View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1583_high_27 (Length: 315)

Name: NF1583_high_27
Description: NF1583
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1583_high_27
NF1583_high_27
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (18-277)||(37984-38243)
scaffold0134 (29-147)||(38307-38425)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (18-277)||(456484-456743)
chr7 (18-277)||(27217023-27217282)
chr7 (18-277)||(16232683-16232942)
chr7 (18-277)||(41523080-41523339)
chr7 (18-277)||(41525542-41525801)
chr7 (32-277)||(11393041-11393286)
chr7 (18-277)||(15376454-15376712)
chr7 (18-277)||(20384864-20385122)
chr7 (18-276)||(14948863-14949120)
chr7 (18-276)||(16410223-16410480)
chr7 (18-277)||(32125654-32125912)
chr7 (18-273)||(13869515-13869770)
chr7 (20-277)||(21189338-21189594)
chr7 (18-277)||(11303410-11303669)
chr7 (18-277)||(18640435-18640693)
chr7 (18-277)||(18627729-18627987)
chr7 (18-277)||(24702401-24702650)
chr7 (18-277)||(24704848-24705097)
chr7 (21-276)||(18430876-18431130)
chr7 (18-285)||(16108429-16108696)
chr7 (18-275)||(16213849-16214106)
chr7 (18-285)||(23664693-23664960)
chr7 (18-277)||(26355722-26355982)
chr7 (18-277)||(26358174-26358434)
chr7 (18-285)||(29796763-29797032)
chr7 (18-285)||(29800582-29800851)
chr7 (17-230)||(8940489-8940706)
chr7 (18-230)||(14269697-14269909)
chr7 (18-230)||(15081582-15081794)
chr7 (18-230)||(8468945-8469157)
chr7 (18-233)||(11972755-11972970)
chr7 (17-228)||(45847394-45847605)
chr7 (154-297)||(14269939-14270081)
chr7 (48-220)||(13841274-13841446)
chr7 (154-277)||(11972659-11972781)
chr7 (189-297)||(8468783-8468891)
chr7 (154-290)||(8940322-8940459)
chr7 (154-289)||(38898105-38898241)
chr7 (154-277)||(15081824-15081948)
chr7 (18-147)||(38897775-38897904)
chr7 (192-277)||(13841175-13841260)
chr7 (18-147)||(16214170-16214299)
chr7 (20-147)||(10501136-10501263)
chr7 (154-257)||(45847637-45847739)
chr7 (18-147)||(8940769-8940897)
chr7 (18-147)||(14156626-14156755)
chr7 (18-147)||(14269311-14269440)
chr7 (18-146)||(1856970-1857097)
chr7 (18-146)||(25926870-25926998)
chr7 (42-147)||(14156839-14156944)
chr7 (18-147)||(21189143-21189272)
chr7 (18-141)||(15081389-15081512)
chr7 (18-147)||(8940962-8941091)
chr7 (18-146)||(13918143-13918272)
chr7 (18-114)||(10500968-10501064)
chr7 (150-230)||(38897995-38898075)
chr7 (18-147)||(14269504-14269633)
chr7 (65-147)||(45847249-45847331)
chr7 (18-147)||(17985125-17985254)
chr7 (60-148)||(11310239-11310327)
chr7 (248-300)||(14157110-14157162)
chr7 (248-294)||(16998661-16998707)
chr7 (248-297)||(10501429-10501478)
chr7 (248-297)||(32301353-32301402)
chr7 (231-295)||(25927238-25927301)
chr7 (248-290)||(14273587-14273629)
chr7 (29-147)||(15376272-15376390)
chr7 (248-290)||(15720068-15720110)
chr7 (29-147)||(20384682-20384800)
chr7 (248-290)||(46580681-46580723)
chr7 (150-235)||(13745563-13745648)
chr7 (248-297)||(42462015-42462064)
chr7 (250-290)||(16460773-16460813)
chr7 (155-230)||(15119918-15119993)
chr7 (108-147)||(16410544-16410583)
chr7 (250-289)||(18203887-18203926)
chr7 (108-147)||(18628051-18628090)
chr7 (108-147)||(18640757-18640796)
chr7 (108-147)||(26355619-26355658)
chr7 (108-147)||(26358071-26358110)
chr7 (248-290)||(11661345-11661387)
chr7 (29-115)||(16202766-16202852)
chr7 (252-290)||(16579831-16579869)
chr7 (252-290)||(16585794-16585832)
chr7 (18-56)||(20110741-20110779)
chr7 (248-290)||(38519445-38519487)
chr7 (58-127)||(125965-126034)
chr7 (252-289)||(130827-130864)
chr7 (250-295)||(1858839-1858884)
chr7 (252-297)||(16008610-16008655)
chr7 (250-295)||(18279375-18279420)
chr7 (250-295)||(18283338-18283383)
chr7 (252-297)||(20619446-20619491)
chr7 (250-295)||(45170095-45170140)
chr7 (250-290)||(14258523-14258563)
chr7 (261-297)||(15113009-15113045)
chr7 (18-50)||(23461832-23461864)
chr7 (79-147)||(27217346-27217414)
chr7 (156-220)||(38294567-38294631)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (18-277)||(45606647-45606906)
chr3 (18-277)||(7781087-7781346)
chr3 (18-277)||(17463341-17463599)
chr3 (18-276)||(34159490-34159747)
chr3 (18-276)||(55476655-55476912)
chr3 (18-273)||(53301244-53301499)
chr3 (18-277)||(6468875-6469133)
chr3 (18-277)||(15977696-15977954)
chr3 (18-277)||(13544188-13544445)
chr3 (18-276)||(16454021-16454279)
chr3 (18-273)||(27165419-27165674)
chr3 (18-277)||(12567723-12567981)
chr3 (18-285)||(54520977-54521244)
chr3 (18-256)||(46822445-46822683)
chr3 (18-273)||(8499687-8499942)
chr3 (18-273)||(15412598-15412853)
chr3 (18-276)||(13153996-13154253)
chr3 (18-277)||(10247464-10247722)
chr3 (18-276)||(28848362-28848609)
chr3 (18-276)||(13151531-13151788)
chr3 (18-257)||(10557091-10557330)
chr3 (18-285)||(29544582-29544849)
chr3 (18-230)||(12119394-12119606)
chr3 (64-270)||(12305315-12305521)
chr3 (18-219)||(13436520-13436721)
chr3 (18-206)||(24513910-24514098)
chr3 (18-233)||(38961578-38961794)
chr3 (18-233)||(41124146-41124361)
chr3 (18-187)||(16282498-16282667)
chr3 (18-220)||(25237063-25237265)
chr3 (153-277)||(9707482-9707606)
chr3 (154-277)||(16282688-16282810)
chr3 (18-233)||(17444504-17444719)
chr3 (154-277)||(8899257-8899379)
chr3 (154-277)||(41124050-41124172)
chr3 (18-164)||(20629932-20630078)
chr3 (18-220)||(25229476-25229678)
chr3 (154-277)||(38961768-38961890)
chr3 (154-290)||(11913927-11914064)
chr3 (18-146)||(15465448-15465576)
chr3 (18-153)||(10379614-10379749)
chr3 (18-147)||(27165738-27165867)
chr3 (18-144)||(8500009-8500135)
chr3 (18-147)||(14567432-14567561)
chr3 (18-147)||(38961385-38961514)
chr3 (18-147)||(41124425-41124554)
chr3 (18-147)||(53301051-53301180)
chr3 (18-147)||(55319044-55319173)
chr3 (21-147)||(55318854-55318980)
chr3 (18-147)||(10557394-10557523)
chr3 (18-147)||(46822747-46822876)
chr3 (18-146)||(26055005-26055133)
chr3 (18-147)||(13937520-13937649)
chr3 (154-235)||(17444693-17444773)
chr3 (26-148)||(36528447-36528569)
chr3 (18-146)||(5223677-5223805)
chr3 (18-147)||(16282305-16282434)
chr3 (18-147)||(20629739-20629868)
chr3 (37-147)||(16358234-16358344)
chr3 (154-222)||(25237009-25237076)
chr3 (42-148)||(3264325-3264431)
chr3 (18-147)||(17444311-17444440)
chr3 (18-147)||(17393201-17393330)
chr3 (83-147)||(15007988-15008052)
chr3 (237-277)||(17446614-17446654)
chr3 (231-268)||(15977663-15977700)
chr3 (248-300)||(16643234-16643286)
chr3 (248-300)||(54876393-54876445)
chr3 (248-290)||(324307-324349)
chr3 (248-290)||(14966241-14966283)
chr3 (248-290)||(21837497-21837539)
chr3 (29-147)||(34159811-34159929)
chr3 (248-290)||(52989728-52989770)
chr3 (248-297)||(3265021-3265070)
chr3 (250-295)||(11854708-11854753)
chr3 (248-297)||(36527809-36527858)
chr3 (250-290)||(10542440-10542480)
chr3 (250-290)||(14670995-14671035)
chr3 (79-147)||(17463663-17463731)
chr3 (59-127)||(30152450-30152518)
chr3 (108-147)||(55476976-55477015)
chr3 (248-290)||(10834109-10834151)
chr3 (17-71)||(15007868-15007922)
chr3 (156-214)||(15025934-15025992)
chr3 (156-230)||(25201323-25201397)
chr3 (250-295)||(5223371-5223416)
chr3 (250-295)||(12339773-12339818)
chr3 (250-295)||(15465142-15465187)
chr3 (250-295)||(15964944-15964989)
chr3 (250-295)||(15968868-15968913)
chr3 (250-295)||(15972792-15972837)
chr3 (58-127)||(25058298-25058367)
chr3 (250-295)||(37439725-37439770)
chr3 (58-127)||(49231768-49231837)
chr3 (250-290)||(14179443-14179483)
chr3 (250-290)||(14682494-14682534)
chr3 (250-290)||(19775745-19775785)
chr3 (252-300)||(28194754-28194802)
chr3 (18-54)||(36528348-36528384)
chr3 (250-290)||(43889634-43889674)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (18-277)||(39682476-39682735)
chr2 (18-277)||(571560-571819)
chr2 (18-277)||(18809106-18809364)
chr2 (18-277)||(23711754-23712012)
chr2 (18-276)||(23131026-23131284)
chr2 (18-276)||(23133493-23133751)
chr2 (18-276)||(34402262-34402520)
chr2 (18-277)||(28577262-28577520)
chr2 (19-277)||(32039240-32039497)
chr2 (18-276)||(26505543-26505800)
chr2 (18-276)||(26508021-26508278)
chr2 (18-277)||(20261382-20261641)
chr2 (18-277)||(23709273-23709531)
chr2 (18-276)||(24897936-24898193)
chr2 (18-276)||(24905373-24905630)
chr2 (18-276)||(24900419-24900676)
chr2 (18-276)||(24902896-24903153)
chr2 (18-276)||(24907848-24908105)
chr2 (17-276)||(23135754-23136002)
chr2 (18-285)||(10684503-10684772)
chr2 (17-241)||(24529286-24529510)
chr2 (17-277)||(32214670-32214920)
chr2 (18-230)||(23706957-23707169)
chr2 (18-230)||(24918350-24918562)
chr2 (42-256)||(25616365-25616579)
chr2 (18-230)||(24671235-24671447)
chr2 (18-230)||(24642489-24642701)
chr2 (18-230)||(24681654-24681866)
chr2 (18-214)||(45027645-45027840)
chr2 (18-233)||(22105672-22105887)
chr2 (18-230)||(38967689-38967901)
chr2 (18-233)||(24368033-24368248)
chr2 (21-233)||(6726254-6726466)
chr2 (18-233)||(21154748-21154963)
chr2 (18-233)||(41523813-41524028)
chr2 (154-277)||(6726158-6726280)
chr2 (154-277)||(21154937-21155059)
chr2 (154-277)||(22105576-22105698)
chr2 (154-277)||(24367937-24368059)
chr2 (154-272)||(38967542-38967659)
chr2 (154-290)||(23707199-23707336)
chr2 (154-290)||(24918183-24918320)
chr2 (18-147)||(24529094-24529223)
chr2 (158-290)||(24671068-24671201)
chr2 (154-290)||(24681487-24681624)
chr2 (154-277)||(24642731-24642855)
chr2 (18-147)||(6726533-6726662)
chr2 (18-147)||(21154555-21154684)
chr2 (18-147)||(24918626-24918755)
chr2 (18-147)||(41523620-41523749)
chr2 (18-125)||(23931775-23931882)
chr2 (20-147)||(24368312-24368439)
chr2 (17-147)||(22105951-22106081)
chr2 (18-143)||(41523427-41523552)
chr2 (18-147)||(23709080-23709209)
chr2 (18-147)||(21154362-21154491)
chr2 (18-147)||(24681930-24682059)
chr2 (18-145)||(45027452-45027579)
chr2 (18-147)||(23706573-23706702)
chr2 (18-147)||(24671511-24671640)
chr2 (17-145)||(32214476-32214604)
chr2 (18-144)||(23931949-23932075)
chr2 (208-277)||(45029784-45029853)
chr2 (18-142)||(23706765-23706889)
chr2 (82-146)||(31345490-31345554)
chr2 (248-293)||(18358739-18358784)
chr2 (248-294)||(34874218-34874264)
chr2 (248-300)||(27472482-27472534)
chr2 (154-198)||(41524002-41524045)
chr2 (57-127)||(67339-67409)
chr2 (29-147)||(18809428-18809546)
chr2 (156-230)||(21368365-21368439)
chr2 (79-147)||(23711622-23711690)
chr2 (95-147)||(24642373-24642425)
chr2 (79-147)||(26505864-26505932)
chr2 (79-147)||(26508342-26508410)
chr2 (79-147)||(27920373-27920441)
chr2 (79-147)||(32039107-32039175)
chr2 (231-290)||(9784754-9784813)
chr2 (108-147)||(23131347-23131386)
chr2 (250-289)||(23287438-23287477)
chr2 (108-147)||(34402160-34402199)
chr2 (248-290)||(9241999-9242041)
chr2 (248-290)||(21073498-21073540)
chr2 (248-290)||(21081742-21081784)
chr2 (156-230)||(23799457-23799531)
chr2 (29-147)||(28577584-28577702)
chr2 (250-295)||(1283361-1283406)
chr2 (252-297)||(19201985-19202030)
chr2 (250-295)||(30345080-30345125)
chr2 (250-295)||(31345184-31345229)
chr2 (248-297)||(34137006-34137055)
chr2 (58-127)||(34823750-34823819)
chr2 (250-295)||(41531093-41531138)
chr2 (255-299)||(21237816-21237860)
chr2 (261-297)||(22459581-22459617)
chr2 (161-237)||(22686145-22686221)
chr2 (250-290)||(23069291-23069331)
chr2 (250-290)||(26392455-26392495)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (18-277)||(21474827-21475086)
chr1 (18-277)||(13989029-13989287)
chr1 (18-277)||(21923032-21923290)
chr1 (18-273)||(16362085-16362340)
chr1 (18-277)||(21840930-21841188)
chr1 (18-277)||(15859749-15860007)
chr1 (18-273)||(23593474-23593729)
chr1 (18-230)||(16274996-16275209)
chr1 (17-220)||(27161326-27161529)
chr1 (18-233)||(29776947-29777162)
chr1 (18-233)||(31612572-31612787)
chr1 (18-220)||(29298461-29298663)
chr1 (18-233)||(22122755-22122970)
chr1 (154-277)||(29776851-29776973)
chr1 (18-174)||(13227129-13227285)
chr1 (154-277)||(16275239-16275362)
chr1 (18-233)||(22050577-22050792)
chr1 (154-277)||(29298299-29298421)
chr1 (149-277)||(31612476-31612603)
chr1 (154-277)||(22122944-22123066)
chr1 (18-174)||(29535317-29535473)
chr1 (154-255)||(22050766-22050866)
chr1 (18-147)||(29298727-29298856)
chr1 (18-147)||(31612851-31612980)
chr1 (18-147)||(31613044-31613173)
chr1 (18-140)||(9044745-9044867)
chr1 (18-147)||(15859543-15859672)
chr1 (18-147)||(29777226-29777355)
chr1 (156-244)||(27161518-27161605)
chr1 (18-147)||(22122561-22122691)
chr1 (18-147)||(16274803-16274932)
chr1 (18-147)||(27161134-27161263)
chr1 (18-137)||(40129387-40129506)
chr1 (224-294)||(43543197-43543267)
chr1 (18-147)||(16401407-16401536)
chr1 (77-147)||(10812612-10812682)
chr1 (249-300)||(51326855-51326906)
chr1 (248-294)||(27653228-27653274)
chr1 (18-72)||(43543269-43543323)
chr1 (248-290)||(13881387-13881429)
chr1 (29-147)||(13989351-13989469)
chr1 (154-220)||(29298408-29298474)
chr1 (58-118)||(16655942-16656002)
chr1 (248-300)||(28312577-28312629)
chr1 (231-290)||(41781577-41781636)
chr1 (248-290)||(14800602-14800644)
chr1 (248-290)||(14809476-14809518)
chr1 (250-295)||(1925218-1925263)
chr1 (250-295)||(20924232-20924277)
chr1 (250-295)||(23819387-23819432)
chr1 (231-290)||(20437979-20438041)
chr1 (250-290)||(21533880-21533920)
chr1 (250-290)||(22124358-22124398)
chr1 (248-288)||(52940883-52940923)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (18-277)||(20910-21169)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (18-277)||(14110-14369)
scaffold0230 (18-231)||(23271-23484)
scaffold0230 (17-147)||(22917-23047)
scaffold0230 (65-147)||(23125-23207)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (18-277)||(8055192-8055451)
chr6 (18-277)||(1540652-1540910)
chr6 (18-277)||(24422710-24422968)
chr6 (18-277)||(33861957-33862215)
chr6 (18-277)||(33864441-33864699)
chr6 (18-276)||(18334333-18334590)
chr6 (18-277)||(12742480-12742739)
chr6 (18-276)||(2290921-2291178)
chr6 (18-277)||(22782390-22782648)
chr6 (18-276)||(26924381-26924638)
chr6 (18-277)||(30676450-30676709)
chr6 (18-277)||(34963536-34963795)
chr6 (18-277)||(19858663-19858918)
chr6 (18-277)||(25688665-25688924)
chr6 (17-241)||(19847711-19847931)
chr6 (18-285)||(28289077-28289342)
chr6 (18-244)||(17377588-17377814)
chr6 (18-231)||(1598266-1598478)
chr6 (65-277)||(12942364-12942576)
chr6 (18-256)||(23992604-23992844)
chr6 (18-230)||(18914142-18914354)
chr6 (18-230)||(31630281-31630493)
chr6 (18-206)||(25535641-25535829)
chr6 (18-230)||(19005361-19005573)
chr6 (154-277)||(19005209-19005331)
chr6 (154-273)||(18913994-18914112)
chr6 (154-294)||(15875452-15875591)
chr6 (154-257)||(31630523-31630626)
chr6 (18-143)||(18914615-18914740)
chr6 (18-147)||(1905-2034)
chr6 (18-147)||(8864-8993)
chr6 (18-147)||(19005637-19005766)
chr6 (21-147)||(1598542-1598668)
chr6 (29-143)||(26924199-26924313)
chr6 (172-277)||(25656792-25656897)
chr6 (18-146)||(23415258-23415386)
chr6 (17-147)||(112-242)
chr6 (17-147)||(25688988-25689118)
chr6 (204-273)||(18937252-18937321)
chr6 (18-147)||(19847519-19847648)
chr6 (107-230)||(15875621-15875734)
chr6 (18-146)||(27557016-27557144)
chr6 (18-147)||(1598735-1598864)
chr6 (18-143)||(18914422-18914547)
chr6 (18-147)||(25689181-25689310)
chr6 (18-147)||(30676257-30676386)
chr6 (20-127)||(31630090-31630197)
chr6 (18-100)||(15892149-15892231)
chr6 (28-147)||(25737128-25737247)
chr6 (226-277)||(1595712-1595763)
chr6 (57-147)||(22981326-22981416)
chr6 (57-147)||(23806992-23807082)
chr6 (18-85)||(17883238-17883305)
chr6 (248-294)||(14979393-14979439)
chr6 (29-147)||(18334151-18334269)
chr6 (29-147)||(24423032-24423150)
chr6 (248-290)||(25619728-25619770)
chr6 (243-289)||(33443122-33443168)
chr6 (79-147)||(33864763-33864831)
chr6 (248-290)||(18453255-18453297)
chr6 (248-290)||(23838247-23838289)
chr6 (248-290)||(28103904-28103946)
chr6 (250-300)||(31477899-31477949)
chr6 (156-230)||(35056707-35056781)
chr6 (250-295)||(16760267-16760312)
chr6 (250-295)||(22949080-22949125)
chr6 (250-295)||(22953036-22953081)
chr6 (250-295)||(23414952-23414997)
chr6 (250-295)||(23871524-23871569)
chr6 (250-295)||(23875480-23875525)
chr6 (250-290)||(15705451-15705491)
chr6 (251-295)||(18955853-18955897)
chr6 (250-290)||(20136743-20136783)
chr6 (250-290)||(22196086-22196126)
chr6 (18-54)||(25737028-25737064)
chr6 (79-147)||(26924056-26924124)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (18-276)||(13556-13814)
scaffold0444 (106-147)||(13878-13919)
[»] chr8 (88 HSPs)
chr8 (18-277)||(1484565-1484823)
chr8 (18-277)||(14409185-14409443)
chr8 (18-277)||(5853033-5853291)
chr8 (18-276)||(4483444-4483702)
chr8 (18-277)||(24485784-24486043)
chr8 (18-277)||(20045936-20046194)
chr8 (18-276)||(22001917-22002174)
chr8 (18-276)||(4542114-4542371)
chr8 (18-273)||(15070727-15070982)
chr8 (18-277)||(16413056-16413315)
chr8 (18-277)||(14823936-14824196)
chr8 (18-257)||(27472157-27472395)
chr8 (18-256)||(32121912-32122150)
chr8 (18-256)||(18677805-18678043)
chr8 (18-228)||(16401665-16401875)
chr8 (18-230)||(38549745-38549957)
chr8 (18-219)||(25657893-25658094)
chr8 (18-219)||(16198115-16198316)
chr8 (18-230)||(1326672-1326884)
chr8 (18-210)||(24048841-24049032)
chr8 (18-233)||(15202919-15203134)
chr8 (18-233)||(20403486-20403701)
chr8 (18-230)||(19936648-19936850)
chr8 (21-233)||(45290385-45290597)
chr8 (18-237)||(19896524-19896743)
chr8 (154-277)||(20403390-20403512)
chr8 (154-277)||(32810094-32810216)
chr8 (154-276)||(45290571-45290692)
chr8 (154-277)||(15203108-15203230)
chr8 (154-277)||(19896431-19896554)
chr8 (154-294)||(1326914-1327059)
chr8 (154-257)||(38549987-38550090)
chr8 (17-147)||(19896807-19896937)
chr8 (18-147)||(20403765-20403894)
chr8 (18-148)||(15202726-15202856)
chr8 (18-146)||(14397481-14397609)
chr8 (156-277)||(19936882-19937004)
chr8 (17-147)||(27471963-27472093)
chr8 (18-147)||(15071046-15071175)
chr8 (18-147)||(32122214-32122343)
chr8 (18-147)||(38549552-38549681)
chr8 (154-257)||(20982603-20982710)
chr8 (26-147)||(16401287-16401408)
chr8 (154-290)||(16401907-16402050)
chr8 (17-147)||(19897000-19897130)
chr8 (17-119)||(45290287-45290389)
chr8 (18-147)||(15202533-15202662)
chr8 (21-147)||(16412866-16412992)
chr8 (18-147)||(16401472-16401601)
chr8 (18-147)||(38549360-38549488)
chr8 (18-139)||(24049104-24049225)
chr8 (154-230)||(13425335-13425411)
chr8 (155-230)||(20982498-20982573)
chr8 (18-147)||(19936455-19936584)
chr8 (166-230)||(13425241-13425305)
chr8 (18-115)||(11361034-11361131)
chr8 (29-127)||(24717722-24717820)
chr8 (231-285)||(35026849-35026903)
chr8 (57-127)||(39114415-39114485)
chr8 (248-300)||(19808368-19808420)
chr8 (248-296)||(22238025-22238073)
chr8 (159-230)||(21513636-21513707)
chr8 (18-73)||(32810263-32810318)
chr8 (29-147)||(1484887-1485005)
chr8 (231-285)||(2418860-2418914)
chr8 (156-230)||(18815609-18815683)
chr8 (248-290)||(23409868-23409910)
chr8 (248-290)||(23659480-23659522)
chr8 (58-147)||(20045783-20045872)
chr8 (58-127)||(29759429-29759498)
chr8 (79-147)||(5852901-5852969)
chr8 (248-288)||(14103230-14103270)
chr8 (79-147)||(14409053-14409121)
chr8 (248-296)||(17461058-17461106)
chr8 (248-290)||(17086159-17086201)
chr8 (235-285)||(22419405-22419455)
chr8 (156-230)||(36733302-36733376)
chr8 (156-230)||(38988730-38988804)
chr8 (156-230)||(39019827-39019901)
chr8 (58-127)||(13663129-13663198)
chr8 (252-297)||(17438227-17438272)
chr8 (250-295)||(18862734-18862779)
chr8 (250-295)||(21410922-21410967)
chr8 (250-295)||(21805414-21805459)
chr8 (250-295)||(21828103-21828148)
chr8 (58-127)||(22007126-22007195)
chr8 (253-290)||(23914110-23914147)
chr8 (250-295)||(25363210-25363255)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (18-277)||(15118093-15118351)
chr4 (18-276)||(44615452-44615710)
chr4 (18-276)||(50222080-50222337)
chr4 (18-277)||(15534344-15534603)
chr4 (18-277)||(14970447-14970706)
chr4 (17-277)||(3515170-3515430)
chr4 (18-285)||(36038025-36038292)
chr4 (18-285)||(49547514-49547781)
chr4 (18-277)||(44772824-44773086)
chr4 (18-285)||(14048732-14048999)
chr4 (18-223)||(29267570-29267775)
chr4 (18-258)||(19242882-19243122)
chr4 (18-276)||(1837260-1837507)
chr4 (18-230)||(52872813-52873025)
chr4 (18-277)||(7640927-7641191)
chr4 (17-230)||(362390-362603)
chr4 (20-230)||(19617809-19618019)
chr4 (18-230)||(15495914-15496126)
chr4 (18-230)||(14746252-14746464)
chr4 (17-230)||(19857798-19858001)
chr4 (18-187)||(11995-12164)
chr4 (18-233)||(52312769-52312983)
chr4 (108-276)||(18239250-18239417)
chr4 (154-294)||(15496948-15497087)
chr4 (154-297)||(52873055-52873197)
chr4 (154-277)||(12184-12306)
chr4 (154-277)||(15355201-15355323)
chr4 (154-277)||(18215151-18215273)
chr4 (154-277)||(52312673-52312795)
chr4 (154-277)||(19618049-19618171)
chr4 (101-230)||(18214992-18215121)
chr4 (154-290)||(14746494-14746631)
chr4 (18-147)||(18214751-18214880)
chr4 (18-147)||(362859-362988)
chr4 (17-147)||(52872619-52872749)
chr4 (18-147)||(3515493-3515622)
chr4 (18-147)||(52313240-52313369)
chr4 (130-230)||(15355071-15355171)
chr4 (18-145)||(362668-362795)
chr4 (37-147)||(14185621-14185731)
chr4 (18-147)||(14970254-14970383)
chr4 (18-147)||(15495721-15495850)
chr4 (18-147)||(19617614-19617743)
chr4 (18-147)||(19858064-19858193)
chr4 (18-147)||(52313047-52313176)
chr4 (18-147)||(14746059-14746188)
chr4 (154-237)||(19857685-19857768)
chr4 (189-257)||(362268-362336)
chr4 (225-300)||(19857584-19857659)
chr4 (17-166)||(30147189-30147338)
chr4 (29-147)||(22725284-22725401)
chr4 (77-143)||(14745925-14745991)
chr4 (30-127)||(14951270-14951367)
chr4 (248-290)||(10056711-10056753)
chr4 (29-147)||(15117911-15118029)
chr4 (248-290)||(24047305-24047347)
chr4 (18-54)||(12778423-12778459)
chr4 (248-288)||(16043087-16043127)
chr4 (57-125)||(55377225-55377293)
chr4 (248-303)||(40907131-40907186)
chr4 (248-290)||(18212805-18212847)
chr4 (248-290)||(32307001-32307043)
chr4 (250-295)||(10712828-10712873)
chr4 (250-295)||(10926598-10926643)
chr4 (250-295)||(12487683-12487728)
chr4 (248-297)||(14185045-14185094)
chr4 (250-295)||(14954256-14954301)
chr4 (58-127)||(14995644-14995713)
chr4 (250-295)||(25689842-25689887)
chr4 (250-295)||(27533998-27534043)
chr4 (250-303)||(40906974-40907027)
chr4 (110-147)||(44772723-44772760)
chr4 (250-290)||(17048142-17048182)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (18-277)||(6110-6368)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (18-277)||(94574-94832)
scaffold0023 (18-276)||(17180-17438)
scaffold0023 (35-147)||(17004-17116)
scaffold0023 (29-147)||(94896-95014)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (18-276)||(20909176-20909433)
chr5 (18-277)||(264509-264767)
chr5 (18-273)||(38619603-38619858)
chr5 (18-277)||(39245299-39245557)
chr5 (18-276)||(10732681-10732938)
chr5 (18-276)||(42245106-42245363)
chr5 (18-276)||(39363548-39363806)
chr5 (18-256)||(17516904-17517142)
chr5 (18-273)||(23064680-23064935)
chr5 (18-277)||(29346143-29346401)
chr5 (18-277)||(29348616-29348874)
chr5 (18-277)||(29351089-29351347)
chr5 (18-285)||(37804643-37804910)
chr5 (18-241)||(2154372-2154595)
chr5 (18-285)||(9776513-9776780)
chr5 (18-230)||(20901661-20901873)
chr5 (18-233)||(32027652-32027867)
chr5 (18-220)||(20917587-20917789)
chr5 (18-233)||(29330190-29330404)
chr5 (154-277)||(32027556-32027678)
chr5 (154-277)||(20917829-20917951)
chr5 (154-277)||(29330097-29330216)
chr5 (154-241)||(20901903-20901990)
chr5 (17-147)||(17516517-17516647)
chr5 (18-147)||(32028124-32028254)
chr5 (18-147)||(20901468-20901597)
chr5 (17-147)||(32028511-32028641)
chr5 (22-147)||(295826-295951)
chr5 (18-147)||(29330468-29330597)
chr5 (18-147)||(296015-296144)
chr5 (18-147)||(17516711-17516840)
chr5 (18-147)||(20917394-20917523)
chr5 (18-147)||(2154179-2154308)
chr5 (18-147)||(32028318-32028447)
chr5 (18-147)||(32027931-32028060)
chr5 (248-294)||(6765897-6765943)
chr5 (72-147)||(264370-264445)
chr5 (159-230)||(18743965-18744036)
chr5 (57-127)||(27183208-27183278)
chr5 (79-147)||(20909497-20909565)
chr5 (250-290)||(22107442-22107482)
chr5 (58-118)||(28901495-28901555)
chr5 (58-118)||(28937890-28937950)
chr5 (250-290)||(30138936-30138976)
chr5 (154-233)||(20917776-20917855)
chr5 (108-147)||(39245621-39245660)
chr5 (108-147)||(39363869-39363908)
chr5 (156-230)||(1628169-1628243)
chr5 (57-127)||(23506503-23506573)
chr5 (58-127)||(1220384-1220453)
chr5 (58-127)||(10778832-10778901)
chr5 (250-295)||(18356264-18356309)
chr5 (250-295)||(20910924-20910969)
chr5 (252-297)||(42960608-42960653)
chr5 (250-290)||(10753341-10753381)
chr5 (158-230)||(21399896-21399968)
chr5 (237-289)||(25743796-25743848)
chr5 (250-290)||(26740653-26740693)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (18-276)||(134375-134632)
scaffold0028 (18-276)||(136844-137101)
scaffold0028 (18-276)||(139313-139570)
scaffold0028 (18-276)||(141782-142039)
scaffold0028 (18-276)||(144251-144508)
scaffold0028 (250-295)||(58808-58853)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (18-276)||(40564-40821)
scaffold0044 (106-147)||(40885-40926)
scaffold0044 (18-127)||(37860-37968)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (18-285)||(3178-3445)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (18-277)||(9405-9663)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (18-297)||(4043-4324)
scaffold0741 (18-143)||(3657-3782)
scaffold0741 (18-147)||(3850-3979)
scaffold0741 (95-147)||(3541-3593)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (13-290)||(53607-53886)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (18-277)||(4857-5116)
scaffold0716 (18-147)||(5180-5309)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (20-290)||(15070-15342)
scaffold0306 (18-187)||(11080-11249)
scaffold0306 (18-147)||(10887-11016)
scaffold0306 (18-147)||(15398-15526)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (37-285)||(1583-1831)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (18-290)||(6676-6950)
scaffold0317 (18-147)||(6483-6612)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-277)||(11451-11712)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (18-273)||(38396-38651)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (18-231)||(416-629)
scaffold1792 (17-147)||(853-983)
scaffold1792 (65-147)||(693-775)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (70-277)||(10936-11142)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (20-230)||(10001-10211)
scaffold0043 (18-147)||(10277-10406)
scaffold0043 (18-147)||(10470-10599)
scaffold0043 (154-187)||(9938-9971)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (21-230)||(267-476)
scaffold0494 (154-230)||(506-582)
scaffold0494 (223-277)||(12194-12248)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (18-230)||(30229-30441)
scaffold0149 (157-241)||(30112-30196)
scaffold0149 (18-147)||(30505-30634)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (30-222)||(13379-13571)
scaffold0040 (20-177)||(43002-43159)
scaffold0040 (18-147)||(43225-43354)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (23-230)||(799-1006)
scaffold0747 (154-290)||(632-769)
scaffold0747 (18-147)||(1075-1204)
scaffold0747 (18-117)||(1225-1323)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (18-277)||(501247-501486)
scaffold0001 (21-147)||(501550-501676)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (18-219)||(6682-6873)
scaffold0574 (18-147)||(6937-7066)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (18-183)||(7996-8161)
scaffold0278 (21-147)||(8225-8351)
scaffold0278 (18-144)||(8421-8547)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (57-213)||(57708-57864)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (154-297)||(10764-10906)
scaffold0513 (143-230)||(10647-10734)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (154-271)||(27958-28074)
scaffold0114 (91-233)||(28048-28190)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (17-174)||(68227-68384)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (154-290)||(15149-15286)
scaffold0106 (131-230)||(15030-15119)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (167-294)||(35955-36082)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (18-147)||(1740-1869)
scaffold1296 (17-54)||(1640-1677)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (18-146)||(31497-31625)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (18-147)||(8311-8440)
scaffold0436 (248-297)||(8097-8146)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (154-290)||(1203-1340)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (21-147)||(36749-36875)
scaffold0151 (17-147)||(36938-37068)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (18-147)||(18423-18552)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (18-146)||(7430-7558)
scaffold0711 (23-147)||(7243-7367)
scaffold0711 (57-145)||(7084-7172)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (18-146)||(17947-18075)
scaffold0200 (250-295)||(17641-17686)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (18-146)||(33465-33593)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (154-239)||(9932-10017)
scaffold0145 (157-219)||(10005-10067)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (18-146)||(39626-39754)
scaffold0117 (250-295)||(39320-39365)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (18-146)||(19829-19957)
scaffold0293 (248-290)||(17575-17617)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (31-139)||(113317-113425)
