View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1583_low_6 (Length: 453)

Name: NF1583_low_6
Description: NF1583
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1583_low_6
NF1583_low_6
[»] scaffold0134 (3 HSPs)
scaffold0134 (18-221)||(38040-38243)
scaffold0134 (297-440)||(37821-37964)
scaffold0134 (29-147)||(38307-38425)
[»] chr7 (147 HSPs)
chr7 (18-221)||(456540-456743)
chr7 (18-221)||(27217079-27217282)
chr7 (18-221)||(16232739-16232942)
chr7 (18-221)||(41523136-41523339)
chr7 (18-221)||(41525598-41525801)
chr7 (32-221)||(11393041-11393230)
chr7 (18-221)||(13869567-13869770)
chr7 (18-221)||(15376454-15376656)
chr7 (18-221)||(20384864-20385066)
chr7 (18-221)||(14948863-14949065)
chr7 (18-221)||(16410278-16410480)
chr7 (18-221)||(32125710-32125912)
chr7 (17-221)||(8940498-8940706)
chr7 (18-221)||(11303466-11303669)
chr7 (18-221)||(14269697-14269900)
chr7 (18-221)||(15081582-15081785)
chr7 (18-221)||(18627785-18627987)
chr7 (18-221)||(18640491-18640693)
chr7 (18-220)||(8468955-8469157)
chr7 (20-221)||(21189338-21189538)
chr7 (18-221)||(16213903-16214106)
chr7 (18-220)||(23664693-23664895)
chr7 (297-440)||(456321-456464)
chr7 (297-440)||(11972496-11972639)
chr7 (297-440)||(14949141-14949284)
chr7 (297-440)||(15376732-15376875)
chr7 (18-221)||(16108429-16108632)
chr7 (297-440)||(16232520-16232663)
chr7 (297-440)||(18640272-18640415)
chr7 (297-440)||(20385142-20385285)
chr7 (297-440)||(21189614-21189757)
chr7 (297-436)||(24275175-24275314)
chr7 (18-221)||(29796829-29797032)
chr7 (18-221)||(29800648-29800851)
chr7 (297-440)||(32125491-32125634)
chr7 (297-440)||(41522917-41523060)
chr7 (297-440)||(41525379-41525522)
chr7 (297-439)||(11393306-11393448)
chr7 (298-440)||(16410059-16410201)
chr7 (21-221)||(18430931-18431130)
chr7 (18-221)||(24702457-24702650)
chr7 (18-221)||(24704904-24705097)
chr7 (297-440)||(24702238-24702381)
chr7 (18-221)||(26355722-26355924)
chr7 (18-221)||(26358174-26358376)
chr7 (297-440)||(27216860-27217003)
chr7 (18-220)||(11972768-11972970)
chr7 (297-440)||(16213684-16213827)
chr7 (297-440)||(44116509-44116652)
chr7 (298-440)||(3386333-3386475)
chr7 (297-443)||(18430709-18430855)
chr7 (17-221)||(45847394-45847598)
chr7 (297-440)||(24704688-24704828)
chr7 (297-443)||(13647325-13647472)
chr7 (48-220)||(13841274-13841446)
chr7 (297-440)||(17061934-17062077)
chr7 (315-440)||(13869346-13869472)
chr7 (297-440)||(20110556-20110689)
chr7 (297-436)||(38898395-38898535)
chr7 (321-440)||(48273392-48273512)
chr7 (314-440)||(13831373-13831499)
chr7 (297-440)||(3564338-3564482)
chr7 (297-424)||(12756690-12756817)
chr7 (18-147)||(38897775-38897904)
chr7 (297-443)||(12698831-12698979)
chr7 (297-440)||(18456387-18456530)
chr7 (297-440)||(26356002-26356156)
chr7 (297-440)||(26358454-26358608)
chr7 (297-443)||(9509189-9509336)
chr7 (297-443)||(38227481-38227627)
chr7 (18-147)||(16214170-16214299)
chr7 (20-147)||(10501136-10501263)
chr7 (18-147)||(8940769-8940897)
chr7 (18-147)||(14156626-14156755)
chr7 (18-147)||(14269311-14269440)
chr7 (18-146)||(1856970-1857097)
chr7 (18-146)||(25926870-25926998)
chr7 (42-147)||(14156839-14156944)
chr7 (18-147)||(21189143-21189272)
chr7 (18-141)||(15081389-15081512)
chr7 (18-147)||(8940962-8941091)
chr7 (329-443)||(10589039-10589154)
chr7 (315-443)||(26211995-26212125)
chr7 (18-146)||(13918143-13918272)
chr7 (298-443)||(2280094-2280238)
chr7 (18-114)||(10500968-10501064)
chr7 (297-428)||(15144012-15144143)
chr7 (18-147)||(14269504-14269633)
chr7 (321-443)||(67745-67868)
chr7 (322-443)||(22072913-22073036)
chr7 (154-221)||(11972715-11972781)
chr7 (154-221)||(14269939-14270005)
chr7 (154-221)||(15081824-15081890)
chr7 (150-221)||(38897995-38898066)
chr7 (154-221)||(38898105-38898171)
chr7 (154-221)||(45847637-45847704)
chr7 (65-147)||(45847249-45847331)
chr7 (344-443)||(16386268-16386369)
chr7 (390-443)||(47831807-47831860)
chr7 (154-221)||(8940393-8940459)
chr7 (18-147)||(17985125-17985254)
chr7 (341-443)||(34200786-34200889)
chr7 (344-441)||(40443393-40443490)
chr7 (346-443)||(28505321-28505419)
chr7 (60-148)||(11310239-11310327)
chr7 (322-439)||(18005650-18005768)
chr7 (390-439)||(811199-811248)
chr7 (390-443)||(15754955-15755008)
chr7 (390-443)||(16495402-16495455)
chr7 (390-439)||(44014182-44014231)
chr7 (344-439)||(14932755-14932851)
chr7 (344-439)||(15356190-15356286)
chr7 (344-439)||(15360304-15360400)
chr7 (382-437)||(18154901-18154956)
chr7 (390-443)||(11996095-11996148)
chr7 (322-428)||(16056343-16056449)
chr7 (342-443)||(27847851-27847951)
chr7 (303-425)||(10063798-10063921)
chr7 (390-443)||(16219785-16219835)
chr7 (29-147)||(15376272-15376390)
chr7 (29-147)||(20384682-20384800)
chr7 (385-442)||(2832504-2832561)
chr7 (189-221)||(8468859-8468891)
chr7 (301-443)||(19486722-19486865)
chr7 (397-428)||(1868070-1868101)
chr7 (397-428)||(14044761-14044792)
chr7 (397-428)||(14354791-14354822)
chr7 (297-347)||(15081968-15082019)
chr7 (108-147)||(16410544-16410583)
chr7 (108-147)||(18628051-18628090)
chr7 (108-147)||(18640757-18640796)
chr7 (108-147)||(26355619-26355658)
chr7 (108-147)||(26358071-26358110)
chr7 (150-220)||(13745563-13745633)
chr7 (298-356)||(15113031-15113088)
chr7 (29-115)||(16202766-16202852)
chr7 (385-439)||(19649552-19649606)
chr7 (18-56)||(20110741-20110779)
chr7 (58-127)||(125965-126034)
chr7 (382-439)||(12187019-12187076)
chr7 (192-221)||(13841231-13841260)
chr7 (155-220)||(15119918-15119983)
chr7 (345-443)||(15211456-15211557)
chr7 (382-439)||(17138120-17138177)
chr7 (18-50)||(23461832-23461864)
chr7 (79-147)||(27217346-27217414)
chr7 (156-220)||(38294567-38294631)
[»] chr3 (156 HSPs)
chr3 (18-221)||(45606647-45606850)
chr3 (18-221)||(53301244-53301447)
chr3 (18-221)||(7781087-7781290)
chr3 (18-221)||(46822480-46822683)
chr3 (18-221)||(17463397-17463599)
chr3 (18-221)||(34159545-34159747)
chr3 (18-221)||(27165471-27165674)
chr3 (18-221)||(55476710-55476912)
chr3 (18-221)||(12119394-12119597)
chr3 (18-221)||(15412650-15412853)
chr3 (18-217)||(15977756-15977954)
chr3 (18-221)||(6468875-6469077)
chr3 (18-221)||(8499739-8499942)
chr3 (18-221)||(13544244-13544445)
chr3 (18-221)||(16454021-16454224)
chr3 (18-221)||(10557127-10557330)
chr3 (18-221)||(12567779-12567981)
chr3 (18-221)||(54521041-54521244)
chr3 (18-219)||(13436520-13436721)
chr3 (18-221)||(13153996-13154198)
chr3 (297-440)||(29172602-29172745)
chr3 (297-440)||(9707626-9707769)
chr3 (18-221)||(10247464-10247666)
chr3 (297-440)||(17463178-17463321)
chr3 (297-440)||(28848630-28848773)
chr3 (297-440)||(34159326-34159469)
chr3 (297-440)||(45606926-45607069)
chr3 (297-440)||(55476491-55476634)
chr3 (297-440)||(7781366-7781509)
chr3 (297-440)||(8899094-8899237)
chr3 (297-440)||(16454300-16454443)
chr3 (297-440)||(38961910-38962053)
chr3 (18-221)||(28848362-28848554)
chr3 (297-440)||(13151809-13151953)
chr3 (297-440)||(13154274-13154418)
chr3 (297-441)||(13544024-13544168)
chr3 (18-206)||(24513910-24514098)
chr3 (297-440)||(6469153-6469296)
chr3 (297-440)||(10247742-10247885)
chr3 (297-436)||(12567564-12567703)
chr3 (18-221)||(13151531-13151733)
chr3 (18-220)||(38961578-38961781)
chr3 (18-220)||(41124159-41124361)
chr3 (18-187)||(16282498-16282667)
chr3 (297-438)||(16282830-16282971)
chr3 (297-440)||(17446674-17446816)
chr3 (297-440)||(17672626-17672769)
chr3 (18-221)||(29544582-29544785)
chr3 (297-440)||(50242822-50242965)
chr3 (18-220)||(25237063-25237265)
chr3 (297-438)||(41123892-41124030)
chr3 (64-221)||(12305364-12305521)
chr3 (309-440)||(15977515-15977646)
chr3 (18-220)||(17444504-17444706)
chr3 (307-440)||(12119753-12119887)
chr3 (307-440)||(15412429-15412563)
chr3 (18-164)||(20629932-20630078)
chr3 (18-220)||(25229476-25229678)
chr3 (297-424)||(53070672-53070799)
chr3 (329-440)||(55500942-55501053)
chr3 (307-440)||(8499518-8499652)
chr3 (298-440)||(36166598-36166739)
chr3 (297-443)||(14972854-14973001)
chr3 (297-440)||(40213695-40213838)
chr3 (297-443)||(43550497-43550644)
chr3 (297-443)||(25476359-25476506)
chr3 (298-440)||(21618449-21618590)
chr3 (18-146)||(15465448-15465576)
chr3 (18-153)||(10379614-10379749)
chr3 (297-443)||(17487856-17488003)
chr3 (297-443)||(17499338-17499485)
chr3 (329-443)||(18438534-18438649)
chr3 (341-440)||(44494809-44494908)
chr3 (315-443)||(12399209-12399338)
chr3 (315-443)||(23083353-23083482)
chr3 (18-147)||(27165738-27165867)
chr3 (340-440)||(10556985-10557085)
chr3 (297-443)||(13442274-13442421)
chr3 (297-443)||(20698409-20698556)
chr3 (297-443)||(26686887-26687034)
chr3 (297-443)||(43840932-43841079)
chr3 (18-144)||(8500009-8500135)
chr3 (18-147)||(14567432-14567561)
chr3 (18-147)||(38961385-38961514)
chr3 (18-147)||(41124425-41124554)
chr3 (297-425)||(42386428-42386557)
chr3 (18-147)||(53301051-53301180)
chr3 (18-147)||(55319044-55319173)
chr3 (297-440)||(24153183-24153326)
chr3 (342-440)||(17737236-17737337)
chr3 (21-147)||(55318854-55318980)
chr3 (18-147)||(10557394-10557523)
chr3 (18-147)||(46822747-46822876)
chr3 (18-146)||(26055005-26055133)
chr3 (18-147)||(13937520-13937649)
chr3 (297-429)||(14572603-14572735)
chr3 (26-148)||(36528447-36528569)
chr3 (297-443)||(11424737-11424880)
chr3 (297-429)||(14576807-14576939)
chr3 (18-146)||(5223677-5223805)
chr3 (18-147)||(16282305-16282434)
chr3 (18-147)||(20629739-20629868)
chr3 (153-221)||(9707482-9707550)
chr3 (300-440)||(27165250-27165391)
chr3 (154-221)||(8899313-8899379)
chr3 (154-221)||(16282688-16282754)
chr3 (154-221)||(17444693-17444759)
chr3 (154-221)||(38961768-38961834)
chr3 (300-440)||(53301527-53301669)
chr3 (37-147)||(16358234-16358344)
chr3 (297-443)||(24340697-24340844)
chr3 (154-221)||(25237010-25237076)
chr3 (154-221)||(41124106-41124172)
chr3 (42-148)||(3264325-3264431)
chr3 (18-147)||(17444311-17444440)
chr3 (387-440)||(45577947-45578000)
chr3 (299-425)||(23274705-23274832)
chr3 (154-221)||(11913927-11913993)
chr3 (382-440)||(28194693-28194752)
chr3 (329-443)||(13210333-13210448)
chr3 (329-443)||(14234487-14234602)
chr3 (297-424)||(52523701-52523831)
chr3 (322-443)||(15470927-15471046)
chr3 (18-147)||(17393201-17393330)
chr3 (318-429)||(32307691-32307802)
chr3 (315-441)||(46822267-46822394)
chr3 (382-439)||(12174318-12174376)
chr3 (390-439)||(16097332-16097381)
chr3 (83-147)||(15007988-15008052)
chr3 (322-439)||(16103784-16103901)
chr3 (345-442)||(30029841-30029939)
chr3 (382-439)||(49668135-49668193)
chr3 (329-441)||(12511059-12511172)
chr3 (382-442)||(14665398-14665458)
chr3 (297-443)||(37642239-37642386)
chr3 (382-439)||(9512924-9512982)
chr3 (382-439)||(9520899-9520957)
chr3 (29-147)||(34159811-34159929)
chr3 (382-439)||(856140-856197)
chr3 (297-362)||(2051173-2051238)
chr3 (385-442)||(14668554-14668611)
chr3 (382-439)||(23077537-23077594)
chr3 (382-422)||(13919350-13919390)
chr3 (79-147)||(17463663-17463731)
chr3 (59-127)||(30152450-30152518)
chr3 (322-424)||(37251165-37251270)
chr3 (108-147)||(55476976-55477015)
chr3 (17-71)||(15007868-15007922)
chr3 (156-214)||(15025934-15025992)
chr3 (385-439)||(15878114-15878168)
chr3 (58-127)||(25058298-25058367)
chr3 (58-127)||(49231768-49231837)
chr3 (297-369)||(22147499-22147571)
chr3 (156-220)||(25201333-25201397)
chr3 (391-439)||(26196500-26196548)
chr3 (18-54)||(36528348-36528384)
[»] chr2 (136 HSPs)
chr2 (18-221)||(39682532-39682735)
chr2 (18-221)||(571616-571819)
chr2 (18-221)||(18809162-18809364)
chr2 (18-221)||(23711754-23711956)
chr2 (18-221)||(23131081-23131284)
chr2 (18-221)||(23133548-23133751)
chr2 (18-221)||(34402262-34402465)
chr2 (19-221)||(32039240-32039441)
chr2 (18-221)||(28577318-28577520)
chr2 (18-221)||(20261438-20261641)
chr2 (18-221)||(23706957-23707160)
chr2 (17-221)||(24529286-24529490)
chr2 (18-221)||(24918359-24918562)
chr2 (18-221)||(26505598-26505800)
chr2 (18-221)||(26508076-26508278)
chr2 (18-221)||(23709273-23709475)
chr2 (18-221)||(24897936-24898138)
chr2 (18-221)||(24905373-24905575)
chr2 (18-214)||(45027645-45027840)
chr2 (18-221)||(10684503-10684706)
chr2 (18-221)||(24671244-24671447)
chr2 (18-221)||(24900419-24900621)
chr2 (18-221)||(24902896-24903098)
chr2 (18-221)||(24907848-24908050)
chr2 (18-220)||(22105685-22105887)
chr2 (297-440)||(18808943-18809086)
chr2 (297-440)||(23130862-23131005)
chr2 (297-440)||(23133329-23133472)
chr2 (297-440)||(23135590-23135733)
chr2 (297-440)||(23709551-23709694)
chr2 (297-440)||(23712032-23712175)
chr2 (18-221)||(24642489-24642692)
chr2 (18-221)||(24681663-24681866)
chr2 (297-440)||(26505379-26505522)
chr2 (297-440)||(26507857-26508000)
chr2 (297-440)||(34402541-34402684)
chr2 (297-440)||(39682313-39682456)
chr2 (297-442)||(32214940-32215085)
chr2 (297-440)||(571397-571540)
chr2 (297-440)||(6725995-6726138)
chr2 (297-440)||(24367774-24367917)
chr2 (17-221)||(23135809-23136002)
chr2 (297-437)||(21155079-21155219)
chr2 (297-440)||(24898214-24898358)
chr2 (297-440)||(24900697-24900841)
chr2 (297-440)||(24903174-24903318)
chr2 (297-440)||(24905651-24905795)
chr2 (297-440)||(24908126-24908270)
chr2 (297-440)||(32039517-32039660)
chr2 (18-220)||(24368046-24368248)
chr2 (297-440)||(28577099-28577242)
chr2 (18-221)||(38967698-38967901)
chr2 (297-440)||(45029873-45030016)
chr2 (297-438)||(43137301-43137442)
chr2 (297-440)||(22105412-22105556)
chr2 (21-220)||(6726267-6726466)
chr2 (42-221)||(25616400-25616579)
chr2 (18-220)||(21154748-21154950)
chr2 (18-220)||(41523813-41524015)
chr2 (17-221)||(32214670-32214864)
chr2 (297-440)||(24529547-24529691)
chr2 (297-440)||(38967374-38967518)
chr2 (297-443)||(22337115-22337262)
chr2 (297-443)||(23060513-23060660)
chr2 (297-443)||(23076442-23076589)
chr2 (18-147)||(24529094-24529223)
chr2 (18-147)||(6726533-6726662)
chr2 (18-147)||(21154555-21154684)
chr2 (18-147)||(24918626-24918755)
chr2 (18-147)||(41523620-41523749)
chr2 (297-443)||(22731208-22731355)
chr2 (18-125)||(23931775-23931882)
chr2 (20-147)||(24368312-24368439)
chr2 (17-147)||(22105951-22106081)
chr2 (18-143)||(41523427-41523552)
chr2 (297-443)||(22738154-22738300)
chr2 (18-147)||(23709080-23709209)
chr2 (344-443)||(38136-38235)
chr2 (315-440)||(298806-298933)
chr2 (362-437)||(24643034-24643109)
chr2 (297-443)||(23285865-23286008)
chr2 (18-147)||(21154362-21154491)
chr2 (18-147)||(24681930-24682059)
chr2 (297-443)||(23660023-23660169)
chr2 (18-145)||(45027452-45027579)
chr2 (18-147)||(23706573-23706702)
chr2 (18-147)||(24671511-24671640)
chr2 (17-145)||(32214476-32214604)
chr2 (297-443)||(23654360-23654507)
chr2 (18-144)||(23931949-23932075)
chr2 (301-443)||(23103375-23103516)
chr2 (18-142)||(23706765-23706889)
chr2 (154-221)||(6726214-6726280)
chr2 (382-443)||(23040249-23040310)
chr2 (297-443)||(19671830-19671976)
chr2 (154-221)||(21154937-21155003)
chr2 (154-221)||(22105632-22105698)
chr2 (154-221)||(23707199-23707265)
chr2 (154-221)||(24367993-24368059)
chr2 (154-221)||(24681558-24681624)
chr2 (154-221)||(38967593-38967659)
chr2 (297-355)||(24642875-24642933)
chr2 (367-443)||(8946657-8946734)
chr2 (154-221)||(24642731-24642797)
chr2 (158-221)||(24671139-24671201)
chr2 (154-221)||(24918254-24918320)
chr2 (322-438)||(28405981-28406099)
chr2 (342-443)||(20309108-20309208)
chr2 (297-443)||(23708593-23708738)
chr2 (382-439)||(7679589-7679647)
chr2 (297-424)||(7707-7835)
chr2 (82-146)||(31345490-31345554)
chr2 (315-436)||(25616192-25616314)
chr2 (382-442)||(22134266-22134326)
chr2 (392-443)||(23072019-23072070)
chr2 (322-439)||(25175854-25175972)
chr2 (390-428)||(18786971-18787009)
chr2 (297-424)||(32451902-32452031)
chr2 (154-198)||(41524002-41524045)
chr2 (57-127)||(67339-67409)
chr2 (29-147)||(18809428-18809546)
chr2 (156-220)||(21368375-21368439)
chr2 (382-422)||(23287384-23287424)
chr2 (79-147)||(23711622-23711690)
chr2 (95-147)||(24642373-24642425)
chr2 (382-422)||(26392403-26392443)
chr2 (79-147)||(26505864-26505932)
chr2 (79-147)||(26508342-26508410)
chr2 (79-147)||(27920373-27920441)
chr2 (79-147)||(32039107-32039175)
chr2 (108-147)||(23131347-23131386)
chr2 (322-424)||(23207296-23207401)
chr2 (108-147)||(34402160-34402199)
chr2 (29-147)||(28577584-28577702)
chr2 (58-127)||(34823750-34823819)
chr2 (156-220)||(23799467-23799531)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (18-221)||(21474827-21475030)
chr1 (18-221)||(13989085-13989287)
chr1 (18-221)||(21923032-21923234)
chr1 (18-221)||(16362137-16362340)
chr1 (18-221)||(15859749-15859951)
chr1 (18-221)||(21840986-21841188)
chr1 (297-440)||(13988866-13989009)
chr1 (297-440)||(21923310-21923453)
chr1 (18-221)||(23593474-23593677)
chr1 (297-440)||(23593754-23593897)
chr1 (17-220)||(27161326-27161529)
chr1 (18-221)||(16274996-16275200)
chr1 (297-440)||(21475106-21475249)
chr1 (297-441)||(21840766-21840910)
chr1 (297-440)||(29298137-29298279)
chr1 (297-440)||(29776688-29776831)
chr1 (18-220)||(29298461-29298663)
chr1 (18-220)||(29776960-29777162)
chr1 (18-220)||(31612585-31612787)
chr1 (297-440)||(31612313-31612456)
chr1 (18-220)||(22122755-22122957)
chr1 (297-442)||(16361915-16362060)
chr1 (297-443)||(13212880-13213027)
chr1 (297-440)||(21707167-21707310)
chr1 (297-440)||(21711709-21711852)
chr1 (297-446)||(21342090-21342240)
chr1 (18-174)||(13227129-13227285)
chr1 (297-440)||(21346961-21347105)
chr1 (297-440)||(22123086-22123230)
chr1 (18-220)||(22050577-22050779)
chr1 (297-443)||(45574861-45575008)
chr1 (297-440)||(433012-433153)
chr1 (303-446)||(15860033-15860177)
chr1 (297-440)||(16275382-16275526)
chr1 (18-174)||(29535317-29535473)
chr1 (297-442)||(50210187-50210333)
chr1 (297-437)||(40389157-40389298)
chr1 (318-440)||(34509783-34509906)
chr1 (297-443)||(27250703-27250850)
chr1 (18-147)||(29298727-29298856)
chr1 (18-147)||(31612851-31612980)
chr1 (18-147)||(31613044-31613173)
chr1 (297-443)||(22532269-22532416)
chr1 (18-140)||(9044745-9044867)
chr1 (18-147)||(15859543-15859672)
chr1 (18-147)||(29777226-29777355)
chr1 (18-147)||(22122561-22122691)
chr1 (18-147)||(16274803-16274932)
chr1 (18-147)||(27161134-27161263)
chr1 (342-443)||(20847173-20847275)
chr1 (315-442)||(22468688-22468816)
chr1 (18-137)||(40129387-40129506)
chr1 (315-443)||(21026680-21026809)
chr1 (154-221)||(16275239-16275306)
chr1 (154-221)||(22050766-22050832)
chr1 (154-221)||(29776907-29776973)
chr1 (18-147)||(16401407-16401536)
chr1 (382-442)||(20454613-20454673)
chr1 (149-221)||(31612532-31612603)
chr1 (154-221)||(29298355-29298421)
chr1 (297-424)||(21861544-21861672)
chr1 (297-424)||(21896230-21896358)
chr1 (154-221)||(22122944-22123010)
chr1 (156-221)||(27161518-27161582)
chr1 (315-442)||(20135188-20135316)
chr1 (77-147)||(10812612-10812682)
chr1 (318-429)||(21754059-21754170)
chr1 (297-424)||(35261055-35261180)
chr1 (385-439)||(21714546-21714600)
chr1 (322-439)||(22921868-22921986)
chr1 (382-443)||(14295610-14295672)
chr1 (297-443)||(33681010-33681153)
chr1 (18-72)||(43543269-43543323)
chr1 (390-428)||(52928038-52928076)
chr1 (390-427)||(20918620-20918657)
chr1 (297-428)||(16758664-16758797)
chr1 (390-443)||(22237630-22237680)
chr1 (29-147)||(13989351-13989469)
chr1 (154-220)||(29298408-29298474)
chr1 (382-443)||(38801447-38801508)
chr1 (390-439)||(20248283-20248332)
chr1 (385-442)||(24783155-24783212)
chr1 (58-118)||(16655942-16656002)
chr1 (382-439)||(42865273-42865330)
chr1 (368-439)||(21161720-21161792)
[»] scaffold0444 (3 HSPs)
scaffold0444 (18-221)||(13611-13814)
scaffold0444 (297-440)||(13392-13535)
scaffold0444 (106-147)||(13878-13919)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (18-221)||(20966-21169)
scaffold0254 (297-440)||(20747-20890)
[»] scaffold0230 (5 HSPs)
scaffold0230 (18-221)||(14166-14369)
scaffold0230 (18-221)||(23271-23474)
scaffold0230 (297-440)||(13947-14090)
scaffold0230 (17-147)||(22917-23047)
scaffold0230 (65-147)||(23125-23207)
[»] chr6 (123 HSPs)
chr6 (18-221)||(8055248-8055451)
chr6 (18-221)||(1540652-1540854)
chr6 (18-221)||(18334333-18334535)
chr6 (18-221)||(24422766-24422968)
chr6 (18-221)||(33862013-33862215)
chr6 (18-221)||(33864497-33864699)
chr6 (18-221)||(12742536-12742739)
chr6 (18-221)||(1598276-1598478)
chr6 (17-221)||(19847711-19847911)
chr6 (18-221)||(2290921-2291123)
chr6 (18-221)||(17377588-17377791)
chr6 (18-221)||(22782446-22782648)
chr6 (18-221)||(26924381-26924583)
chr6 (18-221)||(30676450-30676653)
chr6 (18-221)||(25688721-25688924)
chr6 (18-221)||(34963592-34963795)
chr6 (18-206)||(25535641-25535829)
chr6 (297-440)||(12742317-12742460)
chr6 (297-440)||(18334611-18334754)
chr6 (18-221)||(18914151-18914354)
chr6 (297-440)||(19005046-19005189)
chr6 (297-440)||(19858938-19859081)
chr6 (297-440)||(22782227-22782370)
chr6 (297-440)||(24422547-24422690)
chr6 (18-217)||(31630281-31630480)
chr6 (297-440)||(33861794-33861937)
chr6 (297-440)||(33864278-33864421)
chr6 (18-221)||(19858663-19858862)
chr6 (297-442)||(30676729-30676874)
chr6 (297-440)||(2291199-2291342)
chr6 (297-440)||(8055029-8055172)
chr6 (18-221)||(23992642-23992844)
chr6 (297-440)||(25754809-25754952)
chr6 (297-440)||(26924659-26924802)
chr6 (297-442)||(34963371-34963516)
chr6 (18-221)||(28289077-28289278)
chr6 (297-440)||(1540930-1541073)
chr6 (18-220)||(19005371-19005573)
chr6 (298-440)||(25656629-25656771)
chr6 (297-440)||(1595549-1595692)
chr6 (297-440)||(3852036-3852179)
chr6 (298-440)||(25688502-25688644)
chr6 (297-437)||(16448545-16448686)
chr6 (297-440)||(20556913-20557054)
chr6 (297-424)||(18456735-18456862)
chr6 (297-424)||(18461895-18462022)
chr6 (65-221)||(12942420-12942576)
chr6 (297-443)||(25629329-25629476)
chr6 (297-443)||(29060540-29060687)
chr6 (297-443)||(17287770-17287917)
chr6 (297-443)||(20593773-20593920)
chr6 (321-442)||(18409825-18409947)
chr6 (18-143)||(18914615-18914740)
chr6 (297-443)||(19303515-19303661)
chr6 (18-147)||(1905-2034)
chr6 (18-147)||(8864-8993)
chr6 (315-443)||(16496244-16496373)
chr6 (18-147)||(19005637-19005766)
chr6 (297-443)||(20360934-20361081)
chr6 (21-147)||(1598542-1598668)
chr6 (331-443)||(20076700-20076812)
chr6 (297-443)||(22780201-22780348)
chr6 (29-143)||(26924199-26924313)
chr6 (344-443)||(20638304-20638404)
chr6 (18-146)||(23415258-23415386)
chr6 (17-147)||(112-242)
chr6 (17-147)||(25688988-25689118)
chr6 (18-147)||(19847519-19847648)
chr6 (297-428)||(25644335-25644468)
chr6 (344-424)||(18821866-18821946)
chr6 (18-146)||(27557016-27557144)
chr6 (18-147)||(1598735-1598864)
chr6 (18-143)||(18914422-18914547)
chr6 (18-147)||(25689181-25689310)
chr6 (18-147)||(30676257-30676386)
chr6 (20-127)||(31630090-31630197)
chr6 (154-221)||(31630523-31630590)
chr6 (18-100)||(15892149-15892231)
chr6 (297-443)||(20109140-20109285)
chr6 (382-443)||(25714417-25714478)
chr6 (107-221)||(15875630-15875734)
chr6 (28-147)||(25737128-25737247)
chr6 (154-220)||(19005266-19005331)
chr6 (154-221)||(18914046-18914112)
chr6 (382-443)||(27333277-27333339)
chr6 (382-443)||(27394017-27394079)
chr6 (57-147)||(22981326-22981416)
chr6 (57-147)||(23806992-23807082)
chr6 (297-441)||(19847968-19848114)
chr6 (322-443)||(23019408-23019528)
chr6 (396-443)||(22080799-22080846)
chr6 (344-443)||(35245586-35245684)
chr6 (154-220)||(15875526-15875591)
chr6 (390-443)||(1561303-1561356)
chr6 (390-443)||(28496539-28496592)
chr6 (390-443)||(29808950-29809003)
chr6 (382-428)||(9098573-9098620)
chr6 (18-85)||(17883238-17883305)
chr6 (331-441)||(23992429-23992540)
chr6 (329-443)||(16920638-16920751)
chr6 (390-439)||(19652199-19652248)
chr6 (297-443)||(8227485-8227632)
chr6 (329-428)||(19668386-19668488)
chr6 (390-424)||(11185524-11185558)
chr6 (29-147)||(18334151-18334269)
chr6 (382-443)||(22831503-22831565)
chr6 (29-147)||(24423032-24423150)
chr6 (172-221)||(25656848-25656897)
chr6 (402-446)||(19008799-19008843)
chr6 (382-422)||(33443068-33443108)
chr6 (79-147)||(33864763-33864831)
chr6 (385-439)||(18907111-18907165)
chr6 (385-439)||(19862978-19863032)
chr6 (385-439)||(19873120-19873174)
chr6 (382-439)||(21766695-21766752)
chr6 (355-439)||(22432249-22432334)
chr6 (355-439)||(22438799-22438884)
chr6 (382-429)||(4185880-4185928)
chr6 (345-443)||(25603406-25603506)
chr6 (345-443)||(25611744-25611844)
chr6 (18-54)||(25737028-25737064)
chr6 (79-147)||(26924056-26924124)
chr6 (156-220)||(35056717-35056781)
[»] chr4 (118 HSPs)
chr4 (18-221)||(29267572-29267775)
chr4 (18-221)||(15118093-15118295)
chr4 (18-219)||(52872813-52873014)
chr4 (18-221)||(44615507-44615710)
chr4 (18-221)||(15534400-15534603)
chr4 (18-221)||(50222080-50222282)
chr4 (18-221)||(14970447-14970650)
chr4 (17-221)||(362399-362603)
chr4 (17-221)||(3515226-3515430)
chr4 (18-221)||(44772824-44773026)
chr4 (297-440)||(18215293-18215436)
chr4 (18-221)||(19242919-19243122)
chr4 (18-221)||(36038089-36038292)
chr4 (18-221)||(49547514-49547717)
chr4 (20-221)||(19617809-19618010)
chr4 (297-440)||(12326-12469)
chr4 (297-440)||(15118371-15118514)
chr4 (297-440)||(52312510-52312653)
chr4 (297-446)||(19242693-19242842)
chr4 (297-440)||(1837528-1837671)
chr4 (297-440)||(3515007-3515150)
chr4 (18-221)||(7640927-7641129)
chr4 (18-221)||(15495914-15496117)
chr4 (297-440)||(18239438-18239581)
chr4 (297-440)||(44615288-44615431)
chr4 (297-440)||(44773106-44773249)
chr4 (297-440)||(50222358-50222501)
chr4 (18-187)||(11995-12164)
chr4 (18-219)||(14048798-14048999)
chr4 (297-442)||(19618191-19618336)
chr4 (18-221)||(14746252-14746455)
chr4 (297-440)||(23803284-23803427)
chr4 (297-440)||(51463887-51464030)
chr4 (18-220)||(52312782-52312983)
chr4 (297-440)||(44102214-44102357)
chr4 (17-221)||(19857807-19858001)
chr4 (298-442)||(14970727-14970871)
chr4 (297-436)||(15355343-15355483)
chr4 (297-440)||(44928898-44929042)
chr4 (18-221)||(1837260-1837452)
chr4 (297-440)||(12610950-12611086)
chr4 (297-424)||(21815604-21815731)
chr4 (298-440)||(54798729-54798872)
chr4 (322-440)||(14280316-14280434)
chr4 (303-443)||(15367690-15367831)
chr4 (303-443)||(15370018-15370159)
chr4 (303-443)||(15402703-15402844)
chr4 (303-443)||(15371202-15371343)
chr4 (303-443)||(15373483-15373624)
chr4 (303-443)||(16223532-16223673)
chr4 (297-440)||(7641211-7641344)
chr4 (297-443)||(7798774-7798921)
chr4 (297-437)||(20149832-20149973)
chr4 (297-443)||(7088877-7089024)
chr4 (297-438)||(14038653-14038795)
chr4 (297-440)||(16377497-16377639)
chr4 (18-147)||(18214751-18214880)
chr4 (331-443)||(52873375-52873488)
chr4 (101-221)||(18214992-18215112)
chr4 (297-443)||(7893703-7893850)
chr4 (297-443)||(12902757-12902904)
chr4 (18-147)||(362859-362988)
chr4 (298-440)||(8574844-8574985)
chr4 (17-147)||(52872619-52872749)
chr4 (18-147)||(3515493-3515622)
chr4 (297-441)||(22636437-22636582)
chr4 (18-147)||(52313240-52313369)
chr4 (18-145)||(362668-362795)
chr4 (297-443)||(16270210-16270356)
chr4 (297-443)||(44052829-44052976)
chr4 (37-147)||(14185621-14185731)
chr4 (18-147)||(14970254-14970383)
chr4 (18-147)||(15495721-15495850)
chr4 (297-443)||(6899891-6900037)
chr4 (18-147)||(19617614-19617743)
chr4 (18-147)||(19858064-19858193)
chr4 (18-147)||(52313047-52313176)
chr4 (130-221)||(15355071-15355162)
chr4 (297-443)||(16239944-16240090)
chr4 (18-147)||(14746059-14746188)
chr4 (108-221)||(18239250-18239362)
chr4 (358-443)||(3096293-3096379)
chr4 (154-221)||(19857701-19857768)
chr4 (315-436)||(23374351-23374473)
chr4 (297-441)||(22353835-22353980)
chr4 (154-221)||(12184-12250)
chr4 (154-221)||(18215151-18215217)
chr4 (154-220)||(15355201-15355266)
chr4 (297-424)||(13825-13953)
chr4 (154-221)||(52312729-52312795)
chr4 (17-166)||(30147189-30147338)
chr4 (390-443)||(39706356-39706409)
chr4 (154-221)||(14746494-14746560)
chr4 (154-221)||(15496948-15497014)
chr4 (154-221)||(19618049-19618115)
chr4 (154-221)||(52873055-52873121)
chr4 (29-147)||(22725284-22725401)
chr4 (297-428)||(43198527-43198661)
chr4 (297-428)||(52243168-52243302)
chr4 (382-443)||(15551817-15551879)
chr4 (318-439)||(12774011-12774132)
chr4 (344-443)||(14053323-14053422)
chr4 (382-443)||(17046487-17046549)
chr4 (329-428)||(12288214-12288316)
chr4 (344-424)||(6190481-6190563)
chr4 (77-143)||(14745925-14745991)
chr4 (30-127)||(14951270-14951367)
chr4 (382-439)||(8846360-8846418)
chr4 (29-147)||(15117911-15118029)
chr4 (300-369)||(15464908-15464977)
chr4 (18-54)||(12778423-12778459)
chr4 (57-125)||(55377225-55377293)
chr4 (58-127)||(14995644-14995713)
chr4 (385-442)||(20157522-20157579)
chr4 (110-147)||(44772723-44772760)
chr4 (189-221)||(362304-362336)
chr4 (382-422)||(17333298-17333338)
chr4 (341-424)||(46640472-46640558)
[»] chr5 (107 HSPs)
chr5 (18-221)||(38619655-38619858)
chr5 (18-221)||(17516904-17517107)
chr5 (18-221)||(2154372-2154575)
chr5 (18-221)||(20909231-20909433)
chr5 (18-221)||(264509-264711)
chr5 (18-221)||(20901661-20901864)
chr5 (18-221)||(10732681-10732883)
chr5 (18-221)||(23064732-23064935)
chr5 (18-221)||(39245355-39245557)
chr5 (18-221)||(42245106-42245308)
chr5 (18-221)||(39363603-39363806)
chr5 (18-221)||(37804643-37804846)
chr5 (297-440)||(264787-264930)
chr5 (297-440)||(10732959-10733102)
chr5 (18-221)||(29346199-29346401)
chr5 (297-440)||(39363384-39363527)
chr5 (297-440)||(20909012-20909155)
chr5 (297-440)||(29329934-29330077)
chr5 (18-221)||(29348672-29348874)
chr5 (18-221)||(29351145-29351347)
chr5 (297-440)||(42245384-42245527)
chr5 (18-220)||(20917587-20917789)
chr5 (18-220)||(32027665-32027867)
chr5 (297-440)||(29345980-29346123)
chr5 (297-440)||(39245136-39245279)
chr5 (297-440)||(36154802-36154942)
chr5 (18-221)||(9776577-9776780)
chr5 (297-440)||(11581218-11581361)
chr5 (297-440)||(29348453-29348596)
chr5 (297-440)||(29350926-29351069)
chr5 (297-440)||(32027393-32027536)
chr5 (297-437)||(18319052-18319193)
chr5 (297-440)||(20902027-20902172)
chr5 (297-440)||(2154632-2154776)
chr5 (18-220)||(29330203-29330404)
chr5 (297-440)||(10775694-10775838)
chr5 (299-440)||(20917973-20918110)
chr5 (307-440)||(38619434-38619568)
chr5 (297-440)||(31061068-31061212)
chr5 (307-439)||(23064512-23064645)
chr5 (297-437)||(24067110-24067251)
chr5 (297-443)||(9077952-9078099)
chr5 (297-443)||(23390470-23390617)
chr5 (297-443)||(25421532-25421679)
chr5 (340-443)||(21997551-21997655)
chr5 (318-440)||(24529223-24529346)
chr5 (17-147)||(17516517-17516647)
chr5 (315-443)||(21729056-21729185)
chr5 (315-443)||(21808381-21808510)
chr5 (297-443)||(1096467-1096614)
chr5 (298-440)||(22412187-22412329)
chr5 (301-443)||(24493569-24493711)
chr5 (18-147)||(32028124-32028254)
chr5 (344-443)||(8286863-8286964)
chr5 (18-147)||(20901468-20901597)
chr5 (297-443)||(13025311-13025457)
chr5 (297-443)||(13095495-13095641)
chr5 (297-443)||(25431395-25431541)
chr5 (17-147)||(32028511-32028641)
chr5 (22-147)||(295826-295951)
chr5 (18-147)||(29330468-29330597)
chr5 (18-147)||(296015-296144)
chr5 (18-147)||(17516711-17516840)
chr5 (18-147)||(20917394-20917523)
chr5 (18-147)||(2154179-2154308)
chr5 (18-147)||(32028318-32028447)
chr5 (154-221)||(20901903-20901970)
chr5 (315-443)||(22075018-22075148)
chr5 (154-221)||(29330150-29330216)
chr5 (154-221)||(32027612-32027678)
chr5 (154-221)||(20917829-20917895)
chr5 (382-443)||(21329556-21329618)
chr5 (344-443)||(21292992-21293090)
chr5 (18-147)||(32027931-32028060)
chr5 (297-424)||(22144068-22144196)
chr5 (298-385)||(20766095-20766181)
chr5 (381-440)||(20806845-20806904)
chr5 (334-443)||(21502167-21502277)
chr5 (382-443)||(19660894-19660956)
chr5 (329-424)||(20026945-20027043)
chr5 (345-433)||(18418590-18418678)
chr5 (297-424)||(37723922-37724048)
chr5 (382-439)||(22959591-22959649)
chr5 (382-443)||(36314577-36314639)
chr5 (390-439)||(21565546-21565595)
chr5 (322-443)||(26012034-26012154)
chr5 (315-441)||(17517193-17517320)
chr5 (385-439)||(26704075-26704129)
chr5 (385-439)||(26973808-26973862)
chr5 (390-443)||(19668898-19668951)
chr5 (72-147)||(264370-264445)
chr5 (382-424)||(26740705-26740747)
chr5 (57-127)||(27183208-27183278)
chr5 (382-427)||(26732892-26732937)
chr5 (79-147)||(20909497-20909565)
chr5 (344-439)||(21873254-21873350)
chr5 (58-118)||(28901495-28901555)
chr5 (58-118)||(28937890-28937950)
chr5 (108-147)||(39245621-39245660)
chr5 (108-147)||(39363869-39363908)
chr5 (159-221)||(18743974-18744036)
chr5 (154-220)||(20917776-20917842)
chr5 (57-127)||(23506503-23506573)
chr5 (58-127)||(1220384-1220453)
chr5 (58-127)||(10778832-10778901)
chr5 (382-439)||(22032323-22032380)
chr5 (379-439)||(23501412-23501472)
[»] chr8 (130 HSPs)
chr8 (18-221)||(1484621-1484823)
chr8 (18-221)||(14409185-14409387)
chr8 (18-221)||(5853033-5853235)
chr8 (18-221)||(4483499-4483702)
chr8 (18-221)||(27472157-27472360)
chr8 (18-221)||(15070779-15070982)
chr8 (18-221)||(24485784-24485987)
chr8 (18-221)||(14823994-14824196)
chr8 (18-221)||(32121947-32122150)
chr8 (18-221)||(16401665-16401868)
chr8 (18-221)||(16413056-16413259)
chr8 (18-221)||(18677805-18678008)
chr8 (18-221)||(20045936-20046138)
chr8 (18-221)||(22001972-22002174)
chr8 (18-220)||(38549745-38549947)
chr8 (18-219)||(25657893-25658094)
chr8 (18-221)||(4542114-4542316)
chr8 (297-440)||(14409463-14409606)
chr8 (18-219)||(16198115-16198316)
chr8 (297-440)||(1484402-1484545)
chr8 (297-440)||(5853311-5853454)
chr8 (297-436)||(16413335-16413474)
chr8 (297-440)||(20403227-20403370)
chr8 (297-440)||(22001753-22001896)
chr8 (297-440)||(41598188-41598331)
chr8 (18-210)||(24048841-24049032)
chr8 (297-440)||(4483281-4483423)
chr8 (297-440)||(15203250-15203393)
chr8 (297-440)||(20046214-20046357)
chr8 (18-221)||(1326672-1326875)
chr8 (297-440)||(4542392-4542535)
chr8 (18-220)||(15202919-15203121)
chr8 (18-220)||(20403499-20403701)
chr8 (297-440)||(19896265-19896411)
chr8 (18-178)||(19936648-19936808)
chr8 (21-220)||(45290385-45290584)
chr8 (297-440)||(14823774-14823916)
chr8 (18-220)||(19896541-19896743)
chr8 (297-436)||(45290713-45290853)
chr8 (303-446)||(19937030-19937174)
chr8 (297-443)||(16092316-16092463)
chr8 (297-446)||(6759255-6759402)
chr8 (297-424)||(19801401-19801527)
chr8 (307-427)||(15070571-15070692)
chr8 (297-440)||(25484294-25484430)
chr8 (297-442)||(26223917-26224062)
chr8 (297-443)||(7372778-7372925)
chr8 (17-147)||(19896807-19896937)
chr8 (297-442)||(28649018-28649164)
chr8 (18-147)||(20403765-20403894)
chr8 (297-443)||(18818383-18818530)
chr8 (18-148)||(15202726-15202856)
chr8 (298-440)||(26219717-26219858)
chr8 (18-146)||(14397481-14397609)
chr8 (297-443)||(20536208-20536355)
chr8 (297-443)||(21923902-21924049)
chr8 (298-440)||(26225268-26225409)
chr8 (17-147)||(27471963-27472093)
chr8 (18-147)||(15071046-15071175)
chr8 (315-443)||(21918992-21919121)
chr8 (331-443)||(23406379-23406492)
chr8 (18-147)||(32122214-32122343)
chr8 (18-147)||(38549552-38549681)
chr8 (297-443)||(22626736-22626882)
chr8 (297-443)||(22875065-22875211)
chr8 (26-147)||(16401287-16401408)
chr8 (17-147)||(19897000-19897130)
chr8 (17-119)||(45290287-45290389)
chr8 (18-147)||(15202533-15202662)
chr8 (21-147)||(16412866-16412992)
chr8 (18-147)||(16401472-16401601)
chr8 (18-147)||(38549360-38549488)
chr8 (297-443)||(18879210-18879352)
chr8 (18-139)||(24049104-24049225)
chr8 (344-443)||(31971257-31971356)
chr8 (154-221)||(20982603-20982670)
chr8 (344-443)||(45131019-45131117)
chr8 (154-221)||(13425335-13425402)
chr8 (154-221)||(20403446-20403512)
chr8 (154-221)||(32810150-32810216)
chr8 (154-221)||(38549987-38550054)
chr8 (322-443)||(38855250-38855372)
chr8 (154-221)||(45290571-45290637)
chr8 (155-221)||(20982498-20982564)
chr8 (18-147)||(19936455-19936584)
chr8 (329-443)||(6520368-6520483)
chr8 (154-221)||(1326914-1326980)
chr8 (154-221)||(19896488-19896554)
chr8 (154-220)||(16401907-16401972)
chr8 (156-221)||(19936882-19936946)
chr8 (154-221)||(15203108-15203174)
chr8 (322-439)||(21285601-21285719)
chr8 (297-425)||(13508059-13508188)
chr8 (297-425)||(13597591-13597720)
chr8 (344-443)||(16199666-16199765)
chr8 (345-442)||(23648554-23648652)
chr8 (341-443)||(17140916-17141019)
chr8 (166-221)||(13425241-13425296)
chr8 (315-441)||(18678094-18678221)
chr8 (382-443)||(21490995-21491057)
chr8 (18-115)||(11361034-11361131)
chr8 (297-424)||(20498581-20498709)
chr8 (342-443)||(21389471-21389571)
chr8 (342-443)||(21396001-21396101)
chr8 (342-443)||(21778797-21778897)
chr8 (342-443)||(21790494-21790594)
chr8 (341-443)||(5866292-5866395)
chr8 (297-443)||(17612084-17612231)
chr8 (315-441)||(32121734-32121861)
chr8 (393-443)||(21249384-21249434)
chr8 (393-443)||(21255222-21255272)
chr8 (382-443)||(23760903-23760962)
chr8 (382-428)||(983465-983512)
chr8 (29-127)||(24717722-24717820)
chr8 (57-127)||(39114415-39114485)
chr8 (390-439)||(26355766-26355815)
chr8 (18-73)||(32810263-32810318)
chr8 (29-147)||(1484887-1485005)
chr8 (58-147)||(20045783-20045872)
chr8 (58-127)||(29759429-29759498)
chr8 (79-147)||(5852901-5852969)
chr8 (79-147)||(14409053-14409121)
chr8 (390-429)||(21673718-21673757)
chr8 (159-221)||(21513645-21513707)
chr8 (297-327)||(24486063-24486093)
chr8 (58-127)||(13663129-13663198)
chr8 (156-221)||(18815609-18815674)
chr8 (58-127)||(22007126-22007195)
chr8 (156-220)||(38988740-38988804)
chr8 (156-220)||(39019837-39019901)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (18-221)||(6166-6368)
[»] scaffold0023 (12 HSPs)
scaffold0023 (18-221)||(94630-94832)
scaffold0023 (18-221)||(17180-17383)
scaffold0023 (297-440)||(94411-94554)
scaffold0023 (297-436)||(17459-17598)
scaffold0023 (297-440)||(44454-44598)
scaffold0023 (311-439)||(100378-100507)
scaffold0023 (35-147)||(17004-17116)
scaffold0023 (382-443)||(119875-119937)
scaffold0023 (322-439)||(40173-40291)
scaffold0023 (29-147)||(94896-95014)
scaffold0023 (390-439)||(101503-101552)
scaffold0023 (385-439)||(38542-38596)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (18-221)||(40619-40821)
scaffold0044 (297-440)||(40400-40543)
scaffold0044 (106-147)||(40885-40926)
scaffold0044 (18-127)||(37860-37968)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (18-221)||(134430-134632)
scaffold0028 (18-221)||(136899-137101)
scaffold0028 (18-221)||(139368-139570)
scaffold0028 (18-221)||(141837-142039)
scaffold0028 (18-221)||(144306-144508)
scaffold0028 (297-440)||(136680-136823)
scaffold0028 (297-440)||(139149-139292)
scaffold0028 (297-440)||(144087-144230)
scaffold0028 (297-440)||(134211-134354)
scaffold0028 (297-440)||(141618-141761)
scaffold0028 (318-439)||(132662-132784)
scaffold0028 (340-425)||(62216-62302)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (18-221)||(426-629)
scaffold1792 (17-147)||(853-983)
scaffold1792 (65-147)||(693-775)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (18-221)||(3242-3445)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (18-221)||(9461-9663)
scaffold0363 (297-441)||(9241-9385)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (20-221)||(10010-10211)
scaffold0043 (18-147)||(10277-10406)
scaffold0043 (18-147)||(10470-10599)
scaffold0043 (154-187)||(9938-9971)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (21-217)||(267-463)
scaffold0494 (297-442)||(12268-12413)
scaffold0494 (154-221)||(506-573)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (18-221)||(4043-4246)
scaffold0741 (18-143)||(3657-3782)
scaffold0741 (18-147)||(3850-3979)
scaffold0741 (95-147)||(3541-3593)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (18-221)||(6676-6879)
scaffold0317 (18-147)||(6483-6612)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (30-221)||(13379-13570)
scaffold0040 (20-177)||(43002-43159)
scaffold0040 (18-147)||(43225-43354)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (17-221)||(11508-11712)
scaffold0029 (297-442)||(11286-11431)
[»] scaffold0716 (3 HSPs)
scaffold0716 (18-221)||(4913-5116)
scaffold0716 (297-440)||(4694-4837)
scaffold0716 (18-147)||(5180-5309)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (18-221)||(30238-30441)
scaffold0149 (298-440)||(29931-30074)
scaffold0149 (18-147)||(30505-30634)
scaffold0149 (157-221)||(30132-30196)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (297-440)||(158469-158612)
scaffold0003 (297-440)||(339924-340065)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (23-221)||(808-1006)
scaffold0747 (18-147)||(1075-1204)
scaffold0747 (18-117)||(1225-1323)
scaffold0747 (154-221)||(703-769)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (20-221)||(15141-15342)
scaffold0306 (18-187)||(11080-11249)
scaffold0306 (18-147)||(10887-11016)
scaffold0306 (18-147)||(15398-15526)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (13-221)||(53607-53815)
scaffold0022 (298-440)||(116430-116571)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (37-221)||(1647-1831)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (297-441)||(10772-10916)
scaffold0454 (70-221)||(10992-11142)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (297-440)||(16784-16927)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (18-221)||(38396-38599)
scaffold0074 (300-440)||(38679-38820)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (297-440)||(82072-82215)
scaffold0037 (297-428)||(22645-22776)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (297-436)||(501088-501227)
scaffold0001 (297-440)||(85598-85742)
scaffold0001 (18-158)||(501347-501486)
scaffold0001 (21-147)||(501550-501676)
scaffold0001 (340-439)||(160688-160788)
scaffold0001 (173-219)||(501305-501351)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (18-219)||(6682-6873)
scaffold0574 (18-147)||(6937-7066)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (18-183)||(7996-8161)
scaffold0278 (21-147)||(8225-8351)
scaffold0278 (18-144)||(8421-8547)
scaffold0278 (322-429)||(5657-5765)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (297-440)||(106-249)
[»] scaffold0145 (5 HSPs)
scaffold0145 (297-445)||(9744-9893)
scaffold0145 (297-443)||(32942-33088)
scaffold0145 (297-443)||(38761-38907)
scaffold0145 (154-221)||(9950-10017)
scaffold0145 (157-219)||(10005-10067)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (297-437)||(4300-4440)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (297-440)||(4214-4358)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (297-440)||(12064-12201)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (57-213)||(57708-57864)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (297-440)||(22886-23029)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (297-424)||(79303-79430)
scaffold0056 (297-442)||(17189-17337)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (297-424)||(20398-20524)
scaffold0031 (297-443)||(128751-128897)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (17-174)||(68227-68384)
scaffold0064 (344-443)||(46995-47093)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (298-440)||(44682-44825)
scaffold0122 (297-436)||(26039-26179)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (297-437)||(1299-1440)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (297-440)||(2147-2291)
scaffold0247 (297-443)||(18001-18148)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (297-440)||(161108-161252)
scaffold0007 (297-361)||(164609-164674)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (297-443)||(3125-3271)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (297-443)||(16574-16721)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (297-443)||(51913-52060)
scaffold0011 (297-443)||(167952-168099)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (297-442)||(3160-3306)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (18-147)||(1740-1869)
scaffold1296 (17-54)||(1640-1677)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (297-443)||(4508-4654)
scaffold0228 (297-443)||(12090-12236)
