View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15827_low_1 (Length: 1135)

Name: NF15827_low_1
Description: NF15827
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15827_low_1
NF15827_low_1
[»] chr5 (195 HSPs)
chr5 (419-1118)||(31472611-31473304)
chr5 (419-965)||(16092198-16092746)
chr5 (419-892)||(25903914-25904383)
chr5 (419-839)||(1189606-1190030)
chr5 (419-761)||(17072822-17073164)
chr5 (419-756)||(40221466-40221803)
chr5 (419-753)||(10474322-10474655)
chr5 (419-754)||(18511211-18511547)
chr5 (419-756)||(695833-696158)
chr5 (419-761)||(24126795-24127136)
chr5 (419-756)||(10529098-10529434)
chr5 (419-756)||(21947971-21948306)
chr5 (419-760)||(2174859-2175198)
chr5 (419-756)||(25921472-25921808)
chr5 (421-771)||(18596576-18596924)
chr5 (419-912)||(36208370-36208856)
chr5 (419-756)||(2818334-2818671)
chr5 (423-716)||(25804009-25804300)
chr5 (419-756)||(39854428-39854763)
chr5 (428-756)||(4236573-4236900)
chr5 (419-749)||(17818491-17818817)
chr5 (419-724)||(6756470-6756772)
chr5 (419-756)||(37705779-37706115)
chr5 (419-754)||(18509317-18509652)
chr5 (419-756)||(38882049-38882385)
chr5 (419-716)||(6745053-6745348)
chr5 (419-755)||(18466625-18466964)
chr5 (419-716)||(34477052-34477349)
chr5 (419-716)||(34479417-34479714)
chr5 (423-761)||(39397996-39398332)
chr5 (419-771)||(27912459-27912816)
chr5 (419-756)||(31179370-31179706)
chr5 (419-756)||(31542679-31543014)
chr5 (419-756)||(31545024-31545360)
chr5 (419-756)||(16776101-16776437)
chr5 (419-771)||(27910374-27910730)
chr5 (419-748)||(2954368-2954696)
chr5 (423-756)||(12555926-12556258)
chr5 (419-771)||(18468936-18469289)
chr5 (419-771)||(26097662-26098011)
chr5 (480-761)||(34530725-34531006)
chr5 (419-716)||(6747290-6747584)
chr5 (419-756)||(36402327-36402663)
chr5 (419-716)||(21684451-21684746)
chr5 (419-716)||(15552229-15552525)
chr5 (419-678)||(658355-658610)
chr5 (542-761)||(20042989-20043208)
chr5 (538-761)||(20044949-20045172)
chr5 (419-756)||(31465988-31466313)
chr5 (419-751)||(6661183-6661512)
chr5 (428-839)||(9020086-9020491)
chr5 (419-622)||(20505842-20506042)
chr5 (419-749)||(21288715-21289041)
chr5 (419-771)||(10586768-10587112)
chr5 (419-633)||(41585743-41585956)
chr5 (561-769)||(26098391-26098599)
chr5 (419-638)||(2723964-2724173)
chr5 (419-621)||(39798126-39798327)
chr5 (419-713)||(20053834-20054117)
chr5 (419-633)||(4410090-4410302)
chr5 (454-701)||(17413200-17413442)
chr5 (542-798)||(42770676-42770924)
chr5 (419-604)||(10749796-10749980)
chr5 (258-356)||(34476892-34476990)
chr5 (419-604)||(38960131-38960314)
chr5 (256-356)||(34479255-34479355)
chr5 (419-604)||(15354574-15354757)
chr5 (419-604)||(23665140-23665323)
chr5 (419-604)||(23793264-23793447)
chr5 (419-618)||(15143547-15143748)
chr5 (419-604)||(3373136-3373320)
chr5 (419-604)||(10757273-10757456)
chr5 (419-604)||(15356850-15357033)
chr5 (618-756)||(20507659-20507797)
chr5 (256-356)||(10750041-10750141)
chr5 (260-356)||(21684294-21684389)
chr5 (260-356)||(38882430-38882525)
chr5 (260-356)||(10528937-10529035)
chr5 (259-356)||(10757517-10757614)
chr5 (260-356)||(4236970-4237065)
chr5 (419-600)||(4897828-4898011)
chr5 (260-356)||(3372977-3373074)
chr5 (419-587)||(23741858-23742023)
chr5 (256-356)||(25804366-25804467)
chr5 (266-356)||(25921321-25921410)
chr5 (258-353)||(36402168-36402265)
chr5 (419-603)||(15445265-15445453)
chr5 (457-716)||(2144599-2144856)
chr5 (419-512)||(26098287-26098380)
chr5 (486-576)||(42770934-42771024)
chr5 (259-332)||(4410386-4410459)
chr5 (256-356)||(15356686-15356787)
chr5 (256-356)||(23665387-23665488)
chr5 (256-356)||(23793099-23793200)
chr5 (260-344)||(38959972-38960056)
chr5 (895-963)||(1190086-1190154)
chr5 (258-356)||(15354412-15354511)
chr5 (258-344)||(39798384-39798470)
chr5 (260-356)||(2175243-2175341)
chr5 (260-356)||(23741697-23741794)
chr5 (260-355)||(31179213-31179308)
chr5 (258-353)||(2724233-2724330)
chr5 (260-344)||(15552600-15552685)
chr5 (268-353)||(2818186-2818272)
chr5 (541-701)||(4754158-4754312)
chr5 (258-353)||(41585578-41585674)
chr5 (260-351)||(658204-658295)
chr5 (660-716)||(4410045-4410101)
chr5 (260-347)||(10587166-10587252)
chr5 (259-353)||(31465832-31465928)
chr5 (256-353)||(18511052-18511150)
chr5 (256-353)||(26098125-26098225)
chr5 (266-347)||(27912887-27912969)
chr5 (256-347)||(18467035-18467127)
chr5 (260-347)||(18469360-18469448)
chr5 (256-347)||(27910784-27910876)
chr5 (254-353)||(40221869-40221969)
chr5 (264-353)||(21948372-21948464)
chr5 (546-701)||(29748351-29748502)
chr5 (895-963)||(36208298-36208366)
chr5 (275-353)||(17818351-17818429)
chr5 (260-353)||(34530559-34530653)
chr5 (260-353)||(39854826-39854921)
chr5 (661-756)||(41585946-41586041)
chr5 (256-353)||(6745410-6745511)
chr5 (689-761)||(2723906-2723978)
chr5 (258-353)||(6747646-6747745)
chr5 (266-347)||(21289105-21289187)
chr5 (260-353)||(1189454-1189546)
chr5 (541-603)||(2298122-2298183)
chr5 (541-603)||(10627364-10627425)
chr5 (284-353)||(20045326-20045395)
chr5 (256-353)||(20505683-20505784)
chr5 (256-330)||(31472454-31472531)
chr5 (278-332)||(31543099-31543153)
chr5 (484-618)||(34033630-34033768)
chr5 (266-353)||(2954755-2954843)
chr5 (895-960)||(25903825-25903889)
chr5 (258-353)||(36208913-36209009)
chr5 (261-353)||(6756832-6756926)
chr5 (259-353)||(18596985-18597080)
chr5 (469-529)||(20045211-20045271)
chr5 (259-353)||(24127196-24127292)
chr5 (278-326)||(31545454-31545502)
chr5 (259-355)||(37705625-37705723)
chr5 (261-347)||(6661038-6661124)
chr5 (541-618)||(35430259-35430338)
chr5 (541-603)||(1170811-1170872)
chr5 (420-474)||(11917011-11917065)
chr5 (280-353)||(12555779-12555852)
chr5 (276-353)||(16776500-16776577)
chr5 (541-603)||(31782578-31782639)
chr5 (541-603)||(35385573-35385634)
chr5 (296-353)||(26098071-26098127)
chr5 (420-464)||(533893-533937)
chr5 (293-353)||(10474203-10474262)
chr5 (419-467)||(20043222-20043270)
chr5 (541-604)||(32520533-32520597)
chr5 (420-464)||(42428430-42428474)
chr5 (541-600)||(11962554-11962612)
chr5 (541-618)||(15224889-15224968)
chr5 (541-600)||(22672837-22672895)
chr5 (541-600)||(25452498-25452556)
chr5 (421-464)||(31183095-31183138)
chr5 (260-349)||(696218-696310)
chr5 (855-920)||(9020025-9020091)
chr5 (420-474)||(9353371-9353425)
chr5 (541-591)||(26406594-26406643)
chr5 (420-474)||(28832263-28832317)
chr5 (420-474)||(36932389-36932443)
chr5 (828-888)||(2954308-2954369)
chr5 (543-603)||(13295835-13295896)
chr5 (420-469)||(17004004-17004053)
chr5 (260-344)||(20054182-20054266)
chr5 (541-598)||(25445501-25445557)
chr5 (420-464)||(538149-538193)
chr5 (420-464)||(19806487-19806531)
chr5 (419-475)||(23667542-23667598)
chr5 (420-464)||(32636948-32636992)
chr5 (420-464)||(33831804-33831848)
chr5 (419-490)||(42238371-42238443)
chr5 (260-352)||(16092045-16092137)
chr5 (568-603)||(16093438-16093473)
chr5 (259-353)||(25904443-25904537)
chr5 (565-600)||(28786407-28786442)
chr5 (541-603)||(1240428-1240489)
chr5 (708-765)||(2144878-2144936)
chr5 (420-474)||(10281755-10281809)
chr5 (821-867)||(11962821-11962867)
chr5 (420-474)||(12084214-12084268)
chr5 (420-474)||(15464536-15464590)
chr5 (259-353)||(17073227-17073322)
chr5 (254-353)||(20043329-20043430)
chr5 (730-776)||(29748265-29748311)
chr5 (420-465)||(31300644-31300689)
[»] chr3 (257 HSPs)
chr3 (419-964)||(3314403-3314945)
chr3 (419-893)||(880448-880919)
chr3 (428-965)||(889779-890310)
chr3 (419-960)||(51674763-51675290)
chr3 (419-964)||(47148892-47149458)
chr3 (420-966)||(53590908-53591442)
chr3 (419-771)||(1313319-1313669)
chr3 (630-963)||(6231169-6231499)
chr3 (419-756)||(1626680-1627016)
chr3 (419-756)||(43423460-43423796)
chr3 (419-771)||(53917661-53918012)
chr3 (419-756)||(4308278-4308614)
chr3 (419-782)||(28761424-28761787)
chr3 (419-911)||(31151120-31151605)
chr3 (419-755)||(43421412-43421747)
chr3 (419-761)||(28101999-28102340)
chr3 (419-756)||(45882863-45883200)
chr3 (419-755)||(10956024-10956359)
chr3 (419-771)||(53915493-53915844)
chr3 (419-756)||(5926761-5927097)
chr3 (419-756)||(11170328-11170664)
chr3 (419-716)||(38890004-38890300)
chr3 (419-755)||(10958320-10958655)
chr3 (644-963)||(3306518-3306835)
chr3 (419-756)||(51943295-51943630)
chr3 (419-761)||(53468450-53468793)
chr3 (419-756)||(24979631-24979968)
chr3 (419-756)||(43228215-43228551)
chr3 (419-756)||(51727004-51727339)
chr3 (419-756)||(18099167-18099503)
chr3 (419-761)||(36011746-36012087)
chr3 (419-756)||(3859452-3859787)
chr3 (419-716)||(25533406-25533702)
chr3 (419-716)||(42990268-42990564)
chr3 (419-756)||(43226010-43226345)
chr3 (420-756)||(32264035-32264376)
chr3 (419-771)||(4103893-4104247)
chr3 (422-756)||(18096900-18097234)
chr3 (419-716)||(27101178-27101474)
chr3 (419-716)||(30005805-30006101)
chr3 (463-750)||(6561740-6562028)
chr3 (419-756)||(18162588-18162923)
chr3 (419-756)||(48361668-48362003)
chr3 (419-771)||(458189-458544)
chr3 (419-760)||(10084386-10084730)
chr3 (419-756)||(39715394-39715725)
chr3 (419-716)||(9604604-9604899)
chr3 (419-756)||(22114302-22114638)
chr3 (419-771)||(455812-456167)
chr3 (419-771)||(746660-747017)
chr3 (419-794)||(54691571-54691944)
chr3 (419-700)||(25388886-25389165)
chr3 (419-756)||(5191577-5191911)
chr3 (419-769)||(23633371-23633713)
chr3 (419-756)||(15780784-15781139)
chr3 (419-716)||(38210334-38210630)
chr3 (419-756)||(6063443-6063781)
chr3 (419-756)||(26720472-26720807)
chr3 (419-756)||(6065793-6066130)
chr3 (419-716)||(10621527-10621823)
chr3 (419-716)||(50493963-50494259)
chr3 (419-676)||(1321483-1321739)
chr3 (419-756)||(12267972-12268299)
chr3 (419-716)||(10191307-10191602)
chr3 (419-756)||(5522624-5522948)
chr3 (536-756)||(35777345-35777566)
chr3 (419-667)||(6484372-6484620)
chr3 (536-761)||(28100154-28100379)
chr3 (458-716)||(29956650-29956907)
chr3 (419-659)||(4666535-4666774)
chr3 (422-756)||(35917944-35918282)
chr3 (426-769)||(53597152-53597491)
chr3 (419-690)||(28413029-28413299)
chr3 (536-761)||(28180943-28181166)
chr3 (419-716)||(42992250-42992530)
chr3 (419-749)||(32219026-32219345)
chr3 (423-628)||(25688161-25688366)
chr3 (419-658)||(7606585-7606822)
chr3 (498-782)||(23636925-23637205)
chr3 (426-782)||(13420189-13420531)
chr3 (419-673)||(17795269-17795519)
chr3 (419-673)||(19103709-19103959)
chr3 (467-761)||(54884076-54884367)
chr3 (419-628)||(6231853-6232060)
chr3 (419-755)||(27635655-27635959)
chr3 (419-673)||(25635391-25635642)
chr3 (419-709)||(561771-562058)
chr3 (538-761)||(28137421-28137633)
chr3 (426-708)||(36871304-36871583)
chr3 (419-619)||(5886261-5886458)
chr3 (419-619)||(5899734-5899931)
chr3 (419-616)||(11168165-11168361)
chr3 (632-761)||(47701804-47701933)
chr3 (588-715)||(41849117-41849244)
chr3 (612-756)||(11163074-11163218)
chr3 (256-356)||(11168423-11168523)
chr3 (492-765)||(1673890-1674160)
chr3 (573-776)||(24177183-24177383)
chr3 (419-553)||(47701668-47701801)
chr3 (419-618)||(1620457-1620657)
chr3 (259-356)||(11170692-11170789)
chr3 (419-602)||(3306839-3307020)
chr3 (256-356)||(5191973-5192072)
chr3 (419-577)||(24181483-24181642)
chr3 (260-356)||(10955867-10955962)
chr3 (260-356)||(10084229-10084324)
chr3 (256-356)||(10958159-10958258)
chr3 (260-344)||(22114143-22114227)
chr3 (257-356)||(51726844-51726942)
chr3 (259-356)||(1321801-1321898)
chr3 (258-356)||(7606441-7606539)
chr3 (483-769)||(4560352-4560611)
chr3 (256-344)||(6065629-6065718)
chr3 (260-356)||(10191152-10191247)
chr3 (467-618)||(14634486-14634638)
chr3 (260-344)||(41849387-41849470)
chr3 (277-356)||(38890362-38890441)
chr3 (260-342)||(5522466-5522548)
chr3 (256-352)||(18099006-18099104)
chr3 (419-529)||(25634038-25634148)
chr3 (260-344)||(747092-747177)
chr3 (256-355)||(43226401-43226499)
chr3 (256-332)||(456253-456329)
chr3 (444-592)||(11007545-11007684)
chr3 (257-356)||(25533747-25533845)
chr3 (257-353)||(32219407-32219506)
chr3 (256-353)||(3315005-3315104)
chr3 (260-353)||(18096740-18096835)
chr3 (258-332)||(458630-458704)
chr3 (267-356)||(53893900-53893989)
chr3 (256-344)||(42990633-42990721)
chr3 (259-356)||(25389229-25389327)
chr3 (260-353)||(24980031-24980126)
chr3 (269-355)||(43228610-43228696)
chr3 (544-700)||(13419865-13420015)
chr3 (257-353)||(18162985-18163083)
chr3 (260-353)||(1313727-1313822)
chr3 (419-496)||(41849243-41849319)
chr3 (260-353)||(4308122-4308216)
chr3 (256-349)||(5886528-5886622)
chr3 (258-344)||(6063281-6063368)
chr3 (260-353)||(36012149-36012243)
chr3 (256-353)||(43423304-43423402)
chr3 (260-353)||(9604447-9604540)
chr3 (256-344)||(10621362-10621452)
chr3 (419-477)||(35919112-35919170)
chr3 (260-353)||(27635497-27635592)
chr3 (260-356)||(50494321-50494417)
chr3 (254-353)||(53917500-53917600)
chr3 (260-349)||(5900001-5900091)
chr3 (258-353)||(6232119-6232210)
chr3 (260-353)||(45883263-45883357)
chr3 (419-474)||(53894054-53894109)
chr3 (259-355)||(3859834-3859931)
chr3 (266-353)||(27101028-27101116)
chr3 (256-340)||(28101844-28101930)
chr3 (266-353)||(5926615-5926703)
chr3 (260-356)||(38210693-38210789)
chr3 (258-353)||(43421258-43421354)
chr3 (680-756)||(1321365-1321441)
chr3 (256-347)||(23633775-23633866)
chr3 (260-349)||(15781203-15781293)
chr3 (258-332)||(28412868-28412943)
chr3 (260-353)||(53915338-53915432)
chr3 (276-353)||(6484678-6484756)
chr3 (572-673)||(25633930-25634028)
chr3 (266-328)||(36957651-36957713)
chr3 (260-353)||(1626525-1626620)
chr3 (260-353)||(3307080-3307176)
chr3 (259-347)||(31151667-31151755)
chr3 (259-347)||(42992712-42992800)
chr3 (269-347)||(561633-561710)
chr3 (692-756)||(6484309-6484373)
chr3 (444-701)||(7768553-7768806)
chr3 (541-618)||(11066652-11066731)
chr3 (260-352)||(25687998-25688094)
chr3 (260-347)||(28761287-28761375)
chr3 (419-600)||(10595033-10595213)
chr3 (258-349)||(880082-880175)
chr3 (259-330)||(25635718-25635789)
chr3 (541-600)||(27762107-27762165)
chr3 (276-349)||(880313-880386)
chr3 (684-797)||(1618916-1619032)
chr3 (420-474)||(1736334-1736388)
chr3 (541-603)||(10094195-10094256)
chr3 (541-603)||(10201075-10201136)
chr3 (541-603)||(10208121-10208182)
chr3 (541-603)||(16462203-16462264)
chr3 (420-474)||(18552912-18552966)
chr3 (541-603)||(22626105-22626166)
chr3 (256-330)||(25634224-25634298)
chr3 (419-508)||(27420822-27420912)
chr3 (276-353)||(28181324-28181400)
chr3 (420-474)||(30709819-30709873)
chr3 (310-356)||(35919020-35919066)
chr3 (541-603)||(47883003-47883064)
chr3 (541-590)||(13893475-13893523)
chr3 (419-600)||(29913954-29914132)
chr3 (898-963)||(54692046-54692111)
chr3 (260-347)||(4103736-4103822)
chr3 (555-603)||(7418064-7418112)
chr3 (541-618)||(11073007-11073084)
chr3 (419-600)||(47878170-47878350)
chr3 (293-353)||(51943693-51943752)
chr3 (259-353)||(53591503-53591598)
chr3 (260-353)||(12267819-12267913)
chr3 (296-347)||(26720878-26720928)
chr3 (260-353)||(32263881-32263975)
chr3 (260-331)||(51674608-51674682)
chr3 (541-600)||(54193229-54193287)
chr3 (420-474)||(1417519-1417573)
chr3 (276-353)||(4666834-4666911)
chr3 (565-603)||(6303310-6303348)
chr3 (420-474)||(8370515-8370569)
chr3 (565-603)||(10100235-10100273)
chr3 (541-603)||(16996875-16996936)
chr3 (565-603)||(27544273-27544311)
chr3 (420-474)||(27974981-27975035)
chr3 (420-474)||(27986475-27986529)
chr3 (256-336)||(53597569-53597648)
chr3 (593-626)||(7606830-7606863)
chr3 (420-469)||(21711227-21711276)
chr3 (562-618)||(31021284-31021341)
chr3 (260-353)||(47148745-47148832)
chr3 (260-353)||(53468295-53468390)
chr3 (419-600)||(10612777-10612957)
chr3 (420-464)||(23391909-23391953)
chr3 (420-464)||(29196386-29196430)
chr3 (420-464)||(40734622-40734666)
chr3 (420-464)||(40913417-40913461)
chr3 (420-464)||(44331669-44331713)
chr3 (541-600)||(10897008-10897066)
chr3 (565-600)||(20031462-20031497)
chr3 (730-769)||(25635331-25635370)
chr3 (423-474)||(48438221-48438272)
chr3 (541-600)||(54188512-54188570)
chr3 (741-798)||(1620711-1620768)
chr3 (420-474)||(6794742-6794796)
chr3 (565-599)||(10949404-10949438)
chr3 (444-490)||(11079628-11079674)
chr3 (420-474)||(16264354-16264408)
chr3 (260-333)||(24181675-24181749)
chr3 (420-474)||(25795785-25795839)
chr3 (420-474)||(26298992-26299046)
chr3 (420-462)||(31314571-31314613)
chr3 (420-474)||(32143325-32143379)
chr3 (420-474)||(33386695-33386749)
chr3 (260-319)||(35917876-35917937)
chr3 (420-474)||(37466295-37466349)
chr3 (260-297)||(43228695-43228733)
chr3 (315-353)||(48361568-48361605)
chr3 (444-490)||(48390327-48390373)
chr3 (585-618)||(1618824-1618857)
chr3 (260-347)||(17795581-17795669)
chr3 (260-347)||(19104021-19104109)
chr3 (926-963)||(25633231-25633268)
chr3 (456-505)||(31021196-31021244)
[»] chr8 (151 HSPs)
chr8 (419-964)||(36865330-36865873)
chr8 (419-892)||(30480502-30480971)
chr8 (419-782)||(14419189-14419552)
chr8 (419-782)||(13858483-13858845)
chr8 (419-761)||(27106896-27107237)
chr8 (593-963)||(35872555-35872913)
chr8 (423-798)||(27910973-27911345)
chr8 (423-798)||(27957392-27957764)
chr8 (419-756)||(1225166-1225503)
chr8 (419-771)||(32339290-32339645)
chr8 (419-756)||(28251566-28251902)
chr8 (419-756)||(14807751-14808097)
chr8 (419-756)||(15072710-15073047)
chr8 (419-756)||(15067981-15068317)
chr8 (423-761)||(5372179-5372517)
chr8 (419-756)||(27829297-27829632)
chr8 (419-771)||(3873991-3874346)
chr8 (419-761)||(25952516-25952857)
chr8 (419-716)||(608774-609070)
chr8 (419-771)||(41384730-41385080)
chr8 (419-756)||(4424018-4424354)
chr8 (419-756)||(27826986-27827321)
chr8 (419-771)||(15809200-15809554)
chr8 (423-761)||(33541413-33541728)
chr8 (419-771)||(41382658-41382998)
chr8 (419-716)||(22684652-22684951)
chr8 (561-911)||(5622878-5623224)
chr8 (419-756)||(18810708-18811043)
chr8 (419-771)||(28283220-28283575)
chr8 (419-756)||(44720843-44721179)
chr8 (419-769)||(15185713-15186058)
chr8 (419-708)||(43079650-43079938)
chr8 (419-771)||(24873180-24873537)
chr8 (510-761)||(14477271-14477522)
chr8 (419-716)||(43082013-43082309)
chr8 (419-761)||(21482317-21482647)
chr8 (419-769)||(31162200-31162549)
chr8 (419-666)||(15956051-15956294)
chr8 (419-756)||(18812893-18813217)
chr8 (426-725)||(21480545-21480832)
chr8 (419-771)||(43530109-43530451)
chr8 (419-726)||(3005629-3005932)
chr8 (579-769)||(26775188-26775378)
chr8 (419-621)||(31035252-31035457)
chr8 (419-639)||(31578275-31578495)
chr8 (259-356)||(32339707-32339804)
chr8 (538-729)||(37214317-37214518)
chr8 (256-356)||(18811105-18811206)
chr8 (258-356)||(4424416-4424514)
chr8 (260-356)||(15809616-15809711)
chr8 (489-701)||(31573794-31574001)
chr8 (256-356)||(27827383-27827483)
chr8 (656-756)||(3886153-3886253)
chr8 (258-356)||(22684489-22684590)
chr8 (855-964)||(40877984-40878093)
chr8 (260-356)||(18813279-18813376)
chr8 (260-356)||(27829694-27829790)
chr8 (455-633)||(181622-181799)
chr8 (419-550)||(2468128-2468259)
chr8 (645-716)||(12517248-12517319)
chr8 (259-356)||(43530513-43530610)
chr8 (260-356)||(3883436-3883532)
chr8 (258-344)||(28283060-28283146)
chr8 (278-356)||(44721241-44721318)
chr8 (259-353)||(35872300-35872395)
chr8 (661-771)||(181522-181632)
chr8 (259-356)||(3874391-3874488)
chr8 (427-618)||(17847661-17847848)
chr8 (260-356)||(609133-609230)
chr8 (452-618)||(3895957-3896126)
chr8 (260-344)||(24873039-24873124)
chr8 (260-353)||(28251410-28251504)
chr8 (430-603)||(6376141-6376315)
chr8 (256-353)||(15068378-15068476)
chr8 (260-353)||(15073108-15073202)
chr8 (260-353)||(33541255-33541349)
chr8 (895-963)||(30481028-30481096)
chr8 (584-755)||(31035068-31035238)
chr8 (260-353)||(14808157-14808252)
chr8 (276-344)||(43082383-43082450)
chr8 (257-347)||(2467976-2468066)
chr8 (275-353)||(30480364-30480442)
chr8 (256-353)||(41383060-41383158)
chr8 (459-513)||(14419732-14419786)
chr8 (260-347)||(15185564-15185652)
chr8 (419-516)||(16833789-16833886)
chr8 (260-347)||(27106747-27106835)
chr8 (576-756)||(2468261-2468433)
chr8 (259-353)||(25952916-25953011)
chr8 (274-353)||(36865935-36866014)
chr8 (419-475)||(37214263-37214319)
chr8 (276-344)||(43080012-43080079)
chr8 (541-603)||(13985199-13985262)
chr8 (256-353)||(14419031-14419129)
chr8 (267-347)||(13858341-13858422)
chr8 (259-351)||(14477648-14477741)
chr8 (457-519)||(35872477-35872538)
chr8 (260-347)||(3005486-3005572)
chr8 (258-344)||(15956358-15956445)
chr8 (541-618)||(33839043-33839120)
chr8 (259-353)||(37214108-37214203)
chr8 (420-474)||(5702522-5702576)
chr8 (420-474)||(7412345-7412399)
chr8 (541-603)||(9021228-9021289)
chr8 (542-618)||(13985933-13986011)
chr8 (541-603)||(16752643-16752704)
chr8 (541-603)||(16757388-16757449)
chr8 (256-347)||(21480900-21480994)
chr8 (541-603)||(28327908-28327969)
chr8 (541-603)||(28895502-28895563)
chr8 (541-603)||(30423212-30423274)
chr8 (420-464)||(6599096-6599140)
chr8 (420-464)||(6674549-6674593)
chr8 (555-603)||(17799558-17799606)
chr8 (541-600)||(590797-590855)
chr8 (541-600)||(33032657-33032715)
chr8 (746-789)||(40877901-40877944)
chr8 (259-353)||(41385142-41385234)
chr8 (420-474)||(4696635-4696689)
chr8 (541-603)||(4812608-4812669)
chr8 (276-349)||(5372043-5372117)
chr8 (420-474)||(9765858-9765912)
chr8 (260-332)||(21482724-21482798)
chr8 (420-474)||(23799616-23799670)
chr8 (420-474)||(26403269-26403323)
chr8 (541-603)||(28332631-28332692)
chr8 (908-949)||(5623242-5623283)
chr8 (543-600)||(29554908-29554964)
chr8 (420-464)||(4743214-4743258)
chr8 (420-464)||(10930199-10930243)
chr8 (708-756)||(14419784-14419832)
chr8 (420-464)||(15212910-15212954)
chr8 (420-464)||(27811402-27811446)
chr8 (420-464)||(33352274-33352318)
chr8 (420-464)||(40321204-40321248)
chr8 (541-600)||(3276347-3276405)
chr8 (421-464)||(4733830-4733873)
chr8 (421-464)||(8965692-8965735)
chr8 (419-485)||(14477520-14477587)
chr8 (541-600)||(25684646-25684704)
chr8 (419-512)||(28327996-28328090)
chr8 (273-347)||(31162612-31162686)
chr8 (541-603)||(2267144-2267205)
chr8 (420-474)||(19752433-19752487)
chr8 (420-474)||(31071268-31071322)
chr8 (821-867)||(33032384-33032430)
chr8 (257-305)||(2467877-2467926)
chr8 (566-618)||(11701102-11701155)
chr8 (562-603)||(15949534-15949575)
chr8 (419-463)||(31566556-31566601)
chr8 (423-464)||(40221869-40221910)
[»] chr4 (252 HSPs)
chr4 (419-965)||(12400806-12401349)
chr4 (419-963)||(38928176-38928715)
chr4 (419-891)||(12395844-12396312)
chr4 (419-963)||(19095696-19096217)
chr4 (419-963)||(37313064-37313600)
chr4 (423-839)||(33415491-33415900)
chr4 (419-912)||(18537472-18537960)
chr4 (593-963)||(24446756-24447114)
chr4 (419-756)||(40091414-40091750)
chr4 (419-756)||(24880449-24880786)
chr4 (419-756)||(40637072-40637408)
chr4 (419-756)||(48486317-48486653)
chr4 (419-756)||(24878987-24879324)
chr4 (419-769)||(36378277-36378627)
chr4 (419-756)||(22800861-22801197)
chr4 (419-756)||(22802733-22803069)
chr4 (419-756)||(24888794-24889130)
chr4 (419-756)||(14633318-14633652)
chr4 (419-756)||(47274725-47275059)
chr4 (419-716)||(8631418-8631714)
chr4 (419-771)||(24348197-24348552)
chr4 (419-756)||(619447-619782)
chr4 (419-756)||(5198418-5198754)
chr4 (419-756)||(47868399-47868735)
chr4 (429-756)||(16453307-16453634)
chr4 (419-771)||(14787428-14787783)
chr4 (419-756)||(37089371-37089709)
chr4 (419-756)||(11434953-11435288)
chr4 (419-750)||(19322701-19323029)
chr4 (419-756)||(22044390-22044725)
chr4 (419-756)||(22046685-22047020)
chr4 (419-762)||(41997484-41997826)
chr4 (419-781)||(44599837-44600198)
chr4 (419-756)||(51015244-51015579)
chr4 (419-756)||(9148249-9148586)
chr4 (440-798)||(13543910-13544272)
chr4 (419-756)||(2484872-2485208)
chr4 (424-755)||(56030443-56030770)
chr4 (419-756)||(36921492-36921830)
chr4 (419-716)||(38409243-38409538)
chr4 (419-756)||(6764837-6765178)
chr4 (419-716)||(31849598-31849894)
chr4 (419-756)||(36919583-36919922)
chr4 (419-756)||(7941317-7941657)
chr4 (419-795)||(18534830-18535203)
chr4 (419-716)||(11006236-11006532)
chr4 (419-756)||(16934142-16934478)
chr4 (419-756)||(18847151-18847486)
chr4 (419-754)||(9176473-9176807)
chr4 (419-761)||(18409346-18409686)
chr4 (419-716)||(11008567-11008861)
chr4 (419-771)||(18709163-18709521)
chr4 (419-756)||(9174145-9174481)
chr4 (419-756)||(16931788-16932124)
chr4 (419-771)||(17662244-17662588)
chr4 (419-716)||(22132391-22132684)
chr4 (419-678)||(36380425-36380684)
chr4 (419-716)||(22780372-22780668)
chr4 (419-716)||(22782737-22783033)
chr4 (486-756)||(5637530-5637804)
chr4 (419-681)||(26085976-26086236)
chr4 (419-756)||(8756249-8756585)
chr4 (419-639)||(16455356-16455576)
chr4 (536-761)||(6132866-6133090)
chr4 (419-716)||(22134617-22134909)
chr4 (424-771)||(47210756-47211096)
chr4 (486-716)||(3824635-3824863)
chr4 (536-761)||(3937324-3937548)
chr4 (419-771)||(53405110-53405467)
chr4 (419-674)||(38890223-38890476)
chr4 (419-612)||(2891433-2891626)
chr4 (430-769)||(15032557-15032884)
chr4 (419-671)||(27499128-27499376)
chr4 (593-761)||(38270158-38270326)
chr4 (498-724)||(52942536-52942748)
chr4 (419-666)||(30136640-30136884)
chr4 (423-606)||(13547302-13547484)
chr4 (419-619)||(12102221-12102423)
chr4 (419-765)||(28453676-28454018)
chr4 (419-574)||(4215486-4215640)
chr4 (457-619)||(31983564-31983727)
chr4 (644-761)||(2891309-2891427)
chr4 (419-769)||(16185833-16186185)
chr4 (419-559)||(5635475-5635614)
chr4 (419-750)||(9863712-9864047)
chr4 (461-755)||(40998990-40999281)
chr4 (618-771)||(5100980-5101133)
chr4 (431-615)||(3982186-3982374)
chr4 (419-618)||(25357772-25357977)
chr4 (426-749)||(10112876-10113198)
chr4 (258-356)||(8631258-8631355)
chr4 (259-356)||(24348597-24348693)
chr4 (260-356)||(2484715-2484810)
chr4 (260-356)||(5635318-5635413)
chr4 (256-356)||(9176311-9176410)
chr4 (419-559)||(11437558-11437696)
chr4 (260-356)||(31849440-31849535)
chr4 (446-701)||(9022361-9022613)
chr4 (426-701)||(47150898-47151168)
chr4 (419-529)||(5101154-5101262)
chr4 (259-356)||(47868797-47868895)
chr4 (259-356)||(9173986-9174082)
chr4 (256-356)||(11008404-11008504)
chr4 (260-356)||(5198800-5198895)
chr4 (260-356)||(7941719-7941814)
chr4 (257-356)||(11006091-11006190)
chr4 (260-344)||(26085818-26085902)
chr4 (256-356)||(22046522-22046623)
chr4 (278-356)||(22132248-22132326)
chr4 (260-353)||(17662092-17662184)
chr4 (276-356)||(11435350-11435430)
chr4 (256-353)||(14789269-14789367)
chr4 (256-353)||(22802573-22802671)
chr4 (259-356)||(11437758-11437856)
chr4 (260-356)||(37089212-37089309)
chr4 (260-356)||(9148631-9148727)
chr4 (259-353)||(24446501-24446596)
chr4 (257-356)||(47210634-47210733)
chr4 (259-353)||(49088950-49089045)
chr4 (276-356)||(51015641-51015720)
chr4 (260-353)||(14787274-14787368)
chr4 (256-353)||(36921334-36921432)
chr4 (260-349)||(38928024-38928114)
chr4 (259-347)||(3937125-3937212)
chr4 (278-356)||(22134476-22134553)
chr4 (260-347)||(6765247-6765335)
chr4 (260-356)||(14633714-14633810)
chr4 (276-356)||(18847549-18847627)
chr4 (259-343)||(22780211-22780296)
chr4 (256-344)||(22782573-22782662)
chr4 (276-356)||(22044249-22044328)
chr4 (260-353)||(24889192-24889286)
chr4 (263-353)||(36919432-36919523)
chr4 (258-356)||(16931629-16931727)
chr4 (260-353)||(33415334-33415429)
chr4 (419-506)||(47563009-47563095)
chr4 (259-356)||(44599679-44599775)
chr4 (257-353)||(4215697-4215795)
chr4 (275-356)||(38409600-38409680)
chr4 (260-353)||(40637470-40637566)
chr4 (257-347)||(53405538-53405629)
chr4 (260-353)||(2891686-2891780)
chr4 (260-349)||(3824447-3824540)
chr4 (260-353)||(22800705-22800799)
chr4 (256-353)||(36378685-36378781)
chr4 (419-486)||(14789427-14789496)
chr4 (259-353)||(40091258-40091354)
chr4 (259-353)||(52942328-52942425)
chr4 (259-353)||(5101310-5101405)
chr4 (256-349)||(16453706-16453800)
chr4 (260-349)||(16455624-16455714)
chr4 (260-353)||(37312924-37313018)
chr4 (275-353)||(47563153-47563231)
chr4 (895-965)||(12396337-12396407)
chr4 (845-965)||(18535220-18535339)
chr4 (419-516)||(26557823-26557920)
chr4 (429-603)||(5336789-5336964)
chr4 (260-347)||(5664635-5664722)
chr4 (276-344)||(18709021-18709088)
chr4 (260-347)||(19323090-19323177)
chr4 (258-332)||(38269993-38270068)
chr4 (257-347)||(18409189-18409281)
chr4 (266-347)||(18534689-18534770)
chr4 (457-519)||(24446678-24446739)
chr4 (541-603)||(55822265-55822326)
chr4 (419-492)||(6133098-6133171)
chr4 (559-674)||(10114412-10114522)
chr4 (863-963)||(13543808-13543908)
chr4 (266-353)||(27499442-27499530)
chr4 (708-817)||(52043716-52043823)
chr4 (260-347)||(12102479-12102566)
chr4 (419-529)||(49088794-49088905)
chr4 (258-332)||(8756101-8756176)
chr4 (541-600)||(16489352-16489410)
chr4 (256-356)||(16933984-16934081)
chr4 (541-600)||(25699752-25699810)
chr4 (541-604)||(29609591-29609654)
chr4 (541-618)||(54906722-54906801)
chr4 (419-516)||(3578670-3578766)
chr4 (541-603)||(4570094-4570155)
chr4 (276-353)||(6133231-6133308)
chr4 (541-603)||(7050378-7050439)
chr4 (420-474)||(10047383-10047437)
chr4 (541-603)||(11853549-11853610)
chr4 (267-347)||(15032401-15032480)
chr4 (545-603)||(16638827-16638884)
chr4 (711-769)||(36380359-36380417)
chr4 (541-603)||(36771396-36771457)
chr4 (420-474)||(39245998-39246052)
chr4 (281-353)||(13547548-13547621)
chr4 (260-347)||(56030857-56030945)
chr4 (542-597)||(3760105-3760161)
chr4 (420-464)||(12743925-12743969)
chr4 (420-464)||(12745314-12745358)
chr4 (908-963)||(18537976-18538029)
chr4 (260-330)||(19096298-19096370)
chr4 (541-617)||(22295294-22295370)
chr4 (419-506)||(22295412-22295500)
chr4 (267-353)||(36380742-36380827)
chr4 (276-347)||(41997887-41997958)
chr4 (541-600)||(4556180-4556238)
chr4 (541-600)||(4558314-4558372)
chr4 (541-600)||(8529270-8529328)
chr4 (419-505)||(10114565-10114652)
chr4 (541-600)||(13072102-13072160)
chr4 (541-600)||(15316961-15317019)
chr4 (257-347)||(18537322-18537412)
chr4 (541-600)||(18586969-18587027)
chr4 (541-600)||(31300427-31300485)
chr4 (849-911)||(33415889-33415952)
chr4 (541-600)||(47566496-47566554)
chr4 (420-474)||(5269230-5269284)
chr4 (259-330)||(619297-619370)
chr4 (562-603)||(4874620-4874661)
chr4 (555-600)||(4884877-4884922)
chr4 (543-618)||(5516367-5516444)
chr4 (421-474)||(36315268-36315321)
chr4 (421-474)||(36329477-36329530)
chr4 (547-618)||(38208809-38208882)
chr4 (536-569)||(38270125-38270158)
chr4 (281-333)||(47275137-47275190)
chr4 (419-490)||(4884985-4885057)
chr4 (419-490)||(8529378-8529450)
chr4 (420-464)||(12739550-12739594)
chr4 (420-464)||(26175636-26175680)
chr4 (420-464)||(36463389-36463433)
chr4 (420-464)||(36994648-36994692)
chr4 (420-464)||(46147391-46147435)
chr4 (420-464)||(48893638-48893682)
chr4 (419-459)||(52942487-52942527)
chr4 (420-472)||(54867188-54867239)
chr4 (420-467)||(3796565-3796612)
chr4 (419-462)||(3937273-3937316)
chr4 (684-776)||(12102067-12102162)
chr4 (565-600)||(15831144-15831179)
chr4 (541-600)||(16689061-16689119)
chr4 (684-769)||(25357622-25357713)
chr4 (921-964)||(33415977-33416020)
chr4 (420-474)||(5143263-5143317)
chr4 (420-474)||(5147681-5147735)
chr4 (420-474)||(5396710-5396764)
chr4 (257-353)||(12395687-12395784)
chr4 (257-353)||(12400649-12400746)
chr4 (444-490)||(15831252-15831298)
chr4 (315-353)||(24879386-24879423)
chr4 (420-474)||(25862061-25862115)
chr4 (541-603)||(36769479-36769540)
chr4 (444-490)||(36769590-36769636)
chr4 (420-474)||(38152478-38152532)
chr4 (471-513)||(54928699-54928741)
chr4 (421-474)||(6743454-6743507)
chr4 (659-724)||(29609681-29609745)
[»] chr6 (150 HSPs)
chr6 (419-891)||(3390226-3390695)
chr6 (419-761)||(13057168-13057510)
chr6 (419-761)||(25477248-25477597)
chr6 (419-761)||(13039728-13040070)
chr6 (419-756)||(9019905-9020241)
chr6 (419-754)||(3631938-3632271)
chr6 (419-761)||(3629864-3630204)
chr6 (429-789)||(3233739-3234098)
chr6 (419-756)||(14507175-14507510)
chr6 (419-756)||(11983028-11983364)
chr6 (423-756)||(32279976-32280308)
chr6 (419-756)||(15541139-15541475)
chr6 (419-756)||(28241320-28241656)
chr6 (419-749)||(14458766-14459093)
chr6 (419-756)||(1230248-1230584)
chr6 (419-716)||(4816230-4816526)
chr6 (419-756)||(15532681-15533016)
chr6 (419-756)||(24338447-24338783)
chr6 (419-771)||(30967162-30967516)
chr6 (419-771)||(30034602-30034957)
chr6 (419-756)||(30728823-30729163)
chr6 (419-716)||(19704566-19704864)
chr6 (419-716)||(20915355-20915651)
chr6 (463-756)||(15530166-15530457)
chr6 (419-756)||(2628885-2629225)
chr6 (420-771)||(12195515-12195865)
chr6 (419-761)||(12161557-12161894)
chr6 (419-716)||(26065005-26065296)
chr6 (419-716)||(26084974-26085265)
chr6 (480-761)||(22490613-22490895)
chr6 (419-756)||(3027850-3028185)
chr6 (419-965)||(26944924-26945461)
chr6 (419-724)||(15719665-15719959)
chr6 (419-716)||(26932561-26932857)
chr6 (608-886)||(32447502-32447776)
chr6 (536-756)||(19227523-19227743)
chr6 (419-776)||(16455423-16455779)
chr6 (419-761)||(14466307-14466639)
chr6 (419-615)||(1069717-1069913)
chr6 (419-781)||(15366990-15367347)
chr6 (419-636)||(5273215-5273431)
chr6 (419-619)||(12186070-12186271)
chr6 (419-776)||(19696400-19696757)
chr6 (481-750)||(17012029-17012294)
chr6 (611-756)||(1072067-1072212)
chr6 (419-701)||(22857951-22858229)
chr6 (419-604)||(26066123-26066307)
chr6 (419-604)||(33308988-33309171)
chr6 (419-604)||(33311257-33311440)
chr6 (419-604)||(26068394-26068578)
chr6 (419-604)||(29754708-29754892)
chr6 (630-771)||(17852506-17852647)
chr6 (259-347)||(2628726-2628814)
chr6 (644-756)||(8995458-8995570)
chr6 (256-356)||(33309233-33309333)
chr6 (607-749)||(13870608-13870749)
chr6 (597-782)||(15346344-15346517)
chr6 (260-356)||(33311502-33311598)
chr6 (259-356)||(14507017-14507113)
chr6 (259-356)||(14458606-14458704)
chr6 (419-529)||(15346553-15346662)
chr6 (419-617)||(28037724-28037927)
chr6 (259-356)||(28241162-28241258)
chr6 (258-356)||(1230088-1230185)
chr6 (643-761)||(10584100-10584213)
chr6 (419-618)||(25078556-25078755)
chr6 (256-356)||(26068231-26068331)
chr6 (260-356)||(29754549-29754645)
chr6 (276-356)||(4816088-4816167)
chr6 (419-503)||(10584227-10584311)
chr6 (277-356)||(19704422-19704502)
chr6 (459-618)||(20526922-20527081)
chr6 (260-344)||(5273055-5273141)
chr6 (259-353)||(11982871-11982965)
chr6 (260-356)||(26065961-26066057)
chr6 (258-349)||(26065365-26065459)
chr6 (258-349)||(26085334-26085428)
chr6 (260-356)||(30967578-30967673)
chr6 (256-353)||(3394742-3394841)
chr6 (445-603)||(12911471-12911629)
chr6 (428-529)||(30445730-30445832)
chr6 (256-332)||(8717191-8717268)
chr6 (260-344)||(12195354-12195439)
chr6 (260-344)||(18322482-18322566)
chr6 (456-603)||(12937229-12937376)
chr6 (257-344)||(26932400-26932487)
chr6 (419-529)||(25465589-25465699)
chr6 (259-344)||(30034446-30034528)
chr6 (849-964)||(3234132-3234247)
chr6 (259-353)||(15367404-15367499)
chr6 (260-353)||(3629711-3629805)
chr6 (260-353)||(9020304-9020398)
chr6 (895-965)||(3396093-3396163)
chr6 (257-353)||(24338292-24338389)
chr6 (257-353)||(30728666-30728763)
chr6 (543-618)||(11138423-11138499)
chr6 (260-353)||(3233567-3233662)
chr6 (541-618)||(7542503-7542581)
chr6 (260-330)||(13057587-13057659)
chr6 (267-353)||(15346719-15346806)
chr6 (276-356)||(20915214-20915293)
chr6 (256-353)||(3631780-3631878)
chr6 (259-353)||(25480253-25480347)
chr6 (419-516)||(28078193-28078291)
chr6 (902-963)||(3390132-3390193)
chr6 (849-911)||(3396168-3396231)
chr6 (419-591)||(11262600-11262775)
chr6 (908-963)||(15719423-15719478)
chr6 (541-600)||(22351973-22352031)
chr6 (909-964)||(32447821-32447876)
chr6 (767-839)||(3396220-3396289)
chr6 (541-591)||(5165936-5165985)
chr6 (541-603)||(13878727-13878788)
chr6 (541-603)||(13883475-13883536)
chr6 (280-353)||(15530027-15530101)
chr6 (541-603)||(16785919-16785980)
chr6 (260-340)||(22611059-22611138)
chr6 (541-603)||(26887345-26887406)
chr6 (541-603)||(31248835-31248896)
chr6 (541-603)||(35201447-35201508)
chr6 (257-332)||(15540987-15541064)
chr6 (543-600)||(19701985-19702041)
chr6 (541-603)||(3577636-3577696)
chr6 (541-600)||(17036058-17036116)
chr6 (541-600)||(17694972-17695030)
chr6 (480-529)||(3833482-3833532)
chr6 (420-474)||(5757517-5757571)
chr6 (420-474)||(10077204-10077258)
chr6 (684-756)||(12186330-12186404)
chr6 (256-344)||(17012417-17012506)
chr6 (256-336)||(25465440-25465519)
chr6 (294-332)||(25477619-25477657)
chr6 (420-474)||(31979517-31979571)
chr6 (541-600)||(13467585-13467642)
chr6 (266-332)||(22491005-22491073)
chr6 (419-490)||(25941780-25941852)
chr6 (419-490)||(30443532-30443604)
chr6 (260-330)||(32280391-32280463)
chr6 (420-464)||(33211185-33211229)
chr6 (419-490)||(33215938-33216010)
chr6 (260-353)||(1069563-1069657)
chr6 (541-596)||(12166267-12166321)
chr6 (419-516)||(22870101-22870196)
chr6 (730-769)||(28038014-28038053)
chr6 (420-474)||(5572280-5572334)
chr6 (420-474)||(21356040-21356094)
chr6 (420-474)||(31936591-31936645)
chr6 (542-601)||(6843262-6843325)
chr6 (260-301)||(17038524-17038565)
chr6 (541-597)||(25941650-25941704)
[»] chr1 (206 HSPs)
chr1 (419-911)||(50078821-50079310)
chr1 (419-899)||(11457476-11457952)
chr1 (419-965)||(50076673-50077195)
chr1 (419-963)||(12302506-12303032)
chr1 (419-965)||(50307547-50308079)
chr1 (17-356)||(2617859-2618199)
chr1 (419-761)||(18839526-18839868)
chr1 (419-756)||(13215025-13215366)
chr1 (419-769)||(16428584-16428934)
chr1 (419-771)||(17324637-17324988)
chr1 (419-755)||(18307054-18307389)
chr1 (419-756)||(38925482-38925815)
chr1 (419-965)||(40133656-40134225)
chr1 (419-893)||(17318703-17319167)
chr1 (419-756)||(51749983-51750319)
chr1 (419-771)||(6995701-6996052)
chr1 (419-755)||(25251275-25251611)
chr1 (427-769)||(9241094-9241436)
chr1 (419-756)||(10399829-10400165)
chr1 (419-756)||(15823490-15823826)
chr1 (419-735)||(31425016-31425335)
chr1 (419-716)||(25127856-25128153)
chr1 (419-756)||(41646864-41647200)
chr1 (419-771)||(31735522-31735877)
chr1 (419-761)||(17186128-17186470)
chr1 (419-769)||(6756458-6756808)
chr1 (419-756)||(39462463-39462799)
chr1 (419-761)||(31489854-31490192)
chr1 (419-771)||(47906193-47906550)
chr1 (419-716)||(15294835-15295131)
chr1 (419-754)||(39932017-39932354)
chr1 (419-756)||(6822959-6823294)
chr1 (419-756)||(20291401-20291736)
chr1 (419-756)||(28840622-28840959)
chr1 (419-771)||(28998254-28998605)
chr1 (419-771)||(29003970-29004321)
chr1 (419-771)||(2510326-2510680)
chr1 (419-761)||(17324004-17324344)
chr1 (419-769)||(31422861-31423224)
chr1 (423-756)||(2617460-2617792)
chr1 (419-771)||(2949233-2949583)
chr1 (419-756)||(14097970-14098307)
chr1 (419-756)||(16226111-16226447)
chr1 (419-756)||(3579618-3579955)
chr1 (419-756)||(13761781-13762116)
chr1 (419-756)||(20302403-20302738)
chr1 (419-761)||(50248571-50248914)
chr1 (419-756)||(27336941-27337279)
chr1 (419-756)||(28842437-28842774)
chr1 (419-771)||(27339132-27339486)
chr1 (419-756)||(28207069-28207403)
chr1 (419-716)||(24325648-24325943)
chr1 (419-716)||(4131376-4131676)
chr1 (431-798)||(8347284-8347648)
chr1 (419-756)||(51752309-51752643)
chr1 (419-771)||(9463245-9463602)
chr1 (422-756)||(47451592-47451919)
chr1 (419-771)||(9459418-9459775)
chr1 (419-708)||(46431707-46431996)
chr1 (419-771)||(42922163-42922512)
chr1 (456-716)||(21948226-21948484)
chr1 (419-716)||(47179697-47179992)
chr1 (419-761)||(14183591-14183928)
chr1 (419-709)||(16432396-16432676)
chr1 (486-771)||(48665100-48665392)
chr1 (419-716)||(47177346-47177641)
chr1 (430-798)||(49495222-49495578)
chr1 (446-761)||(18800600-18800911)
chr1 (444-798)||(15669419-15669771)
chr1 (419-633)||(25248552-25248766)
chr1 (419-620)||(6115103-6115304)
chr1 (501-756)||(6823828-6824091)
chr1 (419-615)||(16429042-16429238)
chr1 (419-794)||(8349051-8349424)
chr1 (419-735)||(13125457-13125772)
chr1 (419-750)||(26520120-26520449)
chr1 (419-633)||(16231630-16231842)
chr1 (419-776)||(27916421-27916778)
chr1 (419-604)||(23785935-23786119)
chr1 (419-608)||(51757623-51757810)
chr1 (419-618)||(30738627-30738830)
chr1 (419-618)||(26613239-26613440)
chr1 (419-621)||(16561545-16561749)
chr1 (419-559)||(23816027-23816166)
chr1 (256-356)||(20291798-20291898)
chr1 (419-756)||(30790401-30790731)
chr1 (442-618)||(155788-155963)
chr1 (259-344)||(13358927-13359012)
chr1 (259-356)||(51750381-51750477)
chr1 (260-356)||(13447117-13447212)
chr1 (260-356)||(10399669-10399767)
chr1 (419-528)||(15916562-15916672)
chr1 (260-356)||(15294678-15294773)
chr1 (260-356)||(20302783-20302879)
chr1 (260-356)||(13762178-13762275)
chr1 (256-344)||(16226522-16226611)
chr1 (260-356)||(24326005-24326101)
chr1 (259-344)||(28842848-28842932)
chr1 (260-353)||(23816230-23816323)
chr1 (661-755)||(25248756-25248850)
chr1 (260-356)||(31735365-31735461)
chr1 (256-356)||(47177704-47177805)
chr1 (256-352)||(51757881-51757977)
chr1 (259-353)||(14097814-14097910)
chr1 (461-614)||(43104245-43104400)
chr1 (260-353)||(39462861-39462956)
chr1 (258-356)||(46431546-46431644)
chr1 (260-353)||(47906611-47906704)
chr1 (260-344)||(16231917-16232002)
chr1 (260-356)||(23786182-23786278)
chr1 (256-353)||(50078631-50078730)
chr1 (260-353)||(2949079-2949173)
chr1 (256-353)||(28206908-28207007)
chr1 (260-353)||(50248417-50248511)
chr1 (276-353)||(15823889-15823967)
chr1 (274-355)||(2510200-2510280)
chr1 (260-344)||(9459277-9459361)
chr1 (260-344)||(9463104-9463188)
chr1 (480-677)||(28279292-28279486)
chr1 (260-356)||(47180055-47180152)
chr1 (258-353)||(50307387-50307484)
chr1 (259-352)||(51752715-51752806)
chr1 (419-513)||(13127687-13127782)
chr1 (454-618)||(14353047-14353210)
chr1 (543-618)||(26332613-26332688)
chr1 (259-353)||(31490252-31490346)
chr1 (260-353)||(3579431-3579524)
chr1 (276-353)||(27336801-27336879)
chr1 (260-353)||(4131221-4131316)
chr1 (259-350)||(6995539-6995631)
chr1 (260-347)||(39932426-39932514)
chr1 (419-475)||(13358797-13358853)
chr1 (256-347)||(14183451-14183542)
chr1 (660-756)||(16231545-16231641)
chr1 (256-353)||(25251117-25251215)
chr1 (256-353)||(27338969-27339070)
chr1 (556-701)||(26332699-26332837)
chr1 (265-352)||(11457327-11457415)
chr1 (256-347)||(16429299-16429391)
chr1 (259-353)||(18839928-18840023)
chr1 (260-347)||(30790250-30790337)
chr1 (260-353)||(12302349-12302446)
chr1 (260-353)||(25248398-25248492)
chr1 (260-353)||(30780386-30780482)
chr1 (895-964)||(17318611-17318680)
chr1 (419-600)||(21353347-21353525)
chr1 (256-353)||(31424858-31424956)
chr1 (908-963)||(50079328-50079383)
chr1 (541-603)||(4144804-4144865)
chr1 (276-353)||(9240951-9241028)
chr1 (256-353)||(28998090-28998191)
chr1 (256-353)||(29003806-29003907)
chr1 (258-349)||(38925326-38925420)
chr1 (256-347)||(8348901-8348991)
chr1 (258-353)||(41647260-41647357)
chr1 (260-347)||(15916734-15916821)
chr1 (259-353)||(47451971-47452066)
chr1 (260-353)||(13215424-13215518)
chr1 (266-353)||(17324484-17324573)
chr1 (685-776)||(26613503-26613597)
chr1 (260-353)||(31422706-31422800)
chr1 (541-618)||(49959129-49959208)
chr1 (541-603)||(2232597-2232658)
chr1 (541-603)||(14997040-14997101)
chr1 (420-464)||(3156989-3157033)
chr1 (684-724)||(6115344-6115384)
chr1 (420-472)||(13598402-13598454)
chr1 (420-464)||(28223421-28223465)
chr1 (288-344)||(28841033-28841088)
chr1 (541-600)||(2401342-2401400)
chr1 (541-600)||(9526469-9526527)
chr1 (258-347)||(17185977-17186067)
chr1 (260-353)||(18307449-18307543)
chr1 (541-600)||(25134074-25134132)
chr1 (420-474)||(16124555-16124609)
chr1 (420-474)||(19072932-19072986)
chr1 (420-474)||(19120822-19120876)
chr1 (420-474)||(26644936-26644990)
chr1 (420-474)||(47098863-47098917)
chr1 (420-474)||(47703975-47704029)
chr1 (445-490)||(9521826-9521871)
chr1 (420-464)||(834167-834211)
chr1 (419-490)||(9526577-9526649)
chr1 (705-769)||(16431032-16431096)
chr1 (266-340)||(25128225-25128301)
chr1 (266-347)||(26519295-26519373)
chr1 (420-464)||(28220226-28220270)
chr1 (420-464)||(28265554-28265598)
chr1 (541-604)||(37990772-37990836)
chr1 (420-464)||(40122196-40122240)
chr1 (423-474)||(3281715-3281766)
chr1 (541-600)||(9521718-9521776)
chr1 (283-353)||(17324414-17324484)
chr1 (423-474)||(29651818-29651869)
chr1 (564-603)||(31047696-31047735)
chr1 (420-467)||(37069774-37069821)
chr1 (542-600)||(2393404-2393461)
chr1 (420-474)||(9476265-9476319)
chr1 (420-474)||(13604662-13604716)
chr1 (266-347)||(18800429-18800510)
chr1 (420-474)||(21536608-21536662)
chr1 (420-462)||(45644354-45644396)
chr1 (420-470)||(47102884-47102934)
chr1 (294-347)||(6114989-6115041)
chr1 (269-336)||(16561819-16561885)
chr1 (716-765)||(43104094-43104143)
[»] chr7 (202 HSPs)
chr7 (419-912)||(20137108-20137596)
chr7 (419-963)||(4295933-4296455)
chr7 (423-889)||(9680638-9681106)
chr7 (419-839)||(11355134-11355548)
chr7 (419-761)||(44724528-44724869)
chr7 (419-771)||(13099473-13099826)
chr7 (419-963)||(42222888-42223448)
chr7 (429-761)||(21679976-21680307)
chr7 (419-771)||(42330996-42331349)
chr7 (419-761)||(39145985-39146327)
chr7 (419-756)||(24748548-24748885)
chr7 (419-756)||(31435045-31435382)
chr7 (419-771)||(443534-443886)
chr7 (419-771)||(38393921-38394276)
chr7 (419-761)||(21678015-21678356)
chr7 (419-756)||(27306229-27306564)
chr7 (419-716)||(48457647-48457943)
chr7 (419-738)||(21592142-21592460)
chr7 (419-756)||(35583-35919)
chr7 (419-756)||(44518-44854)
chr7 (419-756)||(1049295-1049630)
chr7 (419-798)||(9678966-9679349)
chr7 (419-754)||(7470021-7470359)
chr7 (419-756)||(40836742-40837077)
chr7 (432-735)||(24258438-24258744)
chr7 (419-716)||(1849975-1850271)
chr7 (419-716)||(20626032-20626328)
chr7 (419-716)||(20629923-20630219)
chr7 (419-716)||(20642342-20642638)
chr7 (419-770)||(20299394-20299750)
chr7 (419-755)||(21990106-21990440)
chr7 (419-754)||(7471979-7472317)
chr7 (423-755)||(37412128-37412462)
chr7 (423-756)||(20297312-20297648)
chr7 (439-756)||(27832651-27832969)
chr7 (419-716)||(3878571-3878867)
chr7 (480-761)||(25276090-25276371)
chr7 (419-771)||(18345476-18345831)
chr7 (419-716)||(1046924-1047219)
chr7 (419-771)||(3035656-3036014)
chr7 (460-769)||(22828672-22828981)
chr7 (419-771)||(31155910-31156261)
chr7 (419-716)||(7351651-7351947)
chr7 (419-716)||(28487547-28487843)
chr7 (430-798)||(24817362-24817725)
chr7 (419-711)||(40946327-40946618)
chr7 (454-769)||(7188484-7188795)
chr7 (419-756)||(25542485-25542818)
chr7 (432-771)||(7349285-7349629)
chr7 (419-771)||(28485501-28485855)
chr7 (454-769)||(20091581-20091889)
chr7 (423-706)||(43253520-43253801)
chr7 (486-771)||(11757163-11757454)
chr7 (419-639)||(7092212-7092430)
chr7 (536-756)||(26804527-26804746)
chr7 (480-756)||(22251605-22251877)
chr7 (419-681)||(24813496-24813755)
chr7 (423-628)||(7094463-7094667)
chr7 (419-755)||(24465503-24465827)
chr7 (593-756)||(18567567-18567730)
chr7 (419-626)||(38396719-38396924)
chr7 (419-765)||(6332171-6332512)
chr7 (419-604)||(2935374-2935558)
chr7 (419-604)||(9027193-9027376)
chr7 (419-618)||(16297020-16297222)
chr7 (419-604)||(22108173-22108356)
chr7 (419-604)||(40549933-40550116)
chr7 (419-556)||(22393876-22394013)
chr7 (419-604)||(1606486-1606669)
chr7 (419-604)||(22137184-22137367)
chr7 (419-604)||(40552211-40552394)
chr7 (419-701)||(11081521-11081801)
chr7 (419-571)||(26295586-26295738)
chr7 (563-756)||(22392427-22392608)
chr7 (260-356)||(48458005-48458100)
chr7 (256-356)||(7471817-7471917)
chr7 (256-356)||(38394338-38394438)
chr7 (260-356)||(2935621-2935716)
chr7 (448-701)||(6048884-6049134)
chr7 (261-356)||(28487905-28488000)
chr7 (260-356)||(43253358-43253453)
chr7 (259-356)||(11759479-11759576)
chr7 (262-356)||(38396991-38397084)
chr7 (260-356)||(44916-45012)
chr7 (256-356)||(20297714-20297814)
chr7 (256-356)||(7092050-7092150)
chr7 (256-356)||(7094297-7094397)
chr7 (256-356)||(28485917-28486017)
chr7 (484-580)||(6348912-6349008)
chr7 (259-356)||(40836582-40836680)
chr7 (260-356)||(40946682-40946777)
chr7 (277-356)||(35981-36059)
chr7 (260-356)||(1850333-1850429)
chr7 (260-344)||(9027034-9027118)
chr7 (260-356)||(20299812-20299908)
chr7 (260-356)||(25542880-25542976)
chr7 (256-356)||(40550180-40550281)
chr7 (256-344)||(7351487-7351576)
chr7 (259-356)||(3878930-3879028)
chr7 (257-344)||(7349114-7349202)
chr7 (259-356)||(7469863-7469959)
chr7 (260-356)||(1606731-1606827)
chr7 (260-347)||(20626394-20626481)
chr7 (260-347)||(20630285-20630372)
chr7 (260-347)||(20642704-20642791)
chr7 (266-356)||(3036076-3036166)
chr7 (419-591)||(6067197-6067370)
chr7 (257-353)||(42223506-42223603)
chr7 (260-356)||(22137430-22137527)
chr7 (649-710)||(38396316-38396377)
chr7 (260-356)||(40552457-40552554)
chr7 (256-344)||(1049125-1049216)
chr7 (281-356)||(18345893-18345967)
chr7 (260-353)||(27306076-27306170)
chr7 (260-353)||(42330846-42330940)
chr7 (256-349)||(44724932-44725026)
chr7 (269-353)||(9679409-9679495)
chr7 (257-353)||(13099314-13099411)
chr7 (257-353)||(26804861-26804958)
chr7 (541-615)||(40281498-40281572)
chr7 (258-327)||(1502814-1502883)
chr7 (256-351)||(4295777-4295873)
chr7 (541-618)||(11084467-11084544)
chr7 (260-353)||(31434892-31434987)
chr7 (259-332)||(1046756-1046831)
chr7 (293-353)||(21990500-21990560)
chr7 (258-353)||(11355609-11355707)
chr7 (256-353)||(21678412-21678510)
chr7 (260-353)||(21680378-21680472)
chr7 (256-347)||(24748946-24749039)
chr7 (419-673)||(13290472-13290723)
chr7 (419-472)||(11759364-11759417)
chr7 (432-578)||(6046625-6046772)
chr7 (895-963)||(11355010-11355077)
chr7 (914-965)||(20137619-20137670)
chr7 (903-965)||(9680540-9680601)
chr7 (280-353)||(37411988-37412061)
chr7 (541-619)||(2120881-2120960)
chr7 (863-963)||(9678864-9678964)
chr7 (650-769)||(30906280-30906398)
chr7 (259-353)||(443948-444045)
chr7 (292-356)||(22108420-22108484)
chr7 (419-603)||(25351353-25351534)
chr7 (541-765)||(26210491-26210710)
chr7 (661-716)||(7094662-7094717)
chr7 (419-603)||(25410130-25410313)
chr7 (259-305)||(31153690-31153737)
chr7 (541-603)||(3320171-3320232)
chr7 (541-603)||(3324919-3324980)
chr7 (708-765)||(6048617-6048675)
chr7 (541-603)||(7069780-7069841)
chr7 (541-603)||(7074787-7074848)
chr7 (541-603)||(8378625-8378686)
chr7 (420-474)||(9190047-9190101)
chr7 (420-474)||(20284093-20284147)
chr7 (541-603)||(25357047-25357108)
chr7 (541-603)||(25405393-25405454)
chr7 (541-603)||(42006663-42006724)
chr7 (281-353)||(9681170-9681243)
chr7 (562-603)||(12310157-12310198)
chr7 (281-353)||(22251452-22251524)
chr7 (420-464)||(30814560-30814604)
chr7 (256-347)||(7188890-7188983)
chr7 (908-963)||(24817854-24817909)
chr7 (541-600)||(30246973-30247031)
chr7 (541-600)||(44512646-44512704)
chr7 (420-474)||(2580394-2580448)
chr7 (565-603)||(15541139-15541177)
chr7 (541-603)||(21369642-21369703)
chr7 (420-474)||(21983288-21983342)
chr7 (461-523)||(22280379-22280441)
chr7 (259-347)||(24465887-24465976)
chr7 (284-353)||(39145856-39145925)
chr7 (420-474)||(46516349-46516403)
chr7 (420-473)||(4796707-4796760)
chr7 (661-754)||(7092414-7092512)
chr7 (260-336)||(24813348-24813425)
chr7 (276-340)||(25276487-25276549)
chr7 (260-353)||(21591989-21592082)
chr7 (420-464)||(27347941-27347985)
chr7 (420-464)||(31732969-31733013)
chr7 (419-490)||(34546879-34546951)
chr7 (420-464)||(36146408-36146452)
chr7 (420-464)||(41317434-41317478)
chr7 (420-464)||(41649011-41649055)
chr7 (552-600)||(44143997-44144045)
chr7 (420-464)||(47676136-47676180)
chr7 (633-750)||(6348778-6348895)
chr7 (420-490)||(21369753-21369824)
chr7 (565-600)||(34547007-34547042)
chr7 (420-463)||(47263682-47263725)
chr7 (420-474)||(2647735-2647789)
chr7 (420-474)||(9185204-9185258)
chr7 (419-457)||(26804762-26804800)
chr7 (259-347)||(27832487-27832576)
chr7 (420-474)||(28617264-28617318)
chr7 (420-474)||(29159807-29159861)
chr7 (420-474)||(33332489-33332543)
chr7 (420-474)||(35960820-35960874)
chr7 (444-490)||(44010775-44010821)
chr7 (562-603)||(8260584-8260625)
chr7 (256-336)||(24817199-24817280)
[»] chr2 (168 HSPs)
chr2 (419-893)||(17848903-17849373)
chr2 (419-965)||(31732775-31733286)
chr2 (443-964)||(45239000-45239501)
chr2 (419-887)||(28196431-28196891)
chr2 (419-756)||(40032052-40032393)
chr2 (419-768)||(19007548-19007896)
chr2 (419-771)||(42923508-42923861)
chr2 (419-761)||(11739558-11739900)
chr2 (419-839)||(17848287-17848696)
chr2 (419-756)||(6258816-6259150)
chr2 (419-755)||(6264147-6264479)
chr2 (419-756)||(22287335-22287671)
chr2 (419-748)||(34979576-34979906)
chr2 (419-755)||(19502010-19502345)
chr2 (419-761)||(14837188-14837524)
chr2 (419-756)||(19504345-19504680)
chr2 (419-756)||(27104719-27105053)
chr2 (419-771)||(42452688-42453036)
chr2 (419-756)||(42064435-42064771)
chr2 (419-756)||(45279983-45280320)
chr2 (419-756)||(21520692-21521030)
chr2 (419-771)||(23452236-23452591)
chr2 (419-756)||(13910044-13910379)
chr2 (419-761)||(44289066-44289408)
chr2 (419-753)||(3022086-3022428)
chr2 (419-798)||(11578106-11578481)
chr2 (498-755)||(15539552-15539809)
chr2 (419-756)||(43623579-43623903)
chr2 (419-756)||(24162222-24162547)
chr2 (419-789)||(22874029-22874387)
chr2 (419-716)||(35215585-35215881)
chr2 (419-716)||(35217962-35218258)
chr2 (426-769)||(20146613-20146955)
chr2 (419-756)||(18800312-18800637)
chr2 (419-765)||(17897244-17897586)
chr2 (661-965)||(38414281-38414569)
chr2 (419-626)||(5375345-5375550)
chr2 (579-761)||(22163106-22163287)
chr2 (419-798)||(37962940-37963304)
chr2 (430-666)||(28459200-28459435)
chr2 (576-716)||(38020162-38020302)
chr2 (603-756)||(22407591-22407744)
chr2 (419-620)||(40699429-40699632)
chr2 (419-604)||(36558863-36559047)
chr2 (419-604)||(36561140-36561324)
chr2 (419-776)||(35107200-35107552)
chr2 (419-604)||(45332180-45332364)
chr2 (419-559)||(22407453-22407592)
chr2 (266-356)||(23452084-23452174)
chr2 (444-776)||(35028479-35028807)
chr2 (471-603)||(20589763-20589896)
chr2 (259-347)||(19501842-19501930)
chr2 (256-347)||(19504174-19504265)
chr2 (621-716)||(5377629-5377724)
chr2 (258-353)||(42453798-42453892)
chr2 (262-356)||(45279844-45279938)
chr2 (256-356)||(36560977-36561077)
chr2 (662-755)||(38020064-38020157)
chr2 (541-701)||(43139355-43139509)
chr2 (280-356)||(13909907-13909982)
chr2 (419-510)||(22163021-22163111)
chr2 (263-356)||(27105115-27105209)
chr2 (419-529)||(22707750-22707861)
chr2 (491-666)||(27136195-27136368)
chr2 (260-356)||(36558721-36558817)
chr2 (536-633)||(38414196-38414291)
chr2 (256-353)||(21520530-21520629)
chr2 (260-353)||(28459038-28459131)
chr2 (423-550)||(7462950-7463077)
chr2 (260-353)||(43623423-43623518)
chr2 (454-603)||(33603994-33604143)
chr2 (260-353)||(19007956-19008051)
chr2 (543-619)||(26345661-26345738)
chr2 (260-352)||(17849434-17849528)
chr2 (471-619)||(15693958-15694109)
chr2 (260-349)||(22162869-22162959)
chr2 (258-353)||(22707593-22707690)
chr2 (260-356)||(24162063-24162160)
chr2 (419-529)||(23870963-23871072)
chr2 (559-617)||(27583477-27583535)
chr2 (259-356)||(45332019-45332116)
chr2 (259-353)||(22287180-22287275)
chr2 (895-963)||(28196334-28196402)
chr2 (276-356)||(35217827-35217906)
chr2 (419-617)||(13828340-13828542)
chr2 (541-603)||(28458949-28459011)
chr2 (543-618)||(7502975-7503052)
chr2 (685-761)||(12342673-12342750)
chr2 (260-353)||(14837584-14837679)
chr2 (281-353)||(34979456-34979528)
chr2 (287-356)||(42064816-42064884)
chr2 (281-353)||(42923373-42923446)
chr2 (259-353)||(3022488-3022583)
chr2 (293-353)||(5375225-5375284)
chr2 (276-332)||(35215450-35215506)
chr2 (895-962)||(17848812-17848879)
chr2 (541-618)||(17921754-17921833)
chr2 (541-603)||(2740941-2741002)
chr2 (276-353)||(38020396-38020473)
chr2 (895-964)||(17848154-17848222)
chr2 (259-353)||(28196951-28197046)
chr2 (256-353)||(6263989-6264087)
chr2 (541-618)||(30720732-30720811)
chr2 (541-618)||(34575230-34575308)
chr2 (259-340)||(45238841-45238924)
chr2 (541-603)||(2736205-2736266)
chr2 (420-474)||(8390189-8390243)
chr2 (543-604)||(10942634-10942696)
chr2 (543-604)||(10948503-10948565)
chr2 (257-353)||(11739418-11739515)
chr2 (420-474)||(14699046-14699100)
chr2 (541-603)||(17462436-17462497)
chr2 (291-353)||(17848754-17848816)
chr2 (541-603)||(20054886-20054947)
chr2 (541-603)||(22712637-22712698)
chr2 (541-603)||(22717346-22717407)
chr2 (541-618)||(27248021-27248102)
chr2 (444-506)||(39287262-39287324)
chr2 (541-603)||(39680045-39680106)
chr2 (541-603)||(39686983-39687044)
chr2 (541-603)||(45567409-45567470)
chr2 (266-353)||(6258668-6258756)
chr2 (260-353)||(7462789-7462884)
chr2 (260-347)||(22874431-22874519)
chr2 (420-464)||(17057369-17057413)
chr2 (420-464)||(17085352-17085396)
chr2 (541-600)||(12781342-12781400)
chr2 (849-911)||(17848235-17848298)
chr2 (541-600)||(17932637-17932695)
chr2 (444-600)||(17943540-17943692)
chr2 (541-600)||(27517760-27517818)
chr2 (541-600)||(30478997-30479055)
chr2 (420-474)||(13569332-13569386)
chr2 (257-336)||(20146456-20146535)
chr2 (420-474)||(20522224-20522278)
chr2 (420-474)||(28259216-28259270)
chr2 (565-603)||(38190997-38191035)
chr2 (420-474)||(39482935-39482989)
chr2 (420-464)||(723744-723788)
chr2 (419-466)||(8173539-8173587)
chr2 (420-464)||(10707301-10707345)
chr2 (684-776)||(13828603-13828695)
chr2 (419-490)||(30479105-30479177)
chr2 (420-464)||(34139770-34139814)
chr2 (420-464)||(39284960-39285004)
chr2 (420-467)||(1345587-1345634)
chr2 (420-467)||(2838076-2838123)
chr2 (420-463)||(11151591-11151634)
chr2 (260-347)||(20592395-20592484)
chr2 (541-600)||(37170873-37170931)
chr2 (419-512)||(39680133-39680227)
chr2 (419-512)||(39687071-39687165)
chr2 (543-597)||(41303155-41303210)
chr2 (420-474)||(8040064-8040118)
chr2 (420-474)||(10445483-10445537)
chr2 (260-347)||(11577957-11578045)
chr2 (444-490)||(12781246-12781292)
chr2 (565-603)||(20050166-20050204)
chr2 (420-474)||(33118140-33118194)
chr2 (420-474)||(33528660-33528714)
chr2 (420-474)||(34682373-34682427)
chr2 (659-701)||(41304627-41304668)
chr2 (460-501)||(17921871-17921912)
chr2 (708-776)||(20589560-20589629)
chr2 (423-464)||(29867993-29868034)
chr2 (567-600)||(33674551-33674584)
chr2 (708-765)||(40699221-40699278)
chr2 (543-603)||(45158308-45158369)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (419-771)||(79123-79474)
scaffold0031 (260-353)||(79536-79631)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (419-864)||(79711-80148)
scaffold0004 (254-353)||(80210-80311)
scaffold0004 (897-963)||(79661-79726)
scaffold0004 (541-603)||(188363-188424)
[»] scaffold0339 (2 HSPs)
scaffold0339 (419-756)||(3950-4284)
scaffold0339 (281-333)||(4362-4415)
[»] scaffold0005 (6 HSPs)
scaffold0005 (419-756)||(183640-183974)
scaffold0005 (419-771)||(51947-52302)
scaffold0005 (256-353)||(50363-50461)
scaffold0005 (260-353)||(52362-52456)
scaffold0005 (260-356)||(183482-183578)
scaffold0005 (419-486)||(50234-50303)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (419-756)||(41482-41818)
scaffold0038 (259-356)||(41324-41420)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (419-756)||(14972-15308)
scaffold0131 (419-716)||(14381-14677)
scaffold0131 (259-353)||(14230-14323)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (419-716)||(69291-69586)
scaffold0025 (605-716)||(73207-73318)
scaffold0025 (251-347)||(69124-69220)
scaffold0025 (594-637)||(73160-73203)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (419-771)||(11472-11823)
scaffold0154 (261-353)||(11315-11410)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (419-756)||(6152-6488)
scaffold0472 (259-347)||(6558-6647)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (439-784)||(85156-85500)
scaffold0045 (262-353)||(85578-85671)
scaffold0045 (841-917)||(85050-85128)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (419-716)||(34-330)
scaffold0267 (260-356)||(376-473)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (419-756)||(2833-3168)
scaffold0250 (266-344)||(3243-3319)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (419-771)||(15819-16168)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (419-716)||(29164-29459)
scaffold0068 (260-356)||(29521-29616)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (419-747)||(1640-1958)
scaffold0468 (256-347)||(1489-1578)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (419-755)||(16648-16981)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (456-715)||(2036-2293)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (536-761)||(35588-35812)
scaffold0011 (262-353)||(35944-36037)
scaffold0011 (419-486)||(35816-35883)
[»] scaffold0370 (2 HSPs)
scaffold0370 (419-639)||(1452-1670)
scaffold0370 (276-356)||(1310-1389)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (426-750)||(4773-5095)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (419-604)||(22221-22404)
scaffold0140 (419-604)||(24496-24679)
scaffold0140 (259-356)||(24742-24840)
scaffold0140 (256-356)||(22467-22568)
scaffold0140 (420-474)||(8458-8512)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (588-756)||(993-1166)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (256-356)||(1288-1388)
scaffold1674 (419-452)||(1450-1483)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (256-344)||(12711-12799)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (276-356)||(4535-4614)
scaffold0891 (419-474)||(4678-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (444-603)||(57452-57613)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (541-603)||(224819-224880)
scaffold0006 (420-472)||(5687-5739)
scaffold0006 (420-474)||(2496-2550)
scaffold0006 (420-474)||(133319-133373)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (256-301)||(16615-16660)
scaffold0256 (541-600)||(16328-16386)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (276-320)||(1-45)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (420-464)||(20415-20459)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (423-474)||(10736-10787)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (566-600)||(17131-17165)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (420-474)||(44000-44054)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 608; Significance: 0; HSPs: 195)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 1118
Target Start/End: Original strand, 31472611 - 31473304
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472611 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31472710  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472711 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 31472810  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472811 ccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 31472910  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  31472911 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac-----tttatttttattctt 31473005  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagc 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31473006 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgtgctccgattttttaagaatgaatgtgccaattctgctccataaatcgtgctccgattttgacagc 31473105  T
Q  919 ttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaatagataacaacacattacattgacattatttcatacttccataacctaacgaga 1018  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  31473106 ttcagcaaacttcaatttctccaattttaaatcactttcacaacaatagataacaacacattacattgatattatttcatacttcc-taaccaaaccaga 31473204  T
Q  1019 ctgaaattcaacataaacaaggcaacaagaacttaatcactatcaaagtcaatctcctcatcgtcaatgaactgaacaaaaatattattcggaacatttt 1118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31473205 ctgaaattcaacataaacaaggcaacaagaacttaatcactatcaaagtcaatctcctcatcgtcaatgaactgaacaaaaatattattcggaacatttt 31473304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Original strand, 16092198 - 16092746
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16092198 tttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatg 16092297  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092298 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 16092397  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca- 717  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||      
T  16092398 ccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctc 16092497  T
Q  718 --aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttat 814  Q
      | ||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||    
T  16092498 acaagtttacatctgatacaaagtctatatttctagtaaagcaatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaactacgtt---ttatttttat 16092594  T
Q  815 tcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgc-tccataaatcgtgctccaattttg 913  Q
       ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  16092595 gactctgcgccaaatcgtactccgattttgccagatcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgccaattctgcttcgaaaaatcgtgctccgattttg 16092694  T
Q  914 acagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16092695 acagcttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcagtttcacaacaat 16092746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 419 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 25904383 - 25903914
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  25904383 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaacgttacaatagagatatcaatg 25904285  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25904284 tgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 25904185  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25904184 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 25904085  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  25904084 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccttcataaattgaaaccaaattaggcccataaaaatacgt---tttatttttattctt 25903988  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc 892  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25903987 ctgcgcgaaatcgtgctccgattttgccagatcgtgctccgattttttatgaataaaagtgtcaattctgctcc 25903914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 419 - 839
Target Start/End: Original strand, 1189606 - 1190030
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-ggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1189606 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 1189705  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    || ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1189706 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaagtgaatca 1189805  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----t 713  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    |    
T  1189806 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctct 1189905  T
Q  714 ctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagc-atccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttt 811  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  1189906 ctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcaatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttt 1190002  T
Q  812 tattcttctgcgcgaaatcgtgctccga 839  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1190003 tattcttctgcccaaaatcgtgctccga 1190030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 17073164 - 17072822
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17073164 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 17073065  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | ||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17073064 agttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17072965  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17072964 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 17072865  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17072864 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 17072822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40221803 - 40221466
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221803 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 40221704  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40221703 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 40221604  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40221603 ccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 40221504  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40221503 ggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaag 40221466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Original strand, 10474322 - 10474655
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10474322 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatg 10474420  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10474421 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgtatcaa 10474520  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10474521 ccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatttcaa 10474620  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaa 753  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10474621 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 18511211 - 18511547
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18511211 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaacg 18511309  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18511310 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18511409  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  18511410 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 18511509  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18511510 aaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaa 18511547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 696158 - 695833
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  696158 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatg 696059  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  696058 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaa 695960  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  695959 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctttatctcaa 695871  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  695870 ggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 24127136 - 24126795
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24127136 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 24127038  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24127037 agttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaa 24126938  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
     | ||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24126937 tcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagccccatctatctcaa 24126838  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24126837 ggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaagaatcc 24126795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 10529098 - 10529434
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10529098 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 10529196  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10529197 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 10529296  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  10529297 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactctatctcaa 10529396  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10529397 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 10529434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 21948306 - 21947971
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21948306 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaagg 21948208  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21948207 ggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 21948108  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21948107 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaa 21948009  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21948008 aatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 21947971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 2175198 - 2174859
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2175198 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 2175101  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175100 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 2175001  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2175000 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 2174901  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
     |||| | || |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  2174900 agtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaaagcatc 2174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 25921472 - 25921808
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25921472 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 25921570  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25921571 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaa 25921670  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25921671 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 25921770  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25921771 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 25921808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 421 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596576
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgag 18596825  T
Q  521 ttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 620  Q
    ||| || || | |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18596824 ttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaacc 18596725  T
Q  621 ctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaagg 720  Q
    |||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18596724 ctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt--tatacccttgtttcagccccctctatcccaagg 18596627  T
Q  721 tttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18596626 tttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 18596576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 36208856 - 36208370
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208856 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaa-agagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 36208758  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  36208757 ggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatca 36208658  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc 716  Q
    ||     |||| |||| | |  | |  ||||| || |||| || |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36208657 acaac--aaccctagtttctcccgcttagaga-aatctctcta-aaaccctagttt-gttgtttg-tttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 36208564  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||    
T  36208563 aaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcgcaaattggaacaaaatcaggcccataaaaata---tgttttatttttattc 36208467  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaatttt 912  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||    
T  36208466 ttttgcgcgaaatcatgctccgattttgccagatcgtgctctgattttttacgaatggaaagtgtcaattttgctccaaaaattgtactccaatttt 36208370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 2818334 - 2818671
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2818334 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 2818432  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2818433 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaa 2818532  T
Q  619 -ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2818533 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 2818632  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2818633 aagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 2818671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 423 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 25804300 - 25804009
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25804300 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 25804203  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804202 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 25804103  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25804102 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 39854763 - 39854428
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39854763 tttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatg 39854665  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39854664 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 39854565  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39854564 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaa 39854466  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  39854465 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 39854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 428 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4236900 - 4236573
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaag 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4236900 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 4236802  T
Q  528 aagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaac 627  Q
    || | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4236801 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaac 4236702  T
Q  628 cttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacac 727  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||| | |    
T  4236701 cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctccaagtttgctc 4236602  T
Q  728 taatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4236601 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 4236573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 419 - 749
Target Start/End: Original strand, 17818491 - 17818817
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818491 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgta-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 17818587  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17818588 ggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 17818687  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  17818688 ccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag-cccctctttctcaa 17818786  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttata 749  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17818787 ggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 6756772 - 6756470
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6756772 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg 6756674  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
      ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6756673 --ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaa 6756576  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  6756575 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaa 6756476  T
Q  719 ggttta 724  Q
     |||||    
T  6756475 agttta 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 37705779 - 37706115
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37705779 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 37705877  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37705878 ggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 37705977  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  37705978 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatctcaa 37706077  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37706078 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaag 37706115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 18509317 - 18509652
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18509317 tttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaatagatatcaacg 18509415  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509416 agttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18509515  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccc-ctctatctca 717  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||    
T  18509516 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccctctatctctca 18509615  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
    | |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  18509616 aagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 38882385 - 38882049
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38882385 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 38882288  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38882287 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 38882188  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag-ccccctctatctca 717  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  38882187 cccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctatctcc 38882088  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38882087 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 38882049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 6745348 - 6745053
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6745348 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 6745250  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6745249 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6745150  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6745149 ccctcaaacc-tagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagccccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18466964 - 18466625
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18466964 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 18466866  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466865 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18466766  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    |||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  18466765 ccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 18466666  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  18466665 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 18466625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 34477052 - 34477349
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  34477052 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 34477149  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||| ||||| | |  |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477150 ggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 34477249  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477250 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 34479417 - 34479714
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  34479417 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 34479514  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||| ||||| | |  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479515 ggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 34479614  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479615 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 423 - 761
Target Start/End: Original strand, 39397996 - 39398332
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39397996 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggtt 39398094  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  | | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398095 acaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 39398194  T
Q  623 caaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggt 721  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39398195 caaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaggt 39398292  T
Q  722 ttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  39398293 ttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaagaatcc 39398332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 27912816 - 27912459
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  27912816 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 27912718  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27912717 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27912618  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------ 712  Q
    |||||||| | || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||          
T  27912617 ccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctc 27912518  T
Q  713 tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  27912517 tctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 27912459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 31179370 - 31179706
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| || ||||    
T  31179370 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaatg 31179467  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31179468 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31179567  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31179568 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctca 31179667  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31179668 aagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaag 31179706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31543014 - 31542679
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  31543014 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatg 31542917  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||| || ||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31542916 ggttcga-gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31542818  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31542817 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 31542718  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31542717 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 31542679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31545360 - 31545024
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  31545360 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatg 31545263  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31545262 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31545163  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31545162 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctca 31545063  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31545062 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 31545024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16776437 - 16776101
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  16776437 tttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 16776339  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16776338 g-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 16776240  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16776239 cccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 16776140  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccata-tttatagtaaaag 756  Q
     |||| | |  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16776139 agtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaaag 16776101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 27910730 - 27910374
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  27910730 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 27910632  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27910631 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27910532  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccc------ctcta 712  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||      ||||     
T  27910531 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaa-ccttgtttcagcccccgctatctctc 27910433  T
Q  713 tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  27910432 tctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 27910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 2954696 - 2954368