scaffold0014 (250-289)||(206531-206570)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (248-294)||(85614-85660)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-127)||(6196-6305)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (248-297)||(24603-24652)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (248-296)||(15809-15857)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (248-290)||(10090-10132)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (248-290)||(169755-169797)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (18-127)||(8566-8675)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (248-297)||(225-274)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (17-54)||(75644-75681)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (250-290)||(6167-6207)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (250-290)||(15073-15113)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (248-288)||(667-707)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (156-235)||(15282-15361)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (157-220)||(16263-16326)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (250-297)||(120074-120121)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (250-300)||(915-965)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (248-290)||(6947-6989)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (248-290)||(1967-2009)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (59-125)||(15780-15846)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (248-290)||(1880-1922)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (248-290)||(221212-221254)
scaffold0012 (250-295)||(189466-189511)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (58-127)||(6970-7039)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (248-297)||(10539-10588)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (250-295)||(367-412)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (250-295)||(11590-11635)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (18-127)||(28469-28578)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (250-295)||(32749-32794)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (250-295)||(36031-36076)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (250-295)||(80424-80469)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (250-295)||(36175-36220)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (248-297)||(713-762)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (250-290)||(6684-6724)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (250-290)||(21239-21279)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (250-290)||(75836-75876)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (248-280)||(67343-67375)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (250-290)||(20823-20863)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (250-290)||(126028-126068)


Alignment Details
Target: scaffold0134 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38243 - 37984
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38243 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 38144  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38143 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 38044  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38043 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 37984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 456743 - 456484
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 456644  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456643 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 456544  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456543 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 456484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27217282 - 27217023
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217282 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 27217183  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217182 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 27217083  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217082 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 27217023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16232942 - 16232683
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattg 16232843  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232842 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 16232743  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232742 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 16232683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41523339 - 41523080
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523339 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41523240  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523239 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 41523140  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523139 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 41523080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41525801 - 41525542
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525801 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41525702  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525701 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 41525602  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525601 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 41525542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393286
Alignment:
Q  32 gtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaac 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  132 gtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T
Q  232 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393241 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 11393286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 15376454 - 15376712
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15376454 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15376553  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376554 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15376652  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376653 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15376712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 20384864 - 20385122
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20384864 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20384963  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20385062  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385063 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 20385122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 14948863 - 14949120
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  14948863 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 14948962  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948963 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14949061  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949062 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 14949120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16410480 - 16410223
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16410480 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 16410381  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410380 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 16410282  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410281 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 16410223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32125912 - 32125654
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  32125912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 32125813  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 32125714  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125713 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 32125654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13869770 - 13869515
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13869770 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13869671  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869670 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13869571  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13869570 gaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 13869515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 21189338 - 21189594
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21189338 ttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc 21189437  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189438 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 21189536  T
Q  220 agtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189537 agtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 21189594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11303669 - 11303410
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303669 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 11303570  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11303569 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 11303470  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11303469 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 11303410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18640693 - 18640435
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18640693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18640594  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18640593 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 18640495  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18640494 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatat 18640435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18627987 - 18627729
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18627987 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18627888  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18627887 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgat 18627789  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18627788 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatat 18627729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24702650 - 24702401
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24702650 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24702551  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702550 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24702461  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702460 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 24702401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24705097 - 24704848
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24705097 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24704998  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704997 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24704908  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704907 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 24704848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18431130 - 18430876
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18431130 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 18431031  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431030 aattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 18430932  T
Q  221 gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430931 gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 18430876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 16108429 - 16108696
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16108429 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16108528  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16108529 tcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgat 16108628  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  16108629 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatatcttgagat 16108696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16214106 - 16213849
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16214106 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16214007  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16214006 tcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16213907  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  16213906 gaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttat 16213849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 23664693 - 23664960
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23664693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23664792  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23664793 tcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 23664892  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  23664893 gaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 26355722 - 26355982
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26355722 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26355821  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26355822 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgat 26355920  T
Q  218 gaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26355921 gaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 26355982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 26358174 - 26358434
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26358174 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26358273  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26358274 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgat 26358372  T
Q  218 gaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26358373 gaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 26358434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29797032 - 29796763
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29797032 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29796933  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29796932 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 29796833  T
Q  218 gaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  29796832 gaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29800851 - 29800582
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29800851 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29800752  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29800751 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 29800652  T
Q  218 gaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  29800651 gaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29800582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8940706 - 8940489
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacac----ggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8940706 aaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 8940607  T
Q  113 tatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatga 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  8940606 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatga 8940507  T
Q  213 ttgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8940506 ttgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 14269697 - 14269909
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14269697 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatgg 14269796  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14269797 tcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 14269896  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  14269897 gaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 15081582 - 15081794
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15081582 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15081681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15081682 tcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 15081781  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  15081782 gaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8469157 - 8468945
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8469157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 8469058  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8469057 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgat 8468958  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    ||| |||||||||    
T  8468957 gaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11972970 - 11972755
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  11972970 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatag 11972871  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  11972870 tcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 11972771  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  11972770 gaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 45847394 - 45847605
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45847394 aaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 45847493  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45847494 gtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattga 45847593  T
Q  217 tgaagtgttata 228  Q
    ||||||||||||    
T  45847594 tgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 14269939 - 14270081
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269939 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 14270037  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14270038 gattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 14270081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  48 taggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  148 aattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11972781 - 11972659
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11972781 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatatt 11972683  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11972682 gattattatttgatgttgttatat 11972659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468783
Alignment:
Q  189 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtt 8468792  T
Q  289 taagtgttg 297  Q
    |||||||||    
T  8468791 taagtgttg 8468783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8940459 - 8940322
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  8940459 ttatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 8940361  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8940360 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 8940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Original strand, 38898105 - 38898241
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  38898105 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 38898203  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38898204 ttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 15081824 - 15081948
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  15081824 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 15081922  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  15081923 ttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38897775 - 38897904
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38897775 aattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38897874  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38897875 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13841260 - 13841175
Alignment:
Q  192 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841260 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 13841175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16214299 - 16214170
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16214299 aattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 16214200  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16214199 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 10501136 - 10501263
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10501136 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtc 10501235  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10501236 aaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 45847637 - 45847739
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45847637 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgtt 45847735  T
Q  254 gatt 257  Q
    ||||    
T  45847736 gatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8940897 - 8940769
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8940897 aattggtcttaggtgtaaacaaa-aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8940799  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940798 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14156626 - 14156755
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  14156626 aattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatga 14156725  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  14156726 tcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14269311 - 14269440
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  14269311 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattg 14269410  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269411 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 1856970 - 1857097
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1856970 aattggtcttaggtgtaaacacg-aagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 1857068  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1857069 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 25926870 - 25926998
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  25926870 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatgg 25926969  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25926970 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Original strand, 14156839 - 14156944
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14156839 aagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcaca 14156938  T
Q  142 gtgaat 147  Q
    ||||||    
T  14156939 gtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189272
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081512
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    | | ||||||| ||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8941091 - 8940962
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  8941091 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgc 8940992  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  8940991 tcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 13918143 - 13918272
Alignment:
Q  18 aattggtctt-aggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13918143 aattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 13918242  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  13918243 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Original strand, 10500968 - 10501064
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 114  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10500968 aattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  150 ttgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14269504 - 14269633
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||      
T  14269504 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatca 14269603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||| |||||| |||||||    
T  14269604 tcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 45847249 - 45847331
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45847249 tttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17985125 - 17985254
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||| |    
T  17985125 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgagttatag 17985224  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  17985225 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  60 ttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 14157110 - 14157162
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14157110 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgtct 14157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16998707 - 16998661
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998707 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtg 16998661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 10501429 - 10501478
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10501429 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttg 10501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32301402 - 32301353
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32301402 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 32301353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 25927238 - 25927301
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25927238 tatatatgatgttt-aagttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25927301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14273629 - 14273587
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14273629 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14273587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15720110 - 15720068
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15720110 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15720068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 46580681 - 46580723
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46580681 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 46580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 235
Target Start/End: Original strand, 13745563 - 13745648
Alignment:
Q  150 ttgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 235  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745563 ttgatcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42462064 - 42462015
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42462064 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 16460773 - 16460813
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16460773 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16460813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  155 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18203926 - 18203887
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18203926 tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11661387 - 11661345
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11661387 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 11661345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 115  Q
    ||||||||||   ||||||||||||   ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16579869 - 16579831
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16579869 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16579831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 290
Target Start/End: Original strand, 16585794 - 16585832
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16585794 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16585832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110741
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataa 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataa 20110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38519487 - 38519445
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38519487 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 38519445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 289
Target Start/End: Original strand, 130827 - 130864
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  130827 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 130864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 1858839 - 1858884
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1858839 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1858884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16008655 - 16008610
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16008655 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 16008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18279420 - 18279375
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18279420 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18279375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18283383 - 18283338
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18283383 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18283338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20619491 - 20619446
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20619491 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 20619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 45170095 - 45170140
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45170095 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 45170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14258563 - 14258523
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14258563 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14258523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15113045 - 15113009
Alignment:
Q  261 atttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15113045 atttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttg 15113009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 23461832 - 23461864
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtag 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23461832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27217414 - 27217346
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  27217414 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | | ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 45606647 - 45606906
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606647 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 45606746  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606747 tcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 45606846  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606847 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 45606906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 7781087 - 7781346
