View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15828_low_15 (Length: 309)

Name: NF15828_low_15
Description: NF15828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15828_low_15
NF15828_low_15
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (28-295)||(3409551-3409818)
chr6 (74-295)||(29518857-29519078)
chr6 (28-295)||(2378018-2378284)
chr6 (129-295)||(29518495-29518661)
chr6 (129-295)||(32741171-32741337)
chr6 (28-297)||(10073989-10074256)
chr6 (105-295)||(2578443-2578634)
chr6 (129-285)||(3409251-3409407)
chr6 (129-296)||(35210196-35210363)
chr6 (104-287)||(10074371-10074553)
chr6 (129-295)||(3058218-3058384)
chr6 (104-295)||(16454872-16455065)
chr6 (129-295)||(14748342-14748504)
chr6 (139-295)||(2377756-2377912)
chr6 (137-295)||(2579872-2580030)
chr6 (128-295)||(3415449-3415618)
chr6 (130-295)||(1846741-1846906)
chr6 (129-285)||(26544041-26544197)
chr6 (139-295)||(16454577-16454733)
chr6 (108-287)||(2579500-2579678)
chr6 (139-286)||(16107680-16107827)
chr6 (129-295)||(1127352-1127518)
chr6 (143-295)||(2843560-2843713)
chr6 (112-295)||(2578835-2579016)
chr6 (104-293)||(10073618-10073804)
chr6 (105-295)||(2579109-2579297)
chr6 (74-294)||(16107998-16108208)
chr6 (139-295)||(5832027-5832182)
chr6 (140-292)||(6999799-6999951)
chr6 (137-295)||(593707-593867)
chr6 (140-280)||(1950200-1950340)
chr6 (142-245)||(32460630-32460733)
chr6 (137-291)||(10911565-10911720)
chr6 (143-262)||(9062383-9062501)
chr6 (104-256)||(8481893-8482045)
chr6 (132-289)||(5958613-5958766)
chr6 (104-269)||(6071098-6071264)
chr6 (137-297)||(12071689-12071849)
chr6 (137-296)||(12092481-12092640)
chr6 (137-297)||(12085032-12085191)
chr6 (104-210)||(35210456-35210551)
chr6 (137-292)||(31714671-31714823)
chr6 (141-295)||(17135069-17135223)
chr6 (105-253)||(2975521-2975668)
chr6 (74-196)||(33605913-33606034)
chr6 (205-249)||(22605301-22605345)
chr6 (241-288)||(3409405-3409452)
chr6 (205-256)||(11637760-11637811)
chr6 (174-220)||(14789279-14789325)
chr6 (144-278)||(30618634-30618766)
chr6 (205-249)||(21130103-21130147)
chr6 (229-287)||(10902438-10902496)
chr6 (213-255)||(11638053-11638095)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (45-295)||(37533011-37533259)
chr7 (50-266)||(7553937-7554154)
chr7 (137-295)||(1085616-1085774)
chr7 (28-292)||(14681401-14681663)
chr7 (28-256)||(22566702-22566930)
chr7 (105-295)||(30244236-30244428)
chr7 (137-296)||(7517580-7517739)
chr7 (137-295)||(23377-23535)
chr7 (129-295)||(37533364-37533530)
chr7 (131-292)||(29157559-29157720)
chr7 (105-295)||(30245043-30245231)
chr7 (144-295)||(11845198-11845349)
chr7 (139-295)||(6054562-6054718)
chr7 (137-295)||(40094774-40094932)
chr7 (139-295)||(45433243-45433399)
chr7 (137-295)||(22567039-22567196)
chr7 (137-287)||(36939741-36939891)
chr7 (50-295)||(45434548-45434794)
chr7 (139-284)||(45754718-45754862)
chr7 (145-285)||(19122740-19122879)
chr7 (137-295)||(24177435-24177593)
chr7 (143-293)||(34218036-34218186)
chr7 (139-295)||(47129097-47129253)
chr7 (137-295)||(118299-118459)
chr7 (137-295)||(8128441-8128599)
chr7 (142-295)||(30032572-30032725)
chr7 (137-294)||(36622960-36623117)
chr7 (140-293)||(9901648-9901799)
chr7 (137-257)||(16569196-16569316)
chr7 (137-257)||(16596346-16596466)
chr7 (137-291)||(40230295-40230449)
chr7 (110-263)||(1085280-1085436)
chr7 (140-272)||(24838724-24838857)
chr7 (140-292)||(20599317-20599471)
chr7 (137-286)||(36534795-36534942)
chr7 (137-295)||(41854635-41854792)
chr7 (158-293)||(37167808-37167937)
chr7 (179-295)||(30253534-30253646)
chr7 (105-207)||(30244667-30244771)
chr7 (108-210)||(30255308-30255412)
chr7 (140-289)||(41910592-41910749)
chr7 (183-293)||(28300255-28300366)
chr7 (137-258)||(43241495-43241616)
chr7 (108-210)||(30245463-30245567)
chr7 (218-295)||(47129450-47129527)
chr7 (137-225)||(28301613-28301701)
chr7 (220-294)||(28300569-28300644)
chr7 (137-205)||(36109007-36109075)
chr7 (225-293)||(37532753-37532821)
chr7 (142-242)||(44361517-44361616)
chr7 (59-134)||(37532822-37532896)
chr7 (88-255)||(37345868-37346036)
chr7 (105-187)||(40094502-40094583)
chr7 (204-255)||(21416181-21416232)
chr7 (206-254)||(23569043-23569091)
chr7 (238-294)||(30244453-30244509)
chr7 (238-301)||(30245256-30245319)
chr7 (137-255)||(4124128-4124246)
chr7 (238-295)||(30253671-30253728)
chr7 (131-174)||(14681281-14681324)
chr7 (205-284)||(40094424-40094503)
chr7 (220-282)||(45755010-45755072)
chr7 (204-249)||(21619091-21619136)
chr7 (192-295)||(37393114-37393216)
chr7 (139-189)||(36967335-36967385)
chr7 (179-295)||(15902342-15902457)
chr7 (205-249)||(27391815-27391859)
chr7 (232-286)||(4719305-4719359)
chr7 (247-296)||(7517767-7517816)
chr7 (247-296)||(7518033-7518082)
chr7 (204-244)||(27598052-27598092)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (30-297)||(3669953-3670220)
chr8 (28-287)||(1013879-1014138)
chr8 (128-295)||(3669678-3669845)
chr8 (139-293)||(3038292-3038446)
chr8 (88-295)||(9309304-9309512)
chr8 (127-288)||(30441071-30441236)
chr8 (115-295)||(34835185-34835367)
chr8 (104-295)||(34835439-34835633)
chr8 (104-295)||(34835705-34835899)
chr8 (104-293)||(40518550-40518738)
chr8 (139-287)||(34834878-34835026)
chr8 (71-288)||(45121663-45121881)
chr8 (105-295)||(8918764-8918956)
chr8 (137-285)||(45122067-45122215)
chr8 (129-293)||(20870575-20870741)
chr8 (129-287)||(1014253-1014411)
chr8 (88-291)||(30359558-30359763)
chr8 (110-295)||(45122604-45122782)
chr8 (105-297)||(6731872-6732055)
chr8 (115-291)||(9482608-9482784)
chr8 (137-295)||(6876862-6877021)
chr8 (137-296)||(9608745-9608904)
chr8 (139-297)||(25561813-25561972)
chr8 (139-294)||(33113368-33113523)
chr8 (139-295)||(40518071-40518229)
chr8 (105-295)||(45122972-45123164)
chr8 (139-295)||(37544490-37544646)
chr8 (140-295)||(147454-147609)
chr8 (137-295)||(45121910-45122068)
chr8 (162-291)||(9483191-9483320)
chr8 (139-296)||(30359273-30359430)
chr8 (139-295)||(1513915-1514071)
chr8 (144-292)||(70277-70425)
chr8 (88-291)||(18371665-18371863)
chr8 (131-289)||(40579512-40579670)
chr8 (137-295)||(5915872-5916025)
chr8 (137-293)||(5420651-5420807)
chr8 (137-292)||(41972158-41972316)
chr8 (88-209)||(18372342-18372463)
chr8 (104-285)||(147794-147968)
chr8 (108-295)||(6651476-6651652)
chr8 (147-291)||(18371998-18372142)
chr8 (137-295)||(9308977-9309139)
chr8 (88-209)||(18372785-18372905)
chr8 (140-285)||(32640542-32640682)
chr8 (88-241)||(18372988-18373139)
chr8 (141-294)||(18380020-18380171)
chr8 (131-295)||(32305478-32305635)
chr8 (137-285)||(4154678-4154824)
chr8 (137-288)||(9507777-9507933)
chr8 (160-274)||(9609108-9609222)
chr8 (92-181)||(18372485-18372574)
chr8 (129-215)||(41416251-41416335)
chr8 (140-250)||(43274824-43274934)
chr8 (139-255)||(8794113-8794229)
chr8 (212-295)||(40579269-40579352)
chr8 (104-295)||(4154281-4154472)
chr8 (137-286)||(12283873-12284021)
chr8 (219-295)||(8919144-8919220)
chr8 (139-245)||(18372656-18372758)
chr8 (137-295)||(9620678-9620834)
chr8 (215-295)||(41129066-41129146)
chr8 (140-227)||(3037776-3037865)
chr8 (141-286)||(43398077-43398225)
chr8 (147-210)||(25561729-25561792)
chr8 (142-242)||(20130454-20130553)
chr8 (137-269)||(5274775-5274907)
chr8 (214-278)||(20995433-20995497)
chr8 (231-295)||(43274635-43274699)
chr8 (218-275)||(16524446-16524503)
chr8 (173-229)||(18373236-18373292)
chr8 (140-236)||(40991756-40991852)
chr8 (248-295)||(3037969-3038016)
chr8 (88-163)||(43274699-43274776)
chr8 (191-278)||(40417733-40417820)
chr8 (237-291)||(18372288-18372342)
chr8 (208-245)||(12156708-12156745)
chr8 (137-194)||(20995502-20995559)
chr8 (137-214)||(33831978-33832055)
chr8 (195-236)||(11442911-11442952)
chr8 (137-169)||(18645713-18645745)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (34-295)||(44290458-44290719)
chr1 (28-292)||(48588491-48588755)
chr1 (127-295)||(44290824-44290993)
chr1 (74-294)||(41157311-41157532)
chr1 (30-295)||(26661522-26661789)
chr1 (99-286)||(37556071-37556260)
chr1 (129-295)||(41759475-41759641)
chr1 (129-296)||(3537598-3537765)
chr1 (137-295)||(41142372-41142531)
chr1 (105-296)||(34364891-34365084)
chr1 (33-216)||(3537226-3537410)
chr1 (137-295)||(41156991-41157149)
chr1 (129-291)||(3550712-3550871)
chr1 (110-295)||(11977251-11977438)
chr1 (139-292)||(17294579-17294733)
chr1 (106-295)||(22077495-22077683)
chr1 (137-295)||(29798199-29798357)
chr1 (137-295)||(31767161-31767319)
chr1 (139-295)||(34649440-34649596)
chr1 (137-296)||(34364507-34364666)
chr1 (128-295)||(45493974-45494146)
chr1 (137-295)||(5319965-5320123)
chr1 (145-295)||(14318875-14319025)
chr1 (129-295)||(50052024-50052189)
chr1 (138-287)||(40082408-40082556)
chr1 (131-263)||(32594748-32594880)
chr1 (129-297)||(32168696-32168853)
chr1 (137-293)||(3875333-3875489)
chr1 (141-297)||(9955911-9956069)
chr1 (134-280)||(38804370-38804516)
chr1 (139-272)||(26661921-26662054)
chr1 (137-297)||(37850598-37850758)
chr1 (137-295)||(45084382-45084534)
chr1 (140-286)||(37555733-37555878)
chr1 (137-288)||(24600321-24600472)
chr1 (137-291)||(66476-66630)
chr1 (137-295)||(39066201-39066358)
chr1 (105-284)||(66100-66278)
chr1 (105-295)||(22077110-22077311)
chr1 (104-285)||(30630648-30630828)
chr1 (137-231)||(41184489-41184583)
chr1 (137-289)||(24131994-24132143)
chr1 (128-257)||(44043810-44043944)
chr1 (143-287)||(5575110-5575252)
chr1 (138-289)||(22793279-22793431)
chr1 (28-169)||(50051777-50051918)
chr1 (147-287)||(5528762-5528902)
chr1 (139-285)||(45839629-45839779)
chr1 (137-293)||(22077831-22077986)
chr1 (137-296)||(19283454-19283613)
chr1 (208-295)||(11977015-11977102)
chr1 (137-285)||(44685456-44685605)
chr1 (137-296)||(21378058-21378199)
chr1 (137-295)||(1188588-1188746)
chr1 (207-295)||(50051689-50051776)
chr1 (152-294)||(44091909-44092051)
chr1 (137-297)||(1187361-1187522)
chr1 (119-196)||(50469180-50469256)
chr1 (179-255)||(10351202-10351278)
chr1 (164-284)||(4956218-4956340)
chr1 (88-189)||(47379891-47379990)
chr1 (220-295)||(41184408-41184486)
chr1 (137-184)||(35154150-35154197)
chr1 (137-203)||(4878803-4878869)
chr1 (104-286)||(24448245-24448426)
chr1 (186-231)||(41184152-41184197)
chr1 (208-297)||(47380165-47380254)
chr1 (236-295)||(4266798-4266855)
chr1 (137-297)||(5996870-5997029)
chr1 (192-252)||(35154046-35154106)
chr1 (30-68)||(48588340-48588378)
chr1 (129-202)||(4266875-4266948)
chr1 (178-294)||(9499020-9499136)
chr1 (219-255)||(12466365-12466401)
chr1 (146-205)||(30630912-30630972)
chr1 (210-256)||(9956212-9956258)
chr1 (219-255)||(31973375-31973411)
chr1 (74-122)||(41184198-41184246)
chr1 (137-273)||(50556451-50556587)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (30-295)||(5542625-5542890)
chr2 (105-293)||(37106156-37106344)
chr2 (128-295)||(36178605-36178772)
chr2 (129-295)||(14745667-14745833)
chr2 (129-301)||(41283469-41283641)
chr2 (30-288)||(14745300-14745558)
chr2 (133-295)||(37105920-37106082)
chr2 (127-291)||(5543002-5543166)
chr2 (109-289)||(15880233-15880415)
chr2 (65-244)||(36178320-36178498)
chr2 (139-295)||(6421387-6421543)
chr2 (137-292)||(962598-962753)
chr2 (28-294)||(29676793-29677065)
chr2 (105-292)||(40679632-40679818)
chr2 (137-295)||(42514649-42514807)
chr2 (104-295)||(6422084-6422268)
chr2 (144-295)||(15511495-15511646)
chr2 (137-295)||(35580724-35580881)
chr2 (104-293)||(28531316-28531504)
chr2 (105-290)||(7598577-7598754)
chr2 (155-295)||(36178171-36178311)
chr2 (139-295)||(6712978-6713135)
chr2 (139-288)||(36005887-36006035)
chr2 (137-294)||(38796619-38796778)
chr2 (104-295)||(40733482-40733675)
chr2 (142-293)||(33731653-33731804)
chr2 (104-295)||(40733848-40734040)
chr2 (137-290)||(37632602-37632755)
chr2 (129-285)||(1769884-1770040)
chr2 (141-276)||(28254258-28254391)
chr2 (148-284)||(40163383-40163520)
chr2 (137-296)||(7598228-7598387)
chr2 (150-292)||(23346250-23346391)
chr2 (57-295)||(3673003-3673226)
chr2 (139-281)||(5367457-5367599)
chr2 (117-245)||(31468800-31468926)
chr2 (105-215)||(38796298-38796410)
chr2 (199-295)||(6421793-6421889)
chr2 (137-244)||(16542449-16542556)
chr2 (145-295)||(29676543-29676687)
chr2 (137-285)||(12529038-12529186)
chr2 (107-295)||(30313147-30313335)
chr2 (74-194)||(36785664-36785786)
chr2 (104-254)||(30323430-30323581)
chr2 (140-225)||(31899496-31899581)
chr2 (104-255)||(33561491-33561641)
chr2 (137-288)||(16590888-16591034)
chr2 (104-269)||(29873563-29873729)
chr2 (139-295)||(29874023-29874179)
chr2 (145-249)||(37895107-37895211)
chr2 (209-291)||(3672773-3672855)
chr2 (140-253)||(31259658-31259774)
chr2 (105-255)||(37894732-37894881)
chr2 (199-291)||(6421688-6421780)
chr2 (190-282)||(36784273-36784365)
chr2 (118-245)||(33953821-33953947)
chr2 (104-244)||(41678419-41678559)
chr2 (140-295)||(9231252-9231407)
chr2 (138-268)||(31385738-31385868)
chr2 (153-242)||(28254165-28254254)
chr2 (105-199)||(42514981-42515078)
chr2 (140-293)||(3594180-3594333)
chr2 (201-291)||(35580443-35580534)
chr2 (140-244)||(12910231-12910335)
chr2 (227-295)||(31899102-31899170)
chr2 (139-185)||(6421306-6421352)
chr2 (137-278)||(33954279-33954419)
chr2 (179-255)||(30312831-30312907)
chr2 (191-250)||(25390313-25390372)
chr2 (204-255)||(28226404-28226455)
chr2 (179-236)||(2336666-2336723)
chr2 (207-255)||(8904498-8904546)
chr2 (208-255)||(28226726-28226772)
chr2 (104-159)||(40734243-40734300)
chr2 (204-253)||(13792536-13792585)
chr2 (137-173)||(3672719-3672755)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (31-295)||(22304463-22304727)
chr3 (30-278)||(4823549-4823796)
chr3 (50-295)||(37990639-37990884)
chr3 (27-295)||(41359765-41360031)
chr3 (45-289)||(15773099-15773346)
chr3 (105-295)||(54017816-54018008)
chr3 (34-294)||(11661846-11662108)
chr3 (139-293)||(43346793-43346947)
chr3 (139-295)||(35946524-35946680)
chr3 (139-294)||(37990978-37991133)
