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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1583_low_16 (Length: 362)

Name: NF1583_low_16
Description: NF1583
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1583_low_16
NF1583_low_16
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (21-315)||(24420488-24420788)
chr4 (20-315)||(24470838-24471138)
chr4 (42-315)||(24420392-24420665)
chr4 (40-315)||(24470959-24471234)
chr4 (69-313)||(24470605-24470849)
chr4 (45-313)||(24420778-24421046)
chr4 (65-313)||(24421210-24421458)
chr4 (20-315)||(24420872-24421167)
chr4 (28-292)||(24420751-24421015)
chr4 (42-310)||(24421021-24421289)
chr4 (240-315)||(24406527-24406602)
chr4 (40-310)||(24421165-24421435)
chr4 (21-299)||(24470311-24470595)
chr4 (69-294)||(24470413-24470638)
chr4 (48-304)||(24470488-24470744)
chr4 (120-315)||(24476790-24476976)
chr4 (65-315)||(24470265-24470515)
chr4 (40-268)||(24420967-24421195)
chr4 (163-259)||(24476885-24476981)
chr4 (40-294)||(24470528-24470782)
chr4 (159-315)||(24406425-24406587)
chr4 (40-310)||(24420637-24420907)
chr4 (21-268)||(24421159-24421412)
chr4 (40-310)||(24470720-24470989)
chr4 (40-313)||(24470288-24470561)
chr4 (40-284)||(24420327-24420571)
chr4 (48-304)||(24420979-24421235)
chr4 (42-286)||(24477374-24477618)
chr4 (40-315)||(24420584-24420859)
chr4 (102-294)||(24421277-24421469)
chr4 (159-299)||(24421320-24421460)
chr4 (65-313)||(24477491-24477739)
chr4 (102-294)||(24470254-24470446)
chr4 (159-299)||(24470263-24470403)
chr4 (186-277)||(24477065-24477156)
chr4 (69-294)||(24477462-24477687)
chr4 (40-134)||(24477064-24477158)
chr4 (300-340)||(24406379-24406419)
chr4 (300-340)||(24406481-24406521)
chr4 (159-270)||(24477630-24477741)
chr4 (127-259)||(24471142-24471274)
chr4 (246-314)||(24482187-24482255)
chr4 (87-170)||(24481477-24481559)
chr4 (84-199)||(24406499-24406614)
chr4 (84-190)||(24471147-24471253)
chr4 (65-97)||(24421495-24421527)
chr4 (65-97)||(24470196-24470228)
chr4 (246-286)||(24476729-24476769)
chr4 (242-294)||(24477291-24477343)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (69-286)||(4464-4681)
scaffold0879 (42-310)||(4485-4753)
scaffold0879 (40-268)||(4579-4807)
scaffold0879 (45-304)||(4536-4795)
scaffold0879 (20-277)||(4607-4864)
scaffold0879 (159-310)||(4458-4609)
scaffold0879 (174-313)||(4425-4564)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (102-292)||(41899872-41900062)
chr2 (48-286)||(41899830-41900068)
chr2 (75-277)||(41900127-41900329)
chr2 (45-242)||(41899826-41900023)
chr2 (105-294)||(41900302-41900491)
chr2 (102-269)||(41900279-41900446)
chr2 (40-194)||(41899826-41899980)
chr2 (42-267)||(41900089-41900314)
chr2 (246-313)||(41900571-41900638)
chr2 (159-277)||(41900511-41900629)
chr2 (102-229)||(41900511-41900638)
chr2 (52-294)||(41900158-41900400)
chr2 (54-210)||(41900290-41900446)
chr2 (40-148)||(41899824-41899932)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (54-193)||(11879442-11879581)
chr1 (102-205)||(11879442-11879545)
chr1 (57-193)||(11882303-11882439)
chr1 (57-193)||(11891537-11891673)
chr1 (150-274)||(11879442-11879566)
chr1 (102-274)||(11902038-11902210)
chr1 (54-190)||(11902038-11902174)
chr1 (222-291)||(11879349-11879418)
chr1 (69-193)||(11882411-11882535)
chr1 (69-193)||(11891645-11891769)
chr1 (101-146)||(11902373-11902418)
chr1 (53-205)||(11904952-11905104)
chr1 (81-169)||(11879661-11879749)
chr1 (42-193)||(11902074-11902225)
chr1 (220-310)||(11879464-11879554)
chr1 (223-313)||(11902063-11902153)
chr1 (53-175)||(11905000-11905122)
chr1 (40-118)||(52821569-52821647)
chr1 (42-142)||(11879526-11879626)
chr1 (246-286)||(11881952-11881992)
chr1 (246-286)||(11891186-11891226)
chr1 (150-310)||(11902038-11902198)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24420788 - 24420488
Alignment:
Q  21 ccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24420788 ccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctc 24420689  T
Q  115 ctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24420688 ctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcc 24420589  T
Q  215 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24420588 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctcct 24420489  T
Q  315 t 315  Q
    |    
T  24420488 t 24420488  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Original strand, 24470838 - 24471138
Alignment:
Q  20 accaccacctccatctccctctcctcc-----atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctc 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24470838 accacctcctccatctccctctcctccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctc 24470937  T
Q  115 ctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcc 214  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24470938 ctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcc 24471037  T
Q  215 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  24471038 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctcct 24471137  T
Q  315 t 315  Q
    |    
T  24471138 t 24471138  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420392
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 241  Q
    ||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24420565 catatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
        |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24420465 ctactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcctt 24420392  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Original strand, 24470959 - 24471234
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470959 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcc 24471058  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
    ||||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24471059 tccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctcca 24471158  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    ||    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24471159 tactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcctt 24471234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 24470605 - 24470849
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| |    
T  24470605 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctc 24470704  T
Q  169 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470705 catctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatc 24470804  T
Q  269 tccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
     |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  24470805 accttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctcc 24470849  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420778
Alignment:
Q  45 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 144  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  145 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 244  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgt 24420847  T
Q  245 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24420846 ttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24420778  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421210
Alignment:
Q  65 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 164  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24421359  T
Q  165 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 264  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421358 cctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24421259  T
Q  265 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcc 24421210  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24421167 - 24420872
Alignment:
Q  20 accaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccg 119  Q
    ||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | |||||||||||||||||     
T  24421167 accaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctcca 24421068  T
Q  120 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 219  Q
    ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || |    
T  24421067 ccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccat 24420968  T
Q  220 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    | || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24420967 ccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctcctt 24420872  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24421015 - 24420751
Alignment:
Q  28 ctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctcc 127  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||    
T  24421015 ctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcacc 24420916  T
Q  128 ttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttca 227  Q
    |||||| ||||| |||||| | || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  || || || |||||     
T  24420915 ttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttct 24420816  T
Q  228 ccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 292  Q
    || ||||| || ||| |||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24420815 cctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24420751  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24421289 - 24421021
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  24421289 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 24421190  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  24421189 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 24421090  T
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  24421089 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 24421021  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24406602 - 24406527
Alignment:
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406602 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406527  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24421435 - 24421165