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7781087 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 7781186  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781187 tcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 7781286  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781287 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 7781346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17463599 - 17463341
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17463599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 17463500  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463499 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 17463401  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463400 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 17463341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34159747 - 34159490
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34159747 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 34159648  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159647 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 34159549  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159548 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 34159490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55476912 - 55476655
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  55476912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 55476813  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 55476714  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476713 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 55476655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 53301244 - 53301499
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 53301343  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301344 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgat 53301443  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  53301444 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtt 53301499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 6468875 - 6469133
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  6468875 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 6468974  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468975 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 6469073  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469074 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 6469133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15977954 - 15977696
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  15977954 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15977855  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15977756  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15977755 aaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13544445 - 13544188
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13544445 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13544346  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544345 tcaaat-actgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13544248  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13544247 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 13544188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 16454021 - 16454279
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaa-ggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||     
T  16454021 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttata 16454120  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454121 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattga 16454219  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454220 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 16454279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27165674 - 27165419
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27165674 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 27165575  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165574 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 27165475  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27165474 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 27165419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12567981 - 12567723
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  12567981 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 12567882  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567881 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 12567783  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567782 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 12567723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54521244 - 54520977
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 54521145  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54521144 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 54521045  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  54521044 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46822683 - 46822445
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46822683 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 46822584  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 46822484  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822483 gaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8499942 - 8499687
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8499942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8499843  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8499842 tgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 8499743  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8499742 gaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 8499687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15412853 - 15412598
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412853 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatgg 15412754  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412753 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15412654  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15412653 gaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 15412598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 13153996 - 13154253
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13153996 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13154095  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154096 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13154194  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154195 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 13154253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 10247464 - 10247722
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  10247464 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 10247563  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247564 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 10247662  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247663 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 10247722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 28848362 - 28848609
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  28848362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 28848461  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28848462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattttccatgattgat 28848550  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848551 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 28848609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 13151531 - 13151788
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13151531 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13151630  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13151631 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcctgat 13151729  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151730 gaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 13151788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10557330 - 10557091
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557330 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 10557231  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10557230 tcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgat 10557131  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557130 gaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 29544582 - 29544849
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29544582 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29544681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  29544682 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgat 29544781  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  29544782 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatgtcttgagat 29544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 12119394 - 12119606
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12119394 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12119493  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119494 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 12119593  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    ||||| |||||||    
T  12119594 gaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12305521 - 12305315
Alignment:
Q  64 ttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattga 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12305521 ttttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattga 12305422  T
Q  164 tgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12305421 tgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatt 12305322  T
Q  264 tgatgtt 270  Q
    |||||||    
T  12305321 tgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13436721 - 13436520
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13436721 aattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13436622  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13436621 tccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 13436522  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  13436521 ga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24514098 - 24513910
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24514098 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 24513999  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24513998 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 38961578 - 38961794
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg-ccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  38961578 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttata 38961677  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||    
T  38961678 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattga 38961777  T
Q  217 tgaagtgttatatgtat 233  Q
    |||| |  |||||||||    
T  38961778 tgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41124361 - 41124146
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41124361 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41124262  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  41124261 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 41124162  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  41124161 gaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 16282498 - 16282667
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16282498 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 16282597  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16282598 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 16282667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25237265 - 25237063
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25237265 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25237166  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  25237165 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 25237066  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  25237065 gaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 153 - 277
Target Start/End: Original strand, 9707482 - 9707606
Alignment:
Q  153 attatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707482 attatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgt 9707581  T
Q  253 tgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9707582 tgattattatttgatgttgttatat 9707606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 16282688 - 16282810
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282688 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 16282786  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16282787 gattattatttgatgttgttatat 16282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 17444504 - 17444719
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  17444504 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatag 17444603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  17444604 tcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 17444703  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  17444704 gaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8899379 - 8899257
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899379 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 8899281  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  8899280 gattatgatttgatgttgttatat 8899257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41124172 - 41124050
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124172 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 41124074  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41124073 gattattatttgatgttgttatat 41124050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 20629932 - 20630078
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629932 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20630031  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgat 164  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20630032 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25229678 - 25229476
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25229678 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25229579  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  25229578 tcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 25229479  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  25229478 gaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 38961768 - 38961890
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961768 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgtt 38961866  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  38961867 ggttattatttgatgttgttatat 38961890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 11913927 - 11914064
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  11913927 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 11914025  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11914026 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 11914064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15465576 - 15465448
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15465576 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15465477  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15465476 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10379749 - 10379614
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10379749 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 10379650  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattga 153  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10379649 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 10379614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27165867 - 27165738
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  27165867 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatag 27165768  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27165767 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8500135 - 8500009
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8500135 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8500036  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||    
T  8500035 tcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38961385 - 38961514
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38961385 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38961484  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38961485 tcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41124554 - 41124425
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  41124554 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 41124455  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124454 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 53301051 - 53301180
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53301051 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 53301150  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  53301151 tcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 55319044 - 55319173
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  55319044 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 55319143  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  55319144 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 55318854 - 55318980
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55318854 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 55318953  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55318954 aattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10557523 - 10557394
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10557523 aattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 10557424  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10557423 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46822876 - 46822747
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  46822876 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcg 46822777  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  46822776 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 26055005 - 26055133
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26055005 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 26055104  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  26055105 taaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 13937520 - 13937649
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13937520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatgg 13937619  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  13937620 tcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 17444693 - 17444773
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444693 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  26 ttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  126 ctgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5223805 - 5223677
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  5223805 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 5223706  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  5223705 tcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16282305 - 16282434
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16282305 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 16282404  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16282405 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20629739 - 20629868
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20629739 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatgg 20629838  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20629839 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  137 tcacagtgaat 147  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25237076 - 25237009
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237076 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 3264325 - 3264431
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3264325 aagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcaca 3264424  T
Q  142 gtgaata 148  Q
    |||||||    
T  3264425 gtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17444311 - 17444440
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||  ||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  17444311 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatgg 17444410  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17444411 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17393330 - 17393201
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |    
T  17393330 aattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatag 17393231  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  || ||||||| |||||||    
T  17393230 tcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  83 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446654
Alignment:
Q  237 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 17446654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16643286 - 16643234
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  16643286 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtct 16643234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 54876393 - 54876445
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  54876393 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtct 54876445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 324349 - 324307
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  324349 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 324307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14966283 - 14966241
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14966283 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14966241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21837539 - 21837497
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21837539 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 21837497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 52989728 - 52989770
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52989728 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 52989770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 3265021 - 3265070
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3265021 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttg 3265070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11854753 - 11854708
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11854753 tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36527858 - 36527809
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  36527858 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttg 36527809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 10542440 - 10542480
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10542440 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14671035 - 14670995
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14671035 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14670995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17463731 - 17463663
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463731 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  59 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 10834109 - 10834151
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10834109 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15007922 - 15007868
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaa 71  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  15007922 aaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 214
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgatt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5223416 - 5223371
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5223416 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 5223371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12339818 - 12339773
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12339818 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 12339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15465187 - 15465142
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15465187 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15964989 - 15964944
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15964989 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15964944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15968913 - 15968868
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15968913 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15968868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15972837 - 15972792
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15972837 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15972792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058298
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25058298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 37439725 - 37439770
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  37439725 tgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgt 37439770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14179483 - 14179443
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14179483 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14179443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14682534 - 14682494
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14682534 tgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgttta 14682494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19775785 - 19775745
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19775785 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28194802 - 28194754
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  28194802 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtct 28194754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 36528384 - 36528348
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36528384 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 43889634 - 43889674
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43889634 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 43889674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39682735 - 39682476
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682735 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 39682636  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682635 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 39682536  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682535 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 39682476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 571819 - 571560
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571819 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 571720  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  571719 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 571620  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571619 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 571560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18809364 - 18809106
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18809364 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18809265  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809264 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 18809166  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809165 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 18809106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 23711754 - 23712012
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23711754 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23711853  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23711952  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711953 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 23712012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23131284 - 23131026
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23131284 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23131185  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23131184 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 23131085  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131084 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 23131026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23133751 - 23133493
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23133751 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23133652  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133651 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 23133552  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133551 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 23133493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 34402262 - 34402520
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34402262 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 34402361  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402362 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 34402461  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402462 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 34402520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28577520 - 28577262
