View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15829_low_1 (Length: 900)

Name: NF15829_low_1
Description: NF15829
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15829_low_1
NF15829_low_1
[»] chr7 (203 HSPs)
chr7 (419-900)||(7471979-7472456)
chr7 (419-900)||(38393801-38394276)
chr7 (419-900)||(7470021-7470503)
chr7 (419-900)||(3035533-3036014)
chr7 (419-900)||(20625852-20626328)
chr7 (419-900)||(20629743-20630219)
chr7 (419-900)||(20642162-20642638)
chr7 (419-900)||(20299273-20299750)
chr7 (419-895)||(18345360-18345831)
chr7 (423-900)||(20297177-20297648)
chr7 (419-900)||(28487367-28487843)
chr7 (419-900)||(1849783-1850271)
chr7 (419-900)||(28485379-28485855)
chr7 (419-894)||(7351651-7352122)
chr7 (474-900)||(11757043-11757465)
chr7 (419-900)||(31155910-31156382)
chr7 (423-900)||(43253520-43253997)
chr7 (432-894)||(7349285-7349743)
chr7 (419-895)||(13099473-13099942)
chr7 (419-895)||(42330996-42331470)
chr7 (419-759)||(48457608-48457943)
chr7 (419-895)||(21989974-21990440)
chr7 (423-895)||(37412128-37412593)
chr7 (419-762)||(44724535-44724869)
chr7 (419-753)||(3878540-3878867)
chr7 (419-762)||(1049295-1049628)
chr7 (419-762)||(40836742-40837075)
chr7 (419-762)||(27306229-27306562)
chr7 (419-759)||(40946283-40946618)
chr7 (419-762)||(35585-35919)
chr7 (419-762)||(1046924-1047265)
chr7 (419-806)||(443507-443886)
chr7 (419-762)||(31435045-31435380)
chr7 (419-762)||(44520-44854)
chr7 (419-762)||(25542487-25542818)
chr7 (419-762)||(20137108-20137442)
chr7 (419-779)||(9678993-9679349)
chr7 (423-762)||(9680770-9681106)
chr7 (419-762)||(11355214-11355548)
chr7 (432-895)||(24258281-24258744)
chr7 (419-762)||(4295933-4296269)
chr7 (419-762)||(24748550-24748885)
chr7 (419-720)||(21592142-21592438)
chr7 (429-762)||(21679983-21680307)
chr7 (419-762)||(21678022-21678356)
chr7 (419-762)||(42223112-42223448)
chr7 (419-762)||(39145985-39146320)
chr7 (419-644)||(7092212-7092431)
chr7 (439-708)||(27832651-27832916)
chr7 (477-762)||(25276097-25276374)
chr7 (665-900)||(7092414-7092650)
chr7 (665-900)||(7094662-7094897)
chr7 (516-762)||(26804529-26804765)
chr7 (423-644)||(7094463-7094678)
chr7 (419-636)||(38396713-38396924)
chr7 (430-762)||(24817362-24817682)
chr7 (419-789)||(7188472-7188831)
chr7 (459-789)||(22828671-22828993)
chr7 (477-762)||(22251602-22251875)
chr7 (453-789)||(20091580-20091901)
chr7 (419-608)||(2935374-2935558)
chr7 (419-685)||(24813496-24813755)
chr7 (712-900)||(38396104-38396292)
chr7 (596-762)||(18567569-18567731)
chr7 (419-608)||(1606486-1606669)
chr7 (419-608)||(22137184-22137367)
chr7 (419-608)||(40552211-40552394)
chr7 (721-900)||(1606289-1606467)
chr7 (419-608)||(9027193-9027376)
chr7 (419-608)||(22108173-22108356)
chr7 (419-608)||(40549933-40550116)
chr7 (692-895)||(3677101-3677301)
chr7 (748-900)||(21470614-21470765)
chr7 (419-762)||(24465504-24465827)
chr7 (563-762)||(22392429-22392612)
chr7 (419-555)||(22393876-22394013)
chr7 (419-558)||(26295598-26295738)
chr7 (260-356)||(48458005-48458100)
chr7 (818-900)||(47865446-47865528)
chr7 (256-356)||(7471817-7471917)
chr7 (256-356)||(38394338-38394438)
chr7 (260-356)||(2935621-2935716)
chr7 (261-356)||(28487905-28488000)
chr7 (260-356)||(43253358-43253453)
chr7 (259-356)||(11759479-11759576)
chr7 (262-356)||(38396991-38397084)
chr7 (260-356)||(44916-45012)
chr7 (419-704)||(11081522-11081801)
chr7 (256-356)||(20297714-20297814)
chr7 (256-356)||(7092050-7092150)
chr7 (256-356)||(7094297-7094397)
chr7 (256-356)||(28485917-28486017)
chr7 (259-356)||(40836582-40836680)
chr7 (260-356)||(40946682-40946777)
chr7 (277-356)||(35981-36059)
chr7 (419-622)||(6332311-6332512)
chr7 (260-356)||(1850333-1850429)
chr7 (260-344)||(9027034-9027118)
chr7 (260-356)||(20299812-20299908)
chr7 (260-356)||(25542880-25542976)
chr7 (256-356)||(40550180-40550281)
chr7 (256-344)||(7351487-7351576)
chr7 (259-356)||(3878930-3879028)
chr7 (257-344)||(7349114-7349202)
chr7 (259-356)||(7469863-7469959)
chr7 (260-356)||(1606731-1606827)
chr7 (260-347)||(20626394-20626481)
chr7 (260-347)||(20630285-20630372)
chr7 (260-347)||(20642704-20642791)
chr7 (660-724)||(38396306-38396370)
chr7 (266-356)||(3036076-3036166)
chr7 (419-622)||(16297020-16297222)
chr7 (257-353)||(42223506-42223603)
chr7 (485-558)||(6348933-6349006)
chr7 (260-356)||(22137430-22137527)
chr7 (260-356)||(40552457-40552554)
chr7 (256-344)||(1049125-1049216)
chr7 (281-356)||(18345893-18345967)
chr7 (260-353)||(27306076-27306170)
chr7 (260-353)||(42330846-42330940)
chr7 (256-349)||(44724932-44725026)
chr7 (269-353)||(9679409-9679495)
chr7 (257-353)||(13099314-13099411)
chr7 (257-353)||(26804861-26804958)
chr7 (258-327)||(1502814-1502883)
chr7 (256-351)||(4295777-4295873)
chr7 (260-353)||(31434892-31434987)
chr7 (259-332)||(1046756-1046831)
chr7 (293-353)||(21990500-21990560)
chr7 (258-353)||(11355609-11355707)
chr7 (256-353)||(21678412-21678510)
chr7 (260-353)||(21680378-21680472)
chr7 (256-347)||(24748946-24749039)
chr7 (419-472)||(11759364-11759417)
chr7 (419-607)||(25351353-25351534)
chr7 (432-561)||(6046641-6046772)
chr7 (570-704)||(6048885-6049014)
chr7 (420-483)||(9190038-9190101)
chr7 (420-483)||(20284093-20284156)
chr7 (568-622)||(11084467-11084521)
chr7 (280-353)||(37411988-37412061)
chr7 (444-623)||(2120881-2121056)
chr7 (259-353)||(443948-444045)
chr7 (420-484)||(21983288-21983352)
chr7 (292-356)||(22108420-22108484)
chr7 (420-484)||(46516339-46516403)
chr7 (420-483)||(2580394-2580457)
chr7 (259-305)||(31153690-31153737)
chr7 (419-607)||(3320050-3320232)
chr7 (419-607)||(3324798-3324980)
chr7 (568-644)||(12310159-12310234)
chr7 (419-607)||(25405393-25405575)
chr7 (423-484)||(55955-56015)
chr7 (281-353)||(9681170-9681243)
chr7 (281-353)||(22251452-22251524)
chr7 (419-607)||(25357047-25357228)
chr7 (420-484)||(2647725-2647789)
chr7 (420-484)||(4796696-4796760)
chr7 (419-607)||(25410130-25410313)
chr7 (420-484)||(29159807-29159871)
chr7 (540-607)||(7069780-7069841)
chr7 (540-607)||(7074787-7074848)
chr7 (256-347)||(7188890-7188983)
chr7 (419-485)||(7464518-7464585)
chr7 (420-483)||(9185195-9185258)
chr7 (568-607)||(21369642-21369681)
chr7 (568-622)||(26210631-26210686)
chr7 (420-483)||(28617255-28617318)
chr7 (420-483)||(33332480-33332543)
chr7 (568-619)||(40281521-40281572)
chr7 (540-607)||(42006663-42006724)
chr7 (569-607)||(15541139-15541177)
chr7 (259-347)||(24465887-24465976)
chr7 (419-457)||(26804762-26804800)
chr7 (284-353)||(39145856-39145925)
chr7 (712-806)||(40281660-40281753)
chr7 (260-336)||(24813348-24813425)
chr7 (276-340)||(25276487-25276549)
chr7 (420-464)||(2759197-2759241)
chr7 (260-353)||(21591989-21592082)
chr7 (420-464)||(27347941-27347985)
chr7 (540-604)||(30246973-30247031)
chr7 (420-484)||(35960820-35960884)
chr7 (420-464)||(41317434-41317478)
chr7 (540-604)||(44512646-44512704)
chr7 (420-484)||(44848713-44848777)
chr7 (420-484)||(49091665-49091729)
chr7 (419-485)||(7069895-7069962)
chr7 (419-485)||(8378503-8378570)
chr7 (540-607)||(8378625-8378686)
chr7 (719-762)||(22108117-22108160)
chr7 (719-762)||(22137128-22137171)
chr7 (419-485)||(34546879-34546946)
chr7 (569-604)||(34547007-34547042)
chr7 (719-762)||(40549877-40549920)
chr7 (719-762)||(40552155-40552198)
chr7 (569-604)||(44144010-44144045)
chr7 (259-347)||(27832487-27832576)
chr7 (444-485)||(7074902-7074943)
chr7 (256-336)||(24817199-24817280)
chr7 (420-457)||(43864375-43864412)
chr7 (444-485)||(44010775-44010816)
chr7 (420-484)||(47263682-47263744)
[»] chr8 (143 HSPs)
chr8 (419-900)||(15809080-15809554)
chr8 (419-900)||(3873868-3874346)
chr8 (419-900)||(28283220-28283695)
chr8 (419-806)||(32339263-32339645)
chr8 (419-900)||(608588-609070)
chr8 (419-895)||(43529994-43530451)
chr8 (419-895)||(41384616-41385080)
chr8 (419-806)||(24873180-24873564)
chr8 (419-762)||(27829299-27829632)
chr8 (419-762)||(28251566-28251900)
chr8 (419-762)||(14807753-14808097)
chr8 (419-762)||(15072712-15073047)
chr8 (419-762)||(27826988-27827321)
chr8 (419-759)||(22684652-22684996)
chr8 (419-895)||(41382542-41382998)
chr8 (419-762)||(4424020-4424354)
chr8 (419-762)||(18810710-18811043)
chr8 (419-762)||(44720845-44721179)
chr8 (419-762)||(15067983-15068317)
chr8 (419-762)||(27106896-27107230)
chr8 (419-724)||(43079639-43079938)
chr8 (419-762)||(30480502-30480836)
chr8 (419-724)||(43082009-43082309)
chr8 (419-788)||(14419189-14419549)
chr8 (423-720)||(27911055-27911345)
chr8 (423-720)||(27957474-27957764)
chr8 (419-762)||(1225168-1225503)
chr8 (419-788)||(13858483-13858842)
chr8 (419-762)||(18812895-18813217)
chr8 (419-762)||(36865539-36865873)
chr8 (419-762)||(25952523-25952857)
chr8 (423-762)||(5372179-5372510)
chr8 (423-762)||(33541413-33541721)
chr8 (511-762)||(14477278-14477520)
chr8 (419-789)||(15185713-15186070)
chr8 (419-762)||(21482324-21482647)
chr8 (419-670)||(15956051-15956294)
chr8 (426-720)||(21480554-21480832)
chr8 (568-788)||(5622881-5623096)
chr8 (665-867)||(181434-181632)
chr8 (419-789)||(31162188-31162549)
chr8 (419-720)||(3005629-3005922)
chr8 (583-762)||(26775203-26775378)
chr8 (597-762)||(35872555-35872711)
chr8 (259-356)||(32339707-32339804)
chr8 (649-762)||(12517248-12517359)
chr8 (256-356)||(18811105-18811206)
chr8 (258-356)||(4424416-4424514)
chr8 (484-637)||(181622-181772)
chr8 (260-356)||(15809616-15809711)
chr8 (419-622)||(31578275-31578476)
chr8 (660-762)||(3886153-3886251)
chr8 (256-356)||(27827383-27827483)
chr8 (419-625)||(31035252-31035457)
chr8 (258-356)||(22684489-22684590)
chr8 (260-356)||(18813279-18813376)
chr8 (260-356)||(27829694-27829790)
chr8 (537-720)||(37214317-37214505)
chr8 (259-356)||(43530513-43530610)
chr8 (260-356)||(3883436-3883532)
chr8 (588-767)||(31035064-31035238)
chr8 (419-549)||(2468128-2468259)
chr8 (258-344)||(28283060-28283146)
chr8 (278-356)||(44721241-44721318)
chr8 (259-353)||(35872300-35872395)
chr8 (259-356)||(3874391-3874488)
chr8 (260-356)||(609133-609230)
chr8 (260-344)||(24873039-24873124)
chr8 (260-353)||(28251410-28251504)
chr8 (256-353)||(15068378-15068476)
chr8 (260-353)||(15073108-15073202)
chr8 (260-353)||(33541255-33541349)
chr8 (580-762)||(2468261-2468431)
chr8 (488-704)||(31573794-31574000)
chr8 (260-353)||(14808157-14808252)
chr8 (460-533)||(35872480-35872553)
chr8 (419-475)||(37214263-37214319)
chr8 (276-344)||(43082383-43082450)
chr8 (257-347)||(2467976-2468066)
chr8 (275-353)||(30480364-30480442)
chr8 (256-353)||(41383060-41383158)
chr8 (260-347)||(15185564-15185652)
chr8 (260-347)||(27106747-27106835)
chr8 (259-353)||(25952916-25953011)
chr8 (274-353)||(36865935-36866014)
chr8 (276-344)||(43080012-43080079)
chr8 (256-353)||(14419031-14419129)
chr8 (267-347)||(13858341-13858422)
chr8 (259-351)||(14477648-14477741)
chr8 (260-347)||(3005486-3005572)
chr8 (420-484)||(4696625-4696689)
chr8 (420-484)||(9765848-9765912)
chr8 (258-344)||(15956358-15956445)
chr8 (427-622)||(17847661-17847848)
chr8 (420-484)||(26403259-26403323)
chr8 (259-353)||(37214108-37214203)
chr8 (419-607)||(16757267-16757449)
chr8 (256-347)||(21480900-21480994)
chr8 (426-483)||(28307571-28307628)
chr8 (420-484)||(6127225-6127289)
chr8 (420-484)||(7412345-7412409)
chr8 (420-484)||(23799606-23799670)
chr8 (420-484)||(31071258-31071322)
chr8 (860-900)||(32339212-32339252)
chr8 (419-485)||(4812487-4812554)
chr8 (540-607)||(9021228-9021289)
chr8 (540-607)||(16752643-16752704)
chr8 (419-533)||(16833771-16833886)
chr8 (420-483)||(19752424-19752487)
chr8 (419-485)||(25684758-25684825)
chr8 (540-607)||(28327908-28327969)
chr8 (540-607)||(28332631-28332692)
chr8 (419-485)||(28890881-28890948)
chr8 (540-607)||(28895502-28895563)
chr8 (259-353)||(41385142-41385234)
chr8 (276-349)||(5372043-5372117)
chr8 (569-607)||(17799568-17799606)
chr8 (260-332)||(21482724-21482798)
chr8 (721-762)||(6375991-6376032)
chr8 (430-529)||(6376215-6376315)
chr8 (517-607)||(13985176-13985262)
chr8 (444-485)||(29554810-29554851)
chr8 (540-604)||(590797-590855)
chr8 (420-484)||(5702512-5702576)
chr8 (420-464)||(10930199-10930243)
chr8 (419-486)||(14477519-14477587)
chr8 (420-464)||(15212910-15212954)
chr8 (420-484)||(19175783-19175847)
chr8 (420-464)||(27811402-27811446)
chr8 (540-604)||(33032657-33032715)
chr8 (420-464)||(33352274-33352318)
chr8 (420-464)||(40321204-40321248)
chr8 (421-464)||(4733830-4733873)
chr8 (540-607)||(4812608-4812669)
chr8 (568-622)||(13985956-13986011)
chr8 (734-789)||(17847504-17847558)
chr8 (419-485)||(28328023-28328090)
chr8 (569-604)||(29554929-29554964)
chr8 (273-347)||(31162612-31162686)
chr8 (580-622)||(33839077-33839120)
chr8 (257-305)||(2467877-2467926)
chr8 (570-622)||(11701102-11701155)
chr8 (423-464)||(40221869-40221910)
[»] chr4 (232 HSPs)
chr4 (419-895)||(24348081-24348552)
chr4 (419-900)||(22132391-22132869)
chr4 (419-892)||(17662244-17662700)
chr4 (419-900)||(22134617-22135101)
chr4 (419-891)||(14787428-14787894)
chr4 (419-900)||(44599837-44600310)
chr4 (419-759)||(8631418-8631753)
chr4 (419-890)||(53404998-53405467)
chr4 (419-762)||(37089371-37089707)
chr4 (419-806)||(18709163-18709548)
chr4 (424-842)||(47210756-47211159)
chr4 (419-762)||(38409199-38409538)
chr4 (419-762)||(11006236-11006574)
chr4 (424-895)||(56030312-56030770)
chr4 (419-759)||(40637077-40637408)
chr4 (419-762)||(22044390-22044723)
chr4 (419-762)||(22046685-22047018)
chr4 (419-762)||(24888796-24889130)
chr4 (419-762)||(9148251-9148586)
chr4 (419-762)||(11434955-11435288)
chr4 (419-762)||(22800861-22801195)
chr4 (419-762)||(22802733-22803067)
chr4 (419-762)||(7941319-7941657)
chr4 (419-759)||(2484872-2485203)
chr4 (419-762)||(11008567-11008903)
chr4 (419-762)||(47274727-47275059)
chr4 (419-762)||(48486319-48486653)
chr4 (419-762)||(51015246-51015579)
chr4 (419-762)||(5198420-5198754)
chr4 (419-762)||(36921492-36921828)
chr4 (419-759)||(6764842-6765178)
chr4 (419-762)||(40091414-40091748)
chr4 (419-759)||(14633323-14633652)
chr4 (419-762)||(18847153-18847486)
chr4 (419-762)||(36919583-36919920)
chr4 (419-762)||(24878989-24879324)
chr4 (419-762)||(24880451-24880786)
chr4 (419-759)||(47868404-47868735)
chr4 (479-762)||(5637524-5637802)
chr4 (419-720)||(31849598-31849894)
chr4 (419-762)||(38928176-38928511)
chr4 (419-887)||(19322571-19323029)
chr4 (419-762)||(9176473-9176807)
chr4 (419-762)||(16934142-16934476)
chr4 (419-762)||(9174145-9174479)
chr4 (419-762)||(22780372-22780714)
chr4 (419-762)||(22782737-22783079)
chr4 (477-762)||(3824627-3824906)
chr4 (419-762)||(16931788-16932122)
chr4 (419-762)||(19095882-19096217)
chr4 (423-788)||(33415491-33415845)
chr4 (419-762)||(36378292-36378627)
chr4 (419-762)||(12395844-12396178)
chr4 (440-779)||(13543937-13544272)
chr4 (419-762)||(619447-619780)
chr4 (419-762)||(12400806-12401140)
chr4 (429-722)||(16453345-16453634)
chr4 (419-685)||(26085976-26086236)
chr4 (419-762)||(37313064-37313399)
chr4 (419-760)||(41997494-41997826)
chr4 (622-895)||(5100866-5101133)
chr4 (419-788)||(18537472-18537829)
chr4 (419-682)||(36380425-36380684)
chr4 (498-789)||(52942537-52942806)
chr4 (419-762)||(18409346-18409679)
chr4 (419-645)||(16455354-16455576)
chr4 (419-558)||(5635475-5635614)
chr4 (419-762)||(8756249-8756583)
chr4 (525-762)||(3937314-3937541)
chr4 (419-559)||(11437557-11437696)
chr4 (419-569)||(4215490-4215640)
chr4 (419-762)||(18534830-18535162)
chr4 (535-762)||(6132873-6133090)
chr4 (419-678)||(38890223-38890476)
chr4 (423-610)||(13547302-13547484)
chr4 (419-675)||(27499128-27499376)
chr4 (419-616)||(2891433-2891626)
chr4 (430-789)||(15032557-15032896)
chr4 (597-762)||(38270158-38270319)
chr4 (597-762)||(24446756-24446912)
chr4 (419-623)||(12102221-12102423)
chr4 (419-704)||(28453742-28454018)
chr4 (419-552)||(5101130-5101262)
chr4 (736-895)||(30136438-30136596)
chr4 (258-356)||(8631258-8631355)
chr4 (259-356)||(24348597-24348693)
chr4 (419-670)||(30136640-30136884)
chr4 (260-356)||(2484715-2484810)
chr4 (260-356)||(5635318-5635413)
chr4 (256-356)||(9176311-9176410)
chr4 (260-356)||(31849440-31849535)
chr4 (419-789)||(25357610-25357977)
chr4 (641-719)||(2891356-2891434)
chr4 (259-356)||(47868797-47868895)
chr4 (259-356)||(9173986-9174082)
chr4 (256-356)||(11008404-11008504)
chr4 (260-356)||(5198800-5198895)
chr4 (260-356)||(7941719-7941814)
chr4 (257-356)||(11006091-11006190)
chr4 (260-344)||(26085818-26085902)
chr4 (431-619)||(3982186-3982374)
chr4 (419-607)||(16185833-16186018)
chr4 (256-356)||(22046522-22046623)
chr4 (419-758)||(9863712-9864047)
chr4 (278-356)||(22132248-22132326)
chr4 (260-353)||(17662092-17662184)
chr4 (276-356)||(11435350-11435430)
chr4 (256-353)||(14789269-14789367)
chr4 (256-353)||(22802573-22802671)
chr4 (426-785)||(10112847-10113198)
chr4 (259-356)||(11437758-11437856)
chr4 (260-356)||(37089212-37089309)
chr4 (260-356)||(9148631-9148727)
chr4 (460-623)||(31983567-31983727)
chr4 (259-353)||(24446501-24446596)
chr4 (816-895)||(38890516-38890596)
chr4 (257-356)||(47210634-47210733)
chr4 (259-353)||(49088950-49089045)
chr4 (276-356)||(51015641-51015720)
chr4 (260-353)||(14787274-14787368)
chr4 (256-353)||(36921334-36921432)
chr4 (260-349)||(38928024-38928114)
chr4 (259-347)||(3937125-3937212)
chr4 (278-356)||(22134476-22134553)
chr4 (260-347)||(6765247-6765335)
chr4 (260-356)||(14633714-14633810)
chr4 (276-356)||(18847549-18847627)
chr4 (259-343)||(22780211-22780296)
chr4 (256-344)||(22782573-22782662)
chr4 (276-356)||(22044249-22044328)
chr4 (260-353)||(24889192-24889286)
chr4 (263-353)||(36919432-36919523)
chr4 (258-356)||(16931629-16931727)
chr4 (260-353)||(33415334-33415429)
chr4 (259-356)||(44599679-44599775)
chr4 (419-505)||(47563009-47563095)
chr4 (257-353)||(4215697-4215795)
chr4 (275-356)||(38409600-38409680)
chr4 (260-353)||(40637470-40637566)
chr4 (257-347)||(53405538-53405629)
chr4 (260-353)||(2891686-2891780)
chr4 (260-349)||(3824447-3824540)
chr4 (260-353)||(22800705-22800799)
chr4 (256-353)||(36378685-36378781)
chr4 (426-622)||(47150898-47151092)
chr4 (259-353)||(40091258-40091354)
chr4 (461-704)||(40998990-40999226)
chr4 (259-353)||(52942328-52942425)
chr4 (460-533)||(24446681-24446754)
chr4 (259-353)||(5101310-5101405)
chr4 (256-349)||(16453706-16453800)
chr4 (260-349)||(16455624-16455714)
chr4 (260-353)||(37312924-37313018)
chr4 (275-353)||(47563153-47563231)
chr4 (419-531)||(49088791-49088905)
chr4 (419-485)||(14789427-14789495)
chr4 (260-347)||(5664635-5664722)
chr4 (420-484)||(10047383-10047447)
chr4 (276-344)||(18709021-18709088)
chr4 (260-347)||(19323090-19323177)
chr4 (420-484)||(39245998-39246062)
chr4 (258-332)||(38269993-38270068)
chr4 (454-704)||(9022362-9022605)
chr4 (257-347)||(18409189-18409281)
chr4 (266-347)||(18534689-18534770)
chr4 (266-353)||(27499442-27499530)
chr4 (420-484)||(5269220-5269284)
chr4 (260-347)||(12102479-12102566)
chr4 (258-332)||(8756101-8756176)
chr4 (256-356)||(16933984-16934081)
chr4 (421-484)||(36315258-36315321)
chr4 (421-484)||(36329467-36329530)
chr4 (419-485)||(6133105-6133171)
chr4 (276-353)||(6133231-6133308)
chr4 (419-607)||(11853549-11853731)
chr4 (267-347)||(15032401-15032480)
chr4 (580-644)||(10114443-10114505)
chr4 (281-353)||(13547548-13547621)
chr4 (688-789)||(16186099-16186197)
chr4 (260-347)||(56030857-56030945)
chr4 (420-484)||(5396700-5396764)
chr4 (260-330)||(19096298-19096370)
chr4 (420-484)||(25862051-25862115)
chr4 (420-484)||(31985663-31985726)
chr4 (267-353)||(36380742-36380827)
chr4 (420-484)||(38152468-38152532)
chr4 (276-347)||(41997887-41997958)
chr4 (420-472)||(54867188-54867239)
chr4 (421-484)||(6743444-6743507)
chr4 (540-607)||(7050378-7050439)
chr4 (826-895)||(9022182-9022244)
chr4 (257-347)||(18537322-18537412)
chr4 (419-485)||(18587082-18587149)
chr4 (419-458)||(52942487-52942526)
chr4 (569-607)||(55822265-55822303)
chr4 (259-330)||(619297-619370)
chr4 (419-604)||(31300427-31300606)
chr4 (281-333)||(47275137-47275190)
chr4 (419-455)||(3937273-3937309)
chr4 (540-604)||(4556180-4556238)
chr4 (540-604)||(4558314-4558372)
chr4 (420-484)||(5143263-5143327)
chr4 (540-604)||(8529270-8529328)
chr4 (420-464)||(12739550-12739594)
chr4 (540-604)||(15316961-15317019)
chr4 (568-604)||(16489352-16489388)
chr4 (420-484)||(16623322-16623386)
chr4 (540-604)||(18586969-18587027)
chr4 (568-604)||(25699752-25699788)
chr4 (420-464)||(26175636-26175680)
chr4 (420-464)||(36463389-36463433)
chr4 (420-464)||(48893638-48893682)
chr4 (569-604)||(4884877-4884912)
chr4 (419-485)||(4884990-4885057)
chr4 (568-607)||(5336925-5336964)
chr4 (419-485)||(8529383-8529450)
chr4 (569-604)||(15831144-15831179)
chr4 (734-789)||(28453660-28453715)
chr4 (712-762)||(52043712-52043763)
chr4 (568-622)||(54906722-54906777)
chr4 (569-607)||(4570094-4570132)
chr4 (257-353)||(12395687-12395784)
chr4 (257-353)||(12400649-12400746)
chr4 (712-762)||(22295153-22295203)
chr4 (315-353)||(24879386-24879423)
chr4 (444-485)||(4556085-4556126)
chr4 (688-762)||(12102090-12102162)
chr4 (444-485)||(15831257-15831298)
chr4 (689-722)||(16455323-16455356)
chr4 (430-483)||(34495853-34495906)
chr4 (444-485)||(36769595-36769636)
chr4 (629-704)||(54906631-54906702)
[»] chr1 (208 HSPs)
chr1 (419-900)||(31735522-31735997)
chr1 (419-900)||(47906074-47906550)
chr1 (460-900)||(21948230-21948665)
chr1 (419-900)||(27339132-27339608)
chr1 (419-900)||(27336941-27337414)
chr1 (419-900)||(39931880-39932354)
chr1 (419-900)||(15294835-15295321)
chr1 (419-900)||(24325465-24325943)
chr1 (419-900)||(9463245-9463722)
chr1 (419-900)||(46431707-46432201)
chr1 (419-895)||(9459418-9459890)
chr1 (419-895)||(2510326-2510800)
chr1 (419-895)||(17324637-17325104)
chr1 (419-762)||(51749985-51750319)
chr1 (419-762)||(28840624-28840959)
chr1 (419-884)||(28998254-28998710)
chr1 (419-884)||(29003970-29004426)
chr1 (17-356)||(2617859-2618199)
chr1 (477-895)||(48664975-48665400)
chr1 (419-758)||(10399829-10400159)
chr1 (419-762)||(15823492-15823826)
chr1 (423-759)||(2617465-2617792)
chr1 (419-762)||(12302506-12302845)
chr1 (419-762)||(28842439-28842774)
chr1 (419-762)||(6822961-6823294)
chr1 (419-762)||(47179655-47179992)
chr1 (419-762)||(13215027-13215366)
chr1 (419-762)||(13761783-13762116)
chr1 (419-762)||(20302405-20302738)
chr1 (419-895)||(2949233-2949692)
chr1 (419-792)||(6995701-6996065)
chr1 (419-762)||(47177304-47177641)
chr1 (419-762)||(16226113-16226447)
chr1 (419-762)||(38925482-38925813)
chr1 (419-762)||(41646866-41647200)
chr1 (419-762)||(51752311-51752643)
chr1 (419-789)||(39462439-39462799)
chr1 (419-762)||(50307547-50307882)
chr1 (419-762)||(20291403-20291736)
chr1 (419-759)||(14097970-14098302)
chr1 (419-720)||(18839571-18839868)
chr1 (419-758)||(18307059-18307389)
chr1 (419-762)||(28207069-28207401)
chr1 (419-762)||(50076673-50077007)
chr1 (419-719)||(16428638-16428934)
chr1 (419-722)||(4131376-4131678)
chr1 (419-762)||(11457476-11457810)
chr1 (419-762)||(17186128-17186463)
chr1 (419-762)||(25251275-25251610)
chr1 (419-762)||(50078821-50079156)
chr1 (427-762)||(9241094-9241421)
chr1 (419-762)||(3579618-3579953)
chr1 (419-758)||(25127815-25128153)
chr1 (419-720)||(31425016-31425316)
chr1 (419-762)||(31489861-31490192)
chr1 (419-717)||(6756514-6756808)
chr1 (422-762)||(47451594-47451919)
chr1 (500-762)||(6823830-6824091)
chr1 (419-762)||(50248571-50248907)
chr1 (419-788)||(17318814-17319167)
chr1 (419-789)||(31422861-31423236)
chr1 (419-762)||(17324011-17324344)
chr1 (419-789)||(42922153-42922512)
chr1 (419-711)||(40133937-40134225)
chr1 (419-762)||(14183591-14183921)
chr1 (419-713)||(16432396-16432676)
chr1 (419-637)||(16231630-16231842)
chr1 (431-789)||(8347284-8347631)
chr1 (419-608)||(23785935-23786119)
chr1 (419-612)||(51757623-51757810)
chr1 (419-619)||(16429042-16429238)
chr1 (446-762)||(18800600-18800904)
chr1 (419-558)||(23816027-23816166)
chr1 (419-637)||(25248552-25248766)
chr1 (444-680)||(15669419-15669648)
chr1 (511-884)||(26520206-26520580)
chr1 (430-789)||(49495222-49495561)
chr1 (419-624)||(6115103-6115304)
chr1 (419-789)||(8349051-8349411)
chr1 (419-758)||(13125457-13125787)
chr1 (256-356)||(20291798-20291898)
chr1 (259-344)||(13358927-13359012)
chr1 (259-356)||(51750381-51750477)
chr1 (260-356)||(13447117-13447212)
chr1 (260-356)||(10399669-10399767)
chr1 (419-762)||(30790401-30790729)
chr1 (260-356)||(15294678-15294773)
chr1 (260-356)||(20302783-20302879)
chr1 (260-356)||(13762178-13762275)
chr1 (256-344)||(16226522-16226611)
chr1 (260-356)||(24326005-24326101)
chr1 (259-344)||(28842848-28842932)
chr1 (419-494)||(13358778-13358853)
chr1 (419-527)||(15916562-15916672)
chr1 (260-353)||(23816230-23816323)
chr1 (419-622)||(30738627-30738830)
chr1 (260-356)||(31735365-31735461)
chr1 (256-356)||(47177704-47177805)
chr1 (256-352)||(51757881-51757977)
chr1 (259-353)||(14097814-14097910)
chr1 (816-879)||(6115478-6115541)
chr1 (419-758)||(26613239-26613571)
chr1 (260-353)||(39462861-39462956)
chr1 (258-356)||(46431546-46431644)
chr1 (419-626)||(16561544-16561749)
chr1 (260-353)||(47906611-47906704)
chr1 (826-895)||(4131690-4131758)
chr1 (260-344)||(16231917-16232002)
chr1 (260-356)||(23786182-23786278)
chr1 (419-704)||(27916500-27916778)
chr1 (256-353)||(50078631-50078730)
chr1 (665-754)||(25248756-25248841)
chr1 (260-353)||(2949079-2949173)
chr1 (256-353)||(28206908-28207007)
chr1 (260-353)||(50248417-50248511)
chr1 (442-622)||(155788-155963)
chr1 (276-353)||(15823889-15823967)
chr1 (274-355)||(2510200-2510280)
chr1 (260-344)||(9459277-9459361)
chr1 (260-344)||(9463104-9463188)
chr1 (664-762)||(16231547-16231641)
chr1 (260-356)||(47180055-47180152)
chr1 (258-353)||(50307387-50307484)
chr1 (259-352)||(51752715-51752806)
chr1 (259-353)||(31490252-31490346)
chr1 (828-895)||(45693834-45693901)
chr1 (260-353)||(3579431-3579524)
chr1 (276-353)||(27336801-27336879)
chr1 (260-353)||(4131221-4131316)
chr1 (259-350)||(6995539-6995631)
chr1 (260-347)||(39932426-39932514)
chr1 (256-347)||(14183451-14183542)
chr1 (833-900)||(6115532-6115599)
chr1 (256-353)||(25251117-25251215)
chr1 (256-353)||(27338969-27339070)
chr1 (419-604)||(21353347-21353525)
chr1 (265-352)||(11457327-11457415)
chr1 (256-347)||(16429299-16429391)
chr1 (259-353)||(18839928-18840023)
chr1 (260-347)||(30790250-30790337)
chr1 (260-353)||(12302349-12302446)
chr1 (260-353)||(25248398-25248492)
chr1 (260-353)||(30780386-30780482)
chr1 (477-644)||(28279326-28279489)
chr1 (256-353)||(31424858-31424956)
chr1 (276-353)||(9240951-9241028)
chr1 (256-353)||(28998090-28998191)
chr1 (256-353)||(29003806-29003907)
chr1 (258-349)||(38925326-38925420)
chr1 (256-347)||(8348901-8348991)
chr1 (580-704)||(26332719-26332836)
chr1 (258-353)||(41647260-41647357)
chr1 (820-895)||(6996152-6996221)
chr1 (420-484)||(13598402-13598466)
chr1 (260-347)||(15916734-15916821)
chr1 (420-484)||(16124545-16124609)
chr1 (420-484)||(37069774-37069838)
chr1 (259-353)||(47451971-47452066)
chr1 (420-484)||(47703965-47704029)
chr1 (580-758)||(13127790-13127959)
chr1 (260-353)||(13215424-13215518)
chr1 (266-353)||(17324484-17324573)
chr1 (420-483)||(19072932-19072995)
chr1 (420-483)||(19120822-19120885)
chr1 (260-353)||(31422706-31422800)
chr1 (446-528)||(43104332-43104414)
chr1 (420-483)||(47098854-47098917)
chr1 (830-895)||(6997336-6997395)
chr1 (568-622)||(26332634-26332688)
chr1 (420-485)||(21536597-21536662)
chr1 (423-484)||(29651818-29651879)
chr1 (420-484)||(9476265-9476329)
chr1 (419-509)||(13127687-13127779)
chr1 (420-480)||(26644930-26644990)
chr1 (288-344)||(28841033-28841088)
chr1 (540-607)||(2232597-2232658)
chr1 (568-607)||(4144826-4144865)
chr1 (568-622)||(14353047-14353102)
chr1 (258-347)||(17185977-17186067)
chr1 (260-353)||(18307449-18307543)
chr1 (420-483)||(47102871-47102934)
chr1 (423-481)||(3281715-3281773)
chr1 (420-464)||(834167-834211)
chr1 (540-604)||(2401342-2401400)
chr1 (420-464)||(3847121-3847165)
chr1 (540-604)||(9526469-9526527)
chr1 (266-340)||(25128225-25128301)
chr1 (540-604)||(25134074-25134132)
chr1 (266-347)||(26519295-26519373)
chr1 (420-484)||(27104401-27104465)
chr1 (420-464)||(28220226-28220270)
chr1 (420-464)||(28265554-28265598)
chr1 (420-483)||(775676-775739)
chr1 (419-481)||(2232710-2232773)
chr1 (419-485)||(9526582-9526649)
chr1 (852-895)||(11693580-11693623)
chr1 (852-895)||(14352799-14352842)
chr1 (568-607)||(14997040-14997079)
chr1 (717-804)||(16561373-16561459)
chr1 (283-353)||(17324414-17324484)
chr1 (420-483)||(32889443-32889506)
chr1 (580-622)||(49959129-49959172)
chr1 (764-806)||(14352877-14352919)
chr1 (266-347)||(18800429-18800510)
chr1 (728-762)||(43104105-43104139)
chr1 (420-458)||(45644354-45644392)
chr1 (294-347)||(6114989-6115041)
chr1 (269-336)||(16561819-16561885)
[»] chr2 (161 HSPs)
chr2 (419-900)||(23452236-23452711)
chr2 (419-900)||(42452567-42453036)
chr2 (419-900)||(35215585-35216066)
chr2 (419-900)||(35217962-35218447)
chr2 (419-895)||(42923508-42923971)
chr2 (419-762)||(19504345-19504678)
chr2 (419-762)||(19502010-19502344)
chr2 (419-762)||(27104721-27105053)
chr2 (419-759)||(45279983-45280315)
chr2 (419-762)||(21520692-21521028)
chr2 (419-762)||(42064437-42064771)
chr2 (419-762)||(13910044-13910377)
chr2 (419-762)||(40032052-40032391)
chr2 (419-762)||(19007562-19007896)
chr2 (419-762)||(24162222-24162545)
chr2 (419-789)||(6264147-6264504)
chr2 (419-762)||(22287335-22287669)
chr2 (419-762)||(6258816-6259148)
chr2 (419-762)||(43623579-43623901)
chr2 (419-762)||(11739558-11739893)
chr2 (419-762)||(28196559-28196891)
chr2 (443-762)||(45239000-45239314)
chr2 (419-720)||(17848403-17848696)
chr2 (419-720)||(34979576-34979874)
chr2 (419-762)||(17849039-17849373)
chr2 (419-762)||(31732775-31733098)
chr2 (419-762)||(14837195-14837524)
chr2 (419-630)||(5375345-5375550)
chr2 (419-717)||(44289066-44289360)
chr2 (419-761)||(3022086-3022428)
chr2 (498-762)||(15539553-15539808)
chr2 (419-762)||(11578106-11578437)
chr2 (419-608)||(36558863-36559047)
chr2 (419-608)||(36561140-36561324)
chr2 (419-762)||(18800312-18800635)
chr2 (426-777)||(20146613-20146955)
chr2 (583-762)||(22163106-22163280)
chr2 (607-762)||(22407591-22407742)
chr2 (580-721)||(38020161-38020302)
chr2 (419-720)||(22874102-22874387)
chr2 (419-561)||(22407453-22407595)
chr2 (419-608)||(45332180-45332364)
chr2 (430-670)||(28459200-28459435)
chr2 (627-759)||(5377631-5377763)
chr2 (419-703)||(17897244-17897519)
chr2 (423-549)||(7462950-7463077)
chr2 (266-356)||(23452084-23452174)
chr2 (419-624)||(40699429-40699632)
chr2 (259-347)||(19501842-19501930)
chr2 (256-347)||(19504174-19504265)
chr2 (419-539)||(22707750-22707872)
chr2 (419-509)||(22163021-22163111)
chr2 (258-353)||(42453798-42453892)
chr2 (262-356)||(45279844-45279938)
chr2 (419-685)||(35107294-35107552)
chr2 (256-356)||(36560977-36561077)
chr2 (280-356)||(13909907-13909982)
chr2 (263-356)||(27105115-27105209)
chr2 (260-356)||(36558721-36558817)
chr2 (419-789)||(37962940-37963287)
chr2 (256-353)||(21520530-21520629)
chr2 (419-533)||(23870958-23871072)
chr2 (490-670)||(27136195-27136368)
chr2 (260-353)||(28459038-28459131)
chr2 (260-353)||(43623423-43623518)
chr2 (260-353)||(19007956-19008051)
chr2 (260-352)||(17849434-17849528)
chr2 (485-607)||(20589763-20589881)
chr2 (260-349)||(22162869-22162959)
chr2 (258-353)||(22707593-22707690)
chr2 (260-356)||(24162063-24162160)
chr2 (259-356)||(45332019-45332116)
chr2 (734-897)||(27583631-27583786)
chr2 (259-353)||(22287180-22287275)
chr2 (276-356)||(35217827-35217906)
chr2 (666-762)||(38020065-38020157)
chr2 (535-637)||(38414196-38414291)
chr2 (260-353)||(14837584-14837679)
chr2 (568-621)||(27583482-27583535)
chr2 (281-353)||(34979456-34979528)
chr2 (287-356)||(42064816-42064884)
chr2 (281-353)||(42923373-42923446)
chr2 (428-704)||(43139356-43139623)
chr2 (259-353)||(3022488-3022583)
chr2 (293-353)||(5375225-5375284)
chr2 (420-484)||(14699036-14699100)
chr2 (276-332)||(35215450-35215506)
chr2 (444-622)||(17921754-17921927)
chr2 (719-789)||(20147038-20147108)
chr2 (276-353)||(38020396-38020473)
chr2 (420-484)||(8390179-8390243)
chr2 (420-484)||(13569332-13569396)
chr2 (444-604)||(17943540-17943692)
chr2 (420-484)||(20522224-20522288)
chr2 (259-353)||(28196951-28197046)
chr2 (256-353)||(6263989-6264087)
chr2 (568-623)||(26345661-26345716)
chr2 (259-340)||(45238841-45238924)
chr2 (420-482)||(1345572-1345634)
chr2 (419-607)||(2736205-2736387)
chr2 (257-353)||(11739418-11739515)
chr2 (291-353)||(17848754-17848816)
chr2 (816-884)||(34575527-34575588)
chr2 (266-353)||(6258668-6258756)
chr2 (260-353)||(7462789-7462884)
chr2 (260-347)||(22874431-22874519)
chr2 (420-485)||(34682362-34682427)
chr2 (712-789)||(40699205-40699282)
chr2 (420-484)||(8040064-8040128)
chr2 (420-484)||(10445473-10445537)
chr2 (420-464)||(17057369-17057413)
chr2 (420-464)||(17085352-17085396)
chr2 (420-484)||(28259206-28259270)
chr2 (420-484)||(33528650-33528714)
chr2 (540-607)||(17462436-17462497)
chr2 (419-485)||(17462551-17462618)
chr2 (540-607)||(20054886-20054947)
chr2 (540-607)||(22712637-22712698)
chr2 (540-607)||(22717346-22717407)
chr2 (540-607)||(39686983-39687044)
chr2 (540-607)||(45567409-45567470)
chr2 (419-485)||(45679838-45679905)
chr2 (569-607)||(2740941-2740979)
chr2 (257-336)||(20146456-20146535)
chr2 (712-762)||(20589583-20589633)
chr2 (444-485)||(2741056-2741097)
chr2 (689-762)||(12342673-12342743)
chr2 (852-885)||(28568584-28568617)
chr2 (444-485)||(33670992-33671033)
chr2 (420-464)||(723744-723788)
chr2 (540-604)||(12781342-12781400)
chr2 (419-533)||(13828340-13828456)
chr2 (420-484)||(17865207-17865271)
chr2 (540-604)||(17932637-17932695)
chr2 (420-484)||(21629948-21630011)
chr2 (540-604)||(27517760-27517818)
chr2 (420-484)||(33118140-33118204)
chr2 (420-464)||(34139770-34139814)
chr2 (420-484)||(34388862-34388926)
chr2 (665-720)||(38414281-38414330)
chr2 (420-464)||(39284960-39285004)
chr2 (420-484)||(39482935-39482999)
chr2 (420-467)||(2838076-2838123)
chr2 (568-622)||(7502975-7503030)
chr2 (420-463)||(11151591-11151634)
chr2 (260-347)||(20592395-20592484)
chr2 (540-607)||(28458949-28459011)
chr2 (419-485)||(30479110-30479177)
chr2 (580-622)||(34575265-34575308)
chr2 (540-607)||(39680045-39680106)
chr2 (419-485)||(39680160-39680227)
chr2 (419-485)||(39687098-39687165)
chr2 (570-608)||(10942658-10942696)
chr2 (570-608)||(10948527-10948565)
chr2 (260-347)||(11577957-11578045)
chr2 (569-607)||(20050166-20050204)
chr2 (518-556)||(38020311-38020349)
chr2 (569-607)||(38190997-38191035)
chr2 (444-485)||(12781246-12781287)
chr2 (571-604)||(33674551-33674584)
chr2 (663-704)||(41304627-41304667)
[»] chr3 (258 HSPs)
chr3 (419-900)||(4103893-4104365)
chr3 (419-900)||(25533225-25533702)
chr3 (419-900)||(458068-458544)
chr3 (419-900)||(746540-747017)
chr3 (419-900)||(455691-456167)
chr3 (419-900)||(42990070-42990564)
chr3 (419-900)||(10621527-10622009)
chr3 (419-895)||(53917661-53918127)
chr3 (419-895)||(1313205-1313669)
chr3 (419-895)||(51943165-51943630)
chr3 (419-895)||(53915493-53915959)
chr3 (419-762)||(10084386-10084724)
chr3 (419-895)||(42992076-42992530)
chr3 (419-762)||(38889965-38890300)
chr3 (419-759)||(4308278-4308609)
chr3 (419-762)||(11170330-11170664)
chr3 (419-762)||(18099167-18099501)
chr3 (419-759)||(43228220-43228551)
chr3 (419-759)||(43226015-43226345)
chr3 (419-762)||(3859454-3859787)
chr3 (422-762)||(18096900-18097232)
chr3 (419-762)||(10191307-10191644)
chr3 (419-762)||(10956024-10956358)
chr3 (419-724)||(30005801-30006101)
chr3 (419-762)||(45882865-45883200)
chr3 (419-759)||(51727004-51727334)
chr3 (419-762)||(5191579-5191911)
chr3 (419-762)||(10958320-10958654)
chr3 (419-759)||(27101178-27101513)
chr3 (419-759)||(9604604-9604940)
chr3 (419-762)||(6063443-6063779)
chr3 (419-762)||(22114302-22114636)
chr3 (419-762)||(38210294-38210630)
chr3 (419-762)||(25388824-25389165)
chr3 (419-759)||(50493928-50494259)
chr3 (419-762)||(1626680-1627014)
chr3 (419-762)||(5522624-5522946)
chr3 (463-806)||(6561693-6562028)
chr3 (419-762)||(6065793-6066128)
chr3 (419-762)||(43423460-43423794)
chr3 (419-680)||(1321483-1321739)
chr3 (419-762)||(26720474-26720807)
chr3 (420-762)||(32264035-32264374)
chr3 (419-762)||(3314610-3314945)
chr3 (419-789)||(24979607-24979968)
chr3 (419-762)||(43421412-43421746)
chr3 (419-720)||(28101999-28102295)
chr3 (419-762)||(18162590-18162923)
chr3 (419-762)||(47148892-47149231)
chr3 (419-762)||(5926761-5927095)
chr3 (419-895)||(27635655-27636089)
chr3 (460-724)||(29956646-29956905)
chr3 (419-762)||(880448-880783)
chr3 (419-762)||(36011753-36012087)
chr3 (422-759)||(35917944-35918277)
chr3 (419-694)||(28413029-28413299)
chr3 (419-762)||(12267972-12268297)
chr3 (419-762)||(48361668-48362001)
chr3 (419-762)||(53468450-53468786)
chr3 (419-762)||(15780786-15781139)
chr3 (419-662)||(7606585-7606822)
chr3 (592-900)||(41848922-41849244)
chr3 (419-788)||(28761424-28761784)
chr3 (419-757)||(32219026-32219345)
chr3 (419-758)||(39715400-39715725)
chr3 (419-779)||(51674763-51675103)
chr3 (428-762)||(889779-890102)
chr3 (514-762)||(35777347-35777587)
chr3 (423-633)||(25688161-25688367)
chr3 (419-671)||(6484372-6484620)
chr3 (419-762)||(54691571-54691904)
chr3 (420-762)||(53591121-53591442)
chr3 (419-620)||(11168165-11168361)
chr3 (419-623)||(5886261-5886458)
chr3 (419-623)||(5899734-5899931)
chr3 (524-762)||(28100143-28100372)
chr3 (419-789)||(23633359-23633713)
chr3 (419-762)||(31151273-31151605)
chr3 (419-720)||(4666489-4666774)
chr3 (519-762)||(28180950-28181182)
chr3 (419-636)||(6231849-6232060)
chr3 (426-677)||(13420189-13420432)
chr3 (426-786)||(53597143-53597491)
chr3 (616-762)||(11163076-11163218)
chr3 (502-789)||(23636926-23637200)
chr3 (419-713)||(561771-562058)
chr3 (467-720)||(54884121-54884367)
chr3 (419-677)||(17795269-17795519)
chr3 (419-677)||(19103709-19103959)
chr3 (537-762)||(28137421-28137626)
chr3 (419-552)||(47701668-47701801)
chr3 (419-677)||(25635391-25635642)
chr3 (426-712)||(36871304-36871583)
chr3 (256-356)||(11168423-11168523)
chr3 (630-762)||(47701798-47701926)
chr3 (259-356)||(11170692-11170789)
chr3 (256-356)||(5191973-5192072)
chr3 (260-356)||(10955867-10955962)
chr3 (491-684)||(1673975-1674160)
chr3 (631-762)||(6231375-6231502)
chr3 (419-606)||(3306839-3307020)
chr3 (260-356)||(10084229-10084324)
chr3 (256-356)||(10958159-10958258)
chr3 (260-344)||(22114143-22114227)
chr3 (419-561)||(24181498-24181642)
chr3 (580-762)||(24177205-24177380)
chr3 (257-356)||(51726844-51726942)
chr3 (259-356)||(1321801-1321898)
chr3 (258-356)||(7606441-7606539)
chr3 (256-344)||(6065629-6065718)
chr3 (260-356)||(10191152-10191247)
chr3 (260-344)||(41849387-41849470)
chr3 (277-356)||(38890362-38890441)
chr3 (260-342)||(5522466-5522548)
chr3 (256-352)||(18099006-18099104)
chr3 (260-344)||(747092-747177)
chr3 (641-779)||(3306708-3306842)
chr3 (256-355)||(43226401-43226499)
chr3 (256-332)||(456253-456329)
chr3 (257-356)||(25533747-25533845)
chr3 (257-353)||(32219407-32219506)
chr3 (256-353)||(3315005-3315104)
chr3 (260-353)||(18096740-18096835)
chr3 (258-332)||(458630-458704)
chr3 (267-356)||(53893900-53893989)
chr3 (256-344)||(42990633-42990721)
chr3 (259-356)||(25389229-25389327)
chr3 (419-495)||(41849243-41849319)
chr3 (260-353)||(24980031-24980126)
chr3 (419-486)||(35919112-35919179)
chr3 (269-355)||(43228610-43228696)
chr3 (419-622)||(1620457-1620657)
chr3 (257-353)||(18162985-18163083)
chr3 (260-353)||(1313727-1313822)
chr3 (260-353)||(4308122-4308216)
chr3 (256-349)||(5886528-5886622)
chr3 (258-344)||(6063281-6063368)
chr3 (419-533)||(25634033-25634148)
chr3 (260-353)||(36012149-36012243)
chr3 (256-353)||(43423304-43423402)
chr3 (419-486)||(53894054-53894121)
chr3 (260-353)||(9604447-9604540)
chr3 (256-344)||(10621362-10621452)
chr3 (260-353)||(27635497-27635592)
chr3 (260-356)||(50494321-50494417)
chr3 (254-353)||(53917500-53917600)
chr3 (568-640)||(4560425-4560497)
chr3 (260-349)||(5900001-5900091)
chr3 (258-353)||(6232119-6232210)
chr3 (568-705)||(13419864-13419995)
chr3 (260-353)||(45883263-45883357)
chr3 (259-355)||(3859834-3859931)
chr3 (446-622)||(14634465-14634638)
chr3 (266-353)||(27101028-27101116)
chr3 (256-340)||(28101844-28101930)
chr3 (684-762)||(1321367-1321441)
chr3 (266-353)||(5926615-5926703)
chr3 (260-356)||(38210693-38210789)
chr3 (258-353)||(43421258-43421354)
chr3 (256-347)||(23633775-23633866)
chr3 (260-349)||(15781203-15781293)
chr3 (258-332)||(28412868-28412943)
chr3 (260-353)||(53915338-53915432)
chr3 (276-353)||(6484678-6484756)
chr3 (580-677)||(25633930-25634024)
chr3 (266-328)||(36957651-36957713)
chr3 (260-353)||(1626525-1626620)
chr3 (260-353)||(3307080-3307176)
chr3 (259-347)||(31151667-31151755)
chr3 (259-347)||(42992712-42992800)
chr3 (269-347)||(561633-561710)
chr3 (420-484)||(1736324-1736388)
chr3 (420-484)||(18552902-18552966)
chr3 (420-484)||(30709809-30709873)
chr3 (260-352)||(25687998-25688094)
chr3 (419-604)||(29913954-29914132)
chr3 (260-347)||(28761287-28761375)
chr3 (420-484)||(8370505-8370569)
chr3 (420-484)||(27974971-27975035)
chr3 (420-484)||(27986465-27986529)
chr3 (258-349)||(880082-880175)
chr3 (420-483)||(1417510-1417573)
chr3 (688-789)||(1618916-1619016)
chr3 (259-330)||(25635718-25635789)
chr3 (276-349)||(880313-880386)
chr3 (712-762)||(6719392-6719442)
chr3 (419-607)||(10094074-10094256)
chr3 (256-330)||(25634224-25634298)
chr3 (276-353)||(28181324-28181400)
chr3 (310-356)||(35919020-35919066)
chr3 (671-720)||(4560509-4560558)
chr3 (423-484)||(48438221-48438282)
chr3 (260-347)||(4103736-4103822)
chr3 (582-622)||(7768632-7768672)
chr3 (420-484)||(16264354-16264418)
chr3 (420-484)||(21711227-21711291)
chr3 (582-644)||(31021300-31021361)
chr3 (420-484)||(32143325-32143389)
chr3 (420-484)||(33386685-33386749)
chr3 (293-353)||(51943693-51943752)
chr3 (259-353)||(53591503-53591598)
chr3 (419-485)||(10100091-10100158)
chr3 (419-485)||(10200954-10201021)
chr3 (540-607)||(10201075-10201136)
chr3 (419-485)||(10897121-10897188)
chr3 (260-353)||(12267819-12267913)
chr3 (540-607)||(16462203-16462264)
chr3 (540-607)||(22626105-22626166)
chr3 (296-347)||(26720878-26720928)
chr3 (260-353)||(32263881-32263975)
chr3 (420-483)||(37466295-37466358)
chr3 (540-607)||(47883003-47883064)
chr3 (260-331)||(51674608-51674682)
chr3 (419-485)||(54193342-54193409)
chr3 (276-353)||(4666834-4666911)
chr3 (569-607)||(6303310-6303348)
chr3 (569-607)||(10100235-10100273)
chr3 (569-607)||(27544273-27544311)
chr3 (256-336)||(53597569-53597648)
chr3 (444-485)||(6303425-6303466)
chr3 (687-724)||(6719357-6719394)
chr3 (595-640)||(7606828-7606873)
chr3 (444-528)||(11007545-11007630)
chr3 (260-353)||(47148745-47148832)
chr3 (419-604)||(47878170-47878350)
chr3 (260-353)||(53468295-53468390)
chr3 (420-460)||(5236457-5236497)
chr3 (420-484)||(26298992-26299056)
chr3 (420-484)||(27452962-27453026)
chr3 (420-484)||(36029097-36029161)
chr3 (420-484)||(39040011-39040075)
chr3 (420-464)||(40913417-40913461)
chr3 (423-459)||(42992606-42992642)
chr3 (420-464)||(44331669-44331713)
chr3 (540-604)||(54193229-54193287)
chr3 (419-485)||(10208000-10208067)
chr3 (540-607)||(10208121-10208182)
chr3 (419-485)||(10612777-10612844)
chr3 (568-622)||(11066652-11066707)
chr3 (569-604)||(20031462-20031497)
chr3 (419-485)||(22625983-22626050)
chr3 (420-483)||(25795785-25795848)
chr3 (419-485)||(27544388-27544455)
chr3 (569-604)||(27762130-27762165)
chr3 (419-485)||(54188625-54188691)
chr3 (569-599)||(4535622-4535652)
chr3 (569-603)||(10949404-10949438)
chr3 (260-333)||(24181675-24181749)
chr3 (731-789)||(25635319-25635377)
chr3 (420-458)||(32744436-32744474)
chr3 (260-319)||(35917876-35917937)
chr3 (260-297)||(43228695-43228733)
chr3 (315-353)||(48361568-48361605)
chr3 (444-485)||(5858660-5858701)
chr3 (444-485)||(11079633-11079674)
chr3 (260-347)||(17795581-17795669)
chr3 (260-347)||(19104021-19104109)
chr3 (444-485)||(48390327-48390368)
[»] chr5 (185 HSPs)
chr5 (419-900)||(18466491-18466964)
chr5 (419-900)||(18468816-18469289)
chr5 (419-895)||(27910258-27910730)
chr5 (419-895)||(18511211-18511679)
chr5 (419-900)||(27912337-27912816)
chr5 (423-900)||(25803825-25804300)
chr5 (419-900)||(15552043-15552525)
chr5 (419-895)||(18509317-18509784)
chr5 (419-900)||(10586647-10587112)
chr5 (419-895)||(26097544-26098011)
chr5 (421-891)||(18596464-18596924)
chr5 (419-762)||(25921472-25921806)
chr5 (428-762)||(4236575-4236900)
chr5 (419-762)||(2174865-2175198)
chr5 (419-762)||(38882051-38882385)
chr5 (419-759)||(10529098-10529429)
chr5 (419-759)||(39854433-39854763)
chr5 (419-762)||(16776103-16776437)
chr5 (419-762)||(21947973-21948306)
chr5 (419-885)||(40221340-40221803)
chr5 (419-724)||(6745049-6745348)
chr5 (419-762)||(21684451-21684794)
chr5 (419-762)||(31545026-31545360)
chr5 (419-724)||(34477052-34477353)
chr5 (419-762)||(2818334-2818669)
chr5 (419-762)||(31542681-31543014)
chr5 (419-762)||(1189606-1189947)
chr5 (419-762)||(31179370-31179704)
chr5 (419-724)||(34479417-34479718)
chr5 (419-759)||(6747253-6747584)
chr5 (419-762)||(25904049-25904383)
chr5 (419-762)||(17072829-17073164)
chr5 (419-762)||(16092198-16092537)
chr5 (419-761)||(10474322-10474655)
chr5 (419-762)||(24126802-24127136)
chr5 (419-789)||(6756414-6756772)
chr5 (419-762)||(31472611-31472946)
chr5 (419-682)||(658355-658610)
chr5 (419-757)||(17818491-17818817)
chr5 (568-891)||(26098394-26098714)
chr5 (419-762)||(36402327-36402661)
chr5 (419-758)||(37705779-37706109)
chr5 (419-762)||(695835-696158)
chr5 (423-720)||(39397996-39398287)
chr5 (419-762)||(31465988-31466311)
chr5 (419-756)||(2954368-2954696)
chr5 (423-762)||(12555926-12556256)
chr5 (419-637)||(4410090-4410302)
chr5 (477-762)||(34530722-34530999)
chr5 (419-625)||(20505842-20506041)
chr5 (419-628)||(39798123-39798327)
chr5 (419-803)||(6661183-6661555)
chr5 (419-757)||(21288715-21289041)
chr5 (419-637)||(41585743-41585956)
chr5 (568-762)||(20042996-20043186)
chr5 (419-608)||(10749796-10749980)
chr5 (537-762)||(20044956-20045172)
chr5 (419-642)||(2723964-2724173)
chr5 (419-608)||(23665140-23665323)
chr5 (419-608)||(23793264-23793447)
chr5 (721-900)||(3373333-3373512)
chr5 (419-608)||(10757273-10757456)
chr5 (419-608)||(3373136-3373320)
chr5 (419-608)||(15354574-15354757)
chr5 (419-608)||(15356850-15357033)
chr5 (419-608)||(38960131-38960314)
chr5 (419-571)||(23741858-23742008)
chr5 (419-762)||(36208526-36208856)
chr5 (428-716)||(9020211-9020491)
chr5 (258-356)||(34476892-34476990)
chr5 (628-762)||(20507665-20507795)
chr5 (419-717)||(20053834-20054117)
chr5 (256-356)||(34479255-34479355)
chr5 (664-759)||(4410006-4410101)
chr5 (431-704)||(17413176-17413441)
chr5 (256-356)||(10750041-10750141)
chr5 (260-356)||(21684294-21684389)
chr5 (260-356)||(38882430-38882525)
chr5 (260-356)||(10528937-10529035)
chr5 (259-356)||(10757517-10757614)
chr5 (260-356)||(4236970-4237065)
chr5 (419-561)||(23667458-23667598)
chr5 (260-356)||(3372977-3373074)
chr5 (256-356)||(25804366-25804467)
chr5 (419-622)||(15143547-15143748)
chr5 (266-356)||(25921321-25921410)
chr5 (258-353)||(36402168-36402265)
chr5 (665-806)||(41585946-41586083)
chr5 (259-332)||(4410386-4410459)
chr5 (256-356)||(15356686-15356787)
chr5 (256-356)||(23665387-23665488)
chr5 (256-356)||(23793099-23793200)
chr5 (260-344)||(38959972-38960056)
chr5 (258-356)||(15354412-15354511)
chr5 (419-509)||(26098287-26098378)
chr5 (258-344)||(39798384-39798470)
chr5 (260-356)||(2175243-2175341)
chr5 (260-356)||(23741697-23741794)
chr5 (419-529)||(15445265-15445376)
chr5 (835-895)||(21288653-21288713)
chr5 (260-355)||(31179213-31179308)
chr5 (258-353)||(2724233-2724330)
chr5 (260-344)||(15552600-15552685)
chr5 (268-353)||(2818186-2818272)
chr5 (484-558)||(42770951-42771025)
chr5 (258-353)||(41585578-41585674)
chr5 (260-351)||(658204-658295)
chr5 (260-347)||(10587166-10587252)
chr5 (259-353)||(31465832-31465928)
chr5 (714-897)||(15143303-15143482)
chr5 (256-353)||(18511052-18511150)
chr5 (256-353)||(26098125-26098225)
chr5 (266-347)||(27912887-27912969)
chr5 (256-347)||(18467035-18467127)
chr5 (260-347)||(18469360-18469448)
chr5 (256-347)||(27910784-27910876)
chr5 (254-353)||(40221869-40221969)
chr5 (264-353)||(21948372-21948464)
chr5 (275-353)||(17818351-17818429)
chr5 (260-353)||(34530559-34530653)
chr5 (260-353)||(39854826-39854921)
chr5 (256-353)||(6745410-6745511)
chr5 (568-724)||(2144708-2144860)
chr5 (419-604)||(4897828-4898011)
chr5 (258-353)||(6747646-6747745)
chr5 (266-347)||(21289105-21289187)
chr5 (568-789)||(42770693-42770902)
chr5 (260-353)||(1189454-1189546)
chr5 (284-353)||(20045326-20045395)
chr5 (256-353)||(20505683-20505784)
chr5 (256-330)||(31472454-31472531)
chr5 (278-332)||(31543099-31543153)
chr5 (266-353)||(2954755-2954843)
chr5 (572-762)||(29748287-29748479)
chr5 (258-353)||(36208913-36209009)
chr5 (261-353)||(6756832-6756926)
chr5 (420-484)||(9353361-9353425)
chr5 (259-353)||(18596985-18597080)
chr5 (259-353)||(24127196-24127292)
chr5 (278-326)||(31545454-31545502)
chr5 (420-484)||(36932379-36932443)
chr5 (259-355)||(37705625-37705723)
chr5 (261-347)||(6661038-6661124)
chr5 (420-483)||(28832263-28832326)
chr5 (419-607)||(1170811-1170993)
chr5 (280-353)||(12555779-12555852)
chr5 (276-353)||(16776500-16776577)
chr5 (420-485)||(11917000-11917065)
chr5 (296-353)||(26098071-26098127)
chr5 (420-484)||(10281755-10281819)
chr5 (293-353)||(10474203-10474262)
chr5 (420-484)||(15464536-15464600)
chr5 (420-484)||(17003989-17004053)
chr5 (419-467)||(20043222-20043270)
chr5 (419-607)||(35385451-35385634)
chr5 (568-761)||(4754098-4754289)
chr5 (419-485)||(22672950-22673017)
chr5 (419-485)||(25445612-25445679)
chr5 (568-622)||(34033713-34033768)
chr5 (260-349)||(696218-696310)
chr5 (569-607)||(2298145-2298183)
chr5 (260-344)||(20054182-20054266)
chr5 (420-484)||(12084204-12084268)
chr5 (420-484)||(19588750-19588814)
chr5 (420-464)||(19806487-19806531)
chr5 (540-604)||(25452498-25452556)
chr5 (420-464)||(32636948-32636992)
chr5 (712-762)||(2144874-2144925)
chr5 (568-607)||(10627364-10627403)
chr5 (260-352)||(16092045-16092137)
chr5 (572-607)||(16093438-16093473)
chr5 (719-762)||(23665084-23665127)
chr5 (719-762)||(23793460-23793503)
chr5 (259-353)||(25904443-25904537)
chr5 (569-604)||(28786407-28786442)
chr5 (420-483)||(31300626-31300689)
chr5 (568-607)||(31782600-31782639)
chr5 (420-483)||(42127440-42127503)
chr5 (419-485)||(42238376-42238443)
chr5 (716-762)||(15354769-15354815)
chr5 (716-762)||(15357045-15357091)
chr5 (259-353)||(17073227-17073322)
chr5 (254-353)||(20043329-20043430)
chr5 (540-602)||(25445501-25445557)
chr5 (444-485)||(2298026-2298067)
[»] chr6 (146 HSPs)
chr6 (419-895)||(30967046-30967516)
chr6 (419-900)||(30034602-30035078)
chr6 (419-900)||(2628885-2629361)
chr6 (419-900)||(19704566-19705047)
chr6 (420-900)||(12195515-12195986)
chr6 (419-900)||(26932561-26933040)
chr6 (419-759)||(28241320-28241651)
chr6 (419-762)||(11983028-11983362)
chr6 (419-762)||(4816230-4816578)
chr6 (419-762)||(20915355-20915691)
chr6 (419-757)||(14458766-14459093)
chr6 (419-762)||(14507175-14507508)
chr6 (419-759)||(1230248-1230579)
chr6 (419-762)||(9019907-9020241)
chr6 (419-759)||(26064965-26065296)
chr6 (419-759)||(26084934-26085265)
chr6 (419-762)||(13057175-13057510)
chr6 (419-789)||(15532681-15533040)
chr6 (419-789)||(15541139-15541499)
chr6 (419-779)||(3390343-3390695)
chr6 (419-763)||(3631938-3632272)
chr6 (419-762)||(30728823-30729161)
chr6 (419-762)||(3629864-3630197)
chr6 (419-762)||(25477255-25477597)
chr6 (419-762)||(13039735-13040070)
chr6 (463-762)||(15530166-15530455)
chr6 (423-758)||(32279982-32280308)
chr6 (429-762)||(3233739-3234063)
chr6 (526-762)||(19227514-19227741)
chr6 (419-640)||(5273215-5273431)
chr6 (419-762)||(24338447-24338781)
chr6 (419-711)||(12161557-12161841)
chr6 (631-895)||(17852389-17852650)
chr6 (487-887)||(17011907-17012287)
chr6 (485-720)||(22490658-22490889)
chr6 (419-762)||(3027850-3028183)
chr6 (419-608)||(26066123-26066307)
chr6 (419-619)||(1069717-1069913)
chr6 (419-608)||(33308988-33309171)
chr6 (419-720)||(15719673-15719959)
chr6 (419-608)||(26068394-26068578)
chr6 (419-608)||(29754708-29754892)
chr6 (419-608)||(33311257-33311440)
chr6 (419-762)||(16455423-16455757)
chr6 (419-762)||(14466314-14466639)
chr6 (419-644)||(15367129-15367347)
chr6 (615-762)||(1072067-1072210)
chr6 (419-623)||(12186070-12186271)
chr6 (718-900)||(18317869-18318051)
chr6 (612-762)||(32447502-32447649)
chr6 (640-762)||(8995460-8995578)
chr6 (419-885)||(22857951-22858403)
chr6 (259-347)||(2628726-2628814)
chr6 (419-559)||(15346522-15346662)
chr6 (256-356)||(33309233-33309333)
chr6 (419-762)||(19696422-19696757)
chr6 (816-900)||(5275726-5275810)
chr6 (419-624)||(26945258-26945461)
chr6 (260-356)||(33311502-33311598)
chr6 (259-356)||(14507017-14507113)
chr6 (611-757)||(13870608-13870749)
chr6 (259-356)||(14458606-14458704)
chr6 (259-356)||(28241162-28241258)
chr6 (258-356)||(1230088-1230185)
chr6 (256-356)||(26068231-26068331)
chr6 (260-356)||(29754549-29754645)
chr6 (276-356)||(4816088-4816167)
chr6 (277-356)||(19704422-19704502)
chr6 (260-344)||(5273055-5273141)
chr6 (259-353)||(11982871-11982965)
chr6 (260-356)||(26065961-26066057)
chr6 (258-349)||(26065365-26065459)
chr6 (258-349)||(26085334-26085428)
chr6 (260-356)||(30967578-30967673)
chr6 (256-353)||(3394742-3394841)
chr6 (256-332)||(8717191-8717268)
chr6 (260-344)||(12195354-12195439)
chr6 (260-344)||(18322482-18322566)
chr6 (257-344)||(26932400-26932487)
chr6 (419-621)||(28037724-28037927)
chr6 (259-344)||(30034446-30034528)
chr6 (419-502)||(10584227-10584311)
chr6 (259-353)||(15367404-15367499)
chr6 (260-353)||(3629711-3629805)
chr6 (260-353)||(9020304-9020398)
chr6 (257-353)||(24338292-24338389)
chr6 (257-353)||(30728666-30728763)
chr6 (419-533)||(25078556-25078671)
chr6 (260-353)||(3233567-3233662)
chr6 (594-788)||(15346347-15346524)
chr6 (419-539)||(25465589-25465710)
chr6 (428-558)||(30445699-30445832)
chr6 (260-330)||(13057587-13057659)
chr6 (267-353)||(15346719-15346806)
chr6 (276-356)||(20915214-20915293)
chr6 (256-353)||(3631780-3631878)
chr6 (259-353)||(25480253-25480347)
chr6 (445-529)||(12911471-12911555)
chr6 (420-484)||(5757507-5757571)
chr6 (420-484)||(10077194-10077258)
chr6 (460-622)||(20526922-20527080)
chr6 (568-622)||(11138423-11138478)
chr6 (420-483)||(31979517-31979580)
chr6 (419-607)||(13878727-13878909)
chr6 (280-353)||(15530027-15530101)
chr6 (419-607)||(16785919-16786101)
chr6 (260-340)||(22611059-22611138)
chr6 (648-705)||(10584155-10584212)
chr6 (445-529)||(12937219-12937302)
chr6 (257-332)||(15540987-15541064)
chr6 (420-484)||(5572270-5572334)
chr6 (420-484)||(21356040-21356104)
chr6 (419-533)||(28078193-28078308)
chr6 (540-607)||(13883475-13883536)
chr6 (419-485)||(13883590-13883657)
chr6 (540-607)||(26887345-26887406)
chr6 (540-607)||(31248835-31248896)
chr6 (420-483)||(31936591-31936654)
chr6 (419-485)||(35201326-35201393)
chr6 (540-607)||(35201447-35201508)
chr6 (569-607)||(3577658-3577696)
chr6 (568-622)||(7542527-7542581)
chr6 (256-344)||(17012417-17012506)
chr6 (256-336)||(25465440-25465519)
chr6 (294-332)||(25477619-25477657)
chr6 (426-483)||(24436001-24436058)
chr6 (540-604)||(17036058-17036116)
chr6 (540-604)||(17694972-17695030)
chr6 (266-332)||(22491005-22491073)
chr6 (420-484)||(22963704-22963767)
chr6 (420-484)||(23824626-23824689)
chr6 (260-330)||(32280391-32280463)
chr6 (420-464)||(33211185-33211229)
chr6 (260-353)||(1069563-1069657)
chr6 (420-483)||(4629958-4630021)
chr6 (569-604)||(13467607-13467642)
chr6 (569-604)||(19702006-19702041)
chr6 (569-604)||(22351996-22352031)
chr6 (419-485)||(25941785-25941852)
chr6 (568-622)||(25078701-25078755)
chr6 (736-790)||(28038012-28038066)
chr6 (712-762)||(29754979-29755029)
chr6 (260-301)||(17038524-17038565)
chr6 (721-762)||(26066320-26066361)
chr6 (721-762)||(26068591-26068632)
chr6 (852-897)||(30445359-30445404)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (419-895)||(79006-79474)
scaffold0031 (260-353)||(79536-79631)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (419-895)||(11472-11938)
scaffold0154 (261-353)||(11315-11410)
[»] scaffold0005 (6 HSPs)
scaffold0005 (419-891)||(51836-52302)
scaffold0005 (419-759)||(183640-183969)
scaffold0005 (256-353)||(50363-50461)
scaffold0005 (260-353)||(52362-52456)
scaffold0005 (260-356)||(183482-183578)
scaffold0005 (419-485)||(50235-50303)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (460-900)||(1853-2289)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (419-762)||(69291-69628)
scaffold0025 (609-762)||(73207-73360)
scaffold0025 (251-347)||(69124-69220)
scaffold0025 (598-648)||(73160-73210)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (419-759)||(41482-41813)
scaffold0038 (259-356)||(41324-41420)
[»] scaffold0339 (2 HSPs)
scaffold0339 (419-762)||(3952-4284)
scaffold0339 (281-333)||(4362-4415)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (419-762)||(2835-3168)
scaffold0250 (266-344)||(3243-3319)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (419-752)||(14381-14707)
scaffold0131 (419-762)||(14974-15308)
scaffold0131 (259-353)||(14230-14323)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (419-762)||(29116-29459)
scaffold0068 (260-356)||(29521-29616)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (419-762)||(6154-6488)
scaffold0472 (259-347)||(6558-6647)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (419-724)||(30-330)
scaffold0267 (260-356)||(376-473)
[»] scaffold0370 (2 HSPs)
scaffold0370 (419-646)||(1452-1673)
scaffold0370 (276-356)||(1310-1389)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (419-762)||(79814-80148)
scaffold0004 (254-353)||(80210-80311)
scaffold0004 (540-607)||(188363-188424)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (419-789)||(15819-16178)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (419-875)||(1640-2080)
scaffold0468 (256-347)||(1489-1578)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (439-762)||(85186-85500)
scaffold0045 (262-353)||(85578-85671)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (528-708)||(35644-35819)
scaffold0011 (262-353)||(35944-36037)
scaffold0011 (419-485)||(35817-35883)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (419-762)||(16648-16980)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (419-608)||(22221-22404)
scaffold0140 (419-608)||(24496-24679)
scaffold0140 (259-356)||(24742-24840)
scaffold0140 (256-356)||(22467-22568)
scaffold0140 (420-484)||(8448-8512)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (426-806)||(4726-5095)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (592-759)||(993-1161)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (256-356)||(1288-1388)
scaffold1674 (419-454)||(1450-1485)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (256-344)||(12711-12799)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (276-356)||(4535-4614)
scaffold0891 (419-474)||(4678-4733)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (420-484)||(5687-5751)
scaffold0006 (420-484)||(2496-2560)
scaffold0006 (540-607)||(224819-224880)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (444-530)||(57452-57539)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (256-301)||(16615-16660)
scaffold0256 (540-604)||(16328-16386)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (420-484)||(43990-44054)
scaffold0087 (420-469)||(36876-36925)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (419-485)||(3069-3136)
[»] scaffold0209 (2 HSPs)
scaffold0209 (419-485)||(16985-17052)
scaffold0209 (570-604)||(17131-17165)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (276-320)||(1-45)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (423-483)||(10736-10796)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (420-464)||(20415-20459)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (420-481)||(85687-85748)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 203)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 7471979 - 7472456
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471979 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 7472078  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472079 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7472173  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472174 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatc 7472273  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||    
T  7472274 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttttttc 7472373  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472374 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 7472456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 38394276 - 38393801
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394276 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 38394177  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394176 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38394082  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394081 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 38393982  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||     
T  38393981 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttattttt-tca 38393883  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38393882 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 38393801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 7470021 - 7470503
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470021 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 7470120  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7470121 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaa 7470215  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470216 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 7470315  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg------nnnnnn 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                
T  7470316 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttttc 7470415  T
Q  813 nnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7470416 ttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 7470503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 3036014 - 3035533
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3036014 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgg 3035915  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035914 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3035817  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035816 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 3035717  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnc--t 816  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |  |    
T  3035716 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccatactgaagatacgttttttttcttt 3035617  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3035616 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgata 3035533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20626328 - 20625852
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626328 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 20626229  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626228 gttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20626134  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626133 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20626034  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||    
T  20626033 tctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttgct 20625934  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20625933 ccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgata 20625852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20630219 - 20629743
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630219 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 20630120  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630119 gttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20630025  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630024 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20629925  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||    
T  20629924 tctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttgct 20629825  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20629824 ccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgata 20629743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20642638 - 20642162
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642638 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 20642539  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642538 gttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20642444  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642443 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20642344  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||    
T  20642343 tctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttgct 20642244  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20642243 ccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgata 20642162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20299750 - 20299273
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299750 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 20299651  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299650 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct-----cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20299556  T
Q  619 tcaacccac-aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-cccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20299555 tcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctcta 20299456  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |    
T  20299455 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatatggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt-t 20299357  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20299356 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 20299273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 18345831 - 18345360
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345831 tttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 18345732  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345731 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcac-----gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18345637  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18345636 tcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatc 18345537  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  18345536 tccctcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttttttttttct 18345437  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345436 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 18345360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 423 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20297648 - 20297177
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20297648 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 20297549  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297548 caagaataagtctcccacctatttctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 20297454  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297453 ccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 20297354  T
Q  723 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctcctt 822  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  20297353 tcaaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagtataactcgtaaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt-tctcctt 20297255  T
Q  823 caatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20297254 cggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 20297177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 28487843 - 28487367
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487843 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 28487744  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28487743 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 28487649  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487648 tcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28487549  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||    
T  28487548 tctctcaaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagtataactcataaatttagaacaaataccacactgaagatacgttttttttttct 28487449  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28487448 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgata 28487367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 1850271 - 1849783
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850271 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 1850172  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1850171 gttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcct-----cttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 1850077  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1850076 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 1849977  T
Q  717 ----------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
              |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1849976 tctctctctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagattcg 1849877  T
Q  807 nnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
             ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1849876 ttttttttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 1849783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 28485855 - 28485379
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485855 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagga-gagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 28485757  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485756 attacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagcccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 28485662  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28485661 tcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatc 28485562  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct-c 817  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |    
T  28485561 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtgttttttttcc 28485462  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28485461 tccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 28485379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 419 - 894
Target Start/End: Original strand, 7351651 - 7352122
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7351651 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 7351749  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7351750 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 7351844  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7351845 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 7351944  T
Q  717 -tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnc 815  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  7351945 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaagatacgtttttttt- 7352043  T
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 894  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7352044 tctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 7352122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 474 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 11757465 - 11757043
Alignment:
Q  474 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctctt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  11757465 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc---- 11757370  T
Q  574 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccct 672  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11757369 -ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccct 11757271  T
Q  673 agttttgttgttgcctttctaaaccc-ttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataact 771  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11757270 agttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataact 11757171  T
Q  772 cataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatat 871  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757170 cataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt-tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatat 11757072  T
Q  872 atttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11757071 atttgcatcaaatagttcttcatacgata 11757043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 31155910 - 31156382
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31155910 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgg 31156008  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31156009 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31156103  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31156104 atcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 31156202  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
       |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||    
T  31156203 ---tctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaataccacactgaagattcgttttttttttc 31156299  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156300 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 31156382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 423 - 900
Target Start/End: Original strand, 43253520 - 43253997
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253520 ttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtta 43253619  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253620 caagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttt-----ccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43253714  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc----cctctatc 718  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||     |||| ||    
T  43253715 ccctcaaacc-tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttcagccctctttctctctc 43253813  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac--gnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||            |    
T  43253814 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatactttcttatttttt 43253913  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253914 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 43253997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 432 - 894
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349743
Alignment:
Q  432 ttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 531  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T
Q  532 gtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 630  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349384 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 7349478  T
Q  631 ccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcaaag 728  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7349479 ccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaag 7349578  T
Q  729 tttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatga 828  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||| |||| |||    
T  7349579 tttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaagatacgtttttttt-tctcattcagtga 7349677  T
Q  829 aagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 894  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349678 aagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcat 7349743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 13099473 - 13099942
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  13099473 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaat 13099572  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13099573 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtg 13099667  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13099668 aatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaaccccctcta 13099767  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
        |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |    
T  13099768 ----tctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttt 13099863  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13099864 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcata 13099942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 42330996 - 42331470
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42330996 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 42331095  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331096 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt---gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 42331192  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  42331193 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 42331290  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-----nnnnnnn 813  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||                
T  42331291 --tctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaagatacgtttttttttttc 42331388  T
Q  814 nctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331389 tttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 42331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 48457943 - 48457608
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457943 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 48457844  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48457843 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaa 48457749  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457748 tgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 48457649  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48457648 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 48457608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 21990440 - 21989974
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21990440 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatga 21990341  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21990340 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaa 21990246  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||    
T  21990245 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc-----tc 21990151  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    | |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||          ||    
T  21990150 tatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaattataactcataaatttggaacgaataccacacagaagatacgtttttttttcct 21990051  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990050 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 21989974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 423 - 895
Target Start/End: Original strand, 37412128 - 37412593
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggt 520  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  37412128 ttgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagt 37412227  T
Q  521 tacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 620  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412228 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 37412322  T
Q  621 aacccacaaaccctagtgtttgttcc-aaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 719  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37412323 aaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctatatct 37412422  T
Q  720 ctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctc 819  Q
    |     | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||    
T  37412423 cc----aggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacgaataacacactgaagatacgtttttttt-tctc 37412517  T
Q  820 cttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412518 cttcagtggaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcata 37412593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 44724869 - 44724535
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44724869 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 44724770  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724769 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttct-----cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 44724675  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  44724674 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctata-- 44724577  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44724576 --tctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 44724535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 419 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3878867 - 3878540
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878867 tttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 3878768  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3878767 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaa 3878673  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878672 tcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 3878573  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatt 753  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3878572 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatt 3878540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 1049295 - 1049628
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1049295 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 1049393  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1049394 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaa 1049488  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1049489 tcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 1049586  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1049587 --tctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaa 1049628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 40836742 - 40837075
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40836742 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 40836840  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836841 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 40836935  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40836936 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctcaatc 40837035  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||   |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837036 tc---caaa-tttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 40837075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 27306229 - 27306562
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27306229 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 27306328  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306329 gttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27306423  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27306424 tcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 27306520  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306521 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 27306562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 40946618 - 40946283
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40946618 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatag 40946519  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  40946518 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaa 40946424  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40946423 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtc 40946324  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  40946323 cctctcaaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagt 40946283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 35919 - 35585
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 35820  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35819 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 35725  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  35724 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttcagccccctcta-- 35627  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 35585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 1046924 - 1047265
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1046924 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 1047022  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047023 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1047117  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1047118 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatc 1047217  T
Q  719 tctctcaa----agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||      || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1047218 tctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaa 1047265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 443886 - 443507
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  443886 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatg 443787  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443786 gattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 443692  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||     
T  443691 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagctccctcta- 443593  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
       |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  443592 ---tctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaattccacactgaagatacg 443507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 31435045 - 31435380
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31435045 tttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31435144  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435145 ggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31435239  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31435240 atcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttcta- 31435338  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31435339 ---tctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaa 31435380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 44854 - 44520