chr3 (137-293)||(15772854-15773010)
chr3 (88-295)||(29644581-29644791)
chr3 (104-293)||(42342092-42342283)
chr3 (137-295)||(29644902-29645060)
chr3 (137-295)||(32589704-32589861)
chr3 (137-295)||(33803252-33803410)
chr3 (128-287)||(39934963-39935124)
chr3 (105-295)||(21832345-21832532)
chr3 (137-295)||(12114562-12114720)
chr3 (137-295)||(42342388-42342546)
chr3 (137-295)||(54018198-54018356)
chr3 (129-286)||(39389062-39389219)
chr3 (104-287)||(22303963-22304141)
chr3 (137-295)||(25739425-25739583)
chr3 (139-292)||(32462903-32463057)
chr3 (139-295)||(52634678-52634833)
chr3 (104-295)||(32462558-32462752)
chr3 (129-295)||(50612447-50612618)
chr3 (137-296)||(31190017-31190168)
chr3 (137-295)||(53577364-53577522)
chr3 (139-295)||(25755396-25755552)
chr3 (75-269)||(3135099-3135293)
chr3 (137-292)||(45395656-45395811)
chr3 (139-295)||(3135454-3135617)
chr3 (137-295)||(1634315-1634473)
chr3 (105-288)||(9240118-9240300)
chr3 (139-296)||(45901715-45901873)
chr3 (138-295)||(53117975-53118131)
chr3 (137-297)||(39914252-39914412)
chr3 (137-296)||(8327904-8328067)
chr3 (104-192)||(22304213-22304301)
chr3 (129-295)||(37726496-37726654)
chr3 (139-287)||(49336694-49336843)
chr3 (129-296)||(51886553-51886714)
chr3 (137-295)||(44160547-44160702)
chr3 (195-292)||(22303662-22303759)
chr3 (139-295)||(33175659-33175820)
chr3 (118-269)||(47964544-47964694)
chr3 (147-290)||(42584829-42584970)
chr3 (126-244)||(3384317-3384435)
chr3 (163-261)||(33362327-33362425)
chr3 (137-295)||(39336232-39336387)
chr3 (211-295)||(41359491-41359575)
chr3 (207-295)||(54017548-54017636)
chr3 (137-295)||(47964915-47965073)
chr3 (140-229)||(7767380-7767469)
chr3 (139-255)||(11661537-11661638)
chr3 (140-245)||(46546375-46546480)
chr3 (137-193)||(43346650-43346706)
chr3 (179-265)||(39336000-39336086)
chr3 (179-284)||(12749211-12749316)
chr3 (187-247)||(52634990-52635050)
chr3 (241-294)||(8328374-8328427)
chr3 (246-295)||(22304302-22304351)
chr3 (140-269)||(25317161-25317290)
chr3 (139-255)||(25991405-25991521)
chr3 (204-255)||(53596027-53596078)
chr3 (204-255)||(53596342-53596393)
chr3 (192-249)||(17731950-17732007)
chr3 (192-249)||(19033181-19033238)
chr3 (217-295)||(43978865-43978947)
chr3 (204-255)||(53596542-53596593)
chr3 (219-295)||(7766783-7766857)
chr3 (28-116)||(22303759-22303847)
chr3 (204-251)||(48127859-48127906)
chr3 (137-169)||(12747878-12747910)
chr3 (205-249)||(16871005-16871049)
chr3 (205-249)||(17735037-17735081)
chr3 (205-249)||(19036306-19036350)
chr3 (99-161)||(2299937-2300000)
chr3 (204-249)||(16143505-16143550)
chr3 (208-249)||(16869843-16869884)
chr3 (142-203)||(36986040-36986101)
chr3 (142-203)||(37011479-37011540)
chr3 (200-236)||(50329391-50329427)
[»] chr5 (83 HSPs)
chr5 (45-295)||(3295015-3295266)
chr5 (28-295)||(6500715-6500980)
chr5 (129-295)||(6500443-6500608)
chr5 (137-295)||(40296315-40296473)
chr5 (74-291)||(624134-624350)
chr5 (129-291)||(18603124-18603286)
chr5 (129-295)||(27502036-27502202)
chr5 (129-295)||(32487386-32487551)
chr5 (130-295)||(41170627-41170792)
chr5 (134-294)||(36492218-36492378)
chr5 (105-281)||(13415774-13415951)
chr5 (137-295)||(15370099-15370257)
chr5 (104-286)||(26074577-26074761)
chr5 (140-295)||(3295345-3295498)
chr5 (110-286)||(26074155-26074330)
chr5 (140-295)||(25327938-25328093)
chr5 (128-295)||(9498655-9498821)
chr5 (137-295)||(41632782-41632940)
chr5 (139-295)||(42405598-42405752)
chr5 (144-295)||(11416977-11417128)
chr5 (138-295)||(299490-299647)
chr5 (147-291)||(34753029-34753173)
chr5 (137-295)||(12662652-12662810)
chr5 (139-288)||(26075168-26075318)
chr5 (139-295)||(1028517-1028673)
chr5 (139-295)||(6224198-6224354)
chr5 (104-294)||(24489207-24489394)
chr5 (137-296)||(35150007-35150165)
chr5 (137-295)||(36568569-36568725)
chr5 (104-269)||(26074807-26074975)
chr5 (129-295)||(623810-623976)
chr5 (163-293)||(15370428-15370558)
chr5 (149-291)||(33747783-33747925)
chr5 (134-272)||(29549278-29549416)
chr5 (129-275)||(5723811-5723957)
chr5 (105-287)||(38427525-38427697)
chr5 (137-287)||(26590918-26591068)
chr5 (139-293)||(300961-301107)
chr5 (104-269)||(36521922-36522086)
chr5 (139-295)||(35167838-35167994)
chr5 (140-295)||(2411010-2411165)
chr5 (140-295)||(35914852-35915007)
chr5 (104-255)||(36522277-36522427)
chr5 (129-212)||(7768842-7768925)
chr5 (104-255)||(31509589-31509742)
chr5 (139-232)||(42508614-42508707)
chr5 (223-295)||(26900017-26900089)
chr5 (139-217)||(26074320-26074398)
chr5 (140-274)||(41635212-41635346)
chr5 (139-294)||(13786002-13786157)
chr5 (151-262)||(31509745-31509857)
chr5 (204-255)||(13042606-13042657)
chr5 (224-295)||(38427306-38427377)
chr5 (139-218)||(39309686-39309764)
chr5 (195-296)||(13785631-13785732)
chr5 (221-273)||(795254-795306)
chr5 (208-275)||(9498343-9498410)
chr5 (194-273)||(36527117-36527196)
chr5 (139-232)||(42524719-42524811)
chr5 (195-255)||(32445943-32446003)
chr5 (204-251)||(13112604-13112651)
chr5 (109-172)||(13785732-13785794)
chr5 (140-197)||(6225047-6225104)
chr5 (129-177)||(5660290-5660338)
chr5 (174-262)||(19275566-19275653)
chr5 (217-255)||(13042784-13042822)
chr5 (217-255)||(13112782-13112820)
chr5 (137-179)||(35150747-35150789)
chr5 (137-179)||(35151038-35151080)
chr5 (195-293)||(42435486-42435583)
chr5 (239-291)||(24489583-24489635)
chr5 (28-83)||(9498496-9498550)
chr5 (105-149)||(15370380-15370426)
chr5 (204-255)||(36389016-36389067)
chr5 (219-249)||(5963765-5963795)
chr5 (191-269)||(9510546-9510624)
chr5 (129-186)||(22298956-22299014)
chr5 (235-271)||(795152-795189)
chr5 (227-291)||(5660340-5660405)
chr5 (208-249)||(34103625-34103666)
chr5 (242-295)||(35150810-35150863)
chr5 (28-76)||(795196-795244)
chr5 (205-249)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (104-294)||(36629205-36629394)
chr4 (137-292)||(25483336-25483491)
chr4 (129-295)||(41370349-41370515)
chr4 (127-293)||(50630755-50630921)
chr4 (129-295)||(55933122-55933288)
chr4 (28-295)||(18932747-18933024)
chr4 (74-295)||(44620595-44620817)
chr4 (74-294)||(39404334-39404555)
chr4 (137-292)||(54017596-54017751)
chr4 (109-285)||(54108888-54109060)
chr4 (137-294)||(1731646-1731803)
chr4 (134-295)||(50002423-50002584)
chr4 (137-292)||(3340807-3340962)
chr4 (137-295)||(10245920-10246077)
chr4 (139-293)||(39792860-39793014)
chr4 (137-285)||(52884695-52884844)
chr4 (107-285)||(52884856-52885038)
chr4 (106-294)||(22027960-22028150)
chr4 (137-295)||(36608659-36608817)
chr4 (139-295)||(39404020-39404176)
chr4 (139-294)||(34646648-34646803)
chr4 (129-275)||(49880152-49880297)
chr4 (140-294)||(50459724-50459878)
chr4 (147-295)||(54343006-54343147)
chr4 (146-295)||(44620362-44620511)
chr4 (139-295)||(36572021-36572177)
chr4 (137-295)||(22183262-22183420)
chr4 (137-278)||(4955332-4955473)
chr4 (105-290)||(20826186-20826370)
chr4 (146-295)||(44621011-44621160)
chr4 (137-296)||(49076828-49076986)
chr4 (156-295)||(54936215-54936353)
chr4 (137-295)||(22028367-22028527)
chr4 (50-246)||(2740984-2741180)
chr4 (105-296)||(3244448-3244638)
chr4 (137-288)||(32941128-32941279)
chr4 (100-295)||(49076449-49076643)
chr4 (140-296)||(49302907-49303065)
chr4 (143-301)||(20825842-20826000)
chr4 (136-295)||(54108537-54108694)
chr4 (94-295)||(3341083-3341286)
chr4 (138-294)||(16889535-16889691)
chr4 (137-295)||(2740700-2740856)
chr4 (138-297)||(16888812-16888971)
chr4 (152-266)||(45496820-45496934)
chr4 (137-292)||(4390102-4390257)
chr4 (113-297)||(43174480-43174667)
chr4 (105-294)||(45489331-45489522)
chr4 (191-295)||(23817679-23817783)
chr4 (139-255)||(41707503-41707618)
chr4 (129-260)||(6975489-6975620)
chr4 (137-292)||(34004586-34004739)
chr4 (139-283)||(19504707-19504842)
chr4 (137-292)||(51768061-51768216)
chr4 (137-279)||(54741194-54741334)
chr4 (137-292)||(3700365-3700512)
chr4 (183-293)||(18879852-18879962)
chr4 (177-295)||(43827480-43827597)
chr4 (188-289)||(31691203-31691306)
chr4 (74-203)||(44621361-44621492)
chr4 (150-245)||(54017750-54017845)
chr4 (139-274)||(40067045-40067181)
chr4 (137-295)||(28034229-28034387)
chr4 (158-295)||(48111696-48111833)
chr4 (109-226)||(10246317-10246436)
chr4 (159-295)||(3271806-3271947)
chr4 (142-269)||(760194-760320)
chr4 (179-278)||(15841383-15841482)
chr4 (129-189)||(50788087-50788147)
chr4 (145-203)||(44620304-44620362)
chr4 (137-269)||(23556890-23557022)
chr4 (143-295)||(45489712-45489864)
chr4 (229-295)||(43174233-43174299)
chr4 (204-255)||(11197293-11197344)
chr4 (140-255)||(34544107-34544225)
chr4 (162-293)||(39698944-39699077)
chr4 (121-203)||(44620926-44621011)
chr4 (108-174)||(41370673-41370738)
chr4 (217-291)||(41370738-41370812)
chr4 (137-225)||(11348396-11348484)
chr4 (143-255)||(15841023-15841134)
chr4 (74-133)||(16889315-16889375)
chr4 (204-255)||(10396198-10396249)
chr4 (204-255)||(10396483-10396534)
chr4 (200-295)||(11783551-11783646)
chr4 (250-291)||(23817457-23817498)
chr4 (204-256)||(922485-922537)
chr4 (205-244)||(1868119-1868158)
chr4 (247-286)||(19895406-19895445)
chr4 (195-253)||(11706584-11706641)
chr4 (203-249)||(51681604-51681650)
chr4 (191-251)||(2891864-2891924)
chr4 (251-295)||(11702297-11702341)
chr4 (137-185)||(45050601-45050649)
chr4 (215-291)||(50787996-50788072)
chr4 (204-255)||(11197003-11197054)
chr4 (129-160)||(18933103-18933134)
chr4 (192-235)||(45484774-45484817)
chr4 (181-255)||(31249896-31249970)
chr4 (213-255)||(41707279-41707321)
chr4 (137-178)||(11706636-11706677)
chr4 (248-285)||(19895533-19895570)
chr4 (200-233)||(29802604-29802637)
chr4 (28-69)||(41370621-41370662)
chr4 (219-255)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (28-257)||(5246-5477)
scaffold0078 (137-288)||(4982-5133)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (105-291)||(1110-1298)
scaffold0391 (184-255)||(1731-1802)
scaffold0391 (104-188)||(3092-3178)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (139-295)||(514-670)
scaffold0702 (28-295)||(147-408)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (50-286)||(5689-5931)
scaffold0734 (137-286)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (105-253)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (137-295)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (139-214)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (139-269)||(39459-39588)
scaffold0113 (104-262)||(39805-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (131-215)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (175-215)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 3409551 - 3409818
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409551 agcaagtggctccttgtgcagggatggcaatacaggcaaagtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga 3409650  T
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3409651 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttat 3409750  T
Q  228 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409751 tttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 295
Target Start/End: Original strand, 29518857 - 29519078
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 173  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518857 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 29518956  T
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29518957 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 29519056  T
Q  274 agcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29519057 agcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 2378018 - 2378284
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| |||||    
T  2378018 agcaagtggctccttgtgcaggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-ggggg 2378115  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2378116 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 2378215  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378216 ggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10074256 - 10073989
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||| ||||| ||||||||||||    
T  10074256 agcaagtggctcattgtgcaacaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgaggggg 10074159  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074158 agtgttg-tgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 10074060  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074059 ggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2578634 - 2578443
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578634 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 2578536  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578535 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210363
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct 35210363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10074553 - 10074371
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074553 tgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10074455  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10074454 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 10074371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058384
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccc 3058384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 16454872 - 16455065
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16454872 tgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaat 16454971  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454972 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16455065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415618
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  228 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccc 3415618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  130 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  230 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454733