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2954696 tttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata-tgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatg 2954599  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  2954598 ggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaa 2954499  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  2954498 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcatactcctctatctca 2954399  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttat 748  Q
    | ||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  2954398 aagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 423 - 756
Target Start/End: Original strand, 12555926 - 12556258
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaatgggt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  12555926 ttgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaa-gatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagt 12556024  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  ||  | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12556025 tacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactc-caatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 12556123  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggt 721  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  12556124 tcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagt 12556223  T
Q  722 ttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12556224 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 12556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 18469289 - 18468936
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||  |||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18469289 tttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccactaga-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 18469193  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18469192 ggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18469093  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  18469092 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 18468993  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||||   | |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18468992 tcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 18468936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 26098011 - 26097662
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098011 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 26097914  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26097913 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaa 26097815  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26097814 ccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagccccctctatctcaa 26097715  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  26097714 agtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 26097662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 480 - 761
Target Start/End: Original strand, 34530725 - 34531006
Alignment:
Q  480 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacca 579  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||    
T  34530725 actataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagcca 34530824  T
Q  580 agagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 679  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34530825 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 34530924  T
Q  680 tgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34530925 tgcatttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaagaatcc 34531006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 6747584 - 6747290
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  6747584 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatg 6747487  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747486 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6747387  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6747386 ccctcaaacc-tagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6747290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 36402327 - 36402663
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36402327 tttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 36402425  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| || || | |  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36402426 gattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaa 36402525  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36402526 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 36402625  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  36402626 cgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaag 36402663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 21684451 - 21684746
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  21684451 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 21684548  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  21684549 agttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaa 21684648  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21684649 cccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 21684746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 15552525 - 15552229
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  15552525 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 15552428  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15552427 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 15552328  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15552327 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 678
Target Start/End: Original strand, 658355 - 658610
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  658355 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 658450  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  658451 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 658550  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 678  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658551 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 542 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042989
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcc 641  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  642 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtcca 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||||| | | |    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagccta 20043009  T
Q  742 tatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20043008 tatttatagtaaaagaatcc 20042989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 538 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044949
Alignment:
Q  538 ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgttt 637  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  638 gtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatg 737  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||| |    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaag 20044973  T
Q  738 tccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
     | |||||||||||||||| ||||    
T  20044972 cctatatttatagtaaaagaatcc 20044949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 31465988 - 31466313
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31465988 tttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct----------ata-tgatgagtaactttacaaaatagatatcaatg 31466076  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  31466077 ggttacaagaatagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaa 31466175  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  31466176 ccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagccccttttatctcaa 31466275  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31466276 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 31466313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 419 - 751
Target Start/End: Original strand, 6661183 - 6661512
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6661183 tttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaat 6661282  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6661283 gggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatca 6661382  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||  | |||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  6661383 acc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccctctctatctca 6661478  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagt 751  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  6661479 aggtttactctgatacaaggtctatatttatagt 6661512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 428 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 9020491 - 9020086
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaatt-gacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaa 526  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9020491 ccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaa 9020392  T
Q  527 gaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 626  Q
    ||| | |  | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||    
T  9020391 gaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaa--cttcaa 9020294  T
Q  627 ccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttac 725  Q
    || ||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  9020293 ccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttg-tgttgcc-tcccaaacccttgttttcagctccctctagcacaaggtttac 9020198  T
Q  726 a-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgc 824  Q
    | || |||||| ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||| ||||||||    
T  9020197 atctgatacaaggtatgtatttatagtaaaaacatctctcataaattggaacaaaatcagacccataaaaata---tgttttatttttattgttctgcgc 9020101  T
Q  825 gaaatcgtgctccga 839  Q
     ||||||| ||||||    
T  9020100 aaaatcgtactccga 9020086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 20505842 - 20506042
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20505842 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 20505938  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20505939 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20506038  T
Q  619 ccct 622  Q
    ||||    
T  20506039 ccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 21289041 - 21288715
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||        ||    
T  21289041 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaacgttacaaaaga--------tg 21288951  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| |    |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21288950 agttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttttc-aaggtgaatcaa 21288852  T
Q  619 ccctcaaacctta------gtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta 712  Q
    |||||||||| ||      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  21288851 ccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccctcta 21288752  T
Q  713 tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttata 749  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
T  21288751 tctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 10587112 - 10586768
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  10587112 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 10587015  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10587014 gggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 10586915  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccc---ctctat 713  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||| |    
T  10586914 accctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccctctatctct 10586826  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  10586825 ctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 10586768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 633
Target Start/End: Original strand, 41585743 - 41585956
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585743 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatg 41585841  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
      ||| || || | |  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41585842 acttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaatcaa 41585941  T
Q  619 ccctcaaaccttagt 633  Q
    |||||||||| ||||    
T  41585942 ccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 561 - 769
Target Start/End: Original strand, 26098391 - 26098599
Alignment:
Q  561 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctata 660  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098391 caatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctata 26098490  T
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||     
T  26098491 caaaccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtata 26098590  T
Q  761 cctcataaa 769  Q
     ||||||||    
T  26098591 actcataaa 26098599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 2724173 - 2723964
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2724173 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatg 2724075  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |     |||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  2724074 ggttacaagaataaatcacccgcctaattctac---------caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcat 2723984  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg 638  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  2723983 ccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 39798327 - 39798126
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  39798327 tttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatac-gatgagtatcattataaaagagaaatcaatg 39798229  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39798228 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 39798129  T
Q  619 ccc 621  Q
    |||    
T  39798128 ccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 419 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 20054117 - 20053834
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20054117 tttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc--- 20054021  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||| |||||||||||  |||||| ||||||     |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20054020 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatct-----ccaaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 20053926  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctat 713  Q
    | |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20053925 a-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 4410302 - 4410090
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||     
T  4410302 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaata 4410205  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4410204 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 4410105  T
Q  619 ccctcaaaccttagt 633  Q
    ||| |||||| ||||    
T  4410104 cccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 454 - 701
Target Start/End: Original strand, 17413200 - 17413442
Alignment:
Q  454 tgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacc 552  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |  | |   ||||||||||||    
T  17413200 tgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacc 17413299  T
Q  553 caaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaa 652  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||  ||||||| |||    
T  17413300 taaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caa 17413396  T
Q  653 actctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    ||||  |||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  17413397 actc--tacaaaccatagttttagtgctgcc-ttctaaacccttgtttt 17413442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 542 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 42770924 - 42770676
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcc 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||      
T  42770924 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaacc--ccaaccttagtgtttgttg 42770829  T
Q  642 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtcc 740  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||      
T  42770828 ccaagag-caaattctatataaa-cctaattttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-gatacaaagttt 42770734  T
Q  741 atatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42770733 atatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaa-caaatctggcccataaaaatac 42770676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 10749980 - 10749796
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  10749980 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 10749883  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10749882 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 34476892 - 34476990
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34476892 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 34476990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 38960131 - 38960314
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  38960131 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 38960228  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38960229 ggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 34479255 - 34479355
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479255 caattgttgcgaatttgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 34479354  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  34479355 t 34479355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 15354574 - 15354757
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  15354574 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 15354671  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15354672 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 23665323 - 23665140
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23665323 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 23665226  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23665225 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 23793264 - 23793447
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23793264 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 23793361  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23793362 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15143748 - 15143547
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||| ||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15143748 tttgtttacccatttcggtcaaatactgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 15143649  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||   |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  15143648 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatc 15143549  T
Q  617 aa 618  Q
    ||    
T  15143548 aa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 3373136 - 3373320
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  3373136 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 3373233  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac-tcaatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3373234 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 10757456 - 10757273
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  10757456 tttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagaaaaatcaatg 10757359  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10757358 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 15356850 - 15357033
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  15356850 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 15356947  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15356948 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 618 - 756
Target Start/End: Original strand, 20507659 - 20507797
Alignment:
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20507659 acccttaaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 20507758  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  20507759 aagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 20507797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10750141 - 10750041
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10750141 caattgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaa 10750042  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  10750041 t 10750041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 21684294 - 21684389
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21684294 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 21684389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38882525 - 38882430
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38882525 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 38882430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10528937 - 10529035
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528937 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 10529035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10757614 - 10757517
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10757614 ttgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 10757517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4237065 - 4236970
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4237065 tgttgtgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 4236970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4898011 - 4897828
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4898011 tttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaa 4897912  T
Q  518 gggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
     ||||| |||||  |  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  4897911 tggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 3372977 - 3373074
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3372977 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 3373074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 587
Target Start/End: Original strand, 23741858 - 23742023
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23741858 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 23741955  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 587  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23741956 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactc 23742023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25804467 - 25804366
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25804467 caattgttgcgtattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 25804369  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  25804368 aat 25804366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Original strand, 25921321 - 25921410
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25921321 gaattcgttgagaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaattaaat 25921410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 36402168 - 36402265
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36402168 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaatta 36402265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 603
Target Start/End: Original strand, 15445265 - 15445453
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15445265 tttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 15445363  T
Q  518 gggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtg---accaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||| |||||  || | ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15445364 gggttacaagaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttcatgtggccgccaagagactcaatcctaacagtgttt 15445453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 457 - 716
Target Start/End: Original strand, 2144599 - 2144856
Alignment:
Q  457 gggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg-ggttagaagaagatg-catcccgcctaattctaccca 554  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| |||||   | | ||   |||||||| |||||    
T  2144599 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccaccca 2144697  T
Q  555 aagtc-tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt-ttgtccccaagagaca 651  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |  | |||| |||||| ||||  ||||||| ||    
T  2144698 aagtcctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-ca 2144794  T
Q  652 aactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  2144795 aactc--tacaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgtttttgccccttctctctc 2144856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Original strand, 26098287 - 26098380
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagata 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098287 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccat-atgatgagtaacgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 42771024 - 42770934
Alignment:
Q  486 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtga 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42771024 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtga 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4410459 - 4410386
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4410459 ttgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 4410386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 15356686 - 15356787
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  15356686 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 15356785  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  15356786 at 15356787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23665488 - 23665387
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23665488 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 23665389  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  23665388 at 23665387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 23793099 - 23793200
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23793099 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 23793198  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  23793199 at 23793200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 38959972 - 38960056
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38959972 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 38960056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 895 - 963
Target Start/End: Original strand, 1190086 - 1190154
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1190086 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 1190154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 15354412 - 15354511
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  15354412 attgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 15354511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39798470 - 39798384
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39798470 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 39798384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2175341 - 2175243
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2175341 tgttgtgaattcgatcaaaaaagtcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 2175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 23741697 - 23741794
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  23741697 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 23741794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 355
Target Start/End: Original strand, 31179213 - 31179308
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31179213 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaa 31179308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2724330 - 2724233
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2724330 attgttgcgaatttgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 2724233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15552685 - 15552600
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15552685 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatg 15552600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 353
Target Start/End: Original strand, 2818186 - 2818272
Alignment:
Q  268 attcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2818186 attcgatgaaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 2818272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 541 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754158
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtc 640  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||     
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  641 cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  4754214 gccaagag-caaactc--tacaaaccctagtgtttgtgttggcttt-taaacccttgtttt 4754158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 41585578 - 41585674
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585578 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 41585674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 351
Target Start/End: Original strand, 658204 - 658295
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  658204 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtacggaacaat 658295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 660 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410045
Alignment:
Q  660 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4410045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10587252 - 10587166
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10587252 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaa-ggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 10587166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 31465832 - 31465928
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31465832 ttgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 31465928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 18511052 - 18511150
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18511052 caattgttgcgaattcgatgataaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 18511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 26098125 - 26098225
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26098125 caattgttgcgaattcgatgagaaaactcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaat 26098223  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  26098224 ta 26098225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27912969 - 27912887
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912969 gaattcgatgaaaaatcccaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27912887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18467127 - 18467035
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18467127 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18467035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18469448 - 18469360
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18469448 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18469360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27910876 - 27910784
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27910876 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 27910784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40221969 - 40221869
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221969 gacaattgttgtaaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaat 40221871  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  40221870 ta 40221869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21948464 - 21948372
Alignment:
Q  264 gcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21948464 gcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaatta 21948372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 546 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748351
Alignment:
Q  546 ttctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcccc 643  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||| |||  |||| || |||||||  ||    
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    |||||   || ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  29748404 aagag---aattctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttt 29748351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 895 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 36208366 - 36208298
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  36208366 aaatcgtgctccgattttgacagcttcagcaaacttcaatttcaccaattttaagtcactttcacaaca 36208298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 17818351 - 17818429
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17818351 gaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 17818429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 34530559 - 34530653
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34530559 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaatta 34530653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39854921 - 39854826
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39854921 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaatta 39854826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 661 - 756
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586041
Alignment:
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||   | ||||||||||||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaag 41586041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6745511 - 6745410
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat--caaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  6745511 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaat 6745412  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  6745411 ta 6745410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 689 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 2723978 - 2723906
Alignment:
Q  689 aaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2723978 aaaccctagtgtttgctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 2723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6747745 - 6747646
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa--tcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6747745 attgttgcgaattggatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaatta 6747646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21289187 - 21289105
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289187 gaattcgatgaaaaatcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 21289105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1189454 - 1189546
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1189454 tgttgtgaattcgatgaaaa-cacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaa-caaaatgtatggaacaatta 1189546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2298122 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 10627425 - 10627364
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10627425 cctaattctacccta-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20045395 - 20045326
Alignment:
Q  284 accaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045395 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 20045326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 20505683 - 20505784
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa--tcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20505683 caattgttgtgaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaat 20505782  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  20505783 ta 20505784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 31472454 - 31472531
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31472454 caattgttgcgaattcgatgaaaaatacacaccgataacaaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaa 31472531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31543153 - 31543099
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31543153 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaa 31543099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 484 - 618
Target Start/End: Original strand, 34033630 - 34033768
Alignment:
Q  484 taatgatgagtaactttacaaaagagatatc-aatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtc-tcaatctcttcccgtgaccaa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | || | | | ||   | |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  34033630 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcgaaggggttaccataacaagtcttcaaacttaattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaa 34033729  T
Q  581 gagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34033730 gagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa 34033768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2954843 - 2954755
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2954843 gaattcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 2954755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 895 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25903889 - 25903825
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcaca 960  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25903889 aaatcgggctccaattttgatagcttcggcaaact-caatttctccaattttgaatcactttcaca 25903825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36209009 - 36208913
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36209009 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 36208913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6756926 - 6756832
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6756926 gttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 6756832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18597080 - 18596985
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18597080 ttgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 18596985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 20045271 - 20045211
Alignment:
Q  469 ccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20045271 ccctccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttaaaagaa 20045211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24127292 - 24127196
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  24127292 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacacaaataacaaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 24127196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31545502 - 31545454
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31545502 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggttaatcaagcaa 31545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Original strand, 37705625 - 37705723
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37705625 ttgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaa-caaagtatatggaataattaaa 37705723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Original strand, 6661038 - 6661124
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaatcacaccaa-taacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6661038 gttgtgaattcgatgaaaatcacaccaattaaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 6661124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 35430338 - 35430259
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35430338 cctaattctacccaaagacccgaatctcttccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 1170872 - 1170811
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1170872 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11917011
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 11917011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 12555779 - 12555852
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12555779 tcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 12555852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16776577 - 16776500
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16776577 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 16776500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782639
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31782578 cctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 35385573 - 35385634
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35385573 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26098071
Alignment:
Q  296 ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 26098071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 533937 - 533893
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  533937 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 533893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 10474203 - 10474262
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10474203 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 10474262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20043270 - 20043222
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 467  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20043270 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 32520597 - 32520533
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtc-tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  32520597 cctaattctacccaaagtcatgaatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttc 32520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 42428430 - 42428474
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42428430 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 42428474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 11962554 - 11962612
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11962554 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacacaatcctaatagtg 11962612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 15224889 - 15224968
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15224889 cctaattttacccaaagtctcgaatctcttcccatgaccaaaagactttatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 15224968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 22672895 - 22672837
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22672895 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25452556 - 25452498
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25452556 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31183095
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 31183095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 696310 - 696218
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaa-ccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  696310 tgttgtgaattcgatgagaaaatcataccaataacagacttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaat-aaagtgtatggaaca 696218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 855 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 9020091 - 9020025
Alignment:
Q  855 ctccgattttttatgaatgaaa-gtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagctt 920  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  9020091 ctccgattttttacaaatgaaaagtgtcaattctgctccaaaaatcgtactccaattttaacagctt 9020025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353371
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 9353371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 591
Target Start/End: Original strand, 26406594 - 26406643
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 591  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26406594 cctaattctactcaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatc 26406643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 28832263 - 28832317
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28832263 ttgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 28832317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932389
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 36932389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 828 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 2954369 - 2954308
Alignment:
Q  828 atcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgatttttt-atgaatgaaagtgccaattctg 888  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2954369 atcgtgctccgattttgccagattgtgctcagatttttttacgaatgaaagtgccaattctg 2954308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13295896 - 13295835
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  13295896 taattctacccaaagtctcgaatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaaaagtgttt 13295835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17004004
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 469  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 17004004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20054266 - 20054182
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054266 tgttgtgaattcgataaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 20054182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 25445557 - 25445501
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatag 598  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25445557 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 538193 - 538149
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  538193 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 538149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23667598 - 23667542
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccg 475  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23667598 tttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccg 23667542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33831848 - 33831804
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33831848 ttgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagaga 33831804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 42238443 - 42238371
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  42238443 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 42238371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Original strand, 16092045 - 16092137
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16092045 tgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataacaaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa--caaagtatatggaacaatt 16092137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 603
Target Start/End: Original strand, 16093438 - 16093473
Alignment:
Q  568 ttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16093438 ttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25904537 - 25904443
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |  || ||||||||||  | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  25904537 ttgttgcgaattcgatgagaaaacacaccataataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaa-caaagtgtatggaacaatta 25904443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 28786442 - 28786407
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28786442 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 1240489 - 1240428
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  1240489 cctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 708 - 765
Target Start/End: Original strand, 2144878 - 2144936
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2144878 ctctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctca 2144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281809
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctcc 10281809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 867
Target Start/End: Original strand, 11962821 - 11962867
Alignment:
Q  821 gcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgatttttta 867  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11962821 gcgcaaaatcgtgctccgatttttccagatcgggctccgatttttta 11962867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12084268 - 12084214
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  12084268 ttgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctcc 12084214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464590
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctcc 15464590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17073322 - 17073227
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| || ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17073322 ttgttgtgaattcgatccgaaaat-acaccaataataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaatta 17073227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20043430 - 20043329
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataa-tcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaa 350  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20043430 gacaattgttgtggattcaatgagaaaacacatcaataacaaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaa-caaagtgtatggaacaa 20043332  T
Q  351 tta 353  Q
    |||    
T  20043331 tta 20043329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 29748311 - 29748265
Alignment:
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29748311 atacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcaaaatttggaac 29748265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 257)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 3314945 - 3314403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3314945 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatg 3314846  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3314845 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3314746  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3314745 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaa 3314646  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  3314645 ggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggacccaaatcaggcccataaaa-tacctt---ttatttttattctt 3314550  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca-taaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  3314549 ctgcgtgaaatcgtgctccgattttgccagatcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctgctctagaaaatcgtgctcctattttgacag 3314450  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3314449 cttcaacaaacttcaatttcttcaattttgaatcactttcacaacaa 3314403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 419 - 893
Target Start/End: Original strand, 880448 - 880919
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880448 tttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 880546  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  880547 ggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 880646  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  880647 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcagacccctctatctca 880746  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattct 817  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  880747 aggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattct 880843  T
Q  818 tctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca 893  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  880844 tctgcgcgaaatcgtgcgccgattttgccagatcgtactccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctactcca 880919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 428 - 965
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890310
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaag 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaag 889877  T
Q  528 aagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaac 627  Q
    || |    ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  889878 aataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaac 889976  T
Q  628 cttagtgtttgtccccaag-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttaca 726  Q
    |  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  889977 cccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggttt--tgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttaca 890074  T
Q  727 ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcga 826  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |    
T  890075 ctgatacaatatctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac---attttgtttttattcttctgcgcaa 890171  T
Q  827 aatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaa 926  Q
    |||||||||  || ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  890172 aatcgtgctatgatttttccatatcgtgctctgattttttacgaatgaaagtgccaattctactccaaaaattgtggtccgattttgacagcttcaacaa 890271  T
Q  927 acttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  890272 acttcaatttctccaattttgagtcactttcataacaat 890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 419 - 960
Target Start/End: Original strand, 51674763 - 51675290
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51674763 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatg 51674861  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51674862 gattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 51674961  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||           | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51674962 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagggacaaac-----------cttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 51675050  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
     ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |   |||||||||||||||    
T  51675051 cgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaaacatccctcataaattggaaccaaatcagacctataaaaatacgt---tttatttttattctt 51675147  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca-taaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    || || |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  51675148 ctacgtgaaatcgtgctctgattttgccagatcgtgctccgattttttacgaatcaaagtgacaattctgctccagaaaatcgtgctccgattttgacag 51675247  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcaca 960  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51675248 cttcagaaaacatcaatttctccaattttgagtcactttcaca 51675290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 419 - 964
Target Start/End: Original strand, 47148892 - 47149458
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47148892 tttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatg 47148990  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47148991 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatcaa 47149089  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctat---- 713  Q
    || ||||| |  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  47149090 ccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcc 47149189  T
Q  714 ctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagc-atccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttt 811  Q
    |||||||  |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||||    
T  47149190 ctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcaatccctcataaattggaaccaaatcaagcccataaaaatacgt---tttatttt 47149286  T
Q  812 tattcttctgcgcgaa-----------------atcgtgctccgactttgccagatcgcgctccga-ttttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc- 892  Q
    ||||||||||||||||                 |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  47149287 tattcttctgcgcgaaatcgtactccgtaccagatcgtgctccgattttaccagatcgtgctccgatttttttacgaatgaaagtgtcaattctgctcca 47149386  T
Q  893 ataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47149387 aaaaatcgtgctccgattttgacagcttcatcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaa 47149458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 420 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53590908
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 519  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggg-agagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgg 53591345  T
Q  520 gttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaac 619  Q
     ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  53591344 attagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53591245  T
Q  620 cctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaag 719  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  53591244 cctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaac-----------cctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaag 53591156  T
Q  720 gtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttc 819  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  53591155 gtttacacttatacaatgtctatatttatagtaaaagcattcctcataaatcggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattcttc 53591059  T
Q  820 tgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc----ataaatcgtgctccaattttgac 915  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||   ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    | ||||||| |||| ||||||||    
T  53591058 tgcgcgaaatcatgctccgatttttccagatcatcctccgatgttttacgaatgaaagtgtcaattctgctccaaaaaaaaatcgtactccgattttgac 53590959  T
Q  916 agcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaata 966  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||    
T  53590958 agcttcagcaaacttcaatttcttcaattttgagttattttcacaacaata 53590908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 1313669 - 1313319
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1313669 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 1313571  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313570 gattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1313471  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1313470 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagccccctctatctcaa 1313372  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1313371 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 1313319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 630 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 6231499 - 6231169
Alignment:
Q  630 tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacacta 729  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  6231499 tagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttacactg 6231400  T
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaat 829  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  6231399 atacaatgtctatatttatagtaaaatcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattcttctgcgcgaaat 6231303  T
Q  830 cgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaact 929  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6231302 cgtgctccaattttgccagatcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctactccaaaagttgtgctccgattttgacagcttcagcaaact 6231203  T
Q  930 tcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6231202 tcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 6231169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 1626680 - 1627016
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626680 tttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 1626778  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1626779 ggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1626878  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1626879 ccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 1626978  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1626979 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 43423460 - 43423796
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423460 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 43423558  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423559 agttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43423658  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43423659 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctttctcaa 43423758  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43423759 ggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 53917661 - 53918012
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917661 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 53917759  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53917760 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 53917859  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  53917860 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagccccctccatctcaa 53917959  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||  || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  53917960 ggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 53918012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 4308278 - 4308614
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4308278 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 4308376  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4308377 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 4308476  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4308477 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 4308576  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4308577 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 4308614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 782
Target Start/End: Original strand, 28761424 - 28761787
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761424 tttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 28761523  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28761524 gggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 28761623  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    || |||||||| | ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28761624 actctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctca 28761722  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28761723 aggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatc 28761787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 31151605 - 31151120
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||      
T  31151605 tttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca-- 31151508  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31151507 gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31151408  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc 716  Q
    |||  | |||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31151407 acc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 31151312  T
Q  717 aaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttatt 815  Q
     ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||     |  |||||||||||     
T  31151311 gaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattgtaacaaaataaggcccataaaaa-----tgttttatttttatg 31151217  T
Q  816 cttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  31151216 cttctgcgcgaaattgtgctccaattttgccagatcatgctccgatattttacgaatgggaagtgccaattctgctctaaaaatcgtgctccgattt 31151120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 43421412 - 43421747
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421412 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 43421510  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43421511 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43421610  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  43421611 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaa 43421710  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43421711 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 28101999 - 28102340
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28101999 tttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagtaactttacaaaagagatatcaatg 28102097  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28102098 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaa 28102197  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28102198 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 28102297  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    || |||| ||||||||| |   |||||||||||||||| ||||    
T  28102298 gggttactctaatacaacgcttatatttatagtaaaagaatcc 28102340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 45883200 - 45882863
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45883200 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 45883102  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    | |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45883101 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 45883002  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45883001 accctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 45882902  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45882901 tagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 45882863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 10956024 - 10956359
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10956024 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 10956122  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10956123 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaa 10956222  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  10956223 ccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatcttca 10956322  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
     |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  10956323 tgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10956359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 53915493 - 53915844
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53915493 tttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta-aatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatg 53915591  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  53915592 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaa 53915691  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  53915692 ccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagccccctctatcttaa 53915791  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  53915792 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 53915844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 5926761 - 5927097
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  5926761 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattata-tgatgagtaaccttacaaaagatatataaatg 5926859  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5926860 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaa 5926959  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5926960 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaa 5927059  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5927060 ggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 11170664 - 11170328
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11170664 tttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 11170566  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11170565 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11170466  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
     || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11170465 tccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 11170366  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11170365 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 11170328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 38890300 - 38890004
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38890300 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 38890202  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38890201 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 38890102  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38890101 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38890004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 10958320 - 10958655
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10958320 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 10958418  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10958419 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 10958518  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  10958519 ccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatcttta 10958618  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
     |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  10958619 tgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10958655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 644 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 3306835 - 3306518
Alignment:
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccata 743  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  3306835 aagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaatgtctata 3306736  T
Q  744 tttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgacttt 843  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3306735 tttatagtaaaaacatctctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaactatgtt---ttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgatttt 3306639  T
Q  844 gccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca-taaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaa 942  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3306638 gccagatcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgccaattctactccagaaaatcgtgctccgattttgacagctttagcaaacttcaatttctccaa 3306539  T
Q  943 ttttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  3306538 ttttgagtcactttcacaaca 3306518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51943630 - 51943295
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  51943630 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatg 51943532  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| |  | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51943531 agttacaagaaaagtc-tcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 51943433  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  51943432 ccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctctatctcca 51943333  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  51943332 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaag 51943295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 53468450 - 53468793
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat--gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468450 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 53468549  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53468550 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 53468649  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||  |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  53468650 aatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctttatcta 53468748  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53468749 aaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 53468793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24979968 - 24979631
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  24979968 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaat 24979870  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
      |||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24979869 ttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatca 24979770  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24979769 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 24979670  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| || |||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  24979669 aagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaag 24979631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43228551 - 43228215
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43228551 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 43228453  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43228452 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43228353  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  43228352 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcca 43228253  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43228252 agtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaag 43228215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 51727004 - 51727339
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51727004 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 51727102  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51727103 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 51727202  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  51727203 ccctcaaacc-cagtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaa 51727301  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  51727302 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 51727339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 18099167 - 18099503
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  18099167 tttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatg 18099265  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18099266 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18099365  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-a 717  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  18099366 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 18099465  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18099466 aagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaaag 18099503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 36012087 - 36011746
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36012087 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 36011989  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36011988 ggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaa 36011889  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36011888 ccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctttatctcaa 36011789  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36011788 ggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 36011746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3859787 - 3859452
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  3859787 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 3859690  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3859689 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3859590  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3859589 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 3859490  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3859489 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 3859452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 25533702 - 25533406
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25533702 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 25533604  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533603 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 25533504  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25533503 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 25533406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 42990564 - 42990268
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42990564 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 42990466  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990465 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 42990366  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42990365 ccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43226345 - 43226010
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43226345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 43226247  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43226246 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43226147  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43226146 cccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 43226048  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43226047 agtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaag 43226010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 420 - 756
Target Start/End: Original strand, 32264035 - 32264376
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaatg 518  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264035 ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatg 32264134  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32264135 ggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 32264234  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32264235 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctctatctcaa 32264334  T
Q  719 gg----tttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |    ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32264335 agttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 32264376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 4103893 - 4104247
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  4103893 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 4103990  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4103991 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 4104090  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  4104091 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 4104190  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  4104191 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 4104247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Original strand, 18096900 - 18097234
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||    
T  18096900 gttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggt 18096998  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096999 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18097098  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-aagg 720  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |    
T  18097099 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctctcaag 18097198  T
Q  721 tttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18097199 tttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 18097234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 27101178 - 27101474
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27101178 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatg 27101276  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27101277 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27101376  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27101377 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 27101474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 30006101 - 30005805
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30006101 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 30006003  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30006002 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 30005903  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30005902 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 463 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561740
Alignment:
Q  463 gagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctc 561  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatac 661  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 6561829  T
Q  662 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  6561828 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18162923 - 18162588
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  18162923 tttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaat 18162826  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18162825 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 18162726  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||     
T  18162725 atcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--tccctctatctcc 18162628  T
Q  718 aggtttacac-taatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18162627 aagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 18162588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 48361668 - 48362003
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  48361668 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatatt-atgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatg 48361766  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48361767 agttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 48361866  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  48361867 ccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagccccctgtatctcaa 48361965  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48361966 agtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 48362003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 458544 - 458189
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  458544 tttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 458447  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  458446 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 458347  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----t 713  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |    
T  458346 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 458247  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  458246 ctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 458189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 760
Target Start/End: Original strand, 10084386 - 10084730
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  10084386 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacg 10084484  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10084485 ggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 10084584  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||    
T  10084585 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctctatctctc 10084684  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
    |||| |||| | |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10084685 tcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatc 10084730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 39715725 - 39715394
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715725 tttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggggagag--caaccatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 39715631  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||  ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39715630 ggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 39715531  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  39715530 ccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttcag-cccctctatctcaa 39715432  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  39715431 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaag 39715394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 9604604 - 9604899
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9604604 tttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 9604702  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9604703 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 9604802  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9604803 ccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccctctatctc 9604899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22114302 - 22114638
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| || ||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22114302 tttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 22114400  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22114401 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22114500  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  22114501 cccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcca 22114600  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22114601 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 22114638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 456167 - 455812
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  456167 tttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 456070  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  456069 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 455970  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----t 713  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |    
T  455969 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 455870  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  455869 ctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 455812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 747017 - 746660
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  747017 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 746920  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  746919 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 746820  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----- 712  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||         
T  746819 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 746720  T
Q  713 -tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  746719 ctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 746660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 794
Target Start/End: Original strand, 54691571 - 54691944
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  54691571 tttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatg 54691669  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
       || ||||| | |  ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| | ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54691670 aaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 54691769  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  54691770 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-ccccctctatcttaa 54691868  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaa 794  Q
    ||||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  54691869 ggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccttcataaattggaacaaaattaggcccaaaaaa 54691944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 25389165 - 25388886
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  25389165 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 25389068  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25389067 ggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatca 25388969  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 700  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25388968 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 25388886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5191911 - 5191577