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44854 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 44755  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44754 gttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaa 44660  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44659 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 44562  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44561 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 44520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25542818 - 25542487
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25542818 tttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 25542720  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25542719 gttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccag-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtctttcc-aaggtgaa 25542626  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     ||    
T  25542625 tcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttcagcccc-----tc 25542531  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542530 tatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 25542487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 20137108 - 20137442
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20137108 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 20137206  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20137207 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtga 20137301  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20137302 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 20137400  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  20137401 ---tctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaa 20137442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 9679349 - 9678993
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9679349 tttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 9679250  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679249 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9679155  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679154 tcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctat 9679056  T
Q  718 ctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatt 779  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  9679055 ctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaaacatccctcataaatt 9678993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 423 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 9681106 - 9680770
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  9681106 ttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagtta 9681007  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9681006 caagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaa 9680912  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9680911 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccctctatctct 9680812  T
Q  722 ctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680811 ctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 9680770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11355548 - 11355214
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||     
T  11355548 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatga 11355449  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355448 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11355354  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11355353 tcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 11355256  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11355255 --tctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaa 11355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 432 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 24258744 - 24258281
Alignment:
Q  432 ttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata----tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24258744 ttcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24258645  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24258644 ataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaa-----tcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctc 24258550  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||     
T  24258549 aaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaat 24258454  T
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaata--ccacactgaagata-----cgnnnnnnnnctctcc 820  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||     |          |||||    
T  24258453 gtttactctgatacaaaacctatatttatag-agaaatataactcataaatttggaacgaatatcacacactgaagatacatttctttatttttttctcc 24258355  T
Q  821 ttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24258354 ttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatc-aatcgtccttcata 24258281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 4295933 - 4296269
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  4295933 tttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 4296032  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296033 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4296127  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4296128 tcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta- 4296226  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatac-aaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4296227 ---tctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaa 4296269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24748885 - 24748550
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24748885 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 24748786  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24748785 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtga 24748691  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24748690 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 24748592  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
         ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24748591 ---agtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttataataaa 24748550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 21592142 - 21592438
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21592142 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 21592241  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21592242 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaa 21592336  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21592337 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagccccctctatc 21592436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 429 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 21680307 - 21679983
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21680307 cagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaa 21680208  T
Q  529 taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 628  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21680207 taaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctca 21680113  T
Q  629 aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaag 728  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |    
T  21680112 aaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aagg 21680017  T
Q  729 tttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  21680016 tttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 21679983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 21678356 - 21678022
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21678356 tttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgg 21678257  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678256 gttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctc-----gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 21678162  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678161 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 21678062  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||   ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21678061 tc----aaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaa 21678022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 42223448 - 42223112
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  42223448 tttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatag 42223349  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42223348 gtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 42223254  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |   ||    
T  42223253 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcatcccac---at 42223157  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42223156 ctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaa 42223112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 39145985 - 39146320
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39145985 tttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 39146084  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39146085 tgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttcca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtga 39146179  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |     
T  39146180 atcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagccccctcca- 39146278  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39146279 ---tctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaa 39146320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 644
Target Start/End: Original strand, 7092212 - 7092431
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7092212 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgg 7092310  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7092311 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaa 7092405  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092406 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 439 - 708
Target Start/End: Original strand, 27832651 - 27832916
Alignment:
Q  439 caaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcc 537  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27832651 caaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 27832750  T
Q  538 cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 637  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832751 cgcctaattttacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 27832845  T
Q  638 gtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 708  Q
    || |||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27832846 gtatgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 27832916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25276374 - 25276097
Alignment:
Q  477 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||    
T  25276374 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcc 25276280  T
Q  576 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25276279 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 25276180  T
Q  676 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    |||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25276179 tttgttgttgcctttctaaattattgttttagccccctcta----tctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaa 25276097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 665 - 900
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092650
Alignment:
Q  665 caaaccctagt-tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaac 763  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaac 7092513  T
Q  764 atataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttt 863  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092514 atataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacaattttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttt 7092613  T
Q  864 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7092614 caaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 7092650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 665 - 900
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094897
Alignment:
Q  665 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaca 764  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaca 7094761  T
Q  765 tataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttc 864  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7094762 tataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttc 7094861  T
Q  865 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7094862 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 7094897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 516 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804529
Alignment:
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggt 26804671  T
Q  616 gaatcaacccacaaacccta---gtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 712  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804670 gaatcaaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 26804571  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||    |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||    
T  26804570 tctatctc----aaagtttactc----acaaggtctatatttatagtaaa 26804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 423 - 644
Target Start/End: Original strand, 7094463 - 7094678
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7094463 ttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggtta 7094562  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094563 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 7094657  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  7094658 ccctcaaacccta-tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 38396924 - 38396713
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38396924 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgg 38396826  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38396825 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 38396731  T
Q  619 tcaacccacaaaccctag 636  Q
    |||||||||||| |||||    
T  38396730 tcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 430 - 762
Target Start/End: Original strand, 24817362 - 24817682
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24817362 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaaga 24817461  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||     
T  24817462 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccca- 24817555  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
      ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||     ||| ||||||     
T  24817556 --accctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgactt-ctaaacccttgtttcagcccc-----tctatctcaag 24817646  T
Q  728 gtttag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24817647 gtttacatctgatacaaggtctatatttatattaaa 24817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 7188831 - 7188472
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  7188831 tttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaat 7188732  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7188731 gggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaa-----tctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 7188637  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7188636 aatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttgac-ttctaaacccttgtttcagccccctcta 7188541  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
        |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  7188540 ----tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 7188472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 459 - 789
Target Start/End: Original strand, 22828671 - 22828993
Alignment:
Q  459 aagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagt 557  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22828671 aagagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 22828770  T
Q  558 cccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaat 657  Q
    | ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||| ||     
T  22828771 ctcaa-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaa 22828865  T
Q  658 ctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  22828866 ctctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttata 22828961  T
Q  758 gtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||||  |||  ||||||||  ||||||||||    
T  22828962 gtaaaagtatccctcataaaactggaacaaat 22828993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251875
Alignment:
Q  477 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctc 571  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      ||||    
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaa-----tctc 22251696  T
Q  572 ttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccc 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  22251697 ttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactc 22251788  T
Q  672 tagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22251789 tagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctcta----tctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaa 22251875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 453 - 789
Target Start/End: Original strand, 20091580 - 20091901
Alignment:
Q  453 ctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctaccc 552  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20091580 ctgggggagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  553 aaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagag 652  Q
    |||||| ||      ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| | || ||    
T  20091678 aaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag 20091770  T
Q  653 acaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctata 751  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  20091771 -caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-tccgaaacccttgttttcagccccctcta----tctcaaggtttactctgataaaaagtctata 20091863  T
Q  752 tttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  20091864 tttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 20091901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2935558 - 2935374
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2935558 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 2935460  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935459 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 685
Target Start/End: Original strand, 24813496 - 24813755
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||    
T  24813496 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaat 24813595  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24813596 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtg 24813690  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttg 685  Q
    |||||||||   ||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813691 aatcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 712 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 38396292 - 38396104
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnn 811  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         
T  38396292 ctctctctctctcaaaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatacgttttt 38396193  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38396192 tttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 38396104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 596 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567569
Alignment:
Q  596 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  696 cccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||| ||||    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttcta----tctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaa 18567569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1606669 - 1606486
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1606669 tttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 1606571  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606570 gttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22137367 - 22137184
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22137367 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 22137269  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137268 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40552394 - 40552211
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40552394 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 40552296  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552295 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 721 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 1606467 - 1606289
Alignment:
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctcc 820  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||    
T  1606467 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagattcgtttttttt-tctcc 1606369  T
Q  821 ttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1606368 ttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 1606289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 9027193 - 9027376
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9027193 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 9027291  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027292 gttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22108356 - 22108173
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22108356 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 22108258  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108257 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40550116 - 40549933
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40550116 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 40550018  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550017 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 692 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 3677301 - 3677101
Alignment:
Q  692 taaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaatac 791  Q
    ||||||||||||||||||||     ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  3677301 taaacccttgtttcagcccc-----tctatctccaagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaaacataactcataaatttggaacgaatat 3677207  T
Q  792 cacactgaagatacgnnnnnnnn--ctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttc 889  Q
    |||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677206 cacactgaagatacgttttttttttctctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttc 3677107  T
Q  890 ttcata 895  Q
    ||||||    
T  3677106 ttcata 3677101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 748 - 900
Target Start/End: Original strand, 21470614 - 21470765
Alignment:
Q  748 tatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaa 847  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21470614 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatacgtttttttt-tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaa 21470712  T
Q  848 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21470713 atataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgata 21470765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24465827 - 24465504
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | || |||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  24465827 tttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatg 24465729  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24465728 agttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtga 24465634  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||  |   |||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24465633 atcaattc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctcta- 24465547  T
Q  718 ctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24465546 ---tctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaa 24465504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 563 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22392612 - 22392429
Alignment:
Q  563 cctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctcta 662  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||  ||||    
T  22392612 cctcatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caaattcta 22392517  T
Q  663 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392516 tacaaaccctagttt--------gatttataaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 22392429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22394013 - 22393876
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22394013 tttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 22393914  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaa 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22393913 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 419 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26295738 - 26295598
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26295738 tttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 26295639  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26295638 ggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 26295598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48458100 - 48458005
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48458100 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 48458005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 818 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 47865528 - 47865446
Alignment:
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47865528 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 47865446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7471817 - 7471917
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7471817 caattgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 7471915  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7471916 at 7471917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38394438 - 38394338
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38394438 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 38394340  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  38394339 at 38394338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2935716 - 2935621
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2935716 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 2935621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28488000 - 28487905
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28488000 gttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 28487905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 43253358 - 43253453
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43253358 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 43253453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11759576 - 11759479
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11759576 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 11759479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38397084 - 38396991
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38397084 ttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaattaaat 38396991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45012 - 44916
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45012 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 44916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 11081801 - 11081522
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  11081801 tttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaa 11081702  T
Q  517 --gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
      ||||||||||||| ||| | |   ||||||| ||| |||| ||| |      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11081701 aagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaa-----tctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaa 11081607  T
Q  614 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||||||| |    |||||||||||||||| | |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11081606 gtgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag--aat-tctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 11081522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20297814 - 20297714
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20297814 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 20297716  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  20297715 at 20297714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7092050 - 7092150
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7092050 caattgttgcaaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaat-aaagtgtgtggaacaattaa 7092148  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7092149 at 7092150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 7094297 - 7094397
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7094297 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaat-aaagtgtgtggaacaattaa 7094395  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  7094396 at 7094397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28486017 - 28485917
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28486017 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaacaattaa 28485919  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  28485918 at 28485917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 40836582 - 40836680
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg--aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40836582 ttgttgcgaattcgatcgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 40836680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40946777 - 40946682
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40946777 tgttgtgaattcgatgagaatcacatcaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 40946682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36059 - 35981
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36059 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 35981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 6332512 - 6332311
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  6332512 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaa 6332413  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||      |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6332412 gggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctca-----atctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaact 6332318  T
Q  616 gaatcaa 622  Q
    |||||||    
T  6332317 gaatcaa 6332311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1850429 - 1850333
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1850429 tgttgcgaattcgatttgaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 1850333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9027034 - 9027118
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9027034 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9027118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20299908 - 20299812
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20299908 tgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 20299812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25542976 - 25542880
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25542976 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 25542880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40550281 - 40550180
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  40550281 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 40550182  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  40550181 at 40550180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 7351487 - 7351576
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7351487 caattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 7351576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3879028 - 3878930
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  3879028 ttgttgcgaattcgatgagaaatcacatcaataataacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaattaaat 3878930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 344
Target Start/End: Original strand, 7349114 - 7349202
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7349114 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaat-aaagtgtatg 7349202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 7469863 - 7469959
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7469863 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggag-cagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 7469959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1606827 - 1606731
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1606827 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 1606731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20626481 - 20626394
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626481 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20626394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20630372 - 20630285
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20630372 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20630285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20642791 - 20642704
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642791 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 20642704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 660 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 38396370 - 38396306
Alignment:
Q  660 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38396370 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccctctctctc 38396306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3036166 - 3036076
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3036166 gaattcgatgagaaatcacaccaataacaatttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3036076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 16297020 - 16297222
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||     
T  16297020 tttgtttacacagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaa 16297119  T
Q  517 -gggttacaagaataagtgtcccgc-ctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
     ||||||||||||| | | | |    |||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16297120 agggttacaagaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagg 16297214  T
Q  615 tgaatcaa 622  Q
    ||||||||    
T  16297215 tgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42223603 - 42223506
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  42223603 aattgttgcgaattcgataaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtataaaacaatta 42223506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 485 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348933
Alignment:
Q  485 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 6348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22137527 - 22137430
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22137527 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 22137430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40552554 - 40552457
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  40552554 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 40552457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 1049125 - 1049216
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1049125 caattgttgcgaattcgaagaaaaattcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg 1049216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18345967 - 18345893
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345967 cacaccaacaacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 18345893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 27306076 - 27306170
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaa-atcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306076 tgttgcgaattcgatgagagatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 42330846 - 42330940
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42330846 tgttgcgaattcgatgagaaatcacgccaataataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 42330940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44725026 - 44724932
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44725026 caattgttgcgaattcgatgggaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 44724932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9679495 - 9679409
Alignment:
Q  269 ttcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679495 ttcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 9679409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 13099314 - 13099411
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13099314 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 13099411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26804958 - 26804861
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26804958 aattgttgcgaatttgatgagaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 26804861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 327
Target Start/End: Original strand, 1502814 - 1502883
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaac 327  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  1502814 attgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Original strand, 4295777 - 4295873
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4295777 caattgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaat 4295873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 31434892 - 31434987
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  31434892 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaat-aaagtgtaaggaacaatta 31434987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Original strand, 1046756 - 1046831
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  1046756 ttgttgcgaattcgaagaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa 1046831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21990560 - 21990500
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990560 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 21990500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11355707 - 11355609
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11355707 attgttgggaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta 11355609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21678510 - 21678412
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21678510 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaaacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtaaggaacaatta 21678412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21680472 - 21680378
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21680472 tgttgtgaattcgatgaaaacccacaccaataacaagcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaa-caaagtgtatggaacaatta 21680378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24749039 - 24748946
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24749039 caattgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaa 24748946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11759417 - 11759364
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccct 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11759417 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25351534 - 25351353
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||   |    
T  25351534 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---t 25351439  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    | ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351438 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046641
Alignment:
Q  432 ttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 529  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaggtttacaagaat 6046674  T
Q  530 aagt-gtcccgcctaattctacccaaagtccca 561  Q
    ||||  ||   ||||||||||||||||||||||    
T  6046673 aagtcttcaaacctaattctacccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 570 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 6049014 - 6048885
Alignment:
Q  570 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaa 668  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||  ||| ||| ||||||    
T  6049014 tcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag--aat-tctttacaaa 6048920  T
Q  669 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6048919 ccctagttttgatgttggc-ttctaaacccttgttt 6048885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190038
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284156
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 20284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11084521 - 11084467
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11084521 tctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 37411988 - 37412061
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37411988 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 37412061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2120881
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg- 539  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||| | |       
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaa 2120961  T
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 623  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120960 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 444045 - 443948
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  444045 ttgttgtgaattcgatgagaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtattgaacaatta 443948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983352
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22108484 - 22108420
Alignment:
Q  292 caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22108484 caacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 22108420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516339
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580457
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 2580457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 31153690 - 31153737
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtg 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31153690 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtg 31153737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 3320050 - 3320232
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    ||    
T  3320050 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---taa 3320145  T
Q  516 tgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320146 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 3324798 - 3324980
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    ||    
T  3324798 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---taa 3324893  T
Q  516 tgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324894 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 644
Target Start/End: Original strand, 12310159 - 12310234
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  12310159 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgttcaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 12310234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25405575 - 25405393
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  25405575 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 25405480  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405479 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 484
Target Start/End: Original strand, 55955 - 56015
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55955 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactat 56015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9681243 - 9681170
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9681243 cacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 9681170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251524
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22251452 cacaccaataacaaacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 22251524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25357228 - 25357047
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||   |    
T  25357228 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---t 25357133  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    | ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357132 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 2647789 - 2647725
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2647789 ttgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactat 2647725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796696
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactat 4796696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25410313 - 25410130
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||| |||| ||      
T  25410313 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 25410217  T
Q  515 atgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
     || ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410216 -tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159871
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 7069841 - 7069780
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069841 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 7074848 - 7074787
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074848 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7188983 - 7188890
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7188983 caattgttgtgaattcgatcaaaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 7188890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 7464518 - 7464585
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7464518 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactata 7464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185195
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccacta 9185195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21369681 - 21369642
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369681 tctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 26210686 - 26210631
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26210686 tctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 28617318 - 28617255
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  28617318 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccacta 28617255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 33332543 - 33332480
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33332543 ttgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 33332480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 619
Target Start/End: Original strand, 40281521 - 40281572
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 619  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40281521 tctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24465976 - 24465887
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24465976 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 24465887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26804800 - 26804762
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804800 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 353
Target Start/End: Original strand, 39145856 - 39145925
Alignment:
Q  284 accaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  39145856 accaataacaaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaattgtattaaacaatta 39145925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 712 - 806
Target Start/End: Original strand, 40281660 - 40281753
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40281660 ctctacctctctcaaggtttcatccgagacaaggtttatatttataaagaa-atataactcataaatttggaacagatatcacgctgaagatacg 40281753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Original strand, 24813348 - 24813425
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24813348 tgttgtgagttcgatgaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatatcaa 24813425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25276549 - 25276487
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  25276549 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggatcaa--gttaatcaagcaaccaatatcaaagtg 25276487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 2759197 - 2759241
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2759197 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 2759241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 21591989 - 21592082
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21591989 tgttgcgaattcgatgagaaaacacggctataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa--aaagtgtatggaacaatta 21592082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 35960820 - 35960884
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  35960820 ttgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactat 35960884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 44848777 - 44848713
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44848777 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactat 44848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 49091665 - 49091729
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  49091665 ttgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactat 49091729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7069962 - 7069895
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  7069962 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactata 7069895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 8378503 - 8378570
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8378503 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcaactctccgatccactata 8378570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 8378625 - 8378686
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378625 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22108160 - 22108117
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22108160 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 22108117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22137171 - 22137128
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22137171 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 22137128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 34546879 - 34546946
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  34546879 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 34546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 34547007 - 34547042
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34547007 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 40549920 - 40549877
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40549920 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 40549877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 40552198 - 40552155
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40552198 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 40552155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 44144010 - 44144045
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44144010 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 27832487 - 27832576
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27832487 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27832576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7074943 - 7074902
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  7074943 tgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactata 7074902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 24817199 - 24817280
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||  ||||||||| || ||| |||||    
T  24817199 caattgttgcaaattcaatgaaaatcacaccaataaaatacttaatgtgtggagcaagtaataatcaagaaaacaatatcaa 24817280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43864412 - 43864375
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg 457  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43864412 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggg 43864375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 44010775 - 44010816
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  44010775 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 44010816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 47263682 - 47263744
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  47263682 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggg--gagagcagctctccaatccactat 47263744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 15809554 - 15809080
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809554 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 15809455  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15809454 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctag-----tttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 15809360  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15809359 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatc 15809261  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  15809260 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt-tct 15809162  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15809161 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 15809080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 3874346 - 3873868
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874346 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 3874247  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3874246 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3874152  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3874151 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccccgctatc 3874052  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |          ||    
T  3874051 tctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatatgtttttttttttc 3873952  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcg-ttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3873951 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgata 3873868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 28283220 - 28283695
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28283220 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 28283317  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28283318 gttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 28283412  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  28283413 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 28283512  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         |    
T  28283513 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatattacactgaagatacgtttttttt-t 28283611  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28283612 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 28283695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 419 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 32339645 - 32339263
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32339645 tttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgg 32339546  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32339545 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaa 32339451  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339450 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 32339351  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339350 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 32339263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 609070 - 608588
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  609070 tttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 608971  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  608970 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 608876  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608875 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatc 608776  T
Q  719 tc----tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg---nnnnn 811  Q
    ||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  608775 tctctctctcaaagtttgctatgatataaggtctatatttacagtgaa-atataactcataaatttggaacaaatatcacaccgaagatacgttcttttt 608677  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  608676 tttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 608588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 43530451 - 43529994
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43530451 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgg 43530352  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530351 gttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcct-----cttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43530257  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530256 tcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatc 43530170  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||    
T  43530169 tctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaataaataccacactgaagatac-ttttttttttct 43530071  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530070 ccttcagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 43529994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 41385080 - 41384616
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  41385080 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 41384981  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||||||| ||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41384980 gttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaa 41384886  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||    
T  41384885 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc-----tc 41384791  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    | ||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         | |    
T  41384790 tatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttt-ttt 41384692  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384691 ccttcaatgaaagaatatttgcat-aaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 41384616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 806
Target Start/End: Original strand, 24873180 - 24873564
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  24873180 tttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatcg 24873278  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24873279 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtga 24873373  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24873374 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 24873473  T
Q  717 -tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24873474 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatacaacactgaagatacg 24873564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27829632 - 27829299
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27829632 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgg 27829534  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829533 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27829439  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829438 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27829339  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27829338 tcc----aagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaa 27829299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 28251566 - 28251900
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28251566 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgg 28251665  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251666 gttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28251760  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||      
T  28251761 tcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaacccactcta-- 28251858  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28251859 --tctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaa 28251900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 14808097 - 14807753
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagag----------cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808097 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagag 14807998  T
Q  509 aaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807997 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 14807903  T
Q  609 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 708  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807902 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 14807803  T
Q  709 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807802 cccctcta----tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 14807753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15073047 - 15072712
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15073047 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 15072948  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15072947 gttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaacc----ctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 15072852  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15072851 tcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 15072754  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072753 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 15072712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27827321 - 27826988
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27827321 tttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgg 27827223  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827222 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27827128  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827127 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27827028  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27827027 tcc----aagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaa 27826988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 22684652 - 22684996
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat-- 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22684652 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatat 22684751  T
Q  517 -gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684752 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 22684846  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684847 gaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctct 22684946  T
Q  716 a------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22684947 atctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 22684996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 41382998 - 41382542
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  41382998 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 41382899  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||    
T  41382898 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag-----------gtgaa 41382815  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    |||    
T  41382814 acaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagcccc----atc 41382719  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||    
T  41382718 tatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttttttttttct 41382619  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41382618 cattcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcata 41382542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4424354 - 4424020
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4424354 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgg 4424255  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4424254 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaa 4424160  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  4424159 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctcta-- 4424062  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4424061 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaa 4424020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18811043 - 18810710
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18811043 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatgg 18810945  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810944 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagc-----ctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18810850  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18810849 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 18810752  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18810751 --tctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaa 18810710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 44721179 - 44720845
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44721179 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 44721081  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44721080 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtga 44720986  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44720985 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 44720887  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44720886 ---tctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaa 44720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15068317 - 15067983
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15068317 tttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 15068218  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15068217 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctcttt-----ccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaa 15068123  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  15068122 ttaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttcta-- 15068025  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15068024 --tctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaa 15067983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 27106896 - 27107230
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  27106896 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgg 27106995  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106996 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27107090  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27107091 tcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 27107188  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27107189 --tctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaa 27107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 43079938 - 43079639
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43079938 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 43079840  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43079839 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 43079745  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43079744 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc-ctat 43079646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 30480502 - 30480836
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30480502 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgg 30480601  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480602 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30480696  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30480697 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatc 30480796  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  30480797 tc----aaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 30480836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 43082309 - 43082009
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43082309 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 43082211  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082210 gttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtga 43082116  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082115 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 43082016  T
Q  718 ctctctc 724  Q
    |||||||    
T  43082015 ctctctc 43082009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 788
Target Start/End: Original strand, 14419189 - 14419549
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||    
T  14419189 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatg 14419288  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14419289 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtga 14419383  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14419384 atcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 14419482  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  14419483 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaa-ttggaacaaa 14419549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 423 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 27911345 - 27911055
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  27911345 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggga-gagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtta 27911247  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911246 caagaataactctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27911152  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911151 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27911055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 423 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 27957764 - 27957474
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  27957764 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggga-gagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtta 27957666  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957665 caagaataactctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27957571  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957570 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27957474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 1225503 - 1225168
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  1225503 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatg 1225404  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225403 agttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 1225309  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1225308 atcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 1225210  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1225209 ---tctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaa 1225168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 788
Target Start/End: Original strand, 13858483 - 13858842
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  13858483 tttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatg 13858581  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858582 ggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 13858676  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13858677 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctcta- 13858775  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
       |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  13858776 ---tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa-ttggaacaaa 13858842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18813217 - 18812895
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  18813217 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgg 18813119  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813118 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttc-----ccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18813024  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  18813023 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctcta-- 18812937  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18812936 --tctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaa 18812895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 36865873 - 36865539
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  36865873 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaat 36865774  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865773 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaa-----tctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 36865682  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865681 aatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 36865582  T
Q  717 tctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        ||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36865581 ----tcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaa 36865539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25952857 - 25952523
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25952857 tttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatg 25952758  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||   |||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25952757 agttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctc-----gtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtga 25952663  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952662 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatacaa-ccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 25952564  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    || ||||  |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25952563 ctc----aaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaa 25952523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 423 - 762
Target Start/End: Original strand, 5372179 - 5372510
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  5372179 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagt 5372278  T
Q  521 tacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 620  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5372279 tacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaa-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatt 5372373  T
Q  621 aacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||     
T  5372374 aaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc-----tcta 5372468  T
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5372469 tctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaa 5372510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 423 - 762
Target Start/End: Original strand, 33541413 - 33541721
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         
T  33541413 ttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg----- 33541507  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
                     |||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33541508 -----------------cctaattctaccaaaagtcccaa-----tctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaa 33541585  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  33541586 ccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tc 33541681  T
Q  723 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33541682 tcaatgtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 33541721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 511 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477278
Alignment:
Q  511 atcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 610  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttccc 14477426  T
Q  611 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 710  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14477425 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccc 14477326  T
Q  711 cctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||    || ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14477325 cctctatctc----aaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaa 14477278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 15185713 - 15186070
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15185713 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatg 15185812  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagag--actcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  15185813 ggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa------------tctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggt 15185900  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15185901 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttcagtcaccttt 15186000  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |    |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  15186001 a----tctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 15186070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 21482647 - 21482324
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21482647 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 21482548  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21482547 ggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtga 21482453  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
     |||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| || |||||     
T  21482452 ctcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagtccactcta- 21482366  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21482365 ---tctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaa 21482324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 15956294 - 15956051
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15956294 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 15956195  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15956194 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtga 15956100  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaacc 670  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  15956099 atcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 426 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480554
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttaca 524  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 21480733  T
Q  525 agaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 624  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||      | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21480732 agaataagtcacccgcctaattctaccaaaaacccca-----atatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 21480638  T
Q  625 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    |   || ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21480637 c---aaacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccatctatctc 21480554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 568 - 788
Target Start/End: Original strand, 5622881 - 5623096
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5622881 tctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatacaa 5622980  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatat 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||   ||    
T  5622981 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaagaat 5623076  T
Q  768 aactcataaatttggaacaaa 788  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  5623077 cactcataaa-ttggaacaaa 5623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 665 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181434
Alignment:
Q  665 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaca 764  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 181537  T
Q  765 tataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttc 864  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181536 tataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttcttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttc 181437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 31162549 - 31162188
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggga--agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  31162549 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 31162450  T
Q  515 atgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
    ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162449 atgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtccca-----atctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 31162355  T
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg-ttgcctttctaaacccttg-tttcagccccc 712  Q
    ||||||||||  | |||  ||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  31162354 tgaatcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgcttg--tttctaaacctttgtttttagccccc 31162261  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
        ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  31162260 ----tctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 31162188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 3005629 - 3005922
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  3005629 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaat 3005728  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  3005729 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtg 3005823  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctct 715  Q
    |||||| ||   ||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||| |||||||  |  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3005824 aatcaatcc---aaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaacccttgtttccagccccctct 3005917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 583 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775203
Alignment:
Q  583 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 682  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  683 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaa 26775203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 597 - 762
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872711
Alignment:
Q  597 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 35872649  T
Q  697 ccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 35872711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32339804 - 32339707
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339804 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 32339707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 649 - 762
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517359
Alignment:
Q  649 agagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtct 748  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctcaaagtttgctctgatacaaggtat 12517345  T
Q  749 atatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||    
T  12517346 atatatatagtaaa 12517359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18811206 - 18811105
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811206 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 18811107  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  18811106 at 18811105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4424514 - 4424416
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424514 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 4424416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 484 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 181772 - 181622
Alignment:
Q  484 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcc--cgtaac 581  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     |||||||||  ||||||    
T  181772 tatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----ttctcttcccgcgtaac 181679  T
Q  582 caagagactcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 637  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  181678 taagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15809711 - 15809616
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15809711 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 15809616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 31578275 - 31578476
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  31578275 tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 31578374  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
     |||||||||||| |||  ||   ||||||||||||||||||||||      ||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31578375 aggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggt 31578469  T
Q  616 gaatcaa 622  Q
    |||||||    
T  31578470 gaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 660 - 762
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886251
Alignment:
Q  660 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagt 3886248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27827483 - 27827383
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27827483 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 27827385  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  27827384 at 27827383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 419 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 31035457 - 31035252
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgaccta--gtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31035457 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatca 31035359  T