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2579678 - 2579500
Alignment:
Q  108 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  2579678 ggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcc 2579580  T
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2579579 cataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 2579500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127518
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  242 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578835
Alignment:
Q  112 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  212 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccc 2578835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10073804 - 10073618
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073804 tgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10073708  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10073707 gatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 10073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2579297 - 2579109
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |    
T  2579297 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----a 2579202  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2579201 ggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcccc 2579109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Original strand, 16107998 - 16108208
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16107998 agcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaa 16108097  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 271  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16108098 agagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgtt 16108185  T
Q  272 ctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  16108186 ataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832027
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 5832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593707
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  237 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccc 593707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 280  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  242 tgtg 245  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgt 262  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Original strand, 8481893 - 8482045
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||    
T  8481893 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 256  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  132 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 231  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  232 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Original strand, 6071098 - 6071264
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  6071098 tgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 6071196  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071197 atgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071689
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccccta 12071689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092481
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  ||||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccct 12092481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085032
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctccta 12085032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 35210456 - 35210551
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35210456 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagag 35210544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135069
Alignment:
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccc 17135069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 253
Target Start/End: Original strand, 2975521 - 2975668
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2975521 gatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 253  Q
     |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975618 tgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 196
Target Start/End: Original strand, 33605913 - 33606034
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 173  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33605913 agcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaa 33606011  T
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataa 196  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606012 agtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 288
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618634
Alignment:
Q  144 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 243  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  244 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct 30618634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  213 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37533259 - 37533011
Alignment:
Q  45 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533259 gcagcaacggcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtg 37533161  T
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37533160 tgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgt 37533062  T
Q  245 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533061 ggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Original strand, 7553937 - 7554154
Alignment:
Q  50 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 147  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7553937 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 7554035  T
Q  148 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554036 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggt 7554135  T
Q  248 gtctctcttgcttgtgtgg 266  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7554136 gtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085616
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1085616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Original strand, 14681401 - 14681663
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg--agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggg 125  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||  |||| | | ||  |||||||||||||||||||||    
T  14681401 agcaaatggctccttatgcaggaa-ggcgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggg 14681498  T
Q  126 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14681499 gagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtctta 14681598  T
Q  226 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681599 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22566930 - 22566702
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga 127  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22566930 agcaagtggctccttgtgcagcaacgacaatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgaggggga 22566832  T
Q  128 gtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566831 gtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 22566732  T
Q  226 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566731 aggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Original strand, 30244236 - 30244428
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244236 gatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaaga 30244335  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244336 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517739
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtcccct 7517739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533364
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 131 - 292
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Original strand, 30245043 - 30245231
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245043 gatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245142  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30245143 cgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 295
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845349
Alignment:
Q  144 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  244 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 11845349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433399
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 45433399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567039
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccc 22567039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 45434548 - 45434794
Alignment:
Q  50 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 148  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||    
T  45434548 aacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaag 45434647  T
Q  149 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45434648 ttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 45434747  T
Q  249 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434748 tctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 284
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  245 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129253
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 47129253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  237 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128441
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccc 8128441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  242 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 294
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623117
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtccc 36623117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1085436 - 1085280
Alignment:
Q  110 actcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  1085436 actcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaac 1085337  T
Q  207 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085336 ccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 272  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 292
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 293
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  158 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  258 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  279 cgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 30244667 - 30244771
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30244667 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T
Q  203 ggacc 207  Q
    |||||    
T  30244767 ggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  108 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  206 cccat 210  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  232 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  183 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  282 tgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 258
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgc 258  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 30245463 - 30245567
Alignment:
Q  108 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 205  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30245463 ggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30245562  T
Q  206 cccat 210  Q
    |||||    
T  30245563 cccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 295
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129527
Alignment:
Q  218 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcccc 47129527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  220 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 205  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  225 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37532896 - 37532822
Alignment:
Q  59 acaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgg 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532896 acaggcaaagtaaaaagcttccgctata-ggggaacacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Original strand, 37345868 - 37346036
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 185  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| |    
T  37345868 ggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaa 37345966  T
Q  186 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345967 acattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40094583 - 40094502
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 187  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094583 gatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  206 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244509
Alignment:
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccc 30244509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245319
Alignment:
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctatgct 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgct 30245319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctct 255  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253728
Alignment:
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccc 30253728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 174
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 282
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  220 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 282  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  292 cccc 295  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  279 cgatgtggacggtcccc 295  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  232 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517816
Alignment:
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtcccct 7517816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518082
Alignment:
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtcccct 7518082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 297
Target Start/End: Original strand, 3669953 - 3670220
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||     
T  3669953 caagtggctccttgtgcaggaacggcgatacatgcaaagt-aagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggac 3670051  T
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670052 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaagg 3670151  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3670152 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta 3670220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1014138 - 1013879
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || | | | || |||||||||||||||||||||||    
T  1014138 agcaagtggctccttgtgcaggaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgaggggg 1014040  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1014039 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttag 1013940  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013939 agttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  228 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 295
Target Start/End: Original strand, 9309304 - 9309512
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9309304 ggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttga 9309403  T
Q  186 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||    
T  9309404 acaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtg 9309502  T
Q  286 gacggtcccc 295  Q
    ||||||||||    
T  9309503 gacggtcccc 9309512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 288
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441236
Alignment:
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  223 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 34835185 - 34835367
Alignment:
Q  115 cacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 212  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835185 cacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 34835284  T
Q  213 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34835285 actcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcccc 34835367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 34835439 - 34835633
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835439 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835538  T
Q  201 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34835539 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcccc 34835633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 34835705 - 34835899
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835705 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835804  T
Q  201 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34835805 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcccc 34835899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 293
Target Start/End: Original strand, 40518550 - 40518738
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518550 tgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag 40518648  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518649 gacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 287
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45121881 - 45121663
Alignment:
Q  71 aaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggat 168  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45121881 aaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggat 45121783  T
Q  169 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 268  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  45121782 aaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggtt 45121683  T
Q  269 gttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45121682 gttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8918956 - 8918764
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918956 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 8918857  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918856 ggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870575
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcc 20870575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 291
Target Start/End: Original strand, 30359558 - 30359763
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 185  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30359558 ggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttga 30359657  T
Q  186 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30359658 acaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtg 30359757  T
Q  286 gacggt 291  Q
    ||||||    
T  30359758 gacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 45122604 - 45122782
Alignment:
Q  110 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122604 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 45122696  T
Q  210 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122697 taaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Original strand, 6731872 - 6732055
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||     
T  6731872 gatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagaga 6731962  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731963 acccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9482784 - 9482608
Alignment:
Q  115 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482784 cacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 9482685  T
Q  215 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482684 ccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561813
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtccccta 25561813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Original strand, 45122972 - 45123164
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  45122972 gatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaaga 45123069  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123070 tgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121910
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45121910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483191
Alignment:
Q  162 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  262 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 296
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359430
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccct 30359430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  144 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  244 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18371863 - 18371665
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 187  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371863 ggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18371764  T
Q  188 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18371763 a----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18372463 - 18372342
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372463 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372364  T
Q  188 accttataagtaagaggaccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18372363 accttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Original strand, 147794 - 147968
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         
T  147794 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa----- 147888  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147889 ----cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  108 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371998
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggt 18371998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  235 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18372905 - 18372785
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372905 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372807  T
Q  188 accttataagtaagaggaccca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18372806 accttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18373139 - 18372988
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373139 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaa 18373040  T
Q  187 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373039 caccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 231  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  232 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  160 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 259  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  260 tgtgtggttgttcta 274  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18372574 - 18372485
Alignment:
Q  92 agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372574 agcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  240 agtgtggtgtc 250  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  239 gagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  212 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4154472 - 4154281
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4154472 tgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  |||||||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtcccc 4154281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  239 gagtgtg 245  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620678
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccc 9620678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129146
Alignment:
Q  215 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccc 41129146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995433
Alignment:
Q  214 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 20995433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 275
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  218 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 275  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  173 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 236
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037969
Alignment:
Q  248 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3037969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43274776 - 43274699
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274776 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  191 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44290719 - 44290458
Alignment:
Q  34 tggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgtt 132  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290719 tggctccttgtgcaggaacgacgatacaggcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgtt 44290621  T
Q  133 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290620 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 44290521  T
Q  233 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290520 gggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48588755 - 48588491
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48588755 agcaagtggctccttgtgcaggaacgacgatacatgcaaaat-aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgaggggg 48588657  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  48588656 agtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaa 48588557  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588556 ggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290824
Alignment:
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  227 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Original strand, 41157311 - 41157532
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157311 agcttccgctctg-ggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 41157409  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 271  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157410 agagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgtt 41157509  T
Q  272 ctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  41157510 ctagcctcgatgtgggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26661789 - 26661522
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggag 128  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  26661789 caagtggctccttgtgcagcaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggag 26661691  T
Q  129 tgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26661690 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 26661591  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661590 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Original strand, 37556071 - 37556260
Alignment:
Q  99 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37556071 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata 37556170  T
Q  196 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556171 agtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537598
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 3537598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  237 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 296
Target Start/End: Original strand, 34364891 - 34365084
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364891 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaga 34364990  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34364991 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3537410 - 3537226
Alignment:
Q  33 gtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgt 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537410 gtggctccttgtgcaggaacgacgatacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt 3537311  T