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  5191911 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagaacagccctctgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 5191815  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5191814 ggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 5191715  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5191714 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 5191615  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| |    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5191614 agtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaag 5191577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 23633713 - 23633371
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23633713 tttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcg 23633616  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  23633615 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaa 23633518  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23633517 cc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttagccctctctatctcaa 23633422  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23633421 ggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 23633371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15781139 - 15780784
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcag---ccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga----t 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    |    
T  15781139 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatat 15781040  T
Q  512 atcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggt 611  Q
    |||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15781039 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggt 15780940  T
Q  612 gaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagaca-----------aactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 700  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15780939 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 15780840  T
Q  701 tagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15780839 cagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15780784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 38210630 - 38210334
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  38210630 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 38210533  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     |||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38210532 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 38210433  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38210432 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38210334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 6063443 - 6063781
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  6063443 tttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 6063540  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6063541 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 6063640  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc- 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6063641 acccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 6063740  T
Q  717 -aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     || |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6063741 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 6063781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26720807 - 26720472
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  26720807 tttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaag 26720709  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  26720708 ggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaa 26720610  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  26720609 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcca 26720510  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26720509 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 26720472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 6065793 - 6066130
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  6065793 tttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 6065890  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6065891 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 6065990  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag-ccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6065991 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctatctc 6066090  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6066091 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 6066130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 10621527 - 10621823
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  10621527 tttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 10621624  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10621625 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 10621724  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10621725 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctctatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 50494259 - 50493963
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  50494259 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 50494162  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50494161 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 50494062  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50494061 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 50493963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 1321739 - 1321483
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1321739 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 1321641  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1321640 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1321541  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 676  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1321540 cccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 12267972 - 12268299
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||             
T  12267972 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagag--------- 12268061  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
      ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12268062 --ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 12268159  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12268160 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctctatctc 12268259  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  12268260 aaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaag 12268299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 10191307 - 10191602
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  10191307 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacg 10191405  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10191406 ggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 10191504  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  10191505 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctttatctc 10191602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 5522624 - 5522948
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  5522624 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 5522721  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5522722 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 5522821  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| ||||||  ||||||||| || |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5522822 cccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 5522910  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5522911 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 5522948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 536 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 35777566 - 35777345
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtg 634  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35777566 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 35777467  T
Q  635 tttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaataca 734  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||    
T  35777466 tttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgataca 35777367  T
Q  735 atgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  35777366 atgtctatatttatagtaaaag 35777345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 419 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6484620 - 6484372
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6484620 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatg 6484522  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6484521 ggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6484422  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccc 667  Q
    ||||||||||   || |||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6484421 ccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 536 - 761
Target Start/End: Original strand, 28100154 - 28100379
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28100154 tcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 28100253  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  28100254 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggttactctgatacaa 28100353  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
     |   |||||||||||||||| ||||    
T  28100354 cgcttatatttatagtaaaagaatcc 28100379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 458 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956650
Alignment:
Q  458 ggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaag 557  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 29956809  T
Q  558 tctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactct 657  Q
    || ||  |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||    
T  29956808 tcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactct 29956709  T
Q  658 atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29956708 atacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 4666774 - 4666535
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4666774 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 4666678  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatc--ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    | ||| ||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4666677 gattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatc 4666578  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctat 659  Q
    |||||||||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||    
T  4666577 aaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918282
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 35918041  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  |||| |||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35918042 tacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccc 35918141  T
Q  622 tcaaac------cttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatct 715  Q
    ||||||       || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35918142 tcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 35918241  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||  ||| |  | |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35918242 caaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaag 35918282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 426 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 53597491 - 53597152
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttag 524  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  53597491 acccaattcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttac 53597392  T
Q  525 aagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 624  Q
    ||||| | |  ||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  53597391 aagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--cttc 53597294  T
Q  625 aaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggttta 724  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  53597293 aaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttgac-ttataaacccttgtttca-tcccctctatctcaaggttta 53597197  T
Q  725 cactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    | || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53597196 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 53597152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 419 - 690
Target Start/End: Original strand, 28413029 - 28413299
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  28413029 tttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 28413126  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28413127 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 28413226  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 690  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28413227 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 536 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28181166 - 28180943
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  28181166 tcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaatcccagtgt 28181067  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28181066 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaa 28180969  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  28180968 tgtctatatttatagtaaaagaatcc 28180943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 42992530 - 42992250
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  42992530 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactata-tgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatg 42992432  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| |||||             |||  |||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42992431 agttacaagaa-------------taa--ctacccaaagtc-cactctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 42992348  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42992347 ccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 42992250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 32219345 - 32219026
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32219345 tttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaat 32219247  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| || || | |  | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32219246 gggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatca 32219147  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32219146 accttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatctca 32219058  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttata 749  Q
    | |||||  |  |||||| ||| |||||||||    
T  32219057 aagtttagtcagatacaaggtctatatttata 32219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 423 - 628
Target Start/End: Original strand, 25688161 - 25688366
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggt 25688259  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688260 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 25688359  T
Q  622 tcaaacc 628  Q
    |||||||    
T  25688360 tcaaacc 25688366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 419 - 658
Target Start/End: Original strand, 7606585 - 7606822
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  7606585 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgttacaaat-agaaatcaatg 7606682  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7606683 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 7606782  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactcta 658  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7606783 ccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 498 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 23637205 - 23636925
Alignment:
Q  498 tttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  23637205 tttataaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaata 23637106  T
Q  598 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 697  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  23637105 gtgtttctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttg 23637010  T
Q  698 ttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||  |||||||||||| | ||| ||||||    
T  23637009 ttttagcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatccctcataaaattgaaacaaatc 23636925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 426 - 782
Target Start/End: Original strand, 13420189 - 13420531
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttag 524  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13420189 acccatttcggtccaaaactgacctagtctggtg-agagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttac 13420287  T
Q  525 aagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 624  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  13420288 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc--- 13420384  T
Q  625 aaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggttta 724  Q
    |||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||          ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  13420385 aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctagtttgatt----------taaacccttgtttcagcctcctatatctcaaggtttg 13420473  T
Q  725 cactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    |  | ||||||   | |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||    
T  13420474 ctttgatacaaaacctatatttatagtaaaagtatccttcataaaattgaaacaaatc 13420531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 419 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17795519 - 17795269
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795519 tttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 17795420  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  17795419 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaa 17795320  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 673  Q
    |||   |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  17795319 ccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 419 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 19103959 - 19103709
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103959 tttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 19103860  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  19103859 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaa 19103760  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 673  Q
    |||   |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  19103759 ccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 467 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884076
Alignment:
Q  467 agccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatct 566  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || | |  |||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatct 54884269  T
Q  567 cttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaacc 666  Q
    ||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| ||||||||  ||||||      
T  54884268 ctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tacaaatt 54884171  T
Q  667 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  54884170 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcgagctccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttatggtaaaagaatcc 54884076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 6232060 - 6231853
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6232060 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatg 6231962  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  6231961 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6231863  T
Q  619 ccctcaaacc 628  Q
    ||||||||||    
T  6231862 ccctcaaacc 6231853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 27635655 - 27635959
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27635655 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 27635753  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||            ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||                
T  27635754 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc------------ 27635829  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
           ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635830 -------accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 27635922  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  27635923 ggtttactctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 419 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25635642 - 25635391
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25635642 tttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatg 25635543  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25635542 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaa 25635443  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 673  Q
     |  | |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25635442 tc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 709
Target Start/End: Original strand, 561771 - 562058
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgg-gggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  561771 tttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaa 561870  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||  ||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  561871 tgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 561970  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct 709  Q
    ||||    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  561971 aacctg--aaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctagtttcat-gttgactt-ctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 538 - 761
Target Start/End: Original strand, 28137421 - 28137633
Alignment:
Q  538 ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgttt 637  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28137421 ccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgttt 28137520  T
Q  638 gtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatg 737  Q
    || |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  28137521 gttcccaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaacg 28137609  T
Q  738 tccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
       |||||||||||||||| ||||    
T  28137610 catatatttatagtaaaagaatcc 28137633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 426 - 708
Target Start/End: Original strand, 36871304 - 36871583
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttag 524  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||      
T  36871304 acccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaa-gagataacaaagggttgc 36871402  T
Q  525 aagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 623  Q
    ||||| | | | ||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||     
T  36871403 aagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatcct- 36871501  T
Q  624 aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccc 708  Q
     |||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  36871502 -aaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 5886458 - 5886261
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  5886458 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtttcaaa-gacaaatcaatg 5886361  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5886360 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaa 5886262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 5899931 - 5899734
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  5899931 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttgcaaa-gagaaatcaatg 5899834  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5899833 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaa 5899735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 11168361 - 11168165
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  11168361 tttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 11168263  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||| ||||| | |  || |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11168262 ggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 632 - 761
Target Start/End: Original strand, 47701804 - 47701933
Alignment:
Q  632 gtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaat 731  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47701804 gtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacactgat 47701903  T
Q  732 acaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  47701904 acaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 47701933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 588 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  588 aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 687  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  688 taaacccttgttttagccccctctatct 715  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 612 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163074
Alignment:
Q  612 gaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctct 711  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  712 atctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||| |||| | || |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaag 11163074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11168523 - 11168423
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168523 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 11168424  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  11168423 t 11168423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 492 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1673890
Alignment:
Q  492 agtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 591  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | |  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatc 1674061  T
Q  592 ataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 691  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||    
T  1674060 ctaatagtgtttcccatggtgaatcaatcct--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgttaac-ttctaaa 1673965  T
Q  692 cccttgttttagccccctctatctcaaggtttac-actaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    ||||| ||||    | |||||  |||||||||||   | ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  1673964 cccttattttcagactctctacatcaaggtttacttttgatacaagttctatatttatagtaaaagtatccctca 1673890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 573 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24177383 - 24177183
Alignment:
Q  573 gtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagtt 672  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24177383 gtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtt 24177287  T
Q  673 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    || |||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| | || ||    
T  24177286 ttcttgttgac-atctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagtatcccttaaaattt 24177188  T
Q  772 ggaac 776  Q
    |||||    
T  24177187 ggaac 24177183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 553
Target Start/End: Original strand, 47701668 - 47701801
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701668 tttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 47701766  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccc 553  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  47701767 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Original strand, 1620457 - 1620657
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  1620457 tttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaa-gagatatcaaa 1620555  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| |||||   || | |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1620556 gggttacaagaactagccttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 1620655  T
Q  617 aa 618  Q
    ||    
T  1620656 aa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11170789 - 11170692
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170789 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacattaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataattaaat 11170692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 3307020 - 3306839
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3307020 tttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 3306923  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtt 602  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||    |||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3306922 ggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5192072 - 5191973
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5192072 caattattgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 5191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 24181642 - 24181483
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24181642 tttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaat 24181543  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgac 577  Q
    |||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24181542 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgac 24181483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10955867 - 10955962
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10955867 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 10955962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10084229 - 10084324
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10084229 tgttgcgaatccgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgggacaattaaat 10084324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 10958159 - 10958258
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10958159 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaattaaa 10958257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 22114143 - 22114227
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114143 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaatagcaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 22114227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 51726844 - 51726942
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51726844 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggggcaa-gaataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 51726942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1321898 - 1321801
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1321898 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 1321801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 7606441 - 7606539
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606441 attgttgcaaattcgatgaaaaatacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 7606539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 769
Target Start/End: Original strand, 4560352 - 4560611
Alignment:
Q  483 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaga 582  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| |||       ||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |    
T  4560352 ataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaatgggttacaa-aagctgc-------ctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaaca 4560443  T
Q  583 gactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 682  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||           |||||||||||||| |    
T  4560444 ggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt--------agagacaaact-----------ctagttttgttgttac 4560524  T
Q  683 ctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  4560525 ctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttactatgatacatagtctatacttatagtgaaagtatccctcgtaaa 4560611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 6065629 - 6065718
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6065629 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 6065718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10191152 - 10191247
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10191152 tgttgcgaatctgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgggacaattaaat 10191247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 467 - 618
Target Start/End: Original strand, 14634486 - 14634638
Alignment:
Q  467 agccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatc 565  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||   | | ||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  14634486 agccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatc 14634585  T
Q  566 tcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14634586 tcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41849470 - 41849387
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849470 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 41849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890362
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890441 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 38890362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 342
Target Start/End: Original strand, 5522466 - 5522548
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgta 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5522466 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgta 5522548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 352
Target Start/End: Original strand, 18099006 - 18099104
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18099006 caattgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaatt 18099104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25634148 - 25634038
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25634148 tttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 25634049  T
Q  519 ggttagaagaa 529  Q
    | ||| |||||    
T  25634048 gattacaagaa 25634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 747177 - 747092
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  747177 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 747092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43226499 - 43226401
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  43226499 caattgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa--caagtgtatggaacaattaa 43226402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 456329 - 456253
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  456329 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 456253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 444 - 592
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007684
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcct 543  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |         |||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa---------cct 11007635  T
Q  544 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatca 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11007636 aattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatca 11007684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25533845 - 25533747
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25533845 aattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagat-atcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 25533748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32219506 - 32219407
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219506 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 32219407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3315104 - 3315005
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3315104 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaatta 3315005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 18096740 - 18096835
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096740 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 18096835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 458704 - 458630
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  458704 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 458630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Original strand, 53893900 - 53893989
Alignment:
Q  267 aattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53893900 aattcgatcgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 53893989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42990721 - 42990633
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42990721 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatg 42990633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25389327 - 25389229
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25389327 ttgttgtgaattcgatgaaaaaatcataccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 25389229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24980126 - 24980031
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24980126 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 24980031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43228696 - 43228610
Alignment:
Q  269 ttcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43228696 ttcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 43228610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 544 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 13420015 - 13419865
Alignment:
Q  544 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcccc 643  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||  ||    
T  13420015 aattctacccaaaatttgaatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgcc 13419918  T
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 700  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  13419917 aagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgttggcttt-taaacctttgttt 13419865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18163083 - 18162985
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163083 aattgttatgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 18162985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1313822 - 1313727
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1313822 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 1313727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 41849319 - 41849243
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  41849319 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactat-atgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 4308122 - 4308216
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308122 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 4308216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5886622 - 5886528
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5886622 caattgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa--caaagtgtatggaaca 5886528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Original strand, 6063281 - 6063368
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6063281 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg 6063368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36012243 - 36012149
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36012243 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 36012149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 43423304 - 43423402
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaac-ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423304 caattgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 43423402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 9604447 - 9604540
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9604447 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaacc-aaaccaaagtgtatgaaacaatta 9604540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 10621362 - 10621452
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  10621362 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatg 10621452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 477
Target Start/End: Original strand, 35919112 - 35919170
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtt 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35919112 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtt 35919170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 27635497 - 27635592
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27635497 tgttgcaaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27635592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50494417 - 50494321
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  50494417 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 50494321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Original strand, 53917500 - 53917600
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53917500 gacaattgttgcgaaatcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaat 53917598  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  53917599 ta 53917600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5900091 - 5900001
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5900091 tgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa--caaagtgtatggaaca 5900001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6232210 - 6232119
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6232210 attgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagta----ataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 6232119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45883357 - 45883263
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45883357 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 45883263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 474
Target Start/End: Original strand, 53894054 - 53894109
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53894054 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 53894109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3859931 - 3859834
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgat-gaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3859931 ttgttgtgaattcgatcgaaaagtcacaccaataacaacttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaa 3859834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 27101028 - 27101116
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27101028 gaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27101116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 28101844 - 28101930
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101844 caattgttgtgaattcgatgaaaaattacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 28101930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 5926615 - 5926703
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5926615 gaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtaaggaacaatta 5926703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38210789 - 38210693
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  38210789 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 38210693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 43421258 - 43421354
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421258 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 43421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321365
Alignment:
Q  680 tgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 1321365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23633866 - 23633775
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23633866 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 23633775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15781293 - 15781203
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15781293 tgttgtgaattcgatggaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaat-aaagtgtatggaaca 15781203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 28412868 - 28412943
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28412868 attgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaa 28412943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 53915338 - 53915432
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53915338 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-ccaagtgtatgaaacaatta 53915432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6484756 - 6484678
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484756 aaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 6484678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25634028 - 25633930
Alignment:
Q  572 cgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagt 671  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  | | || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25634028 cgtgaccaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagt 25633932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36957713 - 36957651
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc 328  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36957713 gaattcgatgaaaatcatatcaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacc 36957651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1626525 - 1626620
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626525 tgttgcgaattccataagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaa-caaaaacaaagtgtatggaacaatta 1626620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3307176 - 3307080
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3307176 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 3307080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31151755 - 31151667
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31151755 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 31151667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42992800 - 42992712
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42992800 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaa 42992712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 561633 - 561710
Alignment:
Q  269 ttcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  561633 ttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 561710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 692 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6484373 - 6484309
Alignment:
Q  692 cccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||    
T  6484373 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaag 6484309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 7768806 - 7768553
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcc 542  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||  ||||| |||||   | | ||   ||    
T  7768806 tgacctagtatgggggagggagtaacccttcgttccactataataatgagtaactttacaaaggt-atattaaaaggttacaagaattagtcttcaaacc 7768708  T
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttag--tgtttgtc 640  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||     
T  7768707 taattctactcaaagttccaattttagcccgtgagcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa-tctc-aaccttagtttgtttgtt 7768610  T
Q  641 cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
     |||||||   || ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7768609 gccaagag---aattctctacaaaccttagttttgatgttggc-ttctaaacccttgtttt 7768553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Original strand, 25687998 - 25688094
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25687998 tgttgcaaattcgatgagaaaactcacaccaataacaaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 25688094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 28761287 - 28761375
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28761287 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaat-aaagtgtatggaa 28761375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Original strand, 10595033 - 10595213
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatg--atgagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||      
T  10595033 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgacatgagtttctttac-aaagagatat-- 10595129  T
Q  516 atgggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
     || |||| |||||  |  | ||   ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10595130 -tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Original strand, 880082 - 880175
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  880082 attggtgcgaattcgatgaaaaagtcacaccaataataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaa-caaagtgtatgaaaca 880175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25635789 - 25635718
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  25635789 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaa 25635718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 27762107 - 27762165
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27762107 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 880313 - 880386
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  880313 aaaatcacacccataacaaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 684 - 797
Target Start/End: Original strand, 1618916 - 1619032
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc--aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaa 779  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||  |  ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  1618916 tttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctcaaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagtatccctcataaaattggaa-caa 1619014  T
Q  780 atcaggcccataaaaata 797  Q
    |||  |||||||||||||    
T  1619015 atctagcccataaaaata 1619032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736334
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 1736334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 10094195 - 10094256
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10094195 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 10201075 - 10201136
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10201075 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 10208121 - 10208182
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208121 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552912
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 18552912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25634298 - 25634224
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | || |||  ||||||||||||||||    
T  25634298 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaatacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaa 25634224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27420912 - 27420822
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaaga 508  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27420912 tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctactatgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28181400 - 28181324
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28181400 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg-acaatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28181324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709819
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 30709819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 35919020 - 35919066
Alignment:
Q  310 aagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919020 aagggataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 35919066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 13893523 - 13893475
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaat 590  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13893523 cctaattttacccaa-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaat 13893475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Original strand, 29913954 - 29914132
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||   |    
T  29913954 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---t 29914049  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    | |||| |||||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29914050 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 898 - 963
Target Start/End: Original strand, 54692046 - 54692111
Alignment:
Q  898 tcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  54692046 tcgtgcttcgattttgacaactccagcaaacttcaatttctccaattttaagtcactttcacaaca 54692111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 4103736 - 4103822
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  4103736 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgcgtggagcaa-ggatagtcaaacaaccgaaa-aaaagtgtatggaa 4103822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7418112 - 7418064
Alignment:
Q  555 aagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7418112 aagtcccaatctcttcccgtgaccaatagactcaatcataatggtgttt 7418064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11073084 - 11073007
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaa-tctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  11073084 cctaattctacctaaagtcccaaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcata--agtgtttctcgaaggtgaatcaa 11073007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Original strand, 47878170 - 47878350
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat--gagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||      
T  47878170 tttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 47878266  T
Q  516 atgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
     || |||| |||||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47878267 -tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 51943752 - 51943693
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51943752 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtttggaacaatta 51943693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53591598 - 53591503
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  53591598 ttgttgtgaattcaatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaacaatta 53591503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 12267819 - 12267913
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12267819 tgttgtgaactcgatgaaaaattacaccaataacaaatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 12267913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720878
Alignment:
Q  296 ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 26720878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 32263881 - 32263975
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32263881 tgttgtgaattcgaagaaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 32263975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Original strand, 51674608 - 51674682
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaa 331  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  51674608 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaa 51674682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 54193287 - 54193229
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54193287 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417519
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctcc 1417519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4666911 - 4666834
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4666911 aaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 4666834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370515
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 8370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Original strand, 10100235 - 10100273
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10100235 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16996936 - 16996875
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16996936 cctaattctacccaaa-tcccaatttctttccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16996875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974981
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27974981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986475
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27986475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53597648 - 53597569
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  53597648 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 53597569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 626
Target Start/End: Original strand, 7606830 - 7606863
Alignment:
Q  593 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606830 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 7606863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711276
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagc 469  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 21711276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 618
Target Start/End: Original strand, 31021284 - 31021341
Alignment:
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021284 aatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 31021341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 47148745 - 47148832
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47148745 tgttgtgaatttgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtg-------ggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47148832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 53468295 - 53468390
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53468295 tgttgcaaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 53468390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Original strand, 10612777 - 10612957
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat--gagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||      
T  10612777 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 10612873  T
Q  516 atgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
     || |||| |||||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10612874 -tgagttataagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtg 10612957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 23391909 - 23391953
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23391909 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 23391953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 29196386 - 29196430
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  29196386 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 29196430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40734666 - 40734622
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40734666 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 40734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 10897066 - 10897008
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10897066 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 600
Target Start/End: Original strand, 20031462 - 20031497
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20031462 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 730 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 25635370 - 25635331
Alignment:
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25635370 atacaaagtctatatttatagtaaaagcatccctcataaa 25635331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 474
Target Start/End: Original strand, 48438221 - 48438272
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48438221 ttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 48438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 54188570 - 54188512
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54188570 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 798
Target Start/End: Original strand, 1620711 - 1620768
Alignment:
Q  741 atatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  1620711 atatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaa-caaatctagcccataaaaatac 1620768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6794796 - 6794742
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6794796 ttgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 6794742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 599
Target Start/End: Original strand, 10949404 - 10949438
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10949404 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079628
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 11079628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264408
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 16264408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24181749 - 24181675
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  24181749 tgttgtgaattcgaagaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtggagaaattaataatcaagcaaccaaaat 24181675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795839
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 25795839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 26298992 - 26299046
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  26298992 ttgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctcc 26299046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 31314613 - 31314571
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 462  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31314613 ttgttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggaga 31314571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143379
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 32143379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33386749 - 33386695
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  33386749 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 33386695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 319
Target Start/End: Original strand, 35917876 - 35917937
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  35917876 tgttgcgaattcgatgaaaaaattacaccaataacaacttgatgtatggaacaagggataat 35917937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 37466295 - 37466349
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  37466295 ttgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctcc 37466349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43228733 - 43228695
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228733 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaactt 43228695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 353
Target Start/End: Original strand, 48361568 - 48361605
Alignment:
Q  315 ataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48361568 ataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 48361605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Original strand, 48390327 - 48390373
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  48390327 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 48390373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 618
Target Start/End: Original strand, 1618824 - 1618857
Alignment:
Q  585 ctcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1618824 ctcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaa 1618857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17795669 - 17795581
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17795669 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 17795581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19104109 - 19104021
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19104109 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 19104021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 926 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 25633268 - 25633231
Alignment:
Q  926 aacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25633268 aactccaatttcttcaattttgaatcactttcacaaca 25633231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 505
Target Start/End: Original strand, 31021196 - 31021244
Alignment:
Q  456 ggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaa 505  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  31021196 ggggtgagagcagccctccgttcaa-tataatgatgagtaactttacaaa 31021244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 151)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 36865873 - 36865330
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36865873 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaat 36865774  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36865773 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 36865677  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36865676 accctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctta 36865577  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  36865576 aggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaaacatctatcataaattggaaacaaatcaagcccataaaaatacgt---tttatttttattc 36865480  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgac 915  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36865479 ttcttcgcgaaatcgtgctccaattttgccagaccgtgctccgattttttacgaatggaaagtgccaattctgctccaaaaatcgtactccgattttgac 36865380  T
Q  916 agcttcagc-aaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  36865379 aacttcagcaaaacttcaatttctccaattttaagtcactttcacaacaa 36865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 419 - 892
Target Start/End: Original strand, 30480502 - 30480971
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30480502 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgactaacgttacaaaagagatatcaatg 30480600  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30480601 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 30480700  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  30480701 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaa 30480800  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  30480801 ggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaagcccataaaaatacgt---tttatttttattctt 30480897  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatg-aaagtgccaattctgctcc 892  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  30480898 ctgcgcgaaatcgtgctttga-tttgccagattgtgcttcgattttttacgaatgaaaattgccaattgtgctcc 30480971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 419 - 782
Target Start/End: Original strand, 14419189 - 14419552
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14419189 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatg 14419288  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14419289 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14419388  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14419389 ccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 14419488  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14419489 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaattggaacaaaatc 14419552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 782
Target Start/End: Original strand, 13858483 - 13858845
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13858483 tttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatg 13858581  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    || |  ||||| | |  |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13858582 ggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 13858681  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13858682 ccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatctcaa 13858781  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13858782 ggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatc 13858845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 27106896 - 27107237
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  27106896 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccctacaaaagagatatctatg 27106994  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27106995 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27107094  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27107095 ccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 27107194  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27107195 ggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 27107237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 593 - 963
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872913
Alignment:
Q  593 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaac 35872649  T
Q  693 ccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataa 792  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcatgcccataa 35872749  T
Q  793 aaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc 892  Q
    |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35872750 aaata---tgttttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgattttgcca-----tgctccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctgctcc 35872841  T
Q  893 -ataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  35872842 gaaaaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttattcaattttgagtccctttcacaaca 35872913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 423 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 27911345 - 27910973
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27911345 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtt 27911248  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911247 acaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 27911148  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27911147 caaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtt 27911049  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    |||| | |||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27911048 tacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaa-caaatctggcccataaaaatac 27910973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 423 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 27957764 - 27957392
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27957764 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtt 27957667  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957666 acaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 27957567  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27957566 caaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtt 27957468  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    |||| | |||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27957467 tacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaa-caaatctggcccataaaaatac 27957392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1225503 - 1225166
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaat 517  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1225503 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaat 1225405  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    | |||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1225404 gagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 1225305  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1225304 accctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 1225205  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1225204 aggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaag 1225166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 32339645 - 32339290
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32339645 tttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatg 32339547  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32339546 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaa 32339447  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  32339446 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 32339347  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  32339346 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 32339290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 28251566 - 28251902
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28251566 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatg 28251664  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28251665 ggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 28251764  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  28251765 cccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaacccactctatctcaa 28251864  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28251865 agtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 28251902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14808097 - 14807751
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag----------cagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaaga 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14808097 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaaga 14807999  T
Q  509 gatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 608  Q
    || |||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14807998 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 14807899  T
Q  609 ggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccc 708  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14807898 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 14807799  T
Q  709 tctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14807798 tctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 14807751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15073047 - 15072710
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15073047 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgta-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 15072949  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatc-tcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15072948 ggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 15072849  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15072848 accctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 15072749  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15072748 aagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15072710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15068317 - 15067981
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068317 tttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 15068219  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15068218 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaa 15068119  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15068118 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaa 15068019  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||   | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15068018 agtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaag 15067981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 423 - 761
Target Start/End: Original strand, 5372179 - 5372517
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  5372179 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagt 5372278  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5372279 tacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaattaaccc 5372378  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggt 721  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  5372379 tcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaagat 5372477  T
Q  722 ttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5372478 ttacactgatacaatgtctataattatagtaaaagaatcc 5372517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27829632 - 27829297
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  27829632 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 27829535  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27829534 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27829435  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27829434 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 27829335  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| | | ||||||||||||||||    
T  27829334 agtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaag 27829297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 3874346 - 3873991
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3874346 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 3874248  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3874247 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3874148  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  3874147 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccccgctatctctc 3874048  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  3874047 tcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 3873991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 25952857 - 25952516
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952857 tttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatg 25952758  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25952757 agttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaa 25952658  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25952657 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 25952559  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||| | || |||||| |   |||||||||||||||| ||||    
T  25952558 ggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaagaatcc 25952516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 609070 - 608774
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  609070 tttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 608972  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  608971 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa 608872  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  608871 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 608774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 41385080 - 41384730
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41385080 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 41384982  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| |    |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41384981 agttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaa 41384882  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41384881 ccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaa 41384783  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      |||||  | || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  41384782 tttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 41384730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4424354 - 4424018
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  4424354 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatg 4424256  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4424255 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaa 4424156  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4424155 cccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaa 4424056  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| |||  |||||||||||||||    
T  4424055 agtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaag 4424018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27827321 - 27826986
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  27827321 tttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 27827224  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27827223 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27827124  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27827123 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 27827024  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| | | ||||||||||||||||    
T  27827023 agtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaag 27826986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 15809554 - 15809200
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15809554 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 15809456  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15809455 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 15809356  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||      
T  15809355 cccacaaaccctagtgtttgttccaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctctc 15809257  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15809256 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 15809200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 423 - 761
Target Start/End: Original strand, 33541413 - 33541728
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  33541413 ttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg---- 33541507  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
                      |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33541508 ------------------cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccct 33541589  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33541590 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtt 33541689  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33541690 tacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 33541728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 41382998 - 41382658
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41382998 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 41382900  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||           ||||||| |||    
T  41382899 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat-----------aggtgaaacaa 41382811  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41382810 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagccccatctatctcaa 41382711  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  41382710 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 41382658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 22684652 - 22684951
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat- 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  22684652 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaatagagaaatcaata 22684750  T
Q  518 --gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
      |||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22684751 ttgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 22684850  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatct 715  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22684851 caaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatct 22684950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 561 - 911
Target Start/End: Original strand, 5622878 - 5623224
Alignment:
Q  561 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctata 660  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5622878 caatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctata 5622977  T
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||   | |||||||||||||||| |||    
T  5622978 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaagaatc 5623077  T
Q  761 cctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccga 860  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||   |  ||||||||  |   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  5623078 actcataaattggaacaaaattaggccc--aaaaata---tgttttattttgctgactctgcgcaaaatcgtactccgattttgccagatcgtgctccga 5623172  T
Q  861 ttttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5623173 ttttgtacgaatgaaagtgccaattctgctccaataaatcgtgctccgattt 5623224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18811043 - 18810708
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  18811043 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 18810946  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18810945 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18810846  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18810845 cccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 18810746  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  18810745 agtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18810708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 28283220 - 28283575
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  28283220 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 28283316  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||  ||||| | |  | || ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28283317 ggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 28283416  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------ 712  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          
T  28283417 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 28283516  T
Q  713 tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28283517 tctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 28283575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 44721179 - 44720843
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  44721179 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 44721082  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt-cccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44721081 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatca 44720982  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44720981 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 44720882  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  44720881 aagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaag 44720843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Original strand, 15185713 - 15186058
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15185713 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatg 15185812  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagag--actcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  15185813 ggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatc 15185905  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
T  15185906 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttcagtcacctttatctc 15186005  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15186006 aaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaa 15186058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 43079938 - 43079650
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  43079938 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 43079841  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43079840 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 43079741  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccc 708  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43079740 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 24873180 - 24873537
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||     