Q  515 atgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    | |||||||||||||||||  ||   |||||||||||| |||||| ||      |||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31035358 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctca-----atctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaag 31035264  T
Q  614 gtgaatcaaccc 625  Q
    ||||||||||||    
T  31035263 gtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 22684489 - 22684590
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatg---aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22684489 attgttgcgaattcgatggaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaattaa 22684588  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  22684589 at 22684590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18813376 - 18813279
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813376 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 18813279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27829790 - 27829694
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27829790 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 27829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 720
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214505
Alignment:
Q  537 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 636  Q
    ||||||||||||||||||||| |||      || ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaa-----tcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 37214402  T
Q  637 tgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214403 tgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 37214502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43530610 - 43530513
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43530610 ttgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 43530513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 3883436 - 3883532
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3883436 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3883532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035064
Alignment:
Q  588 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcc 687  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac 31035142  T
Q  688 tttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatat 767  Q
     ||||||||| ||| ||||||    |||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31035141 -ttctaaaccattgttttcag---actctctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatat 31035064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 549
Target Start/End: Original strand, 2468128 - 2468259
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2468128 tttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 2468227  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattcta 549  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2468228 ggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Original strand, 28283060 - 28283146
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283060 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28283146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44721318 - 44721241
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44721318 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 44721241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 35872300 - 35872395
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35872300 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaaaaatta 35872395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3874488 - 3874391
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3874488 ttgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 3874391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 609230 - 609133
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  609230 tgttgtgaattcgatgaaaatcgcaccaataacaacttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaattaaat 609133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 24873039 - 24873124
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24873039 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg 24873124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 28251410 - 28251504
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28251410 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28251504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15068476 - 15068378
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068476 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaacaacaaacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15068378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15073202 - 15073108
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15073202 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 33541255 - 33541349
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33541255 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat-aaagtgtatggaacaatta 33541349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 580 - 762
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468431
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctc----tatacaaaccctagt 675  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||| ||| |||    |||||||||| ||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctatatatacaaaccgtagt 2468356  T
Q  676 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||          |||||||| |||||||||||| |||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2468357 tt--------gatttctaaatccttgtttcagctccctcta----tctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaa 2468431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 704
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31574000
Alignment:
Q  488 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaaga 586  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaaga 31573888  T
Q  587 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc 686  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||||| ||   || |||||| |||||||||  |||||     
T  31573889 gactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagagaaaa---ctctacaaatcctagttttcgtgttgg 31573983  T
Q  687 ctttctaaacccttgttt 704  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  31573984 c-ttctaaacctttgttt 31574000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14808252 - 14808157
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14808252 tgttgcgcattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 460 - 533
Target Start/End: Original strand, 35872480 - 35872553
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 533  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35872480 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 475
Target Start/End: Original strand, 37214263 - 37214319
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37214263 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43082450 - 43082383
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43082450 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 43082383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 2467976 - 2468066
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2467976 aattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtagggaa 2468066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 30480364 - 30480442
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30480364 gaaaatgacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 30480442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41383158 - 41383060
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatc-acaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  41383158 caattgttgcgagttcgatgaaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtttatggaacaatta 41383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 15185564 - 15185652
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15185564 tgttgtgaattcggtgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 15185652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 27106747 - 27106835
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27106747 tgttgcaaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27106835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25953011 - 25952916
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  25953011 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaagcaatta 25952916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36866014 - 36865935
Alignment:
Q  274 tgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36866014 tgaaaaccacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 36865935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43080079 - 43080012
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43080079 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 43080012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 14419031 - 14419129
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14419031 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 14419129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 13858341 - 13858422
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858341 aattcgatgaaaaatcacaccaataagaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 13858422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14477741 - 14477648
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14477741 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaat 14477648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 3005486 - 3005572
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  3005486 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa--caaagtgtatggaa 3005572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696625
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 4696625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765848
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15956445 - 15956358
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15956445 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatg 15956358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17847848 - 17847661
Alignment:
Q  427 cccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 525  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||| |    |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  17847848 cccagtttggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactata--atgatt----ttacaaaagagatatcaa-aggttacaa 17847756  T
Q  526 gaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||| |||  ||   ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847755 gaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403259
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 37214108 - 37214203
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37214108 ttgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 37214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 16757267 - 16757449
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    ||    
T  16757267 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---taa 16757362  T
Q  516 tgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757363 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21480994 - 21480900
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21480994 caattgttgtgaattcgatgaaaaataacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa 21480900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 483
Target Start/End: Original strand, 28307571 - 28307628
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  28307571 acccagttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccacta 28307628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 6127225 - 6127289
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6127225 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactat 6127289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412409
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799606
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactat 23799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 31071322 - 31071258
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31071322 ttgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 860 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339212
Alignment:
Q  860 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 32339212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 4812487 - 4812554
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4812487 tttgtttacccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 4812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 9021228 - 9021289
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021228 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 16833886 - 16833771
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||| || ||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||      
T  16833886 tttgtttacccagttcgtccaaaagtgacttagtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaat 16833787  T
Q  518 ggttacaagaataagt 533  Q
    | |||||||| |||||    
T  16833786 gattacaagagtaagt 16833771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752424
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccacta 19752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25684825 - 25684758
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25684825 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25684758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28327969 - 28327908
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327969 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctc-----gtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28890948 - 28890881
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28890948 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28895563 - 28895502
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895563 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41385234 - 41385142
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    ||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41385234 ttgttgcgaattccatgaaaaatcacacaaataacaaacttg----gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaatta 41385142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 5372043 - 5372117
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5372043 aaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaaca 5372117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 17799568 - 17799606
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799568 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21482798 - 21482724
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  21482798 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaa 21482724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 721 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375991
Alignment:
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 6375991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 6376315 - 6376215
Alignment:
Q  430 agttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||  ||| ||||||    
T  6376315 agttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaaaaggtaacaaga 6376217  T
Q  528 at 529  Q
    ||    
T  6376216 at 6376215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 607
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||       |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaa----tctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554851
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 29554851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 590855 - 590797
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  590855 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5702576 - 5702512
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  5702576 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctat 5702512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 10930199 - 10930243
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10930199 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14477587 - 14477519
Alignment:
Q  419 tttgttgacc-cagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatat 486  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| | ||||||||    
T  14477587 tttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactatat 14477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 19175847 - 19175783
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  19175847 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 33032715 - 33032657
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33032715 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733830
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 4733830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 4812608 - 4812669
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4812608 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Original strand, 13985956 - 13986011
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985956 tctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 17847558 - 17847504
Alignment:
Q  734 tctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||    
T  17847558 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctca-aaatttggaacaaat 17847504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28328090 - 28328023
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28328090 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 28328023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 29554929 - 29554964
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29554929 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31162686 - 31162612
Alignment:
Q  273 atgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31162686 atgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaa 31162612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 622
Target Start/End: Original strand, 33839077 - 33839120
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839077 accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Original strand, 2467877 - 2467926
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtg 305  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2467877 aattgttgtcaattcgatgaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtg 2467926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 570 - 622
Target Start/End: Original strand, 11701102 - 11701155
Alignment:
Q  570 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11701102 tcttcccgtgaccaagagactcaattctaataatgtttcttcaaggtgaatcaa 11701155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40221910 - 40221869
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  40221910 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40221869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 232)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 24348552 - 24348081
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348552 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 24348453  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348452 gttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 24348358  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348357 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 24348258  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||    
T  24348257 tctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacattgaagatactttttttttttct 24348158  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348157 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 24348081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 22132391 - 22132869
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22132391 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 22132489  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132490 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22132584  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc-----ct 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||    
T  22132585 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcgaa-gagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatct 22132683  T
Q  714 ctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnn 813  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22132684 ctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttttttt 22132783  T
Q  814 nctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22132784 t-tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 22132869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 892
Target Start/End: Original strand, 17662244 - 17662700
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662244 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 17662343  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662344 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 17662438  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662439 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 17662527  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  17662528 tctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac-ttttttttttct 17662626  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttc 892  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662627 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttc 17662700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 22134617 - 22135101
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22134617 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 22134714  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134715 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22134809  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc------- 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22134810 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatct 22134908  T
Q  712 ----ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgn 807  Q
        |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22134909 ctctctctctctctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgt 22135008  T
Q  808 nnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
            ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135009 tttttttttctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 22135101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 419 - 891
Target Start/End: Original strand, 14787428 - 14787894
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagag--cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14787428 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 14787527  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    | |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787528 gagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 14787622  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787623 aatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 14787722  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |    
T  14787723 --tctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttt-t 14787819  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 891  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787820 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 14787894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 44599837 - 44600310
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||     
T  44599837 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatga 44599935  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44599936 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 44600030  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  44600031 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta- 44600129  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct- 816  Q
       |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||         |     
T  44600130 ---tctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacaaataccacactgaagattcgttttttttttc 44600226  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44600227 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 44600310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 8631418 - 8631753
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631418 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 8631517  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631518 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 8631612  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631613 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 8631712  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  8631713 tctctcaaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagt 8631753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 419 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 53405467 - 53404998
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53405467 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--gagagcagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgg 53405370  T
Q  519 gttacaagaataag------tgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 612  Q
    ||||||||||||||      | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53405369 gttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctcttt-----ccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaa 53405275  T
Q  613 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 712  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53405274 ggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc- 53405177  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnn 811  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          
T  53405176 tctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaaatacgtttttt 53405077  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 890  Q
        ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405076 tttttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttct 53404998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 37089371 - 37089707
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37089371 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 37089469  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089470 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 37089564  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089565 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 37089664  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089665 tctctc-aagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 37089707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 419 - 806
Target Start/End: Original strand, 18709163 - 18709548
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18709163 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 18709261  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18709262 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaa 18709356  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18709357 tcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18709456  T
Q  717 --tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
      ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709457 tctctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 18709548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 424 - 842
Target Start/End: Original strand, 47210756 - 47211159
Alignment:
Q  424 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210756 tgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttac 47210855  T
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||               
T  47210856 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa----------- 47210939  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct--ct 721  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47210940 -cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccct 47211038  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctcct 821  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  47211039 ctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttttttttttctcct 47211138  T
Q  822 tcaatgaaagaatatttgcat 842  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  47211139 tcagtgaaagaatatttgcat 47211159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38409538 - 38409199
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38409538 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 38409440  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409439 gttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38409345  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38409344 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctctatc 38409245  T
Q  719 t--ctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409244 tccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 38409199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11006236 - 11006574
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  11006236 tttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaa-gagaaatcaatgg 11006334  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11006335 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11006429  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006430 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 11006529  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006530 ctctctctcaaaatagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 11006574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 424 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030312
Alignment:
Q  424 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttac 56030674  T
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030673 aagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaa-----tctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 56030579  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct 723  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    |||    
T  56030578 cctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttcta----tct 56030483  T
Q  724 caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttc 823  Q
    ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||          ||||||||    
T  56030482 caaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaaagaataccacaccgaagatac-ttttttttttctccttc 56030384  T
Q  824 aatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030383 agtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 56030312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 40637408 - 40637077
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637408 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 40637309  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40637308 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 40637214  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637213 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 40637114  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40637113 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 40637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22044390 - 22044723
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22044390 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 22044488  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22044489 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaa 22044583  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044584 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 22044683  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22044684 tcc----aagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaa 22044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22046685 - 22047018
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22046685 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 22046783  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046784 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22046878  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046879 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 22046978  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22046979 tcc----aagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaa 22047018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24889130 - 24888796
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24889130 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 24889031  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889030 gttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctag-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 24888936  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888935 tcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 24888836  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888835 tct----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 24888796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 9148586 - 9148251
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148586 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 9148488  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148487 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9148393  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9148392 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctctatc 9148293  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9148292 --tctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaa 9148251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11435288 - 11434955
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11435288 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 11435190  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435189 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttc-----cggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11435095  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435094 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 11434995  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434994 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 11434955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22800861 - 22801195
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22800861 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 22800960  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22800961 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc-----ctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 22801055  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22801056 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 22801153  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801154 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 22801195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22802733 - 22803067
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22802733 tttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgg 22802832  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802833 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22802927  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  22802928 tcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 22803025  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803026 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 22803067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 7941657 - 7941319
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7941657 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 7941558  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941557 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7941463  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtg--tttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941462 tcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 7941363  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||| |   ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7941362 tctctcccg--gtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaa 7941319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 2484872 - 2485203
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2484872 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 2484970  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484971 gttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 2485065  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  2485066 tcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccct---tc 2485162  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2485163 tagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 2485203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11008567 - 11008903
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  11008567 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaaa---gaaatcaatgg 11008663  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11008664 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11008758  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008759 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 11008858  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008859 ctctctctcaaaatagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 11008903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47275059 - 47274727
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47275059 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 47274961  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47274960 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaa 47274866  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47274865 tcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 47274769  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274768 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 47274727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 48486653 - 48486319
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  48486653 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgt 48486554  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486553 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 48486459  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  48486458 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 48486361  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486360 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 48486319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 51015579 - 51015246
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  51015579 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgg 51015481  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015480 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51015386  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015385 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 51015286  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51015285 tcc----aagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaa 51015246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 5198754 - 5198420
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198754 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 5198655  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5198654 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaa 5198560  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5198559 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 5198462  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198461 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 5198420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 36921492 - 36921828
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36921492 tttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 36921591  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921592 attacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 36921686  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  36921687 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-ccccctcta- 36921784  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36921785 -tctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaa 36921828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 6765178 - 6764842
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765178 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 6765079  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6765078 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 6764984  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-----gagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6764983 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctt 6764884  T
Q  714 ctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6764883 cta----tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 6764842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 40091414 - 40091748
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40091414 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgg 40091513  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40091514 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 40091608  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40091609 tcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 40091706  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40091707 --tctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaa 40091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 14633652 - 14633323
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14633652 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgg 14633553  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633552 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc------cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14633459  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||    
T  14633458 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccc-----ttc 14633364  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14633363 tatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 14633323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18847486 - 18847153
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18847486 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 18847389  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18847388 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtga 18847294  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18847293 atcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctcta- 18847195  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18847194 ---tctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaa 18847153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 36919583 - 36919920
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36919583 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatgg 36919682  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919683 attacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 36919777  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  36919778 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc--ctat 36919875  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919876 atctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 36919920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24879324 - 24878989
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  24879324 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatg 24879225  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879224 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 24879130  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24879129 atcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagccccctcta- 24879031  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24879030 ---tctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaa 24878989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24880786 - 24880451
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  24880786 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatg 24880687  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880686 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 24880592  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  24880591 accaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgccccctcta- 24880493  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24880492 ---tctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaa 24880451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 47868735 - 47868404
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47868735 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 47868636  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47868635 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 47868541  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47868540 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccctctctatc 47868441  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47868440 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 47868404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 479 - 762
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637802
Alignment:
Q  479 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgt 5637618  T
Q  579 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagtttt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5637619 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 5637718  T
Q  679 gttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5637719 gttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaa 5637802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 31849598 - 31849894
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31849598 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 31849696  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849697 gttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 31849791  T
Q  619 tcaacccacaaaccct-agtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849792 tcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 31849891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 38928176 - 38928511
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  38928176 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 38928275  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928276 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38928370  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  38928371 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctcta- 38928469  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  38928470 ---tctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaa 38928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 19323029 - 19322571
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19323029 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 19322930  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322929 gggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 19322835  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19322834 aatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcatccccctcta 19322739  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac--gnnnnnnnn 814  Q
        |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||               
T  19322738 ----tctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag-atgaatataactcataaatttggaatgaatatcacattgaagatacatttctttttt 19322644  T
Q  815 ctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 887  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322643 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 19322571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 9176473 - 9176807
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9176473 tttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 9176571  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9176572 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 9176666  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176667 atcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 9176766  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||     ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9176767 ctcc----aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 9176807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 16934142 - 16934476
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  16934142 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 16934240  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16934241 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtga 16934335  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16934336 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctcta- 16934434  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934435 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 16934476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 9174145 - 9174479
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  9174145 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatga 9174243  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9174244 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 9174338  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174339 atcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 9174438  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||     ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9174439 ctcc----aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 9174479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22780372 - 22780714
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22780372 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgg 22780470  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780471 gttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtga 22780565  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780566 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctat 22780665  T
Q  717 ---tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       ||||||||  || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22780666 ctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaa 22780714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22782737 - 22783079
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22782737 tttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgg 22782835  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22782836 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtga 22782930  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22782931 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctat 22783030  T
Q  717 ---tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       ||||||||  || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22783031 ctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaa 22783079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824906
Alignment:
Q  477 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttccc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  3824627 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tccc 3824721  T
Q  577 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagtt 676  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3824722 gtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtt 3824821  T
Q  677 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaag-tttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824822 ttgttgttgcttttctaaacc--tgtttcagccccctctatctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 3824906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 16931788 - 16932122
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  16931788 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 16931886  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16931887 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtga 16931981  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16931982 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctcta- 16932080  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16932081 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaa 16932122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 19096217 - 19095882
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19096217 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 19096118  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct--tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19096117 gttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaag-------ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtg 19096025  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19096024 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctct 19095925  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19095924 a----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 19095882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 423 - 788
Target Start/End: Original strand, 33415491 - 33415845
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33415491 ttgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtta 33415590  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33415591 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 33415685  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  33415686 ccctcaaaccttagtgtttgttcc-aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tc 33415780  T
Q  723 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  33415781 tcaaggtttactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaaaaatccctcataaa-ttggaacaaa 33415845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 36378627 - 36378292
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  36378627 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatg 36378528  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36378527 agttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtga 36378433  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36378432 atcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtcta- 36378334  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36378333 ---tctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaa 36378292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 12395844 - 12396178
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12395844 tttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 12395943  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12395944 gttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12396038  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12396039 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatc 12396138  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||   | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12396139 tc----aaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaa 12396178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 440 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543937
Alignment:
Q  440 aaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 639  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgt 13544079  T
Q  640 ttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagttta-gtctg 737  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13544078 ttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttacatctg 13543979  T
Q  738 atacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatt 779  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  13543978 atacaagatctatatttatagtaaaaacatccctcataaatt 13543937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 619447 - 619780
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  619447 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttagggga-gagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 619545  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  619546 gttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagaccca-----atctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaa 619640  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  619641 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccccctcta-- 619738  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  619739 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 619780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 12400806 - 12401140
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12400806 tttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 12400905  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12400906 gttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaa 12401000  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12401001 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatc 12401100  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||   | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12401101 tc----aaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaa 12401140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 429 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16453634 - 16453345
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16453634 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 16453535  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16453534 ataagtctcccgcctaatactacccaaagtccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 16453440  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453439 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctc 16453345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 685
Target Start/End: Original strand, 26085976 - 26086236
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  26085976 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaaacaatgg 26086074  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086075 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 26086169  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttg 685  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086170 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 37313064 - 37313399
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  37313064 tttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatg 37313163  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37313164 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaa-----tctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtga 37313258  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37313259 atcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 37313357  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| | ||||||||   ||||||||||||||||    
T  37313358 ---tctcaaggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaa 37313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 41997826 - 41997494
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  41997826 tttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctgggga-gagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaag 41997728  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41997727 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaa-----tcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 41997633  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||     
T  41997632 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagcccccttta- 41997534  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagta 760  Q
       |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41997533 ---tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagta 41997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 622 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100866
Alignment:
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||    |    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctcta----t 5101038  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctcct 821  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||         ||||||    
T  5101037 ctcaaggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccagattgaagatacgttttttt--tctcct 5100940  T
Q  822 tcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100939 tcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 5100866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 788
Target Start/End: Original strand, 18537472 - 18537829
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18537472 tttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 18537571  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18537572 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtg 18537666  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    ||||||||  | |||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18537667 aatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctct 18537761  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
    |    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||    
T  18537762 a----tctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagcatcactcataaa-ttggaacaaa 18537829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 419 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 36380684 - 36380425
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  36380684 tttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatg 36380585  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380584 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 36380490  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 682  Q
    |||||||| ||||||||| || || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36380489 atcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 498 - 789
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942806
Alignment:
Q  498 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 597  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa------------------cccgtaaccaagagactcaatcct 52942618  T
Q  598 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942619 aatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 52942718  T
Q  698 cttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctg--atacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| | |||||||||||||||    
T  52942719 cttgtttcagcccc-----tctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattactta-aaatttggaacaaat 52942806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 18409346 - 18409679
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| | | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  18409346 tttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatg 18409444  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||      ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  18409445 ggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaa-----tctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggtta 18409539  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |    
T  18409540 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc-----ctct 18409634  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||||  |||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18409635 ctatctcattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaa 18409679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16455576 - 16455354
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16455576 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16455477  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455476 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16455382  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttc 645  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455381 atcaaccatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 419 - 558
Target Start/End: Original strand, 5635475 - 5635614
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635475 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 5635574  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5635575 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 8756249 - 8756583
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8756249 tttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaat 8756348  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaa-gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||      ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8756349 gagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggt 8756443  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctc 714  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8756444 gaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcagccccttc 8756539  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8756540 ta----tctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 8756583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 525 - 762
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937541
Alignment:
Q  525 agaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 624  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||      |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 3937408  T
Q  625 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 724  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||    
T  3937409 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctcta----tctc 3937504  T
Q  725 aaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3937505 aaggtttactctgata-aaagtctatatttatagtaaa 3937541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11437696 - 11437557
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437696 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 11437598  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcc 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11437597 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 4215640 - 4215490
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4215640 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 4215541  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  4215540 gttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttc 4215490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 18534830 - 18535162
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  18534830 tttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaat 18534929  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18534930 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtg 18535024  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  18535025 aatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcagccccctct 18535119  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||    
T  18535120 a----tctcaaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaa 18535162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 535 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132873
Alignment:
Q  535 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 634  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccct 6132996  T
Q  635 agtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagt 734  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    || |||||      
T  6132995 agtgtttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtt-cagcctcctctatctc----aatgtttaca 6132901  T
Q  735 ctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6132900 ccgatacaatgtctatatttatagtaaa 6132873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 678
Target Start/End: Original strand, 38890223 - 38890476
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38890223 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 38890322  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38890323 gggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatg 38890417  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagtttt 678  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38890418 aatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 423 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13547484 - 13547302
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  13547484 ttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagtta 13547385  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 610  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547384 caagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 419 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 27499376 - 27499128
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || |       
T  27499376 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatta--- 27499281  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  27499280 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatc-----gtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatga 27499186  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagt 675  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27499185 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 419 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 2891626 - 2891433
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2891626 tttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 2891527  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891526 ggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 430 - 789
Target Start/End: Original strand, 15032557 - 15032896
Alignment:
Q  430 agttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15032557 agttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 15032656  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |      ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |    
T  15032657 ataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaa-----atcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaa-cctc 15032750  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
    |          |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||     
T  15032751 a----------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccccttta----tctcaag 15032834  T
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  15032835 gtttactctggtaccaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 15032896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 597 - 762
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270319
Alignment:
Q  597 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 696  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  697 ccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||| | ||||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttcta----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 38270319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 597 - 762
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446912
Alignment:
Q  597 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 24446850  T
Q  697 ccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 24446912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 419 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12102423 - 12102221
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  12102423 tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagt 12102324  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||      ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102323 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttcca-----atcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 12102229  T
Q  616 gaatcaac 623  Q
    ||||||||    
T  12102228 gaatcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28454018 - 28453742
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  28454018 tttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 28453919  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
     | |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| |||| |      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28453918 agtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtg 28453824  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    |||||| |  | ||||||||||||| || | ||||| ||| |||  | ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  28453823 aatcaatc--ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttt 28453742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5101262 - 5101130
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  5101262 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgg 5101164  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctaccc 552  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  5101163 gttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 736 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 30136596 - 30136438
Alignment:
Q  736 tgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaata 835  Q
    |||||| |||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  30136596 tgatactaggtatatatttatagagaa-atataactaataaatttagaacgaatatcacactgaagatacgttttttttttctccttcaatgaaagaata 30136498  T
Q  836 tttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136497 tttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 30136438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 8631258 - 8631355
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8631258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 8631355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24348693 - 24348597
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24348693 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaactaaat 24348597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30136884 - 30136640
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| || | | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||    
T  30136884 tttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatg 30136785  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      | ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  30136784 agtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcaca-----atttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtga 30136690  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaacc 670  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||    
T  30136689 atcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 2484715 - 2484810
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2484715 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaattaaat 2484810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 5635318 - 5635413
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5635318 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 5635413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 9176311 - 9176410
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9176311 caattgttgcgaattcgacgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaa 9176409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 31849440 - 31849535
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31849440 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 31849535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 25357977 - 25357610
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  25357977 tttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 25357878  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattc----tacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 611  Q
    |||||||||||||||||  ||   | ||||||    || |||||||||||      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25357877 gggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtccca-----atctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 25357783  T
Q  612 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccc 710  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |    |  ||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  25357782 aggtgaatcaa-tcac-aaccctagtgtctcccacttagaga-aatctctct--aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccc 25357690  T
Q  711 c-ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    | |||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||| |||||||||||    
T  25357689 ctctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcgtaaaattggaacaaat 25357610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 641 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891356
Alignment:
Q  641 tgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 2891356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47868895 - 47868797
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47868895 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataaaat 47868797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 9173986 - 9174082
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9173986 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaataattaaat 9174082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 11008404 - 11008504
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008404 caattgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 11008502  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  11008503 at 11008504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5198895 - 5198800
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198895 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 5198800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7941814 - 7941719
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7941814 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaacaacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatgaaat 7941719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 11006091 - 11006190
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11006091 aattgttgtgaattcgatcgaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 11006189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 26085818 - 26085902
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26085818 tgttgcgaattcgatgagaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 26085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 431 - 619
Target Start/End: Original strand, 3982186 - 3982374
Alignment:
Q  431 gttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  3982186 gttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaa 3982285  T
Q  529 taagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 619  Q
    | |||  ||   | ||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982286 tcagtcttcaaacttaattctacccaaagtccca----aatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 16185833 - 16186018
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | |||||     
T  16185833 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaa 16185931  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||| |||||||||||  ||   |||||||||||||||||| |||      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185932 gggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttcca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 22046522 - 22046623
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg--aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22046522 caattgttgtgaattcgatcgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22046620  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  22046621 aat 22046623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 9864047 - 9863712
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctgggga--agagagcagccctccgatccactata----tgatgagtaacgttacaaaagagaaa 511  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| |    
T  9864047 tttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gagata 9863949  T
Q  512 tcaatgggttacaagaataagtgtcccgcct-aattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 610  Q
    ||||  |||||||||||| ||| | |   || |||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9863948 tcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttccc 9863854  T
Q  611 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 709  Q
    |||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||         
T  9863853 aaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactc--tacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttttcag 9863760  T
Q  710 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    | ||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9863759 ctctcta-ctatctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatag 9863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 22132248 - 22132326
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22132248 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 22132326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 17662092 - 17662184
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  17662092 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatc-aaaccaaagtgtatggaacaatta 17662184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11435430 - 11435350
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11435430 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 11435350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 14789269 - 14789367
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14789269 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14789367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 22802573 - 22802671
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22802573 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 10113198 - 10112847
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-ggtta 522  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||    
T  10113198 acccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggtta 10113100  T
Q  523 caagaataagtgtcccgc-ctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    ||||||| ||| | |    ||||||||||||||||||| |  ||||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10113099 caagaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttc----cccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatca 10113004  T
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 720  Q
    | |    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||    ||||    
T  10113003 atc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttttcaactccc----tctc 10112914  T
Q  721 tctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttat-agtaaacatataactcataaatttggaac 785  Q
    |||| | |||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10112913 tctcgaggtttacatctgatacaatgtctatatttataaaaaaaaatataactcataaatttggaac 10112847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11437856 - 11437758
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11437856 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaattaaat 11437758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 37089212 - 37089309
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37089212 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 37089309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9148727 - 9148631
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9148727 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 9148631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 460 - 623
Target Start/End: Original strand, 31983567 - 31983727
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagt 557  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||    
T  31983567 agagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagt 31983666  T
Q  558 cccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    | ||      ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983667 ctcaa-----tctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 24446501 - 24446596
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24446501 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaaaaatta 24446596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 816 - 895
Target Start/End: Original strand, 38890516 - 38890596
Alignment:
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38890516 tctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcata 38890596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 47210634 - 47210733
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47210634 aattgttgcgaattcgttgtgaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 47210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49089045 - 49088950
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49089045 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 49088950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51015720 - 51015641
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015720 aaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 51015641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 14787274 - 14787368
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14787274 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 14787368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 36921334 - 36921432
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36921334 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 36921432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 38928024 - 38928114
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38928024 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 38928114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 3937125 - 3937212
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3937125 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 3937212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 22134476 - 22134553