Q  132 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537310 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157149
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41157149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 129 - 291
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  110 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 292
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22077683 - 22077495
Alignment:
Q  106 atggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077683 atggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 22077585  T
Q  206 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22077584 cccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccc 22077495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767161
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccc 31767161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364666
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccct 34364666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493974
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  223 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccc 45493974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  245 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052024
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccc 50052024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 287
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168696
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtccccta 32168696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 297
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956069
Alignment:
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtccccta 9956069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  134 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850598
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta 37850598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084534
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccc 45084534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 286
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 66278 - 66100
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66278 gatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaaga 66180  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66179 ggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22077311 - 22077110
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacacctt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||    
T  22077311 gatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaatacctt 22077213  T
Q  193 ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077212 ataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 22077113  T
Q  293 ccc 295  Q
    |||    
T  22077112 ccc 22077110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30630828 - 30630648
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30630828 tgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagag 30630730  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630729 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184489
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131994
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacg 24131994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  222 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575252
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtgga 5575252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50051918 - 50051777
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||  |||||| |||| | | || | |||||||||||||||||||||    
T  50051918 agcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatactggcaaagt-aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgaggggg 50051820  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 169  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051819 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
     |||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 285
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077831
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcc 22077831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283454
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtcccct 19283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378058
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccct 21378058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188588
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtcccc 1188588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  207 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 294
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  152 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 251  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  252 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187361
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtccccta 1187361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469180
Alignment:
Q  119 tgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 196  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  164 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 261  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  262 tgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47379990 - 47379891
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 187  Q
    |||||||||| | || || |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  47379990 ggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttgat--gcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaac 47379893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41184486 - 41184408
Alignment:
Q  220 gccttaaggttttgggtaagagtgtggt---gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41184486 gccttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtcccc 41184408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 203
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 286
Target Start/End: Original strand, 24448245 - 24448426
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  24448245 tgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagag 24448343  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    | | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  24448344 ggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  186 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 231  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380165
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtccccta 47380165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 48588378 - 48588340
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaag 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588378 caagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaag 48588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 294
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  178 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 277  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  278 tcgatgtggacggtccc 294  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 255
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  146 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 205  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  210 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 256  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41184246 - 41184198
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 122  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41184246 agcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 273
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 273  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5542890 - 5542625
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggga-gcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5542890 caagtggctccttgtgcaggaacagcgatacaggcaaagttaga-gcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggag 5542792  T
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5542791 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagg 5542692  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542691 tttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 105 - 293
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  228 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 129 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283469
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctatgct 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgct 41283469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14745558 - 14745300
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||| ||||| |||||||||| ||    
T  14745558 caagtggctccttgtgcaggaacggcgatacagacaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-ag 14745461  T
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745460 tgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaagg 14745361  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745360 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  133 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  233 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 289
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  109 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 206  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  207 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36178498 - 36178320
Alignment:
Q  65 aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36178498 aaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacattaaagtgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttc 36178400  T
Q  165 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178399 ggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421543
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccc 6421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Original strand, 29676793 - 29677065
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga 127  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29676793 agcaagtggctccttgtgcagcaacggaaatacaagcaa-gtaaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggt 29676891  T
Q  128 gtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattg 220  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     |||||||||||||||    
T  29676892 gtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattg 29676991  T
Q  221 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29676992 ccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40679818 - 40679632
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40679818 gatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagaga 40679720  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679719 acccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514807
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42514807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 6422084 - 6422268
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6422084 tgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagag 6422176  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422177 gacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  144 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 243  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  244 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28531504 - 28531316
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28531504 tgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagag 28531406  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531405 gtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 7598577 - 7598754
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598577 gatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 7598676  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 290  Q
    ||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7598677 acccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  155 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  255 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713135
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6713135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  237 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 40733482 - 40733675
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733482 tgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaag 40733581  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733582 aggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 293
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  242 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Original strand, 40733848 - 40734040
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733848 tgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaag 40733947  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733948 agggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 276  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  148 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 292
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346391
Alignment:
Q  150 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  250 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtc 23346391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 295
Target Start/End: Original strand, 3673003 - 3673226
Alignment:
Q  57 atacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaag-gggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttata 153  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3673003 atacatgcaaagt-aaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttata 3673101  T
Q  154 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 253  Q
    |||||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  3673102 tgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctct 3673184  T
Q  254 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673185 cttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3673226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 281
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  117 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 214  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  215 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38796410 - 38796298
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796410 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T
Q  203 ggacccataaacc 215  Q
    ||||| |||||||    
T  38796310 ggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421889
Alignment:
Q  199 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccc 6421889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 244
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  237 aagagtgt 244  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  245 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 295
Target Start/End: Original strand, 30313147 - 30313335
Alignment:
Q  107 tggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313147 tggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagg 30313244  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||    
T  30313245 acccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccc 30313335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36785786 - 36785664
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785786 agcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 36785687  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36785686 atagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 30323430 - 30323581
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||    
T  30323430 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgag 30323528  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323529 aggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33561641 - 33561491
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33561641 tgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagag 33561543  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561542 gacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591034
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggac 16591034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29873729 - 29873563
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |    
T  29873729 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  245 ggtgt 249  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 291
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672855
Alignment:
Q  209 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggt 3672855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  237 aagagtgtggtgtctct 253  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37894881 - 37894732
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  37894881 gatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaag 37894783  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894782 actcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  199 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  190 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  118 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  33953947 ttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctg 33953849  T
Q  218 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953848 ttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41678559 - 41678419
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41678559 tgatggactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgag 41678461  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678460 aggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 268  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  153 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Original strand, 42514981 - 42515078
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514981 gatggactcacatttgagggggagtgttg-tgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  201 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  240 agtgt 244  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899102
Alignment:
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc 31899102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  191 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 250  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 255
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  207 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 255
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Original strand, 40734243 - 40734300
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734243 tgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 253  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 22304463 - 22304727
Alignment:
Q  31 aagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagt 129  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22304463 aagtggctccttgttcaggaacgacgatacaagcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagt 22304561  T
Q  130 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304562 gttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggt 22304661  T
Q  230 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22304662 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtcccc 22304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Original strand, 4823549 - 4823796
Alignment:
Q  30 caagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagt 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4823549 caagtggctccttgtgcaggaatggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagt 4823647  T
Q  130 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4823648 gttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagat 4823747  T
Q  230 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823748 tttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37990884 - 37990639
Alignment:
Q  50 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtga 147  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  37990884 aacggcgatacatgcaaagt-aaaagcttccgct-tgaggggggcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtga 37990787  T
Q  148 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990786 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 37990687  T
Q  248 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990686 gtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37990639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41360031 - 41359765
Alignment:
Q  27 gagcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggg 125  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||    
T  41360031 gagcaagtggctccttgtgcaagaacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggg 41359933  T
Q  126 gagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcct 223  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359932 gagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgcct 41359837  T
Q  224 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359836 taaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 15773099 - 15773346
Alignment:
Q  45 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 142  Q
    |||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15773099 gcagcaacagcgatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaag 15773197  T
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15773198 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagt 15773297  T
Q  243 gtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 289  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773298 gtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54018008 - 54017816
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018008 gatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54017909  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54017908 ggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtcccc 54017816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 11661846 - 11662108
Alignment:
Q  34 tggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11661846 tggctccttgtgcagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttg 11661945  T
Q  134 --gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-tt 230  Q
      || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11661946 ttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggttt 11662045  T
Q  231 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662046 ttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990978
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 37990978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 88 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29644791 - 29644581
Alignment:
Q  88 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 184  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29644791 ggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttg 29644692  T
Q  185 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  29644691 aacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgt 29644592  T
Q  285 ggacggtcccc 295  Q
    ||| |||||||    
T  29644591 ggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42342283 - 42342092
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  42342283 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaag 42342184  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342183 aggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644902
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccc 29644902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  226 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21832532 - 21832345
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832532 gatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 21832434  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832433 actcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114562
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccc 12114562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342388
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 42342388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22304141 - 22303963
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  22304141 tgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaag 22304049  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304048 cggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 139 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634833
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccc 52634833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32462752 - 32462558
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32462752 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaa 32462653  T
Q  201 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462652 gatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  224 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  75 gcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 173  Q
    |||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  232 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634315
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1634315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Original strand, 9240118 - 9240300
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9240118 gatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagg 9240216  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240217 acccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 296
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Original strand, 22304213 - 22304301
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304213 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  239 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175659
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  236 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccc 33175659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  118 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 217  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  218 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 290  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  126 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  226 aggttttgggtaagagtgt 244  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  163 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336232
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccc 39336232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359491
Alignment:
Q  211 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 41359491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017548
Alignment:
Q  207 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcccc 54017548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  239 gagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  240 agtgtg 245  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 193
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 265  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 284
