 33410412
Alignment:
Q  25 gattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33410465 gattgaaagaagattgagaagcaccgtcgaaaacgacggaactctatcggttta 33410412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Original strand, 27013926 - 27013973
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27013926 actatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgatt 27013973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Original strand, 5672545 - 5672591
Alignment:
Q  87 ctatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5672545 ctatgttgtttatttctttaatcatgtctagctaattttctttgatt 5672591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42354961 - 42354594
Alignment:
Q  7 agagagaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn--actatgttgtttctttatt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  42354961 agagagaagaacaacaaagattgaaagaagattgaggagcaacgccgacatcgacgaaactctatcggtttatttttttttactatgttgtttctttatt 42354862  T
Q  105 taatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtct 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  42354861 taatcatgtctagctaattcc-tttgattgagtcatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgaaattgtctttattatcaatattattcagtct 42354763  T
Q  205 ttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattga 304  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  42354762 ttattcagaatcatttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattga 42354664  T
Q  305 atgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42354663 atgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 42354594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 10963095 - 10963343
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10963095 tttgattgagccatgatgaaccttttgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacgtgtgt 10963194  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963195 tcattgcttttcatataattg-tttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 10963293  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963294 ttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 10963343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 10966604 - 10966852
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966604 tttgattgagccatgatgaaccttttgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacgtgtgt 10966703  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966704 tcattgcttttcatataattg-tttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 10966802  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966803 ttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 10966852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30158509 - 30158214
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30158509 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttattgattaagccatgatgaccctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 30158410  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt-----cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30158409 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaa 30158310  T
Q  279 ttacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158309 ttacatgaattgatattatgaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 30158214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 10959588 - 10959836
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10959588 tttgattgaggcatgatgaaccttttgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagcctttattcagaattacttgtgt 10959687  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10959688 tcattgcttttcatataattgctt-gtatgactatcaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 10959786  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10959787 ttaattctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 10959836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 2783789 - 2784057
Alignment:
Q  110 atgtctagctaatt-ccct-ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatg--tagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2783789 atgtctagctaatttccctcttgattaagccatgatgaatctattgtaatatatgaatgagtagttgatcctctctttagtattaatgttattcagtctt 2783888  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2783889 tattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattaggaattgaa 2783988  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2783989 tgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 2784057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 9154387 - 9154751
Alignment:
Q  11 agaagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatc 109  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||        |||||||||||| | |||||||||    
T  9154387 agaagaacaacacgaattggaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacggaactttatctgtttattttttttactatgttgtttatgtatttaatc 9154486  T
Q  110 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtcttta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||  || ||| || |||||||    
T  9154487 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttga-aatctctttattatcgatattactcggtcttta 9154585  T
Q  208 ttcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatg 307  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||| | || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9154586 ttcagaattatttgtattcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactagtaatcctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaatg 9154684  T
Q  308 actattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9154685 actactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattatatttaattcaacataggaacctagagat 9154751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Original strand, 9157658 - 9157924
Alignment:
Q  108 tcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9157658 tcatgtctagctaatttcctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttga-actctctttattatcaatattattcagtctt 9157756  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  9157757 tattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactagtaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 9157855  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9157856 tgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagat 9157924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29234013 - 29233769
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29234013 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcgtatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 29233915  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29233914 attgtttttcatataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 29233817  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233816 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 29233769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2280085 - 2279801
Alignment:
Q  89 atgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttatt 186  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||    
T  2280085 atgttgtttgtttctttattcatgtctagctaatttcatatgattgagccatgatgaacct-ttataatatatgatttagtagctgatactctcttattt 2279987  T
Q  187 attaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatga 286  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2279986 aataatgttattcagtttttattcagaattatttgtgttcattgctttc-atttaattgcct-gtatgactattaaccttagcttcttgaaattacatga 2279889  T
Q  287 attgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2279888 attgatattaggaattgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaattagtaattttgtttgattcaacataggaacctagagat 2279801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 112 - 374
Target Start/End: Original strand, 44508481 - 44508744
Alignment:
Q  112 gtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttatt 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44508481 gtctagttaattccctttaattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttaaaactctctttattatcaatattattcaatctttatt 44508580  T
Q  210 cagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgac 309  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  44508581 cagaattatttgtgttcattgtttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaagaattgaatgac 44508679  T
Q  310 tattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44508680 tactaacccgagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacacaggaacctagagat 44508744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5887409 - 5887165
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5887409 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 5887311  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5887310 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 5887213  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887212 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 5887165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 18882901 - 18883149
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18882901 tttgattgagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgaaaatctctttattatcaatattattcagtctttattcagaattatttgtgt 18883000  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18883001 tcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttagggattaaatgactactaaccctagctt 18883099  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18883100 ttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 18883149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5897393 - 5897149
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5897393 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 5897295  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5897294 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttctta-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 5897197  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5897196 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 5897149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23375155 - 23374911