scaffold0228 (297-443)||(22042-22188)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (297-443)||(13211-13358)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (297-443)||(1851-1998)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (297-441)||(39479-39623)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (297-441)||(75189-75333)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (18-146)||(31497-31625)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (297-443)||(1022-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (315-443)||(4849-4978)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (315-443)||(32949-33077)
scaffold0120 (315-443)||(45928-46056)
scaffold0120 (297-443)||(16113-16260)
scaffold0120 (381-443)||(17388-17450)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (297-443)||(3470-3617)
scaffold0292 (297-443)||(343-489)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (329-443)||(28414-28529)
scaffold0046 (341-443)||(11292-11395)
scaffold0046 (390-443)||(1997-2050)
scaffold0046 (390-443)||(4552-4605)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (18-147)||(8311-8440)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (297-443)||(8479-8626)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (297-443)||(25896-26042)
scaffold0026 (297-443)||(39858-40004)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (21-147)||(36749-36875)
scaffold0151 (17-147)||(36938-37068)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (18-147)||(18423-18552)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (297-443)||(8507-8650)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (91-220)||(28061-28190)
scaffold0114 (344-443)||(15485-15584)
scaffold0114 (154-221)||(28008-28074)
scaffold0114 (382-439)||(7295-7352)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (18-146)||(7430-7558)
scaffold0711 (23-147)||(7243-7367)
scaffold0711 (57-145)||(7084-7172)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (297-443)||(6095-6245)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (18-146)||(17947-18075)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (18-146)||(33465-33593)
scaffold0138 (329-443)||(12942-13054)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (297-428)||(8481-8613)
scaffold0621 (322-443)||(6535-6657)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (297-443)||(1952-2099)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (353-443)||(4712-4803)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (143-221)||(10647-10725)
scaffold0513 (154-221)||(10764-10830)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (297-425)||(24276-24406)
scaffold0042 (17-54)||(75644-75681)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (18-146)||(39626-39754)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (340-443)||(39913-40016)
scaffold0080 (323-424)||(19883-19987)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (297-379)||(3504-3586)
scaffold0327 (385-439)||(289-343)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (344-443)||(32067-32165)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (344-443)||(13497-13596)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (344-443)||(11464-11564)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (297-442)||(174767-174911)
scaffold0021 (382-443)||(121766-121827)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (18-146)||(19829-19957)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (31-139)||(113317-113425)
scaffold0014 (382-422)||(206584-206624)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (297-443)||(10399-10544)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (390-443)||(1102-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (390-443)||(6611-6664)
scaffold0333 (390-443)||(13991-14044)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (341-440)||(15664-15764)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (390-443)||(6191-6244)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (390-443)||(15845-15898)
scaffold0020 (385-439)||(178898-178952)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (364-424)||(11982-12042)
scaffold0503 (297-334)||(12039-12076)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (297-356)||(13092-13151)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (154-221)||(15149-15215)
scaffold0106 (382-440)||(15298-15356)
scaffold0106 (342-443)||(1289-1389)
scaffold0106 (390-443)||(7266-7319)
scaffold0106 (131-178)||(15030-15077)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (382-443)||(4893-4954)
scaffold0395 (297-367)||(937-1006)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (342-443)||(16282-16382)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (297-428)||(27723-27855)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (297-424)||(53523-53651)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (297-391)||(13144-13239)
scaffold0175 (387-443)||(273-329)
scaffold0175 (390-443)||(34123-34176)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (322-439)||(19268-19386)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (390-439)||(1086-1135)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (342-424)||(1051-1134)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (297-443)||(11464-11611)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (297-443)||(38230-38377)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (329-443)||(20910-21026)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (322-443)||(32538-32657)
scaffold0034 (297-424)||(51857-51985)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (322-439)||(2805-2923)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (322-439)||(14696-14814)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (304-424)||(12587-12708)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (297-424)||(13147-13276)
scaffold0357 (297-428)||(16074-16206)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (385-439)||(23843-23897)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (297-429)||(129919-130051)
scaffold0010 (297-424)||(60689-60818)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (297-428)||(10516-10647)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (390-439)||(2713-2762)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (390-443)||(1137-1190)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (390-439)||(36454-36503)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (390-439)||(45860-45909)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (167-220)||(35955-36007)
scaffold0100 (382-443)||(23942-24001)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (342-443)||(51582-51682)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (390-440)||(5196-5246)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (297-363)||(27911-27977)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (297-422)||(4545-4671)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (390-443)||(12766-12819)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-127)||(6196-6305)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (297-439)||(133-275)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (391-439)||(28839-28887)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (344-439)||(29558-29654)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (297-369)||(225482-225553)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (344-443)||(1072-1170)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (318-439)||(32102-32224)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (368-428)||(8118-8180)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (18-127)||(8566-8675)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (382-429)||(6826-6874)
scaffold0556 (322-369)||(8090-8137)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (322-428)||(10542-10649)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (154-221)||(1203-1269)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (157-220)||(16263-16326)
scaffold0123 (397-428)||(25121-25152)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (297-422)||(8033-8161)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (385-439)||(159-213)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (297-379)||(6675-6757)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (59-125)||(15780-15846)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (385-439)||(21866-21920)
scaffold0210 (385-439)||(29758-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (385-439)||(69794-69848)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (382-439)||(1881-1938)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (58-127)||(6970-7039)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (382-439)||(10582-10639)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (18-127)||(28469-28578)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (390-439)||(19980-20029)
scaffold0139 (297-420)||(38339-38464)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (345-443)||(192997-193098)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (297-424)||(6257-6386)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (156-220)||(15297-15361)


Alignment Details
Target: scaffold0134 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38243 - 38040
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38243 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 38144  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38143 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 38044  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  38043 gaag 38040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37964 - 37821
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37964 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 37865  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37864 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 147)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 456743 - 456540
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 456644  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456643 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 456544  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  456543 gaag 456540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27217282 - 27217079
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217282 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 27217183  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217182 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 27217083  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  27217082 gaag 27217079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16232942 - 16232739
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattg 16232843  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232842 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 16232743  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16232742 gaag 16232739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41523339 - 41523136
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523339 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41523240  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523239 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 41523140  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  41523139 gaag 41523136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41525801 - 41525598
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525801 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41525702  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525701 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 41525602  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  41525601 gaag 41525598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393230
Alignment:
Q  32 gtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaac 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  132 gtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 11393230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13869770 - 13869567
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13869770 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13869671  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869670 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13869571  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13869570 gaag 13869567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 15376454 - 15376656
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15376454 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15376553  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376554 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15376652  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15376653 gaag 15376656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 20384864 - 20385066
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20384864 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20384963  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20385062  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20385063 gaag 20385066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 14948863 - 14949065
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  14948863 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 14948962  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948963 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14949061  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14949062 gaag 14949065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16410480 - 16410278
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16410480 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 16410381  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410380 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 16410282  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16410281 gaag 16410278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32125912 - 32125710
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  32125912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 32125813  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 32125714  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  32125713 gaag 32125710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8940706 - 8940498
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacac----ggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8940706 aaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 8940607  T
Q  113 tatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatga 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  8940606 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatga 8940507  T
Q  213 ttgatgaag 221  Q
    |||||||||    
T  8940506 ttgatgaag 8940498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11303669 - 11303466
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303669 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 11303570  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11303569 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 11303470  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  11303469 gaag 11303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 14269697 - 14269900
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14269697 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatgg 14269796  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14269797 tcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 14269896  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14269897 gaag 14269900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 15081582 - 15081785
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15081582 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15081681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15081682 tcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 15081781  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15081782 gaag 15081785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18627987 - 18627785
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18627987 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18627888  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18627887 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgat 18627789  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18627788 gaag 18627785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18640693 - 18640491
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18640693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18640594  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18640593 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 18640495  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18640494 gaag 18640491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8469157 - 8468955
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8469157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 8469058  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8469057 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgat 8468958  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  8468957 gaa 8468955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 21189338 - 21189538
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21189338 ttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc 21189437  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189438 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 21189536  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  21189537 ag 21189538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16214106 - 16213903
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16214106 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16214007  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16214006 tcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16213907  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16213906 gaag 16213903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 23664693 - 23664895
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23664693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23664792  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23664793 tcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 23664892  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  23664893 gaa 23664895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 456464 - 456321
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456464 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 456365  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456364 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11972639 - 11972496
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972639 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11972540  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972539 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 14949141 - 14949284
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14949141 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 14949240  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949241 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 15376732 - 15376875
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376732 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15376831  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376832 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 16108429 - 16108632
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16108429 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16108528  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16108529 tcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgat 16108628  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16108629 gaag 16108632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16232663 - 16232520
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232663 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16232564  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232563 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18640415 - 18640272
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18640415 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18640316  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640315 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 20385142 - 20385285
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20385142 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20385241  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385242 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 21189614 - 21189757
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189614 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21189713  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189714 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24275314 - 24275175
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275314 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 24275215  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275214 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29797032 - 29796829
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29797032 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29796933  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29796932 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 29796833  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29796832 gaag 29796829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29800851 - 29800648
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29800851 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29800752  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29800751 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 29800652  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29800651 gaag 29800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32125634 - 32125491
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125634 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 32125535  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125534 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41523060 - 41522917
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523060 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 41522961  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522960 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41525522 - 41525379
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525522 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 41525423  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525422 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 297 - 439
Target Start/End: Original strand, 11393306 - 11393448
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11393306 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11393405  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393406 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 16410102  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410101 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18431130 - 18430931
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18431130 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 18431031  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431030 aattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 18430932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24702650 - 24702457
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24702650 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24702551  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702550 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24705097 - 24704904
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24705097 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24704998  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704997 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24704908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24702381 - 24702238
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702381 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24702282  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702281 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 26355722 - 26355924
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26355722 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26355821  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26355822 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgat 26355920  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  26355921 gaag 26355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 26358174 - 26358376
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26358174 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26358273  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26358274 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgat 26358372  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  26358373 gaag 26358376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27217003 - 27216860
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27217003 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 27216904  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216903 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11972970 - 11972768
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  11972970 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatag 11972871  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  11972870 tcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 11972771  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  11972770 gaa 11972768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16213827 - 16213684
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213827 cattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 16213728  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213727 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44116652 - 44116509
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116652 cattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 44116553  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116552 ttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3386475 - 3386333
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3386475 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatt 3386376  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386375 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18430855 - 18430709
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18430855 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttat 18430756  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430755 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 45847394 - 45847598
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45847394 aaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 45847493  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45847494 gtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattga 45847593  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  45847594 tgaag 45847598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24704828 - 24704688
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24704828 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24704732  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704731 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13647472 - 13647325
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  13647472 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 13647373  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  13647372 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  48 taggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  148 aattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 17061934 - 17062077
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17061934 cattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatactgctgagttgctgattgtta 17062032  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062033 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13869472 - 13869346
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869472 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatga 13869373  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13869372 gtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20110689 - 20110556
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  20110689 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata----------gctgttgttat 20110600  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110599 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 38898395 - 38898535
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  38898395 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgtta 38898494  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898495 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  321 attgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 314 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  314 gtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 3564338 - 3564482
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3564338 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 3564437  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3564438 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 12756690 - 12756817
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12756690 cattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttat 12756789  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756790 ttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38897775 - 38897904
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38897775 aattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38897874  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38897875 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12698979 - 12698831
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtt 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12698979 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 12698880  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698879 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 18456387 - 18456530
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| | ||||    
T  18456387 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgtta 18456485  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456486 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 26356002 - 26356156
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgtt 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || ||||||    
T  26356002 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26356101  T
Q  386 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26356102 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 26358454 - 26358608
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgtt 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || ||||||    
T  26358454 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26358553  T
Q  386 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26358554 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9509336 - 9509189
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  9509336 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgtta 9509237  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9509236 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38227627 - 38227481
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  38227627 cattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 38227529  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227528 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16214299 - 16214170
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16214299 aattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 16214200  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16214199 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 10501136 - 10501263
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10501136 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtc 10501235  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  10501236 aaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8940897 - 8940769
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8940897 aattggtcttaggtgtaaacaaa-aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8940799  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940798 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14156626 - 14156755
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  14156626 aattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatga 14156725  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  14156726 tcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14269311 - 14269440
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  14269311 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattg 14269410  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269411 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 1856970 - 1857097
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1856970 aattggtcttaggtgtaaacacg-aagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 1857068  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1857069 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 25926870 - 25926998
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  25926870 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatgg 25926969  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25926970 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Original strand, 14156839 - 14156944
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14156839 aagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcaca 14156938  T
Q  142 gtgaat 147  Q
    ||||||    
T  14156939 gtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189272
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081512
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    | | ||||||| ||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8941091 - 8940962
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  8941091 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgc 8940992  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  8940991 tcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589039
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  428 attaagatgatgatgt 443  Q
       |||||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26212125 - 26211995
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 13918143 - 13918272
Alignment:
Q  18 aattggtctt-aggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13918143 aattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 13918242  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  13918243 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 443
Target Start/End: Original strand, 2280094 - 2280238
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtta 395  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||     
T  2280094 attatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttt 2280192  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280193 attaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Original strand, 10500968 - 10501064
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 114  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10500968 aattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 15144012 - 15144143
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||    
T  15144012 cattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttat 15144111  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144112 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14269504 - 14269633
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||      
T  14269504 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatca 14269603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||| |||||| |||||||    
T  14269604 tcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  321 attgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  419 tctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11972781 - 11972715
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11972781 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaag 11972715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 14269939 - 14270005
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269939 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 14270005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 15081824 - 15081890
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081824 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 15081890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 221
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898066
Alignment:
Q  150 ttgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 38898066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 38898105 - 38898171
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898105 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38898171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 45847637 - 45847704
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45847637 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 45847704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 45847249 - 45847331
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45847249 tttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386369
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  16386368 gt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831807
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8940459 - 8940393
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940459 ttatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8940393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17985125 - 17985254
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||| |    
T  17985125 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgagttatag 17985224  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  17985225 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34200889 - 34200786
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34200889 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 34200791  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  34200790 gatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443393
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  346 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  60 ttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005650
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  18005669 ctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495402
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014182
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 439
Target Start/End: Original strand, 14932755 - 14932851
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932755 ttgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 439
Target Start/End: Original strand, 15356190 - 15356286
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356190 ttgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 439
Target Start/End: Original strand, 15360304 - 15360400
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360304 ttgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 437
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154956
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996148
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  420 ctaagttga 428  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 27847851 - 27847951
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  27847851 atttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  27847948 atgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 425
Target Start/End: Original strand, 10063798 - 10063921
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaa 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |  || ||||||||||| ||||| || || || |||| | || |||||||| |||||| ||||    
T  10063798 ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaa 10063896  T
Q  401 ctaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10063897 ctaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 16219785 - 16219835
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16219785 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832561
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468859
Alignment:
Q  189 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8468859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 443
Target Start/End: Original strand, 19486722 - 19486865
Alignment:
Q  301 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttattt 398  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  |    
T  19486722 acttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaact 19486820  T
Q  399 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  19486821 aactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 428
Target Start/End: Original strand, 1868070 - 1868101
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868070 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Original strand, 15081968 - 15082019
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttga 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15081968 cattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 220
Target Start/End: Original strand, 13745563 - 13745633
Alignment:
Q  150 ttgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  13745563 ttgatcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaa 13745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15113088 - 15113031
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15113088 attacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 115  Q
    ||||||||||   ||||||||||||   ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649606
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110741
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataa 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataa 20110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187019
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13841260 - 13841231
Alignment:
Q  192 tgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841260 tgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13841231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119983
Alignment:
Q  155 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 15119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211456
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgat 441  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 15211458  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  15211457 gt 15211456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138177
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Original strand, 23461832 - 23461864
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtag 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23461832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27217414 - 27217346
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  27217414 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | | ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 156)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 45606647 - 45606850