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28577520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 28577421  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28577420 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgat 28577322  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577321 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 28577262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039497
Alignment:
Q  19 attggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  119 cagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatg 32039438  T
Q  219 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32039439 aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatat 32039497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26505800 - 26505543
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  26505800 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26505701  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505700 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 26505602  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505601 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 26505543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26508278 - 26508021
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  26508278 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26508179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508178 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 26508080  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508079 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 26508021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20261641 - 20261382
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261641 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20261542  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20261541 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 20261442  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20261441 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 20261382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 23709273 - 23709531
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23709273 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23709372  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709373 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23709471  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709472 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 23709531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24897936 - 24898193
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24897936 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24898035  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898036 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24898134  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898135 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 24898193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24905373 - 24905630
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24905373 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24905472  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905473 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24905571  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905572 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 24905630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24900419 - 24900676
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24900419 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24900518  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900519 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24900617  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900618 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 24900676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24902896 - 24903153
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24902896 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24902995  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902996 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24903094  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903095 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 24903153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24907848 - 24908105
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24907848 aattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24907947  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907948 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24908046  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908047 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 24908105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23136002 - 23135754
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  23136002 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 23135903  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135902 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattgtccatgattga 23135814  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23135813 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttata 23135754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 10684503 - 10684772
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10684503 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 10684602  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10684603 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 10684702  T
Q  218 gaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  10684703 gaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 10684772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 24529286 - 24529510
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24529286 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatg 24529385  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529386 gtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattga 24529485  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  24529486 tgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Original strand, 32214670 - 32214920
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32214670 aaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 32214769  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32214770 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgtatacgatattgttcatgattga 32214859  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32214860 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 32214920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 23706957 - 23707169
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23706957 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23707056  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23707057 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 23707156  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  23707157 gaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24918562 - 24918350
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24918562 aattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24918463  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24918462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24918363  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  24918362 gaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25616579 - 25616365
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  25616579 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcaca 25616480  T
Q  142 gtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25616479 atgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatg 25616380  T
Q  242 ttttaagatgttgat 256  Q
    |||||||||||||||    
T  25616379 ttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24671447 - 24671235
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24671447 aattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 24671348  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24671347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24671248  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  24671247 gaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 24642489 - 24642701
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24642489 aattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatgg 24642588  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24642589 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24642688  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  24642689 gaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24681866 - 24681654
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24681866 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatgg 24681767  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24681766 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24681667  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  24681666 gaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 45027645 - 45027840
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  45027645 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatag 45027744  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgatt 214  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45027745 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22105887 - 22105672
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22105887 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 22105788  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22105787 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22105688  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  22105687 gaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38967901 - 38967689
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  38967901 aattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatag 38967802  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  38967801 tgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgtt 38967702  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  38967701 gaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24368248 - 24368033
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  24368248 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 24368149  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||  || ||||  |||||||||    
T  24368148 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgat 24368049  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  24368048 gaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6726466 - 6726254
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  6726466 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtca 6726367  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  6726366 aattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T
Q  221 gtgttatatgtat 233  Q
     |  |||||||||    
T  6726266 ttagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 21154748 - 21154963
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  21154748 aatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21154847  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  || ||||||    
T  21154848 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgat 21154947  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  21154948 gaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 41523813 - 41524028
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41523813 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41523912  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  41523913 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 41524012  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  41524013 gaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6726280 - 6726158
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726280 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 6726182  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6726181 gattattatttgatgttgttatat 6726158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 21154937 - 21155059
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154937 ttataattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 21155035  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21155036 gattattatttgatgttgttatat 21155059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22105698 - 22105576
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105698 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 22105600  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  22105599 gattataatttgatgttgttatat 22105576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24368059 - 24367937
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368059 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgtt 24367961  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  24367960 ggttattatttgatgttgttatat 24367937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38967659 - 38967542
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967659 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgtt 38967561  T
Q  254 gattattatttgatgttgt 272  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38967560 gattattatttgatgttgt 38967542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 23707199 - 23707336
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  23707199 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 23707297  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23707298 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23707336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24918320 - 24918183
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  24918320 ttatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 24918222  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24918221 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 24918183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529223
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671068
Alignment:
Q  158 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  256 ttattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 24671068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24681624 - 24681487
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  24681624 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatg 24681526  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24681525 ttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 24681487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 24642731 - 24642855
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  24642731 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 24642829  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  24642830 ttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726533
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21154555 - 21154684
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21154555 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacgg 21154654  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21154655 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24918755 - 24918626
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24918755 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24918656  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918655 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 41523620 - 41523749
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41523620 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 41523719  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523720 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23931882 - 23931775
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23931882 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23931783  T
Q  118 tcagatta 125  Q
    ||| ||||    
T  23931782 tcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368312
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22106081 - 22105951
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22106081 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatg 22105982  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22105981 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523552
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 23709080 - 23709209
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21154362 - 21154491
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  21154362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttag 21154461  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  21154462 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24682059 - 24681930
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24682059 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatgg 24681960  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24681959 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 45027452 - 45027579
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  45027452 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 45027551  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  45027552 tcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 23706573 - 23706702
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||  |  ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23706573 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23706672  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23706673 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24671640 - 24671511
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24671640 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatgg 24671541  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24671540 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 32214476 - 32214604
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| || |||||||    
T  32214476 aaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatg 32214575  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  32214576 gtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23932075 - 23931949
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23932075 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 23931976  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    |||  |||||  || ||||||||||||    
T  23931975 tcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 277
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45029853
Alignment:
Q  208 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatat 45029853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Original strand, 23706765 - 23706889
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23706765 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatgg 23706864  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacag 142  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23706865 tcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  82 ttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 18358739 - 18358784
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18358739 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagt 18358784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 34874218 - 34874264
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34874218 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtg 34874264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27472534 - 27472482
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  27472534 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtct 27472482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 41524002 - 41524045
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524002 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 67409 - 67339
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  67409 atgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 23711622 - 23711690
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23711622 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  95 gatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26505932 - 26505864
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26505932 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26508410 - 26508342
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26508410 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 27920373 - 27920441
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27920373 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 32039107 - 32039175
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32039107 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9784813 - 9784754
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9784813 tatataagatgtttaaggttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgttta 9784754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23287477 - 23287438
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23287477 tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9242041 - 9241999
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9242041 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 9241999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 21073498 - 21073540
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21073498 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21073540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 21081742 - 21081784
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21081742 gatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgttta 21081784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| || | ||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     |||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1283406 - 1283361
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1283406 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1283361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Original strand, 19201985 - 19202030
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19201985 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 19202030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 30345080 - 30345125
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30345080 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 30345125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31345229 - 31345184
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31345229 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 31345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34137055 - 34137006
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34137055 gatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttg 34137006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 41531093 - 41531138
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41531093 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 41531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21237860 - 21237816
Alignment:
Q  255 attattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  21237860 attattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtc 21237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Original strand, 22459581 - 22459617
Alignment:
Q  261 atttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22459581 atttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttg 22459617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  161 tgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 237  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 23069291 - 23069331
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23069291 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23069331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26392495 - 26392455
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26392495 tgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26392455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 21474827 - 21475086
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474827 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 21474926  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474927 tcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 21475026  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475027 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 21475086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13989287 - 13989029
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13989287 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13989188  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989187 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13989089  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989088 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 13989029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 21923032 - 21923290
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  21923032 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 21923131  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923132 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 21923230  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923231 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 21923290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16362340 - 16362085
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16362340 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatgg 16362241  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16362240 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgat 16362141  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16362140 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 16362085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21841188 - 21840930
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  21841188 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21841089  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21841088 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 21840990  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21840989 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 21840930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 15859749 - 15860007
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15859749 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatgg 15859848  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15859849 tcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatggttgat 15859947  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15859948 gaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatat 15860007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 23593474 - 23593729
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| |    
T  23593474 aattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatag 23593573  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23593574 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 23593673  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23593674 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 23593729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 16274996 - 16275209
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaa-tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16274996 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 16275095  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16275096 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattga 16275195  T
Q  217 tgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||    
T  16275196 tgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 27161326 - 27161529
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27161326 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 27161425  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  ||||||||    
T  27161426 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattga 27161525  T
Q  217 tgaa 220  Q
    ||||    
T  27161526 tgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29777162 - 29776947
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29777162 aattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 29777063  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  29777062 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 29776963  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  29776962 gaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31612787 - 31612572
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31612787 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 31612688  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | || ||||||||  |||||||||    
T  31612687 tcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgat 31612588  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  31612587 gaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29298663 - 29298461
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29298663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29298564  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  29298563 tcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 29298464  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  29298463 gaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22122755 - 22122970
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |    
T  22122755 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatag 22122854  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22122855 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22122954  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| || |||||||||    
T  22122955 gaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29776973 - 29776851