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24421435 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccc 24421336  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || ||     
T  24421335 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccacct 24421236  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 24421165  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 24470311 - 24470595
Alignment:
Q  21 ccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||||| || || |||  ||| |    
T  24470311 ccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccac 24470410  T
Q  115 ctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcc 214  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||| | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  ||    
T  24470411 caccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacc 24470510  T
Q  215 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 299  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470511 tccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470595  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 294
Target Start/End: Original strand, 24470413 - 24470638
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| |    
T  24470413 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctc 24470512  T
Q  169 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||    
T  24470513 cttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctc 24470612  T
Q  269 tccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    ||| ||||| || || || |||||||    
T  24470613 tccatcaccaccacctccatatgtct 24470638  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470744
Alignment:
Q  48 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 147  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||     
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  148 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 247  Q
    |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || || ||| ||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  248 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 304  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcacc 24470744  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24476976 - 24476790
Alignment:
Q  120 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 219  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |             
T  24476976 ccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccac--------- 24476886  T
Q  220 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24476885 ctccttcaccccctcctccatatgtttatgaatctccacccccaccatctccttcacctcccccatcctatgtctataagtcacatccacctcctt 24476790  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 315
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470515
Alignment:
Q  65 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 164  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24470364  T
Q  165 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 264  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470365 cctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24470464  T
Q  265 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    || | || |||||||| || || ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24470465 caacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcctt 24470515  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24421195 - 24420967
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||    
T  24421195 ctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcc 24421096  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| |||    
T  24421095 accatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccacca 24420996  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24420995 tatgtctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476885
Alignment:
Q  163 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccacc 24476885  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 24470528 - 24470782
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24470528 ctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacc 24470627  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
    ||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24470628 tccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctcca 24470727  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||    
T  24470728 tatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtct 24470782  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24406587 - 24406425
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa------at 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||      |     
T  24406587 ccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406488  T
Q  253 ctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406425  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24420907 - 24420637
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  24420907 ctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctcc 24420808  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     || ||||| || | ||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24420807 accctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24420708  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24420707 tacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24420637  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24421412 - 24421159
Alignment:
Q  21 ccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||  ||| |    
T  24421412 ccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccac 24421313  T
Q  115 ctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcc 214  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  ||    
T  24421312 caccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacc 24421213  T
Q  215 tccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421212 tccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 310
Target Start/End: Original strand, 24470720 - 24470989
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  24470720 ctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctcc 24470819  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||  |||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24470820 accatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcc-tccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24470918  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    || ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24470919 tacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24470989  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 313
Target Start/End: Original strand, 24470288 - 24470561
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24470288 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctccccc 24470387  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  | || ||||| || || ||     
T  24470388 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccc 24470487  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24470561  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24420571 - 24420327
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||||||||    
T  24420571 ctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcc 24420472  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
    ||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||     
T  24420471 tccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctcct 24420372  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctcca 284  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24420371 tatatttacaagtctccacctccaccatctccatcacctcctcca 24420327  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24420979
Alignment:
Q  48 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 147  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  148 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 247  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || |||||||| ||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtata 24421036  T
Q  248 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 304  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  24421035 taaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 24420979  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24477618 - 24477374
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||    
T  24477618 cctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctc 24477519  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||    
T  24477518 catatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccata 24477419  T
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 286  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||| ||  || ||||||||||    
T  24477418 tgtctacaagtctcctcctccaccatcacccccaactcctccacc 24477374  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24420859 - 24420584
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || || || || || || ||  |||| ||||| || || || |||||||| || || || ||    
T  24420859 ctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctccccc 24420760  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||| | |||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||| || ||||||    
T  24420759 accatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctcca 24420660  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 315  Q
    ||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || || |||||||    
T  24420659 tatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctcctt 24420584  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421277
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24421277  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421320
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 258  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  259 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 299  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477491