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22134476 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 22134553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6765335 - 6765247
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6765335 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 6765247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14633810 - 14633714
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14633810 tgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 14633714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18847627 - 18847549
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18847627 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaataattaaat 18847549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Original strand, 22780211 - 22780296
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtat 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22780211 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtat 22780296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 22782573 - 22782662
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  22782573 caattgttgcgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatg 22782662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 22044249 - 22044328
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22044249 aaaataacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 22044328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24889286 - 24889192
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24889286 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24889192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Original strand, 36919432 - 36919523
Alignment:
Q  263 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36919432 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 36919523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 16931629 - 16931727
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16931629 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 16931727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 33415334 - 33415429
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33415334 tgttgcgaatccgatgagaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaatta 33415429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 44599679 - 44599775
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44599679 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaa-ggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 44599775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47563095 - 47563009
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa 505  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47563095 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4215795 - 4215697
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4215795 aattgttgcgaattcgatgagaaaactcacacaaataacaacttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaa-caaaaacaaagtgtatgaaacaatta 4215697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38409680 - 38409600
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38409680 gaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaa-caaattgtatggaacaattaaat 38409600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40637566 - 40637470
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40637566 tgttgcgaattcgttgagaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaatta 40637470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53405629 - 53405538
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  53405629 aattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaa 53405538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2891780 - 2891686
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2891780 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 2891686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 3824447 - 3824540
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824447 tgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaaca 3824540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 22800705 - 22800799
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22800705 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatta 22800799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36378781 - 36378685
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36378781 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatgaaacaatta 36378685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 622
Target Start/End: Original strand, 47150898 - 47151092
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | || |  || | ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  47150898 acccaattcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttac 47150997  T
Q  524 aagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||| | |   |||||||||||||||| || ||      |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47150998 aagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaa-----tctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 40091258 - 40091354
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40091258 ttgttgcgaattcgatgaaaaattcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaataatta 40091354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 461 - 704
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999226
Alignment:
Q  461 gagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtc 558  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |   ||| |||   |||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  559 ccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatc 658  Q
     |       ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    || |||||||||||||   ||||| ||| |    
T  40999090 tcga-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatc--tcaatcctagtgtttgttgtcaagag-caaac 40999181  T
Q  659 tctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  40999182 tctatacaacccctagttttcttgttgac-gtctaaacccttgttt 40999226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 52942328 - 52942425
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942328 ttgttgcaaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaatta 52942425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 460 - 533
Target Start/End: Original strand, 24446681 - 24446754
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 533  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24446681 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5101405 - 5101310
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5101405 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 5101310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16453800 - 16453706
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16453800 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatgaaaca 16453706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16455714 - 16455624
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16455714 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 16455624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 37312924 - 37313018
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37312924 tgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 37313018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47563231 - 47563153
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47563231 gaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47563153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 49088905 - 49088791
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag-agaaatcaat 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||    
T  49088905 tttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattacaaaagaagatgtcaat 49088806  T
Q  517 gggttacaagaataa 531  Q
    | |||||||||||||    
T  49088805 gagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 14789427 - 14789495
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--aagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||    
T  14789427 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5664722 - 5664635
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5664722 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 5664635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047447
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10047447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Original strand, 18709021 - 18709088
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18709021 aaaaccacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 18709088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19323177 - 19323090
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19323177 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaat-aaagtgtatggaa 19323090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246062
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 39246062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 38269993 - 38270068
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38269993 attgttgggaattcgatagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaa 38270068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 9022605 - 9022362
Alignment:
Q  454 tggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg--gttacaagaataagtgtcccg-cctaattcta 549  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||| | |   |||||||| |    
T  9022605 tgggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcaa 9022507  T
Q  550 cccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaa 648  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| | |    
T  9022506 cccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgcca 9022414  T
Q  649 agagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  9022413 agag--aat-tctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgttt 9022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 18409189 - 18409281
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409189 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18409281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18534689 - 18534770
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18534689 gaattcgatgaaactcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18534770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27499530 - 27499442
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27499530 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaa-caaagtttatggaacaatta 27499442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269220
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 5269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12102566 - 12102479
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaat-aacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12102566 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaactacttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 12102479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 8756101 - 8756176
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  8756101 attgttgtgaattcgatgaaaatcacatcaataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa 8756176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 16933984 - 16934081
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  16933984 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttaatgtgtggagcaaggg--aattaagcaaccaaaa--caagcgtatggaataattaa 16934079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315258
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329467
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6133171 - 6133105
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||    
T  6133171 tttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6133308 - 6133231
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  6133308 aaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaa-caaagtgtatgaaacaatta 6133231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 11853731 - 11853549
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  11853731 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 11853636  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853635 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 15032401 - 15032480
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15032401 aattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 15032480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 580 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 10114505 - 10114443
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  10114505 accaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 10114443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13547621 - 13547548
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547621 cacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 13547548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 688 - 789
Target Start/End: Original strand, 16186099 - 16186197
Alignment:
Q  688 tttctaaacccttgtttc-agccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaaca 786  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||  ||| |||| ||||||||    
T  16186099 tttctaaacccttgtttttagccccctct----ctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatccctcctaaaattggaaca 16186194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 56030945 - 56030857
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataa-caacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  56030945 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 56030857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396700
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19096370 - 19096298
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19096370 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacactaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaa 19096298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25862115 - 25862051
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25862115 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactat 25862051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985663
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactat 31985663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36380827 - 36380742
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36380827 aattcgatgaaaatcacaccaataaaatatttgatgtgtggagtaagtaatgatcaagcaatcaaa--caaagtgtatgaaacaatta 36380742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152468
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41997958 - 41997887
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41997958 aaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 41997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 472
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867239
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccct 472  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg-agagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743444
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactat 6743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 7050378 - 7050439
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050378 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 826 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 9022244 - 9022182
Alignment:
Q  826 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9022244 tgaaagaatatttgcatcaaa-------tattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcata 9022182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 18537322 - 18537412
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18537322 aattgttgtgaattcgatgaagttcacacctataaaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18537412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18587149 - 18587082
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18587149 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 18587082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 458
Target Start/End: Original strand, 52942487 - 52942526
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 458  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942487 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 52942526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 55822303 - 55822265
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822303 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Original strand, 619297 - 619370
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  619297 ttgttgcggattcgatgagaaaacacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaa 619370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 31300606 - 31300427
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||| |||| ||      
T  31300606 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggga-gagagcagccctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 31300511  T
Q  515 atgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
     || ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31300510 -tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47275190 - 47275137
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47275190 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat 47275137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 455
Target Start/End: Original strand, 3937273 - 3937309
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3937273 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctg 3937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143327
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactat 5143327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 8529328 - 8529270
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8529328 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 15317019 - 15316961
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15317019 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 16489388 - 16489352
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489388 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16623386 - 16623322
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  16623386 ttgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 18587027 - 18586969
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587027 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 568 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 25699788 - 25699752
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699788 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 4884912 - 4884877
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4884912 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4885057 - 4884990
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  4885057 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Original strand, 5336925 - 5336964
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5336925 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8529450 - 8529383
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8529450 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 8529383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 15831179 - 15831144
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15831179 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 28453715 - 28453660
Alignment:
Q  734 tctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||||||||||    
T  28453715 tctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatccctcaaataattggaacaaat 28453660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Original strand, 52043712 - 52043763
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043712 ctctctctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 52043763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 54906777 - 54906722
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906777 tctcttccagtgaccaagagactcaattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4570132 - 4570094
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4570132 ctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 12395687 - 12395784
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  12395687 aattcttgcaaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagagtatcgaaaaatta 12395784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 12400649 - 12400746
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  12400649 aattcttgcaaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagagtatcgaaaaatta 12400746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22295203 - 22295153
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22295203 ctctatctctctcaagatttcatctgatacaaggtttatatttatagtaaa 22295153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24879423 - 24879386
Alignment:
Q  315 ataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24879423 ataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24879386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 4556085 - 4556126
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  4556085 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4556126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 12102162 - 12102090
Alignment:
Q  688 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12102162 tttctaaacccttgttttcagcccccc---tctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaa 12102090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831257
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 15831257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455323
Alignment:
Q  689 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctc 16455323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 34495906 - 34495853
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34495906 agttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccacta 34495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769595
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 36769595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 629 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 54906702 - 54906631
Alignment:
Q  629 aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  54906702 aaccctagtgtttgttgcaaagagaaaa---ctttacaaaccctagttttattgttggc-ttctaagcccttgttt 54906631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 208)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 31735522 - 31735997
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31735522 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 31735621  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31735622 attacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaa 31735716  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31735717 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 31735816  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  31735817 tcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt-tct 31735915  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31735916 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 31735997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 47906550 - 47906074
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906550 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 47906451  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47906450 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 47906356  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  47906355 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 47906256  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |    
T  47906255 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac--ttttttttt 47906158  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47906157 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 47906074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 460 - 900
Target Start/End: Original strand, 21948230 - 21948665
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcc 559  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21948230 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 21948329  T
Q  560 cagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatct 659  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21948330 cagc-----gtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaact 21948423  T
Q  660 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21948424 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagt 21948523  T
Q  760 aaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct-ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattc 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948524 aaacatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttttttttttcctccttctgtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattc 21948623  T
Q  859 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21948624 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 21948665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 27339132 - 27339608
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339132 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 27339230  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27339231 gttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctct-----tcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaa 27339325  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27339326 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccccctctatc 27339425  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |     
T  27339426 tctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttcttttttttt 27339525  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27339526 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 27339608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 27336941 - 27337414
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27336941 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 27337039  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337040 gttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttc-----ccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27337134  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337135 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27337233  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||         | |    
T  27337234 tctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacgcataaatttggaacaaataccacatcgaagatacgtttttttt-ttt 27337332  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27337333 ccttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 27337414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 39932354 - 39931880
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-aagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39932354 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatg 39932255  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39932254 ggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcag-----tctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtta 39932160  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932159 atcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 39932060  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||         ||    
T  39932059 c--tctcaaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacgaatactacactgaagatacgtttttttt-tc 39931963  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39931962 tccttcaataaaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 39931880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 15294835 - 15295321
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294835 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 15294934  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294935 gttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 15295029  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  15295030 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatc 15295129  T
Q  717 --------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnn 808  Q
            |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||       
T  15295130 tctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaattaggaacgaataccacactgaagatacatt 15295229  T
Q  809 nnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295230 ttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 15295321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 24325943 - 24325465
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325943 tttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgg 24325844  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24325843 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 24325749  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  24325748 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtttcagccccctctatc 24325650  T
Q  717 --tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnn 814  Q
      |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             
T  24325649 tctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactaaagatac-attttttt 24325551  T
Q  815 ctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24325550 ttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 24325465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 9463245 - 9463722
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9463245 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 9463343  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9463344 gttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 9463438  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9463439 atcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 9463538  T
Q  717 -tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnc 815  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             
T  9463539 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaagatacgtttttttt- 9463637  T
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9463638 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgata 9463722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 46431707 - 46432201
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga--agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46431707 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaat 46431805  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431806 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----tcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 46431900  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc----- 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  46431901 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccatct 46432000  T
Q  712 ------------ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactga 799  Q
                |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46432001 ctctctctctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacagtga 46432100  T
Q  800 agatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgat 899  Q
    |||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46432101 agatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgat 46432200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 9459418 - 9459890
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9459418 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgg 9459516  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9459517 gttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 9459611  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9459612 atcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctctat 9459711  T
Q  717 -tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnc 815  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             
T  9459712 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaagatacgtttttttt- 9459810  T
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9459811 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcata 9459890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 2510326 - 2510800
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2510326 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgg 2510425  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2510426 gttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaa-----tctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 2510519  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2510520 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctctatc 2510619  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct-- 816  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||      
T  2510620 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaaatacgttttttttcttt 2510719  T
Q  817 --ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510720 ccctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 2510800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 17324637 - 17325104
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17324637 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatga 17324736  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324737 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 17324831  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17324832 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagccccctgtatc 17324931  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    | ||   | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||         |||    
T  17324932 t-tc---aggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcaccctgaagatacgttttttttttct 17325027  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17325028 ccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcata 17325104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 51750319 - 51749985
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750319 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 51750220  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750219 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51750125  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750124 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 51750025  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750024 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 51749985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28840959 - 28840624
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28840959 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 28840861  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840860 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28840766  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  28840765 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgta-- 28840668  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840667 tctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 28840624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 419 - 884
Target Start/End: Original strand, 28998254 - 28998710
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  28998254 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatga 28998353  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998354 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28998448  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  28998449 tcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctcta-- 28998546  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||         |||    
T  28998547 --tctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaatatacggtttttttttct 28998644  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 884  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998645 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 28998710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 419 - 884
Target Start/End: Original strand, 29003970 - 29004426
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  29003970 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatga 29004069  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004070 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 29004164  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  29004165 tcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctcta-- 29004262  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||         |||    
T  29004263 --tctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaatatacggtttttttttct 29004360  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 884  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004361 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 29004426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2618199 - 2617859
Alignment:
Q  17 actttgtacggttcttcttagttttttccaatctgatttctctttaatgcaaactacctctcggcacacgtggtacaatacnnnnnnnctctccctcaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||    
T  2618199 actttgtacggttcttcttagttttttccaatctgatttctctttaatgcaaactacctctcggcacatgtggtacaatacaaaaaaactctccctcaca 2618100  T
Q  117 acttctattcttgtactcattgtgtgttccatcaattgttaaacaaagatcactaaccgttaaacaacagcggaaacttcataatataacttggt-nnnn 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||         
T  2618099 acttctattcttgtactcattgtgtgttccatcaattgttaaacaaagatcactaaccgttaaacaacggtggaaacttcataatataacttggtaaaaa 2618000  T
Q  216 nnnntataaaagggtaaatgagtacacacattttacatgacaattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaaggga 315  Q
        |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2617999 aaaatataaaagggtaaatgagtacacgaattttacatgacaattgttgcgaattcgatgaaaaccacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaaggga 2617900  T
Q  316 taatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617899 taatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 2617859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 477 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 48665400 - 48664975
Alignment:
Q  477 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttccc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  48665400 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc----ccg 48665305  T
Q  577 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagtt 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48665304 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagtt 48665205  T
Q  677 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcat 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48665204 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcat 48665105  T
Q  775 aaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct---------ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttca 865  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||         |          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665104 aaatttggaacaaatactacactgaagatacgttttttttttttttttttctttcttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttca 48665005  T
Q  866 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48665004 aaatatatgtgcatcaaatcgttcttcata 48664975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Original strand, 10399829 - 10400159
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399829 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 10399928  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399929 gttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10400023  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400024 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10400123  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    || |    |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10400124 tccc----agtttgctctgatacaaggtctatatttatag 10400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15823826 - 15823492
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15823826 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgg 15823727  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15823726 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaa 15823632  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15823631 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatc 15823532  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15823531 tct----aagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaa 15823492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 423 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2617792 - 2617465
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617792 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 2617693  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617692 caagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 2617598  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    ||    
T  2617597 ccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctcta----tc 2617502  T
Q  723 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2617501 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 2617465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 12302506 - 12302845
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  12302506 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 12302605  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302606 gttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12302700  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302701 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatc 12302800  T
Q  719 tctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302801 tctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 12302845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28842774 - 28842439
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28842774 tttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 28842676  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28842675 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 28842581  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842580 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28842481  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28842480 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaa 28842439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6823294 - 6822961
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6823294 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatga 6823195  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6823194 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaa 6823100  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6823099 tcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 6823003  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6823002 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaa 6822961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47179992 - 47179655
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  47179992 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggga-gagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 47179895  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47179894 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 47179800  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179799 atcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 47179700  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47179699 ctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 47179655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13215366 - 13215027
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaa----atc 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    |||    
T  13215366 tttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatc 13215267  T
Q  514 aatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13215266 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaag 13215172  T
Q  614 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215171 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 13215072  T
Q  714 ctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215071 cta----tctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 13215027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13762116 - 13761783
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13762116 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 13762018  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13762017 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacag-----actcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaa 13761923  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  13761922 tcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctcta-- 13761825  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761824 --tctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 13761783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20302738 - 20302405
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20302738 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 20302640  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302639 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctag-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20302545  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20302544 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 20302447  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20302446 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaa 20302405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 2949233 - 2949692
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2949233 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcggggga-gagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 2949331  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949332 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctc-----gtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 2949426  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  2949427 tcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 2949524  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||| ||||  || ||| |||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||         |||    
T  2949525 --tctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagtataactcataaatttggaacgaatacc------aagatacgttttttttttct 2949616  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2949617 -cttcagtgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcata 2949692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 792
Target Start/End: Original strand, 6995701 - 6996065
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  6995701 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatga 6995800  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6995801 gttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaa 6995895  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  6995896 tcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggccccctcta-- 6995993  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaatacc 792  Q
      ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6995994 --tctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaacgaatacc 6996065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47177641 - 47177304
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  47177641 tttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggga-gagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 47177544  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47177543 gttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtga 47177449  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177448 atcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 47177349  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47177348 ctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 47177304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16226447 - 16226113
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16226447 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 16226349  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226348 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16226254  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  16226253 atcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctcta- 16226155  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226154 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 16226113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 38925482 - 38925813
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38925482 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgttttactat--gatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 38925578  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38925579 gttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 38925673  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  38925674 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagccccctcta-- 38925771  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925772 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 38925813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 41647200 - 41646866
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41647200 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatga 41647101  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647100 gttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaa-----tctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 41647006  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||   ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41647005 tcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctcta-- 41646908  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646907 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 41646866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 51752643 - 51752311
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51752643 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 51752545  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51752544 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaaggtgaa 51752451  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51752450 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctctatc 51752351  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752350 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 51752311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 39462799 - 39462439
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||    
T  39462799 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagg 39462700  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462699 gttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 39462605  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||      
T  39462604 tcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagccttctcta-- 39462507  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| | |||||||||||||||    
T  39462506 --tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattactta-aaatttggaacaaat 39462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 50307547 - 50307882
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50307547 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 50307646  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307647 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 50307741  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    ||    
T  50307742 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagcccc----at 50307837  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     | |||||| ||||| | |||||||| |  |||||||||||||||    
T  50307838 atatctcaaggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaa 50307882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20291736 - 20291403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  20291736 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttac-aaagagaaatcaatgg 20291638  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291637 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctag-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20291543  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||      
T  20291542 tcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctcta-- 20291445  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20291444 --tctcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaa 20291403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 14097970 - 14098302
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14097970 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatg 14098069  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct--tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14098070 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaag-------ctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 14098162  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  14098163 gaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagtcccctct 14098262  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14098263 a----tctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagt 14098302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 18839868 - 18839571
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18839868 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 18839769  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839768 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----ttctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 18839674  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839673 atcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagccccctctat 18839574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18307389 - 18307059
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18307389 tttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 18307291  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18307290 cgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtga 18307196  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307195 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 18307097  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18307096 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 18307059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 28207069 - 28207401
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  28207069 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 28207166  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||      |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207167 gttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaa-----tctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28207261  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28207262 taaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 28207359  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207360 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 28207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 50076673 - 50077007
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50076673 tttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggga-gagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 50076771  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076772 gattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 50076866  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    || |    
T  50076867 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagcc----cttt 50076962  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50076963 ctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 50077007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 16428934 - 16428638
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16428934 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16428835  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16428834 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 16428740  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428739 atcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 16428640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 722
Target Start/End: Original strand, 4131376 - 4131678
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tc 513  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||    
T  4131376 tttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatc 4131475  T
Q  514 aatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131476 aatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 4131569  T
Q  614 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4131570 gtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccct 4131669  T
Q  714 ctatctctc 722  Q
    |||||||||    
T  4131670 ctatctctc 4131678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11457476 - 11457810
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11457476 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 11457575  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||      ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11457576 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaa-----tctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 11457670  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  11457671 tcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagccccctcta-- 11457768  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11457769 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 11457810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 17186128 - 17186463
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  17186128 tttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatg 17186227  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17186228 ggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtga 17186322  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17186323 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctat 17186422  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    || ||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  17186423 ctc----aaggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaa 17186463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 25251275 - 25251610
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  25251275 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatg 25251374  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25251375 ggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtga 25251469  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25251470 atcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccctcta- 25251568  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25251569 ---tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaa 25251610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 50078821 - 50079156
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  50078821 tttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatg 50078920  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50078921 ggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtga 50079015  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50079016 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcagccccctctat 50079115  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    || |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  50079116 ctc----aaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 50079156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 427 - 762
Target Start/End: Original strand, 9241094 - 9241421
Alignment:
Q  427 cccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9241094 cccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaa 9241193  T
Q  526 gaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 625  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9241194 gaataagtctcccgtctaattctacccaaagcccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccc 9241288  T
Q  626 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctca 725  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |    
T  9241289 tcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccc---ctctatctta 9241384  T
Q  726 aagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9241385 aggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaa 9241421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 3579618 - 3579953
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3579618 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 3579716  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||      |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3579717 gttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaa-----tctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaaggtgaa 3579811  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||    
T  3579812 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagccccccc--tc 3579909  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579910 tatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaa 3579953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 25128153 - 25127815
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25128153 tttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 25128054  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25128053 aattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtga 25127959  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25127958 atcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaggcccctctat 25127859  T
Q  718 ctc--tctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    |||  |||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25127858 ctctctctcaaggtttacatctaatacaaggtttatatttatag 25127815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 31425016 - 31425316
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31425016 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggga-gagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 31425114  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagaga---ctcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31425115 agttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaagg 31425209  T
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425210 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 31425309  T
Q  714 ctatctc 720  Q
     ||||||    
T  31425310 ttatctc 31425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31490192 - 31489861
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  31490192 tttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatga 31490094  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||      ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31490093 gttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 31489999  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31489998 tcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaact--atacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccccctctatc 31489901  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  31489900 tc----aaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 31489861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 6756808 - 6756514
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6756808 tttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 6756709  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756708 aggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctc-----gtaatcaaga--ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 6756616  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6756615 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcagtcccctct 6756516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 422 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451594
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagtt 47451820  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||         | || ||||||||    
T  47451819 acaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatca 47451731  T
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    |    
T  47451730 accctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctcta----t 47451635  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451634 ctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 47451594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 500 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823830
Alignment:
Q  500 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctctt--cccgtaaccaagagactcaatcct 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |  ||||||||||||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  598 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 6823892  T
Q  698 cttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6823891 cttgtttcagccccc---ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaa 6823830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 50248571 - 50248907
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagag--cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  || || || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  50248571 tttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaat 50248670  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50248671 gggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcga-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 50248765  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  50248766 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctcta 50248865  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50248866 ----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 50248907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 17319167 - 17318814
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||     
T  17319167 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggga-gagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaata 17319069  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  17319068 agttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctgttcccgtaaccaagagactcaatcct------gtttcccaaggtga 17318980  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17318979 atcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 17318881  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
       |||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
T  17318880 ---tctcaaggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaaaaatccctcataaa-ttggaacaaa 17318814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 31422861 - 31423236
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccac------------tata-tgatgagtaacgttacaaaa 505  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||            |||| ||||||||||| ||||||||    
T  31422861 tttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 31422960  T
Q  506 gagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 605  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31422961 gagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgt 31423055  T
Q  606 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423056 ttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31423155  T
Q  705 cagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||  |||  | |||||| |||||||||||    
T  31423156 cagccccctcta----tctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagtatctcccataaaattggaacaaat 31423236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 17324344 - 17324011
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  17324344 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatg 17324245  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||      ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324244 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaa-----tctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 17324150  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||     
T  17324149 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagccctctcta- 17324053  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17324052 ---tctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttataataaa 17324011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 42922512 - 42922153
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42922512 tttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 42922413  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42922412 gggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtg 42922318  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42922317 aatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctcta 42922222  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
        ||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  42922221 ----tcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaat 42922153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 419 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 40134225 - 40133937
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40134225 tttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 40134126  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40134125 tgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtga 40134031  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 711  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40134030 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 14183591 - 14183921
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14183591 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 14183690  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |      |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14183691 gggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttccaaggtg 14183785  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14183786 aatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagttt--gtgttg-cattctaaacccttgtttcagccctctcta 14183879  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14183880 ----tctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaa 14183921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 419 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 16432676 - 16432396
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16432676 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaat 16432577  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||      ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16432576 gggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttca-----atctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtg 16432482  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432481 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttctgccccct 16432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 419 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16231842 - 16231630
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16231842 tttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 16231745  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16231744 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16231650  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagt 637  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16231649 atcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 431 - 789
Target Start/End: Original strand, 8347284 - 8347631
Alignment:
Q  431 gttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8347284 gttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 8347383  T
Q  529 taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 628  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||      ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||       
T  8347384 taagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaa-----tctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct-- 8347476  T
Q  629 aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaag 728  Q
    |||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    || |    
T  8347477 aaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaacccttgtttcaaccccctctatctc----aagg 8347570  T
Q  729 tttag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||   |||||||| |||||||||||    
T  8347571 tttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagtacccctcataaaattggaacaaat 8347631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23786119 - 23785935
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23786119 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 23786021  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786020 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 51757810 - 51757623
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |    
T  51757810 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aaagagaaatcgatag 51757712  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 612  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757711 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 16429238 - 16429042
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16429238 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 16429139  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16429138 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattccca-----atctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttga 16429044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 446 - 762
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800904
Alignment:
Q  446 acctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaa 544  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  545 ttctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||||||||||||| | |      ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||| |||||     
T  18800700 ttctacccaaagttcaaa-----tctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtg 18800792  T
Q  645 ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaag 744  Q
     | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||    |||||| ||||| |||||||||||    
T  18800793 gccaagag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgac-ttctaaacctttgtttcagccccttgta----tctcaaggtttactctgatacaag 18800886  T
Q  745 gtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18800887 gtctatatttatagtaaa 18800904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 419 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 23816166 - 23816027
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816166 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 23816067  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23816066 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 419 - 637
Target Start/End: Original strand, 25248552 - 25248766
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25248552 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 25248651  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25248652 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctca-----atctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtga 25248746  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagt 637  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  25248747 atcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 680
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669648
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcct 542  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  543 aattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 642  Q
    |||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15669519 aattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttg 15669611  T
Q  643 ttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgt 680  Q
    || | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  15669612 ttgccaagag-caaactttatacaaaccctacttttgt 15669648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 511 - 884
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520580
Alignment:
Q  511 atcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttccc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||  |||||| | |  | || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  609 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cag 707  Q
    ||||||||||||||||    || | ||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacctc--aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaaccgttgttttcag 26520401  T
Q  708 ccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac-- 805  Q
    |||||    ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  26520402 cccccc---tctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagagaa-atataacttataaatttggaacgaatatcacactgaagatacat 26520497  T
Q  806 ----gnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 884  Q
                  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520498 ttcttttgtttttttcttcttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 430 - 789
Target Start/End: Original strand, 49495222 - 49495561
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49495222 agttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 49495321  T
Q  529 taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 628  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |       
T  49495322 tgagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaactc--- 49495413  T
Q  629 aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaag 728  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  49495414 aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagttt--------gatttataaacccttgtttcagccccctcta----tctcaagg 49495500  T
Q  729 tttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| || ||||||||    
T  49495501 tttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattcgaacaaat 49495561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 624
Target Start/End: Original strand, 6115103 - 6115304
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||     
T  6115103 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatt 6115202  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||      |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6115203 ggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtga 6115297  T
Q  618 atcaacc 624  Q
    |||||||    
T  6115298 atcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 8349051 - 8349411
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||| ||| ||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  8349051 tttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaat 8349150  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |      ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8349151 gagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaa-----tctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 8349245  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8349246 aataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccctctcta 8349341  T
Q  717 tctctctcaaagttt-agtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
        |||||| ||||   ||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  8349342 ----tctcaaggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaattatccctcataaaattggaacaaat 8349411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Original strand, 13125457 - 13125787
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||  ||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  13125457 tttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 13125556  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    ||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||      ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||    
T  13125557 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgt 13125651  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctata-caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 714  Q
    |||||||||    |||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||      
T  13125652 gaatcaacc--tcaaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttggc-ttcttaacccttgtttcagccccc-- 13125745  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
      | ||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13125746 --tttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatag 13125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20291898 - 20291798
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20291898 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaa 20291799  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  20291798 t 20291798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13359012 - 13358927
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13359012 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 13358927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51750477 - 51750381
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51750477 ttgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 51750381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 13447117 - 13447212
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13447117 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13447212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10399669 - 10399767
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399669 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 10399767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 30790401 - 30790729
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30790401 tttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggg-aagagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 30790499  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||| |     | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30790500 gggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctc-----catctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggt 30790593  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctc 714  Q
     |||||| |||| ||||||||||| |    |  ||||| ||||||||   ||||||||||||  |  |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30790594 aaatcaa-ccac-aaccctagtgtctccctcttagaga-aatctcta---aaaccctagtttattgtttg--tttctaaactcttgttttcagctccctc 30790685  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30790686 ta----tctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaa 30790729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 15294678 - 15294773
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15294678 tgttgcgatttcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 15294773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20302879 - 20302783
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20302879 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaattaaat 20302783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13762275 - 13762178
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13762275 tgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13762178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16226611 - 16226522
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226611 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 16226522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24326101 - 24326005
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24326101 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagt-aaagtgtatggaacaattaaat 24326005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28842932 - 28842848
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28842932 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28842848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13358853 - 13358778
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13358853 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15916672 - 15916562
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  15916672 tttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaat 15916573  T
Q  517 gggttacaaga 527  Q
    |||||||||||    
T  15916572 gggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23816323 - 23816230
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23816323 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 23816230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 30738627 - 30738830
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata---tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30738627 tttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatca 30738726  T
Q  515 atgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    | |||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| |||||      ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30738727 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccca-----atctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaag 30738821  T
Q  614 gtgaatcaa 622  Q
    |||||||||    
T  30738822 gtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 31735365 - 31735461
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31735365 tgttgcgaattcgatgagaaattacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 31735461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47177805 - 47177704
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47177805 caattgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataattaa 47177706  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  47177705 at 47177704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51757977 - 51757881
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51757977 caattgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 51757881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 14097814 - 14097910