T  24873180 tttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatc 24873277  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24873278 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatca 24873377  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----- 712  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         
T  24873378 acccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 24873477  T
Q  713 -tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  24873478 ctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 24873537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 510 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477271
Alignment:
Q  510 atatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 609  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaag 14477423  T
Q  610 gtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct 709  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14477422 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccct 14477323  T
Q  710 ctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||||| | || |||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  14477322 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatcc 14477271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 43082309 - 43082013
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  43082309 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 43082212  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43082211 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatca 43082112  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43082111 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 43082013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21482647 - 21482317
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21482647 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 21482548  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |   | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21482547 ggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaa 21482448  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||   |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||          ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21482447 ccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagtccactctatctcaa 21482360  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
     |||||| || ||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  21482359 agtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaagaatcc 21482317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 31162549 - 31162200
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatggggg--agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31162549 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 31162450  T
Q  516 atgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    ||| |||| ||||| | |  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31162449 atgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 31162350  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg-ttgcctttctaaacccttg-ttttagccccctctat 713  Q
    |||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  31162349 caaccct--aacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgcttg--tttctaaacctttgtttttagccccctcttt 31162256  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31162255 ctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 31162200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15956294 - 15956051
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15956294 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 15956195  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15956194 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 15956095  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaacc 666  Q
    |||   |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15956094 ccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18813217 - 18812893
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  18813217 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 18813120  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18813119 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18813020  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  18813019 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctcca 18812931  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  18812930 agtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18812893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 426 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480545
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaga 525  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 21480733  T
Q  526 agaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 625  Q
    |||| | |   |||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21480732 agaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caa 21480635  T
Q  626 accttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttac 725  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21480634 acc-tagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccatctatctcaaggtttac 21480545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 43530451 - 43530109
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  43530451 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactata-tgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatg 43530353  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| | ||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43530352 ggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43530253  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||             |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  43530252 ccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 43530166  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43530165 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 43530109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 419 - 726
Target Start/End: Original strand, 3005629 - 3005932
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3005629 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaat 3005728  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    || ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  3005729 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtgaatca 3005828  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-tagccccctctatctc 716  Q
    |   || |||| || |||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||  |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3005829 a---tccaaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaacccttgtttccagccccctctatctc 3005922  T
Q  717 aaggtttaca 726  Q
    ||||||||||    
T  3005923 aaggtttaca 3005932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 579 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775188
Alignment:
Q  579 aagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 678  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  679 ttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaaccctcataaa 26775188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 31035457 - 31035252
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgaccta--gtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31035457 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatca 31035359  T
Q  516 atgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    | |||||| ||||| | | | ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31035358 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaa 31035259  T
Q  615 tcaaccc 621  Q
    |||||||    
T  31035258 tcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 639
Target Start/End: Original strand, 31578275 - 31578495
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31578275 tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 31578374  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
     ||||| |||||   | | ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578375 aggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatc 31578474  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgt 639  Q
    ||  ||| |||||||||||||||    
T  31578475 aa-tctc-aaccttagtgtttgt 31578495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32339804 - 32339707
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339804 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 32339707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 538 - 729
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214518
Alignment:
Q  538 ccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgttt 637  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  638 gtccccaagagacaaactctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37214507  T
Q  719 ggtttacacta 729  Q
    |||||||||||    
T  37214508 ggtttacacta 37214518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18811206 - 18811105
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811206 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 18811107  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  18811106 at 18811105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4424514 - 4424416
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424514 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 4424416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15809711 - 15809616
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15809711 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 15809616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 489 - 701
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31574001
Alignment:
Q  489 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||   | | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  588 aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 687  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||| | |||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagaga-aaactc--tacaaatcctagttttcgtgttggc-ttc 31573987  T
Q  688 taaacccttgtttt 701  Q
    |||||| |||||||    
T  31573988 taaacctttgtttt 31574001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27827483 - 27827383
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27827483 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 27827385  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  27827384 at 27827383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 656 - 756
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886253
Alignment:
Q  656 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  756 g 756  Q
    |    
T  3886253 g 3886253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 22684489 - 22684590
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatg---aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22684489 attgttgcgaattcgatggaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaattaa 22684588  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  22684589 at 22684590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 855 - 964
Target Start/End: Original strand, 40877984 - 40878093
Alignment:
Q  855 ctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgc-tccataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcac 953  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  40877984 ctccgattttttacgaatgaaagtgccaattctgcttcaaaaaatcgtgctccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttctccaattttgagtcac 40878082  T
Q  954 tttcacaacaa 964  Q
    |||||||||||    
T  40878083 tttcacaacaa 40878093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18813376 - 18813279
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813376 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 18813279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27829790 - 27829694
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27829790 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 27829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 455 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 181799 - 181622
Alignment:
Q  455 gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccca 554  Q
    |||||||||||||| | || |||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||    
T  181799 gggggagagagcagtcatctgtttcactat---gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccca 181704  T
Q  555 aagtctcaatctcttcccgtg--accaagagactcaatcataa-tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagt 633  Q
    ||||| || |||||||||| |  || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  181703 aagtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 550
Target Start/End: Original strand, 2468128 - 2468259
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468128 tttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 2468227  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattcta 550  Q
    || || ||||| | |  ||||| |||||||||    
T  2468228 ggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 645 - 716
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517319
Alignment:
Q  645 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 12517319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43530610 - 43530513
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43530610 ttgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 43530513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 3883436 - 3883532
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3883436 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3883532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Original strand, 28283060 - 28283146
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283060 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28283146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44721318 - 44721241
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44721318 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 44721241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 35872300 - 35872395
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35872300 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaaaaatta 35872395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 661 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181522
Alignment:
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||     
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtata 181533  T
Q  761 cctcataaatt 771  Q
     ||||||||||    
T  181532 actcataaatt 181522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3874488 - 3874391
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3874488 ttgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3874391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17847848 - 17847661
Alignment:
Q  427 cccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaga 525  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  17847848 cccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactataatgat-------tttacaaaagagatatcaaagg-ttaca 17847757  T
Q  526 agaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||   | | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847756 agaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 609230 - 609133
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  609230 tgttgtgaattcgatgaaaatcgcaccaataacaacttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaattaaat 609133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 452 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 3896126 - 3895957
Alignment:
Q  452 tatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca-atgggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattct 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||  |    ||   ||||||| |    
T  3896126 tatgggggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatcataagagttacaagaattaattttcaaacctaattat 3896027  T
Q  550 acccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3896026 actcaaagtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttctccaaagtgaatcaa 3895957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 24873039 - 24873124
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24873039 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg 24873124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 28251410 - 28251504
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28251410 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28251504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 430 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 6376315 - 6376141
Alignment:
Q  430 agttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||    
T  6376315 agttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggtaacaaga 6376217  T
Q  529 a-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |  |  | ||   |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376216 attagtcttcaaacctaattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15068476 - 15068378
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068476 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaacaacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15068378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15073202 - 15073108
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15073202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 33541255 - 33541349
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33541255 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat-aaagtgtatggaacaatta 33541349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 895 - 963
Target Start/End: Original strand, 30481028 - 30481096
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30481028 aaatcgtgctccgattttgacaacttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 30481096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 584 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035068
Alignment:
Q  584 actcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 683  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac 31035142  T
Q  684 tttctaaacccttgttttagccccctcta--tctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
     ||||||||| |||||||    | |||||  |||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  31035141 -ttctaaaccattgttttcagactctctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31035068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14808252 - 14808157
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14808252 tgttgcgcattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43082450 - 43082383
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43082450 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 43082383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 2467976 - 2468066
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2467976 aattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtagggaa 2468066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 30480364 - 30480442
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30480364 gaaaatgacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 30480442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41383158 - 41383060
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  41383158 caattgttgcgagttcgatgaaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtttatggaacaatta 41383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 459 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  459 gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 15185564 - 15185652
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15185564 tgttgtgaattcggtgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 15185652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833789
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| |||| || |||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaa 16833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 27106747 - 27106835
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27106747 tgttgcaaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27106835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 576 - 756
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468433
Alignment:
Q  576 accaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactc----tatacaaaccctagt 671  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||  ||||||| |||||||    |||||||||| ||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctatatatacaaaccgtagt 2468356  T
Q  672 tttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||          |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2468357 tt--------gatttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 2468433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25953011 - 25952916
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  25953011 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaagcaatta 25952916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36866014 - 36865935
Alignment:
Q  274 tgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36866014 tgaaaaccacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 36865935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 475
Target Start/End: Original strand, 37214263 - 37214319
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  37214263 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43080079 - 43080012
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43080079 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 43080012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 13985199 - 13985262
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13985199 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 14419031 - 14419129
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14419031 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 14419129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 13858341 - 13858422
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858341 aattcgatgaaaaatcacaccaataagaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 13858422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14477741 - 14477648
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14477741 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaat 14477648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 457 - 519
Target Start/End: Original strand, 35872477 - 35872538
Alignment:
Q  457 gggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 519  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35872477 gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgg 35872538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 3005486 - 3005572
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  3005486 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa--caaagtgtatggaa 3005572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15956445 - 15956358
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15956445 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatg 15956358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 33839043 - 33839120
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839043 cctaattctacccaaagtcttgaatctcttcc--tgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 37214108 - 37214203
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37214108 ttgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 37214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5702576 - 5702522
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5702576 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctcc 5702522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412399
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 7412399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 9021228 - 9021289
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9021228 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 618
Target Start/End: Original strand, 13985933 - 13986011
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985933 ctaattatacccaaagtcccgaatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 16757388 - 16757449
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16757388 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21480994 - 21480900
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21480994 caattgttgtgaattcgatgaaaaataacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa 21480900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 28327969 - 28327908
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28327969 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 28895563 - 28895502
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28895563 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 6599140 - 6599096
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6599140 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6599096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 6674593 - 6674549
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6674593 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 6674549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 603
Target Start/End: Original strand, 17799558 - 17799606
Alignment:
Q  555 aagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17799558 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 590855 - 590797
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  590855 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 33032715 - 33032657
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33032715 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 789
Target Start/End: Original strand, 40877901 - 40877944
Alignment:
Q  746 tatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggccca 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40877901 tatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccca 40877944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41385234 - 41385142
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    ||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41385234 ttgttgcgaattccatgaaaaatcacacaaataacaaacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaatta 41385142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696635
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 4696635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 4812608 - 4812669
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4812608 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 5372043 - 5372117
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5372043 aaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaaca 5372117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765858
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 9765858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21482798 - 21482724
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  21482798 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaa 21482724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799616
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctcc 23799616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403269
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 26403269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 908 - 949
Target Start/End: Original strand, 5623242 - 5623283
Alignment:
Q  908 attttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaa 949  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5623242 attttgacagcttcagcaaactttaatttctccaattttgaa 5623283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 600
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 4743214 - 4743258
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  4743214 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagaga 4743258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 10930199 - 10930243
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  10930199 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 708 - 756
Target Start/End: Original strand, 14419784 - 14419832
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14419784 ctctatctcaaggtttaccctgatacaatgtctatatttatagcaaaag 14419832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3276405 - 3276347
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3276405 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733830
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 4733830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 464
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965735
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 8965735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 14477587 - 14477520
Alignment:
Q  419 tttgttgacc-cagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactata 485  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  14477587 tttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactata 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25684704 - 25684646
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25684704 cctaattctacccaa-gtccctgtctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtg 25684646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28328090 - 28327996
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatg-atgagtaactttacaaaagagata 512  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  28328090 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttac-aaagagata 28327996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31162686 - 31162612
Alignment:
Q  273 atgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31162686 atgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaa 31162612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 2267144 - 2267205
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2267144 cctaattctacccaa-gtcctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752433
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctcc 19752433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31071322 - 31071268
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  31071322 ttgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 31071268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 33032430 - 33032384
Alignment:
Q  821 gcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgatttttta 867  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33032430 gcgcaaaatcgtgctccgatttttccagatcgggctccgatttttta 33032384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Original strand, 2467877 - 2467926
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtg 305  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2467877 aattgttgtcaattcgatgaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtg 2467926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 618
Target Start/End: Original strand, 11701102 - 11701155
Alignment:
Q  566 tcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11701102 tcttcccgtgaccaagagactcaattctaataatgtttcttcaaggtgaatcaa 11701155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 15949575 - 15949534
Alignment:
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15949575 aatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaatagtgttt 15949534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 463
Target Start/End: Original strand, 31566556 - 31566601
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagag 463  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31566556 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggggagag 31566601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40221910 - 40221869
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40221910 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40221869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 252)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Original strand, 12400806 - 12401349
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12400806 tttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 12400904  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12400905 ggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 12401004  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  12401005 ccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaa 12401104  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  12401105 ggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaactggaaccaaatcaggctcataaaaatacgt---tttatttttattctt 12401201  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctc-cataaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    |||| |||| |||||||| || ||| | |||||| || |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||    
T  12401202 ctgcacgaattcgtgctctgatttttctagatcgtgccctaattatttacgaatgaaagtgccaattctgctctaaaaaatcgtactccgattttgacag 12401301  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12401302 cttcagcaaacttgaatttctccaattttgagtaactttcacaacaat 12401349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Original strand, 38928176 - 38928715
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38928176 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 38928274  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928275 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 38928374  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38928375 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctca 38928474  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattct 817  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |       
T  38928475 aggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttctgaa 38928569  T
Q  818 tctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattttgaca 916  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  38928570 tctgcgcaaaatcgtactccgattttgccagatcgtgcttcgattatttatgaatgaaagtgccaattctgctccaagaaatcgtgctccgattttgaca 38928669  T
Q  917 gcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38928670 gcttcagcaaac-tcaatttctccaattttgagtcaatttcacaaca 38928715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 419 - 891
Target Start/End: Original strand, 12395844 - 12396312
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12395844 tttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 12395942  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12395943 ggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 12396042  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  12396043 ccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaa 12396142  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  12396143 ggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaactggaaccaaatcaggctcataaaaatacgt---tttatttttattctt 12396239  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctc 891  Q
    |||| |||| |||||||| || ||| | |||||| || |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12396240 ctgcacgaattcgtgctctgatttttctagatcgtgccctaattatttacgaatgaaagtgccaattctgctc 12396312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 19096217 - 19095696
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19096217 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataagtaacgttacaaaagagatatcaatg 19096119  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19096118 ggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaag-ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatca 19096020  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19096019 accctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 19095920  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  19095919 aaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattc 19095823  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgac 915  Q
    |||| |||||||||||||||                     |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  19095822 ttctccgcgaaatcgtgctc---------------------cgattttttacgaatggaaagtgtcaattctgctccaaaagtcgtgctccgattttgac 19095744  T
Q  916 agcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19095743 aacttcagcaaacttcaatttctccaattttaaatcactttcacaaca 19095696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Original strand, 37313064 - 37313600
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37313064 tttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatg 37313163  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37313164 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 37313263  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37313264 ctctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37313363  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||  | ||||||   | |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |   |||||||||||  ||    
T  37313364 ggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaaa-aatccctcaaaaattgaaacaaaatcaggccc--aaagatacgt---tttatttttatgatt 37313457  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  37313458 ctacgcaaaatcgtactccgattttgccagatcgtgctccga--ttttacgaatggaaagtgtcaattcttctccaaaaatcgtactccgattttgacag 37313555  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37313556 cttc-gtaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 37313600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 423 - 839
Target Start/End: Original strand, 33415491 - 33415900
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415491 ttgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 33415589  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415590 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 33415689  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33415690 caaaccttagtgtttgt-tccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtt 33415788  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgc 822  Q
    ||| || |||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |   |||||    
T  33415789 tactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaaaaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttctgactctgc 33415883  T
Q  823 gcgaaatcgtgctccga 839  Q
    || ||||||||||||||    
T  33415884 gcaaaatcgtgctccga 33415900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 912
Target Start/End: Original strand, 18537472 - 18537960
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537472 tttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 18537571  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18537572 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatca 18537671  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc 716  Q
    |||  | |||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18537672 acc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 18537766  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    || |||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |   ||||||||||| |    
T  18537767 aatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagcatcactcataaattggaacaaaatcatgcccataaaaatacgt---tttatttttatgc 18537863  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaa-tgaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaatttt 912  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  18537864 ttccgcgcaaaatcgtactccgattttgctagatcgtgctttgattttttacgaattggaagtgccaattctgctctaaaaatcgtactccgatttt 18537960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 593 - 963
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24447114
Alignment:
Q  593 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaac 24446850  T
Q  693 ccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataa 792  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcatgcccataa 24446950  T
Q  793 aaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc 892  Q
    |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24446951 aaata---tgttttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgattttgcca-----tgctccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctgctcc 24447042  T
Q  893 -ataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  24447043 gaaaaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttattcaattttgagtccctttcacaaca 24447114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 40091414 - 40091750
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40091414 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatg 40091512  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091513 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 40091612  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40091613 ccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 40091712  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40091713 agtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 40091750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24880786 - 24880449
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24880786 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaat 24880688  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24880687 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaacca 24880588  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  24880587 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgccccctctatctcc 24880488  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24880487 aagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaag 24880449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40637408 - 40637072
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40637408 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 40637310  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40637309 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 40637210  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40637209 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 40637110  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  40637109 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 40637072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 48486653 - 48486317
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48486653 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatg 48486555  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48486554 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 48486455  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48486454 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 48486355  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48486354 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 48486317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24879324 - 24878987
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24879324 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaat 24879226  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24879225 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 24879126  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  24879125 accctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagccccctctatctcc 24879026  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24879025 aagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaag 24878987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 36378627 - 36378277
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36378627 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatg 36378528  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36378527 agttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 36378428  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36378427 ccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctcaa 36378328  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36378327 ggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtaaccctcataaa 36378277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22800861 - 22801197
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22800861 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 22800959  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22800960 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 22801059  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22801060 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 22801159  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22801160 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 22801197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22802733 - 22803069
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22802733 tttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatg 22802831  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22802832 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22802931  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22802932 ccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 22803031  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22803032 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 22803069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24889130 - 24888794
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24889130 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgataagtaacgttacaaaagagatatcaatg 24889032  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| | ||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24889031 ggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 24888932  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24888931 ccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcta 24888832  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24888831 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 24888794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14633652 - 14633318
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14633652 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatg 14633554  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14633553 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14633455  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  14633454 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaa 14633356  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14633355 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 14633318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 47275059 - 47274725
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47275059 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 47274962  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47274961 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 47274862  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47274861 ccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 47274763  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47274762 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47274725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 8631418 - 8631714
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8631418 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 8631516  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8631517 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 8631616  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8631617 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 8631714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 24348552 - 24348197
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24348552 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 24348454  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24348453 ggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 24348354  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  24348353 cccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 24348254  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||||   | |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  24348253 tcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 24348197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 619447 - 619782
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  619447 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 619544  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  619545 ggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 619644  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  619645 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccccctctatctcaa 619744  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  619745 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 619782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5198754 - 5198418
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  5198754 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 5198656  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5198655 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaa 5198556  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5198555 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 5198456  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5198455 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 5198418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 47868735 - 47868399
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  47868735 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 47868637  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47868636 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 47868537  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  47868536 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccctctctatctcca 47868437  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  47868436 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 47868399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 429 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16453634 - 16453307
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453634 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 16453535  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | | |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453534 ataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 16453435  T
Q  629 ttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacact 728  Q
     |||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16453434 ctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctcggtttgctct 16453335  T
Q  729 aatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| | | |||||||||| |||||    
T  16453334 gatacaaagcctatatttatagcaaaag 16453307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 14787428 - 14787783
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag--cagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14787428 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaa 14787526  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    || |||| ||||| | |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787527 tgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 14787626  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14787627 aatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 14787726  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||   | |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  14787727 tcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 14787783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 37089371 - 37089709
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  37089371 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 37089468  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37089469 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 37089568  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  37089569 ccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 37089668  T
Q  717 -aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      | |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37089669 tcaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 37089709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 11435288 - 11434953
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  11435288 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 11435191  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11435190 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11435091  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11435090 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 11434991  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11434990 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 11434953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 19323029 - 19322701
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19323029 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 19322930  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19322929 gggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 19322830  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||  |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19322829 acc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcatccccctctatctca 19322734  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
    |||||||| || ||||||  || ||||||||||    
T  19322733 aggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22044390 - 22044725
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  22044390 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 22044487  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22044488 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaa 22044587  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22044588 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 22044687  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| | | ||||||||||||||||    
T  22044688 agtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaag 22044725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22046685 - 22047020
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  22046685 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 22046782  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046783 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22046882  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22046883 cccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 22046982  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | |  |||||| | | ||||||||||||||||    
T  22046983 agtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaag 22047020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 41997826 - 41997484
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  41997826 tttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctgggg-agagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaag 41997728  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41997727 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 41997628  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  41997627 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctcaa 41997528  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccc 762  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  41997527 ggtttactctgatacaaagtctatatttatagtagaagaatccc 41997484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 781
Target Start/End: Original strand, 44599837 - 44600198
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  44599837 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 44599934  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44599935 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 44600034  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44600035 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 44600134  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaat 781  Q
    | |||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||    
T  44600135 aagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacaaat 44600198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51015579 - 51015244
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  51015579 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 51015482  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51015481 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 51015382  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  51015381 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 51015282  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51015281 agtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 51015244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9148586 - 9148249
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  9148586 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 9148489  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9148488 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 9148389  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||    
T  9148388 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctctatctctc 9148289  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||| | || |||||| | | ||||||||||||||||    
T  9148288 aaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaag 9148249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 440 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543910
Alignment:
Q  440 aaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatccc 539  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccc 13544174  T
Q  540 gcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgt 639  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13544173 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacct-agtgtttgt 13544075  T
Q  640 ccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc----aaggtttaca-ctaatac 733  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||||    || ||||||| || ||||    
T  13544074 tgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttacatctgatac 13543975  T
Q  734 aatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  13543974 aagatctatatttatagtaaaaacatccctcataaattgaaaccaaatcaaacccataaaaatac 13543910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 2484872 - 2485208
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2484872 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 2484969  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2484970 ggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 2485069  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccc-tctatctca 717  Q
    |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2485070 cccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccccttctagctca 2485169  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2485170 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 2485208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 424 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030443
Alignment:
Q  424 tgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtta 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcat----atgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagtta 56030675  T
Q  524 gaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 623  Q
     ||||| | |  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030674 caagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 56030575  T
Q  624 aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggttt 723  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  56030574 aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggttt 56030475  T
Q  724 acactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    || || |||||| | | |||||||||||||||    
T  56030474 actctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 36921492 - 36921830
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36921492 tttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 36921590  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36921591 gattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 36921690  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tct 715  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||    
T  36921691 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-ccccctctatctct 36921789  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||| |||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  36921790 caaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaag 36921830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 38409538 - 38409243
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  38409538 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 38409441  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38409440 ggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 38409341  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38409340 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctctatctc 38409243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6765178 - 6764837
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6765178 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 6765080  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6765079 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 6764980  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccc-----caagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctat 713  Q
    |||||||| | |||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6764979 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctat 6764880  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  6764879 ctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 6764837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 31849598 - 31849894
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  31849598 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 31849695  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31849696 ggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 31849795  T
Q  619 ccctcaaa-ccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31849796 cccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 31849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 36919583 - 36919922
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36919583 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactata-tgatgaataacgttacaaaagagatatcaatg 36919681  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36919682 gattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 36919781  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc--t 715  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  36919782 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctat 36919881  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36919882 caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36919922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 7941657 - 7941317
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  7941657 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 7941559  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7941558 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 7941459  T
Q  619 ccctcaaaccttagtg--tttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tc 714  Q
    ||| |||||| |||||  ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  7941458 cccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7941359  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||  ||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7941358 tcccggtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaaag 7941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 795
Target Start/End: Original strand, 18534830 - 18535203
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18534830 tttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaat 18534929  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18534930 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatca 18535029  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc 716  Q
    |||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18535030 acc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcagccccctctatctc 18535124  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaa 795  Q
    ||||||||| || |  | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18535125 aaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaaagcatccctcataaattggaacaaaatcaggcccataaaaa 18535203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 11006236 - 11006532
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  11006236 tttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccattacaaa-gagaaatcaatg 11006333  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11006334 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 11006433  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11006434 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 11006532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 16934142 - 16934478
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  16934142 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16934239  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16934240 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatca 16934339  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16934340 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctca 16934439  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16934440 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 16934478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18847486 - 18847151
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  18847486 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 18847390  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18847389 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatca 18847290  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18847289 acccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctca 18847190  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | ||||    | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18847189 aagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 18847151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 9176473 - 9176807
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9176473 tttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 9176570  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9176571 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 9176670  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| ||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9176671 acccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcc 9176770  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  9176771 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 9176807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 18409346 - 18409686
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18409346 tttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaactt-acaaaagagatatcaatg 18409444  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  18409445 ggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatcaa 18409544  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  18409545 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cctctctatctcat 18409643  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
     ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  18409644 tgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaagaatcc 18409686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 11008567 - 11008861
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||   || |||||||    
T  11008567 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccattacaaa---gaaatcaatg 11008662  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11008663 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 11008762  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11008763 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 11008861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 18709163 - 18709521
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  18709163 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 18709260  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18709261 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18709360  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------ 712  Q
    | | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          
T  18709361 ctcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 18709460  T
Q  713 --tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18709461 tctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 18709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 9174145 - 9174481
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9174145 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 9174242  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     |||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9174243 agttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 9174342  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    || | | |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9174343 actcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcc 9174442  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9174443 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9174481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 16931788 - 16932124
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  16931788 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16931885  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16931886 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatca 16931985  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16931986 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctca 16932085  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16932086 aagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaag 16932124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 17662244 - 17662588
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17662244 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 17662342  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17662343 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17662442  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    |||||||| | ||||||||||  | |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  17662443 ccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 17662531  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17662532 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 17662588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 22132391 - 22132684
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  22132391 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 22132488  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22132489 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22132588  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22132589 cccacaaaccctagtgtttgt-tcgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22132684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 419 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 36380684 - 36380425
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36380684 tttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatg 36380585  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36380584 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 36380485  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 678  Q
    |||||||||| || || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380484 ccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 22780372 - 22780668
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  22780372 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 22780469  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22780470 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 22780569  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22780570 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 22782737 - 22783033
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  22782737 tttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 22782834  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22782835 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 22782934  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22782935 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 22783033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 486 - 756
Target Start/End: Original strand, 5637530 - 5637804
Alignment:
Q  486 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  5637530 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5637629  T
Q  586 tcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 685  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637630 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 5637729  T
Q  686 tctaaacccttgttttagccccctctatctc----aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||    || |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5637730 tctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaag 5637804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 681
Target Start/End: Original strand, 26085976 - 26086236
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| | |||||    
T  26085976 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaaacaatg 26086073  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26086074 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26086173  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 681  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086174 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 8756249 - 8756585
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8756249 tttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaat 8756348  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacc-aagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    | |||| ||||| | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8756349 gagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatc 8756448  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatct 715  Q
    ||||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8756449 aacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcagccccttctatct 8756544  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8756545 caaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 8756585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 16455576 - 16455356
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16455576 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16455477  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16455476 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 16455377  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgt 639  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  16455376 ccatcaaaccctagtgtttgt 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 536 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132866
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttg-ttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaagaatcc 6132866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 22134617 - 22134909
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  22134617 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 22134713  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22134714 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22134813  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22134814 cccacaaaccctagtgtttgt-ttgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 771
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47211096
Alignment:
Q  424 tgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtta 523  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 47210854  T
Q  524 gaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 623  Q
     ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||            | |    
T  47210855 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------cac 47210942  T
Q  624 aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------tctca 717  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||    
T  47210943 aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctca 47211042  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    | |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  47211043 aagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 47211096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 486 - 716
Target Start/End: Original strand, 3824635 - 3824863
Alignment:
Q  486 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||    
T  3824635 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaatagac 3824734  T
Q  586 tcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 685  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3824735 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttt 3824834  T
Q  686 tctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  3824835 tctaaacc--tgtttcagccccctctatctc 3824863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 536 - 761
Target Start/End: Original strand, 3937324 - 3937548
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3937324 tcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 3937423  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  3937424 ttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttactctgata-aa 3937522  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||    
T  3937523 agtctatatttatagtaaaagaatcc 3937548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 53405467 - 53405110
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||  |||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  53405467 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagctctctgttccactata-tgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatg 53405371  T
Q  519 ggttagaagaagatgcat------cccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtg 612  Q
    ||||| ||||| | | ||      ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53405370 ggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtg 53405271  T
Q  613 aatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccc---ct 709  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |    
T  53405270 aatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctat 53405172  T
Q  710 ctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    || |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  53405171 ctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 53405110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 419 - 674
Target Start/End: Original strand, 38890223 - 38890476
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890223 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 38890322  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  38890323 gggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatca 38890422  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 674  Q
    |||  | |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890423 acc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2891626 - 2891433
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2891626 tttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 2891527  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtg 612  Q
    ||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2891526 ggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 430 - 769
Target Start/End: Original strand, 15032557 - 15032884
Alignment:
Q  430 agttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15032557 agttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 15032656  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | |    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||        
T  15032657 ataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaa-cctca---- 15032751  T
Q  629 ttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacact 728  Q
          |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15032752 ------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactct 15032843  T
Q  729 aatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
      ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15032844 ggtaccaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 15032884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 27499376 - 27499128
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |       
T  27499376 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatta--- 27499281  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  27499280 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaa 27499181  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagt 671  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499180 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 593 - 761
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270326
Alignment:
Q  593 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 692  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  693 ccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 38270326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 498 - 724
Target Start/End: Original strand, 52942536 - 52942748
Alignment:
Q  498 tttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||             ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  52942536 tttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaata 52942622  T
Q  598 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 697  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942623 gtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 52942722  T
Q  698 ttttagccccctctatctcaaggttta 724  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||    
T  52942723 tttcag-cccctctatctcaaagttta 52942748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 419 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 30136884 - 30136640
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30136884 tttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatg 30136785  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     || | ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30136784 agtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaa 30136685  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaacc 666  Q
    ||  | |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  30136684 cc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 13547484 - 13547302
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13547484 ttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagtt 13547386  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 606  Q
    | ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13547385 acaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 12102423 - 12102221
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12102423 tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagt 12102324  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcc-cgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | |  |||   ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12102323 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 12102224  T
Q  617 aac 619  Q
    |||    
T  12102223 aac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 28454018 - 28453676
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28454018 tttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 28453919  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     | ||| |||||   |  | |  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28453918 agtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 28453819  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    | |  | |||| |||||||| |  ||||||| |||||||  | ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    | ||||| ||||    
T  28453818 atc--ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttttcagactctctacctca 28453725  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    ||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  28453724 aggttcacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatccctca 28453676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 4215640 - 4215486
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4215640 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 4215542  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 574  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  4215541 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgt 4215486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 457 - 619
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983727
Alignment:
Q  457 gggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaa 555  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || || | | | ||   |||||||||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaa 31983663  T
Q  556 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaac 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983664 agtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 644 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 2891427 - 2891309
Alignment:
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacact-aatacaatgtccat 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  2891427 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaatgtctat 2891328  T
Q  743 atttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  2891327 atttatagtaaaagaatcc 2891309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Original strand, 16185833 - 16186185
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  16185833 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaa 16185931  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt--cccaaggtgaa 614  Q
    |||||  ||||| | | | ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||    
T  16185932 gggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttttgttcaaggtgaa 16186031  T
Q  615 tcaaccc---tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-ttttagccccctc 710  Q
    ||||  |    | ||||||||||| |  | |  ||||| || |||| |  ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16186032 tcaaaacaatcccaaccttagtgtctcccgcttagaga-aatctctct--aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgtttttagccccctc 16186126  T
Q  711 tatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    | ||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16186127 tctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctcctaaa 16186185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Original strand, 5635475 - 5635614