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23375155 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtttttattcagaattatttgtgttc 23375057  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  23375056 attgcttttcatataattgctc-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgacttttaaccctatctttt 23374959  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374958 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 23374911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6173778 - 6173534
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6173778 tgattaagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttc 6173680  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||     
T  6173679 attgctttc-atttaattg-tttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgaccactaaccctagatttt 6173582  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6173581 aatcctgaattagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagat 6173534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16415180 - 16414937
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  16415180 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcgcttgtgttt 16415082  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16415081 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattatgaattaaatgactattaaccctagctttt 16414985  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16414984 aatcttgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 16414937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18516154 - 18515911
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  18516154 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcgcttgtgttt 18516056  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18516055 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattatgaattaaatgactattaaccctagctttt 18515959  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18515958 aatcttgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 18515911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16315014 - 16314771
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  16315014 tgattgagccataatgaacct-ttgtgatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttatgttt 16314916  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16314915 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagatttt 16314819  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16314818 aatcctgaattagtaattctgttcgattcaacataggaacctagagat 16314771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18496008 - 18495765
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  18496008 tgattgagccataatgaacct-ttgtgatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttatgttt 18495910  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18495909 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagatttt 18495813  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18495812 aatcctgaattagtaattctgttcgattcaacataggaacctagagat 18495765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 19868744 - 19868918
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  19868744 agtctttattcagaattatttgtgtttgttgcttttcatatgattgctttgcatgactattaaccctagcttcttccaattacataaattgatcttagga 19868843  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19868844 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagat 19868918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25888884 - 25888727
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25888884 actatgttgtttattcctttaatcatgtctagctaattct-tttgattaagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 25888786  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25888785 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgttttttacataa 25888727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 4250148 - 4250321
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  4250148 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 4250246  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4250247 attgaatgactactaaccctagcttttaatcttgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 4250321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 28327206 - 28327379
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||    
T  28327206 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctagga 28327304  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28327305 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 28327379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 28330531 - 28330704
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||    
T  28330531 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctagga 28330629  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28330630 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 28330704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20537004 - 20536784
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||| |  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20537004 ttgattgaaacatgatgaacctatggtaatatgtgaatcagtggttgaaa--ctctttattatcaatattatgcagtctttattcaaaattatttgtgtt 20536907  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20536906 cattgcttttcttatgattg-tttgtatgactattaaccctaacttctt-caatcatattaattgatcttaggaattaattgactattaaccctatcttt 20536809  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgttt 350  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  20536808 taatcctgaaatagtaattctgttt 20536784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 3305612 - 3305785
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |    
T  3305612 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgataatagaa 3305710  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3305711 attgaatgactactaaccctaacttttaataatgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 3305785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 27054633 - 27054806
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  27054633 agtcattattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 27054731  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27054732 attaaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaatataggaacctagagat 27054806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4226122 - 4226034
Alignment:
Q  286 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4226122 aattgatcttagaaattgaatgattgctaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagat 4226034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54736406 - 54736313
Alignment:
Q  281 acatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  54736406 acataaattgatcttaagaattgaatcgctactaatcctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaatataggaacctagagat 54736313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Original strand, 18551406 - 18551604
Alignment:
Q  175 actctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttctt 274  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    || | |||| ||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18551406 actctctttattatcaataacattcagtctttattcagaattatacatgcttattgattttcttatgattg-tttgtatggctactaaccctagcttctt 18551504  T
Q  275 gcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     |||||  || ||||||| |||||| || | |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||| ||||||||    
T  18551505 tcaattgtattaattgatcttaggagttaattgactactaaccctagctattaaacctgaaatagtgattctgtttgactttacatatgaaactagagat 18551604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25888727 - 25888651
Alignment:
Q  304 aatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatag------taatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25888727 aatgactattaaccctaccttttaatcctgaaatagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 25888651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 37641513 - 37641803
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37641513 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagccatgataaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 37641612  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37641613 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 37641712  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37641713 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 37641803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 131 - 374
Target Start/End: Original strand, 28918065 - 28918310
Alignment:
Q  131 attgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28918065 attgagccatgatgaaccttttgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcat 28918164  T
Q  229 tgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaa 328  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28918165 tgcttttcatataattgtgttgtatgactattaaccctagcatcatgaaattaaataaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaa 28918264  T
Q  329 tcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28918265 tcctgaaatagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 28918310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17903217 - 17902970
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17903217 tttgattgagccatgatgaacattttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttaattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 17903118  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17903117 tcattgctttc-atataatttctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctaactt 17903020  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17903019 ttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaatctagagat 17902970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 49719500 - 49719790
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctc 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  49719500 actatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaaactcttagtttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatattctc 49719598  T
Q  181 tttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaatt 280  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49719599 tt-attaataatgctattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaatt 49719695  T