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776973 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 29776875  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29776874 gattattatttgatgttgttatat 29776851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13227285 - 13227129
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13227285 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13227186  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13227185 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 16275239 - 16275362
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16275239 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatatt 16275338  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16275339 gattattatttgatgttgttatat 16275362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22050577 - 22050792
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22050577 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 22050676  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22050677 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22050776  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  22050777 gaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29298421 - 29298299
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298421 ttatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 29298323  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  29298322 gattattatttgatgttattatat 29298299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 149 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31612603 - 31612476
Alignment:
Q  149 attgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaag 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31612603 attgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaag 31612505  T
Q  249 atgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31612504 atattgattattatttgatgttgttatat 31612476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 22122944 - 22123066
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22122944 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatatt 22123042  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22123043 gattattatttgatgttgttatat 22123066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29535473 - 29535317
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29535473 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29535374  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29535373 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Original strand, 22050766 - 22050866
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050766 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 22050864  T
Q  254 ga 255  Q
    ||    
T  22050865 ga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29298856 - 29298727
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  29298856 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 29298757  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298756 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31612980 - 31612851
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31612980 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31612881  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612880 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31613044
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 9044745 - 9044867
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9044745 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 9044844  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcac 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  9044845 tcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15859543 - 15859672
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  15859543 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatga 15859642  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15859643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29777355 - 29777226
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29777355 aattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29777256  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29777255 tcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 22122561 - 22122691
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaa-gttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22122561 aattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatg 22122660  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  22122661 gtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16274803 - 16274932
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16274803 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatgg 16274902  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16274903 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 27161134 - 27161263
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27161134 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 27161233  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27161234 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40129506 - 40129387
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  40129506 aattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatag 40129407  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggt 137  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  40129406 tcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543197
Alignment:
Q  224 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtg 43543197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16401536 - 16401407
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||| | || |  |||||||||||| || |||||||||||    
T  16401536 aattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatgg 16401437  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16401436 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  77 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326855
Alignment:
Q  249 atgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtct 51326855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 27653228 - 27653274
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27653228 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtg 27653274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43543323 - 43543269
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43543323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 13881387 - 13881429
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13881387 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 13881429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29298474 - 29298408
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  29298474 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28312629 - 28312577
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  28312629 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtct 28312577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Original strand, 41781577 - 41781636
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41781577 tatataagatgtttaaggttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgttta 41781636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14800644 - 14800602
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  14800644 gatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14800602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14809518 - 14809476
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  14809518 gatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14809476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 1925218 - 1925263
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1925218 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1925263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 20924232 - 20924277
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20924232 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20924277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 23819387 - 23819432
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23819387 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23819432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Original strand, 20437979 - 20438041
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaag---atgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20437979 tatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 20438041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 21533880 - 21533920
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  21533880 tgttgattattatttgatattgttatatcctaagaagttta 21533920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22124398 - 22124358
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22124398 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22124358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Original strand, 52940883 - 52940923
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtt 288  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52940883 gatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21169 - 20910
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21169 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 21070  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21069 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20970  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20969 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14369 - 14110
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14369 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 14270  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14170  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14169 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 23271 - 23484
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23271 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 23370  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23470  T
Q  218 gaagtgttatatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  23471 gaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 22917 - 23047
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  22917 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatg 23016  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23017 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 23125 - 23207
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  23125 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8055451 - 8055192
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055451 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 8055352  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055351 tcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 8055252  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055251 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 8055192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 1540652 - 1540910
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1540652 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1540751  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540752 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1540850  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540851 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 1540910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24422968 - 24422710
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24422968 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24422869  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422868 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24422770  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422769 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 24422710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33862215 - 33861957
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33862215 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33862116  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 33862017  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862016 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 33861957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33864699 - 33864441
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33864699 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33864600  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864599 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 33864501  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864500 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 33864441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 18334333 - 18334590
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18334333 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18334432  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334433 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 18334531  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334532 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 18334590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12742739 - 12742480
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12742739 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12742640  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12742639 tcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgat 12742540  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742539 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 12742480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 2290921 - 2291178
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  2290921 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 2291020  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2291021 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgactgat 2291119  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291120 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 2291178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22782648 - 22782390
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782648 aattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatgg 22782549  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782548 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 22782450  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22782449 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatat 22782390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 26924381 - 26924638
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26924381 aattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 26924480  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924481 tcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 26924579  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924580 gaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 26924638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 30676450 - 30676709
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30676450 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatgg 30676549  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30676550 taaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 30676649  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30676650 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 30676709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34963795 - 34963536
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34963795 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 34963696  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34963695 tcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 34963596  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34963595 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 34963536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 19858663 - 19858918
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19858663 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgtc---tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19858759  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858760 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgc-tgtgaatacgatattgtccatgattgat 19858858  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19858859 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatat 19858918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25688924 - 25688665
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25688924 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatgg 25688825  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688824 tcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgag 25688725  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25688724 gaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatat 25688665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 19847711 - 19847931
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847711 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat----gctagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 19847806  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847807 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattga 19847906  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19847907 tgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 28289077 - 28289342
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28289077 aattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 28289176  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28289177 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatgattgat 28289274  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  28289275 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatatcttgagat 28289342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 17377588 - 17377814
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17377588 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatgg 17377687  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17377688 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 17377787  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17377788 gaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1598478 - 1598266
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  1598478 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatag 1598379  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598378 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1598280  T
Q  218 gaagtgttatatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  1598279 gaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12942576 - 12942364
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgat 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12942576 tttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgat 12942477  T
Q  165 gaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattt 264  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12942476 gaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattt 12942377  T
Q  265 gatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||    
T  12942376 gatgttgttatat 12942364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23992844 - 23992604
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23992844 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23992745  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992744 tcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23992646  T
Q  218 gaagtgttatatgtatat---atgatgttttaagatgttgat 256  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23992645 gaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18914354 - 18914142
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18914354 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatgg 18914255  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18914254 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgat 18914155  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  18914154 gaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 31630281 - 31630493
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31630281 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 31630380  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31630381 tcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 31630480  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
     ||||||||||||    
T  31630481 aaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25535829 - 25535641
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25535829 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 25535730  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25535729 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19005573 - 19005361
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19005573 aattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 19005474  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  19005473 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgat 19005374  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    ||| |||||||||    
T  19005373 gaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19005331 - 19005209
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005331 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 19005233  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19005232 gattattatttgatgttgttatat 19005209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18914112 - 18913994
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914112 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 18914014  T
Q  254 gattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18914013 gattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15875591 - 15875452
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875591 ttatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 15875493  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15875492 gattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtg 15875452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 31630523 - 31630626
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630523 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 31630622  T
Q  254 gatt 257  Q
    ||||    
T  31630623 gatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18914740 - 18914615
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18914740 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatgg 18914641  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18914640 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2034
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1905 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 2004  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2005 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 8864 - 8993
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8864 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8963  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19005766 - 19005637
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  19005766 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgt 19005667  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005666 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1598668 - 1598542
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1598668 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtca 1598569  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598568 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Original strand, 26924199 - 26924313
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26924199 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 26924298  T
Q  129 aacgtaggtcacagt 143  Q
     ||||||||||||||    
T  26924299 cacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656792
Alignment:
Q  172 tatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 271  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  272 ttatat 277  Q
    ||||||    
T  25656797 ttatat 25656792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23415386 - 23415258
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23415386 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23415287  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  23415286 tcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 112 - 242
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  112 aaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatg 211  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  212 gtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25689118 - 25688988
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  25689118 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatg 25689019  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689018 gtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  204 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19847519 - 19847648
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  19847519 aattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcg 19847618  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19847619 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15875734 - 15875621
Alignment:
Q  107 ttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  15875734 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgt 15875645  T
Q  207 ccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15875644 tcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27557144 - 27557016
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27557144 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatgg 27557045  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  27557044 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1598864 - 1598735
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| || |||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1598864 aattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 1598765  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598764 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18914547 - 18914422
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  18914547 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatgg 18914448  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18914447 tcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 30676257 - 30676386
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  || ||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30676257 aattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 30676356  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30676357 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630197
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  120 agattact 127  Q
    | ||||||    
T  31630190 aaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Original strand, 15892149 - 15892231
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892149 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  28 aggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  128 gaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595712
Alignment:
Q  226 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 1595712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 147
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 17883238 - 17883305
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttga 85  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17883238 aattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 14979393 - 14979439
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14979393 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttaagtg 14979439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 25619728 - 25619770
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25619728 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33443168 - 33443122
Alignment:
Q  243 tttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33443168 tttaagttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33864831 - 33864763
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864831 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18453297 - 18453255
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18453297 gatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgttta 18453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23838289 - 23838247
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23838289 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 28103904 - 28103946
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28103904 gatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgttta 28103946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 31477899 - 31477949
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  31477899 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtct 31477949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||| || ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16760312 - 16760267
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16760312 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 16760267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22949125 - 22949080
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22949125 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22949080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22953081 - 22953036
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22953081 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22953036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23414997 - 23414952