Alignment:
Q  65 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 164  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  165 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 264  Q
    || ||||| |  || || || |||||| ||||||| || || || | |||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  24477639 cctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccac 24477540  T
Q  265 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24477539 catctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24477491  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 294
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470446
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470446  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470403
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 258  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  259 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 299  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477065
Alignment:
Q  186 cctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 277  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacc 24477065  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24477687 - 24477462
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 168  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||  || || || |||||| || ||||||  |||||||| || |    
T  24477687 ccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctc 24477588  T
Q  169 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24477587 cgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24477488  T
Q  269 tccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24477487 tccttcacctcccccaccatatgtct 24477462  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24477158 - 24477064
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 134  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24406419 - 24406379
Alignment:
Q  300 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406419 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406379  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24406521 - 24406481
Alignment:
Q  300 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406521 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406481  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477630
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 258  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  259 ccccaccatctc 270  Q
    | || |||||||    
T  24477641 cacctccatctc 24477630  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 24471142 - 24471274
Alignment:
Q  127 cttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttc 226  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  24471142 cttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttc 24471241  T
Q  227 accccctcctccatatgtttacaaatctccacc 259  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24471242 accaccgcctccttatatttacaagtctccacc 24471274  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24482255 - 24482187
Alignment:
Q  246 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24482255 tacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  87 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacca 170  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24406614 - 24406499
Alignment:
Q  84 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 183  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  24406614 ccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgc 24406515  T
Q  184 cccctccatatgtcta 199  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  24406514 cacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  84 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 183  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  184 cccctcc 190  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  65 acctccaccttctccatccccaccacctccata 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 97
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  65 acctccaccttctccatccccaccacctccata 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24476769 - 24476729
Alignment:
Q  246 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 286  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24476769 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccacc 24476729  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24477343 - 24477291
Alignment:
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24477343 tgtttacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtct 24477291  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 286
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4681
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctc 4563  T
Q  169 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || || || || || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  269 tccttcacctcctccacc 286  Q
     || ||||| ||||||||    
T  4664 cccatcaccccctccacc 4681  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 310
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4753
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 4684  T
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  4685 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 4753  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 4579 - 4807
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||    
T  4579 ctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcc 4678  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 239  Q
     |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| |||    
T  4679 accatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccacca 4778  T
Q  240 tatgtttacaaatctccacccccaccatc 268  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4779 tatgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4795
Alignment:
Q  45 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  145 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 244  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  245 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 304  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 4795  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Original strand, 4607 - 4864
Alignment:
Q  20 accaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccg 119  Q
    ||||||| | ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | |||||||||||||||||     
T  4607 accaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctcca 4706  T
Q  120 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 219  Q
    ||||| || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || |    
T  4707 ccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccat 4806  T
Q  220 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 277  Q
    | || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4807 ccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4609
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 258  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  259 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 4609  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4564
Alignment:
Q  174 ccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctcctt 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  274 cacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctcc 4564  T

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Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41900062 - 41899872
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  41900062 tacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttaca 41899963  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 292  Q
    ||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41899962 agtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgt 41899872  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899830
Alignment:
Q  48 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 147  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  148 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 247  Q
    | |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgttta 41899869  T
Q  248 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 286  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41899868 caagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41900329 - 41900127
Alignment:
Q  75 tctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccc 174  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41900329 tctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccc 41900230  T
Q  175 cttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 274  Q
    | |||||||| || || |||||  | ||||| || |  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  41900229 catcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttc 41900130  T
Q  275 acc 277  Q
    |||    
T  41900129 acc 41900127  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899826
Alignment:
Q  45 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 144  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  145 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatat 242  Q
    ||   |||| ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899923 atgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41900491 - 41900302
Alignment:
Q  105 aagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 204  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||    
T  41900491 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagt 41900392  T
Q  205 cccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    | || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  41900391 caccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtct 41900302  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900279