Q  281 acatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctg-aaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49719696 acatgaattgatattaggaattgattgactactaaccctagcttttaatcttgaaaaaagtaatactgtttgattcaacataggaacctagagat 49719790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 361
Target Start/End: Original strand, 49716017 - 49716293
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctc 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  49716017 actatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaaactcttagtttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatattctc 49716115  T
Q  181 tttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaatt 280  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49716116 tt-attaataatgctattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaatt 49716212  T
Q  281 acatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacata 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49716213 acatgaattgatattaggaattgattgactactaaccctagcttttaatcttgaaatagtaatactgtttgattcaacata 49716293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16839360 - 16839116
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16839360 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 16839262  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16839261 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 16839164  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16839163 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 16839116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16849290 - 16849046
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16849290 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 16849192  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16849191 attgcttttcatataattgctcgg-atgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactcttaaccctagctttt 16849094  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16849093 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 16849046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 371
Target Start/End: Original strand, 20964148 - 20964389
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20964148 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatgttattcagtctttattcagaattatttgtgttc 20964246  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20964247 attgctttc-atttaattgctt-gtatgactattaaccatagcttcttgaaattacatgtattgatattaggaattgaatgactactaaccctagctttt 20964344  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctaga 371  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20964345 aatcctgaattagtaattttgtttgattcaacataggaacctaga 20964389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24200670 - 24200427
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  24200670 tgattgagcaatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcaaaatcacttgtgttt 24200572  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24200571 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 24200475  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24200474 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 24200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 20981051 - 20981295
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20981051 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactatcttatttaataatgttattcagtctatattcagaattatttgtgttc 20981149  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  20981150 attgctttc-atttaattgcat-gtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaagaattgaatgactactaaccctagctttt 20981247  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20981248 aatcctgaattaataattttgtttgattcaacataggaacctagagat 20981295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23441640 - 23441467
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||||    
T  23441640 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctagga 23441542  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23441541 attgaatgactactaaccctagctttttatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 23441467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 33898088 - 33898261
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  33898088 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgttagga 33898186  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33898187 attgaatgactactaaccctagcttttaatcttgaattagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 33898261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34553040 - 34552867
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  34553040 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgttttttttatgattg-tttgtatgactactaaccctagtttctttcaatcacataaattgatcttagta 34552942  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34552941 attgaatgactattaaccctatcttttaatcctgaaatagtaattctgttttattcaacataggaacctagagat 34552867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 18392155 - 18392328
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  18392155 agtctttattcagaattatttgtgcttaatggttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagaa 18392253  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392254 attgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 18392328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3088035 - 3087908
Alignment:
Q  247 tttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcct 346  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||  | || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3088035 tttgtatgactaataaccctaacttctttcaaccatataaattgatcttaggaattgaataactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattct 3087936  T
Q  347 gtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3087935 gtttaattcaacataggaacctagagat 3087908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 6195580 - 6195753
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  6195580 agtctttattcagaattatttgtgcttaacgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctggcttctttcaatcacataaattgatcttagga 6195678  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6195679 attgaatgactaccaaccataacttttaatcttgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagat 6195753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50197230 - 50197143
Alignment:
Q  287 attgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50197230 attgatcttaggaattgaatgactactaactctagcttttaatcttgaaatagttattctgtttaattcaacataggaacctagagat 50197143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 22653949 - 22654198
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatg--tagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22653949 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcaatagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 22654048  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22654049 tcattgctttttatattattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccccaactt 22654148  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22654149 ttaatcctgaaatagtaatcttgtttgattcaacataggaacctagagat 22654198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 14187688 - 14187937
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14187688 tttgatcgagccatgataaatctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 14187787  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14187788 tcattgctttttatataattgctttgtatgactataaaccctaacttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 14187887  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14187888 ttaatcctgaagtagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 14187937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 5963902 - 5964192
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  5963902 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagccatgatgatcctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctgt 5964001  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5964002 attattaatgcgattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 5964101  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5964102 tgaattgatattaggaattgaatgactattaacactagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 5964192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 127 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27863986 - 27863741
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27863986 tttgattgagccatgatgaacctattgtactatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 27863887  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27863886 tcattgctttttatatgattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatcttaggaattgaatgactattaaccctaactt 27863787  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctag 370  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27863786 ttaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacataggaacctag 27863741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Original strand, 20262246 - 20262491
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20262246 ttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 20262344  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20262345 cattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 20262442  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20262443 taatccagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 20262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Original strand, 21048876 - 21049121
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21048876 ttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 21048974  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21048975 cattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 21049072  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21049073 taatccagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 21049121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 30645120 - 30645409