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23414997 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23414952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23871569 - 23871524
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23871569 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23871524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23875525 - 23875480
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23875525 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23875480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 15705451 - 15705491
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15705451 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 15705491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 295
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18955897
Alignment:
Q  251 gttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18955897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20136783 - 20136743
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20136783 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20136743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 22196086 - 22196126
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22196086 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22196126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25737064 - 25737028
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25737064 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 26924056 - 26924124
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  26924056 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13814 - 13556
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13814 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 13715  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13714 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13615  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13614 gaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 13556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13919 - 13878
Alignment:
Q  106 tttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919 tttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 88)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1484823 - 1484565
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1484823 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1484724  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484723 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1484625  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484624 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 1484565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 14409185 - 14409443
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14409185 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14409284  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409285 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14409383  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409384 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 5853033 - 5853291
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  5853033 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 5853132  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853133 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 5853231  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853232 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 5853291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4483702 - 4483444
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4483702 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4483603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483602 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 4483503  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483502 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 4483444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 24485784 - 24486043
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  24485784 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatag 24485883  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24485884 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24485983  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485984 gaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatat 24486043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 20045936 - 20046194
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20045936 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20046035  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20046036 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 20046134  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046135 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 20046194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22002174 - 22001917
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  22002174 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 22002075  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002074 tcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 22001976  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001975 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 22001917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 4542114 - 4542371
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |    
T  4542114 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatag 4542213  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542214 tcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 4542312  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542313 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 4542371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15070982 - 15070727
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  15070982 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatgg 15070883  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070882 tcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15070783  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15070782 gaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 15070727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 16413056 - 16413315
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16413056 aattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16413155  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16413156 tcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16413255  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16413256 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 16413315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14824196 - 14823936
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14824196 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14824097  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14824096 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgat 14823998  T
Q  218 gaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14823997 gaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatat 14823936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 27472157 - 27472395
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27472157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 27472256  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27472257 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 27472356  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472357 gaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32122150 - 32121912
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32122150 aattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 32122051  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122050 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 32121951  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121950 gaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 18677805 - 18678043
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18677805 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 18677904  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18677905 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgat 18678004  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 256  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18678005 gaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 16401665 - 16401875
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  16401665 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatag 16401764  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16401765 tcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 16401864  T
Q  218 gaagtgttata 228  Q
    |||||||||||    
T  16401865 gaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 38549745 - 38549957
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549745 aattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38549844  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549845 tcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38549944  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    ||| | |||||||    
T  38549945 gaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16198316 - 16198115
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16198316 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatgg 16198217  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16198216 tccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16198117  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  16198116 ga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 1326672 - 1326884
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1326672 aattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 1326771  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1326772 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgat 1326871  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  1326872 gaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24049032 - 24048841
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24049032 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 24048933  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccat 210  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  24048932 tcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 15202919 - 15203134
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  15202919 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15203018  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| || ||| || |  |||||||||    
T  15203019 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgat 15203118  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  15203119 gaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20403701 - 20403486
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20403701 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattg 20403602  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  20403601 tcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 20403502  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  20403501 gaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 19936648 - 19936850
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19936648 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatag 19936747  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||          |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19936748 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatattatattgttcatgattgat 19936837  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  19936838 gaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290597
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  221 gtgttatatgtat 233  Q
     |  |||||||||    
T  45290585 ttagtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19896743 - 19896524
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19896743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19896644  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  19896643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 19896544  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatat 237  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  19896543 gaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20403512 - 20403390
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403512 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 20403414  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20403413 gattattatttgatgttgttatat 20403390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32810216 - 32810094
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32810216 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgtt 32810118  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32810117 gattattatttgatgttgttatat 32810094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 45290571 - 45290692
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290571 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 45290669  T
Q  254 gattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  45290670 gattattatttgacgttgttata 45290692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 15203108 - 15203230
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203108 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 15203206  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15203207 gattattatttgatgttgttatat 15203230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19896554 - 19896431
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgat-gttttaagatgt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19896554 ttatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgt 19896456  T
Q  253 tgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19896455 tgattattatttgatgttgttatat 19896431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Original strand, 1326914 - 1327059
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaa 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| |    
T  1326914 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttga 1327012  T
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtg 1327059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 38549987 - 38550090
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549987 ttatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 38550086  T
Q  254 gatt 257  Q
    ||||    
T  38550087 gatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19896937 - 19896807
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19896937 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatg 19896838  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  19896837 gtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20403894 - 20403765
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403894 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20403795  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403794 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 15202726 - 15202856
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15202726 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15202825  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15202826 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 14397481 - 14397609
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14397481 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatgg 14397580  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14397581 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 277
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937004
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 19936980  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  19936981 gattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 27471963 - 27472093
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27471963 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 27472062  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27472063 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15071175 - 15071046
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15071175 aattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15071076  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15071075 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32122343 - 32122214
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32122343 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 32122244  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32122243 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38549552 - 38549681
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549552 aattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 38549651  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38549652 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 20982603 - 20982710
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaaga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  20982603 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaaga 20982702  T
Q  250 tgttgatt 257  Q
    ||||||||    
T  20982703 tgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 16401287 - 16401408
Alignment:
Q  26 ttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16401287 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 16401386  T
Q  126 ctgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  16401387 cagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 16401907 - 16402050
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  16401907 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 16402005  T
Q  252 ttgattat------tatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16402006 ttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16402050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19897130 - 19897000
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19897130 aaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 19897031  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  19897030 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 45290287 - 45290389
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45290287 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 45290386  T
Q  117 gtc 119  Q
    |||    
T  45290387 gtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15202533 - 15202662
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15202533 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15202632  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15202633 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 16412866 - 16412992
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16412866 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 16412965  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412966 aattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16401472 - 16401601
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16401472 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16401571  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||| | ||||| | |||| |||||    
T  16401572 tcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38549360 - 38549488
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549360 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38549459  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38549460 tcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24049225 - 24049104
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24049225 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 24049126  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtca 139  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
T  24049125 tcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Original strand, 13425335 - 13425411
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425335 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  155 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936584
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  || |||| |||||||| |||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  19936455 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgc 19936554  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  19936555 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  166 aattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361034
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttat 11361034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 127
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026903
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 19808368 - 19808420
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  19808368 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtct 19808420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Original strand, 22238025 - 22238073
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgtt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22238025 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  159 attgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32810318 - 32810263
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  32810318 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418914
Alignment:
Q  231 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatatattaagat 2418914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23409910 - 23409868
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23409910 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23409868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23659522 - 23659480
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23659522 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 23659480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 5852901 - 5852969
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5852901 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Original strand, 14103230 - 14103270
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtt 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14103230 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttaagttgtt 14103270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 14409053 - 14409121
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409053 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Original strand, 17461058 - 17461106
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgtt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17461058 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 17086159 - 17086201
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  17086159 gatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgttta 17086201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 22419405 - 22419455
Alignment:
Q  235 tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||    
T  22419405 tatgatgttttaagatgttgattatcgtttgaaattgttatatcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Original strand, 17438227 - 17438272
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17438227 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 17438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 18862734 - 18862779
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18862734 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18862779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21410967 - 21410922
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21410967 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21410922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21805459 - 21805414
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21805459 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21805414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 21828103 - 21828148
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21828103 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21828148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23914147 - 23914110
Alignment:
Q  253 tgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23914147 tgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23914110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 25363210 - 25363255
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25363210 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 15118093 - 15118351
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15118093 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15118192  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118193 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15118291  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118292 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15118351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44615710 - 44615452
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  44615710 aattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 44615611  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615610 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 44615511  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615510 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 44615452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 50222080 - 50222337
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  50222080 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 50222179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222180 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 50222278  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50222279 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttata 50222337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15534603 - 15534344
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534603 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 15534504  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15534503 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 15534404  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15534403 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 15534344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 14970447 - 14970706
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970447 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 14970546  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14970547 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgat 14970646  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14970647 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14970706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3515430 - 3515170
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3515430 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatg 3515331  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515330 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattga 3515231  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3515230 tgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3515170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36038292 - 36038025
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36038292 aattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 36038193  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36038192 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 36038093  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  36038092 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 49547514 - 49547781
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547514 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 49547613  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547614 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 49547713  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49547714 gaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 44772824 - 44773086
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  44772824 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatag 44772923  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772924 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 44773022  T
Q  218 gaagtgttatatg----tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773023 gaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 44773086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14048999 - 14048732
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  14048999 aattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatgg 14048900  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14048899 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 14048800  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  14048799 gaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29267775 - 29267570
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267775 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 29267676  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29267675 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgat 29267576  T
Q  218 gaagtg 223  Q
    ||||||    
T  29267575 gaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19243122 - 19242882
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19243122 aattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19243023  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243022 ttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 19242923  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242922 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 19242882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 1837260 - 1837507