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  279 cgatgt 284  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  187 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304351
Alignment:
Q  246 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 22304351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  239 gagtgtggtgtctctct 255  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  217 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22303847 - 22303759
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggc-aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 116  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22303847 agcaagtggcttcttgtgcagcaacggcgattcaggcaaaagtaaaaagcttccgct-ttaggggaacacgttgaattgatggactcaca 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 251  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Original strand, 2299937 - 2300000
Alignment:
Q  99 taaagtgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299937 taaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  200 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 83)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3295266 - 3295015
Alignment:
Q  45 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgca 140  Q
    |||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  3295266 gcagcaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgca 3295169  T
Q  141 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3295168 agtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatga 3295070  T
Q  241 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295069 gtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtcccc 3295015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 6500715 - 6500980
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6500715 agcaagtggctccttatgtaggaacgccgatacag-caaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatgggg 6500812  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6500813 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaa 6500911  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6500912 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 6500980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500608
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6500608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296315
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 40296315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 624134 - 624350
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 173  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  624134 agcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaat 624232  T
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  624233 agtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttct 624332  T
Q  274 agcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  624333 agcctcgatgtggacggt 624350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502036
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 27502036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  130 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 229  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  230 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  134 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13415951 - 13415774
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415951 gatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 13415853  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 281  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13415852 ggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 286
Target Start/End: Original strand, 26074577 - 26074761
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074155
Alignment:
Q  110 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  210 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328093
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 25328093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  128 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  228 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632940
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtcccc 41632940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405598
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42405598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  144 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  244 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 237  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028517
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1028517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224354
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccc 6224354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24489394 - 24489207
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  24489394 tgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga- 24489297  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24489296 -acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568569
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccc 36568569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26074975 - 26074807
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26074975 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtagg 26074876  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074875 aggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370558
Alignment:
Q  163 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 262  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  263 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 15370558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 149 - 291
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  149 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  249 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  134 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 272  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 275  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 287
Target Start/End: Original strand, 38427525 - 38427697
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38427525 gatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagg 38427614  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427615 acccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 287  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36522086 - 36521922
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||||    
T  36522086 tgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagag 36521988  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521987 gacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411165
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccc 2411165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36522427 - 36522277
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  36522427 tgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagag 36522329  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522328 gaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 212
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Original strand, 31509589 - 31509742
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31509589 tgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgag 31509687  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509688 aggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 232  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900017
Alignment:
Q  223 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccc 26900017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 274  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 262
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  151 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  250 ctctcttgcttgt 262  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 295
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  224 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  295 ct 296  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  221 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 275  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  194 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 273  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 232  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 255
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13785794 - 13785732
Alignment:
Q  109 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785794 gactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 197  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 177
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  174 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 262  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  217 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  217 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 293
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 291
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 9498550 - 9498496
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgct 83  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9498550 agcaagtggctccttgtgcaggaacggtgatacatgcaaagt-aagagcttccgct 9498496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 249
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  191 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 186  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  235 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 291
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 291  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  208 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  242 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 795244 - 795196
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagc 76  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  795244 agcaagtggctccttgtgcagcaacggtgatacagacaaagtaaaaagc 795196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 104 - 294
Target Start/End: Original strand, 36629205 - 36629394
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36629205 tgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagag 36629303  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629304 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36629394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483491
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 25483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630755
Alignment:
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtcc 50630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933122
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 55933122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18933024 - 18932747
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||  |||||| |||| | | ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  18933024 agcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggtaaaat-aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg 18932926  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg-----------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 215  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18932925 -gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacc 18932827  T
Q  216 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932826 cattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 295
Target Start/End: Original strand, 44620595 - 44620817
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620595 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaa 44620694  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 271  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620695 atagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T
Q  272 ctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  44620794 atatcctcgatgtggacggtcccc 44620817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Original strand, 39404334 - 39404555
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    ||||||||||  | || ||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404334 agcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 39404432  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 271  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404433 agagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 39404532  T
Q  272 ctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39404533 ctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Original strand, 54108888 - 54109060
Alignment:
Q  109 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108888 gactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 54108984  T
Q  209 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54108985 ataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 137 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  134 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  234 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340962
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtc 3340962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246077
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccc 10246077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792860
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  107 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027960
Alignment:
Q  106 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccc 22027960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608659