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatg--tagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  30645120 actatgttgtttattcctttaatcatgtctaactaattccctttgattgagttatgatgaacctattgtaatatatgaattaatagttgaaactctcttt 30645219  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||    
T  30645220 attattaatattatccagtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttgatatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcaca 30645318  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30645319 taaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaacttttaattttgaaatagtaattctgtttaattcaacataagaacctagagat 30645409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 24434723 - 24434967
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24434723 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 24434821  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24434822 attgcttttcatataattactc-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 24434919  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24434920 aatcctgaattaataattctgtttggttcaacataggaacctagagat 24434967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 24444769 - 24445013
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24444769 tgattgagccatgatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 24444867  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  24444868 atttcttttcatataattactc-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaatcctagctttt 24444965  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24444966 aatcctgaattaataattctgtttggttcaacataggaacctagagat 24445013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 17543742 - 17543986
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17543742 tgatttagccatgatgaactt-tcgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 17543840  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17543841 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttattgaatttatatgaattgatattatgaattgaatgactattaaccctagctttt 17543938  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17543939 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 17543986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24903910 - 24903667
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  24903910 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatggtttagtagttgatactctcttatttaata-tattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 24903813  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  24903812 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaattgaatgactactaaccctagctttt 24903715  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24903714 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaagctagagat 24903667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17013459 - 17013215
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17013459 tgatttagccatgatgaactt-tcgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataataatattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 17013361  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17013360 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttattgaatttatatgaattgatattatgaattgaatgactattaaccctagctttt 17013263  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013262 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 17013215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18696449 - 18696171
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgat 132  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | |   || ||    
T  18696449 attgaggagcaaagtcatcaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattcttagtttcat 18696350  T
Q  133 tgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18696349 tgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagaagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttatttagaattatttgtgttcattg 18696251  T
Q  231 ctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagctt-cttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgacta 311  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696250 -tttttatataattgc-ttgtatgactattaaccctaacttccttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgacta 18696171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 374
Target Start/End: Original strand, 31981038 - 31981284
Alignment:
Q  118 ctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||           |||    
T  31981038 ctaattccctttgattgagccatgataaacctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctttttattatcaatattattcag-----------aat 31981126  T
Q  216 tacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaa 315  Q
    || |||||||||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31981127 tatttgtgttcattgattttcatatgattg-tttcaatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatattaggaattgaatgactactaa 31981225  T
Q  316 ccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31981226 ccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 31981284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 31984592 - 31984925
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattga 135  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||  ||| || |||| || |||||||||||||||||     
T  31984592 attgaggagtaaagccgacaacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttattcctttgat-atgtttaactaattccctttgattgg 31984690  T
Q  136 gccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttatt-----attaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||     || ||| ||||||||||||||||          ||| |||||    
T  31984691 gccatgataaacctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctttttattttattatcaatattattcagtctttatt----------tgtattcat 31984780  T
Q  229 tgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaa 328  Q
    ||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||    
T  31984781 tgcttttcatatgattggtt-gcatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaatcatagcttttaa 31984879  T
Q  329 tcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31984880 tcctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagat 31984925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 374
Target Start/End: Original strand, 9466889 - 9467063
Alignment:
Q  199 cagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagg 298  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  9466889 cagtctttattcataattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagg 9466987  T
Q  299 aattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9466988 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 9467063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 5827789 - 5827962
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| || ||||||    
T  5827789 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcttatgattg-tttgcttgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattaatcttagga 5827887  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5827888 attgaatgactactaaccctagcttttaattctgaaagagtaattctgtttaattcaacataggaacctcgagat 5827962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39660313 - 39660145
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  39660313 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 39660215  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  39660214 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaaccta 39660145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 13331851 - 13332024
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  13331851 agtctttattcataattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-ttcgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 13331949  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13331950 attgaatgactactaaccctagcttttaattctgaaatagtaattctgtttaattcatcataggaacctagagat 13332024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Original strand, 452843 - 452954
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452843 tttgattgagctatgatgaatct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactct----------aatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 452931  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctt 248  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  452932 tcattgctttct-tataattgctt 452954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 23613140 - 23613248
Alignment:
Q  25 gattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaatt 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  23613140 gattgaaagaagattgag-agcaacgtcgacaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttatttatgtatttaaccatgtctagctaatt 23613238  T
Q  124 ccctttgatt 133  Q
     |||||||||    
T  23613239 tcctttgatt 23613248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18721790 - 18721693
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18721790 attgaggagcaacgccgacaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgatt 18721693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25595166 - 25595069
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25595166 attgaggagcaacgccgacaacgacgaaactctatcggtttattttttttactatgttgtttatgtatttaatcatgtctagctaatttccattgatt 25595069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25591976 - 25591890
Alignment:
Q  43 gagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25591976 gagcaacgtcgacaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaatcatgtctagctaatttcctt 25591890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Original strand, 452959 - 453006
Alignment:
Q  269 cttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaac 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  452959 cttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgattgactactaac 453006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 45155729 - 45155692
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaatt 123  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45155729 actatgttgtttatttctttaatcatgtctagctaatt 45155692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 26547739 - 26548029