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |    
T  1837260 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatag 1837359  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837360 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatattgtccatgattgat 1837448  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837449 gaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 1837507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 52872813 - 52873025
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52872813 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 52872912  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52872913 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 52873012  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    || ||||||||||    
T  52873013 gatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 7640927 - 7641191
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7640927 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 7641026  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7641027 ttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgattgat 7641125  T
Q  218 gaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641126 gaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 7641191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 362603 - 362390
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  362603 aaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatg 362504  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  362503 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 362404  T
Q  217 tgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||    
T  362403 tgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 19617809 - 19618019
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19617809 ttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtc 19617908  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19617909 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 19618008  T
Q  220 agtgttatatg 230  Q
    |||||||||||    
T  19618009 agtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 15495914 - 15496126
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15495914 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatgg 15496013  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15496014 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgat 15496113  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  15496114 gaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 14746252 - 14746464
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746252 aattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatgg 14746351  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  14746352 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgat 14746451  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  14746452 gaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19858001 - 19857798
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  19858001 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatg 19857902  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19857901 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattga 19857812  T
Q  217 tgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||||    
T  19857811 tgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 11995 - 12164
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11995 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12094  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12095 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 12164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52312983 - 52312769
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  52312983 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 52312884  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  52312883 tca-attactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 52312785  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  52312784 gaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 276
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239417
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtc 207  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  208 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 18239417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Original strand, 15496948 - 15497087
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496948 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 15497046  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15497047 gattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtg 15497087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 52873055 - 52873197
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873055 ttatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 52873153  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  52873154 gattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttg 52873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 12184 - 12306
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 12282  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  12283 gattattattggatgttgttatat 12306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 15355201 - 15355323
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355201 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 15355299  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15355300 gattattatttgatgttgttatat 15355323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 18215151 - 18215273
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215151 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 18215249  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  18215250 gattatgatttgatgttgttatat 18215273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52312795 - 52312673
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312795 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 52312697  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52312696 gattattatttgatgttgttatat 52312673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 19618049 - 19618171
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618049 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 19618147  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  19618148 gattaccatttgatgttgttatat 19618171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  101 tagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacga 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  201 tattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 14746494 - 14746631
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  14746494 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 14746592  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14746593 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14746631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 18214751 - 18214880
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18214751 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18214850  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18214851 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 362988 - 362859
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362988 aattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatgg 362889  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  362888 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 52872619 - 52872749
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52872619 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 52872718  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52872719 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3515622 - 3515493
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3515622 aattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 3515523  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3515522 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52313369 - 52313240
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52313369 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 52313270  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313269 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Original strand, 15355071 - 15355171
Alignment:
Q  130 acgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355071 acgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatat 15355170  T
Q  230 g 230  Q
    |    
T  15355171 g 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 362795 - 362668
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  362795 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 362696  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  362695 tcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  137 tcacagtgaat 147  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14970254 - 14970383
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970254 aattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14970353  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14970354 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15495721 - 15495850
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15495721 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15495820  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15495821 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19617614 - 19617743
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  19617614 aattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatgg 19617713  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19617714 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19858193 - 19858064
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19858193 aattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19858094  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19858093 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52313176 - 52313047
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  52313176 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatgg 52313077  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313076 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14746059 - 14746188
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14746059 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14746158  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  14746159 tcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19857768 - 19857685
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857768 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  189 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857584
Alignment:
Q  225 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtct 19857584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30147338 - 30147189
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30147338 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatg 30147239  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatga 166  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30147238 gtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     |||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  77 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  30 gtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10056753 - 10056711
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10056753 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10056711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 24047305 - 24047347
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24047305 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgttta 24047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Original strand, 12778423 - 12778459
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12778423 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16043127 - 16043087
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtt 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16043127 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40907186 - 40907131
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtctgtg 303  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  40907186 gatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcctgtg 40907131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18212847 - 18212805
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18212847 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18212805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 32307001 - 32307043
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  32307001 gatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712828
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10712828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926598
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10926598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12487728 - 12487683
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12487728 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 12487683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14185094 - 14185045
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  14185094 gatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttg 14185045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 14954256 - 14954301
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14954256 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 14954301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995644
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25689887 - 25689842
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25689887 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25689842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27534043 - 27533998
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27534043 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 27533998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40907027 - 40906974
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtctgtg 303  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  40907027 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgatgtttgtg 40906974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  110 agttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 17048142 - 17048182
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17048142 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 17048182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6368 - 6110
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6368 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 6269  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6268 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 6170  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6169 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 6110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 94832 - 94574
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  94832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 94733  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94732 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 94634  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94633 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 94574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 17180 - 17438
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17180 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17279  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17280 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgat 17379  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17380 gaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 17438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17116
Alignment:
Q  35 aacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgta 134  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||    
T  17004 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgta 17103  T
Q  135 ggtcacagtgaat 147  Q
    ||||| |||||||    
T  17104 ggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20909433 - 20909176
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20909433 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20909334  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909333 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20909235  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909234 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 20909176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Original strand, 264509 - 264767
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  264509 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 264608  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264609 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 264707  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264708 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 264767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38619858 - 38619603
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38619858 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 38619759  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619758 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 38619659  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38619658 gaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 38619603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39245557 - 39245299
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  39245557 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 39245458  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245457 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 39245359  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245358 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 39245299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 10732681 - 10732938
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  10732681 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 10732780  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10732781 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgat 10732879  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732880 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 10732938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 42245106 - 42245363
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |    
T  42245106 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatag 42245205  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245206 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 42245304  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245305 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 42245363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39363806 - 39363548
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39363806 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 39363707  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363706 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 39363607  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363606 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 39363548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 17516904 - 17517142
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17516904 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcg 17517003  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517004 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 17517103  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517104 gaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23064935 - 23064680
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23064935 aattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23064836  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064835 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23064736  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23064735 gaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtt 23064680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29346401 - 29346143
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29346401 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29346302  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346301 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29346203  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346202 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 29346143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29348874 - 29348616
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29348874 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29348775  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348774 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29348676  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348675 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 29348616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29351347 - 29351089
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29351347 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29351248  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351247 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29351149  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351148 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 29351089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 37804643 - 37804910
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37804643 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatgg 37804742  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37804743 tcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaat 37804842  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  37804843 gaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatatcttgagat 37804910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 2154372 - 2154595
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2154372 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 2154471  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2154472 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgat 2154571  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2154572 gaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776513
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  9776580 gaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 9776513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Original strand, 20901661 - 20901873
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20901661 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20901760  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901761 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 20901860  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  20901861 gaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32027867 - 32027652
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32027867 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 32027768  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  32027767 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 32027668  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  32027667 gaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 20917587 - 20917789
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20917587 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20917686  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  20917687 tcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 20917786  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  20917787 gaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29330404 - 29330190
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29330404 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29330305  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || || ||| ||||  |||||||||    
T  29330304 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgat 29330206  T
Q  218 gaagtgttatatgtat 233  Q
    ||| |  |||||||||    
T  29330205 gaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32027678 - 32027556
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027678 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 32027580  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32027579 gattattatttgatgttgttatat 32027556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Original strand, 20917829 - 20917951
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917829 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 20917927  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20917928 gattattatttgatgttgttatat 20917951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29330216 - 29330097
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  29330216 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga---t 29330121  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29330120 gattattatttgatgttgttatat 29330097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 20901903 - 20901990
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901903 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 17516517 - 17516647
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17516517 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 17516616  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17516617 gtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028254 - 32028124
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32028254 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028155  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028154 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20901468 - 20901597
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20901468 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 20901567  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20901568 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028641 - 32028511
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32028641 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028542  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028541 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 295826 - 295951
Alignment:
Q  22 ggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcag 121  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  295826 ggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaa 295925  T
Q  122 attactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  295926 attactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29330597 - 29330468
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29330597 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29330498  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  29330497 tcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 296015 - 296144
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  296015 aattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 296114  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  296115 tcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17516711 - 17516840
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  17516711 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcg 17516810  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  17516811 tcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917523
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 2154179 - 2154308
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  2154179 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 2154278  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2154279 tcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028447 - 32028318
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  32028447 aattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatgg 32028348  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  32028347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028060 - 32027931
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32028060 aattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32027961  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32027960 tcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6765943 - 6765897
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6765943 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtg 6765897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 264370 - 264445
Alignment:
Q  72 tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  264370 tgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  159 attgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20909565 - 20909497
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20909565 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 22107442 - 22107482
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22107442 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 22107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 30138936 - 30138976
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30138936 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 20917776 - 20917855
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917776 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23506573 - 23506503