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  || || ||||||||||| |    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatct 269  Q
    | || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41899980 - 41899826
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  41899980 ctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcc 41899881  T
Q  140 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 194  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||||    
T  41899880 tccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41900314 - 41900089
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  41900314 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgc 41900215  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 241  Q
    | ||| |  ||| |||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41900214 cttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 41900115  T
Q  242 tgtttacaaatctccacccccaccat 267  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  41900114 tgtttacaaatctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900571
Alignment:
Q  246 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctcc 41900571  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900511
Alignment:
Q  159 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  259 ccccaccatctccttcacc 277  Q
    | || || ||||| |||||    
T  41900529 cacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900511
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcacc 229  Q
    | || ||||  ||||| ||||| |||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41900400 - 41900158
Alignment:
Q  52 tttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatcta 151  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  152 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaa 251  Q
    || ||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||  |||| |||||||| |  || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||     
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaag 41900201  T
Q  252 tctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 294  Q
    || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41900200 tcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 41900158  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900290
Alignment:
Q  54 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 153  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  154 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 210  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 41900290  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41899932 - 41899824
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 139  Q
    ||||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  41899932 ctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctcc 41899833  T
Q  140 tccatatat 148  Q
     ||||||||    
T  41899832 accatatat 41899824  T

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Target: chr1 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  54 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 153  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  154 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
     ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879545
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  202 agtc 205  Q
    ||||    
T  11879542 agtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882439
Alignment:
Q  57 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 155  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11882401  T
Q  156 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882402 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891673
Alignment:
Q  57 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 155  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11891635  T
Q  156 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891636 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 274
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879566
Alignment:
Q  150 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 249  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  250 aatctccacccccaccatctccttc 274  Q
    | || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttc 11879566  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902210
Alignment:
Q  102 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 201  Q
    |||||||| || || || ||| || |||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || |    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  202 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 274  Q
    |||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  54 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 153  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  154 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 190  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 291
Target Start/End: Original strand, 11879349 - 11879418
Alignment:
Q  222 ccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 291  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11879349 ccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatcacctccaccaccttatg 11879418  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 193
Target Start/End: Original strand, 11882411 - 11882535
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 167  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11882411 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11882509  T
Q  168 ccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882510 ccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 193
Target Start/End: Original strand, 11891645 - 11891769
Alignment:
Q  69 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 167  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11891645 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11891743  T
Q  168 ccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891744 ccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 146
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  101 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 146  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 11904952 - 11905104
Alignment:
Q  53 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatcta 151  Q
    ||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||    
T  11904952 ttacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-ta 11905050  T
Q  152 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 205  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  |||||||||    
T  11905051 taagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtc 11905104  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  81 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacc 169  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Original strand, 11902074 - 11902225
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11902074 cctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctc 11902173  T
Q  142 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 193  Q
    | ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902174 cttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 310
Target Start/End: Original strand, 11879464 - 11879554
Alignment:
Q  220 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| |||||    
T  11879464 ctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Original strand, 11902063 - 11902153
Alignment:
Q  223 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 313  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11902063 cttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctcc 11902153  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 11905000 - 11905122
Alignment:
Q  53 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctac 152  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||  |||     
T  11905000 ttacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactat 11905099  T
Q  153 atgtcaccaccaccaccatcccc 175  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  11905100 aagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52821647 - 52821569
Alignment:
Q  40 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 118  Q
    |||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821647 ctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Original strand, 11879526 - 11879626
Alignment:
Q  42 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| ||||||   ||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||||    
T  11879526 cctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctc 11879625  T
Q  142 c 142  Q
    |    
T  11879626 c 11879626  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 286
Target Start/End: Original strand, 11881952 - 11881992
Alignment:
Q  246 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 286  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11881952 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11881992  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 286
Target Start/End: Original strand, 11891186 - 11891226
Alignment:
Q  246 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 286  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11891186 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11891226  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 310
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902198
Alignment:
Q  150 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 249  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  250 aatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 310  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||| |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccacc 11902198  T

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