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26547739 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagccatgatgaacctattttaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 26547838  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26547839 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 26547938  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26547939 tgaattgatattaggaattgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 26548029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 88 - 374
Target Start/End: Original strand, 26551298 - 26551588
Alignment:
Q  88 tatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26551298 tatgttgtttattcgtttgatcatgtctagctaatttccttgttgattaagccatgatgaacctattttaatatatgaatcagtagttgatactctcttt 26551397  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26551398 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattaca 26551497  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26551498 tgaattgatattaggaattgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 26551588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4732263 - 4732014
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4732263 tttgattgagccatgttgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatcttctctttattattaatcttattcagtctttattcagaattacttgtgt 4732164  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4732163 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattggatgactattaaccctagctt 4732064  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4732063 ttaatcatgaaatagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagat 4732014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28562810 - 28562542
Alignment:
Q  110 atgtctagctaatt-ccct-ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28562810 atgtctagctaatttccctcttgattaagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgatcctctctttattattaatgttattcagtctt 28562711  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28562710 tattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattaggaattgaa 28562611  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28562610 tgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 28562542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28566378 - 28566110
Alignment:
Q  110 atgtctagctaatt-ccct-ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctt 205  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566378 atgtctagctaatttccctcttgattaagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgatcctctctttattattaatgttattcagtctt 28566279  T
Q  206 tattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28566278 tattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattaggaattgaa 28566179  T
Q  306 tgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566178 tgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 28566110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34653225 - 34652938
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctt-tatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctt 182  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34653225 actatgttgtttattctttttaatcatgtctagctaattccatttgattgagccatga---atctattgtaatatatgaattagtagttgaaactctctt 34653129  T
Q  183 tattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattac 282  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  34653128 tattatcaatattattcagtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcac 34653030  T
Q  283 atgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34653029 ataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaataataattttgtttaattcaacataggaacctagagat 34652938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 25185073 - 25185322
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25185073 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttgttattaatattattcaatctttatttagaaatacttgtgt 25185172  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25185173 tcattgctttttatatgattgttttatatgactaataaccctagcttcttgcaatcacataaattgattttaggaattgaatgactattaaccctagctt 25185272  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | |||||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25185273 ttaatcctaaaatactagctctgtttaattcatcataggaacctagagat 25185322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 19685855 - 19686105
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19685855 tttgattgagccatgataaatctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctttattcagaattatttgtgt 19685954  T
Q  225 tcattgctttttatata--attgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagc 322  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19685955 tcattgcttttcatatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactaataaccctagc 19686053  T
Q  323 tttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19686054 ttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 19686105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 19689238 - 19689488
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689238 tttgattgagccatgatgaatctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctttattcagaattatttgtgt 19689337  T
Q  225 tcattgctttttatata--attgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagc 322  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19689338 tcattgcttttcatatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaac 19689436  T
Q  323 tttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19689437 ttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 19689488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 26726638 - 26726881
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  26726638 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattaagtctttattcagaatcacttgtgttt 26726736  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26726737 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccatagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 26726833  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26726834 aatcctgaattagtaaatctgtttgattcaacataggaacctagagat 26726881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 17944409 - 17944586
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  17944409 attcagtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatctt 17944507  T
Q  296 aggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17944508 aggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 17944586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 33920904 - 33921077
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  33920904 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 33921002  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33921003 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 33921077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40800234 - 40800102
Alignment:
Q  239 ataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaata 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  40800234 ataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaacactaccttttaatcctgaaata 40800135  T
Q  339 gtaatcctgtttgattcaacataggaacctaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40800134 gtaatcctgtttgattcaacataggaacctaga 40800102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1810765 - 1810591
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||| |    
T  1810765 agtctttattgagaattatttgtgttcattgtttttcatatgattgttttgcatgactattaaccctaacttcttacaattacataaattgatcttagaa 1810666  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1810665 attgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaattgtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 1810591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 292
Target Start/End: Original strand, 2453008 - 2453186
Alignment:
Q  110 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtcttta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2453008 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaattagtagttgaaactct-tttattatcaatattattcagtcttta 2453106  T
Q  208 ttcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgat 292  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||     ||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||    
T  2453107 ttcagaattatttgtattcattgcttttcatatgattgc-----atgactattaaccctaacttcttgcaaccacataaattgat 2453186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 26337745 - 26337918
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||| | || ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  26337745 agtctttattcagaattatttgtgtttattgcttttcgtatgattg-tatgaatgactattaaccctagtttctttcaatcacataaattgatcttagga 26337843  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26337844 attgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattctgtttaattcaacataagaacctagagat 26337918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Original strand, 9690525 - 9690701
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||| |||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||| ||||||    
T  9690525 agtctttattcataattatttgtgttcattgcttttcgtacgattg-tttgcatgactattaaccctagcttatttcaatcacataaattgatcttagga 9690623  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagatgtg 377  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9690624 attgaacgactactaaccctagtttttaatcctgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagatgtg 9690701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2500362 - 2500195
Alignment:
Q  202 tctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaat 301  Q
    ||||||||||||| || ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2500362 tctttattcagaaatatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 2500264  T
Q  302 tgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2500263 tgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctag 2500195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33321276 - 33321107
Alignment:
Q  204 tttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattg 303  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  33321276 tttattcaaaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattg 33321178  T