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5635475 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 5635573  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtc 559  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5635574 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 9864047 - 9863712
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatggggg--agagagcagccctccgttttactataatgatga---gtaactttacaaaagagata 512  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  9864047 tttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gagata 9863949  T
Q  513 tcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggt 611  Q
    ||||  ||||| |||||   | | ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9863948 tcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggt 9863849  T
Q  612 gaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt--agccccc 708  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||| | |    
T  9863848 gaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactc--tacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttttcagctctc 9863755  T
Q  709 t-ctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
    | ||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||    
T  9863754 tactatctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatag 9863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 461 - 755
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999281
Alignment:
Q  461 gagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtc 559  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    |  |||   |||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  560 tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctat 659  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa-tctcaatcc-tagtgtttgttgtcaagag-caaactctat 40999186  T
Q  660 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    |||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||| || ||| || ||  |||||||||||||||    
T  40999187 acaacccctagttttcttgttgac-gtctaaacccttgttttcagactctctacctcaaggtttactctgatataaggtttatatttatagtaaaa 40999281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 618 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100980
Alignment:
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 5100980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 431 - 615
Target Start/End: Original strand, 3982186 - 3982374
Alignment:
Q  431 gttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3982186 gttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaa 3982285  T
Q  530 -gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaat 615  Q
      |  | ||   | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3982286 tcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25357977 - 25357772
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25357977 tttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 25357878  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattc----tacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtg 612  Q
    |||||| ||||| | | | ||   | ||||||    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25357877 gggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtg 25357778  T
Q  613 aatcaa 618  Q
    ||||||    
T  25357777 aatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 426 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 10113198 - 10112876
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg-ggtta 523  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||    
T  10113198 acccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggtta 10113100  T
Q  524 gaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccc-gtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
     |||||   | | ||    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  10113099 caagaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa-tc 10113001  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaagg 720  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||    
T  10113000 tc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttttcaactccctctctctcgagg 10112906  T
Q  721 tttaca-ctaatacaatgtccatatttata 749  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||    
T  10112905 tttacatctgatacaatgtctatatttata 10112876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 8631258 - 8631355
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8631258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 8631355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24348693 - 24348597
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24348693 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaactaaat 24348597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 2484715 - 2484810
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2484715 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaattaaat 2484810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 5635318 - 5635413
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5635318 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 5635413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 9176311 - 9176410
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9176311 caattgttgcgaattcgacgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaa 9176409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11437696 - 11437558
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  11437696 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 11437599  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtc 559  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11437598 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 11437558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 31849440 - 31849535
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31849440 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 31849535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 446 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 9022613 - 9022361
Alignment:
Q  446 acctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg--gttagaagaagatg-catcccgcc 542  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||   | | ||   ||    
T  9022613 acctaatatgggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacc 9022515  T
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcc 641  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||      
T  9022514 taattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttg 9022417  T
Q  642 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    |||||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  9022416 ccaagag---aattctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgtttt 9022361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 426 - 701
Target Start/End: Original strand, 47150898 - 47151168
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttag 524  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || |  || |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  47150898 acccaattcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttac 47150997  T
Q  525 aagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 623  Q
    ||||| | | | ||   |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |     
T  47150998 aagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--ttt 47151095  T
Q  624 aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
     |||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  47151096 caaccctagtgttggttaccaagag-caaactctat--aaaccttagttttg-tgttggc-ttctaaacccttgtttt 47151168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 5101262 - 5101154
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5101262 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggagatagcagccctccgttttactat-atgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatg 5101165  T
Q  519 ggttagaagaa 529  Q
    ||||| |||||    
T  5101164 ggttacaagaa 5101154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47868895 - 47868797
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47868895 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataaaat 47868797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 9173986 - 9174082
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9173986 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaataattaaat 9174082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 11008404 - 11008504
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008404 caattgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 11008502  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  11008503 at 11008504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5198895 - 5198800
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198895 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 5198800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7941814 - 7941719
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7941814 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaacaacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatgaaat 7941719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 11006091 - 11006190
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11006091 aattgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 11006189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 26085818 - 26085902
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26085818 tgttgcgaattcgatgagaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 26085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 22046522 - 22046623
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg--aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22046522 caattgttgtgaattcgatcgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22046620  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  22046621 aat 22046623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 22132248 - 22132326
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22132248 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 22132326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 17662092 - 17662184
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  17662092 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatc-aaaccaaagtgtatggaacaatta 17662184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11435430 - 11435350
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11435430 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 11435350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 14789269 - 14789367
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14789269 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14789367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 22802573 - 22802671
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22802573 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11437856 - 11437758
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11437856 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 11437758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 37089212 - 37089309
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37089212 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 37089309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9148727 - 9148631
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9148727 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 9148631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 24446501 - 24446596
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24446501 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaaaaatta 24446596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 47210634 - 47210733
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47210634 aattgttgcgaattcgttgtgaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 47210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49089045 - 49088950
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49089045 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 49088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51015720 - 51015641
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015720 aaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 51015641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 14787274 - 14787368
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14787274 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14787368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 36921334 - 36921432
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36921334 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 36921432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 38928024 - 38928114
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38928024 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 38928114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 3937125 - 3937212
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3937125 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 3937212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 22134476 - 22134553
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22134476 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 22134553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6765335 - 6765247
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765335 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 6765247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14633810 - 14633714
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14633810 tgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 14633714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18847627 - 18847549
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18847627 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaataattaaat 18847549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 22780211 - 22780296
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22780211 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtat 22780296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 22782573 - 22782662
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  22782573 caattgttgcgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatg 22782662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 22044249 - 22044328
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22044249 aaaataacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 22044328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24889286 - 24889192
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24889286 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24889192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Original strand, 36919432 - 36919523
Alignment:
Q  263 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36919432 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 36919523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 16931629 - 16931727
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16931629 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 16931727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 33415334 - 33415429
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33415334 tgttgcgaatccgatgagaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaatta 33415429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 47563095 - 47563009
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47563095 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataa-gatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 44599679 - 44599775
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44599679 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaa-ggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 44599775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4215795 - 4215697
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4215795 aattgttgcgaattcgatgagaaaactcacacaaataacaacttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaa-caaaaacaaagtgtatgaaacaatta 4215697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38409680 - 38409600
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38409680 gaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaa-caaattgtatggaacaattaaat 38409600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40637566 - 40637470
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40637566 tgttgcgaattcgttgagaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaatta 40637470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53405629 - 53405538
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  53405629 aattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaa 53405538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2891780 - 2891686
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2891780 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 2891686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 3824447 - 3824540
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824447 tgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaaca 3824540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 22800705 - 22800799
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22800705 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatta 22800799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36378781 - 36378685
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36378781 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatgaaacaatta 36378685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Original strand, 14789427 - 14789496
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg--gagagagcagccctccgttttactataa 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14789427 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 14789496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 40091258 - 40091354
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40091258 ttgttgcgaattcgatgaaaaattcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaataatta 40091354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 52942328 - 52942425
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942328 ttgttgcaaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaatta 52942425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5101405 - 5101310
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5101405 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 5101310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16453800 - 16453706
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16453800 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatgaaaca 16453706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16455714 - 16455624
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16455714 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 16455624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 37312924 - 37313018
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37312924 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 37313018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47563231 - 47563153
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47563231 gaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47563153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 895 - 965
Target Start/End: Original strand, 12396337 - 12396407
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12396337 aaatcgggctccgattttgacagcttcagcaaacttgaatttctccaattttgagtaactttcacaacaat 12396407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 845 - 965
Target Start/End: Original strand, 18535220 - 18535339
Alignment:
Q  845 ccagatcgcgctccgattttttatgaatga-aagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaat 943  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||    
T  18535220 ccagatcgtgctccgactttttacgaatgggaagtgccaattctactctaaaaatcgtactccgattttgacagctttag--aactccaatttcttcaat 18535317  T
Q  944 tttgaatcactttcacaacaat 965  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  18535318 attgagtcactttcacaacaat 18535339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 26557920 - 26557823
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26557920 tttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 26557823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 603
Target Start/End: Original strand, 5336789 - 5336964
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaag 527  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||   |||||||||| |  || ||| |||    
T  5336789 cagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttcttttacaaagagatataagaggattacaag 5336888  T
Q  528 aagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5336889 aattagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5664722 - 5664635
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5664722 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 5664635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Original strand, 18709021 - 18709088
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18709021 aaaaccacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 18709088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19323177 - 19323090
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19323177 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaat-aaagtgtatggaa 19323090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 38269993 - 38270068
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38269993 attgttgggaattcgatagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaa 38270068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 18409189 - 18409281
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409189 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18409281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18534689 - 18534770
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18534689 gaattcgatgaaactcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18534770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 457 - 519
Target Start/End: Original strand, 24446678 - 24446739
Alignment:
Q  457 gggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 519  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24446678 gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgg 24446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 55822326 - 55822265
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55822326 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6133171 - 6133098
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatga 492  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  6133171 tttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactataatgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 10114522 - 10114412
Alignment:
Q  559 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactcta 658  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |  | |||| ||||||||||  ||||||| || ||||      
T  10114522 ctcaatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactc-- 10114428  T
Q  659 tacaaaccctagtttt 674  Q
    ||||||||||||||||    
T  10114427 tacaaaccctagtttt 10114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 13543908 - 13543808
Alignment:
Q  863 ttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaa-tcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaa 961  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  13543908 ttttacgaatgaaagtgcctattctgcaacataaaattgtgctccgattttgacagcttcaacatactt-aatttctccaattttgagtcattttcacaa 13543810  T
Q  962 ca 963  Q
    ||    
T  13543809 ca 13543808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27499530 - 27499442
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27499530 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaa-caaagtttatggaacaatta 27499442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 708 - 817
Target Start/End: Original strand, 52043716 - 52043823
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc-aggcccataaaaatactttaatt 805  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |   ||    
T  52043716 ctctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctaaaaaattggaa-caaatctaagcccataaaaatacgt---tt 52043811  T
Q  806 tatttttattct 817  Q
    ||||||||||||    
T  52043812 tatttttattct 52043823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12102566 - 12102479
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaat-aacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12102566 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaactacttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 12102479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 49088905 - 49088794
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaag-agatatcaa 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  49088905 tttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactat-atgatgactaacattacaaaagaagatgtcaa 49088807  T
Q  517 tgggttagaagaa 529  Q
    || |||| |||||    
T  49088806 tgagttacaagaa 49088794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 8756101 - 8756176
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  8756101 attgttgtgaattcgatgaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa 8756176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16489410 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 16933984 - 16934081
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  16933984 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttaatgtgtggagcaaggg--aattaagcaaccaaaa--caagcgtatggaataattaa 16934079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25699810 - 25699752
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25699810 cctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 604
Target Start/End: Original strand, 29609591 - 29609654
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29609591 cctaattctactcgaagtctcaatctcttgccgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 29609654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 54906801 - 54906722
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906801 cctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactcaattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Original strand, 3578670 - 3578766
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| ||||||||||||| || | || |||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3578670 tttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctccattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 3578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 4570155 - 4570094
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4570155 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6133308 - 6133231
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  6133308 aaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaa-caaagtgtatgaaacaatta 6133231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 7050378 - 7050439
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7050378 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047437
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 10047437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 11853610 - 11853549
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11853610 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 15032401 - 15032480
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15032401 aattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 15032480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16638884 - 16638827
Alignment:
Q  545 attctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16638884 attctacccaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 711 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 36380417 - 36380359
Alignment:
Q  711 tatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36380417 tatctcaaggtttactctgatacaaagtccatatttatagtaaaagtaaccctcataaa 36380359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 36771457 - 36771396
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36771457 cctaattctacccaa-gtcacagcctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246052
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 39246052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13547621 - 13547548
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547621 cacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 13547548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 56030945 - 56030857
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  56030945 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 56030857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3760161 - 3760105
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagt-ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3760161 ctaattctacccaaagtgctaaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaata 3760105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 12743925 - 12743969
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12743925 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12743969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 12745314 - 12745358
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12745314 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 12745358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 908 - 963
Target Start/End: Original strand, 18537976 - 18538029
Alignment:
Q  908 attttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18537976 attttgacagcttcag--aacttcaatttcttcaattttgagtcactttcacaaca 18538029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19096370 - 19096298
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19096370 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaa 19096298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 22295370 - 22295294
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||| | |||||||||||    
T  22295370 cctaattatactcaaagtttcaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaacaatgtttactaaggtgaatca 22295294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22295500 - 22295412
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa 506  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||   |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22295500 tttgtttacccagttcagtccaatactgccctagtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36380827 - 36380742
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36380827 aattcgatgaaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa--caaagtgtatgaaacaatta 36380742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41997958 - 41997887
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41997958 aaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 41997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8529328 - 8529270
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8529328 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10114652 - 10114565
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaa 505  Q
    |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10114652 tttgtttacctaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagttaatttacaaa 10114565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 13072102 - 13072160
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13072102 cctaattctacccaaa-tcacagcctcttccagtgaccaagagactcaatcataatagtg 13072160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 15317019 - 15316961
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15317019 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 18537322 - 18537412
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18537322 aattgttgtgaattcgatgaagttcacacctataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18537412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 18587027 - 18586969
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18587027 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 31300485 - 31300427
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31300485 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 849 - 911
Target Start/End: Original strand, 33415889 - 33415952
Alignment:
Q  849 atcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  33415889 atcgtgctccgattttttacgaattaaagtgccaattctgctccaaaaaatcgtgctccgattt 33415952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 47566554 - 47566496
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47566554 cctaattctacccaaattc-cagtctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47566496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269230
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 5269230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Original strand, 619297 - 619370
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  619297 ttgttgcggattcgatgagaaaacacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaa 619370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 603
Target Start/End: Original strand, 4874620 - 4874661
Alignment:
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4874620 aatctcttcccgtgaccaagagactctatcttaatagtgttt 4874661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4884922 - 4884877
Alignment:
Q  555 aagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4884922 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 618
Target Start/End: Original strand, 5516367 - 5516444
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5516367 taattctacgcaaagtctcgaatctcttcccgtgagcaagagacccaaacctaatggtgtttctccaagatgaatcaa 5516444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315268
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 36315268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329477
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 36329477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 618
Target Start/End: Original strand, 38208809 - 38208882
Alignment:
Q  547 tctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38208809 tctacctaaagtctcgaatctcttcttgtgaccaaaagactcaatcttaatagtgtttctccaagatgaatcaa 38208882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 569
Target Start/End: Original strand, 38270125 - 38270158
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270125 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47275190 - 47275137
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47275190 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat 47275137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4885057 - 4884985
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4885057 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 4884985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8529450 - 8529378
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8529450 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 8529378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 36994692 - 36994648
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  36994692 ttgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagaga 36994648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 46147391 - 46147435
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  46147391 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 46147435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 459
Target Start/End: Original strand, 52942487 - 52942527
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942487 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 52942527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 472
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867239
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccct 472  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3796612 - 3796565
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 467  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  3796612 ttgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagca 3796565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 462
Target Start/End: Original strand, 3937273 - 3937316
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  3937273 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 12102162 - 12102067
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgtttt-agccccc-tctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag-catccctcataaattggaac 776  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   || ||||||  || ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  12102162 tttctaaacccttgttttcagcccccctctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaaagaaatccctaaaaaattggaac 12102067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 15831179 - 15831144
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15831179 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 16689061 - 16689119
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16689061 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 25357713 - 25357622
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgtttt-agcccc-----ctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||||||||||||||||| ||||||     |||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25357713 tttctaaacccttgttttcagcccctctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcgtaaa 25357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 921 - 964
Target Start/End: Original strand, 33415977 - 33416020
Alignment:
Q  921 cagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33415977 cagcaaatttcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaa 33416020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143317
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 5143317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 5147681 - 5147735
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  5147681 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctcc 5147735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396710
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcc 5396710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 12395687 - 12395784
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  12395687 aattcttgcaaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagagtatcgaaaaatta 12395784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 12400649 - 12400746
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  12400649 aattcttgcaaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagagtatcgaaaaatta 12400746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831252
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 15831252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24879423 - 24879386
Alignment:
Q  315 ataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24879423 ataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24879386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25862115 - 25862061
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  25862115 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctcc 25862061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 36769540 - 36769479
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  36769540 cctaattttacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagaaactcgatcctaatagtgttt 36769479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769590
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 36769590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152478
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcc 38152478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 513
Target Start/End: Original strand, 54928699 - 54928741
Alignment:
Q  471 ctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 513  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54928699 ctccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 54928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #251
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743454
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctcc 6743454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #252
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 724
Target Start/End: Original strand, 29609681 - 29609745
Alignment:
Q  659 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggttta 724  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  29609681 tacaaaccctagttttagtgttggctta-taaacccttgtttttgccacctctctctcaaggttta 29609745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 150)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 3390695 - 3390226
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390695 tttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 3390596  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3390595 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3390496  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3390495 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctcaa 3390396  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||    
T  3390395 ggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatctctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatatttattctt 3390299  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctc 891  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3390298 ctgcgcgaaattgtgctccgattttgccagatcgtgctccaattttttacgattgaaagtgccaattctgctc 3390226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 13057510 - 13057168
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057510 tttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 13057411  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13057410 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 13057311  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13057310 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 13057211  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13057210 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 13057168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 25477597 - 25477248
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaact-------ttacaaaagagat 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  25477597 tttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttacaaaagagat 25477498  T
Q  512 atcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggt 611  Q
    |||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25477497 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 25477398  T
Q  612 gaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctct 711  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25477397 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 25477298  T
Q  712 atctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  25477297 atctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaagaatcc 25477248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 13040070 - 13039728
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13040070 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 13039971  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13039970 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 13039871  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  13039870 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctatatctcaa 13039771  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  13039770 ggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaagaatcc 13039728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9020241 - 9019905
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020241 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 9020143  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9020142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 9020043  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9020042 ccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctc 9019943  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  9019942 agtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 9019905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 3631938 - 3632271
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3631938 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 3632035  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3632036 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 3632135  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3632136 cccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactccctctatctcaa 3632235  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3632236 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 3632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 3629864 - 3630204
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3629864 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctcagtttcactatatt-attagtaactttacaaaagagatatcaatg 3629961  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3629962 ggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3630061  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  3630062 ccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccccctctatctcaa 3630161  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3630162 gttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 3630204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 429 - 789
Target Start/End: Original strand, 3233739 - 3234098
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3233739 cagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacgg-tgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaaga 3233837  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | | |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233838 ataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 3233937  T
Q  629 ttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacac 727  Q
     ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3233938 ctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacac 3234037  T
Q  728 taatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggccca 789  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3234038 tgatacaa-gtctatatttatagtaaaagcatccttcataaattggaacaaaatcaggccca 3234098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 14507175 - 14507510
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  14507175 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgataagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 14507272  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14507273 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14507372  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507373 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 14507472  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14507473 agtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaag 14507510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 11983028 - 11983364
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11983028 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 11983126  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11983127 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11983226  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |    
T  11983227 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagccccctctatctcca 11983326  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11983327 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 11983364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 423 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 32280308 - 32279976
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280308 ttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 32280209  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280208 acaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 32280109  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||    
T  32280108 caaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag-cccctctatctccaagtt 32280010  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||  | |||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  32280009 tactatgatacaaggtctatatatataggaaaag 32279976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541475
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15541139 tttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactata-tgatgaataactttacaaaagagatatcaatg 15541237  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15541238 ggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 15541337  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15541338 ccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 15541437  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15541438 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15541475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 28241320 - 28241656
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28241320 tttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 28241418  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28241419 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 28241518  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28241519 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcta 28241618  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28241619 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 28241656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 749
Target Start/End: Original strand, 14458766 - 14459093
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14458766 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 14458864  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  14458865 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg--aatcag 14458962  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14458963 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaa 14459062  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttata 749  Q
     |||| | || |||||| ||| |||||||||    
T  14459063 agtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 1230248 - 1230584
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1230248 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 1230346  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1230347 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1230446  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1230447 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccctctctatctcaa 1230546  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| |  | |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1230547 agtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaag 1230584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 4816230 - 4816526
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  4816230 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatg 4816328  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4816329 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 4816428  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4816429 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 15532681 - 15533016
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532681 tttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 15532778  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15532779 ggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 15532878  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532879 ccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 15532978  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15532979 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15533016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 24338447 - 24338783
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338447 tttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 24338544  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | | | ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24338545 ggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaa 24338644  T
Q  619 ccctcaaacct-tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||  ||||||||||  | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24338645 ccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 24338744  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24338745 aggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 30967516 - 30967162
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30967516 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 30967418  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30967417 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 30967318  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  30967317 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 30967218  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  30967217 tcaaagtttagcct-atacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 30967162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 30034602 - 30034957
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30034602 tttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 30034700  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30034701 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 30034800  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  30034801 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctccctctatctctc 30034900  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  30034901 ttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 30034957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 30728823 - 30729163
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga----tatc 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||    
T  30728823 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataat-atgagtaactttacaaaagagaaagatatc 30728921  T
Q  515 aatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    |||| |||| || || | |  |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30728922 aatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30729021  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 714  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  30729022 tcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccctctatc 30729121  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  30729122 tcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 30729163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 19704566 - 19704864
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaa-agagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  19704566 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaat 19704664  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704665 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 19704764  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||| |||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19704765 aacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccatctc 19704864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 20915355 - 20915651
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  20915355 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 20915452  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20915453 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 20915552  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20915553 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 20915651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 463 - 756
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530457
Alignment:
Q  463 gagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctca 562  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctca 15530263  T
Q  563 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctataca 662  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15530264 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctataca 15530363  T
Q  663 aaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||   |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15530364 aaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15530457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 2628885 - 2629225
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  2628885 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 2628982  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628983 ggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 2629082  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccc-----ctctat 713  Q
    |||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||| |    
T  2629083 cccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatctctct 2629182  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||| |||||   | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2629183 ctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaag 2629225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 420 - 771
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195865
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 12195612  T
Q  520 gttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||| ||||| | |  |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12195613 gttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 12195712  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12195713 cccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 12195812  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||| |  | |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12195813 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 12195865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 12161557 - 12161894
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12161557 tttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 12161654  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  12161655 ggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaa 12161754  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12161755 ccctcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcag-cccctttatctcaa 12161851  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12161852 ggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaagaatcc 12161894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 26065296 - 26065005
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||| | | ||||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  26065296 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatg 26065200  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26065199 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26065100  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26065099 ccctcaaaccctagtgttt---ccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 26085265 - 26084974
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||| | | ||||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  26085265 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-taacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatg 26085169  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26085168 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26085069  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26085068 ccctcaaaccctagtgttt---ccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 480 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 22490895 - 22490613
Alignment:
Q  480 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacca 579  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22490895 actataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacca 22490796  T
Q  580 agagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 679  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22490795 agagactcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgt 22490696  T
Q  680 tgcctttc-taaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  22490695 tgcctttcaaaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttatggtaaaagaatcc 22490613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 3027850 - 3028185
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| | ||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027850 tttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3027949  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||||| || || |    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3027950 tgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 3028049  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatct 715  Q
    ||||  | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||    
T  3028050 aacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcagccccttttatct 3028144  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3028145 catggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 3028185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 26945461 - 26944924
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| || | |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26945461 tttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    | |||| || || | |  | |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26945361 gagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgactc 26945262  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatct 715  Q
    ||||    ||||||||||| |  | |  ||||| || |||| |  ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26945261 aacc--acaaccttagtgtcttccgcttagaga-aatctctct--aaaacctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcggccccctatatct 26945169  T
Q  716 caaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttat 814  Q
    ||||||||| | || |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||||  |||||    
T  26945168 caaggtttatacctgatacaaggtttatatttatagtaaaagcattcctcataaattggaacaaaatcaggcccataaaatta---tatttta--tttat 26945074  T
Q  815 tcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttg 913  Q
     ||||||||| |||| || || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||  | ||||||| |||| ||||||    
T  26945073 gcttctgcgcaaaattgtacttcgattttgcgagatcgtactccgattttttacgaatgggaagttccaattcttctaaaaaaatcgtactccgattttg 26944974  T
Q  914 acagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26944973 acagcatcag--aactccaatttcttcaattttgagtcactttcacaacaat 26944924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 15719959 - 15719665
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719959 tttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15719860  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15719859 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 15719760  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    || |   |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15719759 actc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 15719672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 26932561 - 26932857
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  26932561 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 26932658  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932659 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatca 26932758  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  26932759 acccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctctatctc 26932857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 608 - 886
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447776
Alignment:
Q  608 aggtgaatcaaccctcaaacct-tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccc 706  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 32447601  T
Q  707 cctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaattt 806  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |   |||    
T  32447602 cctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccatcgtaaattgaaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---ttt 32447696  T
Q  807 atttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattc 886  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32447697 atttttatgactctgcgcaaaatcgtactccaatttttccagatcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgccaattc 32447776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 536 - 756
Target Start/End: Original strand, 19227523 - 19227743
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19227523 tcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 19227622  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | || ||||||    
T  19227623 ttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgctctgatacaa 19227722  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      || ||||||||||||||||    
T  19227723 gatctatatttatagtaaaag 19227743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Original strand, 16455423 - 16455779
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16455423 tttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaa 16455522  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16455523 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 16455622  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tct 715  Q
    |||    |||| ||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    | |||||  |||    
T  16455623 acc--acaaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttttcagactctctacctct 16455718  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  16455719 caaggtttacaccgatacaaggtatatatttatagtaaaggtatccctgaaaaattggaac 16455779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14466639 - 14466307
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14466639 tttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatg 14466540  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| |||  || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14466539 agttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 14466440  T
Q  619 ccctc-aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
     |||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||           ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  14466439 tcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaact-----------ctagttttgctgttgtctttctaaactcttgtttcaaccctctctatctca 14466351  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  14466350 aggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaaagaatcc 14466307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 615
Target Start/End: Original strand, 1069717 - 1069913
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1069717 tttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 1069816  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1069817 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 15367347 - 15366990
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  15367347 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactata-tgatgaataactttacaatagagatattaat 15367249  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15367248 gggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatca 15367149  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||   |||| ||||||||||  ||||||| ||||| | |||||| ||||| |||           || ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  15367148 accc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacacaatacaacccctaattt--------gaattataagcccttggttcagccccctctatctca 15367061  T
Q  718 aggtttaca-------ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaat 781  Q
    |||||||||       || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15367060 aggtttacaccgatgtctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaat 15366990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 636
Target Start/End: Original strand, 5273215 - 5273431
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||  | |||| ||||||| |||||||    
T  5273215 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataa-gatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatg 5273312  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5273313 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 5273412  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtt 636  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  5273413 acccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Original strand, 12186070 - 12186271
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186070 tttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 12186169  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcc-cgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     |||| ||||| | |  |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12186170 agttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 12186269  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  12186270 ac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 19696757 - 19696400
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19696757 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaa 19696658  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    || ||| ||||| | | | ||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19696657 ggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 19696558  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agcc--ccctctat 713  Q
    ||   |  |||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  19696557 aa--tttgaaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccctccctctct 19696463  T
Q  714 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    ||||||||||   |  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  19696462 ctcaaggtttcatcatatacaaggtctatatttatagtaaaagaatccttcaaaaattggaac 19696400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 481 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 17012294 - 17012029
Alignment:
Q  481 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17012294 ctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaa 17012195  T
Q  581 gagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtt 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17012194 gagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtt 17012099  T
Q  681 gcctttctaaacccttgt-tttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
      | |||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||    
T  17012098 tac-ttctaaacccttttattcagacccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 611 - 756
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072212
Alignment:
Q  611 tgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctc 710  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  711 tatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1072212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 701
Target Start/End: Original strand, 22857951 - 22858229
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  22857951 tttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaa 22858049  T
Q  518 -gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
     |||||| |||||   | | ||   ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858050 agggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 22858149  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||    
T  22858150 caa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagaga-aaattc--tacaaaccctagtttttgtgttagc-ttctaaacccttgtttt 22858229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 26066123 - 26066307
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  26066123 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 26066220  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26066221 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 33309171 - 33308988
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  33309171 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 33309074  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33309073 ggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 33311440 - 33311257
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  33311440 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 33311343  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33311342 ggttacaagaatagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 26068394 - 26068578
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  26068394 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatg 26068491  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26068492 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 29754708 - 29754892
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  29754708 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 29754805  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29754806 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 630 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 17852647 - 17852506
Alignment:
Q  630 tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacacta 729  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  17852647 tagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctg 17852548  T
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17852547 attcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 17852506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 2628726 - 2628814
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628726 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 2628814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 644 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 8995570 - 8995458
Alignment:
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccata 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||  || |||    
T  8995570 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctata 8995471  T
Q  744 tttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||||||    
T  8995470 tttatagtaaaag 8995458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33309333 - 33309233
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33309333 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaa 33309234  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  33309233 t 33309233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 607 - 749
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870749
Alignment:
Q  607 aaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cc 13870706  T
Q  707 cctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttata 749  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| | | |||||||||    
T  13870707 cctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 597 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 15346517 - 15346344
Alignment:
Q  597 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||   |        |||||||||||    
T  15346517 agtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagtttgaat--------tctaaaccctt 15346430  T
Q  697 gttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatc 782  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15346429 ggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaattggaacaaaatc 15346344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33311598 - 33311502
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33311598 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 33311502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 14507017 - 14507113
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507017 ttgttgcaaattcgatgaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 14507113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 14458606 - 14458704
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458606 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataatagcttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 14458704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15346662 - 15346553
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15346662 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactat-atgatgaataactttacaatagagatatcaatg 15346564  T
Q  519 ggttagaagaa 529  Q
    ||||| |||||    
T  15346563 ggttacaagaa 15346553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 617
Target Start/End: Original strand, 28037724 - 28037927
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgt---tttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc 514  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| | |||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28037724 tttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatc 28037823  T
Q  515 aatgggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtga 613  Q
    || |||||| ||||| | |  |     |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28037824 aaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggtga 28037923  T
Q  614 atca 617  Q
    ||||    
T  28037924 atca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 28241162 - 28241258
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28241162 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 28241258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 1230088 - 1230185
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1230088 attgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaattaaat 1230185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 643 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 10584213 - 10584100
Alignment:
Q  643 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccat 742  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  10584213 caagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttat 10584119  T
Q  743 atttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10584118 atttatagtaaaagaatcc 10584100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Original strand, 25078556 - 25078755
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25078556 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatcaaa 25078654  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||   |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  25078655 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacttaaa-tctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaatc 25078753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 26068231 - 26068331
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26068231 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaa 26068329  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  26068330 at 26068331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 29754549 - 29754645
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29754549 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 29754645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 4816088 - 4816167
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816088 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 4816167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10584311 - 10584227
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttaca 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10584311 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Original strand, 19704422 - 19704502
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704422 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 19704502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20526922
Alignment:
Q  459 gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaag 557  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||   | | ||   |||||||||||| ||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaag 20526983  T
Q  558 tctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526982 tcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 5273055 - 5273141
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273055 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 5273141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 11982871 - 11982965
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11982871 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 11982965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 26065961 - 26066057
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26065961 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 26066057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26065459 - 26065365
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26065459 attgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaaca 26065365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26085428 - 26085334
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26085428 attgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaaca 26085334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30967673 - 30967578
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  30967673 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaa-caaagtgcatggaataattaaat 30967578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3394841 - 3394742
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3394841 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaaaatcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta 3394742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 445 - 603
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911629
Alignment:
Q  445 gacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa-gatgcatcccgcct 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||  |  | ||   |||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaacct 12911569  T
Q  544 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12911570 aactctaccaaaagtctcaatctattatcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12911629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 428 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 30445832 - 30445730
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaa 526  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30445832 ccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 30445733  T
Q  527 gaa 529  Q
    |||    
T  30445732 gaa 30445730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 8717191 - 8717268
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8717191 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 12195354 - 12195439
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12195354 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg 12195439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18322566 - 18322482
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18322566 tgttgcgaattctatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 603
Target Start/End: Original strand, 12937229 - 12937376
Alignment:
Q  456 ggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||  |  | ||   |||||||||||| |    
T  12937229 ggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaacctaattctaccaa 12937327  T
Q  555 aagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937328 aagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 344
Target Start/End: Original strand, 26932400 - 26932487
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26932400 aattgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 26932487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Original strand, 25465589 - 25465699
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25465589 tttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaa 25465687  T
Q  518 gggttagaagaa 529  Q
    ||| || |||||    
T  25465688 ggggtacaagaa 25465699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Original strand, 30034446 - 30034528
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30034446 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaa-ggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatg 30034528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 849 - 964
Target Start/End: Original strand, 3234132 - 3234247
Alignment:
Q  849 atcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccat-aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttg 947  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3234132 atcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctacaacataaaatcggactccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttctccaattttg 3234230  T
Q  948 aatcactttcacaacaa 964  Q
    | |||||||||| ||||    
T  3234231 agtcactttcaccacaa 3234247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15367499 - 15367404
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367499 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15367404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3629711 - 3629805
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3629711 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3629805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9020398 - 9020304
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9020398 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 9020304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 895 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 3396163 - 3396093
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3396163 aaatcgggcttcgattttgacagcttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaat 3396093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 24338292 - 24338389
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338292 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24338389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 30728666 - 30728763
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30728666 aattgtagcgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 30728763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 543 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3233567 - 3233662
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3233567 tgttgcgaattcgatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaatta 3233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 7542503 - 7542581
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaa-tctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7542503 cctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13057659 - 13057587
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13057659 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaa 13057587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15346806 - 15346719
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15346806 aattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatta 15346719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 20915214 - 20915293
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20915214 aaaatcacaccaataataacttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaataattaaat 20915293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 3631780 - 3631878