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606647 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 45606746  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606747 tcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 45606846  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  45606847 gaag 45606850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 53301244 - 53301447
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 53301343  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301344 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgat 53301443  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  53301444 gaag 53301447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 7781087 - 7781290
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7781087 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 7781186  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781187 tcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 7781286  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  7781287 gaag 7781290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46822683 - 46822480
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46822683 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 46822584  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 46822484  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  46822483 gaag 46822480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17463599 - 17463397
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17463599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 17463500  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463499 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 17463401  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  17463400 gaag 17463397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34159747 - 34159545
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34159747 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 34159648  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159647 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 34159549  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  34159548 gaag 34159545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27165674 - 27165471
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27165674 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 27165575  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165574 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 27165475  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  27165474 gaag 27165471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55476912 - 55476710
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  55476912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 55476813  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 55476714  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  55476713 gaag 55476710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 12119394 - 12119597
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12119394 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12119493  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119494 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 12119593  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  12119594 gaag 12119597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15412853 - 15412650
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412853 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatgg 15412754  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412753 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15412654  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15412653 gaag 15412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15977954 - 15977756
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  15977954 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15977855  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15977756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 6468875 - 6469077
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  6468875 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 6468974  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468975 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 6469073  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  6469074 gaag 6469077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8499942 - 8499739
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8499942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8499843  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8499842 tgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 8499743  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  8499742 gaag 8499739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13544445 - 13544244
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13544445 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13544346  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544345 tca-aatactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13544248  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13544247 gaag 13544244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 16454021 - 16454224
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaa-ggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||     
T  16454021 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttata 16454120  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454121 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattga 16454219  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  16454220 tgaag 16454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10557330 - 10557127
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557330 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 10557231  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10557230 tcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgat 10557131  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  10557130 gaag 10557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12567981 - 12567779
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  12567981 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 12567882  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567881 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 12567783  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  12567782 gaag 12567779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 54521244 - 54521041
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 54521145  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54521144 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 54521045  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  54521044 gaag 54521041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13436721 - 13436520
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13436721 aattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13436622  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13436621 tccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 13436522  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  13436521 ga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 13153996 - 13154198
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13153996 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13154095  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154096 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13154194  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13154195 gaag 13154198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 29172602 - 29172745
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172602 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 29172701  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172702 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 9707626 - 9707769
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707626 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 9707725  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707726 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 10247464 - 10247666
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  10247464 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 10247563  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247564 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 10247662  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  10247663 gaag 10247666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17463321 - 17463178
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463321 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 17463222  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463221 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 28848630 - 28848773
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848630 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 28848729  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848730 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34159469 - 34159326
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159469 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34159370  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159369 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 45606926 - 45607069
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45606926 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 45607025  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607026 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55476634 - 55476491
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55476634 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 55476535  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476534 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 7781366 - 7781509
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7781366 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 7781465  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781466 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8899237 - 8899094
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8899237 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 8899138  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899137 ttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 16454300 - 16454443
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16454300 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16454399  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454400 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 38961910 - 38962053
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38961910 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 38962009  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38962010 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 28848362 - 28848554
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  28848362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 28848461  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28848462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattttccatgattgat 28848550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 13151809 - 13151953
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13151809 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13151908  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151909 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 13154274 - 13154418
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13154274 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13154373  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154374 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13544168 - 13544024
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544168 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 13544069  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544068 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24514098 - 24513910
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24514098 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 24513999  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24513998 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 6469153 - 6469296
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6469153 cattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 6469252  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469253 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 10247742 - 10247885
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10247742 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttat 10247841  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247842 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12567703 - 12567564
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12567703 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 12567604  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567603 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 13151531 - 13151733
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13151531 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13151630  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13151631 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcctgat 13151729  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13151730 gaag 13151733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 38961578 - 38961781
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg-ccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  38961578 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttata 38961677  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||    
T  38961678 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattga 38961777  T
Q  217 tgaa 220  Q
    ||||    
T  38961778 tgaa 38961781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41124361 - 41124159
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41124361 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41124262  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  41124261 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 41124162  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  41124161 gaa 41124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 16282498 - 16282667
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16282498 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 16282597  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16282598 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 16282667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Original strand, 16282830 - 16282971
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16282830 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 16282929  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282930 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 17446674 - 17446816
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17446674 cattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 17446773  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446774 ttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17672769 - 17672626
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17672769 cattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttat 17672670  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672669 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 29544582 - 29544785
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29544582 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29544681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  29544682 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgat 29544781  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29544782 gaag 29544785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50242965 - 50242822
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50242965 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 50242866  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242865 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25237265 - 25237063
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25237265 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25237166  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  25237165 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 25237066  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  25237065 gaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41124030 - 41123892
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  41124030 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttat 41123934  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123933 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12305521 - 12305364
Alignment:
Q  64 ttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattga 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12305521 ttttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattga 12305422  T
Q  164 tgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12305421 tgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 12305364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 309 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  309 tatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 17444504 - 17444706
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  17444504 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatag 17444603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  17444604 tcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 17444703  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  17444704 gaa 17444706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 307 - 440
Target Start/End: Original strand, 12119753 - 12119887
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12119753 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaag 12119852  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119853 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 307 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15412563 - 15412429
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15412563 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15412464  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412463 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 20629932 - 20630078
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629932 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20630031  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgat 164  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20630032 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25229678 - 25229476
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25229678 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25229579  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  25229578 tcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 25229479  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  25229478 gaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 53070672 - 53070799
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53070672 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttat 53070771  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070772 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 329 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500942
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  429 ttaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||    
T  55500953 ttaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 307 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8499652 - 8499518
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8499652 attatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 8499553  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499552 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14973001 - 14972854
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14973001 cattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 14972902  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972901 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 40213695 - 40213838
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40213695 cattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttat 40213794  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213795 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 25476359 - 25476506
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  25476359 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt 25476458  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476459 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618449
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15465576 - 15465448
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15465576 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15465477  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15465476 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10379749 - 10379614
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10379749 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 10379650  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattga 153  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10379649 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 10379614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17488003 - 17487856
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  17488003 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgtta 17487904  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487903 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17499485 - 17499338
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  17499485 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgtta 17499386  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499385 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438534
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  428 attaagatgatgatgt 443  Q
    || |||||||||||||    
T  18438549 atgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399209
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 23083353 - 23083482
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23083353 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 23083452  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083453 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27165867 - 27165738
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  27165867 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatag 27165768  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27165767 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10557085 - 10556985
Alignment:
Q  340 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557085 gcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T
Q  440 a 440  Q
    |    
T  10556985 a 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13442421 - 13442274
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  13442421 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgtta 13442322  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442321 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 20698409 - 20698556
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20698409 cattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 20698508  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20698509 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26687034 - 26686887
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  26687034 cattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 26686935  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686934 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43841079 - 43840932
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43841079 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgtta 43840980  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43840979 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8500135 - 8500009
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8500135 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8500036  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||    
T  8500035 tcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38961385 - 38961514
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38961385 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38961484  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38961485 tcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41124554 - 41124425
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  41124554 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 41124455  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124454 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 297 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42386557 - 42386428
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||| ||||||||||   |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42386557 cattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 42386458  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386457 tttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 53301051 - 53301180
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53301051 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 53301150  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  53301151 tcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 55319044 - 55319173
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  55319044 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 55319143  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  55319144 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24153183 - 24153326
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||||    
T  24153183 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgtta 24153281  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153282 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  439 ga 440  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 55318854 - 55318980
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55318854 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 55318953  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55318954 aattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10557523 - 10557394
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10557523 aattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 10557424  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10557423 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46822876 - 46822747
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  46822876 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcg 46822777  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  46822776 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 26055005 - 26055133
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26055005 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 26055104  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  26055105 taaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 13937520 - 13937649
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13937520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatgg 13937619  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  13937620 tcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  26 ttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  126 ctgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 11424737 - 11424880
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  11424737 cattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 11424832  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424833 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 429
Target Start/End: Original strand, 14576807 - 14576939
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  14576807 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgtta 14576905  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576906 tttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5223805 - 5223677
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  5223805 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 5223706  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  5223705 tcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16282305 - 16282434
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16282305 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 16282404  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16282405 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20629739 - 20629868
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20629739 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatgg 20629838  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20629839 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Original strand, 9707482 - 9707550
Alignment:
Q  153 attatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707482 attatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 9707550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27165391 - 27165250
Alignment:
Q  300 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatt 397  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| || | |||||||| ||||||    
T  27165391 tacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatt 27165293  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165292 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8899379 - 8899313
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899379 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8899313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 16282688 - 16282754
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282688 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 16282754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 17444693 - 17444759
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444693 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 17444759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 38961768 - 38961834
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961768 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38961834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  300 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgt-tgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttat 396  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  137 tcacagtgaat 147  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 24340697 - 24340844
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || || || ||||||| | |||||||| |||||    
T  24340697 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgtt 24340795  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340796 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25237076 - 25237010
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237076 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 25237010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41124172 - 41124106
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41124172 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaag 41124106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Original strand, 3264325 - 3264431
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3264325 aagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcaca 3264424  T
Q  142 gtgaata 148  Q
    |||||||    
T  3264425 gtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17444311 - 17444440
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||  ||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  17444311 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatgg 17444410  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17444411 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  387 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 299 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  299 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 11913927 - 11913993
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913927 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 11913993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194693
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    | | |||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234487
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||    
T  14234503 gattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 52523701 - 52523831
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| |||||  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||    
T  52523701 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttg 52523799  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523800 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470927
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||   |||||||||||||    
T  15470947 ctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17393330 - 17393201
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |    
T  17393330 aattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatag 17393231  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  || ||||||| |||||||    
T  17393230 tcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  416 cggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822267
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174376
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097332
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  83 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16103901 - 16103784
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16103901 ttgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 16103804  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  16103803 ctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029841
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668193
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511059
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  428 attaagatgatgat 441  Q
    ||||||||| ||||    
T  12511072 attaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665398
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 37642239 - 37642386
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-tt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  ||    
T  37642239 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcatt 37642337  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  37642338 aactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512924
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520899
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856140
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Original strand, 2051173 - 2051238
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  2051173 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668554
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077594
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17463731 - 17463663
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463731 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  59 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 424
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 417  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcg 37251263  T
Q  418 gtctaag 424  Q
    |||||||    
T  37251264 gtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15007922 - 15007868
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaa 71  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  15007922 aaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 214
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgatt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878168
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058298
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25058298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 369
Target Start/End: Original strand, 22147499 - 22147571
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttt 369  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147499 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201333
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaa 25201333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 439
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  391 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 36528384 - 36528348
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36528384 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 136)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39682735 - 39682532
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682735 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 39682636  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682635 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 39682536  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  39682535 gaag 39682532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 571819 - 571616
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571819 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 571720  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  571719 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 571620  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  571619 gaag 571616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18809364 - 18809162
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18809364 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18809265  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809264 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 18809166  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18809165 gaag 18809162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23711754 - 23711956
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23711754 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23711853  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23711952  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23711953 gaag 23711956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23131284 - 23131081
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23131284 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23131185  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23131184 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 23131085  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23131084 gaag 23131081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23133751 - 23133548
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23133751 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23133652  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133651 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 23133552  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23133551 gaag 23133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 34402262 - 34402465
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34402262 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 34402361  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402362 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 34402461  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  34402462 gaag 34402465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039441
Alignment:
Q  19 attggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  119 cagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatg 32039438  T
Q  219 aag 221  Q
    |||    
T  32039439 aag 32039441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28577520 - 28577318
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28577520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 28577421  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28577420 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgat 28577322  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  28577321 gaag 28577318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20261641 - 20261438
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261641 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20261542  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20261541 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 20261442  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20261441 gaag 20261438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23706957 - 23707160
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23706957 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23707056  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23707057 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 23707156  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23707157 gaag 23707160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 24529286 - 24529490
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24529286 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatg 24529385  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529386 gtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattga 24529485  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  24529486 tgaag 24529490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24918562 - 24918359
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24918562 aattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24918463  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24918462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24918363  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24918362 gaag 24918359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26505800 - 26505598
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  26505800 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26505701  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505700 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 26505602  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  26505601 gaag 26505598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26508278 - 26508076
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  26508278 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26508179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508178 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 26508080  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  26508079 gaag 26508076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23709273 - 23709475
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23709273 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23709372  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709373 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23709471  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23709472 gaag 23709475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24897936 - 24898138