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097814 ttgttgcgaattcgaagaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 14097910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 816 - 879
Target Start/End: Original strand, 6115478 - 6115541
Alignment:
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115478 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Original strand, 26613239 - 26613571
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||     
T  26613239 tttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaa 26613338  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| | ||      |||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26613339 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctca-----atctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggt 26613433  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt-tgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccct 713  Q
    ||||||| |  | ||||||||||| |    |  ||||| ||||||| |  |||||||| ||| | || ||    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26613434 gaatcaatc--ccaaccctagtgtctcccgcttagaga-aatctctct--aaaccctaatttgttttttttttcttctaaacccttgttttcagccccct 26613528  T
Q  714 ctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    |||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26613529 cta--tctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatag 26613571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39462956 - 39462861
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462956 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaatta 39462861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 46431546 - 46431644
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46431546 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 46431644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16561749 - 16561544
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||  | |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16561749 tttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 16561650  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||||| ||      ||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16561649 gggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctca-----atctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggt 16561555  T
Q  616 gaatcaaccca 626  Q
    |||||||||||    
T  16561554 gaatcaaccca 16561544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47906704 - 47906611
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47906704 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaacc-aaaccaaagtgtatggaacaatta 47906611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 826 - 895
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131758
Alignment:
Q  826 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatcaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 4131758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16232002 - 16231917
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232002 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 16231917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23786278 - 23786182
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23786278 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 23786182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 27916778 - 27916500
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||     
T  27916778 tttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaaa 27916680  T
Q  517 g--ggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    |  ||||| |||||| |||  ||   |||||||| |||||||||| ||      |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27916679 gaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcaca-----atctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaag 27916585  T
Q  614 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    |||||||||    | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  27916584 gtgaatcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgctggc-ttctaaacccttgttt 27916500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 50078631 - 50078730
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50078631 caattgttgcgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 50078729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 665 - 754
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248841
Alignment:
Q  665 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatattt 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttactctgatacaaagtctatattt 25248841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 2949079 - 2949173
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2949079 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 2949173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 28206908 - 28207007
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206908 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 28207007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 50248417 - 50248511
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248417 tgttgtgaattcgatgataaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 50248511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  442 attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg- 539  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| | | | |       
T  155963 attgacctagtttgggga-gagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||| |||||||||||      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaa-----tctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15823967 - 15823889
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823967 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 15823889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 355
Target Start/End: Original strand, 2510200 - 2510280
Alignment:
Q  274 tgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510200 tgaaaatcacaccaataacaacttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 2510280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9459277 - 9459361
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459277 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9459361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 9463104 - 9463188
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463104 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 9463188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 664 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231547
Alignment:
Q  664 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 16231547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47180152 - 47180055
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47180152 tgttgtgaattcgatcaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataattaaat 47180055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 50307387 - 50307484
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307387 attgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 50307484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51752806 - 51752715
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51752806 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataataactt-atgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatt 51752715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31490346 - 31490252
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31490346 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaatacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 31490252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 828 - 895
Target Start/End: Original strand, 45693834 - 45693901
Alignment:
Q  828 aaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693834 aaagaatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 45693901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3579431 - 3579524
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3579431 tgttgtgaattcgatgaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 3579524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Original strand, 27336801 - 27336879
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336801 aaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 27336879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 4131221 - 4131316
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4131221 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 4131316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Original strand, 6995539 - 6995631
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6995539 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaa 6995631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39932514 - 39932426
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932514 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 39932426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 14183451 - 14183542
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14183451 caattgttgtgaattcgataaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 14183542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 833 - 900
Target Start/End: Original strand, 6115532 - 6115599
Alignment:
Q  833 atatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  6115532 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgata 6115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 25251117 - 25251215
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25251117 caattattgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 25251215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 27338969 - 27339070
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338969 caattgttgtgaattcgttgagaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 27339068  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  27339069 ta 27339070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 21353347 - 21353525
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| ||   |    
T  21353347 tttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagatat---t 21353442  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    | ||||||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21353443 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 11457327 - 11457415
Alignment:
Q  265 cgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11457327 cgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatt 11457415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16429391 - 16429299
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16429391 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 16429299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18840023 - 18839928
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  18840023 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaa-caaagtgtatggaacaatta 18839928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 30790250 - 30790337
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30790250 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 30790337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 12302349 - 12302446
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat---cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302349 tgttgcgaattcgataaaaaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 12302446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 25248398 - 25248492
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25248398 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 25248492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30780482 - 30780386
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtga--agtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30780482 tgttgtgaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 30780386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 28279489 - 28279326
Alignment:
Q  477 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttc 574  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||      |||||||    
T  28279489 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaa-----tctcttc 28279395  T
Q  575 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  28279394 ccgtgaccaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 28279326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 31424858 - 31424956
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  31424858 caattgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataa-caaaatgtatgggacaatta 31424956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Original strand, 9240951 - 9241028
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9240951 aaaatcacaccaataacaaacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 9241028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 28998090 - 28998191
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa--aatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28998090 caattgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaat 28998189  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  28998190 ta 28998191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 29003806 - 29003907
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa--aatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29003806 caattgttgtgaattcgaagagaaaacacaccaatgacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaat 29003905  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  29003906 ta 29003907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Original strand, 38925326 - 38925420
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38925326 attgttgtgaatttgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaaca 38925420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 8348901 - 8348991
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8348901 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaaaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 8348991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 704
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332836
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttg 679  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||  ||||||||||| |||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctatttttg 26332813  T
Q  680 ttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  26332814 -tgttggc-ttctaaacccttgttt 26332836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41647357 - 41647260
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41647357 attgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataatta 41647260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 6996221 - 6996152
Alignment:
Q  820 cttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||||    
T  6996221 cttcagtgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttca------atttacatcaaatcgttcttcata 6996152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598466
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 13598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15916821 - 15916734
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15916821 tgttgtgaattcgatgaaaagtcacaccaataaatacttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 15916734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16124609 - 16124545
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16124609 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 16124545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069838
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47452066 - 47451971
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47452066 ttgttgtgaattcaatgaaaaatcacatcaataacaaatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47451971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703965
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 758
Target Start/End: Original strand, 13127790 - 13127959
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttg 679  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| | || ||  || ||||||| |||||||| ||||     
T  13127790 accaagagacttaattccaacaatgtttcccaaggtgaatctatccc--aaccctagtgtttgttgccaaaaggaaa-ctctatataaaccctacttttc 13127886  T
Q  680 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||     ||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  13127887 ttgttggctt-ctaaacccttgtttcaacccc-----tctctctaaaggtttactccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13215518 - 13215424
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13215518 tgttgtgaattcgttgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 13215424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 17324484 - 17324573
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| || |||||||||    
T  17324484 gaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataa-caaagtgaatagaacaatta 17324573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072995
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19072995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120885
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19120885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 31422706 - 31422800
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  31422706 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaat-aaagtgtacggaataatta 31422800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43104414 - 43104332
Alignment:
Q  446 acctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43104414 acctagtctggg-aggagagcatctctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 43104332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098854
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 47098854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 830 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 6997395 - 6997336
Alignment:
Q  830 agaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  6997395 agaatatttgcatcaaaaatataatattctctttca------atttgcatcaaatcgttcttcata 6997336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Original strand, 26332634 - 26332688
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332634 tctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 21536662 - 21536597
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21536662 ttgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactata 21536597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 484
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651879
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476329
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Original strand, 13127687 - 13127779
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 509  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13127687 tttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagaga 13127779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644930
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatcca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26644930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28841088 - 28841033
Alignment:
Q  288 ataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28841088 ataacaacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 28841033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2232658 - 2232597
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232658 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Original strand, 4144826 - 4144865
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144826 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 14353102 - 14353047
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353102 tctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 17185977 - 17186067
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17185977 attgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 17186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18307543 - 18307449
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307543 tgttgcgaattcgatgagaaaatacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 18307449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102871
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccacta 47102871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 481
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281773
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccac 481  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccac 3281773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 2401342 - 2401400
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2401342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 3847121 - 3847165
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3847121 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 3847165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25128301 - 25128225
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128301 gaattcaatgaaaactcacgtcaataacaaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 25128225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 26519295 - 26519373
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26519295 gaattcgatgaaaatcacaccaataaaatactt--tgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 26519373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27104465 - 27104401
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27104465 ttgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 775676 - 775739
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  775676 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccacta 775739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 2232773 - 2232710
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccac 481  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2232773 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccac 2232710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9526649 - 9526582
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  9526649 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 9526582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 895
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693623
Alignment:
Q  852 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcata 11693623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 852 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352799
Alignment:
Q  852 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcata 14352799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 14997079 - 14997040
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997079 tctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 717 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16561459 - 16561373
Alignment:
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagata 804  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||    
T  16561459 tctctctcaaggtttcatctgatataaggtttatatttatag-agaaatataactcataaatttgaaacggatatcacgctgaagata 16561373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324414
Alignment:
Q  283 caccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  17324484 caccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataa-caaagtgtatgaaaaaatta 17324414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 32889443 - 32889506
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  32889443 ttgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccacta 32889506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 49959172 - 49959129
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49959172 accaagagactcattcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 764 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 14352919 - 14352877
Alignment:
Q  764 atataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14352919 atataactcgtaaatttggaacaaatatcacgctgaagatacg 14352877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 18800429 - 18800510
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  || ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18800429 gaattcgatgaaaatcacaccaacaaaatacttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18800510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 43104139 - 43104105
Alignment:
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104139 gtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 43104105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 458
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644392
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 45644392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115041
Alignment:
Q  294 acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 6115041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16561885 - 16561819
Alignment:
Q  269 ttcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  16561885 ttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagaaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 16561819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 23452236 - 23452711
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452236 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 23452335  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23452336 gttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 23452430  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23452431 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtc 23452530  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||    
T  23452531 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaggtac-ttttttttttct 23452629  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23452630 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 23452711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 42453036 - 42452567
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42453036 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 42452938  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452937 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 42452843  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452842 tcaacccacaaactctagtgtttgttaca--gagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 42452745  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||     ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          |||    
T  42452744 tcc----aagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatacattttttttttct 42452649  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42452648 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 42452567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 35215585 - 35216066
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||     
T  35215585 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatga 35215683  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35215684 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----aactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35215778  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35215779 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35215878  T
Q  717 -----tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnn 811  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |          
T  35215879 ctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagattc-atttt 35215977  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
        ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35215978 tttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgata 35216066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 35217962 - 35218447
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  35217962 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaacgg 35218060  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35218061 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35218155  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35218156 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35218255  T
Q  717 ---------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgn 807  Q
             ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  35218256 ctctctctctctctctcaaagtttagccttatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggagcaaataccacactgaagattcgt 35218355  T
Q  808 nnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35218356 ttttttt-tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgata 35218447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 42923508 - 42923971
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42923508 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 42923607  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42923608 attacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 42923702  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  42923703 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcctcctcta-- 42923800  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||          |||    
T  42923801 tctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaacac----ctgaagatac--ttatttgttct 42923894  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923895 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 42923971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 19504345 - 19504678
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19504345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 19504444  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504445 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc------cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 19504538  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504539 tcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 19504638  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504639 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 19504678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 19502010 - 19502344
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502010 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 19502109  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502110 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 19502204  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19502205 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatc 19502304  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502305 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 19502344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27105053 - 27104721
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27105053 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttac-aaagagaaatcaatgg 27104955  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104954 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27104860  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27104859 tcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctcta-- 27104763  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104762 --tctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 27104721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 45279983 - 45280315
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45279983 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 45280082  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45280083 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaa 45280177  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc-ctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  45280178 tcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagccccctcta- 45280276  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
       |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45280277 ---tctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagt 45280315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 21520692 - 21521028
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21520692 tttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 21520791  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21520792 gttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 21520886  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  21520887 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccatcta-- 21520984  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21520985 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaa 21521028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 42064771 - 42064437
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaatt-gacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  42064771 tttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatg 42064673  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064672 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 42064578  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42064577 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctat 42064478  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064477 ctcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 42064437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 13910044 - 13910377
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13910044 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgg 13910142  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13910143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccag-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaa 13910237  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910238 tcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 13910337  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910338 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 13910377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 40032052 - 40032391
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tc 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    ||    
T  40032052 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatc 40032151  T
Q  514 aatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 613  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032152 aatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 40032246  T
Q  614 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032247 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 40032346  T
Q  714 ctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032347 cta----tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 40032391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 19007896 - 19007562
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19007896 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 19007797  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19007796 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaa 19007702  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19007701 tcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 19007604  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  19007603 --tctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaa 19007562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 24162222 - 24162545
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  24162222 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaa-gagaaatcaatgg 24162320  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24162321 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc---------------aaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaa 24162405  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24162406 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 24162503  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162504 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 24162545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 6264147 - 6264504
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6264147 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 6264246  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||  || || ||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6264247 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatc-----gtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtga 6264341  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6264342 atcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----tttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctcta- 6264436  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||    
T  6264437 ---tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcgctta-aaatttggaacaaat 6264504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22287335 - 22287669
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22287335 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgg 22287434  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22287435 gttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaa-----tctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaa 22287529  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22287530 tcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctata-- 22287627  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22287628 --tctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaa 22287669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 6258816 - 6259148
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6258816 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggga-gagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 6258914  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258915 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa-------tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 6259007  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||     
T  6259008 atcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcctcctcta- 6259106  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6259107 ---tctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaa 6259148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 43623579 - 43623901
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623579 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 43623678  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43623679 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaa 43623773  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||            ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43623774 tcaaccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacccccctctatc 43623861  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43623862 tccc----agtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaa 43623901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11739558 - 11739893
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  11739558 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatg 11739657  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739658 gattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11739752  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11739753 atcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccagccccctctat 11739852  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||    || |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11739853 ctc----aaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 11739893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28196891 - 28196559
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28196891 tttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgg 28196794  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| | ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196793 gttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaa-----tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28196699  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  28196698 tcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctcta-- 28196601  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28196600 --tctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaa 28196559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 443 - 762
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239314
Alignment:
Q  443 ttgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcct 542  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  543 aattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 642  Q
    ||||||||| |||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 45239194  T
Q  643 tt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagttta-gtctgata 740  Q
    || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||     
T  45239195 ttgccaaagag--aaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatg 45239292  T
Q  741 caaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  45239293 aatggtctatatttatagtaaa 45239314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 17848696 - 17848403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17848696 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 17848597  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17848596 -ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaa 17848506  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17848505 tcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagccccctctat 17848406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 34979576 - 34979874
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaag-agagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  34979576 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaat 34979675  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34979676 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtg 34979770  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34979771 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcagccccctcta 34979870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 17849373 - 17849039
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17849373 tttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 17849275  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17849274 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtga 17849180  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17849179 atcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 17849081  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  17849080 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaa 17849039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 31732775 - 31733098
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31732775 tttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31732874  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31732875 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtga 31732957  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31732958 atcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 31733056  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31733057 ---tctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaa 31733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 14837524 - 14837195
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14837524 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 14837425  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||  ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837424 agttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc-----------ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 14837336  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  14837335 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagctccctcta- 14837237  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14837236 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaa 14837195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 419 - 630
Target Start/End: Original strand, 5375345 - 5375550
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5375345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgg 5375444  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5375445 gttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 5375538  T
Q  619 tcaacccacaaa 630  Q
    ||||||| ||||    
T  5375539 tcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 419 - 717
Target Start/End: Original strand, 44289066 - 44289360
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || || | | ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |    
T  44289066 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacg 44289165  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289166 ggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 44289260  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  44289261 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttagtcccctctat 44289360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 3022428 - 3022086
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata----------tgatgagtaacgttacaaaagag 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | || ||||          ||||||||||| ||| ||| |||    
T  3022428 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactttataaa-gag 3022330  T
Q  509 aaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | ||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022329 atattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaa-----tctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3022235  T
Q  609 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 708  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3022234 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagc 3022135  T
Q  709 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaa 761  Q
    | ||| ||    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3022134 ctcctata----tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 498 - 762
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539808
Alignment:
Q  498 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 597  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagaatcaatcct 15539647  T
Q  598 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  15539648 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacc 15539747  T
Q  698 cttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||| |||||| ||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15539748 cttgtttcaaccccctata----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 15539808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11578106 - 11578437
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11578106 tttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 11578205  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11578206 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtg 11578300  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11578301 aatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagcccactcta 11578395  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        ||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11578396 ----tctcaagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaa 11578437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 36558863 - 36559047
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36558863 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 36558961  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36558962 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 36561140 - 36561324
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561140 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 36561238  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561239 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 18800312 - 18800635
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18800312 tttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggga-gagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaat 18800410  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800411 gggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 18800505  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18800506 aatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagctt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctata 18800593  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800594 ----tctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18800635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 426 - 777
Target Start/End: Original strand, 20146613 - 20146955
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  20146613 acccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttac 20146712  T
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||      ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20146713 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctca-----atcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaat 20146807  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct 723  Q
    |  | |||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |   |||| |  ||||    
T  20146808 c--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt--tcaaactctctacctct 20146901  T
Q  724 caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaa 777  Q
     || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20146902 taaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatccctcataaa 20146955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 583 - 762
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163280
Alignment:
Q  583 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 682  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  683 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 22163280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 607 - 762
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407742
Alignment:
Q  607 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 706  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  707 gccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||| ||    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407691 gcaccctata----tctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 22407742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 580 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020161
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttg 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  680 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 38020161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 22874387 - 22874102
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22874387 tttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 22874288  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||      ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22874287 ggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctca-----atctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttccaaggtga 22874193  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874192 atcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctctat 22874105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 419 - 561
Target Start/End: Original strand, 22407453 - 22407595
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22407453 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 22407552  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtccca 561  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22407553 gttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 45332180 - 45332364
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  45332180 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatgg 45332278  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332279 gttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagt-----cctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 430 - 670
Target Start/End: Original strand, 28459200 - 28459435
Alignment:
Q  430 agttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28459200 agttcgatccaaattgacctagtctaggta-gagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaa 28459298  T
Q  529 taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 628  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  28459299 taagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctca 28459393  T
Q  629 aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaacc 670  Q
    || |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28459394 aatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 627 - 759
Target Start/End: Original strand, 5377631 - 5377763
Alignment:
Q  627 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaa 726  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5377631 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctcaa 5377730  T
Q  727 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5377731 agtttgctctgaaacaaggtctatatttatagt 5377763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 703
Target Start/End: Original strand, 17897244 - 17897519
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||     
T  17897244 tttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggga-gagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaaa 17897342  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||      ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897343 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctca-----atcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 17897437  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 703  Q
    ||||||  | |||  ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  17897438 aatcaa-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgtt 17897519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 423 - 549
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 7463049  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattcta 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7463050 acaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Original strand, 23452084 - 23452174
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452084 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 23452174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 40699632 - 40699429
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  40699632 tttgtttacctagttcggtctaatactgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 40699533  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    || |||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||  ||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699532 ggattacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttctc-----gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 40699438  T
Q  616 gaatcaacc 624  Q
    |||||||||    
T  40699437 gaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 19501842 - 19501930
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19501842 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19501930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 19504174 - 19504265
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19504174 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaa 19504265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 539
Target Start/End: Original strand, 22707750 - 22707872
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg-gga-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22707750 tttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 22707849  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg 539  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22707850 gggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Original strand, 22163021 - 22163111
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163021 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42453892 - 42453798
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42453892 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaacaatta 42453798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 45279844 - 45279938
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45279844 ttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 45279938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 35107552 - 35107294
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||     
T  35107552 tttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaa 35107453  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgc--ctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
    || |||||||||||||| | |     |||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35107452 gg-ttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaagg 35107359  T
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttg 685  Q
    |||||||| || ||| ||    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35107358 tgaatcaatcc-caaccc----tgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 35107294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 36560977 - 36561077
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36560977 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaa 36561075  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  36561076 at 36561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Original strand, 13909907 - 13909982
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13909907 tcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 13909982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27105209 - 27105115
Alignment:
Q  263 tgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27105209 tgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 27105115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 36558721 - 36558817
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36558721 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 36558817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 37962940 - 37963287
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| || | | | ||||||| |||||| |||| ||||||||   |||||||||    
T  37962940 tttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaatg 37963036  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||      |||||||  || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||    
T  37963037 gattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctca-----atctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaagggga 37963131  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||| |   |||| | |||||||||   ||||| ||| || || ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37963132 atcaacac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctcta- 37963218  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
       |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||||||||    
T  37963219 ---tctcaaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccatcataaaattggaacaaat 37963287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 21520530 - 21520629
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21520530 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaatta 21520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23871072 - 23870958
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  23871072 tttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgg 23870973  T
Q  519 gttacaagaataagt 533  Q
    |||||||||||||||    
T  23870972 gttacaagaataagt 23870958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 490 - 670
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136368
Alignment:
Q  490 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagaga 588  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||      | |||| |||| |||||||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaa-----tttctttccgtgaccaagaga 27136289  T
Q  589 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaacc 670  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136290 ttcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 28459038 - 28459131
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28459038 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaacacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28459131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 43623423 - 43623518
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43623423 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataactaacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaatta 43623518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19008051 - 19007956
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19008051 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 19007956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17849528 - 17849434
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17849528 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatt 17849434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 485 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  485 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaacca 583  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgacca 20589787  T
Q  584 agagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  20589786 agagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Original strand, 22162869 - 22162959
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22162869 tgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaattttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaattgtatggaaca 22162959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 22707593 - 22707690
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22707593 attgttgcgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 22707690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 24162063 - 24162160
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24162063 tgttgtgaatacgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaa-aaaagtgtatgaaacaattaaat 24162160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 45332019 - 45332116
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  45332019 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtttgtaacaattaaat 45332116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 734 - 897
Target Start/End: Original strand, 27583631 - 27583786
Alignment:
Q  734 tctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaa 833  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||          ||||||||| ||||||||    
T  27583631 tctgatacaagatctatatttatagagaa-atataactcataaatttggaacggatatcacgctgaagatacatttcttttttctccttcagtgaaagaa 27583729  T
Q  834 tatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatg 897  Q
    |||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  27583730 tatttgcatca-------aatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatg 27583786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 22287180 - 22287275
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22287180 ttgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-catagtgtatggaacaatta 22287275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 35217827 - 35217906
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  35217827 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 35217906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 666 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020065
Alignment:
Q  666 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    |||| | |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctcta----tctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaa 38020065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 637
Target Start/End: Original strand, 38414196 - 38414291
Alignment:
Q  535 tcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 634  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || |||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38414196 tcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttc------cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccct 38414288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14837679 - 14837584
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14837679 tgttgtgaattcgatgagaaatcacatcaataacaatacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 14837584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 568 - 621
Target Start/End: Original strand, 27583482 - 27583535
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27583482 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 34979456 - 34979528
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34979456 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 34979528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42064884 - 42064816
Alignment:
Q  287 aataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42064884 aataacaacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 42064816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923446
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42923373 cacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 42923446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 43139623 - 43139356
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 525  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| | ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43139623 ccagttcggtctaatactgacctagtatagggaaaagaacagtcctctgtaccactataatgatgagtaactttacaaa-gagaaatcaaaaggttacaa 43139525  T
Q  526 gaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 624  Q
     ||| ||| |   | |||||||||||| |||||| ||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  43139524 taattagtctttagacctaattctacctaaagtctcaa-----tatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc 43139430  T
Q  625 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
        |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  43139429 --tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttt 43139356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3022583 - 3022488
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaa-atcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3022583 ttgttgtgaattcggtgagagatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3022488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 5375225 - 5375284
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5375225 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 5375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699036
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 14699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 332
Target Start/End: Original strand, 35215450 - 35215506
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  35215450 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa 35215506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921754
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cc 541  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||  |||||   ||||| ||||| ||||||| ||| |     ||    
T  17921927 tgacctagtctgggta-gagagcagccctccgttccactataatgatgactaactttatgaaaga---atcaaagggttgcaagaatcagttttaaaacc 17921832  T
Q  542 taattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921831 taattctacccaaagtcccgaa----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 719 - 789
Target Start/End: Original strand, 20147038 - 20147108
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  20147038 tctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaaatattcctcataaaattggaacaaat 20147108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38020473 - 38020396
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38020473 aaaatcacaccaataacaaatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 38020396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390179
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569396
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 17943692 - 17943540
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cc 541  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||| | |   ||    
T  17943692 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaagaattagtcttcaaacc 17943597  T
Q  542 taattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17943596 taattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522288
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 20522288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28197046 - 28196951
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28197046 ttgttgtgagttcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 28196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 6263989 - 6264087
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6263989 caattgttgtgaattcgatgagaaaacacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 6264087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 26345716 - 26345661
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345716 tctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Original strand, 45238841 - 45238924
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  45238841 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtg 45238924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1345634 - 1345572
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccact 482  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1345634 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccact 1345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2736387 - 2736205
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  2736387 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 2736292  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736291 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacc-aaagtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 11739418 - 11739515
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  11739418 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagggatagtcaag-aaataaaaacaaagtgtatgaaacaatta 11739515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17848816 - 17848754
Alignment:
Q  291 acaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  17848816 acaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaatta 17848754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 816 - 884
Target Start/End: Original strand, 34575527 - 34575588
Alignment:
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 884  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575527 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 34575588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 6258668 - 6258756
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6258668 gaattcgatgagaaaacataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtctggaacaatta 6258756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 7462789 - 7462884
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7462789 tgttgcgaattcgttgagaaaaccacatcgataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 7462884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22874519 - 22874431
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22874519 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaa 22874431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682362
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactata 34682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 712 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 40699282 - 40699205
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |||||||||||    
T  40699282 ctctctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaat 40699205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040128
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8040128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10445537 - 10445473
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  10445537 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259206
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33528714 - 33528650
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  33528714 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactat 33528650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17462497 - 17462436
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462497 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17462618 - 17462551
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17462618 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17462551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 20054886 - 20054947
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054886 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 39687044 - 39686983
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687044 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 45679905 - 45679838
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45679905 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2740979 - 2740941
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740979 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 336
Target Start/End: Original strand, 20146456 - 20146535
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  20146456 aattgttgtgaattcgttgaaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtgaagtaaag--taatcaagcaaccaatatcaa 20146535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20589633 - 20589583
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589633 ctctctctctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 20589583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2741056
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2741056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 762
Target Start/End: Original strand, 12342673 - 12342743
Alignment:
Q  689 ttctaaaccctt-gtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    || ||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  12342673 ttctaaaccctttgtttcagccccctctatctc----aaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaa 12342743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 852 - 885
Target Start/End: Original strand, 28568584 - 28568617
Alignment:
Q  852 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568584 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 28568617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Original strand, 13828340 - 13828456
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtcca-aattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||   | | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||||     
T  13828340 tttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaa 13828439  T
Q  517 gggttacaagaataagt 533  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13828440 gggctacaagaataagt 13828456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 17865207 - 17865271
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  17865207 ttgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 17865271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 21629948 - 21630011
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21629948 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactat 21630011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 27517760 - 27517818
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27517760 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 33118140 - 33118204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33118140 ttgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactat 33118204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 34388862 - 34388926
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  34388862 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 665 - 720
Target Start/End: Original strand, 38414281 - 38414330
Alignment:
Q  665 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  38414281 caaaccctagttttgttgttgcctttctaa------gtttcagccccctctatctc 38414330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 39482935 - 39482999
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  39482935 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactat 39482999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2838123 - 2838076
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  2838123 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 7503030 - 7502975
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503030 tctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151634
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagag 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagag 11151634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20592484 - 20592395
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20592484 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataaaatacgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 20592395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||      | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaa-----tatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30479177 - 30479110
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  30479177 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactata 30479110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 622
Target Start/End: Original strand, 34575265 - 34575308
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575265 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctc-----gtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39680227 - 39680160
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  39680227 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 39680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39687165 - 39687098
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  39687165 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 39687098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 608
Target Start/End: Original strand, 10942658 - 10942696
Alignment:
Q  570 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10942658 tcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10942696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 608
Target Start/End: Original strand, 10948527 - 10948565
Alignment:
Q  570 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10948527 tcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10948565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 11577957 - 11578045
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11577957 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacattaataaaaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaat-aaagtatatggaa 11578045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 20050166 - 20050204
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050166 ctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 518 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020311
Alignment:
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaag 556  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 38020311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 38191035 - 38190997
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191035 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 12781246 - 12781287
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  12781246 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 12781287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 604
Target Start/End: Original strand, 33674551 - 33674584
Alignment:
Q  571 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33674551 cttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33674584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 704
Target Start/End: Original strand, 41304627 - 41304667
Alignment:
Q  663 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41304627 tacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 41304667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 258)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 4103893 - 4104365
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4103893 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 4103991  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103992 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4104086  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104087 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 4104186  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||         |||    
T  4104187 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacact---gatacgttttttttttct 4104283  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4104284 ccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 4104365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 25533702 - 25533225
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533702 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 25533603  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533602 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25533508  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533507 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 25533408  T
Q  719 tc----tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnn 814  Q
    ||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||            
T  25533407 tctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttagaacaaatatcacactgaagatacgtttttt-- 25533310  T
Q  815 ctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25533309 -tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 25533225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 458544 - 458068
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  458544 tttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 458446  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  458445 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 458351  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458350 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 458251  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||    
T  458250 ctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttttttttttc 458151  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  458150 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 458068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 747017 - 746540
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  747017 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 746919  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  746918 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 746824  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  746823 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 746724  T
Q  717 -tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnc 815  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  746723 ctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttt- 746625  T
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  746624 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 746540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 456167 - 455691
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  456167 tttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 456069  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  456068 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 455974  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455973 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 455874  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||    
T  455873 ctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccgcactgaagatacgttttttttttc 455774  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  455773 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 455691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 42990564 - 42990070
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42990564 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatga 42990465  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990464 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 42990370  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990369 tcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 42990270  T
Q  719 tc------------------tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaa 800  Q
    ||                  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990269 tctctctcaaagtctctctctctcaaagtttagcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaa 42990170  T
Q  801 gatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990169 gatacattttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 42990070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 10621527 - 10622009
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10621527 tttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgg 10621625  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10621626 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 10621720  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10621721 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctctat 10621820  T
Q  717 -------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnn 809  Q
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  10621821 ctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttt 10621920  T
Q  810 nnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10621921 tttt--tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 10622009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 53917661 - 53918127
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53917661 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 53917760  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917761 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 53917855  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |      