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3631780 caattgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3631878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25480347 - 25480253
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25480347 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 25480253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Original strand, 28078193 - 28078291
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078193 tttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 902 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 3390193 - 3390132
Alignment:
Q  902 gctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3390193 gctccgattttgacagcttctgtaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 3390132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 849 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 3396231 - 3396168
Alignment:
Q  849 atcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca-taaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3396231 atcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgccaattctgctccagaaaatcgtgctccgattt 3396168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 11262775 - 11262600
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa- 516  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||     
T  11262775 tttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttctttac-aaagagatatcaaa 11262677  T
Q  517 --tgggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 591  Q
        ||||| |||||  |  | ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11262676 aggaggttataagaattagtcttcaaacctaattctacctaaa-tctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatc 11262600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 908 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 15719478 - 15719423
Alignment:
Q  908 attttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15719478 attttgacagattcagcaaactttaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 15719423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 22351973 - 22352031
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22351973 cctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 909 - 964
Target Start/End: Original strand, 32447821 - 32447876
Alignment:
Q  909 ttttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32447821 ttttgacagcttcaacaaacttaaatttctccaattttgagtcactttcacaacaa 32447876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 767 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 3396289 - 3396220
Alignment:
Q  767 aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccga 839  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3396289 aaattagaaccaaatcagatccataaaaatacgtt---ttatttttattcttctacgcgaaatcgtgctccga 3396220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 591
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165985
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 591  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 5165985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13878788 - 13878727
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13878788 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13883536 - 13883475
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13883536 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 15530027 - 15530101
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15530027 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataatcagacaatcaaaatttaagtgtatggaacaatta 15530101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16785980 - 16785919
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16785980 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22611138 - 22611059
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  22611138 tgttgcgagttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaaagtg 22611059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 31248835 - 31248896
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31248835 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 15540987 - 15541064
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  15540987 aattgttgcgacttcgatgaaaaatcaaaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaa 15541064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 543 - 600
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 3577636 - 3577696
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3577636 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 17694972 - 17695030
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17694972 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 3833532 - 3833482
Alignment:
Q  480 actataatgatgagt-aactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3833532 actataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 3833482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757517
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 5757517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10077258 - 10077204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10077258 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 10077204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 684 - 756
Target Start/End: Original strand, 12186330 - 12186404
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12186330 tttctaaacccttgttttcagccccttctatctcaaggtttacatgtgatacaaggtttatatttatagtaaaag 12186404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17012506 - 17012417
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17012506 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataaaatacttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 17012417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 25465440 - 25465519
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  25465440 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 25465519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25477657 - 25477619
Alignment:
Q  294 acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25477657 acttgatgtgtgaagtaagggatagtcaagcaaccaaaa 25477619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979571
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctcc 31979571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 13467585 - 13467642
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13467585 cctaattctacc--aagtcacagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22491073 - 22491005
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  22491073 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaa 22491005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25941852 - 25941780
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  25941852 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 25941780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30443604 - 30443532
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30443604 tttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagctctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32280463 - 32280391
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  32280463 tgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaa 32280391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33216010 - 33215938
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  33216010 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtatgggggatagagcagctctccgttccactataatgat 33215938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1069563 - 1069657
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1069563 tgttgtgaattcgatgagaaaatataccaataacaaattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 1069657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 596
Target Start/End: Original strand, 12166267 - 12166321
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataat 596  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12166267 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaat 12166321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Original strand, 22870101 - 22870196
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |  ||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22870101 tttgttcacccagttcggtccaatactgacctact--gggagagagagaagctctccgttccactataatgatgagtttctttac-aaagagatatcaa 22870196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 730 - 769
Target Start/End: Original strand, 28038014 - 28038053
Alignment:
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28038014 atacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 28038053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5572334 - 5572280
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5572334 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctcc 5572280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356094
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcc 21356094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936645
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctcc 31936645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 6843325 - 6843262
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccg---tgaccaagagactcaatcataatagtgt 601  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6843325 ctaattctacccaaagtctcgaatctcttcctgctgtgaccaagagactcaatcctaatggtgt 6843262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17038565 - 17038524
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatg 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17038565 tgttgtgaatttgatgaaaatcacaccaataaaaacttgatg 17038524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 25941704 - 25941650
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25941704 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaata 25941650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 206)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 419 - 911
Target Start/End: Original strand, 50078821 - 50079310
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50078821 tttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatg 50078920  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  50078921 ggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 50079020  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50079021 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 50079120  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  50079121 ggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaatttgaaccaaatcagatccataaaaatacgt---tttatttttattctt 50079217  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattt 911  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50079218 cagcgcgaaatcgtgctccgattttgccagatcgtgctccgattttctacgaatgaaagtgccaaatctgctccaaaaatcgtgctccgattt 50079310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 419 - 899
Target Start/End: Original strand, 11457476 - 11457952
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457476 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 11457574  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457575 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11457674  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11457675 ccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagccccctctatctcaa 11457774  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  11457775 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcagacccataaaaatacgt---tttatttttattctt 11457871  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaatc 899  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11457872 ctgcgcgaaatcgtgctccgattttgctagatcgtgctccaattttttacaaatgaaagtgtcaattctgctccaaaaatc 11457952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Original strand, 50076673 - 50077195
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076673 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggg-agagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 50076771  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50076772 gattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 50076871  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  50076872 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccctttctatctcaa 50076971  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  50076972 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac---attttatttttattctt 50077068  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    |||||| |||||||||||                     |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  50077069 ctgcgcaaaatcgtgctc---------------------cgattttttacgaattaaagtgccaaatctgctccaaaaaatcgtgctccgattttgacag 50077147  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  50077148 cttcaacaaacttcaatttctctaattttgagtcactttcacaacaat 50077195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Original strand, 12302506 - 12303032
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12302506 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 12302604  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12302605 agttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 12302704  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  12302705 ccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 12302804  T
Q  715 tcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaag-catccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttattttt 812  Q
    |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  12302805 tcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtaatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac---attttattttt 12302901  T
Q  813 attcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca-taaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||||||||| |||||||||||||                     ||||||||||  ||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  12302902 attcttctgcacgaaatcgtgctc---------------------cgattttttacaaatgaaaatgttaattctgctctagaaaatcgtgctccgcttt 12302980  T
Q  912 tgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12302981 tgacaactttagcaaacttcaatttctccaattttgaatcactttcacaaca 12303032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Original strand, 50307547 - 50308079
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50307547 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 50307645  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50307646 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 50307745  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  50307746 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatatatctca 50307845  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattct 817  Q
    ||||||||  | |||||| |   |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||        ||||||||| |       
T  50307846 aggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaaagaatccctcgtaaattgtaacaaaatcaggcccaaaaaaa------gttttatttttctgaa 50307939  T
Q  818 tctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattttgaca 916  Q
    ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||| |||||        |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50307940 tctgcgcaaaatcgtactctgattttgccagatcgtgcttcgattttttacgaatg--------aattatgctccaaaaaatcgtgctccaattttgaca 50308031  T
Q  917 gcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50308032 gcttcagcaaac-tcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaat 50308079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2618199 - 2617859
Alignment:
Q  17 actttgtacggttcttcttagttttttccaatctgatttctctttaatgcaaactacctctcggcacacgtggtacaatacnnnnnnnctctccctcaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||    
T  2618199 actttgtacggttcttcttagttttttccaatctgatttctctttaatgcaaactacctctcggcacatgtggtacaatacaaaaaaactctccctcaca 2618100  T
Q  117 acttctattcttgtactcattgtgtgttccatcaattgttaaacaaagatcactaaccgttaaacaacagcggaaacttcataatataacttggt-nnnn 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||         
T  2618099 acttctattcttgtactcattgtgtgttccatcaattgttaaacaaagatcactaaccgttaaacaacggtggaaacttcataatataacttggtaaaaa 2618000  T
Q  216 nnnntataaaagggtaaatgagtacacacattttacatgacaattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaaggga 315  Q
        |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2617999 aaaatataaaagggtaaatgagtacacgaattttacatgacaattgttgcgaattcgatgaaaaccacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaaggga 2617900  T
Q  316 taatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617899 taatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 2617859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 18839868 - 18839526
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839868 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 18839769  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839768 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18839669  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18839668 ccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagccccctctatctcat 18839569  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18839568 ggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 18839526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 13215366 - 13215025
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga----tatc 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||    
T  13215366 tttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatc 13215267  T
Q  515 aatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    ||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215266 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 13215167  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 714  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13215166 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 13215067  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||  ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13215066 tcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 13215025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 16428934 - 16428584
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16428934 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16428835  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16428834 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16428735  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  16428734 ccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctaat 16428635  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||| | || ||| ||   | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16428634 ggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagtatcccttataaa 16428584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 17324637 - 17324988
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17324637 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 17324735  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324736 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17324835  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  17324836 ccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagccccctgtatcttca 17324935  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||| ||  | ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17324936 ggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 17324988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18307389 - 18307054
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307389 tttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 18307291  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     || | ||||| | |  || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18307290 cgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaa 18307191  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18307190 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 18307091  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  18307090 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 18307054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 38925482 - 38925815
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38925482 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttttactat---gatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 38925577  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38925578 ggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 38925677  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38925678 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagccccctctatctcaa 38925777  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38925778 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 38925815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 40134225 - 40133656
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134225 tttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 40134126  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  40134125 tgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaa 40134026  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc---------cccct 709  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||         |||||    
T  40134025 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccctttcagcccct 40133926  T
Q  710 ctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatt 809  Q
     ||||||||| ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||       |  ||||||    
T  40133925 atatctcaagatttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccaaaaaa-------tgttttatt 40133833  T
Q  810 tttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctcca--------------- 893  Q
    |||||  || ||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||                   
T  40133832 tttatgattatgcgcaaaatcgtactctgattttgccagatcgtgctccgattttttaccaatggaaagtgccaattatgctccaaaagtcgtactccga 40133733  T
Q  894 -----taaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40133732 tttttcaaatcgtgctccgattttgacagcttcagcaaacttcaatttctctaattttgagtcactttcacaacaat 40133656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 17319167 - 17318703
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17319167 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaata 17319069  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||    
T  17319068 agttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gtttcccaaggtgaatcaa 17318975  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17318974 ccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 17318875  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||  | ||||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |   |||||||||||   |    
T  17318874 ggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaaaaatccctcataaattggaacaaaatcaggtc--taaaaatacgt---tttatttttatgact 17318780  T
Q  819 ctgcgc-gaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctcca 893  Q
    ||||||  ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||    
T  17318779 ctgcgcaaaaatcgcactccgattttgccagatcgtgctccgattttttacgaatggaaactgtcaattctggtcca 17318703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51750319 - 51749983
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51750319 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 51750221  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51750220 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 51750121  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  51750120 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 51750021  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51750020 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 51749983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 6995701 - 6996052
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  6995701 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatg 6995799  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6995800 agttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6995899  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  6995900 cccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggccccctctatctcaa 6995999  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    | ||||| || || ||| ||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  6996000 gatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagtataactcataaatt 6996052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 25251275 - 25251611
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  25251275 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatg 25251374  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25251375 ggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa 25251474  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25251475 ccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaa 25251574  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  25251575 ggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 427 - 769
Target Start/End: Original strand, 9241094 - 9241436
Alignment:
Q  427 cccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9241094 cccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaa 9241193  T
Q  527 gaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 626  Q
    ||| | |  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9241194 gaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaa 9241293  T
Q  627 ccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag-ccccctctatctcaaggtttac 725  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  9241294 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagcccccctctatcttaaggtttac 9241392  T
Q  726 actaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
     || |||||| | | |||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  9241393 tctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaacccccataaa 9241436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 10399829 - 10400165
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10399829 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 10399927  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10399928 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 10400027  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  10400028 ccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctccc 10400127  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10400128 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaag 10400165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15823826 - 15823490
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15823826 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaatagagatatcaatg 15823728  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15823727 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 15823628  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  15823627 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcta 15823528  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15823527 agtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 15823490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 735
Target Start/End: Original strand, 31425016 - 31425335
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31425016 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 31425114  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagag---actcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
     |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31425115 agttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 31425214  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 714  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31425215 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatc 31425314  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  31425315 tcaaggtttacattgatacaa 31425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 25128153 - 25127856
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25128153 tttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 25128054  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
      ||| ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  25128053 aattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaa 25127954  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25127953 ccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaggcccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 41647200 - 41646864
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41647200 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 41647102  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41647101 agttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 41647002  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || | ||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41647001 ccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaa 41646902  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41646901 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 41646864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 31735522 - 31735877
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  31735522 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 31735620  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31735621 gattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 31735720  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca- 717  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31735721 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcat 31735820  T
Q  718 ---aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
       | |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31735821 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 31735877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 17186128 - 17186470
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17186128 tttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatg 17186227  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17186228 ggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17186327  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17186328 ccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaa 17186427  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||| | || ||||||  || ||||||||| |||||| ||||    
T  17186428 ggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaaagaatcc 17186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 6756808 - 6756458
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756808 tttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 6756709  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756708 aggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaaga--ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 6756611  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||    
T  6756610 accctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcagtcccctctatttc 6756511  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  6756510 aaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactctcataaa 6756458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 39462799 - 39462463
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  39462799 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgaataacttttcaaaagagatatcaaag 39462701  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462700 ggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 39462601  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  39462600 ccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagccttctctatctcaa 39462501  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  39462500 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 39462463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 31490192 - 31489854
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31490192 tttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataaccttacaaaagagatatcaatg 31490095  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31490094 agttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 31489995  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31489994 ccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaact--atacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaa 31489897  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31489896 ggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 31489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 47906550 - 47906193
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47906550 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 47906452  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47906451 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 47906352  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------ 712  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||          
T  47906351 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 47906252  T
Q  713 tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  47906251 tctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 47906193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 15294835 - 15295131
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15294835 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 15294933  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294934 ggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 15295033  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15295034 ccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctc 15295131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 39932354 - 39932017
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggga-gagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39932354 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaat 39932256  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39932255 gggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatca 39932156  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc- 716  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39932155 accctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 39932056  T
Q  717 -aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
     || ||||   || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  39932055 caaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaa 39932017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6823294 - 6822959
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  6823294 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 6823196  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6823195 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa 6823096  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6823095 cccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 6822997  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  6822996 agtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaag 6822959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20291736 - 20291401
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||    
T  20291736 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactata-tgatgagaatcgttacaaa-gagaaatcaatg 20291639  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20291638 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20291539  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20291538 ccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctctatctcaa 20291439  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20291438 aatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaag 20291401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 28840959 - 28840622
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  28840959 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 28840862  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28840861 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 28840762  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||    
T  28840761 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgtatctctc 28840662  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28840661 aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 28840622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 28998254 - 28998605
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  28998254 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatg 28998352  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998353 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 28998452  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28998453 ccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaa 28998552  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28998553 agtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 28998605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 29003970 - 29004321
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  29003970 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatg 29004068  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004069 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 29004168  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29004169 ccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaa 29004268  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29004269 agtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 29004321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 2510326 - 2510680
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2510326 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaactttacaagagagaaatcaatg 2510424  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2510425 ggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaa 2510523  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      
T  2510524 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctctatctctc 2510623  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2510624 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 2510680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 17324344 - 17324004
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17324344 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatg 17324245  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324244 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 17324145  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17324144 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagccctctctatctcaa 17324047  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  17324046 ggtttactctaatacaaagtctatatttataataaaagaatcc 17324004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 769
Target Start/End: Original strand, 31422861 - 31423224
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttac------------tataatgatgagtaactttacaaaa 506  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||            |||||||||||||||| ||||||||    
T  31422861 tttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 31422960  T
Q  507 gagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttccc 606  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31422961 gagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttccc 31423060  T
Q  607 aaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgttt-gtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 705  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31423061 aaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 31423160  T
Q  706 ccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  31423161 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagtatctcccataaa 31423224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 423 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 2617792 - 2617460
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2617792 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 2617694  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617693 acaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 2617594  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtt 722  Q
    |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  2617593 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctcaaagtt 2617494  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2617493 tgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 2617460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 2949233 - 2949583
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2949233 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 2949330  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949331 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 2949430  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2949431 ccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 2949530  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||| | |  || |||| || |||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  2949531 ggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagtataactcataaatt 2949583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 14097970 - 14098307
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14097970 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaat 14098068  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14098069 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaag-ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 14098167  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  14098168 aaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagtcccctctatctc 14098267  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||||   | |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14098268 aaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaag 14098307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16226447 - 16226111
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  16226447 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16226350  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16226349 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 16226250  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16226249 acccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctctatctca 16226150  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16226149 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 16226111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 3579618 - 3579955
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579618 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta--atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 3579715  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  3579716 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaa 3579815  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag--ccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  3579816 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagccccccctctatctc 3579915  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||  ||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3579916 aaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaag 3579955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 13762116 - 13761781
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  13762116 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 13762019  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13762018 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaa 13761919  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  13761918 cccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatctcca 13761819  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13761818 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 13761781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20302738 - 20302403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |  |||||  ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  20302738 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatc-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 20302641  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20302640 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20302541  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20302540 ccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 20302441  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  20302440 agtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaag 20302403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 50248571 - 50248914
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag--cagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  || || || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50248571 tttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaa 50248669  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50248670 tgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatc 50248769  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  50248770 aaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctctatctc 50248869  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  50248870 aaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 50248914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 27336941 - 27337279
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  27336941 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 27337038  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27337039 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27337138  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    ||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||    
T  27337139 cccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 27337237  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27337238 tcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaag 27337279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 28842774 - 28842437
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  28842774 tttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 28842677  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28842676 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 28842577  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  28842576 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 28842477  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||| | || |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28842476 aaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaag 28842437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 27339132 - 27339486
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  27339132 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 27339229  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27339230 ggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaa 27339329  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tc 714  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||    
T  27339330 cccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccccctctatctctc 27339429  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  27339430 tcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 27339486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 28207069 - 28207403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28207069 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat---gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 28207165  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||| ||||| ||  ||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28207166 agttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaa 28207265  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    | |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28207266 ctctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 28207365  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28207366 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 28207403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 24325943 - 24325648
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24325943 tttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatg 24325845  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24325844 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa 24325745  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24325744 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtttcagccccctctatctc 24325648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 4131376 - 4131676
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga----tatc 514  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4131376 tttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatc 4131475  T
Q  515 aatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    ||||||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4131476 aatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtc-cagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaa 4131574  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 714  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4131575 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccctctatc 4131674  T
Q  715 tc 716  Q
    ||    
T  4131675 tc 4131676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 431 - 798
Target Start/End: Original strand, 8347284 - 8347648
Alignment:
Q  431 gttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8347284 gttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 8347383  T
Q  530 gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacct 629  Q
     | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  8347384 taagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct--aacct 8347481  T
Q  630 tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttaca-ct 728  Q
    | ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8347482 tggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacatct 8347579  T
Q  729 aatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  8347580 gatacaaggtctat-tttatagtaaaagtacccctcataaaattggaa-caaatctgacccataaaaatac 8347648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51752643 - 51752309
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| || |||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  51752643 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 51752546  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51752545 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaaggtgaatcaa 51752447  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  51752446 ccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcca 51752347  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51752346 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 51752309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 9463245 - 9463602
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9463245 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 9463342  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||| | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9463343 ggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 9463442  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----- 712  Q
    |||| |||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         
T  9463443 acccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 9463542  T
Q  713 -tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9463543 ctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 9463602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 422 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451592
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 47451821  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||         | || ||||||||||||    
T  47451820 tacaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccc 47451727  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggt 721  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  47451726 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagt 47451627  T
Q  722 ttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47451626 ttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47451592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 9459418 - 9459775
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9459418 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 9459515  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||| | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9459516 ggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 9459615  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----- 712  Q
    |||| |||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||         
T  9459616 acccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 9459715  T
Q  713 -tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9459716 ctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 9459775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 708
Target Start/End: Original strand, 46431707 - 46431996
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg--agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  46431707 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaa 46431804  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46431805 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 46431904  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccc 708  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46431905 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 42922512 - 42922163
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42922512 tttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 42922413  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  42922412 gggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatca 42922313  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    | |||| |||| ||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  42922312 a-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatctta 42922217  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||| || ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42922216 aggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatt 42922163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 456 - 716
Target Start/End: Original strand, 21948226 - 21948484
Alignment:
Q  456 ggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaa 555  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  21948226 ggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 21948324  T
Q  556 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaact 655  Q
    |||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  21948325 agtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaact 21948423  T
Q  656 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21948424 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 21948484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 47179992 - 47179697
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  47179992 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 47179896  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47179895 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 47179796  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47179795 acccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47179697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 14183591 - 14183928
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183591 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 14183690  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||  ||||| | |  | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14183691 gggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttccaaggtgaatca 14183790  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14183791 acc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagttt--gtgttg-cattctaaacccttgtttcagccctctctatctca 14183884  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  14183885 aggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaagaatcc 14183928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 16432676 - 16432396
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtat-gggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16432676 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaat 16432577  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| |    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16432576 gggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatca 16432477  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct 709  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16432476 accctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttctgccccct 16432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 486 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 48665392 - 48665100
Alignment:
Q  486 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg-tgaccaagaga 584  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||    
T  48665392 atgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaaccaagaga 48665293  T
Q  585 ctcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 684  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48665292 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcct 48665193  T
Q  685 ttctaaacccttgtttta------gccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||||||||||| |       |||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  48665192 ttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 48665100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 47177641 - 47177346
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  47177641 tttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 47177545  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactca-atcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47177544 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 47177445  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47177444 acccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47177346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 430 - 798
Target Start/End: Original strand, 49495222 - 49495578
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49495222 agttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 49495321  T
Q  530 gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacct 629  Q
       |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |   ||||     
T  49495322 tgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aacca 49495418  T
Q  630 tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacacta 729  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||          ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  49495419 tagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagttt--------gatttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctg 49495509  T
Q  730 atacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  49495510 atacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattcgaa-caaatctggctcataaaaatac 49495578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 446 - 761
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800911
Alignment:
Q  446 acctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaa 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |  ||||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  546 ttctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaa 645  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  | |||| |||| |||||  ||||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaa 18800797  T
Q  646 gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatt 745  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  18800798 gag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgac-ttctaaacctttgtttcagccccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatt 18800895  T
Q  746 tatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18800896 tatagtaaaagtatcc 18800911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 444 - 798
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669771
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcct 543  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  544 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcccc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||    
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgcc 15669616  T
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtcca 741  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||      
T  15669617 aagag-caaactttatacaaaccctacttttgt-gctgcctccc-aaaccctagttttcagccccctctatcccaatgtttacatctgctacaaggtctg 15669713  T
Q  742 tatttatagtaaaagcatccc-tcataaat-tggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15669714 tatttatagtaaaagtatcccctcaaaaaactggaac-aaatctggcccataaaaatac 15669771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 419 - 633
Target Start/End: Original strand, 25248552 - 25248766
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248552 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 25248651  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25248652 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 25248751  T
Q  619 ccctcaaaccttagt 633  Q
    |||||||||| ||||    
T  25248752 ccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 620
Target Start/End: Original strand, 6115103 - 6115304
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6115103 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatt 6115202  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  6115203 ggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa 6115302  T
Q  619 cc 620  Q
    ||    
T  6115303 cc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 501 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823828
Alignment:
Q  501 acaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacc-------aagagactcaatcat 593  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||       |||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  594 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 6823892  T
Q  694 cttgttttag-ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  6823891 cttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaag 6823828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 419 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 16429238 - 16429042
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16429238 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16429139  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16429138 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 794
Target Start/End: Original strand, 8349051 - 8349424
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||| || |||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8349051 tttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaat 8349150  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    | |||| ||||| | |   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8349151 gagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataa 8349250  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8349251 acc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccctctctatctca 8349346  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaa 794  Q
    |||||| || |||||||||  || ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||    
T  8349347 aggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaattatccctcataaaattggaa-caaatctgacccataaaa 8349424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 735
Target Start/End: Original strand, 13125457 - 13125772
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13125457 tttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 13125556  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  13125557 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatc 13125656  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctata-caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatct 715  Q
    || |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||| | |||    
T  13125657 aa-cctc-aaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttggc-ttcttaacccttgtttcagccccctttctct 13125752  T
Q  716 caaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||| ||||| || ||||||    
T  13125753 caagttttactctgatacaa 13125772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 750
Target Start/End: Original strand, 26520120 - 26520449
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||  |||||||| || || ||||||||        |||||||    
T  26520120 tttgtttacccagtttggtccaaaactgacctaatttgggggaaagagcaaccctccgttccactataattataagcaactttac--------tatcaat 26520211  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtga------ccaagagactcaatcataatagtgtttcccaagg 610  Q
    |||||| ||||| | |  |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520212 gggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaagg 26520311  T
Q  611 tgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-ag-ccccc 708  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26520312 tgaatcaa-cctc-aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccgttgttttcagcccccc 26520407  T
Q  709 tctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  26520408 tctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 419 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 16231842 - 16231630
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  16231842 tttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16231746  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16231745 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 16231646  T
Q  618 accctcaaaccttagt 633  Q
    |||| |||||| ||||    
T  16231645 acccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 27916778 - 27916421
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27916778 tttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaa 27916680  T
Q  518 g--ggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    |  ||||| |||||   | | ||   |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27916679 gaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 27916580  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt--tagccccctcta 712  Q
    ||||   || |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||  | || | || |     
T  27916579 tcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgctggc-ttctaaacccttgttttctggctctctgtt 27916486  T
Q  713 tctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27916485 tctcacagtttacatttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctccaaaattggaac 27916421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 23786119 - 23785935
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  23786119 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 23786022  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23786021 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51757810 - 51757623
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| || |||||| | ||||||| |||| ||| ||     
T  51757810 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcgata 51757713  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaa 608  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51757712 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Original strand, 30738627 - 30738830
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactata--atgatgagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30738627 tttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatca 30738726  T
Q  516 atgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    | |||||| ||||| | | | ||   |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30738727 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 30738826  T
Q  615 tcaa 618  Q
    ||||    
T  30738827 tcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Original strand, 26613239 - 26613440
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  26613239 tttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaa 26613338  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26613339 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaatc 26613438  T
Q  617 aa 618  Q
    ||    
T  26613439 aa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 16561749 - 16561545
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16561749 tttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 16561650  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||   |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16561649 gggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16561550  T
Q  617 aaccc 621  Q
    |||||    
T  16561549 aaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23816166 - 23816027
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23816166 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 23816068  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtc 559  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23816067 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20291898 - 20291798
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20291898 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaa 20291799  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  20291798 t 20291798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 30790401 - 30790731
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790401 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 30790499  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcc-cgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | |  |||   ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30790500 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatc 30790598  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatct 715  Q
    ||||    |||| |||||| |  | |  ||||| || |||||   ||||||||||||  |  |||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  30790599 aacc--acaaccctagtgtctccctcttagaga-aatctcta---aaaccctagtttattgtttg--tttctaaactcttgttttcagctccctctatct 30790690  T
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30790691 caaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaag 30790731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 442 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  442 attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaag-atgcatcccg 540  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||  |  | ||       
T  155963 attgacctagtttgggg-agagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13359012 - 13358927
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13359012 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 13358927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51750477 - 51750381
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51750477 ttgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 51750381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 13447117 - 13447212
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13447117 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13447212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10399669 - 10399767
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399669 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 10399767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15916672 - 15916562
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15916672 tttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaat 15916573  T
Q  518 gggttagaaga 528  Q
    |||||| ||||    
T  15916572 gggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 15294678 - 15294773
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15294678 tgttgcgatttcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 15294773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20302879 - 20302783
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20302879 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaat 20302783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13762275 - 13762178
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13762275 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13762178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16226611 - 16226522
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226611 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 16226522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24326101 - 24326005
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24326101 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagt-aaagtgtatggaacaattaaat 24326005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28842932 - 28842848
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28842932 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28842848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23816323 - 23816230
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23816323 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 23816230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 661 - 755
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 31735365 - 31735461
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31735365 tgttgcgaattcgatgagaaattacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 31735461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47177805 - 47177704
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47177805 caattgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataattaa 47177706  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  47177705 at 47177704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51757977 - 51757881
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51757977 caattgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 51757881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 14097814 - 14097910
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097814 ttgttgcgaattcgaagaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 14097910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 461 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 43104400 - 43104245
Alignment:
Q  461 gagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg--catcccgcctaattctacccaaagt 558  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    | ||   ||||||||||||||||||    
T  43104400 gagagcatctctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagt 43104301  T
Q  559 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
     ||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  43104300 ttcaatgtcttcctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39462956 - 39462861
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462956 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaatta 39462861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 46431546 - 46431644
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46431546 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 46431644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47906704 - 47906611
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47906704 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaacc-aaaccaaagtgtatggaacaatta 47906611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16232002 - 16231917
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232002 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 16231917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23786278 - 23786182
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23786278 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 23786182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 50078631 - 50078730
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50078631 caattgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 50078729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 2949079 - 2949173
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2949079 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 2949173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 28206908 - 28207007
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206908 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 28207007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 50248417 - 50248511
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248417 tgttgtgaattcgatgataaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 50248511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15823967 - 15823889
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823967 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 15823889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 355
Target Start/End: Original strand, 2510200 - 2510280
Alignment:
Q  274 tgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510200 tgaaaatcacaccaataacaacttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 2510280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9459277 - 9459361
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459277 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9459361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9463104 - 9463188
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463104 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9463188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 480 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28279486 - 28279292
Alignment:
Q  480 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacc 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||   | | ||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28279486 actataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgacc 28279387  T
Q  579 aagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 677  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||   |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  28279386 aagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactc--tacaaaccctaattttgtt 28279292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47180152 - 47180055
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47180152 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataattaaat 47180055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 50307387 - 50307484
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307387 attgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 50307484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51752806 - 51752715
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51752806 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataactt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatt 51752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Original strand, 13127687 - 13127782
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 513  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13127687 tttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14353210 - 14353047
Alignment:
Q  454 tgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccc 553  Q
    ||||||||||||  || || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||| ||||| | |  ||   |||||||||||||    
T  14353210 tgggggagagagtggctcttcgttccactataatgatgaataactttacaaaaga--tttcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctaccc 14353114  T
Q  554 aaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353113 aaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 543 - 618
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332688
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31490346 - 31490252
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31490346 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaatacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 31490252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3579431 - 3579524
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3579431 tgttgtgaattcgatgaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 3579524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Original strand, 27336801 - 27336879
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336801 aaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 27336879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 4131221 - 4131316
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4131221 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 4131316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Original strand, 6995539 - 6995631
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6995539 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaa 6995631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39932514 - 39932426
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932514 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 39932426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13358853 - 13358797
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13358853 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 13358797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 14183451 - 14183542
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14183451 caattgttgtgaattcgataaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 14183542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 660 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231545
Alignment:
Q  660 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 16231545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 25251117 - 25251215
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25251117 caattattgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 25251215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 27338969 - 27339070
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338969 caattgttgtgaattcgttgagaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 27339068  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  27339069 ta 27339070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 701
Target Start/End: Original strand, 26332699 - 26332837
Alignment:
Q  556 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaact 655  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  26332699 agtctcaatctattttcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaacc-tagtgtttgttgccaagag-caaact 26332795  T
Q  656 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  26332796 c--tacaaaccctatttttg-tgttggc-ttctaaacccttgtttt 26332837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 11457327 - 11457415
Alignment:
Q  265 cgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11457327 cgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatt 11457415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16429391 - 16429299
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16429391 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 16429299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18840023 - 18839928
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  18840023 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaa-caaagtgtatggaacaatta 18839928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 30790250 - 30790337
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30790250 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 30790337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 12302349 - 12302446
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat---cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302349 tgttgcgaattcgataaaaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 12302446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 25248398 - 25248492
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25248398 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 25248492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30780482 - 30780386
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtga--agtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30780482 tgttgtgaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 30780386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 895 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 17318680 - 17318611
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  17318680 aaatcgtgctccgatattgatagcttcagcaaacttcaatttctccgattttgagtcactttcacaacaa 17318611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 600
Target Start/End: Original strand, 21353347 - 21353525
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |    
T  21353347 tttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagatat---t 21353442  T
Q  518 gggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    | |||| |||||  |  | ||   ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21353443 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 31424858 - 31424956
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  31424858 caattgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataa-caaaatgtatgggacaatta 31424956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 908 - 963
Target Start/End: Original strand, 50079328 - 50079383
Alignment:
Q  908 attttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  50079328 attttgacagcttcagcaaacttcaatttcttcaatttggagtcactttcacaaca 50079383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Original strand, 9240951 - 9241028
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9240951 aaaatcacaccaataacaaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 9241028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 28998090 - 28998191
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa--aatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28998090 caattgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaat 28998189  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  28998190 ta 28998191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 29003806 - 29003907
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa--aatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29003806 caattgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaat 29003905  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  29003906 ta 29003907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Original strand, 38925326 - 38925420
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38925326 attgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaaca 38925420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 8348901 - 8348991