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24897936 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24898035  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898036 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24898134  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24898135 gaag 24898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24905373 - 24905575
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24905373 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24905472  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905473 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24905571  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24905572 gaag 24905575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 45027645 - 45027840
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  45027645 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatag 45027744  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgatt 214  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45027745 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 10684503 - 10684706
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10684503 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 10684602  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10684603 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 10684702  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  10684703 gaag 10684706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24671447 - 24671244
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24671447 aattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 24671348  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24671347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24671248  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24671247 gaag 24671244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24900419 - 24900621
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24900419 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24900518  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900519 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24900617  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24900618 gaag 24900621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24902896 - 24903098
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24902896 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24902995  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902996 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24903094  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24903095 gaag 24903098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24907848 - 24908050
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24907848 aattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24907947  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907948 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24908046  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24908047 gaag 24908050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22105887 - 22105685
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22105887 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 22105788  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22105787 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22105688  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  22105687 gaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18809086 - 18808943
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18809086 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18808987  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808986 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23131005 - 23130862
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23131005 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23130906  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130905 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23133472 - 23133329
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23133472 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23133373  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133372 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23135733 - 23135590
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135733 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23135634  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135633 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 23709551 - 23709694
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23709551 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23709650  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709651 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 23712032 - 23712175
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23712032 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23712131  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712132 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24642489 - 24642692
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24642489 aattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatgg 24642588  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24642589 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24642688  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24642689 gaag 24642692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24681866 - 24681663
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24681866 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatgg 24681767  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24681766 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 24681667  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24681666 gaag 24681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26505522 - 26505379
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505522 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 26505423  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505422 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26508000 - 26507857
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508000 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 26507901  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507900 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 34402541 - 34402684
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34402541 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34402640  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39682456 - 39682313
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682456 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39682357  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682356 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 32214940 - 32215085
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32214940 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttat 32215039  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32215040 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 571540 - 571397
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  571540 cattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 571441  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571440 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6726138 - 6725995
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726138 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 6726039  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726038 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24367917 - 24367774
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367917 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24367818  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24367817 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23136002 - 23135809
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  23136002 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 23135903  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135902 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattgtccatgattga 23135814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Original strand, 21155079 - 21155219
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21155079 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21155178  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155179 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24898214 - 24898358
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24898214 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24898313  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898314 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24900697 - 24900841
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24900697 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24900796  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900797 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24903174 - 24903318
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24903174 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24903273  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903274 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24905651 - 24905795
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24905651 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24905750  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905751 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24908126 - 24908270
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24908126 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24908225  T
Q  397 ttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908226 ttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 32039517 - 32039660
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32039517 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttat 32039616  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32039617 ttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24368248 - 24368046
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  24368248 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 24368149  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||  || ||||  |||||||||    
T  24368148 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgat 24368049  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  24368048 gaa 24368046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28577242 - 28577099
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28577242 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttat 28577143  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577142 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38967901 - 38967698
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  38967901 aattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatag 38967802  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  38967801 tgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgtt 38967702  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  38967701 gaag 38967698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 45029873 - 45030016
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  45029873 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttat 45029972  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029973 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43137442 - 43137301
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43137442 cattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttat 43137343  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137342 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22105556 - 22105412
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22105556 cattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 22105457  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105456 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6726466 - 6726267
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  6726466 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtca 6726367  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  6726366 aattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25616579 - 25616400
Alignment:
Q  42 aagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcaca 141  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  25616579 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcaca 25616480  T
Q  142 gtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616479 atgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 25616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 21154748 - 21154950
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  21154748 aatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21154847  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  || ||||||    
T  21154848 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgat 21154947  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  21154948 gaa 21154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 41523813 - 41524015
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41523813 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41523912  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  41523913 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 41524012  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  41524013 gaa 41524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 32214670 - 32214864
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32214670 aaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 32214769  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32214770 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgtatacgatattgttcatgattga 32214859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 24529547 - 24529691
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24529547 cattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgtta 24529646  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529647 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38967518 - 38967374
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  38967518 cattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgtta 38967419  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967418 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22337262 - 22337115
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22337262 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgtta 22337163  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337162 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23060660 - 23060513
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23060660 cattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23060561  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060560 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23076589 - 23076442
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23076589 cattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23076490  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076489 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529223
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726533
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21154555 - 21154684
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21154555 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacgg 21154654  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  21154655 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24918755 - 24918626
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24918755 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24918656  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918655 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 41523620 - 41523749
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41523620 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 41523719  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523720 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 22731208 - 22731355
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  22731208 cattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgtta 22731307  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22731308 tttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23931882 - 23931775
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23931882 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23931783  T
Q  118 tcagatta 125  Q
    ||| ||||    
T  23931782 tcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368312
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22106081 - 22105951
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22106081 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatg 22105982  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22105981 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523552
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 22738154 - 22738300
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||  |||||||||    
T  22738154 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatgttgttat 22738253  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738254 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 23709080 - 23709209
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 440
Target Start/End: Original strand, 298806 - 298933
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatg 412  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  298806 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 298905  T
Q  413 agtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  298906 agtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  362 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23286008 - 23285865
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23286008 cattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 23285913  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285912 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 21154362 - 21154491
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  21154362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttag 21154461  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  21154462 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24682059 - 24681930
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24682059 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatgg 24681960  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24681959 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23660169 - 23660023
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||     
T  23660169 cattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgctgttgttg 23660071  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660070 tttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 45027452 - 45027579
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  45027452 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 45027551  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  45027552 tcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 23706573 - 23706702
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||  |  ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23706573 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23706672  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23706673 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24671640 - 24671511
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24671640 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatgg 24671541  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24671540 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 32214476 - 32214604
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| || |||||||    
T  32214476 aaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatg 32214575  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  32214576 gtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 23654360 - 23654507
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | || || ||||||||    
T  23654360 cattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgtta 23654459  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23654460 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23932075 - 23931949
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23932075 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 23931976  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    |||  |||||  || ||||||||||||    
T  23931975 tcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 443
Target Start/End: Original strand, 23103375 - 23103516
Alignment:
Q  301 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattta 399  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  23103375 acttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttattta 23103472  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  23103473 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Original strand, 23706765 - 23706889
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23706765 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatgg 23706864  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacag 142  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23706865 tcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6726280 - 6726214
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726280 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 6726214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040310
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19671976 - 19671830
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||| |||||    
T  19671976 cattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgtt 19671879  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671878 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 21154937 - 21155003
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154937 ttataattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 21155003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22105698 - 22105632
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105698 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 22105632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 23707199 - 23707265
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707199 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23707265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24368059 - 24367993
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24368059 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 24367993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24681624 - 24681558
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681624 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24681558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38967659 - 38967593
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967659 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38967593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Original strand, 24642875 - 24642933
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattatta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24642875 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  367 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 24642731 - 24642797
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24642731 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaag 24642797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671139
Alignment:
Q  158 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24671139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24918320 - 24918254
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918320 ttatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24918254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  420 ctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20309208 - 20309108
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20309208 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 20309112  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  20309111 atgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 23708593 - 23708738
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| | ||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||||| | ||||    
T  23708593 cattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgtt 23708691  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708692 atttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679589
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  82 ttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616192
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134326
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 443
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072070
Alignment:
Q  392 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175854
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  25175873 ctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 428
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 32451902 - 32452031
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gt 393  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| |     
T  32451902 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttga 32452000  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32452001 tgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 41524002 - 41524045
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524002 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 67409 - 67339
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  67409 atgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368375
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 21368375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 23711622 - 23711690
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23711622 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  95 gatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26505932 - 26505864
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26505932 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26508410 - 26508342
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26508410 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 27920373 - 27920441
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27920373 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 32039107 - 32039175
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32039107 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 417  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  418 gtctaag 424  Q
    |||||||    
T  23207302 gtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     |||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799467
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaa 23799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 21474827 - 21475030
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474827 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 21474926  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474927 tcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 21475026  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  21475027 gaag 21475030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13989287 - 13989085
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13989287 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13989188  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989187 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13989089  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13989088 gaag 13989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 21923032 - 21923234
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  21923032 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 21923131  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923132 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 21923230  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  21923231 gaag 21923234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16362340 - 16362137
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16362340 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatgg 16362241  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16362240 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgat 16362141  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16362140 gaag 16362137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 15859749 - 15859951
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15859749 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatgg 15859848  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15859849 tcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatggttgat 15859947  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15859948 gaag 15859951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21841188 - 21840986
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  21841188 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21841089  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21841088 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 21840990  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  21840989 gaag 21840986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13989009 - 13988866
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13989009 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13988910  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988909 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 21923310 - 21923453
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923310 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21923409  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923410 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23593474 - 23593677
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| |    
T  23593474 aattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatag 23593573  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23593574 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaat 23593673  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23593674 gaag 23593677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 23593754 - 23593897
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23593754 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 23593853  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593854 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 27161326 - 27161529
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27161326 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 27161425  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||  ||||||||    
T  27161426 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattga 27161525  T
Q  217 tgaa 220  Q
    ||||    
T  27161526 tgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 16274996 - 16275200
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaa-tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16274996 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 16275095  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16275096 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattga 16275195  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  16275196 tgaag 16275200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 21475106 - 21475249
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475106 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 21475205  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475206 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21840910 - 21840766
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840910 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 21840811  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840810 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29298279 - 29298137
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29298279 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29298181  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298180 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29776831 - 29776688
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29776831 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29776732  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776731 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29298663 - 29298461
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29298663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29298564  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  29298563 tcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 29298464  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  29298463 gaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29777162 - 29776960
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29777162 aattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 29777063  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  29777062 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 29776963  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  29776962 gaa 29776960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31612787 - 31612585
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31612787 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 31612688  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | || ||||||||  |||||||||    
T  31612687 tcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgat 31612588  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  31612587 gaa 31612585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31612456 - 31612313
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31612456 cattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 31612357  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612356 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 22122755 - 22122957
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |    
T  22122755 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatag 22122854  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22122855 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22122954  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  22122955 gaa 22122957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16362060 - 16361915
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  16362060 cattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttat 16361961  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361960 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 13212880 - 13213027
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13212880 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgtta 13212979  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212980 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21707310 - 21707167
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  21707310 cattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttat 21707211  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707210 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21711852 - 21711709
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  21711852 cattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttat 21711753  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711752 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21342240 - 21342090
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21342240 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgtta 21342141  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342140 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13227285 - 13227129
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13227285 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13227186  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13227185 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21347105 - 21346961
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21347105 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgtta 21347006  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347005 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 22123086 - 22123230
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgtta 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  22123086 cattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgcta 22123185  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123186 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 22050577 - 22050779
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||| | |  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22050577 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 22050676  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  22050677 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 22050776  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  22050777 gaa 22050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 45574861 - 45575008
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45574861 cattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgtta 45574960  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574961 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 433153 - 433012
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    ||||    
T  433153 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgtta 433057  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433056 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 303 - 446
Target Start/End: Original strand, 15860033 - 15860177
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15860033 ttgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaac 15860132  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15860133 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 16275382 - 16275526
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16275382 cattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgtta 16275481  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275482 tttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29535473 - 29535317
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29535473 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29535374  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29535373 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 50210187 - 50210333
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  50210187 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 50210286  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210287 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40389298 - 40389157
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40389298 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgtta 40389199  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40389198 tttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509783
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  417 ggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 27250703 - 27250850
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27250703 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtta 27250802  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250803 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29298856 - 29298727
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  29298856 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 29298757  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298756 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31612980 - 31612851
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31612980 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31612881  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612880 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31613044
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22532416 - 22532269
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22532416 cattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 22532317  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532316 tttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 9044745 - 9044867
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9044745 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 9044844  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcac 140  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  9044845 tcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15859543 - 15859672
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  15859543 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatga 15859642  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15859643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29777355 - 29777226
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29777355 aattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29777256  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29777255 tcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 22122561 - 22122691
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaa-gttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22122561 aattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatg 22122660  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  22122661 gtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16274803 - 16274932
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16274803 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatgg 16274902  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16274903 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 27161134 - 27161263
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27161134 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 27161233  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27161234 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  441 tgt 443  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 442
Target Start/End: Original strand, 22468688 - 22468816
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22468688 tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468788 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40129506 - 40129387
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  40129506 aattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatag 40129407  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggt 137  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  40129406 tcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21026809 - 21026680
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026809 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatga 21026710  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026709 gtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 16275239 - 16275306
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275239 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 16275306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 22050766 - 22050832
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050766 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 22050832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29776973 - 29776907