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  23506573 atgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattact 23506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18356309 - 18356264
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18356309 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 20910924 - 20910969
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20910924 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20910969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42960653 - 42960608
Alignment:
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42960653 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42960608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10753381 - 10753341
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10753381 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10753341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  158 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| |||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25743848 - 25743796
Alignment:
Q  237 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  25743848 tgatgttttaagttgttgattactacttgatattgttatatcataagttgttt 25743796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 26740653 - 26740693
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26740653 tgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 134632 - 134375
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  134632 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 134533  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134532 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 134434  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134433 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 134375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 137101 - 136844
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  137101 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137002  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  137001 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 136903  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136902 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 136844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 139570 - 139313
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  139570 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 139471  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139470 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 139372  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139371 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 142039 - 141782
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  142039 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 141940  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141939 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 141841  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141840 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 141782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 144508 - 144251
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  144508 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 144409  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144408 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 144310  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144309 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 144251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 58808 - 58853
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  58808 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 58853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40821 - 40564
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40821 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 40722  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 40623  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622 gaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 40564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40926 - 40885
Alignment:
Q  106 tttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40926 tttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37860
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  37869 tcaaattact 37860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3445 - 3178
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3445 aattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 3346  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3345 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 3246  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  3245 gaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9663 - 9405
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  9663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 9564  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9563 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 9465  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9464 gaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 9405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 4043 - 4324
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4043 aattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4142  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4143 tcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgat 4242  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  4243 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 3657 - 3782
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  || ||||||||||     
T  3657 aattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgc 3756  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3757 tcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 3850 - 3979
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||  || ||||||||||     
T  3850 aattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatga 3949  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3950 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  95 gatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 53607 - 53886
Alignment:
Q  13 catcaaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||     
T  53607 catcaaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgaga 53706  T
Q  113 tatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatga 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  53707 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatga 53806  T
Q  213 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53807 ttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 53886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5116 - 4857
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  5116 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 5017  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5016 tcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 4917  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4916 gaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 4857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5180
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  5309 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatgg 5210  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5209 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15070
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatga 15143  T
Q  220 agtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15142 agtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 11080 - 11249
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  11080 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatgg 11179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11180 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 11249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11016
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10887 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 10986  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10987 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15398
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15526 aattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15428  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15427 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1583
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  137 tcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata 236  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata 1632  T
Q  237 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 6676 - 6950
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6676 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6775  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6776 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgat 6875  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6876 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgttta 6950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 6483 - 6612
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6483 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6582  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11712 - 11451
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11712 aaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttata 11613  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11612 gtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 11513  T
Q  217 tgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  11512 tgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatat 11451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38651
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38595  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38596 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 38651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 416
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  629 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 530  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  529 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 430  T
Q  218 gaagtgttatatgt 231  Q
    ||||||||||||||    
T  429 gaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 983 - 853
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  983 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 884  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  883 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 693
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  775 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10936
Alignment:
Q  70 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaatt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  170 agtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 10944  T
Q  270 tgttatat 277  Q
    ||||||||    
T  10943 tgttatat 10936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10001
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10211 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 10112  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10111 aaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 10012  T
Q  220 agtgttatatg 230  Q
    |||||||||||    
T  10011 agtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10406 - 10277
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  10406 aattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattg 10307  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10306 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10470
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9938
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9971 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 9938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 267 - 476
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  267 tggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 366  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  367 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaa 466  T
Q  221 gtgttatatg 230  Q
    ||||||||||    
T  467 gtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Original strand, 506 - 582
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  506 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 277
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12248
Alignment:
Q  223 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 12248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30441 - 30229
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  30441 aattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatgg 30342  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30341 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 30242  T
Q  218 gaagtgttatatg 230  Q
    |||||||||||||    
T  30241 gaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30112
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30634 - 30505
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  30634 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatgg 30535  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30534 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  30 gtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactga 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  130 acgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 43002
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  43159 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtc 43060  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatg 177  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43059 aaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43225
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43354 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 43255  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43254 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 799
Alignment:
Q  23 gtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaga 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  1006 gtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaa 907  T
Q  123 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 222  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  906 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 807  T
Q  223 gttatatg 230  Q
     |||||||    
T  806 tttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 769 - 632
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  769 ttatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 671  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  670 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1075
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1204 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 1105  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||| |||||| |||||||    
T  1104 tcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1225
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 501486 - 501247
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  501486 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatga 501388  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  501387 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga-------------------atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 501307  T
Q  218 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 277  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  501306 gatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatat 501247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 501676 - 501550
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  501676 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 501577  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  501576 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6873 - 6682
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6873 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 6774  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6773 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6937
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7066 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6967  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6966 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8161 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatgg 8062  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgta 183  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8061 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8351 - 8225
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8351 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 8252  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8251 aattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8547 - 8421
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8547 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatgg 8448  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||    
T  8447 tgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57708
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgatta 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgat 213  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 10764 - 10906
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10764 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgtt 10862  T
Q  254 gattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10863 gagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 10906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  143 tgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28074 - 27958
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28074 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgtt 27976  T
Q  254 gattattatttgatgttg 271  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27975 gattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28048
Alignment:
Q  91 aaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgctt 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  191 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 233  Q
     ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 68384 - 68227
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68384 aaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 68285  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68284 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 15149 - 15286
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  15149 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 15247  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15248 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 230
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  131 cgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt----------ttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36082
Alignment:
Q  167 attagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  266 atgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36054 atgttcttatatcttgaggtgtttaagtg 36082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1740
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1869 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1770  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1769 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1677 - 1640
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1677 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31625 - 31497
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31625 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31526  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  31525 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8311
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8440 aattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8341  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  8340 taaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8146 - 8097
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8146 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 290
Target Start/End: Original strand, 1203 - 1340
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatg 251  Q
    |||||||| || |||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  1203 ttatgattaataaattagtatatgaatataaatg-ttgagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatg 1301  T
Q  252 ttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1302 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 36938 - 37068
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36938 aaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 37037  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  37038 gtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18552 - 18423
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18552 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18453  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  18452 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7558
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7430 aattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 7529  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  7530 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7367
Alignment:
Q  23 gtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaga 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| |    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  123 ttactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 145
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18075 - 17947
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18075 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17976  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  17975 tcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17686 - 17641
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17686 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33593 - 33465
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33593 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatgg 33494  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  33493 tcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10017 - 9932
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10017 ttatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39754 - 39626
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39754 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 39655  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  39654 tcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39365 - 39320
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39365 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 39320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19957
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||| |    
T  19829 aattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcg 19928  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  19929 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17617 - 17575
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17617 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 17575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 113425 - 113317
Alignment:
Q  31 tgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaa 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  113425 tgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaa 113326  T
Q  131 cgtaggtca 139  Q
    |||||||||    
T  113325 cgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 289
Target Start/End: Original strand, 206531 - 206570
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  206531 tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 85660 - 85614
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  85660 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtg 85614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 24603 - 24652
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24603 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttg 24652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15857 - 15809
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgtt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15857 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 15809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 10090 - 10132
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10090 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 169755 - 169797
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  169755 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 169797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 225
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  274 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Original strand, 75644 - 75681
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  75644 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6207
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6167 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 15073 - 15113
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15073 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 288
Target Start/End: Original strand, 667 - 707
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtt 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  667 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttaagttgtt 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 235  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 120121 - 120074
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  120121 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttg 120074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 965 - 915
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttgtct 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  965 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtct 915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 6947 - 6989
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6947 gatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgttta 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2009 - 1967
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2009 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 1967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  59 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 1880 - 1922
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1880 gatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgttta 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 290
Target Start/End: Original strand, 221212 - 221254
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  221212 gatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 221254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 189466 - 189511
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  189466 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10588 - 10539
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  10588 gatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttg 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 367
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  412 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 11590 - 11635
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11590 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28469
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || || ||||||||||     
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  28478 tcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 32749 - 32794
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32749 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 32794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 36031 - 36076
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36031 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80469
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 80469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 36175 - 36220
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgt 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36175 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 762 - 713
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgtttaagtgttg 297  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  762 gatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttg 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6724 - 6684
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6724 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21279 - 21239
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21279 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 75836 - 75876
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  75836 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 75876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 67375 - 67343
Alignment:
Q  248 gatgttgattattatttgatgttgttatatctt 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67375 gatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 67343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20863 - 20823
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20863 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 126068 - 126028
Alignment:
Q  250 tgttgattattatttgatgttgttatatcttaagatgttta 290  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  126068 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 126028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University