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8348901 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaaaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 8348991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41647357 - 41647260
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41647357 attgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataatta 41647260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15916821 - 15916734
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15916821 tgttgtgaattcgatgaaaagtcacaccaataaatacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 15916734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47452066 - 47451971
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47452066 ttgttgtgaattcaatgaaaaatcacatcaataacaaatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47451971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13215518 - 13215424
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13215518 tgttgtgaattcgttgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 13215424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 17324484 - 17324573
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| || |||||||||    
T  17324484 gaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataa-caaagtgaatagaacaatta 17324573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 685 - 776
Target Start/End: Original strand, 26613503 - 26613597
Alignment:
Q  685 ttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc--aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  26613503 ttctaaacccttgttttcagccccctctatctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagcaaaagaatccctcaaaaattggaac 26613597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 31422706 - 31422800
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  31422706 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaat-aaagtgtacggaataatta 31422800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 49959208 - 49959129
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  49959208 cctaattttatccaaagtctcgaatctcttctcatgaccaagagactcattcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 2232658 - 2232597
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2232658 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14997101 cctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 3157033 - 3156989
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 3156989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 724
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115384
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggttta 724  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 6115384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 472
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598454
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccct 472  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 13598454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 28223421 - 28223465
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28223421 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 28223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28841088 - 28841033
Alignment:
Q  288 ataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28841088 ataacaacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28841033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 2401342 - 2401400
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2401342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 17185977 - 17186067
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17185977 attgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 17186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18307543 - 18307449
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307543 tgttgcgaattcgatgagaaaatacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 18307449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16124609 - 16124555
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16124609 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 16124555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072986
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 19072986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120876
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 19120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644936
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 26644936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098863
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctcc 47098863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703975
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 47703975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 9521871 - 9521826
Alignment:
Q  445 gacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9521871 gacctagtatgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9521826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 9526649 - 9526577
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9526649 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 9526577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 705 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 16431096 - 16431032
Alignment:
Q  705 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16431096 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaacctatatttatagtaaaagtatccctcataaa 16431032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25128301 - 25128225
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128301 gaattcaatgaaaactcacgtcaataacaaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 25128225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 26519295 - 26519373
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26519295 gaattcgatgaaaatcacaccaataaaatactt--tgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 26519373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 37990836 - 37990772
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 604  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  37990836 cctaattctacccaaaatttcgaatctcttctcgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 37990772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 40122196 - 40122240
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40122196 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 40122240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 474
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281766
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 3281766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 9521776 - 9521718
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9521776 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324414
Alignment:
Q  283 caccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  17324484 caccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataa-caaagtgtatgaaaaaatta 17324414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 474
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651869
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactcc 29651869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 603
Target Start/End: Original strand, 31047696 - 31047735
Alignment:
Q  564 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31047696 tctcttctcgtgaccaagagactcaatcatattagtgttt 31047735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069821
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 37069821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 600
Target Start/End: Original strand, 2393404 - 2393461
Alignment:
Q  542 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2393404 ctaattctacccaa-gtcccagactattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476319
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctcc 9476319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13604716 - 13604662
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13604716 ttgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 13604662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18800429 - 18800510
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  || ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18800429 gaattcgatgaaaatcacaccaacaaaatacttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18800510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21536662 - 21536608
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21536662 ttgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 21536608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 462
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644396
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 45644396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102884
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagcc 470  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagcc 47102884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115041
Alignment:
Q  294 acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 6115041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16561885 - 16561819
Alignment:
Q  269 ttcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  16561885 ttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 16561819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 716 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 43104143 - 43104094
Alignment:
Q  716 caaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43104143 caaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctca 43104094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 202)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 419 - 912
Target Start/End: Original strand, 20137108 - 20137596
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137108 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 20137206  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20137207 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20137306  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20137307 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 20137406  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    ||||||| || |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||  ||    
T  20137407 ggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttatgatt 20137501  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaatttt 912  Q
     ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  20137502 ttgcgcaaaatcgtactccgattttgccagatcgtgcttcgattttttacgaatggaaagtgccaattctgctccgaaaatcgtactccgatttt 20137596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Original strand, 4295933 - 4296455
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4295933 tttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 4296031  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4296032 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 4296131  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    || ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4296132 ccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctca 4296231  T
Q  718 aggtttacactaatac-aatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  4296232 aggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggatccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattc 4296328  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattttgac 915  Q
    |||||||| |||||||||||                     |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  4296329 ttctgcgcaaaatcgtgctc---------------------cgatttttttcgaatgaaagtggcaattctgctccaaaaaatcgtgctccgattttgac 4296407  T
Q  916 agcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4296408 agcttcagcaagcttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 4296455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 423 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 9681106 - 9680638
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9681106 ttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagtt 9681008  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9681007 acaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccct 9680908  T
Q  623 caaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tctca 717  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    |||||    
T  9680907 caaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctctca 9680808  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |      
T  9680807 aggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac---attttatttttctga 9680711  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgc 889  Q
     ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  9680710 atctgcgcaaaatcgtactccgattttgtcagatcgtgctccaatttttttcgaatgaaagtgcccattctgc 9680638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 11355548 - 11355134
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  11355548 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactata-tgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatg 11355450  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355449 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11355350  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11355349 ccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 11355250  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |   |    
T  11355249 ggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttctgact 11355155  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccga 839  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  11355154 ctgcgcaaaatcgtgctccga 11355134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 44724869 - 44724528
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724869 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 44724771  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724770 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 44724671  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  44724670 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctcca 44724571  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44724570 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 44724528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 13099473 - 13099826
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099473 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaat 13099572  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13099573 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatca 13099672  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13099673 accctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaaccccctctatctca 13099772  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||||  | || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13099773 aggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 13099826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 42223448 - 42222888
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42223448 tttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaata 42223350  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||  ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42223349 ggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 42223250  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccc-cctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  42223249 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcatcccacatctatctc 42223150  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattc 816  Q
    ||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |      
T  42223149 aaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaaaccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttctga 42223055  T
Q  817 ttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgcca---------------------gatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccata 895  Q
     ||| ||| ||||||| |||||| |||||||                     ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42223054 atctacgcaaaatcgtactccgattttgccatatcgtactccgattttgccagatcgtgctctgattttttacgaatgaaagtgtcaattctgctccaaa 42222955  T
Q  896 aatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  42222954 aatcgtgctccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttctccaattttaagtcactttcacaaca 42222888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 429 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21680307 - 21679976
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21680307 cagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaaga 21680209  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | |    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21680208 ataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaacc 21680109  T
Q  629 ttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacact 728  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21680108 ctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacact 21680009  T
Q  729 aatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21680008 aatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 21679976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 42330996 - 42331349
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42330996 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 42331094  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtg--accaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42331095 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 42331194  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42331195 aaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 42331294  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42331295 aaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 42331349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 39145985 - 39146327
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39145985 tttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 39146084  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39146085 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaa 39146184  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39146185 ccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagccccctccatctcaa 39146284  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  39146285 ggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaagaatcc 39146327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24748885 - 24748548
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24748885 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 24748786  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24748785 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaa 24748686  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  24748685 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctaagtcaa 24748586  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24748585 agtttacactgatacaatgtctatatttataataaaag 24748548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 31435045 - 31435382
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435045 tttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31435144  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31435145 ggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 31435244  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31435245 ccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaa 31435344  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  31435345 agtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 31435382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 443886 - 443534
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  443886 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttataaaagagatatcaat 443788  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    || ||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  443787 ggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 443688  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  443687 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagctccctctatctca 443588  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  443587 aggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 443534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 38394276 - 38393921
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38394276 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 38394178  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38394177 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 38394078  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  38394077 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 38393978  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  38393977 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 38393921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21678356 - 21678015
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21678356 tttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactata-tgataagtaaccttacaaaagatatatcaatg 21678258  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21678257 ggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 21678158  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21678157 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 21678058  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21678057 ggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaagaatcc 21678015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 27306229 - 27306564
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306229 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 27306327  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||  ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27306328 ggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27306427  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27306428 ccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 27306526  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27306527 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 27306564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 48457943 - 48457647
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48457943 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 48457845  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  48457844 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaa 48457745  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48457744 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 48457647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 738
Target Start/End: Original strand, 21592142 - 21592460
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21592142 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 21592240  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  21592241 agttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaatcaa 21592340  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21592341 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaa 21592440  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgt 738  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  21592441 agtttacactgatacaatgt 21592460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 35919 - 35583
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35919 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 35821  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35820 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 35721  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35720 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaa 35621  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35620 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 35583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 44854 - 44518
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44854 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 44756  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44755 ggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa 44656  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44655 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 44556  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44555 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 44518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 1049295 - 1049630
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  1049295 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 1049392  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1049393 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1049492  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1049493 cccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 1049592  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1049593 agtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaag 1049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 419 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 9679349 - 9678966
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679349 tttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 9679251  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9679250 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 9679151  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc- 716  Q
     |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  9679150 tcctcaaacct-agtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctct 9679052  T
Q  717 ---aaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
       || ||||||| || ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  9679051 ctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaaacatccctcataaattgaaaccaaatcaaacccataaaaatac 9678966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 7470021 - 7470359
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7470021 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 7470119  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7470120 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaa 7470219  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  7470220 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 7470319  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
      || |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  7470320 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7470359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 40836742 - 40837077
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  40836742 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 40836839  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40836840 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 40836939  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  40836940 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctcaatctcca 40837039  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
      ||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40837040 aatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 40837077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 432 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 24258744 - 24258438
Alignment:
Q  432 ttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24258744 ttcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24258645  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24258644 ataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 24258545  T
Q  629 ttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacact 728  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24258544 atagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttactct 24258445  T
Q  729 aatacaa 735  Q
     ||||||    
T  24258444 gatacaa 24258438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 1850271 - 1849975
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1850271 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 1850173  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850172 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1850073  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1850072 cccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 20626328 - 20626032
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20626328 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 20626230  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20626229 ggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20626130  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20626129 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 20626032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 20630219 - 20629923
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20630219 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 20630121  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20630120 ggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20630021  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20630020 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 20629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 20642638 - 20642342
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20642638 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 20642540  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20642539 ggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20642440  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20642439 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 20642342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 20299750 - 20299394
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20299750 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 20299652  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20299651 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20299552  T
Q  619 ccctcaaa-ccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc-ttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20299551 ccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctc 20299452  T
Q  717 ----aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaat 770  Q
        || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20299451 tctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaat 20299394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21990440 - 21990106
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990440 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 21990342  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21990341 agttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 21990242  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  21990241 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctcca 21990143  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||    
T  21990142 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 754
Target Start/End: Original strand, 7471979 - 7472317
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7471979 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 7472077  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7472078 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 7472177  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  7472178 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 7472277  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
      || |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  7472278 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7472317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 423 - 755
Target Start/End: Original strand, 37412128 - 37412462
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaatgggt 521  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  37412128 ttgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagt 37412227  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 621  Q
    || ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412228 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 37412327  T
Q  622 tcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaagg 720  Q
    ||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  37412328 tcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctatatctccagg 37412427  T
Q  721 tttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||| || || ||| ||| |||||||||||||||    
T  37412428 tttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 423 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20297648 - 20297312
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  20297648 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtt 20297550  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297549 acaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 20297450  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tctcaa 718  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||    
T  20297449 caaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaa 20297350  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20297349 agtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaag 20297312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 439 - 756
Target Start/End: Original strand, 27832651 - 27832969
Alignment:
Q  439 caaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcc 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |  |||    
T  27832651 caaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 27832750  T
Q  539 cgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttg 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27832751 cgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatg 27832850  T
Q  639 tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc-cccctctatctcaaggtttacactaatacaatg 737  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| | || |||||       
T  27832851 ttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagctccactctatcacaaggtttgctctgatacacaa 27832950  T
Q  738 tccatatttatagtaaaag 756  Q
     | ||||||||||||||||    
T  27832951 cctatatttatagtaaaag 27832969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 3878867 - 3878571
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3878867 tttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 3878769  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878768 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaa 3878669  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| ||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3878668 cccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 3878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 480 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 25276371 - 25276090
Alignment:
Q  480 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacca 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25276371 actataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacca 25276272  T
Q  580 agagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 679  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276271 agagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 25276172  T
Q  680 tgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |   |||||||||||||||| ||||    
T  25276171 tgcctttctaaattattgttttagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaagaatcc 25276090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 18345831 - 18345476
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18345831 tttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 18345733  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18345732 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 18345633  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctat----c 714  Q
    |||||||| | |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    |    
T  18345632 ccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctccc 18345533  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||| ||| |  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18345532 tcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 18345476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 1046924 - 1047219
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  1046924 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 1047021  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1047022 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1047121  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1047122 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 1047219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 3036014 - 3035656
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  3036014 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat-atgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatg 3035916  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatc---tcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| ||  |   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035915 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 3035816  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--- 712  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       
T  3035815 caacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 3035716  T
Q  713 -tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  3035715 ctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 3035656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 460 - 769
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828981
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtc 559  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  560 tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctat 659  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  660 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcat 759  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  22828872 acaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagtat 22828971  T
Q  760 ccctcataaa 769  Q
    ||||||||||    
T  22828972 ccctcataaa 22828981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 31155910 - 31156261
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||  |||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  31155910 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatg 31156007  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31156008 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31156107  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31156108 acccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 31156207  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    | |||| |  | ||||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31156208 aagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatt 31156261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 7351651 - 7351947
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  7351651 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 7351748  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7351749 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 7351848  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7351849 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7351947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 28487843 - 28487547
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28487843 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 28487745  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28487744 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaa 28487645  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||| | |||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28487644 cccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28487547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 430 - 798
Target Start/End: Original strand, 24817362 - 24817725
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga 528  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24817362 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaaga 24817461  T
Q  529 agatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 628  Q
    | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||   ||||    
T  24817462 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aacc 24817558  T
Q  629 ttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttaca-c 727  Q
     ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  24817559 ctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaggtttacatc 24817655  T
Q  728 taatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    | |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||| | | | |||||| |||| ||||||||||    
T  24817656 tgatacaaggtctatatttata-ttaaagtatccctcataaaattgtaacaaatctggccaataaaaatac 24817725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 40946618 - 40946327
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  40946618 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaata 40946520  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  40946519 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaa 40946420  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctct 711  Q
    ||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40946419 cccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 40946327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 454 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 7188795 - 7188484
Alignment:
Q  454 tgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccc 553  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |  |||||| |||||||||||    
T  7188795 tggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctaccc 7188696  T
Q  554 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaa 653  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  7188695 aaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaa 7188599  T
Q  654 ctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaa 753  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||    
T  7188598 ccctatacaaaccctatttttattgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 7188500  T
Q  754 aagcatccctcataaa 769  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7188499 aagtatccctcataaa 7188484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25542818 - 25542485
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  25542818 tttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 25542721  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25542720 ggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtctttcc-aaggtgaatcaa 25542622  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25542621 cccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttcag-cccctctatctcaa 25542523  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25542522 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 25542485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 432 - 771
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349629
Alignment:
Q  432 ttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaaga 531  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 7349382  T
Q  532 tgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctt 630  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7349383 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 7349482  T
Q  631 agtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta------tctcaaggttta 724  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      |||||| |||||    
T  7349483 agtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaagttta 7349582  T
Q  725 cactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7349583 gcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 7349629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 28485855 - 28485501
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | || | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28485855 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagg-agagagcaaccctctgattcattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 28485758  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| |    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28485757 gattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaa 28485658  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||      
T  28485657 cccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctctc 28485558  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28485557 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 28485501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 454 - 769
Target Start/End: Original strand, 20091581 - 20091889
Alignment:
Q  454 tgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  20091581 tgggggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  554 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || | |||||  |||| || ||||    
T  20091678 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaa 20091774  T
Q  654 ctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagta 752  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||    
T  20091775 ctctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-tccgaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagta 20091872  T
Q  753 aaagcatccctcataaa 769  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20091873 aaagtatccctcataaa 20091889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 423 - 706
Target Start/End: Original strand, 43253520 - 43253801
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  43253520 ttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 43253618  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253619 acaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 43253718  T
Q  623 caaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccc 706  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  43253719 caaacc-tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttcagccc 43253801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 486 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 11757454 - 11757163
Alignment:
Q  486 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  11757454 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 11757355  T
Q  586 tcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 684  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11757354 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtca 11757255  T
Q  685 ttctaaaccc-ttgttttagccccctctatctc----aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||    || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  11757254 ttctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 11757163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 639
Target Start/End: Original strand, 7092212 - 7092430
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7092212 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatg 7092309  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092310 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa 7092409  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgt 639  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7092410 ccctcaaaccctagtgtttgt 7092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 536 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26804746 - 26804527
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacctta---g 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  26804746 tcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactag 26804647  T
Q  633 tgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaata 732  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    |    
T  26804646 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactc----a 26804551  T
Q  733 caatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26804550 caaggtctatatttatagtaaaag 26804527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 480 - 756
Target Start/End: Original strand, 22251605 - 22251877
Alignment:
Q  480 actataatgatgagtaactttacaaaagaga----tatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtg 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22251605 actataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgta 22251704  T
Q  576 accaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 675  Q
    |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22251705 accaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttg 22251796  T
Q  676 ttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22251797 ttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaag 22251877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 419 - 681
Target Start/End: Original strand, 24813496 - 24813755
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24813496 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaat 24813595  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24813596 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatca 24813695  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 681  Q
    ||||   |||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813696 accc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 423 - 628
Target Start/End: Original strand, 7094463 - 7094667
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7094463 ttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggtt 7094561  T
Q  523 agaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 622  Q
    | ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094562 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 7094661  T
Q  623 caaacc 628  Q
    ||||||    
T  7094662 caaacc 7094667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24465827 - 24465503
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24465827 tttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatg 24465729  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| |    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24465728 agttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa 24465629  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
       |  |||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24465628 ---ttcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 24465541  T
Q  719 ggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  24465540 ggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 593 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18567730 - 18567567
Alignment:
Q  593 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567730 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 18567631  T
Q  693 ccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  18567630 ccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18567567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 419 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 38396924 - 38396719
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  38396924 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactata-tgatgagtaaagttacaaa-gagaaatcaatg 38396827  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38396826 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 38396727  T
Q  619 ccctcaaa 626  Q
    ||| ||||    
T  38396726 cccacaaa 38396719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 419 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 6332512 - 6332171
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6332512 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaa 6332413  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    |||||| ||||| | | | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  6332412 gggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaatc 6332313  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt-tgcctttctaaacccttgttt-tagccccctctatc 714  Q
    ||  ||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  6332312 aa-tctcaatcc-tagtgtttgttgccaagag-taaactctat--aaaccctag-tctgttgtatg--tttataaacccttgtttccagccccctctctc 6332221  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    |||||| |||| || ||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332220 tcaagg-ttactctgatacaagttttatatttatagtaaaagtatccctca 6332171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 2935558 - 2935374
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2935558 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 2935461  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2935460 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 9027193 - 9027376
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  9027193 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 9027290  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9027291 ggttacaagaatagtc-tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 618
Target Start/End: Original strand, 16297020 - 16297222
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  16297020 tttgtttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaa 16297119  T
Q  518 -gggttagaagaag-atgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
     |||||| |||||  |  | ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16297120 agggttacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 16297219  T
Q  616 caa 618  Q
    |||    
T  16297220 caa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 22108356 - 22108173
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  22108356 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 22108259  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22108258 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40550116 - 40549933
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  40550116 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 40550019  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40550018 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22394013 - 22393876
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22394013 tttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 22393914  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaa 556  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  22393913 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 1606669 - 1606486
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  1606669 tttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 1606572  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1606571 ggttacaagaatagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 22137367 - 22137184
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  22137367 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 22137270  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22137269 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40552394 - 40552211
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  40552394 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 40552297  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40552296 ggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 11081801 - 11081521
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11081801 tttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaa 11081702  T
Q  518 --gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
      |||||| |||||   | | ||   ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11081701 aagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaa 11081602  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||||  |||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11081601 tcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgtttt 11081521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26295738 - 26295586
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26295738 tttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 26295639  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 571  Q
    ||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26295638 ggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcc 26295586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 563 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392427
Alignment:
Q  563 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctataca 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||| || |||| ||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caaattctataca 22392513  T
Q  663 aaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||||          ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22392512 aaccctagttt--------gatttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 22392427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48458100 - 48458005
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48458100 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 48458005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7471817 - 7471917
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7471817 caattgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 7471915  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7471916 at 7471917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38394438 - 38394338
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38394438 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 38394340  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  38394339 at 38394338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2935716 - 2935621
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2935716 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 2935621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 6049134 - 6048884
Alignment:
Q  448 ctagtatgggggagagagcagccctccgttttactata--atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgccta 544  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | | | ||   ||||    
T  6049134 ctagtatggggggaagagcaactctccgttccactatataatgatgagtaactttacaaagg-gatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaaccta 6049036  T
Q  545 attctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtcccc 643  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  6049035 attctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaacc-tagtgtttgttgcc 6048938  T
Q  644 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    |||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  6048937 aagag---aattctttacaaaccctagttttgatgttggc-ttctaaacccttgtttt 6048884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28488000 - 28487905
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28488000 gttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 28487905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 43253358 - 43253453
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43253358 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 43253453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11759576 - 11759479
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11759576 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 11759479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38397084 - 38396991
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38397084 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaattaaat 38396991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45012 - 44916
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45012 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 44916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20297814 - 20297714
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20297814 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 20297716  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  20297715 at 20297714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7092050 - 7092150
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7092050 caattgttgcaaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaat-aaagtgtgtggaacaattaa 7092148  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7092149 at 7092150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7094297 - 7094397
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7094297 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaat-aaagtgtgtggaacaattaa 7094395  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7094396 at 7094397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28486017 - 28485917
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28486017 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaacaattaa 28485919  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  28485918 at 28485917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 484 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6349008 - 6348912
Alignment:
Q  484 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6349008 taatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 40836582 - 40836680
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg--aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40836582 ttgttgcgaattcgatcgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 40836680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40946777 - 40946682
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40946777 tgttgtgaattcgatgagaatcacatcaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 40946682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36059 - 35981
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36059 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 35981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1850429 - 1850333
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1850429 tgttgcgaattcgatttgaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 1850333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9027034 - 9027118
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9027034 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9027118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20299908 - 20299812
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20299908 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 20299812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25542976 - 25542880
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25542976 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 25542880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40550281 - 40550180
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  40550281 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 40550182  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  40550181 at 40550180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 7351487 - 7351576
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7351487 caattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 7351576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3879028 - 3878930
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  3879028 ttgttgcgaattcgatgagaaatcacatcaataataacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaattaaat 3878930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 344
Target Start/End: Original strand, 7349114 - 7349202
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7349114 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaat-aaagtgtatg 7349202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 7469863 - 7469959
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7469863 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggag-cagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 7469959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1606827 - 1606731
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1606827 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 1606731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20626481 - 20626394
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626481 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20626394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20630372 - 20630285
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20630372 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20630285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20642791 - 20642704
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642791 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20642704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3036166 - 3036076
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3036166 gaattcgatgagaaatcacaccaataacaatttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3036076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 591
Target Start/End: Original strand, 6067197 - 6067370
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||   ||||||||||||      
T  6067197 tttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttacaaagagatatcaga 6067296  T
Q  518 gggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc 591  Q
    || ||| |||||  |  | ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6067297 ggattacaagaattagtcttcaaacctaattcta-tcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatc 6067370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42223603 - 42223506
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  42223603 aattgttgcgaattcgataaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtataaaacaatta 42223506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22137527 - 22137430
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22137527 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 22137430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396316
Alignment:
Q  649 acaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctc 710  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40552554 - 40552457
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  40552554 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 40552457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 1049125 - 1049216
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1049125 caattgttgcgaattcgaagaaaaattcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg 1049216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18345967 - 18345893
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345967 cacaccaacaacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 18345893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 27306076 - 27306170
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaa-atcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306076 tgttgcgaattcgatgagagatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 42330846 - 42330940
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42330846 tgttgcgaattcgatgagaaatcacgccaataataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 42330940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44725026 - 44724932
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44725026 caattgttgcgaattcgatgggaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 44724932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9679495 - 9679409
Alignment:
Q  269 ttcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679495 ttcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 9679409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 13099314 - 13099411
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13099314 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 13099411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26804958 - 26804861
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26804958 aattgttgcgaatttgatgagaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 26804861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 541 - 615
Target Start/End: Original strand, 40281498 - 40281572
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  40281498 cctaattccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 327
Target Start/End: Original strand, 1502814 - 1502883
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaac 327  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  1502814 attgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Original strand, 4295777 - 4295873
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4295777 caattgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaat 4295873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084467
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 31434892 - 31434987
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  31434892 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaat-aaagtgtaaggaacaatta 31434987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Original strand, 1046756 - 1046831
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  1046756 ttgttgcgaattcgaagaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa 1046831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21990560 - 21990500
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990560 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 21990500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11355707 - 11355609
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11355707 attgttgggaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta 11355609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21678510 - 21678412
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21678510 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtaaggaacaatta 21678412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21680472 - 21680378
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21680472 tgttgtgaattcgatgaaaacccacaccaataacaagcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaa-caaagtgtatggaacaatta 21680378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24749039 - 24748946
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24749039 caattgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaa 24748946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 673
Target Start/End: Original strand, 13290472 - 13290723
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| | ||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13290472 tttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaa 13290570  T
Q  518 gggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaat 615  Q
     ||||| |||||  || | ||   |||||||||||||| |||   ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||    
T  13290571 aggttacaagaattattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagagactaaattctaatagtgtttctcgaaggtgaat 13290670  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 673  Q
    | || | ||| || ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  13290671 c-actcccaagcc-tagtgtttgttgccaagaga-aaactc--tacaaaccctagttt 13290723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11759417 - 11759364
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccct 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11759417 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046625
Alignment:
Q  432 ttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaag 530  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||     
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaat 6046674  T
Q  531 atg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgacc 578  Q
    | | | ||   ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  6046673 aagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccattcttttctcgtgacc 6046625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 895 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 11355077 - 11355010
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11355077 aaatcgggctccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttcttcaattttgagtcactttcacaaca 11355010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 914 - 965
Target Start/End: Original strand, 20137619 - 20137670
Alignment:
Q  914 acagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20137619 acagcttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaat 20137670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 903 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 9680601 - 9680540
Alignment:
Q  903 ctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9680601 ctccgattttgacagcttcagcaaactt-aatttctccaattttgagtcactttcacaacaat 9680540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 37411988 - 37412061
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37411988 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 37412061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 2120960 - 2120881
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 619  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120960 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 863 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 9678964 - 9678864
Alignment:
Q  863 ttttatgaatgaaagtgccaattctgctccataaa-tcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaa 961  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9678964 ttttacgaatgaaagtgcctattctgcaacataaaattgtgctccgattttgacagcttcaacatactt-aatttctccaattttgagtcattttcacaa 9678866  T
Q  962 ca 963  Q
    ||    
T  9678865 ca 9678864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 650 - 769
Target Start/End: Original strand, 30906280 - 30906398
Alignment:
Q  650 caaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttat 748  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |  |||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  30906280 caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaattcttgttttcagccccctctatctcaagatttactcttatacaaggtctatatttat 30906377  T
Q  749 agtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    || ||||| |||| |||||||    
T  30906378 agcaaaagtatccatcataaa 30906398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 444045 - 443948
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  444045 ttgttgtgaattcgatgagaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtattgaacaatta 443948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22108484 - 22108420
Alignment:
Q  292 caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22108484 caacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 22108420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25351534 - 25351353
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||   |    
T  25351534 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---t 25351439  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    | |||| |||||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25351438 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210491
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctca-aaccttagtgttt 637  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||| ||||| ||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtg-tt 26210615  T
Q  638 gtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttaca-ctaatacaat 736  Q
    ||  |||||||   || ||| |||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||   ||||| || ||||||||||||||  | ||||||     
T  26210614 gttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgaggttg-gattctaaaaccttgtttcctccccc-ctctctcaaggtttacatttgatacaag 26210520  T
Q  737 gtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||    
T  26210519 ttctatatttatactaaaagcatccctca 26210491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 661 - 716
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094717
Alignment:
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7094717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25410313 - 25410130
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat--gagtaactttacaaaagagatatca 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||      
T  25410313 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 25410217  T
Q  516 atgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
     || |||| |||||   | | ||   ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25410216 -tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 31153690 - 31153737
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtg 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31153690 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtg 31153737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 3320171 - 3320232
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3320171 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 3324919 - 3324980
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3324919 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 708 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 6048675 - 6048617
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6048675 ctctctctcaaggtttacatctaatacaaggtctatatttatagtaaaagcatccctca 6048617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7069841 - 7069780
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7069841 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7074848 - 7074787
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7074848 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 8378625 - 8378686
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378625 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190047
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcc 9190047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284147
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 20284147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25357108 - 25357047
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25357108 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25405454 - 25405393
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25405454 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9681243 - 9681170
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9681243 cacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 9681170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 562 - 603
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310198
Alignment:
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 12310198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251524
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22251452 cacaccaataacaaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 22251524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30814604 - 30814560
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30814604 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 30814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7188983 - 7188890
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7188983 caattgttgtgaattcgatcaaaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 7188890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 908 - 963
Target Start/End: Original strand, 24817854 - 24817909
Alignment:
Q  908 attttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24817854 attttgacaaattcaacaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 24817909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580448
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcc 2580448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 21369703 - 21369642
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21369703 cctaattttacccaa-gtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983342
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 21983342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 523
Target Start/End: Original strand, 22280379 - 22280441
Alignment:
Q  461 gagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtta 523  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22280379 gagagcagctttctgtttcactataatgatcaataactttacaaaagagatatcaacgggtta 22280441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24465976 - 24465887
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24465976 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 24465887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 353
Target Start/End: Original strand, 39145856 - 39145925
Alignment:
Q  284 accaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  39145856 accaataacaaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaattgtattaaacaatta 39145925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516349
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctcc 46516349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796707
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctc 473  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctc 4796707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 754
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092512
Alignment:
Q  661 caaaccctagt-tttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc----aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 754  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||    || |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7092512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Original strand, 24813348 - 24813425
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24813348 tgttgtgagttcgatgaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaa 24813425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25276549 - 25276487
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25276549 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggatcaa--gttaatcaagcaaccaatatcaaagtg 25276487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 21591989 - 21592082
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21591989 tgttgcgaattcgatgagaaaacacggctataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa--aaagtgtatggaacaatta 21592082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 31732969 - 31733013
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31732969 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 31733013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Original strand, 34546879 - 34546951
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34546879 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 34546951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 36146408 - 36146452
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36146408 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 36146452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 41649011 - 41649055
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  41649011 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 41649055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 552 - 600
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  552 ccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 47676136 - 47676180
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47676136 ttgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 47676180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 633 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 6348895 - 6348778
Alignment:
Q  633 tgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtttaca-ctaa 730  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || |    
T  6348895 tgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttcttttttac-ttctaaacccttgttttcagtcctctctatctcaatgtttacatctga 6348798  T
Q  731 tacaatgtccatatttatag 750  Q
    ||||| ||  ||||||||||    
T  6348797 tacaaggtttatatttatag 6348778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21369824 - 21369753
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  21369824 ttgtttacccagttcggtccaatgatgacctactatggcggagagagcagctctccgttccactataatgat 21369753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 600
Target Start/End: Original strand, 34547007 - 34547042
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34547007 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Original strand, 47263682 - 47263725
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagag 463  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  47263682 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 47263725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2647789 - 2647735
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2647789 ttgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctcc 2647735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctcc 9185204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26804800 - 26804762
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26804800 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 27832487 - 27832576
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27832487 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27832576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28617318 - 28617264
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  28617318 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctcc 28617264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159861
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctcc 29159861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33332543 - 33332489
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33332543 ttgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 33332489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 35960820 - 35960874
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35960820 ttgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 35960874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Original strand, 44010775 - 44010821
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44010775 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 44010821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 8260625 - 8260584
Alignment:
Q  562 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  8260625 aatctcttcccgtgaccaagacactcaatcctaatagggttt 8260584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 24817199 - 24817280
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||  ||||||||| || ||| |||||    
T  24817199 caattgttgcaaattcaatgaaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaagtaataatcaagaaaacaatatcaa 24817280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 168)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 419 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 17849373 - 17848903
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17849373 tttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 17849275  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17849274 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 17849175  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17849174 ccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 17849075  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  17849074 ggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccatataaatacgt---tttatttttattctt 17848978  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcca 893  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17848977 ctgcgcgaaatcgtgctccgatttttccagaccgtgctcagattttttacgaatgaaagtgtcaattcttctcca 17848903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 419 - 965