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776973 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29776907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16401536 - 16401407
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| |||||| | || ||||| | || |  |||||||||||| || |||||||||||    
T  16401536 aattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatgg 16401437  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16401436 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454673
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31612603 - 31612532
Alignment:
Q  149 attgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612603 attgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaag 31612532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29298421 - 29298355
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298421 ttatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29298355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 21861544 - 21861672
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  21861544 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 21861642  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861643 tattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 21896230 - 21896358
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21896230 cattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 21896328  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896329 tattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 22122944 - 22123010
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122944 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 22123010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161582
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 27161582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135188
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | || |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  77 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  416 cggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 35261055 - 35261180
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||    
T  35261055 cattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 35261150  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261151 tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714546
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 14295610 - 14295672
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295610 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33681153 - 33681010
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||    
T  33681153 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 33681056  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681055 atttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43543323 - 43543269
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43543323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 428
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16758797 - 16758664
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  | | |||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |    
T  16758797 cattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttg 16758700  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758699 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22237680 - 22237630
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237680 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29298474 - 29298408
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  29298474 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801508
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248283
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783212
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865330
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161720
Alignment:
Q  368 tttgtatactgctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13814 - 13611
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13814 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 13715  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13714 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 13615  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  13614 gaag 13611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13535 - 13392
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13535 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13436  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13919 - 13878
Alignment:
Q  106 tttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919 tttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21169 - 20966
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21169 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 21070  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21069 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20970  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20969 gaag 20966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20890 - 20747
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20890 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20791  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14369 - 14166
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14369 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 14270  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14170  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14169 gaag 14166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23271 - 23474
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23271 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 23370  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23470  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23471 gaag 23474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14090 - 13947
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14090 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 13991  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13990 ttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 22917 - 23047
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  22917 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatg 23016  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23017 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 23125 - 23207
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  23125 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 123)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8055451 - 8055248
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055451 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 8055352  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055351 tcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 8055252  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  8055251 gaag 8055248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 1540652 - 1540854
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1540652 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1540751  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540752 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1540850  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  1540851 gaag 1540854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 18334333 - 18334535
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18334333 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18334432  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334433 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 18334531  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18334532 gaag 18334535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24422968 - 24422766
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24422968 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24422869  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422868 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 24422770  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24422769 gaag 24422766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33862215 - 33862013
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33862215 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33862116  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 33862017  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  33862016 gaag 33862013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33864699 - 33864497
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33864699 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33864600  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864599 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 33864501  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  33864500 gaag 33864497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12742739 - 12742536
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12742739 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12742640  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12742639 tcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgat 12742540  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  12742539 gaag 12742536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1598478 - 1598276
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  1598478 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatag 1598379  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598378 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1598280  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  1598279 gaag 1598276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 19847711 - 19847911
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847711 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat----gctagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 19847806  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847807 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattga 19847906  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  19847907 tgaag 19847911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 2290921 - 2291123
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  2290921 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 2291020  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2291021 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgactgat 2291119  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  2291120 gaag 2291123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 17377588 - 17377791
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17377588 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatgg 17377687  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17377688 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 17377787  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  17377788 gaag 17377791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22782648 - 22782446
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782648 aattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatgg 22782549  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782548 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 22782450  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  22782449 gaag 22782446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 26924381 - 26924583
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26924381 aattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 26924480  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924481 tcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 26924579  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  26924580 gaag 26924583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 30676450 - 30676653
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30676450 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatgg 30676549  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30676550 taaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 30676649  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  30676650 gaag 30676653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25688924 - 25688721
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25688924 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatgg 25688825  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688824 tcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgag 25688725  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  25688724 gaag 25688721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34963795 - 34963592
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34963795 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 34963696  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34963695 tcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 34963596  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  34963595 gaag 34963592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25535829 - 25535641
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25535829 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 25535730  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25535729 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12742460 - 12742317
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742460 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 12742361  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742360 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 18334611 - 18334754
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334611 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 18334710  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334711 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18914354 - 18914151
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18914354 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatgg 18914255  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18914254 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgat 18914155  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18914154 gaag 18914151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19005189 - 19005046
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005189 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 19005090  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005089 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 19858938 - 19859081
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19858938 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 19859037  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859038 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22782370 - 22782227
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782370 cattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 22782271  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782270 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24422690 - 24422547
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422690 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 24422591  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422590 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Original strand, 31630281 - 31630480
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31630281 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 31630380  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31630381 tcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 31630480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33861937 - 33861794
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33861937 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 33861838  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861837 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33864421 - 33864278
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864421 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 33864322  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864321 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 19858663 - 19858862
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19858663 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgtc---tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19858759  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858760 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgc-tgtgaatacgatattgtccatgattgat 19858858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 30676729 - 30676874
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676729 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 30676828  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676829 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 2291199 - 2291342
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2291199 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 2291298  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291299 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8055172 - 8055029
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8055172 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttat 8055073  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055072 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23992844 - 23992642
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23992844 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23992745  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992744 tcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23992646  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23992645 gaag 23992642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25754952 - 25754809
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25754952 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 25754853  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754852 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 26924659 - 26924802
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26924659 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 26924758  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924759 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 34963516 - 34963371
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963516 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 34963417  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34963416 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 28289077 - 28289278
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28289077 aattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 28289176  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28289177 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatgattgat 28289274  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  28289275 gaag 28289278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 1540930 - 1541073
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1540930 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1541029  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1541030 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19005573 - 19005371
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19005573 aattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 19005474  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  19005473 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgat 19005374  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  19005373 gaa 19005371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25656771 - 25656629
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25656771 attagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatt 25656672  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656671 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttat 1595593  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595592 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 3852036 - 3852179
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3852036 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 3852135  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852136 taaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatt 25688545  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25688544 taactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Original strand, 16448545 - 16448686
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448545 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 16448644  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16448645 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 20556913 - 20557054
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20556913 cattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20557010  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20557011 ttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18456862 - 18456735
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18456862 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 18456763  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456762 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18462022 - 18461895
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18462022 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 18461923  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461922 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12942576 - 12942420
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgat 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12942576 tttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgat 12942477  T
Q  165 gaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12942476 gaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 12942420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 25629329 - 25629476
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  25629329 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaa 25629428  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629429 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29060687 - 29060540
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29060687 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 29060588  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060587 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 17287770 - 17287917
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17287770 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgtta 17287869  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287870 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20593920 - 20593773
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  20593920 cattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttttta 20593821  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593820 tttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Original strand, 18409825 - 18409947
Alignment:
Q  321 attgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409825 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18914740 - 18914615
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18914740 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatgg 18914641  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18914640 tcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 19303515 - 19303661
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19303515 cattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgtta 19303613  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303614 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2034
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1905 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 2004  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2005 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 8864 - 8993
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8864 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8963  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16496373 - 16496244
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496373 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 16496274  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496273 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19005766 - 19005637
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  19005766 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgt 19005667  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005666 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 20360934 - 20361081
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  20360934 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgtta 20361033  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361034 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1598668 - 1598542
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1598668 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtca 1598569  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598568 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  331 tgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  430 taagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 22780201 - 22780348
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  22780201 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgtta 22780300  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780301 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Original strand, 26924199 - 26924313
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26924199 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 26924298  T
Q  129 aacgtaggtcacagt 143  Q
     ||||||||||||||    
T  26924299 cacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638404
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  20638404 t 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23415386 - 23415258
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23415386 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23415287  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  23415286 tcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 112 - 242
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  112 aaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatg 211  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  212 gtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25689118 - 25688988
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  25689118 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatg 25689019  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689018 gtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19847519 - 19847648
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  19847519 aattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcg 19847618  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19847619 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25644468 - 25644335
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  25644468 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgtt 25644369  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644368 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27557144 - 27557016
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27557144 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatgg 27557045  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  27557044 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1598864 - 1598735
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| || |||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1598864 aattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 1598765  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598764 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18914547 - 18914422
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  18914547 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatgg 18914448  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18914447 tcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 30676257 - 30676386
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  || ||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30676257 aattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 30676356  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30676357 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 127
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630197
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  120 agattact 127  Q
    | ||||||    
T  31630190 aaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 31630523 - 31630590
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630523 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 31630590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Original strand, 15892149 - 15892231
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892149 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15875734 - 15875630
Alignment:
Q  107 ttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  15875734 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgt 15875645  T
Q  207 ccatgattgatgaag 221  Q
     ||||||||||||||    
T  15875644 tcatgattgatgaag 15875630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  28 aggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  128 gaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19005331 - 19005266
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005331 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 19005266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18914112 - 18914046
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914112 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18914046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333339
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394079
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 147
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Original strand, 19847968 - 19848114
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||| || || |||  ||||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||    
T  19847968 cattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 19848067  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848068 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 443
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245586
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 35245588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15875591 - 15875526
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  15875591 ttatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaa 15875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496592
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809003
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 428
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098620
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Original strand, 17883238 - 17883305
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttga 85  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17883238 aattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992429
Alignment:
Q  331 tgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  430 taagatgatgat 441  Q
    ||||||| ||||    
T  23992440 taagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Original strand, 16920638 - 16920751
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||| ||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16920638 gttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagat 16920734  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    | | |||||||||||||    
T  16920735 gttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652199
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 8227485 - 8227632
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-tt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |  ||||||| |  ||    
T  8227485 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttgctgatcatt 8227583  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227584 aactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  425 ttga 428  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831503
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656848
Alignment:
Q  172 tatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaag 25656848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33864831 - 33864763
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864831 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18907165 - 18907111
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907165 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862978
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873120
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766695
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  355 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | || |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  382 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603506
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  25603506 t 25603506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611844
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgatg 442  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  25611844 t 25611844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25737064 - 25737028
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25737064 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 26924056 - 26924124
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  26924056 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056717
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaa 35056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 118)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29267775 - 29267572
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267775 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 29267676  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29267675 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgat 29267576  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29267575 gaag 29267572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 15118093 - 15118295
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15118093 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15118192  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118193 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15118291  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15118292 gaag 15118295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 52872813 - 52873014
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52872813 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 52872912  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52872913 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 52873012  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  52873013 ga 52873014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44615710 - 44615507
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  44615710 aattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 44615611  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615610 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 44615511  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  44615510 gaag 44615507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15534603 - 15534400
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534603 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 15534504  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15534503 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 15534404  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15534403 gaag 15534400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 50222080 - 50222282
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  50222080 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 50222179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222180 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 50222278  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  50222279 gaag 50222282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 14970447 - 14970650
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970447 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 14970546  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14970547 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgat 14970646  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14970647 gaag 14970650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 362603 - 362399
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  362603 aaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatg 362504  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  362503 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 362404  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  362403 tgaag 362399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3515430 - 3515226
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3515430 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatg 3515331  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515330 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattga 3515231  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  3515230 tgaag 3515226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 44772824 - 44773026
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  44772824 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatag 44772923  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772924 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 44773022  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  44773023 gaag 44773026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 18215293 - 18215436
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215293 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 18215392  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215393 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19243122 - 19242919
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19243122 aattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19243023  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243022 ttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 19242923  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  19242922 gaag 19242919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36038292 - 36038089
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36038292 aattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 36038193  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36038192 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 36038093  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  36038092 gaag 36038089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 49547514 - 49547717
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547514 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 49547613  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547614 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 49547713  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  49547714 gaag 49547717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 19617809 - 19618010
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19617809 ttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtc 19617908  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19617909 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 19618008  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  19618009 ag 19618010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 12326 - 12469
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12326 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 12425  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 15118371 - 15118514
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118371 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15118470  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118471 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 52312653 - 52312510
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312653 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 52312554  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312553 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19242842 - 19242693
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19242842 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttat 19242743  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242742 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 1837528 - 1837671
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1837528 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1837627  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837628 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3515150 - 3515007
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515150 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttt 3515051  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515050 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 7640927 - 7641129
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7640927 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 7641026  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7641027 ttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgattgat 7641125  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  7641126 gaag 7641129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 15495914 - 15496117
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15495914 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatgg 15496013  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15496014 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgat 15496113  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15496114 gaag 15496117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 18239438 - 18239581
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18239438 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttat 18239537  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239538 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44615431 - 44615288
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44615431 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 44615332  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615331 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 44773106 - 44773249
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44773106 cattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 44773205  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773206 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 50222358 - 50222501
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50222358 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttat 50222457  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222458 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 11995 - 12164
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11995 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12094  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12095 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 12164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14048999 - 14048798