T  53917856 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagccccctcca-- 53917953  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||         |||    
T  53917954 --tctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacgaataccacactgaagatacgtttttttt-tct 53918050  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53918051 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 53918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 1313669 - 1313205
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1313669 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 1313570  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313569 attacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1313475  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||      
T  1313474 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagccccctcta-- 1313378  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||          |||    
T  1313377 --tctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcacactaaagatac--tttttttttct 1313282  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313281 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 1313205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 51943630 - 51943165
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  51943630 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatga 51943531  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943530 gttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagcccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51943437  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||      
T  51943436 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctcta-- 51943339  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||    
T  51943338 --tctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataaatcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttctt-tct 51943242  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51943241 ccttcaatgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcata 51943165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 53915493 - 53915959
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53915493 tttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgg 53915592  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  53915593 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaa 53915687  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||      
T  53915688 tcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagccccctcta-- 53915785  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||         |||    
T  53915786 --tcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactcaagatacgtttttttt-tct 53915882  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915883 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 53915959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 10084386 - 10084724
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10084386 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgg 10084485  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10084486 gttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10084580  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10084581 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctctatc 10084680  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10084681 tctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaa 10084724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 42992530 - 42992076
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  42992530 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatga 42992431  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||||               |||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42992430 gttacaagaataa---------------ctacccaaagtccac------tctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 42992352  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42992351 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatc 42992252  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||         |||    
T  42992251 tctcttaaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaattaatattacactgaagatacgtttttttt-tct 42992153  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992152 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 42992076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38890300 - 38889965
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890300 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 38890201  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890200 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38890106  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890105 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 38890006  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||    
T  38890005 tctctcaaagtttgct---atacaaggtctatatttatagtaaa 38889965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 4308278 - 4308609
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308278 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 4308377  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308378 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4308472  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4308473 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 4308570  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4308571 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 4308609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11170664 - 11170330
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170664 tttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 11170565  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170564 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11170470  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11170469 tcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 11170372  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170371 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 11170330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 18099167 - 18099501
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099167 tttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgg 18099266  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099267 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18099361  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099362 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 18099461  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18099462 tctc---aagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaa 18099501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 43228551 - 43228220
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228551 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 43228452  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228451 gttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43228357  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228356 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatc 43228257  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||     ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  43228256 tcc----aagtttgctctgatacaatgtctatatttatagt 43228220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 43226345 - 43226015
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226345 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 43226246  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226245 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43226151  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226150 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaacg-tagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 43226052  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||     ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  43226051 tcc----aagtttgctctgatacaatgtctatatttatagt 43226015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 3859787 - 3859454
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||     
T  3859787 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgt 3859689  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859688 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3859594  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859593 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 3859494  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859493 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 3859454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 422 - 762
Target Start/End: Original strand, 18096900 - 18097232
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18096900 gttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggtt 18096999  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097000 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 18097094  T
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18097095 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctct 18097194  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18097195 c---aagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaa 18097232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 10191307 - 10191644
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  10191307 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgg 10191406  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10191407 gttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttc-----ctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10191500  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10191501 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctttatc 10191600  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10191601 tctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaa 10191644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 10956024 - 10956358
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10956024 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatga 10956123  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10956124 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaa 10956218  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956219 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10956318  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | ||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956319 t-tc---atgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 10956358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 30006101 - 30005801
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30006101 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatga 30006002  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006001 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctc-----gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30005907  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005906 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 30005807  T
Q  719 tctctc 724  Q
    ||||||    
T  30005806 tctctc 30005801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 45883200 - 45882865
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-ggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45883200 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 45883101  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883100 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 45883006  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45883005 atcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 45882907  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  45882906 ---tctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaa 45882865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 51727004 - 51727334
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727004 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 51727103  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727104 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctctta-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51727198  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  51727199 tcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccttta-- 51727295  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51727296 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 51727334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 5191911 - 5191579
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5191911 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 5191814  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191813 gttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 5191719  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5191718 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 5191621  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5191620 --tctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaa 5191579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 10958320 - 10958654
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10958320 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatga 10958419  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958420 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10958514  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958515 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10958614  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | |    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958615 ttt----atgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 10958654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 27101178 - 27101513
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27101178 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgg 27101277  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101278 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----ttctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27101372  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27101373 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatc 27101472  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||| ||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27101473 tctatctcaatttgctctgatacaaggtctatatttatagt 27101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 9604604 - 9604940
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604604 tttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 9604703  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604704 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctcttt-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9604798  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  9604799 tcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagccccctctatc 9604897  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9604898 tctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagt 9604940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 6063443 - 6063779
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6063443 tttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 6063541  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063542 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 6063636  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6063637 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 6063735  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063736 -tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 6063779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 22114302 - 22114636
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114302 tttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 22114401  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114402 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22114496  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22114497 tcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatc 22114596  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114597 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 22114636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38210630 - 38210294
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||     
T  38210630 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatga 38210532  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38210531 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 38210437  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210436 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 38210337  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38210336 ctctctcaaa--atagcctgatacaaggcctatatttatagtaaa 38210294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25389165 - 25388824
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25389165 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 25389067  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25389066 gttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt-ccaaggtga 25388973  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag------cccc 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      | |     
T  25388972 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagctctctctct 25388873  T
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388872 ctctctctctctcaaa--atagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 25388824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 50494259 - 50493928
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  50494259 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 50494161  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50494160 gttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 50494066  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494065 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 50493966  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||    |||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  50493965 ctctc----agtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 50493928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 1626680 - 1627014
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1626680 tttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 1626779  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1626780 gttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaa-----tctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 1626874  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1626875 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 1626972  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1626973 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 1627014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 5522624 - 5522946
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5522624 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 5522722  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5522723 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaa 5522817  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5522818 tcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 5522904  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522905 --tctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 5522946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 463 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561693
Alignment:
Q  463 gagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtccc 560  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  561 agcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctc 660  Q
    |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6561928 a-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactc 6561834  T
Q  661 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagta 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6561833 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag-a 6561739  T
Q  761 aacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6561738 gaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 6561693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 6065793 - 6066128
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  6065793 tttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 6065891  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6065892 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 6065986  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  6065987 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc---ct 6066083  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6066084 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 6066128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 43423460 - 43423794
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43423460 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatga 43423559  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423560 gttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43423654  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  43423655 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc----tc 43423750  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | |||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43423751 tttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaa 43423794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1321739 - 1321483
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321739 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 1321640  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321639 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1321545  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgt 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1321544 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 26720807 - 26720474
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26720807 tttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagg 26720708  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26720707 gttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaa 26720614  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26720613 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatc 26720514  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720513 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 26720474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 420 - 762
Target Start/End: Original strand, 32264035 - 32264374
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatg 517  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32264035 ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatg 32264134  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264135 ggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 32264229  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264230 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctctat 32264329  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264330 ctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 32264374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 3314945 - 3314610
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  3314945 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatg 3314846  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314845 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 3314751  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3314750 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagccccctcta- 3314652  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3314651 ---tctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaa 3314610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 24979968 - 24979607
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||     
T  24979968 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatt 24979869  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24979868 tgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtga 24979774  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24979773 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 24979675  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
       |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||| | |||||||||||||||    
T  24979674 ---tctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtattactta-aaatttggaacaaat 24979607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 43421412 - 43421746
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43421412 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 43421511  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||      ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43421512 gttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaa-----tcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaa 43421606  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      
T  43421607 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttcta-- 43421704  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43421705 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 43421746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 28101999 - 28102295
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28101999 tttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgg 28102098  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28102099 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaa 28102193  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102194 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28102293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18162923 - 18162590
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacg-ttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||    
T  18162923 tttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatg 18162825  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162824 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 18162730  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |    
T  18162729 atcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccc------t 18162636  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtc-tgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18162635 ctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaa 18162590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 47148892 - 47149231
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47148892 tttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgg 47148991  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47148992 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagaccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaa 47149085  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttg-ttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149086 tcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 47149185  T
Q  718 ctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||| ||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149186 ctccctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 47149231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 5926761 - 5927095
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||    
T  5926761 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgg 5926860  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5926861 gttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaa 5926955  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||      
T  5926956 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctcta-- 5927053  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5927054 --tctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaa 5927095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 27635655 - 27636089
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  27635655 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 27635754  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||                 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||            
T  27635755 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag-----------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc-------- 27635829  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
               ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  27635830 -----------accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 27635916  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt-aaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
      |||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||    
T  27635917 --tctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttgtagtaaaaaatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatac---atttttttc 27636011  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636012 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 27636089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 460 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 29956905 - 29956646
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcc 559  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29956905 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 29956806  T
Q  560 cagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatct 659  Q
    ||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29956805 cagcctcttctc-----gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaact 29956711  T
Q  660 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 724  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956710 ctatacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 29956646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 880448 - 880783
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  880448 tttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 880547  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  880548 gttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaa-----tctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaa 880642  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||     
T  880643 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcagacccctcta- 880741  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  880742 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 880783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 36012087 - 36011753
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36012087 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 36011988  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36011987 gttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaa 36011893  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36011892 tcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctttatc 36011793  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    || |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  36011792 tc----aaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaa 36011753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 422 - 759
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918277
Alignment:
Q  422 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35918043 acaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccag-----tctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatca 35918137  T
Q  622 acccacaaacccta------gtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||| ||||| |||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918138 accctcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 35918237  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |    ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  35918238 a----tctcaaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagt 35918277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 694
Target Start/End: Original strand, 28413029 - 28413299
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  28413029 tttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 28413127  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413128 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 28413222  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28413223 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 12267972 - 12268297
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||              
T  12267972 tttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag---------- 12268061  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12268062 -ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaa 12268155  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12268156 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctcta 12268255  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12268256 ----tctcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaa 12268297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 48361668 - 48362001
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  48361668 tttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatga 48361767  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48361768 gttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagcccca-----atctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 48361862  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  48361863 tcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagccccctgta-- 48361959  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361960 --tctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaa 48362001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 53468450 - 53468786
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt--ctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53468450 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 53468549  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53468550 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaa-----tctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggt 53468644  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  53468645 gaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccccttt 53468743  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    ||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468744 a----tctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 53468786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15781139 - 15780786
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcag---ccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaat-- 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||| || ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||      
T  15781139 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatat 15781040  T
Q  513 --caatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 610  Q
      ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15781039 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttccc 15780945  T
Q  611 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagag-----------acaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 699  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15780944 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccct 15780845  T
Q  700 tgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780844 tgtttcagccccctcta----tctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 15780786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 419 - 662
Target Start/End: Original strand, 7606585 - 7606822
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||     
T  7606585 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttac-aaatagaaatcaatgt 7606683  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606684 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7606778  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctcta 662  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7606779 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 592 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41848922
Alignment:
Q  592 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 691  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  692 taaacccttgtttcagccccctcta------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaac 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatctatctctctctcaaagtttagcctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 41849045  T
Q  786 aaataccacactgaagatacg--------nnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgc 877  Q
    |||||||||||||||||||||                 |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41849044 aaataccacactgaagatacgttttttttttttttttttctctttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgc 41848945  T
Q  878 atcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  41848944 atcaaatcgttcttcatacgata 41848922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 419 - 788
Target Start/End: Original strand, 28761424 - 28761784
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28761424 tttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 28761523  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28761524 gggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaa-----tatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 28761618  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28761619 aatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaaccccctcta 28761717  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
        |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  28761718 ----tctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa-ttggaacaaa 28761784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 419 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 32219345 - 32219026
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacg-ttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  32219345 tttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatg 32219246  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32219245 ggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtccca-----atctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtga 32219151  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||           |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32219150 atcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctcta- 32219063  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32219062 ---tctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttata 32219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 39715725 - 39715400
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| || || | | ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39715725 tttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggg--gagagcaaccatctgtttcactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 39715630  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39715629 gttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 39715535  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||     ||    
T  39715534 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttcagcccc-----tc 39715440  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    | |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  39715439 tatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 39715400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 779
Target Start/End: Original strand, 51674763 - 51675103
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  51674763 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgg 51674862  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51674863 attacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 51674957  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |           ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  51674958 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 51675044  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatt 779  Q
      |||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  51675045 --tctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaaacatccctcataaatt 51675103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 428 - 762
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890102
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaac------tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatc 889972  T
Q  628 aaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaa 726  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||    
T  889973 aaaccccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctcta----tctcaa 890066  T
Q  727 agtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     |||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  890067 ggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaa 890102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 514 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777347
Alignment:
Q  514 aatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaa 612  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaa 35777493  T
Q  613 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35777492 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc 35777393  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35777392 tcta----tctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaa 35777347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 25688161 - 25688367
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25688161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggtt 25688260  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688261 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttct-----cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 25688355  T
Q  622 acccacaaaccc 633  Q
    |||| |||||||    
T  25688356 accctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 419 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 6484620 - 6484372
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  6484620 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgg 6484521  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6484520 gttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaacccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaa 6484426  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccc 671  Q
    ||||||| |||||||  || |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6484425 tcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 54691571 - 54691904
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  54691571 tttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatga 54691670  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |      ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54691671 aatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaa-----tctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 54691765  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  54691766 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-ccccctctatc 54691864  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |     || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  54691865 tt----aaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaa 54691904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 420 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591121
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 519  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggga-gagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgga 53591344  T
Q  520 ttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 619  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |      ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53591343 ttagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaa-----atctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaat 53591249  T
Q  620 caacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 719  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||       
T  53591248 caaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctcta--- 53591163  T
Q  720 ctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     |||||| |||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  53591162 -tctcaaggtttacacttatacaatgtctatatttatagtaaa 53591121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 11168361 - 11168165
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168361 tttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 11168262  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168261 gttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcct-----cttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11168167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 5886458 - 5886261
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  5886458 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttc-aaagacaaatcaatgg 5886360  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5886359 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaa 5886266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 5899931 - 5899734
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5899931 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgg 5899833  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5899832 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaa 5899739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 524 - 762
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100372
Alignment:
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaac 28100237  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct 723  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  28100238 cctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta----tct 28100333  T
Q  724 caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||| | ||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28100334 caagggttactctgatacaacgcttatatttatagtaaa 28100372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23633713 - 23633359
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  |    
T  23633713 tttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcg 23633616  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  23633615 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaa 23633523  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  23633522 atcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttagccctctcta- 23633428  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
       |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  23633427 ---tctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaat 23633359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31151605 - 31151273
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||      
T  31151605 tttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca-- 31151508  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31151507 gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 31151413  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31151412 aatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttcagccccctct 31151317  T
Q  716 atctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31151316 a----tctcgaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaa 31151273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 4666774 - 4666489
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4666774 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 4666678  T
Q  518 ggttacaagaataag--tgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4666677 gattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagat 4666583  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||           |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  4666582 gaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagag-----------acaaaccctatttttgttgttgtcttactagacccttctttcagccccctct 4666494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 519 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180950
Alignment:
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaa 28181088  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||      
T  28181087 tcaaccctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctcta-- 28180992  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28180991 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 28180950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 6232060 - 6231849
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  6232060 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatg 6231962  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6231961 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaaggtga 6231868  T
Q  618 atcaacccacaaaccctag 636  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  6231867 atcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 13420189 - 13420432
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  13420189 acccatttcggtccaaaactgacctagtctggtga-gagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttac 13420287  T
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420288 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 13420382  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt 677  Q
     |   |||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13420383 tc---aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctagttt 13420432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 426 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 53597491 - 53597143
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||    
T  53597491 acccaattcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttac 53597392  T
Q  524 aagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 623  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||| || ||  || ||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597391 aagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatg-----accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 53597297  T
Q  624 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct 723  Q
         |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||     ||| |||    
T  53597296 ttc--aaccctagtgtttgttgccaagagaaaa-ctctatacaacccctagttttcttgttgactta-taaacccttgtttcatcccc-----tctatct 53597206  T
Q  724 caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaaca 786  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||    
T  53597205 caaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaaca 53597143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 616 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163076
Alignment:
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 715  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11163118 a----tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaa 11163076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 502 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23636926
Alignment:
Q  502 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 601  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |      | ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaa-----tatcttcccatgaacaagagactcaatcctaata 23637106  T
Q  602 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 701  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  23637105 gtgtttctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttg 23637010  T
Q  702 tttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||  |||  |||||||| ||| |||||||    
T  23637009 ttttagcctcctcta----tctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatccctcataaaattgaaacaaat 23636926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 419 - 713
Target Start/End: Original strand, 561771 - 562058
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgg-ggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  561771 tttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaa 561870  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||      ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  561871 tgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctca-----atctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgt 561965  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 713  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  561966 gaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctag-tttcatgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884121
Alignment:
Q  467 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcct 565  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||        
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaa--- 54884272  T
Q  566 cttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatac 665  Q
      |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||    
T  54884271 --tctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tac 54884176  T
Q  666 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  54884175 aaattctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcgagctccctctatctc 54884121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17795519 - 17795269
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17795519 tttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 17795420  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||      |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17795419 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctca-----atctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtga 17795325  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt 677  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || |||||||    
T  17795324 atcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19103959 - 19103709
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19103959 tttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 19103860  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||      |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19103859 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctca-----atctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtga 19103765  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt 677  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || |||||||    
T  19103764 atcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 762
Target Start/End: Original strand, 28137421 - 28137626
Alignment:
Q  537 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28137421 ccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctag 28137515  T
Q  637 tgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtct 736  Q
    |||||||||| |||||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||| |||    
T  28137516 tgtttgttcccaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttactct 28137600  T
Q  737 gatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||    
T  28137601 gatacaacgcatatatttatagtaaa 28137626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Original strand, 47701668 - 47701801
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47701668 tttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 47701767  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctaccc 552  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47701768 gttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 419 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 25635642 - 25635391
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  25635642 tttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatg 25635543  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25635542 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtga 25635448  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt 677  Q
    | ||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  25635447 accaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 426 - 712
Target Start/End: Original strand, 36871304 - 36871583
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 523  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| | ||| ||||| |    
T  36871304 acccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaa-gagataacaaagggttgc 36871402  T
Q  524 aagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36871403 aagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaa-----tctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaa 36871497  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 712  Q
     |  | |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  36871498 tc--ctaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11168523 - 11168423
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168523 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 11168424  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  11168423 t 11168423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 630 - 762
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701926
Alignment:
Q  630 accctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagt 729  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccttta----tctcaaggt 47701893  T
Q  730 ttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47701894 ttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 47701926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11170789 - 11170692
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11170789 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacattaataacaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataattaaat 11170692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5192072 - 5191973
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5192072 caattattgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 5191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10955867 - 10955962
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10955867 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 10955962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 491 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1673975
Alignment:
Q  491 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact 590  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||      ||||||||||| | |||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaa-----tctcttcccgtgatcaagagact 1674066  T
Q  591 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgtt 684  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  1674065 caatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgtt 1673975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 631 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231375
Alignment:
Q  631 ccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtt 730  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||  ||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctc----aagatt 6231407  T
Q  731 tagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6231406 tacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 6231375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 419 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3307020 - 3306839
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3307020 tttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 3306923  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 606  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||      | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306922 ggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactcca-----atatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10084229 - 10084324
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10084229 tgttgcgaatccgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgggacaattaaat 10084324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 10958159 - 10958258
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10958159 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaattaaa 10958257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 22114143 - 22114227
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114143 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaatagcaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 22114227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 419 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 24181642 - 24181498
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  24181642 tttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaat 24181543  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtccca 561  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24181542 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 24181498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 580 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177205
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttg 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  680 ttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24177283 ttgttgac-atctaaactcttgttttcagccccctcta----gctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaa 24177205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Original strand, 51726844 - 51726942
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51726844 aattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggggcaa-gaataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 51726942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1321898 - 1321801
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1321898 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 1321801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 7606441 - 7606539
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606441 attgttgcaaattcgatgaaaaatacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 7606539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 6065629 - 6065718
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6065629 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 6065718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10191152 - 10191247
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10191152 tgttgcgaatctgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgggacaattaaat 10191247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41849470 - 41849387
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849470 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 41849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38890441 - 38890362
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890441 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 38890362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 342
Target Start/End: Original strand, 5522466 - 5522548
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgta 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5522466 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgta 5522548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 352
Target Start/End: Original strand, 18099006 - 18099104
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18099006 caattgttgggaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaatt 18099104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 747177 - 747092
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  747177 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 747092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 641 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306708
Alignment:
Q  641 tgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgata 740  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | |||||  ||||||    
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctct----aggtttacactgata 3306747  T
Q  741 caaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatt 779  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  3306746 caatgtctatatttatagtaaaaacatctctcataaatt 3306708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43226499 - 43226401
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  43226499 caattgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa--caagtgtatggaacaattaa 43226402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 456329 - 456253
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  456329 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 456253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25533845 - 25533747
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25533845 aattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagat-atcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 25533748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32219506 - 32219407
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219506 aattgttgtgaattcgatgaaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 32219407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3315104 - 3315005
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3315104 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaatta 3315005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 18096740 - 18096835
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096740 tgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 18096835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 458704 - 458630
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  458704 attgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 458630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Original strand, 53893900 - 53893989
Alignment:
Q  267 aattcgat-gaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53893900 aattcgatcgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 53893989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42990721 - 42990633
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42990721 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatg 42990633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25389327 - 25389229
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25389327 ttgttgtgaattcgatgaaaaaatcataccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaat 25389229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 419 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41849319 - 41849243
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  41849319 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24980126 - 24980031
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24980126 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 24980031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Original strand, 35919112 - 35919179
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatat 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919112 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43228696 - 43228610
Alignment:
Q  269 ttcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43228696 ttcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaa 43228610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Original strand, 1620457 - 1620657
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||     
T  1620457 tttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaaa 1620555  T
Q  517 gggttacaagaa-taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||| ||    ||   ||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  1620556 gggttacaagaactagccttcaaacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggt 1620650  T
Q  616 gaatcaa 622  Q
    |||||||    
T  1620651 gaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18163083 - 18162985
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163083 aattgttatgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 18162985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1313822 - 1313727
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1313822 tgttgcgaattcgatgaaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 1313727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 4308122 - 4308216
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308122 tgttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 4308216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5886622 - 5886528
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5886622 caattgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa--caaagtgtatggaaca 5886528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Original strand, 6063281 - 6063368
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6063281 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccgataacaacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg 6063368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25634148 - 25634033
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25634148 tttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 25634049  T
Q  518 ggttacaagaataagt 533  Q
    | ||||||||||||||    
T  25634048 gattacaagaataagt 25634033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36012243 - 36012149
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36012243 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 36012149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 43423304 - 43423402
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaac-ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423304 caattgttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 43423402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Original strand, 53894054 - 53894121
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatat 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53894054 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatatat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 9604447 - 9604540
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9604447 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaacc-aaaccaaagtgtatgaaacaatta 9604540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 10621362 - 10621452
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  10621362 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatg 10621452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 27635497 - 27635592
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27635497 tgttgcaaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27635592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50494417 - 50494321
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  50494417 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 50494321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Original strand, 53917500 - 53917600
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53917500 gacaattgttgcgaaatcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaat 53917598  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  53917599 ta 53917600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 568 - 640
Target Start/End: Original strand, 4560425 - 4560497
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 640  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4560425 tctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5900091 - 5900001
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5900091 tgttgcgaattcgacgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa--caaagtgtatggaaca 5900001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6232210 - 6232119
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6232210 attgttgcgaattcgatgaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagta----ataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 6232119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 568 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 13419995 - 13419864
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  |||||    
T  13419995 tctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaa 13419901  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 705  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||    
T  13419900 accctagttttcttgttggcttt-taaacctttgtttc 13419864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45883357 - 45883263
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45883357 tgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 45883263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3859931 - 3859834
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgat-gaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3859931 ttgttgtgaattcgatcgaaaagtcacaccaataacaacttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaa 3859834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 446 - 622
Target Start/End: Original strand, 14634465 - 14634638
Alignment:
Q  446 acctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-ccta 543  Q
    ||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| | |   ||||    
T  14634465 acctagtctgctgatgagattagccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaaccta 14634564  T
Q  544 attctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    || |||||||||||| ||  ||||||||     || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634565 atgctacccaaagtctcaatctcttctc-----gtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 27101028 - 27101116
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27101028 gaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 27101116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 340
Target Start/End: Original strand, 28101844 - 28101930
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101844 caattgttgtgaattcgatgaaaaattacaccaataataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 28101930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 684 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321367
Alignment:
Q  684 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaa 1321367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Original strand, 5926615 - 5926703
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5926615 gaattcgatgaaaactcacaccaataacaaacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtaaggaacaatta 5926703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38210789 - 38210693
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  38210789 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaa-caaagcgtatggaataattaaat 38210693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 43421258 - 43421354
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421258 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 43421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23633866 - 23633775
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23633866 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatactagatgtgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 23633775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15781293 - 15781203
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15781293 tgttgtgaattcgatggaaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaat-aaagtgtatggaaca 15781203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Original strand, 28412868 - 28412943
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaat-cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28412868 attgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaa 28412943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 53915338 - 53915432
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53915338 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-ccaagtgtatgaaacaatta 53915432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6484756 - 6484678
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484756 aaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 6484678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 580 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  580 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttt 677  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36957713 - 36957651
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc 328  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36957713 gaattcgatgaaaatcatatcaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacc 36957651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1626525 - 1626620
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626525 tgttgcgaattccataagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaa-caaaaacaaagtgtatggaacaatta 1626620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3307176 - 3307080
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3307176 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 3307080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31151755 - 31151667
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31151755 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 31151667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42992800 - 42992712
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42992800 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaa 42992712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 561633 - 561710
Alignment:
Q  269 ttcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  561633 ttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 561710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736324
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 1736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552902
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709809
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 30709809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Original strand, 25687998 - 25688094
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25687998 tgttgcaaattcgatgagaaaactcacaccaataacaaactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 25688094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 29913954 - 29914132
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| ||   |    
T  29913954 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttac-aaagagatat---t 29914049  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    | ||||||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29914050 gagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 28761287 - 28761375
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28761287 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaat-aaagtgtatggaa 28761375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370505
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974971
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986465
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Original strand, 880082 - 880175
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  880082 attggtgcgaattcgatgaaaaagtcacaccaataataaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaa-caaagtgtatgaaaca 880175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417510
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccacta 1417510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 789
Target Start/End: Original strand, 1618916 - 1619016
Alignment:
Q  688 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaaca 786  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||    
T  1618916 tttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctc--aaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagtatccctcataaaattggaaca 1619013  T
Q  787 aat 789  Q
    |||    
T  1619014 aat 1619016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25635789 - 25635718
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  25635789 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacactaataaatacttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaa 25635718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Original strand, 880313 - 880386
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  880313 aaaatcacacccataacaaacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaaca 880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Original strand, 6719392 - 6719442
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719392 ctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 6719442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 10094074 - 10094256
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||    ||    
T  10094074 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttac-aaagaga---taa 10094169  T
Q  516 tgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| |||  ||   ||||||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094170 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctaccc-aagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25634298 - 25634224
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | || |||  ||||||||||||||||    
T  25634298 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaatacttaatgtggggagcaagtaataatcaagcaaccaa 25634224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28181400 - 28181324
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28181400 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagg-acaatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 28181324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 35919020 - 35919066
Alignment:
Q  310 aagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919020 aagggataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 35919066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 671 - 720
Target Start/End: Original strand, 4560509 - 4560558
Alignment:
Q  671 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4560509 ctagttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctc 4560558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 484
Target Start/End: Original strand, 48438221 - 48438282
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48438221 ttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 48438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 4103736 - 4103822
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  4103736 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgcgtggagcaa-ggatagtcaaacaaccgaaa-aaaagtgtatggaa 4103822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  582 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264418
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711291
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactat 21711291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 644
Target Start/End: Original strand, 31021300 - 31021361
Alignment:
Q  582 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  31021300 caagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 31021361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143389
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33386749 - 33386685
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  33386749 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 51943752 - 51943693
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51943752 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtttggaacaatta 51943693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53591598 - 53591503
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  53591598 ttgttgtgaattcaatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaa-caaaatgtatggaacaatta 53591503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 10100091 - 10100158
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10100091 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10100158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 10200954 - 10201021
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10200954 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 10201075 - 10201136
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201075 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10897188 - 10897121
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10897188 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10897121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 12267819 - 12267913
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12267819 tgttgtgaactcgatgaaaaattacaccaataacaaatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 12267913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720878
Alignment:
Q  296 ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 26720878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 32263881 - 32263975
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32263881 tgttgtgaattcgaagaaaaatcacactaataacaaatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 32263975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 37466295 - 37466358
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  37466295 ttgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccacta 37466358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 331
Target Start/End: Original strand, 51674608 - 51674682
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaa 331  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  51674608 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaa 51674682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 54193409 - 54193342
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54193409 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 54193342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4666911 - 4666834
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4666911 aaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 4666834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 10100235 - 10100273