Q  304 aatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33321177 aatgactactagccctaacttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 33321107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 343
Target Start/End: Original strand, 3194943 - 3195063
Alignment:
Q  222 tgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctag 321  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3194943 tgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccttag 3195041  T
Q  322 ctttcaatcctgaaatagtaat 343  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  3195042 cttttaatcctgaaataataat 3195063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Original strand, 3194845 - 3194925
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctt-tatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat 165  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3194845 actatgttgtttattctttttaatcatgtatagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat 3194925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21333213 - 21333149
Alignment:
Q  13 aagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||    
T  21333213 aagaacaacaccgattgaaagaaaattgaggagcaa-gccggcagcgacggaactctatcggttta 21333149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21336229 - 21336165
Alignment:
Q  13 aagaacaacacagattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||    
T  21336229 aagaacaacaccgattgaaagaaaattgaggagcaa-gccggcagcgacggaactctatcggttta 21336165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 78
Target Start/End: Original strand, 39192043 - 39192080
Alignment:
Q  41 aggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39192043 aggagcaacgtcgacaacgacgaaactctatcgattta 39192080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 107 - 374
Target Start/End: Original strand, 14969334 - 14969603
Alignment:
Q  107 atcatgtctagctaattccctt--tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagt 202  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969334 atcatgtcttgctaatttccttgttgattaagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgatactctctttattattaatgttattcagt 14969433  T
Q  203 ctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969434 ctttattcagaattacttgt--tcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaatt 14969531  T
Q  303 gaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969532 gaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 14969603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 11410411 - 11410700
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctc 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11410411 actatgttgtttatttatttgatcatgtctagctaaactcttagtttgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctc 11410509  T
Q  181 tttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaatt 280  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11410510 tt-attaataatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtccattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaatt 11410606  T
Q  281 acatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11410607 acatgaattgatattaggaattgattgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggatcctagagat 11410700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 17231545 - 17231791
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17231545 tttgattgagccatgatgaagct-ttgtaatatatgaattagtagtcgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgt 17231643  T
Q  225 tcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctt 324  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17231644 tcattgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctatcttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctatctt 17231741  T
Q  325 tcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17231742 ttaattctgaaattgtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 17231791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 22920220 - 22920464
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22920220 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagagttatttgtgttc 22920318  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22920319 attgcttttcatataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 22920416  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22920417 tatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 22920464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13096112 - 13095881
Alignment:
Q  142 atgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttata 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||    
T  13096112 atgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattaataatgttattcagtctttattcagaattacttgtattcattgatttc-ata 13096015  T
Q  240 taattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatag 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||    
T  13096014 taattgctt-gtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactactaaccctaacttttaatcatgaaatag 13095916  T
Q  340 taatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095915 taatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 13095881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 34502024 - 34502278
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaat------atatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattac 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34502024 tttgattgagccatgatgaatctattgtaattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctttattcagaattat 34502123  T
Q  219 ttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccc 318  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34502124 ttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccc 34502222  T
Q  319 tagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34502223 tagcttttaatcttgaagtagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 34502278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Original strand, 2330318 - 2330565
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2330318 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatggatcagtagttgaagctctctttattatcaatattattcagtctttattcataattatttgtgtt 2330417  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    ||||| |||| |||| |||  |||| ||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2330418 cattgtttttcatatgatta-tttgcatgactattaactctagattctttcaataacataaattgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttt 2330516  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2330517 taatcctgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagat 2330565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 31262427 - 31262706
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttat 185  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| | | ||       ||| |||| |||||||||||    
T  31262427 actatgttgtttatttctttaatcatatctaactaatttcctttgattaagccaagatgaatctat-gaatta-------gtatttgaaactctctttat 31262518  T
Q  186 tattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatg 285  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||     
T  31262519 tatcaattttattcggtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattg-tttgcatgattattaactctaacttcttgcaatcacata 31262617  T
Q  286 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31262618 aattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtagttctgtttaattcaacataggaacctagagat 31262706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Original strand, 17696276 - 17696525
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatg-ttattcagtctttattcagaattacttgtg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17696276 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttga-actctctttattatcaatgattattcagtctttatttagaattatttgtg 17696374  T
Q  224 ttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagct 323  Q
    ||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||    
T  17696375 ttcatcgcttttcatatgactg-tttgtatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttagaaattgaatgactactagccctggct 17696473  T
Q  324 ttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaaca-taggaacctagagat 374  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17696474 cttaatcctgaaattgtaattctgtttaactcaacactaggaacctagagat 17696525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 149 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3827225 - 3827018
Alignment:
Q  149 tattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgc 246  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  3827225 tattgtattatatgaattagtagttgatactct-tttattattaatgttattcagtctttattcagaattatttgtatttattgttttttatataattgc 3827127  T
Q  247 tttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaa-------------ttgaatgactattaaccctagctttcaatcctg 333  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3827126 tttgtatgactattaaccctaacttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctg 3827027  T
Q  334 aaatagtaa 342  Q
    |||||||||    
T  3827026 aaatagtaa 3827018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9314145 - 9313968
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||    
T  9314145 attcagtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttattgcaatcacataaattgatctt 9314047  T
Q  296 aggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9314046 aggaattgaatgactactaaccatagctcttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 9313968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 28117598 - 28117775
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  28117598 attcagtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgttttc-atgattattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatttt 28117696  T
Q  296 aggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28117697 aggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagat 28117775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 12746568 - 12746741