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  14048999 aattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatgg 14048900  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14048899 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 14048800  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  14048799 ga 14048798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 19618191 - 19618336
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618191 cattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 19618290  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19618291 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 14746252 - 14746455
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746252 aattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatgg 14746351  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  14746352 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgat 14746451  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14746452 gaag 14746455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 23803284 - 23803427
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23803284 cattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 23803383  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803384 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 51463887 - 51464030
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51463887 cattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 51463986  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463987 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52312983 - 52312782
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  52312983 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 52312884  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  52312883 tca-attactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 52312785  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  52312784 gaa 52312782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44102357 - 44102214
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  44102357 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttat 44102258  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102257 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19858001 - 19857807
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  19858001 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatg 19857902  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19857901 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattga 19857812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 298 - 442
Target Start/End: Original strand, 14970727 - 14970871
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14970727 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatt 14970826  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14970827 taactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 15355343 - 15355483
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15355343 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 15355442  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355443 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 44928898 - 44929042
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44928898 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgtta 44928997  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928998 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 1837260 - 1837452
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |    
T  1837260 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatag 1837359  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837360 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatattgtccatgattgat 1837448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12611086 - 12610950
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||    
T  12611086 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttat 12610994  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12610993 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 21815604 - 21815731
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  21815604 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttat 21815703  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815704 ttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgct-gtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 322 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 421  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  422 aagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15367831 - 15367690
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15367831 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15367732  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367731 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15370159 - 15370018
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15370159 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15370060  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370059 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15402844 - 15402703
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15402844 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15402745  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402744 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15371343 - 15371202
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15371343 ttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15371244  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371243 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15373624 - 15373483
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15373624 ttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15373525  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373524 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16223673 - 16223532
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16223673 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 16223574  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223573 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 7641211 - 7641344
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||    
T  7641211 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttat 7641300  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641301 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7798921 - 7798774
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7798921 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7798822  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798821 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20149973 - 20149832
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20149973 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctgttgtta 20149874  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    ||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149873 ttttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7089024 - 7088877
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7089024 cattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7088925  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7088924 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14038795 - 14038653
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038795 cattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgtta 14038696  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14038695 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 16377497 - 16377639
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16377497 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgtta 16377594  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377595 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 18214751 - 18214880
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18214751 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18214850  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18214851 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873488
Alignment:
Q  331 tgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  430 taagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215112
Alignment:
Q  101 tagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacga 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  201 tattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaag 18215112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7893850 - 7893703
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  7893850 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgtta 7893751  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893750 tttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12902904 - 12902757
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12902904 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 12902805  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902804 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 362988 - 362859
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362988 aattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatgg 362889  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  362888 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 52872619 - 52872749
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52872619 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 52872718  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52872719 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3515622 - 3515493
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3515622 aattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 3515523  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3515522 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22636582 - 22636437
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  22636582 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgtta 22636483  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636482 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52313369 - 52313240
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52313369 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 52313270  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313269 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 362795 - 362668
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  362795 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 362696  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  362695 tcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 16270210 - 16270356
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  16270210 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 16270308  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270309 tttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44052976 - 44052829
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  44052976 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgtta 44052877  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44052876 tttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  137 tcacagtgaat 147  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14970254 - 14970383
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970254 aattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14970353  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14970354 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15495721 - 15495850
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15495721 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15495820  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15495821 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6900037 - 6899891
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  6900037 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 6899939  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899938 tttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19617614 - 19617743
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  19617614 aattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatgg 19617713  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19617714 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19858193 - 19858064
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19858193 aattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19858094  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19858093 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52313176 - 52313047
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  52313176 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatgg 52313077  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52313076 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 15355071 - 15355162
Alignment:
Q  130 acgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15355071 acgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 15355162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 16239944 - 16240090
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||    
T  16239944 cattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgtta 16240042  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240043 tttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 14746059 - 14746188
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14746059 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14746158  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  14746159 tcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239362
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtc 207  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  208 catgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaag 18239362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  358 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19857768 - 19857701
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857768 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19857701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 436
Target Start/End: Original strand, 23374351 - 23374473
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374351 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23374450  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    |||| ||||||||| | ||||||    
T  23374451 gtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22353980 - 22353835
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||| || || |||||||||||    
T  22353980 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgtta 22353881  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  22353880 tttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 12184 - 12250
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 18215151 - 18215217
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215151 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18215217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Original strand, 15355201 - 15355266
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355201 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 15355266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 13825 - 13953
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  13825 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 13923  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13924 tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52312795 - 52312729
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52312795 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaag 52312729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30147338 - 30147189
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30147338 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatg 30147239  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatga 166  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30147238 gtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706409
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 14746494 - 14746560
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14746494 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaag 14746560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 15496948 - 15497014
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496948 ttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 15497014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 19618049 - 19618115
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618049 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19618115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 52873055 - 52873121
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873055 ttatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 52873121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     |||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 43198527 - 43198661
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gt 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||  |||| |||||   | ||||| ||| || || |||||||||| ||    
T  43198527 cattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgt 43198626  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198627 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 52243168 - 52243302
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 392  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |    
T  52243168 cattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttg 52243266  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243267 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551817
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 415  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttgattgt-attcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  416 cggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046487
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 428
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  425 ttga 428  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  77 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  30 gtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846360
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 369
Target Start/End: Original strand, 15464908 - 15464977
Alignment:
Q  300 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttt 369  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464908 tacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Original strand, 12778423 - 12778459
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12778423 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995644
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157579
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  110 agttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362304
Alignment:
Q  189 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaag 362304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 424
Target Start/End: Original strand, 46640472 - 46640558
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640472 catttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 107)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38619858 - 38619655
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38619858 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 38619759  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619758 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 38619659  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  38619658 gaag 38619655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 17516904 - 17517107
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17516904 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcg 17517003  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517004 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 17517103  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  17517104 gaag 17517107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 2154372 - 2154575
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2154372 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 2154471  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2154472 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgat 2154571  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  2154572 gaag 2154575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20909433 - 20909231
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20909433 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20909334  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909333 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 20909235  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20909234 gaag 20909231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 264509 - 264711
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  264509 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 264608  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264609 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 264707  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  264708 gaag 264711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 20901661 - 20901864
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20901661 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20901760  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901761 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 20901860  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20901861 gaag 20901864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 10732681 - 10732883
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  10732681 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 10732780  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10732781 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgat 10732879  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  10732880 gaag 10732883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23064935 - 23064732
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23064935 aattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23064836  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064835 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 23064736  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  23064735 gaag 23064732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39245557 - 39245355
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  39245557 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 39245458  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245457 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 39245359  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  39245358 gaag 39245355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 42245106 - 42245308
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |    
T  42245106 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatag 42245205  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245206 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 42245304  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  42245305 gaag 42245308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39363806 - 39363603
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39363806 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 39363707  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363706 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 39363607  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  39363606 gaag 39363603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 37804643 - 37804846
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37804643 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatgg 37804742  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37804743 tcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaat 37804842  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  37804843 gaag 37804846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 264787 - 264930
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  264787 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 264886  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264887 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 10732959 - 10733102
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10732959 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 10733058  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733059 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29346401 - 29346199
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29346401 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29346302  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346301 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29346203  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29346202 gaag 29346199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39363527 - 39363384
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39363527 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39363428  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363427 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20909155 - 20909012
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20909155 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttat 20909056  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909055 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29330077 - 29329934
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29330077 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 29329978  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329977 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29348874 - 29348672
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29348874 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29348775  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348774 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29348676  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29348675 gaag 29348672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29351347 - 29351145
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  29351347 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29351248  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351247 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 29351149  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  29351148 gaag 29351145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 42245384 - 42245527
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245384 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 42245483  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245484 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 20917587 - 20917789
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20917587 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20917686  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  20917687 tcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 20917786  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  20917787 gaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32027867 - 32027665
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32027867 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 32027768  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  32027767 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 32027668  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  32027667 gaa 32027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29346123 - 29345980
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29346123 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttat 29346024  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346023 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39245279 - 39245136
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245279 cattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 39245180  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245179 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 36154802 - 36154942
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  36154802 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttat 36154898  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154899 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776577
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  9776580 gaag 9776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 11581218 - 11581361
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11581218 cattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 11581317  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581318 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29348596 - 29348453
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  29348596 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttat 29348497  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348496 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29351069 - 29350926
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  29351069 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttat 29350970  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350969 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32027536 - 32027393
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32027536 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 32027437  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027436 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Original strand, 18319052 - 18319193
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18319052 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgtta 18319151  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18319152 tttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 20902027 - 20902172
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902027 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 20902126  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20902127 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 2154632 - 2154776
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2154632 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgtta 2154731  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154732 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29330404 - 29330203
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29330404 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29330305  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || || ||| ||||  |||||||||    
T  29330304 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgat 29330206  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  29330205 gaa 29330203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 10775694 - 10775838
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  10775694 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgtta 10775793  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775794 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 440
Target Start/End: Original strand, 20917973 - 20918110
Alignment:
Q  299 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20917973 ttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20918068  T
Q  399 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918069 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 307 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38619568 - 38619434
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38619568 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 38619469  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619468 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31061212 - 31061068
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31061212 cattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgtta 31061113  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061112 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 307 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23064645 - 23064512
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23064645 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 23064546  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064545 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24067251 - 24067110
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24067251 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 24067152  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24067151 tttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9078099 - 9077952
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9078099 cattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtta 9078000  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9077999 tttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 23390470 - 23390617
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23390470 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgtta 23390569  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390570 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25421679 - 25421532
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25421679 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 25421580  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421579 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 443
Target Start/End: Original strand, 21997551 - 21997655
Alignment:
Q  340 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21997551 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21997650  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  21997651 gatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529223
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 416  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  417 ggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 17516517 - 17516647
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17516517 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 17516616  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17516617 gtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 21729056 - 21729185
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21729155  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729156 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 21808381 - 21808510
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808381 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21808480  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808481 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1096614 - 1096467
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  1096614 cattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgtta 1096515  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096514 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412187
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 301 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24493711 - 24493569
Alignment:
Q  301 acttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattta 399  Q
    ||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  24493711 acttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttactta 24493613  T
Q  400 actaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493612 accaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028254 - 32028124
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32028254 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028155  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028154 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 8286863 - 8286964
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8286863 ttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 8286962  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  8286963 gt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20901468 - 20901597
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20901468 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 20901567  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20901568 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13025457 - 13025311
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13025457 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 13025359  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025358 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13095641 - 13095495
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13095641 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 13095543  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095542 tttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25431541 - 25431395
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25431541 cattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 25431442  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25431441 tttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028641 - 32028511
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32028641 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028542  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32028541 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 295826 - 295951
Alignment:
Q  22 ggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcag 121  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  295826 ggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaa 295925  T
Q  122 attactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  295926 attactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29330597 - 29330468
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29330597 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29330498  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  29330497 tcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 296015 - 296144
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  296015 aattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 296114  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  296115 tcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 17516711 - 17516840
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  17516711 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcg 17516810  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  17516811 tcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917523
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 2154179 - 2154308
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  2154179 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 2154278  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2154279 tcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028447 - 32028318
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  32028447 aattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatgg 32028348  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  32028347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 20901903 - 20901970
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901903 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20901970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22075148 - 22075018
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29330216 - 29330150
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330216 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29330150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32027678 - 32027612
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027678 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 32027612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 20917829 - 20917895
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20917829 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaag 20917895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329618
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293090
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32028060 - 32027931
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32028060 aattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32027961  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32027960 tcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22144196 - 22144068
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| | | ||||| ||| ||||    
T  22144196 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgatgtctgtt 22144098  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144097 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 385
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 385  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 440
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806904
Alignment:
Q  381 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 443
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502277
Alignment:
Q  334 tgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 431  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  432 agatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||    
T  21502266 agatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660956
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 424
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37724048 - 37723922
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgtt 394  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| |   ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  37724048 cattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgtt 37723952  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723951 atttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959649
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314577
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565546
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012154
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  26012133 ctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517320
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704075
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973808
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668898
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 264370 - 264445
Alignment:
Q  72 tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  264370 tgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 424
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20909565 - 20909497
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20909565 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873254
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggt 118  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  108 tgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743974
Alignment:
Q  159 attgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 18743974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Original strand, 20917776 - 20917842
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  20917776 ttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaa 20917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23506573 - 23506503