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100235 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53597648 - 53597569
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  53597648 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatactttatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 53597569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303425
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 6303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 724
Target Start/End: Original strand, 6719357 - 6719394
Alignment:
Q  687 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 724  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6719357 ctttctaaacccttatttcagccccctctatctctctc 6719394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 640
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  595 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 528
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007630
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaa 11007630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 47148745 - 47148832
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47148745 tgttgtgaatttgatgaaaactcacaccaataacaaacttgatgtgtg-------ggataatcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 47148832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 47878170 - 47878350
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | ||||||| |||| ||      
T  47878170 tttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaa-gagatat-- 47878266  T
Q  515 atgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
     || ||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47878267 -tgagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 53468295 - 53468390
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53468295 tgttgcaaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 53468390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 460
Target Start/End: Original strand, 5236457 - 5236497
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaa 460  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5236457 ttgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctggggaa 5236497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 26298992 - 26299056
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  26298992 ttgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactat 26299056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 27452962 - 27453026
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27452962 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 36029097 - 36029161
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  36029097 ttgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactat 36029161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 39040075 - 39040011
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  39040075 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactat 39040011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42992642 - 42992606
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga 459  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992642 ttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggga 42992606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 54193287 - 54193229
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54193287 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 10208000 - 10208067
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  10208000 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactata 10208067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 10208121 - 10208182
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208121 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 10612777 - 10612844
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  10612777 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 10612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11066707 - 11066652
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066707 tctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 20031462 - 20031497
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20031462 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 22625983 - 22626050
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22625983 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactata 22626050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795848
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctacta 25795848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27544455 - 27544388
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  27544455 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactata 27544388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 27762130 - 27762165
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27762130 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 54188691 - 54188625
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54188691 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggga-gagagcagctctccgatccactata 54188625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 4535652 - 4535622
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4535652 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 603
Target Start/End: Original strand, 10949404 - 10949438
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 603  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10949404 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24181749 - 24181675
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||    
T  24181749 tgttgtgaattcgaagaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtggagaaattaataatcaagcaaccaaaat 24181675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 731 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 25635377 - 25635319
Alignment:
Q  731 tagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||    
T  25635377 tagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagcatccctcataaaattggaacaaat 25635319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 458
Target Start/End: Original strand, 32744436 - 32744474
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32744436 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg 32744474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 319
Target Start/End: Original strand, 35917876 - 35917937
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  35917876 tgttgcgaattcgatgaaaaaattacaccaataacaacttgatgtatggaacaagggataat 35917937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43228733 - 43228695
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228733 tgttgcgaattcgatgagaaatcacaccaataacaactt 43228695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 353
Target Start/End: Original strand, 48361568 - 48361605
Alignment:
Q  315 ataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48361568 ataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 48361605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5858701 - 5858660
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  5858701 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactata 5858660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079633
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 11079633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17795669 - 17795581
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17795669 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 17795581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19104109 - 19104021
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19104109 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaat-aaaatgtatggaa 19104021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 48390327 - 48390368
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  48390327 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 48390368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 185)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 18466964 - 18466491
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18466964 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 18466865  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466864 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttt-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18466770  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466769 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18466670  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  18466669 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac---ttttttttct 18466573  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466572 cctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 18466491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 18469289 - 18468816
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18469289 tttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 18469192  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469191 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18469097  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469096 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18468997  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  18468996 tctctcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac-tttttattttct 18468898  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18468897 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 18468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 27910730 - 27910258
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910730 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 27910631  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910630 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagc-----ctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27910536  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||      
T  27910535 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaa-ccttgtttcagcccccgctatc 27910437  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |    
T  27910436 tctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacttttttttttt 27910337  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910336 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 27910258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 18511211 - 18511679
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  18511211 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgg 18511310  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511311 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18511405  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  18511406 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 18511503  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||         |||    
T  18511504 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactaaagatacgtttttttt-tct 18511602  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511603 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 18511679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 27912816 - 27912337
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27912816 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgg 27912717  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912716 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcac-----gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27912622  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27912621 tcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccctctatc 27912522  T
Q  719 tc--tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnnnnnc 815  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||              
T  27912521 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaagatacgtttttttttt 27912422  T
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27912421 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgata 27912337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 423 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 25804300 - 25803825
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804300 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 25804202  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804201 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 25804107  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 722  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25804106 ccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatctctc 25804007  T
Q  723 tc-----aaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    ||      || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         ||    
T  25804006 tctctctcaaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatattacactgaagatacgtttttttt-tc 25803908  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25803907 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 25803825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 15552525 - 15552043
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15552525 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 15552427  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15552426 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 15552332  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15552331 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctctat 15552232  T
Q  717 -----tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnn 811  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||         
T  15552231 ctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacgctgaagatacgttttt 15552132  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15552131 tttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 15552043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 18509317 - 18509784
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |     
T  18509317 tttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaacga 18509416  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509417 gttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtccca-----ttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18509511  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||      
T  18509512 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctcta-- 18509608  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||         |||    
T  18509609 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttgggatgaataccacactgaagatacgtttttttt-tct 18509707  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18509708 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcata 18509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 10587112 - 10586647
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10587112 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatg 10587014  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||      |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10587013 ggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtga 10586919  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttcc-aaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10586918 atcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta-----------gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc-tcta 10586831  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  10586830 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgtttttttttt 10586731  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10586730 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 10586647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 26098011 - 26097544
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26098011 tttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatga 26097913  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26097912 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttc-----ccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc-aaggtgaa 26097819  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||      
T  26097818 tcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagccccctcta-- 26097721  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||    
T  26097720 --tctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacatttttttttcct 26097623  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccct--ttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097622 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 26097544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 421 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596464
Alignment:
Q  421 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgag 18596825  T
Q  520 ttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 619  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18596824 ttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaat 18596730  T
Q  620 caacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 719  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||       
T  18596729 caaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt--tatacccttgtttcagccccctcta--- 18596635  T
Q  720 ctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctc 819  Q
     || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||    
T  18596634 -tcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttttttttttctc 18596536  T
Q  820 cttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 891  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596535 cttcagtgatagaatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 18596464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 25921472 - 25921806
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921472 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 25921571  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921572 gttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaa 25921666  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25921667 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 25921764  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921765 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 25921806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 428 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4236900 - 4236575
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236900 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 4236801  T
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4236800 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccac 4236706  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     ||    
T  4236705 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatctcc----aa 4236610  T
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236609 gtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 4236575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 2175198 - 2174865
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2175198 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 2175100  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175099 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 2175005  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175004 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 2174905  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2174904 tcc----aagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaa 2174865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38882385 - 38882051
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38882385 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 38882287  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882286 gttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38882192  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  38882191 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc---ctc 38882095  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882094 tatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 38882051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 10529098 - 10529429
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529098 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 10529197  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529198 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10529292  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  10529293 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactcta-- 10529390  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10529391 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 10529429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 39854763 - 39854433
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39854763 tttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgg 39854664  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854663 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccag-----tctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 39854569  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||    
T  39854568 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc-----tc 39854474  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39854473 tatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 39854433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16776437 - 16776103
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776437 tttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 16776338  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776337 -ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 16776244  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  16776243 tcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagccccctcta-- 16776146  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctata-tttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16776145 --tctcaaagtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaa 16776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 21948306 - 21947973
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21948306 tttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggg 21948207  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948206 gttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 21948112  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||    
T  21948111 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccc-----tc 21948017  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948016 tatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 21947973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 419 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 40221803 - 40221340
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40221803 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 40221704  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40221703 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 40221609  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40221608 atcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta- 40221510  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac-------gnnnn 810  Q
       |||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||       |        
T  40221509 ---tctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaa--aagtaactcataaatttagaacggatatcacactgaagatacgttttttgtttt 40221415  T
Q  811 nnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 885  Q
         |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221414 ttccttctcctgcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 6745348 - 6745049
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745348 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 6745249  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745248 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 6745154  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6745153 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagccccctttatc 6745055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 21684451 - 21684794
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  21684451 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatga 21684549  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21684550 gttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaa 21684644  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  21684645 tcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatc 21684744  T
Q  717 ----tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684745 tctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 21684794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31545360 - 31545026
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31545360 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatgg 31545262  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31545261 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31545167  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31545166 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccttta- 31545068  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31545067 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 31545026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Original strand, 34477052 - 34477353
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34477052 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 34477150  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34477151 gttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtg 34477245  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477246 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 34477345  T
Q  717 tctctctc 724  Q
    ||||||||    
T  34477346 tctctctc 34477353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 2818334 - 2818669
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  2818334 tttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 2818433  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2818434 gttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----cttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaa 2818528  T
Q  619 tc-aacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2818529 tcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 2818627  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818628 ---tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 2818669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31543014 - 31542681
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31543014 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac-aaagagaaatcaatgg 31542916  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31542915 gtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31542822  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31542821 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 31542723  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31542722 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 31542681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 1189606 - 1189947
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1189606 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 1189705  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1189706 ggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaagtg 1189800  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1189801 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctcta 1189900  T
Q  717 tctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189901 tctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 1189947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 31179370 - 31179704
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  31179370 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatgaatgg 31179468  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31179469 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31179563  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31179564 atcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctcta- 31179662  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31179663 ---tctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaa 31179704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Original strand, 34479417 - 34479718
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34479417 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgg 34479515  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||      |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34479516 gttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtg 34479610  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479611 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 34479710  T
Q  717 tctctctc 724  Q
    ||||||||    
T  34479711 tctctctc 34479718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 6747584 - 6747253
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  6747584 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatga 6747486  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747485 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccag-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 6747391  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747390 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatc 6747292  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||| ||    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747291 tctttc--tctttgctctgatacaaggtctatatttatagt 6747253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25904383 - 25904049
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||     
T  25904383 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgt 25904284  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904283 gttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25904189  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25904188 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 25904091  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25904090 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 25904049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 17073164 - 17072829
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17073164 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 17073065  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073064 agttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaa-----tctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 17072970  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17072969 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 17072871  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17072870 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 17072829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 16092198 - 16092537
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16092198 tttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatg 16092297  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092298 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 16092392  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16092393 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctat 16092492  T
Q  718 ctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16092493 ctctcac-aagtttacatctgatacaaagtctatatttctagtaaa 16092537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 761
Target Start/End: Original strand, 10474322 - 10474655
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  10474322 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgg 10474421  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10474422 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaa-----tctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgta 10474516  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10474517 tcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatt 10474616  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaa 761  Q
    ||    || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474617 tc----aaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24127136 - 24126802
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  24127136 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatga 24127037  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24127036 gttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaa 24126942  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  24126941 tcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcccc----atc 24126846  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    | |||||| |||||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  24126845 tatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaa 24126802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 6756772 - 6756414
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  6756772 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg 6756674  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6756673 --ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggaga 6756581  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  6756580 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctcta- 6756482  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
       |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||    
T  6756481 ---tctcaaagtttaatatgatacaagatctatattaatagtaaaagtataactta-aaatttggaataaat 6756414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 31472611 - 31472946
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31472611 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 31472710  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472711 ggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31472805  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31472806 atcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta- 31472904  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  31472905 ---tctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaa 31472946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 682
Target Start/End: Original strand, 658355 - 658610
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  658355 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga---gagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 658451  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658452 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 658546  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttg 682  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  658547 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 419 - 757
Target Start/End: Original strand, 17818491 - 17818817
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17818491 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 17818588  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  17818589 gttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaa 17818683  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||    
T  17818684 tcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcccc-----tc 17818778  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
    | |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  17818779 tttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 568 - 891
Target Start/End: Original strand, 26098394 - 26098714
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26098394 tctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 26098493  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatat 767  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26098494 accctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctcc----aggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtat 26098589  T
Q  768 aactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaa 866  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26098590 aactcataaaattggaacgaataccacattgaagatacgtttttttatttctccttcaatgaaagaatttttgtatcaaaaatataatattccctttcaa 26098689  T
Q  867 aatatatttgcatcaaatcgttctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26098690 aatatatttgcatcaaatcgttctt 26098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 36402327 - 36402661
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36402327 tttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 36402426  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||      |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36402427 attacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaa-----tctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaa 36402521  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||      
T  36402522 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta-- 36402619  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36402620 --tctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaa 36402661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 419 - 758
Target Start/End: Original strand, 37705779 - 37706109
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37705779 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 37705878  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||     | |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705879 gttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaa-----accctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 37705973  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||      
T  37705974 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctcta-- 37706071  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
      |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  37706072 --tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 37706109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 696158 - 695835
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  696158 tttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatg 696059  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  696058 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtga 695965  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  695964 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatcccccttta- 695877  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  695876 ---tctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaa 695835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 423 - 720
Target Start/End: Original strand, 39397996 - 39398287
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 522  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |  ||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39397996 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggtta 39398095  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398096 caagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaa-----tctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 39398190  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39398191 ccctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 39398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 31465988 - 31466311
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  31465988 tttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct----------atatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgg 31466077  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31466078 gttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaa 31466171  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| | ||      
T  31466172 tcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagcccctttta-- 31466269  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466270 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 31466311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 419 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 2954696 - 2954368
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2954696 tttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgg 2954598  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2954597 gttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaa 2954503  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||     
T  2954502 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcatactcctcta- 2954404  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttat 756  Q
       ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  2954403 ---tctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 423 - 762
Target Start/End: Original strand, 12555926 - 12556256
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggtt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||    
T  12555926 ttgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagtt 12556025  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    ||||||| |||| ||  | ||||||||||| ||| ||| |      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12556026 acaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactccaa------tctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 12556119  T
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    |    
T  12556120 accctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctcta----t 12556215  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12556216 ctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 12556256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 4410302 - 4410090
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  4410302 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatag 4410204  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410203 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4410109  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagt 637  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4410108 tcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Original strand, 34530722 - 34530999
Alignment:
Q  477 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcc 575  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |      ||||||||    
T  34530722 tccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaa-----tctcttcc 34530816  T
Q  576 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagt 675  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34530817 cgtagccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 34530916  T
Q  676 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34530917 tttgttgttgcatttctaaacacttgtttcagccccctcta----tctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaa 34530999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 419 - 625
Target Start/End: Original strand, 20505842 - 20506041
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20505842 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgt 20505939  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505940 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20506034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 39798327 - 39798123
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  39798327 tttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgg 39798228  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798227 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccaca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 39798133  T
Q  619 tcaacccaca 628  Q
    ||||||||||    
T  39798132 tcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 419 - 803
Target Start/End: Original strand, 6661183 - 6661555
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  6661183 tttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaat 6661282  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6661283 gggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaa-----tttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtg 6661377  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6661378 aatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccctctcta 6661473  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagat 803  Q
        |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||    
T  6661474 ----tctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttgaaacggatataacactgaagat 6661555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 419 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 21289041 - 21288715
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||        |||     
T  21289041 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaag--------atga 21288950  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||     |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21288949 gttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagt-----cctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaaggtgaa 21288856  T
Q  619 tcaacccaca------aaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 712  Q
    ||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  21288855 tcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccc 21288756  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
    ||||    |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  21288755 tcta----tctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 419 - 637
Target Start/End: Original strand, 41585743 - 41585956
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  41585743 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatga 41585842  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||      |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585843 cttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaa 41585937  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagt 637  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  41585938 tcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 568 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20043186 - 20042996
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  20043186 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatacaa 20043087  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || ||||  | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  20043086 accctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctc----aaggtttgctatgatacaaagcctatatttatagtaaa 20042996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10749980 - 10749796
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10749980 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 10749882  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749881 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 537 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044956
Alignment:
Q  537 ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 20045078  T
Q  637 tgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtct 736  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    || ||||  |||    
T  20045077 tgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctc----aaggtttgctct 20044982  T
Q  737 gatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||    
T  20044981 gatacaaagcctatatttatagtaaa 20044956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 2724173 - 2723964
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  2724173 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgg 2724074  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2724073 gttacaagaataaatcacccgcctaattctaccaa--------------tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaa 2723988  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttg 642  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2723987 tcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23665323 - 23665140
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23665323 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 23665225  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665224 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 23793264 - 23793447
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23793264 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 23793362  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793363 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 721 - 900
Target Start/End: Original strand, 3373333 - 3373512
Alignment:
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctcc 820  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  3373333 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttttttttttctcc 3373432  T
Q  821 ttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3373433 ttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 3373512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10757456 - 10757273
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10757456 tttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagaaaaatcaatgg 10757358  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757357 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt------ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 3373136 - 3373320
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  3373136 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 3373234  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373235 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 15354574 - 15354757
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15354574 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 15354672  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354673 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 15356850 - 15357033
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15356850 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 15356948  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356949 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 38960131 - 38960314
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38960131 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 38960229  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960230 gttacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 419 - 571
Target Start/End: Original strand, 23741858 - 23742008
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23741858 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 23741956  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctc 571  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23741957 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctc 23742008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 36208856 - 36208526
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36208856 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaa-agagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 36208758  T
Q  518 ggttacaagaataagtgt-cccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    |||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  36208757 ggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctca-----atctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtg 36208663  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    ||||||  ||  ||||||||| | |    |  ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36208662 aatcaa--caacaaccctagtttctcccgcttagaga-aatctctcta-aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctct 36208569  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208568 a----tctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 36208526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 428 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 9020491 - 9020211
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaaatt-gacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 525  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9020491 ccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaa 9020392  T
Q  526 gaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 625  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  9020391 gaataagtcttccgcctaattctacccaaagctcca-----atctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaa--c 9020299  T
Q  626 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctcta 716  Q
       |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  9020298 ttcaaccctagtgtttgttgccaagag-caa-ctctatacaaaccctacttttg-tgttgcc-tcccaaacccttgttttcagctccctcta 9020211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 34476892 - 34476990
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34476892 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 34476990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 628 - 762
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507795
Alignment:
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaa 20507760  T
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20507761 gtttactctgatacaagatctatatttatagtaaa 20507795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 20054117 - 20053834
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||       
T  20054117 tttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc--- 20054021  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||  |||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054020 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca----------aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 20053931  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| | ||||| ||| || |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20053930 aatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttcagcgccctcta 20053835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 34479255 - 34479355
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479255 caattgttgcgaatttgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 34479354  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  34479355 t 34479355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 664 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410006
Alignment:
Q  664 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 4410006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 431 - 704
Target Start/End: Original strand, 17413176 - 17413441
Alignment:
Q  431 gttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17413176 gttcggtccaacactgaccaactctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 17413275  T
Q  529 taagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    ||||| | |   |||||||||||| |||||| ||      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  17413276 taagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaa-----tctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--c 17413368  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 704  Q
     |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  |||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  17413369 caaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccatagttttagtgctgcc-ttctaaacccttgttt 17413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10750141 - 10750041
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10750141 caattgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaa 10750042  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  10750041 t 10750041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 21684294 - 21684389
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21684294 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 21684389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38882525 - 38882430
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38882525 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 38882430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10528937 - 10529035
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528937 tgttgtgaattcgatgagaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 10529035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10757614 - 10757517
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10757614 ttgttgtgaattcgatcaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 10757517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4237065 - 4236970
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4237065 tgttgtgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 4236970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 23667598 - 23667458
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23667598 tttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaatgg 23667500  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtccca 561  Q
    ||| |||| || ||| |  |||||||||||  |||||||||||    
T  23667499 gttgcaagcat-agtttttcgcctaattctttccaaagtccca 23667458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 3372977 - 3373074
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3372977 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 3373074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25804467 - 25804366
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25804467 caattgttgcgtattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 25804369  T
Q  354 aat 356  Q
    |||    
T  25804368 aat 25804366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 15143748 - 15143547
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  15143748 tttgtttacccatttcggtcaaatactgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 15143649  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||| |      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  15143648 gggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaa-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggt 15143554  T
Q  616 gaatcaa 622  Q
    |||||||    
T  15143553 gaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 356
Target Start/End: Original strand, 25921321 - 25921410
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25921321 gaattcgttgagaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaacaattaaat 25921410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 36402168 - 36402265
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36402168 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaatta 36402265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 665 - 806
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586083
Alignment:
Q  665 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaca 764  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    || ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||      
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctc----aaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaag 41586041  T
Q  765 tataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41586042 tataactcatagatttggaacgaataccagactgaagatacg 41586083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4410459 - 4410386
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4410459 ttgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 4410386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 15356686 - 15356787
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  15356686 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 15356785  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  15356786 at 15356787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23665488 - 23665387
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23665488 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 23665389  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  23665388 at 23665387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 23793099 - 23793200
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23793099 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaa 23793198  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  23793199 at 23793200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 38959972 - 38960056
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38959972 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 38960056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 15354412 - 15354511
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  15354412 attgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 15354511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 419 - 509
Target Start/End: Original strand, 26098287 - 26098378
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26098287 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagaga 26098378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39798470 - 39798384
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39798470 attgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 39798384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2175341 - 2175243
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2175341 tgttgtgaattcgatcaaaaaagtcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaattaaat 2175243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 23741697 - 23741794
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  23741697 tgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 23741794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Original strand, 15445265 - 15445376
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  15445265 tttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggg-aagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaa 15445363  T
Q  517 gggttacaagaat 529  Q
    |||||||||||||    
T  15445364 gggttacaagaat 15445376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 835 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288653
Alignment:
Q  835 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcata 21288653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 355
Target Start/End: Original strand, 31179213 - 31179308
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31179213 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaataattaaa 31179308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2724330 - 2724233
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2724330 attgttgcgaatttgatgaaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 2724233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15552685 - 15552600
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15552685 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaa-caaagtgtatg 15552600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 353
Target Start/End: Original strand, 2818186 - 2818272
Alignment:
Q  268 attcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2818186 attcgatgaaaaacacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 2818272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 484 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770951
Alignment:
Q  484 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 42770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Original strand, 41585578 - 41585674
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585578 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 41585674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 351
Target Start/End: Original strand, 658204 - 658295
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  658204 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaa-caaagtgtacggaacaat 658295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10587252 - 10587166
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10587252 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaa-ggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 10587166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 31465832 - 31465928
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31465832 ttgttgcgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 31465928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 714 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 15143482 - 15143303
Alignment:
Q  714 ctatctctctcaaagtttag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg---nnn 809  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||          
T  15143482 ctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatag-agaaatataactcataaatttgtaacggatatcacgctgaagatacgtttctt 15143384  T
Q  810 nnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatg 897  Q
         | || ||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15143383 ttttccccttcttcagtgaaagaatatttgcatca-------aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg 15143303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 18511052 - 18511150
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18511052 caattgttgcgaattcgatgataaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 18511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 26098125 - 26098225
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa---tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26098125 caattgttgcgaattcgatgagaaaactcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaat 26098223  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  26098224 ta 26098225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27912969 - 27912887
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912969 gaattcgatgaaaaatcccaccaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 27912887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18467127 - 18467035
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18467127 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacactaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaa 18467035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18469448 - 18469360
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18469448 tgttgtgaattcgatgaaaaatcataccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 18469360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27910876 - 27910784
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27910876 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 27910784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40221969 - 40221869
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221969 gacaattgttgtaaatttgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaat 40221871  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  40221870 ta 40221869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21948464 - 21948372
Alignment:
Q  264 gcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21948464 gcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaatta 21948372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 17818351 - 17818429
Alignment:
Q  275 gaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17818351 gaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 17818429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 34530559 - 34530653
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34530559 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaatta 34530653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39854921 - 39854826
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39854921 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataataaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaatta 39854826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6745511 - 6745410
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat--caaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  6745511 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaat 6745412  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  6745411 ta 6745410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 568 - 724
Target Start/End: Original strand, 2144708 - 2144860
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt-ttgttccaaagagacaatctctatac 665  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||  |||    
T  2144708 tctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caaactc--tac 2144802  T
Q  666 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 724  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  2144803 aaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgtttttgccccttctctctctctc 2144860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 4898011 - 4897828
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||| ||| || | ||||||||| ||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||     
T  4898011 tttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaa 4897912  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
     |||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4897911 tggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcaca-----atctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6747745 - 6747646
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa--tcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6747745 attgttgcgaattggatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaatta 6747646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21289187 - 21289105
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289187 gaattcgatgaaaaatcacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 21289105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 42770902 - 42770693
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||| | |||||  ||| |||||| ||    
T  42770902 tctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaatagt--ttcccatggtgaatgaacccc--aaccttagtgtttgttgccaagagcaaat-tctatataa 42770808  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacata 766  Q
    ||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||    || ||||| || ||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  42770807 acc-taattttgt-gttgccttcc-aaacccttgttttcagtcccctctatctc----aaggtttactc-gatacaaagtttatatttatagtaaaagta 42770716  T
Q  767 taactcataaatttggaacaaat 789  Q
    |  |||||||| |||||||||||    
T  42770715 tccctcataaaattggaacaaat 42770693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1189454 - 1189546
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1189454 tgttgtgaattcgatgaaaa-cacaccaatatcaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaa-caaaatgtatggaacaatta 1189546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20045395 - 20045326
Alignment:
Q  284 accaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045395 accaataacaaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 20045326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 20505683 - 20505784
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa--tcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20505683 caattgttgtgaattcaatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaat 20505782  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  20505783 ta 20505784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 330
Target Start/End: Original strand, 31472454 - 31472531
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31472454 caattgttgcgaattcgatgaaaaatacacaccgataacaaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaa 31472531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31543153 - 31543099
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31543153 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaa 31543099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2954843 - 2954755
Alignment:
Q  266 gaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2954843 gaattcgatgagaaaacacaccaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 2954755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 29748479 - 29748287
Alignment:
Q  572 ttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaacc 670  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |  | ||||||| |||||||| | |||||  ||| ||| ||||||||    
T  29748479 ttcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatc--ctaaccctactgtttgttgccaagag--aat-tctctacaaacc 29748385  T
Q  671 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||     | |||||      ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748384 ctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttttctggctctctactcgcctctctctaaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 29748287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36209009 - 36208913
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36209009 attgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatagaacaatta 36208913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6756926 - 6756832
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa--cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6756926 gttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 6756832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353361
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18597080 - 18596985
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18597080 ttgttgcaaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaat-aaagtgtatggaacaatta 18596985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24127292 - 24127196
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  24127292 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacacaaataacaaacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 24127196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31545502 - 31545454
Alignment:
Q  278 aatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31545502 aatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaagggttaatcaagcaa 31545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932379
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Original strand, 37705625 - 37705723
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37705625 ttgttgtgaattcgatgagaaaaccacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaa-caaagtatatggaataattaaa 37705723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Original strand, 6661038 - 6661124
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaatcacaccaa-taacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6661038 gttgtgaattcgatgaaaatcacaccaattaaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatggaa 6661124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 28832263 - 28832326
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28832263 ttgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 28832326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1170993 - 1170811
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  1170993 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 1170898  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170897 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 12555779 - 12555852
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12555779 tcacaccaataacaaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 12555852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16776577 - 16776500
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16776577 aaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 16776500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11917000
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactata 11917000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26098071
Alignment:
Q  296 ttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 26098071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281819
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 10474203 - 10474262
Alignment:
Q  293 aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10474203 aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 10474262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464600
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17003989
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactat 17003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20043270 - 20043222
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagca 467  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20043270 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 35385451 - 35385634
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atg--atgagtaacgttacaaaagagaaatca 514  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||  | |||| |||||||    |    
T  35385451 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttac-aaagaga---ta 35385546  T
Q  515 atgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||| ||| ||||||| |||  ||   |||||||||| |||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385547 atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattcta-ccaaagtcccagc-----ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 4754289 - 4754098
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaa 667  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||  |||||    
T  4754289 tctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaa 4754195  T
Q  668 accctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag----ccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaa 761  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| |||||||||| ||| ||    | |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4754194 accctagtgtttgtgttggcttt-taaacccttgtttttagctctctccctct-tctctctcaaggtttcatctgatacaagatctatacttatagtaa 4754098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22673017 - 22672950
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22673017 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 22672950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25445679 - 25445612
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25445679 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25445612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Original strand, 34033713 - 34033768
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34033713 tctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa 34033768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 696310 - 696218
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga--aaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaa-ccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  696310 tgttgtgaattcgatgagaaaatcataccaataacagacttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaat-aaagtgtatggaaca 696218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 2298145 - 2298183
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298145 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20054266 - 20054182
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054266 tgttgtgaattcgataaaaatcacactaataaaatacttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 20054182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12084268 - 12084204
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  12084268 ttgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactat 12084204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 19588750 - 19588814
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  19588750 ttgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactat 19588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 25452556 - 25452498
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25452556 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Original strand, 2144874 - 2144925
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144874 ctctctctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaa 2144925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 10627403 - 10627364
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627403 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Original strand, 16092045 - 16092137
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatt 352  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16092045 tgttgtgaattcgatgagaaaacgcaccaataacaaacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa--caaagtatatggaacaatt 16092137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 607
Target Start/End: Original strand, 16093438 - 16093473
Alignment:
Q  572 ttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093438 ttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 23665127 - 23665084
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23665127 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 23665084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 719 - 762
Target Start/End: Original strand, 23793460 - 23793503
Alignment:
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23793460 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 23793503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25904537 - 25904443
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |  || ||||||||||  | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  25904537 ttgttgcgaattcgatgagaaaacacaccataataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaa-caaagtgtatggaacaatta 25904443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 28786442 - 28786407
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786442 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300626
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| | | |||| ||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccacta 31300626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 607
Target Start/End: Original strand, 31782600 - 31782639
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31782600 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 42127503 - 42127440
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  42127503 ttgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccacta 42127440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 42238443 - 42238376
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  42238443 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 42238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 716 - 762
Target Start/End: Original strand, 15354769 - 15354815
Alignment:
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15354769 atctctcccaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 15354815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 716 - 762
Target Start/End: Original strand, 15357045 - 15357091
Alignment:
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15357045 atctctcccaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 15357091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17073322 - 17073227
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgat--gaaaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| || ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17073322 ttgttgtgaattcgatccgaaaat-acaccaataataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaa-caaagtgtatggaacaatta 17073227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20043430 - 20043329
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataa-tcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaa 350  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20043430 gacaattgttgtggattcaatgagaaaacacatcaataacaaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaa-caaagtgtatggaacaa 20043332  T
Q  351 tta 353  Q
    |||    
T  20043331 tta 20043329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 25445557 - 25445501
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 602  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445557 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 485
Target Start/End: Original strand, 2298026 - 2298067
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  2298026 tgacctagtctgggggggagagcagctctccgatccactata 2298067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 146)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 30967516 - 30967046
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967516 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 30967417  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967416 gttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30967322  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967321 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 30967222  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||    
T  30967221 tctctcaaagtttagcct-atacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagattcgttttttttttct 30967123  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30967122 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcata 30967046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 30034602 - 30035078
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034602 tttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 30034701  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034702 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccctt-----aaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30034796  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30034797 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctccctctatc 30034896  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||         |||    
T  30034897 tctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacattgaagatacgtttttattttct 30034996  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30034997 ccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgata 30035078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 2628885 - 2629361
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2628885 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgg 2628983  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628984 gttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 2629078  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc-ctctat 717  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  2629079 tcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctctatct 2629178  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |    