Target Start/End: Original strand, 31732775 - 31733286
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732775 tttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31732874  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||            |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31732875 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa------------accaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatcaa 31732962  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31732963 ccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 31733062  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
     |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  31733063 tgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttactctt 31733159  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaat-gaaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacag 917  Q
    |||| | |||||||||||                     |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  31733160 ctgcacaaaatcgtgctc---------------------cgattttttacgaatggaaagtgtcaattctgcttcaaaaatcgtactccaattttgacag 31733238  T
Q  918 cttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaat 965  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31733239 cttcaccaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaacaat 31733286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 443 - 964
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239501
Alignment:
Q  443 ttgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcc 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgct 45239098  T
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccc 642  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  45239099 taattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc 45239198  T
Q  643 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta----tctcaaggtttaca-ctaatacaatg 737  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||    |||||||||||||| || ||  |  |    
T  45239199 caa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatgaatgg 45239297  T
Q  738 tccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctcc 837  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  45239298 tctatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaactaaatcaggcccataaaaatacgt---tttatttttattcttctgcgtgaaatcgtgctc- 45239393  T
Q  838 gactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaattt 936  Q
                        |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239394 --------------------cgattttttacgaatgaaagtgccaattctgctccgaaaaatcgtgctccgattttgacagcttcagcaaacttcaattt 45239473  T
Q  937 ctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||    
T  45239474 ctccaattttgagtcactttcacaacaa 45239501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 28196891 - 28196431
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28196891 tttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 28196795  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| |    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196794 ggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 28196695  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28196694 cccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaa 28196595  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattctt 818  Q
     |||||| || |||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||   |    
T  28196594 tgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttatgact 28196500  T
Q  819 ctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattct 887  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  28196499 ctgcgcaaaatcgtactccgattttgccagatcatgctccgattttttactaatgaaagtgtcaattct 28196431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 40032052 - 40032393
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga----tatc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||    
T  40032052 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatc 40032151  T
Q  515 aatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    ||||||||| ||||| | |  || |||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40032152 aatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 40032251  T
Q  615 tcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 714  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40032252 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 40032351  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40032352 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 40032393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 19007896 - 19007548
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19007896 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 19007798  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007797 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 19007698  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19007697 cccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 19007598  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataa 768  Q
    |||||||  | |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19007597 ggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccctcataa 19007548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 42923508 - 42923861
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923508 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactata-tgacgagtaactttacaaaagagatatcaatg 42923606  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923607 gattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 42923706  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  42923707 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcctcctctatctctc 42923806  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||||  | || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42923807 aaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 42923861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 11739558 - 11739900
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11739558 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatg 11739657  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||  ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11739658 gattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 11739757  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11739758 ccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccagccccctctatctcaa 11739857  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11739858 ggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 11739900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 17848696 - 17848287
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17848696 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 17848598  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17848597 g-ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaa 17848502  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttg-tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17848501 ccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagccccctctatctca 17848402  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattct 817  Q
    ||| ||  ||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |       
T  17848401 aggatt--actgatacaaagcctatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttctgac 17848309  T
Q  818 tctgcgcgaaatcgtgctccga 839  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  17848308 tctgcgcaaaatcgtgctccga 17848287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 6258816 - 6259150
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258816 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 6258914  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6258915 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6259012  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  6259013 ccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcctcctctatctcaa 6259112  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6259113 agtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaag 6259150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 6264147 - 6264479
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264147 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 6264246  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6264247 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 6264346  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6264347 ccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----tttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaa 6264442  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
     |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  6264443 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 6264479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 22287335 - 22287671
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22287335 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacg 22287433  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  22287434 ggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaa 22287533  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22287534 ccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctcaa 22287633  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22287634 agtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaag 22287671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 748
Target Start/End: Original strand, 34979576 - 34979906
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag-agagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  34979576 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaat 34979675  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    || ||| ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34979676 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatca 34979775  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34979776 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcagccccctctatctca 34979875  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttat 748  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34979876 aggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 19502010 - 19502345
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  19502010 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 19502108  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19502109 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 19502208  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  19502209 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctcca 19502308  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
     |||| | || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  19502309 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 19502345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14837524 - 14837188
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14837524 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 14837425  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14837424 agttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttccc------aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14837331  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14837330 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagctccctctatctcaa 14837231  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14837230 ggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaagaatcc 14837188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 19504345 - 19504680
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  19504345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 19504443  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504444 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 19504542  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||  |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19504543 ccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 19504642  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19504643 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 19504680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27105053 - 27104719
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  27105053 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaatgttacaaa-gagaaatcaatg 27104956  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27104955 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27104856  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27104855 cccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaa 27104757  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27104756 agttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 27104719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 42453036 - 42452688
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42453036 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 42452939  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42452938 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 42452839  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||  ||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  42452838 cccacaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 42452741  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
     |||| | || |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  42452740 agtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagtataactcataaatt 42452688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 42064771 - 42064435
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||    
T  42064771 tttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaat 42064674  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42064673 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 42064574  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  42064573 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcc 42064474  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42064473 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 42064435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 45279983 - 45280320
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45279983 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 45280081  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280082 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaatcaa 45280181  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-ctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280182 ccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 45280281  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| | || |||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  45280282 aagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaag 45280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 21520692 - 21521030
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21520692 tttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 21520790  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21520791 ggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa 21520890  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||    
T  21520891 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccatctatctctc 21520990  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||||  || |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21520991 aaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaag 21521030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 23452236 - 23452591
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  23452236 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 23452334  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23452335 ggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaa 23452434  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc-- 716  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  23452435 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtctctc 23452534  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23452535 tcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 23452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 13910044 - 13910379
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  13910044 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 13910141  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13910142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa 13910241  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13910242 cccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 13910341  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13910342 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 13910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 44289066 - 44289408
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  44289066 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacg 44289165  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44289166 ggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 44289265  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  44289266 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttagtcccctctatatcaa 44289365  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||| |  | ||||||   | |||||||||||||||| ||||    
T  44289366 ggtttgctatgatacaaaacctatatttatagtaaaagaatcc 44289408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3022428 - 3022086
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataa---------tgatgagtaactttacaaaagag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||         ||||||||||||||| ||| |||    
T  3022428 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactttataaa-gag 3022330  T
Q  510 atatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 609  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3022329 atattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaag 3022230  T
Q  610 gtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct 709  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  3022229 gtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagcctcct 3022130  T
Q  710 ctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaa 753  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||    
T  3022129 atatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 798
Target Start/End: Original strand, 11578106 - 11578481
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11578106 tttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 11578205  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    | |||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11578206 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatca 11578305  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| ||| |||    ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11578306 accc-caaccct---agtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccactctatctca 11578400  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagc-atccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    || ||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11578401 agatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaagcaatccctcaaaaattggaa-caaatcaggcccctaaaaatac 11578481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 498 - 755
Target Start/End: Original strand, 15539552 - 15539809
Alignment:
Q  498 tttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  15539552 tttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaata 15539651  T
Q  598 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15539652 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttg 15539751  T
Q  698 ttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15539752 tttcaaccccctatatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 43623579 - 43623903
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43623579 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 43623677  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43623678 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa 43623777  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||| | ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||      
T  43623778 ccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacccccctctatctccc 43623865  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| || |||||||||||||    
T  43623866 agtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaag 43623903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 24162222 - 24162547
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  24162222 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactata-tgatgagtagcattacaaa-gagaaatcaatg 24162319  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||          |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162320 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 24162409  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24162410 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 24162509  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24162510 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 24162547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22874387 - 22874029
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874387 tttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 22874288  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| || || | |  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22874287 ggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttccaaggtgaatcaa 22874188  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||   |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22874187 ccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctcca 22874100  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggccca 789  Q
    ||||| | || |||||| | |  ||||||||| ||||| | |||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  22874099 ggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagtaaccctcataaaattgaaacaaatctggccca 22874029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 35215585 - 35215881
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  35215585 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 35215682  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
     |||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35215683 agttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 35215782  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35215783 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 35217962 - 35218258
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||| |    
T  35217962 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaacg 35218059  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35218060 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 35218159  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35218160 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 426 - 769
Target Start/End: Original strand, 20146613 - 20146955
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttag 524  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  20146613 acccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttac 20146712  T
Q  525 aagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 624  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  |     
T  20146713 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaatc--cc 20146810  T
Q  625 aaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta--tctcaaggtt 722  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    | |||||  ||| ||||||    
T  20146811 aaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcaaactctctacctcttaaggtt 20146908  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaa 769  Q
    |||  | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20146909 tactttgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatccctcataaa 20146955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 18800312 - 18800637
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18800312 tttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggg-agagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaat 18800410  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800411 gggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 18800510  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    ||||   |||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  18800511 accc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagctt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctatatctcc 18800598  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18800599 atgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 18800637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 765
Target Start/End: Original strand, 17897244 - 17897586
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17897244 tttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggg-agagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaaa 17897342  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17897343 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 17897442  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |  |||||  | ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |    | ||||| ||||    
T  17897443 a-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgttctcagactctctacctca 17897537  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    || |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17897538 agttttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctca 17897586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 661 - 965
Target Start/End: Original strand, 38414281 - 38414569
Alignment:
Q  661 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatc 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||     ||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  38414281 caaaccctagttttgttgttgcctttctaa------gtttcagccccctctatctcaaggtttac-----tacaaagcctatatttatagtaaaagaatc 38414369  T
Q  761 cctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattcttctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccga 860  Q
    | |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||   | ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  38414370 cttcataaattgaaacaaaataaggccca--aaaata---tgatttatttttatgattctgcgc-aaatcgtactccgattttgccagatcatgctccga 38414463  T
Q  861 ttttttatgaatg-aaagtgccaattctgctccataaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcac 959  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38414464 ttttttacgaatggaaagtgccaattctggtccaaaaatcgtactccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcac 38414563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 626
Target Start/End: Original strand, 5375345 - 5375550
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5375345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat-atgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatg 5375443  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375444 ggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaa 5375542  T
Q  619 ccctcaaa 626  Q
    ||||||||    
T  5375543 ccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 579 - 761
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163287
Alignment:
Q  579 aagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 678  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22163106 aagagactcaacc-taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  679 ttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagaatcc 22163287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 798
Target Start/End: Original strand, 37962940 - 37963304
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||    
T  37962940 tttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaatg 37963036  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    | ||| ||||| | |  || || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||    
T  37963037 gattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatcaa 37963136  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    | |   |||| | ||||||||   |||||| |||||| || ||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37963137 cac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37963224  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcat-aaattggaaccaaatcaggcccataaaaatac 798  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37963225 ggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccatcataaaattggaa-caaatctggcccataaaaatac 37963304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 430 - 666
Target Start/End: Original strand, 28459200 - 28459435
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa 529  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28459200 agttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaa 28459298  T
Q  530 gatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacct 629  Q
     | |  |||| ||||||| ||||  ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |     
T  28459299 taagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctcaaatcc 28459398  T
Q  630 tagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaacc 666  Q
    |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  28459399 tagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 576 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020162
Alignment:
Q  576 accaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttg 675  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  676 ttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 603 - 756
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407744
Alignment:
Q  603 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttta 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  703 gccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    || |||| |||||||  |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22407691 gcaccctatatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 22407744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 40699632 - 40699429
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40699632 tttgtttacctagttcggtctaatactgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 40699533  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    || ||| || || | | | ||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40699532 ggattacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 40699433  T
Q  617 aacc 620  Q
    ||||    
T  40699432 aacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 36558863 - 36559047
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  36558863 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 36558960  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36558961 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 36561140 - 36561324
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  36561140 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 36561237  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36561238 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 419 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35107552 - 35107200
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| || || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  35107552 tttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaa 35107453  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgc--ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaat 615  Q
    || ||| ||||| | |  | |     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  35107452 gg-ttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaat 35107354  T
Q  616 caaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt-gttttagccccctctatc 714  Q
    ||| || ||| ||    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||  | ||||| |    
T  35107353 caatcc-caaccc----tgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaactcttggttttag-actctctacc 35107262  T
Q  715 tcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  35107261 tcaaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcccttaaaatttggaac 35107200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 45332180 - 45332364
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45332180 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactat-atgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatg 45332277  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||| || || | |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45332278 ggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Original strand, 22407453 - 22407592
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22407453 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 22407551  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtc 559  Q
    ||||| ||||| | |  |||| |||||||||||| ||||||    
T  22407552 ggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtc 22407592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Original strand, 23452084 - 23452174
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452084 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 23452174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 444 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35028807 - 35028479
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcc- 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||   | || |   |     
T  35028807 tgacctagtaagggggagagagcagctctccgttccactgcaatgatgagtaattttagaaaagagatattaaaaggttacaagaattagtattcaaaca 35028708  T
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccc 642  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||| |||| ||||||||||  |    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttac 35028610  T
Q  643 caagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttaca-ctaatacaatgtcca 741  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| | |||| ||||||   |||||||||||  ||||    | |||||  |||||||||||| || |||||||||| |    
T  35028609 caagag-caaactc--tacaaacccaaattttattgttg-gattctaaaccctgtttttccggctctctaattcaaggtttacatctgatacaatgtcta 35028514  T
Q  742 tatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  35028513 tatttatagtaaaagtatccctaaaaaattggaac 35028479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 471 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 20589896 - 20589763
Alignment:
Q  471 ctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctctt 569  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589896 ctccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctctt 20589797  T
Q  570 cccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20589796 cccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 19501842 - 19501930
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19501842 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19501930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 19504174 - 19504265
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19504174 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19504265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 621 - 716
Target Start/End: Original strand, 5377629 - 5377724
Alignment:
Q  621 ctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5377629 ctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 5377724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42453892 - 42453798
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42453892 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaacaatta 42453798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 45279844 - 45279938
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45279844 ttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 45279938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 36560977 - 36561077
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36560977 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaa 36561075  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  36561076 at 36561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 662 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  662 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 541 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 43139509 - 43139355
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtc 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||     
T  43139509 cctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 43139412  T
Q  641 cccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  43139411 gccaagag-caaactc--tacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgtttt 43139355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Original strand, 13909907 - 13909982
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13909907 tcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13909982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 510
Target Start/End: Original strand, 22163021 - 22163111
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagaga 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22163021 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactat-atgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27105209 - 27105115
Alignment:
Q  263 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27105209 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 27105115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Original strand, 22707750 - 22707861
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag--cagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22707750 tttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 22707848  T
Q  517 tgggttagaagaa 529  Q
    ||||||| |||||    
T  22707849 tgggttacaagaa 22707861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 491 - 666
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136368
Alignment:
Q  491 gagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccg-cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaa 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |  |||   ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  590 tcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaacc 666  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 36558721 - 36558817
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36558721 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 36558817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 536 - 633
Target Start/End: Original strand, 38414196 - 38414291
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagt 633  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38414196 tcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 21520530 - 21520629
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21520530 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaatta 21520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 28459038 - 28459131
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28459038 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaacacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28459131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 550
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 521  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 7463048  T
Q  522 tagaagaagatgcatcccgcctaattcta 550  Q
    || ||||| | |  |||||||||||||||    
T  7463049 tacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 43623423 - 43623518
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43623423 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataactaacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaatta 43623518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 33604143 - 33603994
Alignment:
Q  454 tgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa-gatgcatcccgcctaattctacc 552  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |  | ||   ||||||||| ||    
T  33604143 tgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaaaggttagaagaattagtcttcaaacctaattcttcc 33604045  T
Q  553 caaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33604044 taaagtctcaatcacttcccatgaccaaaagactcaattataatagtgttt 33603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19008051 - 19007956
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19008051 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 19007956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 543 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345661
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaac 619  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17849528 - 17849434
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17849528 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 17849434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 471 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 15694109 - 15693958
Alignment:
Q  471 ctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaa-tctct 568  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||   | | ||   ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15694109 ctccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctct 15694010  T
Q  569 tcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaac 619  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15694009 tcctgtgaccaagagactttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 22162869 - 22162959
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22162869 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaattttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaattgtatggaaca 22162959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 22707593 - 22707690
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22707593 attgttgcgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22707690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 24162063 - 24162160
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24162063 tgttgtgaatacgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaa-aaaagtgtatgaaacaattaaat 24162160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 23871072 - 23870963
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  23871072 tttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactat-atgatgagtaaccttactaaagagatattaatg 23870974  T
Q  519 ggttagaagaa 529  Q
    ||||| |||||    
T  23870973 ggttacaagaa 23870963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 559 - 617
Target Start/End: Original strand, 27583477 - 27583535
Alignment:
Q  559 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27583477 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 45332019 - 45332116
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  45332019 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtttgtaacaattaaat 45332116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 22287180 - 22287275
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22287180 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-catagtgtatggaacaatta 22287275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 895 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 28196402 - 28196334
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  28196402 aaatcgtactccgattttgacagcttcagcaaacttcaatttctccatttttgagtcactttcacaaca 28196334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 35217827 - 35217906
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  35217827 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 35217906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 617
Target Start/End: Original strand, 13828340 - 13828542
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtcca-aattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| | ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||   | |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  13828340 tttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaa 13828439  T
Q  518 gggttagaagaagatg-catcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaa--gagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 614  Q
    ||| || ||||| | | | ||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     ||| ||||||||| ||||||||    
T  13828440 gggctacaagaataagtcttcaaacataattctacccaaagtctgaatctcttcccgtgaccaaaagagactcctaattaacagtgtttcctaaggtgaa 13828539  T
Q  615 tca 617  Q
    |||    
T  13828540 tca 13828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 7503052 - 7502975
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctcaa-tctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503052 taattctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 685 - 761
Target Start/End: Original strand, 12342673 - 12342750
Alignment:
Q  685 ttctaaaccctt-gttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  12342673 ttctaaaccctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagtatcc 12342750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14837679 - 14837584
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14837679 tgttgtgaattcgatgagaaatcacatcaataacaatacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 14837584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 34979456 - 34979528
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34979456 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 34979528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42064884 - 42064816
Alignment:
Q  287 aataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42064884 aataacaacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 42064816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923446
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42923373 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 42923446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3022583 - 3022488
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaa-atcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3022583 ttgttgtgaattcggtgagagatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3022488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 5375225 - 5375284
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5375225 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 5375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Original strand, 35215450 - 35215506
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  35215450 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 35215506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 895 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 17848879 - 17848812
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaac 962  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17848879 aaatcgggcttcgattttgacagtttcagcaaacttcaatttctccaattttgagtcactttcacaac 17848812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921754
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 2741002 - 2740941
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2741002 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38020473 - 38020396
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38020473 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 38020396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 895 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 17848222 - 17848154
Alignment:
Q  895 aaatcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaacaa 964  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17848222 aaatcgggctccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttctccaattttgagtcactttcccaacaa 17848154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28197046 - 28196951
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28197046 ttgttgtgagttcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 28196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 6263989 - 6264087
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6263989 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 6264087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 30720732 - 30720811
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30720732 cctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 34575230 - 34575308
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575230 cctaattctacccaaagtcccgaatct-ttcccgagaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Original strand, 45238841 - 45238924
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  45238841 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtg 45238924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 2736266 - 2736205
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2736266 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390189
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctcc 8390189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 604
Target Start/End: Original strand, 10942634 - 10942696
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10942634 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10942696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 604
Target Start/End: Original strand, 10948503 - 10948565
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 604  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10948503 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10948565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 11739418 - 11739515
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  11739418 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaag-aaataaaaacaaagtgtatgaaacaatta 11739515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699046
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 14699046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 17462497 - 17462436
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17462497 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17848816 - 17848754
Alignment:
Q  291 acaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17848816 acaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaatta 17848754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 20054886 - 20054947
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054886 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 27248021 - 27248102
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtc-tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatc--ataatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  27248021 cctaattctacccaaagtcctggatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctataataatgtttctccaaagtgaatcaa 27248102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 39287324 - 39287262
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39287324 tgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 39687044 - 39686983
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39687044 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 6258668 - 6258756
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6258668 gaattcgatgagaaaacataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtctggaacaatta 6258756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 7462789 - 7462884
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7462789 tgttgcgaattcgttgagaaaaccacatcgataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 7462884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22874519 - 22874431
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22874519 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 849 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 17848298 - 17848235
Alignment:
Q  849 atcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctccat-aaatcgtgctccaattt 911  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  17848298 atcgtgctccgattttttacgaatgaaagtgccaattctgcaacataaaatcgtgctccgattt 17848235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17943692 - 17943540
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaa-gatgcatcccgcc 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||   || |||| |||||  |  | ||   ||    
T  17943692 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaacc 17943597  T
Q  543 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17943596 taattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 27517760 - 27517818
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27517760 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 30479055 - 30478997
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30479055 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 30478997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569386
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 13569386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 336
Target Start/End: Original strand, 20146456 - 20146535
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  20146456 aattgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagtaaag--taatcaagcaaccaatatcaa 20146535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522278
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctcc 20522278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259216
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcc 28259216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 38191035 - 38190997
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191035 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 39482935 - 39482989
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39482935 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctcc 39482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8173587 - 8173539
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagc 466  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8173587 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagc 8173539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10707345 - 10707301
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10707345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 10707301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 684 - 776
Target Start/End: Original strand, 13828603 - 13828695
Alignment:
Q  684 tttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaac 776  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||   || ||||||  || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  13828603 tttctaaatccttgttttcagcccctctctctcaaggtttcatctcatacaacttctatatttatagtaaaagaatccctaaaaaattggaac 13828695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30479177 - 30479105
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  30479177 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactataatgat 30479105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1345634 - 1345587
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  1345634 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 1345587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2838123 - 2838076
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  2838123 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151634
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagag 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagag 11151634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20592484 - 20592395
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20592484 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaaatacgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 20592395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 37170873 - 37170931
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37170873 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39680227 - 39680133
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatg-atgagtaactttacaaaagagata 512  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  39680227 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttac-aaagagata 39680133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39687165 - 39687071
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatg-atgagtaactttacaaaagagata 512  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  39687165 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttctttac-aaagagata 39687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 543 - 597
Target Start/End: Original strand, 41303155 - 41303210
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataata 597  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  41303155 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagacttaatcctaata 41303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040118
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 8040118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10445537 - 10445483
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  10445537 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 10445483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 11577957 - 11578045
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11577957 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacattaataaaaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaat-aaagtatatggaa 11578045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Original strand, 12781246 - 12781292
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgat 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12781246 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgat 12781292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 603
Target Start/End: Original strand, 20050166 - 20050204
Alignment:
Q  565 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20050166 ctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 33118140 - 33118194
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33118140 ttgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctcc 33118194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33528714 - 33528660
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  33528714 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctcc 33528660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682373
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcc 34682373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 659 - 701
Target Start/End: Original strand, 41304627 - 41304668
Alignment:
Q  659 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 701  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41304627 tacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgtttt 41304668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 460 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 17921912 - 17921871
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttta 501  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17921912 agagagcagccctccgttccactataatgatgactaacttta 17921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 708 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20589629 - 20589560
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagc-atccctcataaattggaac 776  Q
    |||| |||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20589629 ctctctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagcaatccctcaaaaattggaac 20589560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 29868034 - 29867993
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  29868034 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 29867993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 567 - 600
Target Start/End: Original strand, 33674551 - 33674584
Alignment:
Q  567 cttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674551 cttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33674584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 708 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699221
Alignment:
Q  708 ctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctca 765  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctca 40699221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 45158369 - 45158308
Alignment:
Q  543 taattctacccaaagtc-tcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  45158369 taattctactcaaagtcctgaatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaacagtgttt 45158308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 79474 - 79123
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  79474 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 79376  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79375 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 79276  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79275 cccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 79176  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    | ||||| || || ||| ||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  79175 gttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaggtataactcataaatt 79123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 79631 - 79536
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79631 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 79536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 80148 - 79711
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  80148 tttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatg 80050  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| | ||| | |  ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  80049 agttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 79951  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||||||||| || | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79950 ccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 79851  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcaggcccataaaaatactttaatttatttttattct 817  Q
    ||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||| |       
T  79850 aggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcaggccc--aaaaatacgt---tttatttttct--g 79758  T
Q  818 tctgcgcgaaatcgtgctccgactttgccagatcgcgctccgatttt 864  Q
     || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  79757 actacgctaaaccgtgctccgattttgccagatcgtgctccgatttt 79711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 80311 - 80210
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  80311 gacaattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaat 80212  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  80211 ta 80210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 897 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 79726 - 79661
Alignment:
Q  897 atcgtgctccaattttgacagcttcagcaaacttcaatttctgcaattttgaatcactttcacaaca 963  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  79726 atcgtgctccgattttgacagcttcagcaaac-tcaatttctccaattttgagtcactttcacaaca 79661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4284 - 3950
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4284 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 4187  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4186 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaa 4087  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4086 ccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 3988  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3987 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 3950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4362
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4415 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat 4362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 6)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 183640 - 183974
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  183640 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatg 183738  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  183739 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 183837  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  183838 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaa 183936  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  183937 agtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 183974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 52302 - 51947
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagag--cagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52302 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaa 52204  T
Q  517 tgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatc 616  Q
    || |||| ||||| | |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52203 tgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 52104  T
Q  617 aaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52103 aatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 52004  T
Q  717 --aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
      || |||||   | |||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  52003 tcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 51947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50461 - 50363
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50461 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 50363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52456 - 52362
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52456 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 52362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 183482 - 183578
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  183482 tgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 183578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 50303 - 50234
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggag--agagcagccctccgttttactataa 486  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  50303 tttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactataa 50234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Original strand, 41482 - 41818
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41482 tttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 41580  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41581 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 41680  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41681 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcta 41780  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41781 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 41818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 41324 - 41420
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41324 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 41420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15308 - 14972
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15308 tttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 15210  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15209 ggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 15110  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  15109 ccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctctatctcaa 15010  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15009 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 14972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 14381 - 14677
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14381 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 14479  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14480 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14579  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  14580 ccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatctc 14677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 14230 - 14323
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14230 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Original strand, 69291 - 69586
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  69291 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 69388  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  69389 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 69488  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69489 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 69586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 605 - 716
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73318
Alignment:
Q  605 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 704  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  705 cccctctatctc 716  Q
    ||||||||||||    
T  73307 cccctctatctc 73318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 347
Target Start/End: Original strand, 69124 - 69220
Alignment:
Q  251 catgacaattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  69124 catgataactgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaaatgtatggaa 69220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 637
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73203
Alignment:
Q  594 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgttt 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 11472 - 11823
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11472 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 11570  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  11571 ggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaa 11670  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  11671 ccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagccccctctatctcca 11770  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    ||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  11771 ggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatt 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11410
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaac-caaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  11315 gttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaatta 11410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6488 - 6152
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  6488 tttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatt-tgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 6391  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6390 ggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 6291  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6290 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 6191  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    | |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6190 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 6152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6647 - 6558
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6647 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 6558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 439 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 85500 - 85156
Alignment:
Q  439 caaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcc 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |  |||    
T  85500 caaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 85401  T
Q  539 cgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttg 638  Q
    || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85400 cgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttg 85301  T
Q  639 tccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgt 738  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   || | |||||||||||||||||  | |||||| |     
T  85300 ttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttct-cctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagc 85202  T
Q  739 ccatatttatagtaaaagcatccctcataaattggaaccaaatcag 784  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  85201 ctatatttatagtaaaagaatccctcataaattggaacaaaatcag 85156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 85671 - 85578
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85671 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 85578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 841 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 85128 - 85050
Alignment:
Q  841 tttgccagatcgcgctccgattttttatgaatgaaagtgccaattctgctcc-ataaatcgtg-ctccaattttgacag 917  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  85128 tttgctagatcgtgttccgattttttacgaatgaaagtgtcaattctgctccaaaaaatcgtgcctccgattttgacag 85050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 330 - 34
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  330 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 233  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc-aatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  232 ggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 133  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  132 acccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 376
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  473 tgttgtgaattcgttgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 174; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3168 - 2833
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  3168 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactata-tgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 3071  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3070 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 2971  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaa 718  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2970 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 2871  T
Q  719 ggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
     |||| | || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  2870 agtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaag 2833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3319 - 3243
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3319 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatg 3243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 771
Target Start/End: Original strand, 15819 - 16168
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15819 tttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15918  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15919 gggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatca 16018  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    | |||| |||| ||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  16019 a-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctctatctta 16114  T
Q  718 aggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaagcatccctcataaatt 771  Q
    |||||||| || ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16115 aggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatt 16168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 162; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 419 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 29459 - 29164
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||    
T  29459 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 29362  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
     |||| ||||| | |  ||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  29361 agttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaa 29262  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctc 716  Q
    |||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29261 cccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 29164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29616 - 29521
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29616 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 29521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 148; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 419 - 747
Target Start/End: Original strand, 1640 - 1958
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1640 tttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 1739  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1740 gggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatca 1839  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctca 717  Q
    |||    |||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  1840 acc--acaaccctagtgtttgt---------tgaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccacctctatctct 1927  T
Q  718 aggtttaca-ctaatacaatgtccatattta 747  Q
    ||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  1928 aggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 1489 - 1578
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1489 caattgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 144; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 419 - 755
Target Start/End: Original strand, 16648 - 16981
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 16747  T
Q  518 gggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 617  Q
    |||||| ||||| | |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16748 gggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatca 16847  T
Q  618 accctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctc 716  Q
    | |  | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16848 atc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctttc-aaacccttgttttcagcctcctctatctc 16942  T
Q  717 aaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaa 755  Q
    ||||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||    
T  16943 aaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaaa 16981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 140; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 2293 - 2036
Alignment:
Q  456 ggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaa 555  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  2293 ggggagagagtagccctccgattcactata-tgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaa 2195  T
Q  556 agtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaagagacaaact 655  Q
    |||| ||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||||    
T  2194 agtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaact 2096  T
Q  656 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatct 715  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2095 ctgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatct 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 134; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 536 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 35812 - 35588
Alignment:
Q  536 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35812 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaaccctagtgt 35713  T
Q  636 ttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaa 735  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  |||||  ||| ||||||    
T  35712 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtactgatacaa 35614  T
Q  736 tgtccatatttatagtaaaagcatcc 761  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  35613 tgtctatatttatagtaaaagaatcc 35588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36037 - 35944
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36037 ttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 35944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 35883 - 35816
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataa 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  35883 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactataa 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 419 - 639
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1670
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  1452 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 1549  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa 618  Q
    ||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1550 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 1649  T
Q  619 ccctcaaaccttagtgtttgt 639  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  1650 cccacaaaccctagtgtttgt 1670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 1310 - 1389
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1310 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgtaacaattaaat 1389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 88; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 426 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 5095 - 4773
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaatgggtta 523  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||  ||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5095 acccaattcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggtta 4996  T
Q  524 gaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 623  Q
     || || | |  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  4995 caaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaa-actc 4897  T
Q  624 aaaccttagtgtttgtccccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt-agccccctctatctcaaggtt 722  Q
     |||  ||||||||||  |  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |  | ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  4896 -aactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctag-tttgttgcttac-ttctaaatcctttttttcagacccctctatctcaaggtt 4801  T
Q  723 tacactaatacaatgtccatatttatag 750  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  4800 tactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 83; Significance: 1e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 22404 - 22221
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  22404 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 22307  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
     |||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22306 agttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 24679 - 24496
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  24679 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatg 24582  T
Q  519 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagact-caatcataatagtgtttc 604  Q
     |||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24581 agttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24840 - 24742
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24840 ttgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 24742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22568 - 22467
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||    
T  22568 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgcatggaataataaa 22469  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  22468 at 22467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8458
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 8458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 78; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 588 - 756
Target Start/End: Original strand, 993 - 1166
Alignment:
Q  588 aatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtccccaa-----gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 682  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||| || ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  683 ctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 756  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 1288 - 1388
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1288 caatttttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 1386  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  1387 at 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 452
Target Start/End: Original strand, 1450 - 1483
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 58; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 12711 - 12799
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12711 caattgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 12799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 4535 - 4614
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4535 aaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaa-caaagtcaaagcgtatggaacaattaaat 4614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 474
Target Start/End: Original strand, 4678 - 4733
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4678 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 603
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  444 tgacctagtatgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttagaaga--agatgcatcccgc 541  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  | |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||| | ||   |    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagat-cttcaaac 57550  T
Q  542 ctaattctacccaaagtctc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  57551 ctaattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 603  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 472
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5739
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccct 472  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 5739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2550
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  2496 ttgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctcc 2550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 133373 - 133319
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  133373 ttgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 133319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16660 - 16615
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16660 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaaacttgatg 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16386 - 16328
Alignment:
Q  541 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45 - 1
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 474
Target Start/End: Original strand, 10736 - 10787
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  10736 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcc 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 600
Target Start/End: Original strand, 17131 - 17165
Alignment:
Q  566 tcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17131 tcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 44000
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctcc 474  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctcc 44000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University