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 36608659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404176
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 39404176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  240 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  146 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  246 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183262
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 22183262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Original strand, 20826186 - 20826370
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20826186 gatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagaga 20826284  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 290  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826285 acccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  146 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  246 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 295
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936353
Alignment:
Q  156 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  256 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 54936353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028367
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 234  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  235 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 22028367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 2740984 - 2741180
Alignment:
Q  50 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggag--cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 147  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||  || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  2740984 aacggcgatacgagcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtga 2741081  T
Q  148 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741082 gttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3244638 - 3244448
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 204  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3244638 gatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagg 3244540  T
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244539 acccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49076643 - 49076449
Alignment:
Q  100 aaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076643 aaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataag 49076544  T
Q  198 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076543 taagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 296  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826000
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctatgct 301  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgct 20826000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  136 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 234  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  235 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 295
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341286
Alignment:
Q  94 cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  292 cccc 295  Q
    ||||    
T  3341283 cccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740856
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccc 2740856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888812
Alignment:
Q  138 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtccccta 16888812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  152 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  252 ctcttgcttgtgtgg 266  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174667
Alignment:
Q  113 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  210 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 297  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta 43174667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45489522 - 45489331
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45489522 gatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaag 45489423  T
Q  202 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 294  Q
    || || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489422 agaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  191 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 290  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  291 tcccc 295  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  239 gagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 283
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 283  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741194
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc 279  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctc 54741194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 292  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  183 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  283 gtggacggtcc 293  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  177 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 276  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  277 ctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 289
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  188 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  286 gacg 289  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 44621361 - 44621492
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 171  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44621361 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaa 44621460  T
Q  172 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621461 acagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  150 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 237  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  238 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 274  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  158 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  258 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 226
Target Start/End: Original strand, 10246317 - 10246436
Alignment:
Q  109 gactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 206  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10246317 gactcacgcttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggac 10246416  T
Q  207 ccataaacccattgccttaa 226  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  10246417 ccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 295
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  159 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 254  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  255 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 269
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760320
Alignment:
Q  142 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  242 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  179 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 278  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  145 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  229 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  140 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 236  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  162 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 259  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  260 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 293  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  121 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  108 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  217 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 225  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  143 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 242  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  243 gtggtgtctctct 255  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16889375 - 16889315
Alignment:
Q  74 agcttccgctctaaggggagcacg-ttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 133  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889375 agcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783551
Alignment:
Q  200 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtcccc 11783551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  250 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 244
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  205 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 286
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  247 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  195 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 253  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 249
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 249  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  191 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702297
Alignment:
Q  251 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccc 11702297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 185
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  215 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 255
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  129 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  192 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 235  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  181 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  213 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 178  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 285
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  248 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  200 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 41370621 - 41370662
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt 69  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41370621 agcaagtagctccttgtgcaggaacggcgatacaggtaaagt 41370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  219 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Original strand, 5246 - 5477
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |    
T  5246 agcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggag 5344  T
Q  127 agtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 224  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5345 agttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 5444  T
Q  225 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 257  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5445 aagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 288
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1298 - 1110
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  1298 gatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaa 1199  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1198 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  184 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 3092
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3178 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  239 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 408 - 147
Alignment:
Q  28 agcaagtggctcattgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| |||||    
T  408 agcaagtggctccttgtgcaggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-ggggg 311  T
Q  127 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |    
T  310 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--acttta 215  T
Q  227 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 gg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 286
Target Start/End: Original strand, 5689 - 5931
Alignment:
Q  50 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 147  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5689 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 5787  T
Q  148 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagt 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||    
T  5788 gttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagt 5887  T
Q  243 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5888 gtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  236 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17648 - 17496
Alignment:
Q  105 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17648 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaaga 17549  T
Q  203 ggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17548 ggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  137 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 236  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  237 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 295  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 269
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  139 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  239 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 269  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 262
Target Start/End: Original strand, 39805 - 39963
Alignment:
Q  104 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| |||     
T  39805 tgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagat 39904  T
Q  204 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 262  Q
    ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39905 gagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  131 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  175 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University