T  2629179 ctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactaataaatttggaacaaatactacactgaagatacgtttttttttcc 2629278  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2629279 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 2629361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 19704566 - 19705047
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-agagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19704566 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatg 19704665  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19704666 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtg 19704760  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc-- 714  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19704761 aatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcca 19704860  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg--nnnnnn 812  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||            
T  19704861 tctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacacttaagatacgtttctttt 19704959  T
Q  813 nnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19704960 ttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 19705047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 420 - 900
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195986
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatggg 12195613  T
Q  520 ttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195614 ttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12195708  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  12195709 tcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 12195806  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||    
T  12195807 --tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagattcgttttttttttct 12195904  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12195905 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 12195986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 419 - 900
Target Start/End: Original strand, 26932561 - 26933040
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26932561 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 26932659  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26932660 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtga 26932754  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  26932755 atcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctctat 26932854  T
Q  717 ---tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnn 813  Q
       |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           
T  26932855 ctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagtataacccataaatttggaacaaataccacactgaagattcgttttttt 26932954  T
Q  814 nctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26932955 t-tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 26933040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 28241320 - 28241651
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241320 tttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 28241419  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241420 gttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28241514  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241515 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28241614  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28241615 tct----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 28241651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 11983028 - 11983362
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983028 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 11983127  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983128 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11983222  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11983223 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagccccctctatc 11983322  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983323 tcc----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 11983362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 4816230 - 4816578
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816230 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgg 4816329  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816330 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 4816424  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4816425 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 4816524  T
Q  717 --------tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816525 tctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 4816578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 20915355 - 20915691
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20915355 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgg 20915453  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||      ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20915454 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtccca-----atctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 20915548  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915549 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 20915648  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915649 ctctctcaa--tttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 20915691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 757
Target Start/End: Original strand, 14458766 - 14459093
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458766 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 14458865  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14458866 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag--gaa 14458958  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  14458959 tcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctcta-- 14459056  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14459057 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 14507175 - 14507508
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14507175 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgg 14507273  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507274 gttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14507368  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  14507369 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctcta-- 14507466  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14507467 --tctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaa 14507508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 1230248 - 1230579
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230248 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 1230347  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230348 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----caataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1230442  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  1230443 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccctctcta-- 1230540  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
      |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1230541 --tctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagt 1230579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 9020241 - 9019907
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9020241 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 9020142  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020141 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9020047  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9020046 tcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 9019947  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9019946 tctc----agtttactctgatacaagatctatatttatagtaaa 9019907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 26065296 - 26064965
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26065296 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgg 26065199  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065198 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 26065104  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065103 tcaaccctcaaaccctagtgttt---ccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 26065007  T
Q  719 tctctcaaag-tttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||| |||   || | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065006 tctctccaagaaatactgtgatacaaggtctatatttatagt 26064965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 26085265 - 26084934
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26085265 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgg 26085168  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085167 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 26085073  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085072 tcaaccctcaaaccctagtgttt---ccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 26084976  T
Q  719 tctctcaaag-tttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||||| |||   || | ||||||||||||||||||||||||    
T  26084975 tctctccaagaaatactgtgatacaaggtctatatttatagt 26084934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13057510 - 13057175
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13057510 tttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 13057411  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13057410 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtga 13057316  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13057315 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 13057217  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13057216 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 13057175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 15532681 - 15533040
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15532681 tttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagggat-agagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 15532779  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15532780 gttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaa-----tctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 15532874  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15532875 tcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 15532972  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  15532973 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactta-aaatttggaacaaat 15533040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541499
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || | | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15541139 tttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgg 15541238  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15541239 gttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctc-----gtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaa 15541333  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15541334 tcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 15541431  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||    
T  15541432 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtaactta-aaatttggaacaaat 15541499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 419 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 3390695 - 3390343
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3390695 tttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 3390596  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390595 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 3390501  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  3390500 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtcta- 3390402  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatt 779  Q
       |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  3390401 ---tctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatctctcataaatt 3390343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 763
Target Start/End: Original strand, 3631938 - 3632272
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3631938 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 3632035  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3632036 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaa-----tctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatga 3632130  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  3632131 atcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactccctcta- 3632229  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaac 763  Q
       |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3632230 ---tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaac 3632272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 30728823 - 30729161
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tca 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  30728823 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatca 30728922  T
Q  515 atgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30728923 atgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctct-----tcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaagg 30729017  T
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 714  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30729018 tgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccctc 30729117  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30729118 ta----tctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaa 30729161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 3629864 - 3630197
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3629864 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggga-gagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgg 3629962  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629963 gttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3630057  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||      
T  3630058 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccccctcta-- 3630155  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||  ||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3630156 --tctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaa 3630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25477597 - 25477255
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg-------ttacaaaagagaa 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||       ||||||||||||     
T  25477597 tttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttacaaaagagat 25477498  T
Q  511 atcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||      |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477497 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaa-----tctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 25477403  T
Q  611 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 710  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477402 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 25477303  T
Q  711 cctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25477302 cctcta----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaa 25477255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13040070 - 13039735
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13040070 tttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 13039971  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13039970 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtga 13039876  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  13039875 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctata- 13039777  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  13039776 ---tctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaa 13039735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 463 - 762
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530455
Alignment:
Q  463 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccag 562  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||     
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  563 cctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctcta 662  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15530265 -----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactcta 15530359  T
Q  663 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530360 tacaaaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctccc----agtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaa 15530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 423 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 32280308 - 32279982
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 521  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32280308 ttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtt 32280209  T
Q  522 acaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 621  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280208 acaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 32280114  T
Q  622 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||| |    
T  32280113 accctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagcccc-----tctat 32280019  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 758  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  32280018 ctccaagtttactatgatacaaggtctatatatatag 32279982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 429 - 762
Target Start/End: Original strand, 3233739 - 3234063
Alignment:
Q  429 cagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3233739 cagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 3233838  T
Q  529 taagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 628  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3233839 taagtctcccgcataattctacccaaagcctcaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 3233933  T
Q  629 aaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaa 727  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||     
T  3233934 aaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctctatctt----aag 3234029  T
Q  728 gtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3234030 gtttacactgatacaag-tctatatttatagtaaa 3234063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 526 - 762
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227741
Alignment:
Q  526 gaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 625  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 19227608  T
Q  626 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctca 725  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||    
T  19227609 acaaaccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagcccccttta----tctca 19227704  T
Q  726 aagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19227705 aagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaa 19227741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 419 - 640
Target Start/End: Original strand, 5273215 - 5273431
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5273215 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttac-aaagagaaatcaatgg 5273313  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5273314 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 5273408  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtt 640  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5273409 atcaacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 24338447 - 24338781
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24338447 tttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggg--gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 24338544  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |      |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24338545 ggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaa-----tctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaa 24338639  T
Q  618 atcaacccacaaaccc-tagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338640 atcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 24338739  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24338740 ----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 24338781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 419 - 711
Target Start/End: Original strand, 12161557 - 12161841
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12161557 tttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggga-gagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 12161655  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| |||| |||||| ||      ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  12161656 gttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaa-----tctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaa 12161750  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 711  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12161751 acaaccctcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagcccc 12161841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 631 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852389
Alignment:
Q  631 ccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtt 730  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaggtt 17852555  T
Q  731 tagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatac--gnnnnnnnnctctccttcaatga 828  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||            |||| |||| |||    
T  17852554 tactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacac-gaagatacttttttttttcttctctttcagtga 17852456  T
Q  829 aagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17852455 aataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcata 17852389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 487 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 17012287 - 17011907
Alignment:
Q  487 gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaaga 586  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||     || |||||||    
T  17012287 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctc-----gtgaccaaga 17012193  T
Q  587 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc 686  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||      
T  17012192 gactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgttta 17012097  T
Q  687 ctttctaaacccttgt-ttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaac 785  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||||||    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  17012096 c-ttctaaacccttttattcagacccctcta----tctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag-agaaatataactcataaatttggaac 17012003  T
Q  786 aaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 885  Q
     || | ||| |||||||||||         | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17012002 gaacatcactctgaagatacgttt------tttttttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 17011909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 485 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490658
Alignment:
Q  485 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaa 584  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaa-----tctctttccgtaaccaa 22490795  T
Q  585 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgtt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    || |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22490794 gagactcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgtt 22490695  T
Q  685 gcctttc-taaacccttgtttcagccccctctatctc 720  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490694 gcctttcaaaaacccttgtttcagccccctctatctc 22490658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 3027850 - 3028183
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3027850 tttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3027949  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027950 tgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaa-----tctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 3028044  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctc 714  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |     
T  3028045 gaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcagccccttt 3028139  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    |||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3028140 ta----tctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaa 3028183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 26066123 - 26066307
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26066123 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 26066221  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066222 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 419 - 619
Target Start/End: Original strand, 1069717 - 1069913
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1069717 tttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 1069816  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069817 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctca-----atctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 1069911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33309171 - 33308988
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33309171 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 33309073  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309072 gttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 15719959 - 15719673
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15719959 tttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15719860  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15719859 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 15719765  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719764 aatcaactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctcta 15719677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 26068394 - 26068578
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26068394 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgg 26068492  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||      ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068493 gttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtccca-----atctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Original strand, 29754708 - 29754892
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29754708 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 29754806  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754807 gttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtccca-----atctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33311440 - 33311257
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33311440 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 33311342  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311341 gttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 16455423 - 16455757
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||     
T  16455423 tttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaa 16455522  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16455523 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtg 16455617  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||    ||||    
T  16455618 aatcaa-ccac-aaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttttcag---actct 16455710  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
     |  ||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  16455711 ctacctctcaaggtttacaccgatacaaggtatatatttatagtaaa 16455757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 14466639 - 14466314
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| | |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  14466639 tttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatg 14466540  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14466539 agttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactccca-----atctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatga 14466445  T
Q  618 atcaacccac-aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| | ||           || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  14466444 atcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaa-----------tagacaaactctagttttgctgttgtctttctaaactcttgtttcaaccctctcta 14466356  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        |||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  14466355 ----tctcaaggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaa 14466314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 419 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 15367347 - 15367129
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggga-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||    
T  15367347 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatg 15367248  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||  ||      ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15367247 ggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttca-----atctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtga 15367153  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgtt 644  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||    
T  15367152 atcaaccc---aaccctagtgtttgtt 15367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 615 - 762
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072210
Alignment:
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 714  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1072167 ta----tctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaa 1072210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 419 - 623
Target Start/End: Original strand, 12186070 - 12186271
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 517  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12186070 tttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatg 12186169  T
Q  518 ggttacaagaataagtgtcc-cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
     ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186170 agttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctca-----atctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 12186264  T
Q  617 aatcaac 623  Q
    |||||||    
T  12186265 aatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 718 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 18318051 - 18317869
Alignment:
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctc 817  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||    
T  18318051 ctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttttttttttc 18317952  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18317951 tccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgata 18317869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 612 - 762
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447649
Alignment:
Q  612 aggtgaatcaacccacaaacc-ctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 710  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 32447601  T
Q  711 cctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||||    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32447602 cctcta----tctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaa 32447649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 640 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995460
Alignment:
Q  640 ttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgat 739  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctc----agtttactctgat 8995483  T
Q  740 acaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8995482 acaagatctatatttatagtaaa 8995460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 419 - 885
Target Start/End: Original strand, 22857951 - 22858403
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatc-aa 515  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||    
T  22857951 tttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagatatatcaaa 22858049  T
Q  516 tgggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 614  Q
     ||||||||||||| |||  ||   ||||| |||||| |||||| ||      |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22858050 agggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctca-----atctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaagg 22858144  T
Q  615 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt--cagccccc 712  Q
    |||||||| |    |||||||||||||||| | |||||| |||   | ||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||    |  | |    
T  22858145 tgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttaccaagagaaaat---tctacaaaccctagtttttgtgttagc-ttctaaacccttgttttctggttctc 22858238  T
Q  713 tctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg-nnnnn 811  Q
    ||||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||          
T  22858239 tctatctctctcacaaattcatctgatacaaggtttatatttatag-agaaatataactcataaatttggaacgtatatcacgttgaagatacgtttctt 22858337  T
Q  812 nnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 885  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22858338 tttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaa--------attccctttcaaaatatatttgcatctaatc 22858403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 2628726 - 2628814
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628726 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 2628814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 419 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15346662 - 15346522
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15346662 tttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgg 15346563  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcc 559  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346562 gttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33309333 - 33309233
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaa 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33309333 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaa 33309234  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  33309233 t 33309233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 19696757 - 19696422
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||     
T  19696757 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaa 19696658  T
Q  517 gggttacaagaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    || ||||||||||||||  ||   |||||||||| |||||||| ||      |||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19696657 ggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctca-----atctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 19696563  T
Q  616 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctc 714  Q
    |||||||      |||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||    
T  19696562 gaatcaa--tttgaaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcag--ccctc 19696470  T
Q  715 tatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19696469 cctctctctcaaggtttcatcatatacaaggtctatatttatagtaaa 19696422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 816 - 900
Target Start/End: Original strand, 5275726 - 5275810
Alignment:
Q  816 tctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5275726 tctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 5275810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 419 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 26945461 - 26945258
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||  |||||| ||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26945461 tttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 615  Q
    | ||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26945361 gagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggt 26945267  T
Q  616 gaatcaacc 624  Q
    || ||||||    
T  26945266 gactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33311598 - 33311502
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33311598 tgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 33311502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 14507017 - 14507113
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507017 ttgttgcaaattcgatgaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 14507113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 611 - 757
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870749
Alignment:
Q  611 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccc 13870707  T
Q  711 cctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
    |     ||| |||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  13870708 c-----tctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 14458606 - 14458704
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458606 ttgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataatagcttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 14458704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 28241162 - 28241258
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28241162 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 28241258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 1230088 - 1230185
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1230088 attgttgcgaattcgataaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaattaaat 1230185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 26068231 - 26068331
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26068231 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaa 26068329  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  26068330 at 26068331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 29754549 - 29754645
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29754549 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 29754645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 4816088 - 4816167
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816088 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 4816167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Original strand, 19704422 - 19704502
Alignment:
Q  277 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaacc-aaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704422 aaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 19704502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 5273055 - 5273141
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa--tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273055 tgttgtgaattcgatgaaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 5273141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 11982871 - 11982965
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11982871 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 11982965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 26065961 - 26066057
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26065961 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaa-caaagcgtatggaacaattaaat 26066057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26065459 - 26065365
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26065459 attgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaaca 26065365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26085428 - 26085334
Alignment:
Q  258 attgttgcgaattcgatga---aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaaca 349  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26085428 attgttgtgaattcgatgagaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaaca 26085334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30967673 - 30967578
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  30967673 tgttgcgaattcgttgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaa-caaagtgcatggaataattaaat 30967578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3394841 - 3394742
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3394841 caattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataaaaatcttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta 3394742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 8717191 - 8717268
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8717191 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Original strand, 12195354 - 12195439
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12195354 tgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg 12195439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18322566 - 18322482
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18322566 tgttgcgaattctatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 344
Target Start/End: Original strand, 26932400 - 26932487
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26932400 aattgttgtgaatttgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 26932487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 621
Target Start/End: Original strand, 28037724 - 28037927
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccga---tccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 513  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | ||    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28037724 tttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatc 28037823  T
Q  514 aatgggttacaagaataag-tgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 612  Q
    || |||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||| ||      ||| || |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28037824 aaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctca-----atctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaa 28037918  T
Q  613 ggtgaatca 621  Q
    |||||||||    
T  28037919 ggtgaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Original strand, 30034446 - 30034528
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30034446 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtatggagcaa-ggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatg 30034528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10584311 - 10584227
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttaca 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  10584311 tttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15367499 - 15367404
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367499 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 15367404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3629711 - 3629805
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3629711 tgttgtgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3629805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9020398 - 9020304
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9020398 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 9020304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 24338292 - 24338389
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338292 aattgttgtgaattcgatgaaaaatcacatcaataacaaacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 24338389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 30728666 - 30728763
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30728666 aattgtagcgaattcgttgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 30728763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Original strand, 25078556 - 25078671
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  25078556 tttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggg-aagaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatcaaa 25078654  T
Q  517 gggttacaagaataagt 533  Q
    |||||||||||||||||    
T  25078655 gggttacaagaataagt 25078671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 3233567 - 3233662
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3233567 tgttgcgaattcgatgagaaaacacatcaataacaaatttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaatta 3233662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346347
Alignment:
Q  594 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 693  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||  ||| | |||||||||||||||||   |        ||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaagagcaaattt-tatacaaaccctagtttgaat--------tcta 15346437  T
Q  694 aacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaa 788  Q
    |||||||| ||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  15346436 aacccttggttcagccccctcta----tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaa-ttggaacaaa 15346347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 419 - 539
Target Start/End: Original strand, 25465589 - 25465710
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||     
T  25465589 tttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaa 25465687  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccg 539  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  25465688 ggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30445832 - 30445699
Alignment:
Q  428 ccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 525  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30445832 ccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 30445733  T
Q  526 gaataagt-gtcccgcctaattctacccaaagtc 558  Q
    |||| |||  ||   |||||||||||||||||||    
T  30445732 gaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtc 30445699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13057659 - 13057587
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13057659 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaa 13057587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15346806 - 15346719
Alignment:
Q  267 aattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15346806 aattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaa-caaagtatatggaacaatta 15346719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 20915214 - 20915293
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20915214 aaaatcacaccaataataacttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaataattaaat 20915293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 3631780 - 3631878
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3631780 caattgttgtgaattcgatgaaaaaacacaccaataacaaacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 3631878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25480347 - 25480253
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25480347 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataaatatttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaat-aaagtgtatgaaacaatta 25480253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 529
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911555
Alignment:
Q  445 gacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 529  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||  ||||||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757507
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10077258 - 10077194
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10077258 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 20527080 - 20526922
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagt 557  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| | |   |||||||||||| |||||    
T  20527080 agagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagt 20526982  T
Q  558 cccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |  |  |||||||      || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526981 cttaatctcttctt-----gtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11138478 - 11138423
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138478 tctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979580
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccacta 31979580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13878909 - 13878727
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  13878909 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 13878814  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878813 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Original strand, 15530027 - 15530101
Alignment:
Q  280 tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15530027 tcacaccaataacaaacttgatgtgtggagtaaggaataatcagacaatcaaaatttaagtgtatggaacaatta 15530101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16786101 - 16785919
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 515  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||   || || ||    
T  16786101 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaa---gagat-aa 16786006  T
Q  516 tgggttacaagaataagtgtcccg-cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    || ||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16786005 tgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22611138 - 22611059
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  22611138 tgttgcgagttcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtgtggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaaagtg 22611059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 648 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 10584212 - 10584155
Alignment:
Q  648 aagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 705  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10584212 aagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgtttc 10584155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 529
Target Start/End: Original strand, 12937219 - 12937302
Alignment:
Q  445 gacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||  ||||||||||||    
T  12937219 gacctagtctgggga-gagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaat 12937302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 332
Target Start/End: Original strand, 15540987 - 15541064
Alignment:
Q  257 aattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  15540987 aattgttgcgacttcgatgaaaaatcaaaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaa 15541064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5572334 - 5572270
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5572334 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356104
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 533
Target Start/End: Original strand, 28078193 - 28078308
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||| | |   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  28078193 tttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa- 28078291  T
Q  517 gggttacaagaataagt 533  Q
     ||||||||||||||||    
T  28078292 aggttacaagaataagt 28078308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13883536 - 13883475
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883536 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13883657 - 13883590
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13883657 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13883590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 31248835 - 31248896
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248835 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936654
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccacta 31936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 35201326 - 35201393
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35201326 tttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 607
Target Start/End: Original strand, 3577658 - 3577696
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577658 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Original strand, 7542527 - 7542581
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542527 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17012506 - 17012417
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatg-aaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17012506 caattgttgtgaattcgatgaaaaatcacaacaataaaatacttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 17012417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 25465440 - 25465519
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataaca-acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaa 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  25465440 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaatacttgatgtatggagcaa--aataatcaagcaaccaatatcaa 25465519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25477657 - 25477619
Alignment:
Q  294 acttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25477657 acttgatgtgtgaagtaagggatagtcaagcaaccaaaa 25477619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24436058 - 24436001
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24436058 acccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Original strand, 17694972 - 17695030
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17694972 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22491073 - 22491005
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  22491073 gaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaa 22491005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 22963704 - 22963767
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22963704 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggga-gagagcagccctccaatccactat 22963767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23824689 - 23824626
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23824689 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggga-gagagcagccctccaatccactat 23824626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32280463 - 32280391
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaa 330  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  32280463 tgttgtgaattcgataaaaaatcacacaaataacaaacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaa 32280391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 1069563 - 1069657
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaactt-gatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1069563 tgttgtgaattcgatgagaaaatataccaataacaaattcgatgtatggagcaagggatagtcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaatta 1069657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Original strand, 4629958 - 4630021
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4629958 ttgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccacta 4630021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 13467607 - 13467642
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13467607 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 19702006 - 19702041
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19702006 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 604
Target Start/End: Original strand, 22351996 - 22352031
Alignment:
Q  569 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22351996 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25941852 - 25941785
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25941852 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25941785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 622
Target Start/End: Original strand, 25078701 - 25078755
Alignment:
Q  568 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  25078701 tctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaatcaa 25078755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 736 - 790
Target Start/End: Original strand, 28038012 - 28038066
Alignment:
Q  736 tgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaata 790  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||    
T  28038012 tgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaata 28038066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 712 - 762
Target Start/End: Original strand, 29754979 - 29755029
Alignment:
Q  712 ctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29754979 ctctctctctctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 29755029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17038565 - 17038524
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatg 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17038565 tgttgtgaatttgatgaaaatcacaccaataaaaacttgatg 17038524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 762
Target Start/End: Original strand, 26066320 - 26066361
Alignment:
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26066320 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 26066361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 762
Target Start/End: Original strand, 26068591 - 26068632
Alignment:
Q  721 tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26068591 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 26068632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 852 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445359
Alignment:
Q  852 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatg 897  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg 30445359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 79474 - 79006
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79474 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 79375  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79374 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttc-----ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 79280  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79279 tcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 79180  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct-c 817  Q
    ||    ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          | |    
T  79179 tc----aagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaggtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacattttttttttcc 79084  T
Q  818 tccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79083 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 79006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 79631 - 79536
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79631 tgttgcgaattcaatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 79536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 419 - 895
Target Start/End: Original strand, 11472 - 11938
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11472 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 11571  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11572 gttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaa 11666  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||      
T  11667 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagccccctcta-- 11764  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctct 818  Q
      |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||    
T  11765 --tctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttt-tct 11861  T
Q  819 ccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862 ccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcata 11938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11410
Alignment:
Q  261 gttgcgaattcgatgaaaat--cacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaac-caaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  11315 gttgcgaattcgatgaaaatatcacaccaataacaacttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaatta 11410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 309; Significance: 1e-173; HSPs: 6)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 419 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 52302 - 51836
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagag--cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  52302 tttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 52203  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    | |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52202 gagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaa-----tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 52108  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52107 aatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctcta 52008  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnct 816  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |    
T  52007 tc--tctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtttttttt-t 51911  T
Q  817 ctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 891  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51910 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctt 51836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 183640 - 183969
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  183640 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgg 183739  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183740 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc------cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 183833  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||    
T  183834 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccc-----ttc 183928  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  183929 tatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 183969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50461 - 50363
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50461 caattgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 50363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52456 - 52362
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52456 tgttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgaaacaatta 52362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 183482 - 183578
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  183482 tgttccgaattcgatgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaa-caaaatgtatggaacaattaaat 183578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 50303 - 50235
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--aagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||    
T  50303 tttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 460 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 2289 - 1853
Alignment:
Q  460 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcc 559  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2289 agagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcc 2190  T
Q  560 cagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatct 659  Q
    ||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||    
T  2189 cagc-----cttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaact 2096  T
Q  660 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc--tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttata 757  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  2095 ctgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttata 1996  T
Q  758 gtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgnnnnnnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatt 857  Q
    || ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1995 gtgaaagtataacttataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatt 1896  T
Q  858 ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgata 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  1895 ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgata 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 69291 - 69628
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  69291 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 69389  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69390 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 69484  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69485 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 69584  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  69585 tctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaa 69628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 609 - 762
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73360
Alignment:
Q  609 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 708  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  709 cccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  73307 cccctctatctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaa 73360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 347
Target Start/End: Original strand, 69124 - 69220
Alignment:
Q  251 catgacaattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataac-aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  69124 catgataactgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaa-caaaatgtatggaa 69220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 648
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73210
Alignment:
Q  598 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttccaa 73210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 419 - 759
Target Start/End: Original strand, 41482 - 41813
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482 tttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 41581  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41582 gttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctct-----tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 41676  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 41776  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41777 tct----aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 41324 - 41420
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41324 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 41420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 247; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 4284 - 3952
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4284 tttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 4186  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4185 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaa 4091  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4090 tcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 3994  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993 --tctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4362
Alignment:
Q  281 cacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaat 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4415 cacatcaataacaaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaat 4362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 3168 - 2835
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3168 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 3070  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3069 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttc-----ccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 2975  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2974 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 2877  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2876 --tctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaa 2835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3319 - 3243
Alignment:
Q  266 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3319 gaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatg 3243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 752
Target Start/End: Original strand, 14381 - 14707
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14381 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg 14480  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14481 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagc-----ctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14575  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||      
T  14576 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctcta-- 14673  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatat 752  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  14674 tctctcaaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15308 - 14974
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15308 tttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 15209  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208 gttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaa-----tctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 15114  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 718  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      
T  15113 tcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctcta-- 15016  T
Q  719 tctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15015 --tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 14974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 353
Target Start/End: Original strand, 14230 - 14323
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14230 ttgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaatta 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 29459 - 29116
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  29459 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttac-aaagagaaatcaatga 29361  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29360 gttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaac-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaa 29266  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 716  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  29265 tcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatc 29166  T
Q  717 ----tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29165 tctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaa 29116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29616 - 29521
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29616 tgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaa-caaagtgtatggaacaattaaat 29521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6488 - 6154
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6488 tttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgg 6390  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6389 gttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 6295  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6294 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctcta- 6196  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6195 ---tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6647 - 6558
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6647 ttgttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 6558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 419 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 330 - 30
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  330 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 232  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  231 gttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 137  T
Q  618 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136 atcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 37  T
Q  718 ctctctc 724  Q
    |||||||    
T  36 ctctctc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 376
Alignment:
Q  260 tgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  473 tgttgtgaattcgttgagaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaattaaat 376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 646
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1673
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1452 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgg 1550  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1551 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc-----ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1645  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 1310 - 1389
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1310 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgtaacaattaaat 1389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 80148 - 79814
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  80148 tttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 80049  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 618  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  80048 gttacaggaataagtctcctgcctaa-tctacccaaagcccca-----atctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 79955  T
Q  619 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 717  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  79954 tcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctcta- 79856  T
Q  718 ctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
       |||||| |||||  |||||||||   ||||||||||||||||    
T  79855 ---tctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaa 79814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 80311 - 80210
Alignment:
Q  254 gacaattgttgcgaattcgatga-aaatcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  80311 gacaattgttgcgaattcgatgagaaaacacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaat 80212  T
Q  352 ta 353  Q
    ||    
T  80211 ta 80210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 419 - 789
Target Start/End: Original strand, 15819 - 16178
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15819 tttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 15918  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15919 gggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtg 16013  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16014 aatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaaccccctcta 16109  T
Q  717 tctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaat 789  Q
        ||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  16110 ----tcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaacaaat 16178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 419 - 875
Target Start/End: Original strand, 1640 - 2080
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1640 tttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 1739  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1740 gggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtg 1834  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 716  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||          || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1835 aatcaa-ccac-aaccctagtgtttgtt---------gaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagccacctcta 1922  T
Q  717 tctctctcaaagttta-gtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagata-----cgnnnn 810  Q
    |||||    | |||||  |||||||||||||||||||||| ||   | || |||||| |||||||||||   ||| ||| |||||||||     |         
T  1923 tctct----aggtttacatctgatacaaggtctatatttagag---aaatgtaactcgtaaatttggaatggatatcacgctgaagataggtttcctttt 2015  T
Q  811 nnnnctctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 875  Q
         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2016 ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 347
Target Start/End: Original strand, 1489 - 1578
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1489 caattgttgtgaattcaatgaaaatcacaccaataaatatttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa--caaagtgtatggaa 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 439 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 85500 - 85186
Alignment:
Q  439 caaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcc 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  85500 caaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 85401  T
Q  538 cgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 637  Q
    || || ||||||| ||||||| ||      ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  85400 cgtctgattctactcaaagtcaca-----atctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagt 85306  T
Q  638 gtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctg 737  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    | ||||| ||| |||||| ||||| | ||    
T  85305 gtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgttt----ctcctct-tctatctcaaggtttactttg 85211  T
Q  738 atacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  85210 atacaaagcctatatttatagtaaa 85186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 85671 - 85578
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85671 ttgcgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaatcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 85578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 528 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35644
Alignment:
Q  528 ataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 627  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-----ccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctc 35725  T
Q  628 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35724 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 35644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36037 - 35944
Alignment:
Q  262 ttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaa-cttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta 353  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36037 ttgcgaattcgatgaaaaattacaccaataacaaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaatta 35944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35883 - 35817
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35883 tttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 419 - 762
Target Start/End: Original strand, 16648 - 16980
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  | ||||  |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16648 tttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 16747  T
Q  517 gggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 616  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16748 gggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaa-----tctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtg 16842  T
Q  617 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctct 715  Q
    |||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16843 aatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctttc-aaacccttgttttcagcctcctct 16937  T
Q  716 atctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 762  Q
    |    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16938 a----tctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaa 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22404 - 22221
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22404 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatga 22306  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22305 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 419 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24679 - 24496
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24679 tttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatga 24581  T
Q  519 gttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 608  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24580 gttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtccca-----atctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24840 - 24742
Alignment:
Q  259 ttgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24840 ttgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataataaaat 24742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22568 - 22467
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||    
T  22568 caattgttgtgaattcgacgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgcatggaataataaa 22469  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  22468 at 22467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8448
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 426 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 5095 - 4726
Alignment:
Q  426 acccagttcggtccaa-attgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggtta 522  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5095 acccaattcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggtta 4996  T
Q  523 caagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 622  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||      ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4995 caaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttca-----atctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaa 4901  T
Q  623 cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-cccttgtttcagccccctctatctct 721  Q
     |    ||| |||||||||||| |  ||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| |  | ||||||| || || |||||| ||||||||    |    
T  4900 ac--tcaactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctag-tttgttgcttac-ttctaaatcctttttttcagacccctcta----t 4810  T
Q  722 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 806  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  4809 ctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag-agaaatataactcataaatttgaaacgaatatcacactgaagatacg 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 592 - 759
Target Start/End: Original strand, 993 - 1161
Alignment:
Q  592 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-----gagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc 686  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  687 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttcta----tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 1288 - 1388
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaa 354  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1288 caatttttgtgaattcgatgaaaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacaattaa 1386  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  1387 at 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 454
Target Start/End: Original strand, 1450 - 1485
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 12711 - 12799
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaa-tcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12711 caattgttgtgaattcgatgaaaaatgacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-caaagtgtatg 12799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 4535 - 4614
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattaaat 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4535 aaaatcacaccaataacaatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaa-caaagtcaaagcgtatggaacaattaaat 4614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 474
Target Start/End: Original strand, 4678 - 4733
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctcc 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4678 tttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5751
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2560
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  2496 ttgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactat 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 540 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 530
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57539
Alignment:
Q  444 tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 530  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaata 57539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16660 - 16615
Alignment:
Q  256 caattgttgcgaattcgatgaaaatcacaccaataacaacttgatg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16660 caattgttgtgaattcgatgaaaatcacaccaataaaaacttgatg 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 16386 - 16328
Alignment:
Q  540 cctaattctacccaaagtcccagcctcttctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16386 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttc-----ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 43990
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactat 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36925 - 36876
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagc 469  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36925 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagc 36876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 3069 - 3136
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3069 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Original strand, 16985 - 17052
Alignment:
Q  419 tttgttgacccagttcggtccaaat-tgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactata 485  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16985 tttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 604
Target Start/End: Original strand, 17131 - 17165
Alignment:
Q  570 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 604  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17131 tcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45 - 1
Alignment:
Q  276 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtgaagtaagggataatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45 aaaatcacaccaataacaacttgatgtgtggagcaagagataatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 483
Target Start/End: Original strand, 10736 - 10796
Alignment:
Q  423 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccacta 483  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  10736 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccacta 10796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 464
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 481
Target Start/End: Original strand, 85687 - 85748
Alignment:
Q  420 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccac 481  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  85687 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccac 85748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University