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  23506573 atgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattact 23506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032323
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 439
Target Start/End: Original strand, 23501412 - 23501472
Alignment:
Q  379 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501412 ctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 130)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1484823 - 1484621
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1484823 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1484724  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484723 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 1484625  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  1484624 gaag 1484621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 14409185 - 14409387
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14409185 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14409284  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409285 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 14409383  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14409384 gaag 14409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 5853033 - 5853235
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  5853033 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 5853132  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853133 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 5853231  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  5853232 gaag 5853235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4483702 - 4483499
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4483702 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4483603  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483602 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgat 4483503  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  4483502 gaag 4483499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 27472157 - 27472360
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27472157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 27472256  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27472257 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 27472356  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  27472357 gaag 27472360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15070982 - 15070779
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  15070982 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatgg 15070883  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070882 tcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15070783  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  15070782 gaag 15070779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 24485784 - 24485987
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  24485784 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatag 24485883  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24485884 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 24485983  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  24485984 gaag 24485987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14824196 - 14823994
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14824196 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14824097  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14824096 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgat 14823998  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  14823997 gaag 14823994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32122150 - 32121947
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32122150 aattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 32122051  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122050 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 32121951  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  32121950 gaag 32121947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 16401665 - 16401868
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  16401665 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatag 16401764  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16401765 tcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 16401864  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16401865 gaag 16401868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 16413056 - 16413259
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16413056 aattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16413155  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16413156 tcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16413255  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  16413256 gaag 16413259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 18677805 - 18678008
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18677805 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 18677904  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18677905 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgat 18678004  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  18678005 gaag 18678008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 20045936 - 20046138
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20045936 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20046035  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20046036 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgat 20046134  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  20046135 gaag 20046138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22002174 - 22001972
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  22002174 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 22002075  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002074 tcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 22001976  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  22001975 gaag 22001972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 38549745 - 38549947
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549745 aattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38549844  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549845 tcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38549944  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  38549945 gaa 38549947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 4542114 - 4542316
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |    
T  4542114 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatag 4542213  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542214 tcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 4542312  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  4542313 gaag 4542316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 14409463 - 14409606
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409463 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 14409562  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409563 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16198316 - 16198115
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16198316 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatgg 16198217  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16198216 tccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 16198117  T
Q  218 ga 219  Q
    ||    
T  16198116 ga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1484545 - 1484402
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484545 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 1484446  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484445 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 5853311 - 5853454
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853311 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 5853410  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853411 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 16413335 - 16413474
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413335 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 16413434  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413435 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20403370 - 20403227
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403370 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20403271  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403270 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22001896 - 22001753
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22001896 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 22001797  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001796 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41598331 - 41598188
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41598331 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 41598232  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598231 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24049032 - 24048841
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  24049032 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 24048933  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccat 210  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  24048932 tcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4483423 - 4483281
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4483423 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta- 4483325  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 15203250 - 15203393
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15203250 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 15203349  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203350 ttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 20046214 - 20046357
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20046214 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 20046313  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046314 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 1326672 - 1326875
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1326672 aattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 1326771  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1326772 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgat 1326871  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  1326872 gaag 1326875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 4542392 - 4542535
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  4542392 cattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttat 4542491  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 15202919 - 15203121
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  15202919 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15203018  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| || ||| || |  |||||||||    
T  15203019 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgat 15203118  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  15203119 gaa 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20403701 - 20403499
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20403701 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattg 20403602  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  20403601 tcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 20403502  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  20403501 gaa 20403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19896411 - 19896265
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattat---gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19896411 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgt 19896312  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896311 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 19936648 - 19936808
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  19936648 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatag 19936747  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgt 178  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19936748 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatgt 19936808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290584
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14823916 - 14823774
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14823916 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 14823817  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14823816 ttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19896743 - 19896541
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19896743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19896644  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||    
T  19896643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 19896544  T
Q  218 gaa 220  Q
    |||    
T  19896543 gaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 45290713 - 45290853
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45290713 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 45290812  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290813 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 303 - 446
Target Start/End: Original strand, 19937030 - 19937174
Alignment:
Q  303 ttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaac 401  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19937030 ttgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 19937129  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19937130 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 16092316 - 16092463
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16092316 cattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 16092415  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092416 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6759402 - 6759255
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759402 cattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 6759306  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759305 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 19801401 - 19801527
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19801401 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttat 19801499  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801500 ttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 307 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15070692 - 15070571
Alignment:
Q  307 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15070692 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15070593  T
Q  406 ctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15070592 ctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 25484294 - 25484430
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||    
T  25484294 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttat 25484386  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484387 ttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26224062 - 26223917
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  26224062 cattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctttattgctgttgttat 26223963  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223962 ttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7372925 - 7372778
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7372925 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 7372826  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372825 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19896937 - 19896807
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19896937 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatg 19896838  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  19896837 gtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 28649018 - 28649164
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  28649018 cattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgtta 28649117  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649118 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20403894 - 20403765
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403894 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20403795  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403794 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 18818383 - 18818530
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18818383 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 18818482  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818483 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 15202726 - 15202856
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15202726 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15202825  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaata 148  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15202826 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 14397481 - 14397609
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14397481 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatgg 14397580  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14397581 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20536355 - 20536208
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20536355 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgtta 20536256  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536255 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 21923902 - 21924049
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  21923902 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgtta 21924001  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924002 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 27471963 - 27472093
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27471963 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 27472062  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27472063 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15071175 - 15071046
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15071175 aattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15071076  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15071075 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 21918992 - 21919121
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918992 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21919091  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919092 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 331 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406379
Alignment:
Q  331 tgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  430 taagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32122343 - 32122214
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32122343 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 32122244  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32122243 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38549552 - 38549681
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549552 aattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 38549651  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38549652 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22626882 - 22626736
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22626882 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 22626784  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626783 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22875211 - 22875065
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  22875211 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgcta 22875113  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875112 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 147
Target Start/End: Original strand, 16401287 - 16401408
Alignment:
Q  26 ttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16401287 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 16401386  T
Q  126 ctgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  16401387 cagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19897130 - 19897000
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19897130 aaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 19897031  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  19897030 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 45290287 - 45290389
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45290287 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 45290386  T
Q  117 gtc 119  Q
    |||    
T  45290387 gtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 15202533 - 15202662
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15202533 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15202632  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15202633 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 16412866 - 16412992
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16412866 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 16412965  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412966 aattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 16401472 - 16401601
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16401472 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16401571  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||| | ||||| | |||| |||||    
T  16401572 tcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 38549360 - 38549488
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38549360 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38549459  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38549460 tcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 18879210 - 18879352
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||     |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18879210 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 18879304  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879305 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24049225 - 24049104
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24049225 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 24049126  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtca 139  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
T  24049125 tcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971257
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 20982603 - 20982670
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982603 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20982670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 13425335 - 13425402
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13425335 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 13425402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20403512 - 20403446
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403512 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20403446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32810216 - 32810150
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810216 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 32810150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 38549987 - 38550054
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549987 ttatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38550054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855372
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38855349 ctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 45290571 - 45290637
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290571 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 45290637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982564
Alignment:
Q  155 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 20982564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936584
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  || |||| |||||||| |||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  19936455 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgc 19936554  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  19936555 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520368
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||    
T  6520384 gattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 1326914 - 1326980
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326914 ttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 1326980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19896554 - 19896488
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896554 ttatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19896488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Original strand, 16401907 - 16401972
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401907 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 16401972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936946
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19936946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 15203108 - 15203174
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15203108 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaag 15203174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 425
Target Start/End: Original strand, 13508059 - 13508188
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || || || ||| || || |||||||| |||||    
T  13508059 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgtt 13508157  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508158 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 425
Target Start/End: Original strand, 13597591 - 13597720
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||    
T  13597591 cattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgtt 13597689  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597690 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23648652 - 23648554
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648652 tgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140916
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  17140920 gatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425296
Alignment:
Q  166 aattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 13425296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678221
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21491057 - 21490995
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491057 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361034
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttat 11361034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20498709 - 20498581
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  20498709 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtt 20498611  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498610 tattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 21389471 - 21389571
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21389471 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21389567  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  21389568 atgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 21396001 - 21396101
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21396001 atttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21396097  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  21396098 atgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 21778797 - 21778897
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21778893  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  21778894 atgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Original strand, 21790494 - 21790594
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21790494 atttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21790590  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  21790591 atgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Original strand, 5866292 - 5866395
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  5866292 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 5866390  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  5866391 gatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 17612084 - 17612231
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| || |||||    
T  17612084 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgttgattgtt 17612182  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612183 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121734
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760962
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 428
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  382 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 127
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355815
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32810318 - 32810263
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  32810318 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 5852901 - 5852969
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5852901 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Original strand, 14409053 - 14409121
Alignment:
Q  79 ggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409053 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513645
Alignment:
Q  159 attgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 21513645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Original strand, 24486063 - 24486093
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgaga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486063 cattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815674
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 18815674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988740
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 38988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019837
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 39019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6368 - 6166
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6368 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 6269  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6268 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 6170  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  6169 gaag 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 12)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 94832 - 94630
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  94832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 94733  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94732 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 94634  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  94633 gaag 94630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 17180 - 17383
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17180 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17279  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17280 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgat 17379  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  17380 gaag 17383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 94554 - 94411
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94554 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 94455  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94454 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 17459 - 17598
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17459 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttat 17558  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17559 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44598 - 44454
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44598 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 44499  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44498 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100378
Alignment:
Q  311 tatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctg 408  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  409 catgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17116
Alignment:
Q  35 aacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgta 134  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||    
T  17004 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgta 17103  T
Q  135 ggtcacagtgaat 147  Q
    ||||| |||||||    
T  17104 ggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119875
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40291
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40272 ctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  29 ggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||    |||||| |||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||||| |||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  129 aacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101503
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38596
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40821 - 40619
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40821 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 40722  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40721 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 40623  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  40622 gaag 40619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40400
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40543 cattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 40444  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443 ttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40926 - 40885
Alignment:
Q  106 tttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40926 tttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37860
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  37869 tcaaattact 37860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 134632 - 134430
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  134632 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 134533  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134532 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 134434  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  134433 gaag 134430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 137101 - 136899
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  137101 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137002  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  137001 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 136903  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  136902 gaag 136899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 139570 - 139368
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  139570 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 139471  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139470 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 139372  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  139371 gaag 139368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 142039 - 141837
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  142039 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 141940  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141939 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 141841  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  141840 gaag 141837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 144508 - 144306
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  144508 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 144409  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144408 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 144310  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  144309 gaag 144306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 136823 - 136680
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  136823 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 136724  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136723 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 139292 - 139149
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  139292 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 139193  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 144230 - 144087
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  144230 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 144131  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144130 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 134354 - 134211
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134354 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 134255  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134254 ttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 141761 - 141618
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  141761 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttat 141662  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141661 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 415  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  416 cggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 62302 - 62216
Alignment:
Q  340 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62302 gcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 426
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  629 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 530  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  529 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgat 430  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  429 gaag 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 983 - 853
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  983 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 884  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  883 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 693
Alignment:
Q  65 tttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  775 tttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3445 - 3242
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3445 aattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 3346  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3345 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgat 3246  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  3245 gaag 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9663 - 9461
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  9663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 9564  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9563 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgat 9465  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  9464 gaag 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9385 - 9241
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9385 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttat 9286  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9285 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10010
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10211 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 10112  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10111 aaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 10012  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  10011 ag 10010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10406 - 10277
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  10406 aattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattg 10307  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10306 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10470
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9938
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9971 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 9938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 267 - 463
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  267 tggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 366  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  367 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 12268 - 12413
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12268 cattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttat 12367  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12368 ttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 506 - 573
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  506 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 4043 - 4246
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4043 aattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4142  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4143 tcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgat 4242  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  4243 gaag 4246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Original strand, 3657 - 3782
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  || ||||||||||     
T  3657 aattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgc 3756  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagt 143  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3757 tcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 3850 - 3979
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||  || ||||||||||     
T  3850 aattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatga 3949  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3950 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  95 gatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 6676 - 6879
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6676 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6775  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6776 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgat 6875  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  6876 gaag 6879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 6483 - 6612
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6483 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6582  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13570
Alignment:
Q  30 gtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactga 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  130 acgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 13570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 43002
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  43159 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtc 43060  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatg 177  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43059 aaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43225
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43354 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 43255  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43254 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11712 - 11508