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  12746568 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 12746666  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12746667 attgaatgactactaaccctagcttttaatcgtgaaatagtaattctgtttaattcaacatatgaacctagagat 12746741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35027489 - 35027316
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  35027489 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttatatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 35027391  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35027390 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 35027316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 208 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5618656 - 5618492
Alignment:
Q  208 ttcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatg 307  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  5618656 ttcataattatttgtgtttattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgat-ttaagaattgaatg 5618559  T
Q  308 actattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5618558 acttctaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 5618492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28894837 - 28894664
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  28894837 agtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 28894739  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28894738 attgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacatagaaacctagagat 28894664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Original strand, 2330981 - 2331217
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||            ||||| |||||||    
T  2330981 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatggatcagtagttgaagctctctttattatcaatattattcat-----------aattatttgtgtt 2331069  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttt 325  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| | | ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  2331070 cattgcttttcatatgattg-tttgcatgactattgatcctagcttctttcaataacataaattgatcttaggaattgaatgactactaacaccagcttt 2331168  T
Q  326 caatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     |||| |||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2331169 taatcatgaaatatcaattctgtttaattcaacgtaggaacctagagat 2331217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33679544 - 33679375
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||| |||| || ||||||    
T  33679544 agtctttatttagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaaccctaacttctttcaatcacataaatttatcttagga 33679446  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctaga 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||    
T  33679445 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattatg-ttaattcaacctaggaacctaga 33679375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 343
Target Start/End: Original strand, 31123117 - 31123334
Alignment:
Q  127 tttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat---gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtg 223  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||     
T  31123117 tttgattgagccattatgaagctattgtaatatgtgaaccaagtagttga-actctctttattataaatgatatgtagtctttattcagaattatttgtt 31123215  T
Q  224 ttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagct 323  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |  | ||||||| ||||| ||| | |||||| |  ||||||||    
T  31123216 ttcattgcttttattatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcatgttaattgatcttaggtattaattgactactttccctagct 31123314  T
Q  324 ttcaatcctgaaatagtaat 343  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31123315 tttaatcctgaaatagtaat 31123334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7560605 - 7560435
Alignment:
Q  128 ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtt 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7560605 ttgattgaaccatgatgaacctattgtgatatgtgaatcagtagttgaaactctctttattatcaatattattcagtctttattcagaattatttatgtt 7560506  T
Q  226 cattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattag 297  Q
    || || ||||  ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||| ||||    
T  7560505 cagtgtttttcttatgattg-tttgtatgacaattaaccctagcttctttcaatcatattaattgatcttag 7560435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5618457 - 5618397
Alignment:
Q  314 aaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5618457 aaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 5618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15579186 - 15579098
Alignment:
Q  286 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15579186 aattgatcttaggaattgaatgactactaaccctatattttaatcatgaaatagtaaatctatttaattcaacatatgaacctagagat 15579098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23388608 - 23388511
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23388608 attgaggagcaacgccgacaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatttcctttgatt 23388511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 264
Target Start/End: Original strand, 22464173 - 22464240
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaacc 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  22464173 attcagtttttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattg-tttgcatgactattaacc 22464240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 9953572 - 9953679
Alignment:
Q  25 gattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta-nnnnnnnactatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaatt 123  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  9953572 gattgaaagaa--ttgaggagcaacgccgacaacgacgaaactctatcggcttattttttttattatgttgtttatgtatttaaccatgtctagctaatt 9953669  T
Q  124 ccctttgatt 133  Q
     |||||||||    
T  9953670 tcctttgatt 9953679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11296373 - 11296320
Alignment:
Q  322 ctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagatg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11296373 cttttaatcatgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagatg 11296320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5738543 - 5738496
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5738543 actatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgatt 5738496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20189882 - 20189837
Alignment:
Q  110 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgta 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  20189882 atgtctagctaatttcctttgattaagccaagatgaatctattgta 20189837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 155
Target Start/End: Original strand, 22146109 - 22146154
Alignment:
Q  110 atgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgta 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  22146109 atgtctagctaatttcctttgattaagccaagatgaatctattgta 22146154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53405 - 53065
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccct---ttgat 132  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | |   || ||    
T  53405 attgaggagcaaagtcatcaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaattcttagtttcat 53306  T
Q  133 tgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattg 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53305 tgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagaagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttatttagaattatttgtgttcattg 53207  T
Q  231 ctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatc 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53206 -tttttatataattgctt-gtatgactattaaccctaacttcctgaaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatc 53109  T
Q  331 ctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  53108 ttgaaatagtaatagtgtttgattcaatatgggaacctagagat 53065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 68316 - 68027
Alignment:
Q  25 gattgaaagaagattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaatt 123  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  68316 gattgagaaaagattgaggagcaaagtcatcaacgacgaaactctatcggtttattttctttactatgttgtttatttatttgatcatgtctagttaaat 68217  T
Q  124 ccct---ttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattac 218  Q
       |   || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68216 tattagtttcattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattac 68118  T
Q  219 ttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgacta 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68117 ttgtgttcattg-tttttatataattgc-ttatatgactattaaccctaacttcttgaaatcacatgaattgatattaggagttgaatgacta 68027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 372
Target Start/End: Original strand, 19704 - 19989
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19704 actatgttgtttaattctttaattatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctcttt 19803  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||    
T  19804 attatcaatattattcactctttatccagaattatttgtgttcat--cttttcatattattg-tttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcaca 19900  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagag 372  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19901 taaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagag 19989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 13254 - 13542
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||    
T  13254 actatgttgtttatttttttaattatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtaattgaaactct-ttt 13352  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||    
T  13353 attatcaatattattcagtctttatccaaaattatttgtgttaactgcttttcatatgattt-tttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcaca 13451  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13452 taaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctcaaataggaattatgtttaattcaacataggaacctagagat 13542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Original strand, 27270 - 27558
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctcttt 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||    