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11712 aaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttata 11613  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattga 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11612 gtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattga 11513  T
Q  217 tgaag 221  Q
    |||||    
T  11512 tgaag 11508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11431 - 11286
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11431 cattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 11332  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11331 ttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5116 - 4913
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  5116 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 5017  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5016 tcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 4917  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  4916 gaag 4913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4837 - 4694
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 4738  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4737 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5180
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  5309 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatgg 5210  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5209 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30441 - 30238
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  30441 aattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatgg 30342  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30341 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 30242  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  30241 gaag 30238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30074 - 29931
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30074 attatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 29975  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29974 taactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30634 - 30505
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  30634 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatgg 30535  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30534 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30132
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 30132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 158469 - 158612
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  158469 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttat 158568  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158569 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 339924 - 340065
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  339924 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-gtta 340020  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  340021 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 808
Alignment:
Q  23 gtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaga 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  1006 gtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaa 907  T
Q  123 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  906 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1075
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1204 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 1105  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||| |||||| |||||||    
T  1104 tcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1225
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 769 - 703
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  769 ttatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15141
Alignment:
Q  20 ttggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtc 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  120 agattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatga 15143  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  15142 ag 15141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 11080 - 11249
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  11080 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatgg 11179  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 187  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11180 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 11249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11016
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10887 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 10986  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10987 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15398
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15526 aattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15428  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15427 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 53607 - 53815
Alignment:
Q  13 catcaaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||     
T  53607 catcaaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgaga 53706  T
Q  113 tatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatga 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  53707 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatga 53806  T
Q  213 ttgatgaag 221  Q
    |||||||||    
T  53807 ttgatgaag 53815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 397  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1647
Alignment:
Q  37 cacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtagg 136  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  137 tcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10772
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916 cattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 10817  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10816 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10992
Alignment:
Q  70 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaatt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  170 agtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16927 - 16784
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16927 cattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 16828  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38599
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38595  T
Q  218 gaag 221  Q
    ||||    
T  38596 gaag 38599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  300 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatt 397  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| ||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  398 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 82215 - 82072
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  82215 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 82116  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82115 ttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 22645 - 22776
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| |||||| |||    
T  22645 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgtt 22742  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22743 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 501227 - 501088
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501227 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttat 501128  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501127 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 85598 - 85742
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  85598 cattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 85697  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85698 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 501486 - 501347
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  501486 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatga 501388  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatg 158  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  501387 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 501676 - 501550
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  501676 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 501577  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  501576 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 160788 - 160688
Alignment:
Q  340 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  160788 gcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatga 160690  T
Q  438 tg 439  Q
    ||    
T  160689 tg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501305
Alignment:
Q  173 atatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 501305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6873 - 6682
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6873 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 6774  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgat 217  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6773 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatattgttcatgattgat 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6937
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7066 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6967  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6966 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8161 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatgg 8062  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgta 183  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8061 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8351 - 8225
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8351 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 8252  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8251 aattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8547 - 8421
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8547 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatgg 8448  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtg 144  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||    
T  8447 tgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5657
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggt 5667  T
Q  420 ctaagttgat 429  Q
    ||||||||||    
T  5666 ctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 249 - 106
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  249 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttat 150  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  149 ttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9893 - 9744
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9893 cattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta 9794  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9793 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33088 - 32942
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  33088 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 32990  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32989 tttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38907 - 38761
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  38907 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 38809  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38808 tttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10017 - 9950
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10017 ttatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaag 9950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4440 - 4300
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4440 cattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 4341  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4214
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4358 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgtta 4259  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4258 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12201 - 12064
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |    
T  12201 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------t 12108  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12107 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57708
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgatta 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgat 213  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23029 - 22886
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23029 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctgttgttat 22930  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 79303 - 79430
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  79303 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttat 79402  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79403 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 17189 - 17337
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtatactgc-tgtgttgctgttgt 393  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  17189 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgt 17288  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17289 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 20398 - 20524
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20398 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttat 20496  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20497 ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 128897 - 128751
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  | ||||||| |||||||    
T  128897 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttat 128798  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  128797 ttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 68384 - 68227
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68384 aaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 68285  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtat 174  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  68284 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46995
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  298 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 26039 - 26179
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26039 cattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 26138  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26139 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Original strand, 1299 - 1440
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  1299 cattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgtta 1398  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1399 tttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 2147 - 2291
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2147 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 2246  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2247 tttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 18001 - 18148
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||    
T  18001 cattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgtt 18099  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18100 aattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 161108 - 161252
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  161108 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgata 161207  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  161208 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 361
Target Start/End: Original strand, 164609 - 164674
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgactggcatttgatattattatgtcat 361  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  164609 cattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3271
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  3125 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgtta 3223  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3224 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 16574 - 16721
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgct-gtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16574 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgtta 16673  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16674 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52060 - 51913
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  52060 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgtta 51961  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51960 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 167952 - 168099
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  167952 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 168051  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  168052 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3306
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3160 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 3259  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3260 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1740
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1869 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1770  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1769 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1677 - 1640
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1677 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4654 - 4508
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4654 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 4555  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4554 tttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12236 - 12090
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12236 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 12137  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12136 tttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22188 - 22042
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22188 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgtta 22089  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22088 tttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13358 - 13211
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13358 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 13259  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13258 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1851
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1998 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgtta 1899  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1898 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39623 - 39479
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  39623 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgtta 39525  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39524 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 441
Target Start/End: Original strand, 75189 - 75333
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  75189 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgtta 75287  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  75288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31625 - 31497
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31625 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31526  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  31525 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1169
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1022 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 1121  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1122 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4978 - 4849
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978 tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatga 4879  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4878 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Original strand, 32949 - 33077
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32949 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 33047  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33048 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 46056 - 45928
Alignment:
Q  315 tgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 413  Q
    |||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 45958  T
Q  414 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45957 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16260 - 16113
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16260 cattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 16161  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16160 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 443
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  381 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3617 - 3470
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  3617 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagtta 3518  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3517 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 343
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||  ||||||||    
T  489 cattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgtta 391  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  390 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28414
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 427  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  428 attaagatgatgatgt 443  Q
    || |||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11395 - 11292
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11395 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 11297  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  11296 gatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1997
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8311
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8440 aattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8341  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    | | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  8340 taaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8626 - 8479
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  8626 cattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgtta 8527  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8526 tttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26042 - 25896
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  26042 cattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 25944  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25943 tttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40004 - 39858
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  40004 cattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgtta 39906  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39905 tttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  21 tggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  121 gattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Original strand, 36938 - 37068
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatg 116  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36938 aaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 37037  T
Q  117 gtcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  37038 gtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18552 - 18423
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18552 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18453  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  18452 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 8507 - 8650
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||   |    
T  8507 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt---a 8602  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8603 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28061
Alignment:
Q  91 aaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgctt 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  191 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
     ||| || ||| ||||  ||||||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15584
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28074 - 28008
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28074 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 28008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7295
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7558
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7430 aattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 7529  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  7530 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7367
Alignment:
Q  23 gtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaga 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| |    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  123 ttactgaacgtaggtcacagtgaat 147  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 145
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  57 atgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaacgtaggtcacagtga 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6245
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgctgttg 392  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || ||||| |||||    
T  6095 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttg 6194  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18075 - 17947
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18075 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17976  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  17975 tcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33593 - 33465
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33593 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatgg 33494  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  33493 tcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12942
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    |   |||||||||||||    
T  12955 g---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6535
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2099 - 1952
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    |||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  2099 cattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgtta 2000  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1999 attaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  353 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 221
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10725
Alignment:
Q  143 tgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 10725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 10764 - 10830
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10764 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaag 10830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 425
Target Start/End: Original strand, 24276 - 24406
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtt 394  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24276 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 24375  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Original strand, 75644 - 75681
Alignment:
Q  17 aaattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  75644 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39754 - 39626
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39754 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 39655  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  39654 tcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 340 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40016 - 39913
Alignment:
Q  340 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40016 gcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39918  T
Q  439 gatgt 443  Q
    |||||    
T  39917 gatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  323 tgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 418  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  419 tctaag 424  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Original strand, 3504 - 3586
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 379  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3504 cattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 289
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32067
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13497
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  443 t 443  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 174911 - 174767
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||    
T  174911 cattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgtt 174815  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  174814 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121766
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19957
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||| |    
T  19829 aattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcg 19928  T
Q  118 tcagattactgaacgtaggtcacagtgaa 146  Q
    ||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  19929 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 113425 - 113317
Alignment:
Q  31 tgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattactgaa 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  113425 tgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaa 113326  T
Q  131 cgtaggtca 139  Q
    |||||||||    
T  113325 cgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 422
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 10399 - 10544
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||    
T  10399 cattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgtt 10495  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10496 aattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6611
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13991
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15664
Alignment:
Q  341 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 438  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15764 cattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgat 15666  T
Q  439 ga 440  Q
    ||    
T  15665 ga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6244
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15898
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178898
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  364 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12076 - 12039
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12076 cattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13151 - 13092
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattat 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13151 cattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 15149 - 15215
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15149 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaag 15215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15356
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1389 - 1289
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  1389 atttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1293  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  1292 atgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7266
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15077
Alignment:
Q  131 cgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4954
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 937 - 1006
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtt 367  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  937 cattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16282
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16286  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  16285 atgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 27723 - 27855
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||    
T  27723 cattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 27821  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27822 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 53523 - 53651
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  53523 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 53621  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
      ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53622 tattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 13144
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 391  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13239 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  387 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34123
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19268
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  19287 ctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1086
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11611 - 11464
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||| |||||    
T  11611 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgtt 11513  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11512 aattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 38230 - 38377
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||  | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  38230 cattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgtt 38328  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38329 aattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20910
Alignment:
Q  329 gttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 426  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  427 gattaagatgatgatgt 443  Q
    | | |||||| ||||||    
T  20926 gttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 51857 - 51985
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gt 393  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||| | ||| |||||| |     
T  51857 cattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttga 51954  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51955 tgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 439
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  420 ctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12708 - 12587
Alignment:
Q  304 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaac 401  Q
    |||||||||| | | || |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||||    
T  12708 tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaac 12610  T
Q  402 taagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  12609 taagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 13147
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattg-agacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gt 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| ||    
T  13276 cattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgt 13178  T
Q  394 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13177 ttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 16074 - 16206
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| | | ||||| |||| |||    
T  16074 cattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtt 16172  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16173 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23843
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 130051 - 129919
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tgtt 394  Q
    |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||| ||||    
T  130051 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgtt 129954  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129953 atttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 60689 - 60818
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | ||| ||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  60689 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttg 60786  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60787 tttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 10516 - 10647
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||    
T  10516 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 10613  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10614 atttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1190
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36007
Alignment:
Q  167 attagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaa 36007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 23942 - 24001
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 51682 - 51582
Alignment:
Q  342 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||    
T  51682 atttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatg 51586  T
Q  440 atgt 443  Q
    ||||    
T  51585 atgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 440
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27977 - 27911
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgc 363  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27977 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4545
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgtta 395  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| |   |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||||||    
T  4671 cattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgtta 4572  T
Q  396 tttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4571 tttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12766
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 133
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gtt 394  Q
    |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||    
T  275 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgtt 178  T
Q  395 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  177 gtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 439
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  391 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 29654 - 29558
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29654 ttgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 225553 - 225482
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttt 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  225553 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 443
Target Start/End: Original strand, 1072 - 1170
Alignment:
Q  344 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 441  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  1072 ttgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  318 ataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 415  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  416 cggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  368 tttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6826
Alignment:
Q  382 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 429  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874 tgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttt 369  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  322 ttgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 419  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  420 ctaagttga 428  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 1203 - 1269
Alignment:
Q  154 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 221  Q
    |||||||| || |||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1203 ttatgattaataaattagtatatgaatataaatg-ttgagaataagatattgtccatgattgatgaag 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  157 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25152 - 25121
Alignment:
Q  397 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25152 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 422
Target Start/End: Original strand, 8033 - 8161
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgct-gttg 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||| || || ||||  |||    
T  8033 cattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttg 8131  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 422  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8132 ttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 159
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6757 - 6675
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 379  Q
    |||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6757 cattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  59 gttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagatta 125  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21920
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29812
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69794
Alignment:
Q  385 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1881
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  58 tgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcagattact 127  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 439
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10639
Alignment:
Q  382 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28469
Alignment:
Q  18 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtataaatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || || ||||||||||     
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  118 tcagattact 127  Q
    ||| ||||||    
T  28478 tcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  390 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 439  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38464 - 38339
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 392  Q
    |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| | |||||||||||| | || |||||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |    
T  38464 cattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttg 38367  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 420  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38366 ttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 443
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193098
Alignment:
Q  345 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgat 441  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 193096  T
Q  442 gt 443  Q
    ||    
T  193097 gt 193098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 424
Target Start/End: Original strand, 6257 - 6386
Alignment:
Q  297 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgactggcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 392  Q
    |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| | |||||||||||| | || |||||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |    
T  6257 cattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttg 6354  T
Q  393 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 424  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6355 ttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15297
Alignment:
Q  156 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 220  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaa 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1243 times since January 2019
Visitors: 1237