T  27270 actatgttgtttatttttttaattatgtctagctaattccctttgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaatcagtaattgaaactct-ttt 27368  T
Q  184 attattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattaca 283  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||    
T  27369 attatcaatattattcagtctttatccaaaattatttgtgttaactgcttttcatatgatt-ttttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcaca 27467  T
Q  284 tgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27468 taaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcataaaataaaaattatgtttaattcaacataggaacctagagat 27558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 27053 - 27297
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27053 tgattgagccataatgaaccg-ttgtaatatatgaattagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaattatttgtgttc 27151  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27152 attgcttttcagataattgcta-gtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctaactttt 27249  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250 aatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagat 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29087 - 28843
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29087 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatagtattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 28989  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28988 attgctttc-atataattgctt-gtatgactattaaccctagcttcttgaaattatatgaattgatattaggaattgaatgactactaaccctagctttt 28891  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28890 aatcttgaattagtaatcctgtttgattcaacataggaacctaaagat 28843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 151 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27285 - 27062
Alignment:
Q  151 ttgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctt 248  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27285 ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgtttattgctttc-atataattgctt 27187  T
Q  249 tgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgt 348  Q
     ||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  27186 -gtatgactattaaccctaacttcttgaatttatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgt 27088  T
Q  349 ttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27087 ttgattcaacataggaacctagagat 27062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31492 - 31347
Alignment:
Q  129 tgattgagccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31492 tgattgagccatgatgaacct-ttgtaatatatgatttagtagttgatactctcttatttaataatattattcagtctttattcagaatcacttgtgttt 31394  T
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttg 275  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31393 attgc-tttcatataattgc-ttgtatgactattaaccctagcttcttg 31347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 5913 - 6221
Alignment:
Q  43 gagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnnactatgtt-gtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattgagccatg 141  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5913 gagcaacatcggcaacgacggaactctatcggtttatttttttactatgtttgtttctttatt----catgtttagctaattccctttgattgagccatg 6008  T
Q  142 atgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatata 241  Q
    ||          ||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6009 at----------taatatata----tagttgatactttctttattaataatgttattcagtctttattcagaattacttgtgtttattgctttc-atata 6093  T
Q  242 attgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagta 341  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  6094 attgctt-gtatgattattaatcatagcttc----aattacatgaattgatattaggaattgaatgactactaactctagcttttaattctgaaatagga 6188  T
Q  342 atcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6189 atcctgtttgattcaacataggaacctagagat 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 2075 - 2384
Alignment:
Q  35 agattgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||        | |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2075 agattgaagagcaacatcggcaacgacggaactctatcggtttattttctttattatgttgtttgtttctttattgatgtctagctaattccctttgatt 2174  T
Q  134 gagccatgatgaacctattgtaatatatgaatgtagttgatactctctttattattaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctt 233  Q
    ||||||||||          ||||||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2175 gagccatgat----------taatatata----tagttgatactttctttattaataatgttattcagtctttattcagaattagttgtgttcattgctt 2260  T
Q  234 tttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctg 333  Q
    |  |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2261 tc-atataattgctt-gtatgattattaatcatagcttcttg---------------atattaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctg 2343  T
Q  334 aaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2344 aaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 6996 - 7173
Alignment:
Q  196 attcagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatatt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  6996 attcagtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattg-tttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatctt 7094  T
Q  296 aggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7095 agaaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 13354 - 13527
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  13354 agtctttattcagaattatttgtgttcattgctttttgtataattg-tttgcatgactattaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttagga 13452  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13453 attaaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagat 13527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 4021 - 4194
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  4021 agtctttattcagaattatttgtgttcattggttttcgtatgattggtt-gcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 4119  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4120 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttcattcaacataggaacctagagat 4194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Original strand, 1192 - 1337
Alignment:
Q  227 attgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1192 attgcttttcatataattgctt-gtatgactattaaccctagctttttg-aattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttt 1289  T
Q  327 aatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1290 aatcctgaattagtaaatctgtttgattcaacataggaacctagagat 1337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 226950 - 227283
Alignment:
Q  37 attgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggtttannnnnnn-actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgattga 135  Q
    ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||  ||| || |||| || |||||||||||||||||     
T  226950 attgaggagtaaagccgacaacgacgaagctctatcggtttattttctttactatgttgtttattcctttgat-atgtttaactaattccctttgattgg 227048  T
Q  136 gccatgatgaacctattgtaatatatgaat--gtagttgatactctctttatt-----attaatgttattcagtctttattcagaattacttgtgttcat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||     || ||| ||||||||||||||||          ||| |||||    
T  227049 gccatgataaacctattgtaatatatgaatcagtagttgaaactctttttattttattatcaatattattcagtctttatt----------tgtattcat 227138  T
Q  229 tgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaa 328  Q
    ||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||    
T  227139 tgcttttcatatgattggtt-gcatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaatcatagcttttaa 227237  T
Q  329 tcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  227238 tcctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagat 227283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 4327 - 4498
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  4327 agtctttattcagaattatttgtgct--ttgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 4423  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagat 4498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 52881 - 53054
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  52881 agtctttattcagaattatttgtgttcaaagcttttcgtatgattg-tttgcatgactattaatcctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 52979  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52980 attgaatgactactaaccctatcttttaatcttgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagat 53054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 29084 - 29257
Alignment:
Q  200 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccttagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||| || | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  29084 agtctttattcagaattatttgtgttcaaagattttcatatgattgatt-gcatgactattaaacctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 29182  T
Q  300 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagat 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  29183 attgaatgactactaaccctagcttttattcctgaaatagtaattctgtttaattcaacctgggaacctagagat 29257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 368
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2120
Alignment:
Q  270 ttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacct 368  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2022 ttctttcaatcacataaattgatcttaggaactgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataagaacct 2120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 26803 - 26843
Alignment:
Q  38 ttgaggagcaacgtcgacatcgacgaaactctatcggttta 78  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26803 ttgaggagcaacgtcgacaacgacgaaactctatcggttta 26843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5811
Alignment:
Q  86 actatgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5858 actatgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgatt 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 62183 - 62227
Alignment:
Q  89 atgttgtttctttatttaatcatgtctagctaattccctttgatt 133  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62183 atgttgtttattattttaatcatgtctagctaatttcctttgatt 62227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University