View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15864_low_8 (Length: 578)

Name: NF15864_low_8
Description: NF15864
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15864_low_8
NF15864_low_8
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (330-561)||(31126847-31127076)
chr6 (361-545)||(20462372-20462556)
chr6 (358-548)||(13602639-13602834)
chr6 (361-545)||(16931043-16931231)
chr6 (361-545)||(19288745-19288933)
chr6 (361-545)||(17981918-17982106)
chr6 (361-545)||(17984107-17984295)
chr6 (361-545)||(18543570-18543758)
chr6 (361-545)||(26026069-26026257)
chr6 (361-545)||(27342304-27342492)
chr6 (361-545)||(27403044-27403232)
chr6 (369-548)||(21625595-21625779)
chr6 (381-545)||(16742706-16742870)
chr6 (361-545)||(11236141-11236330)
chr6 (361-545)||(17043301-17043489)
chr6 (361-545)||(12726846-12727034)
chr6 (361-545)||(19461377-19461565)
chr6 (361-545)||(32311083-32311271)
chr6 (361-548)||(17048238-17048433)
chr6 (361-545)||(18925128-18925315)
chr6 (361-529)||(25686110-25686285)
chr6 (361-545)||(3661992-3662180)
chr6 (362-545)||(27385044-27385230)
chr6 (362-545)||(27475457-27475643)
chr6 (363-545)||(4631498-4631683)
chr6 (361-546)||(22802607-22802797)
chr6 (361-548)||(19483268-19483459)
chr6 (361-550)||(25593014-25593207)
chr6 (361-545)||(25788327-25788515)
chr6 (361-545)||(26865398-26865586)
chr6 (361-545)||(34817190-34817378)
chr6 (361-549)||(16877703-16877897)
chr6 (419-546)||(13553081-13553208)
chr6 (364-545)||(13913659-13913844)
chr6 (361-545)||(9122530-9122718)
chr6 (364-545)||(20112181-20112367)
chr6 (361-529)||(25734929-25735108)
chr6 (361-545)||(27373406-27373594)
chr6 (361-545)||(27463756-27463944)
chr6 (361-545)||(32971946-32972134)
chr6 (361-525)||(20062057-20062225)
chr6 (372-545)||(25794481-25794658)
chr6 (418-545)||(12358800-12358928)
chr6 (361-483)||(12855631-12855756)
chr6 (419-513)||(1559525-1559619)
chr6 (361-477)||(14069599-14069720)
chr6 (361-483)||(18378742-18378868)
chr6 (464-545)||(25589931-25590013)
chr6 (494-547)||(21235598-21235651)
chr6 (500-546)||(18378844-18378890)
chr6 (445-491)||(21747571-21747617)
chr6 (361-401)||(29918491-29918531)
chr6 (425-524)||(13487130-13487229)
chr6 (363-404)||(18419694-18419735)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (15-287)||(4365646-4365925)
chr8 (330-555)||(23192082-23192306)
chr8 (361-545)||(23784020-23784208)
chr8 (361-545)||(209575-209763)
chr8 (361-545)||(723198-723386)
chr8 (361-545)||(3358623-3358811)
chr8 (361-545)||(9341816-9342004)
chr8 (363-545)||(17518527-17518714)
chr8 (363-548)||(21288883-21289074)
chr8 (358-545)||(3833427-3833618)
chr8 (361-545)||(44481774-44481963)
chr8 (361-548)||(3597808-3598000)
chr8 (363-548)||(20381861-20382051)
chr8 (361-545)||(23371252-23371440)
chr8 (361-545)||(29077401-29077589)
chr8 (361-545)||(29087652-29087840)
chr8 (361-545)||(36078607-36078795)
chr8 (361-545)||(36293573-36293761)
chr8 (351-548)||(19927515-19927717)
chr8 (361-548)||(15335521-15335713)
chr8 (361-548)||(15424586-15424778)
chr8 (361-548)||(15515890-15516082)
chr8 (361-529)||(20259038-20259210)
chr8 (361-529)||(21045668-21045840)
chr8 (361-548)||(22663634-22663826)
chr8 (365-545)||(32087691-32087875)
chr8 (361-545)||(242494-242682)
chr8 (361-545)||(795864-796052)
chr8 (361-524)||(23352593-23352760)
chr8 (361-545)||(30324715-30324903)
chr8 (361-545)||(23468865-23469052)
chr8 (361-545)||(15780131-15780319)
chr8 (361-545)||(15790720-15790908)
chr8 (361-545)||(19129401-19129589)
chr8 (363-545)||(23184724-23184911)
chr8 (362-549)||(24497631-24497819)
chr8 (361-545)||(19419039-19419227)
chr8 (460-545)||(6151827-6151913)
chr8 (456-553)||(18773201-18773299)
chr8 (461-551)||(24308315-24308405)
chr8 (363-514)||(24502209-24502358)
chr8 (361-483)||(18684955-18685083)
chr8 (361-483)||(18730520-18730648)
chr8 (361-483)||(19225622-19225747)
chr8 (361-477)||(13688022-13688141)
chr8 (433-545)||(22163893-22164006)
chr8 (366-549)||(18566284-18566470)
chr8 (361-407)||(18773111-18773157)
chr8 (361-545)||(26111904-26112092)
chr8 (361-404)||(6151742-6151785)
chr8 (361-456)||(22745950-22746048)
chr8 (459-548)||(23352528-23352617)
chr8 (361-483)||(24646817-24646943)
chr8 (428-473)||(24308435-24308480)
chr8 (361-404)||(18154422-18154465)
chr8 (504-549)||(24646923-24646968)
chr8 (501-545)||(13687995-13688039)
chr8 (361-393)||(16189479-16189511)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (330-561)||(18361117-18361347)
chr7 (363-553)||(9763131-9763321)
chr7 (361-548)||(9709322-9709513)
chr7 (362-549)||(11571788-11571974)
chr7 (361-548)||(332134-332326)
chr7 (363-553)||(9803623-9803812)
chr7 (361-545)||(11096699-11096887)
chr7 (363-548)||(13260106-13260296)
chr7 (361-545)||(26400171-26400359)
chr7 (361-526)||(13171911-13172079)
chr7 (361-545)||(22577505-22577694)
chr7 (361-545)||(1988220-1988408)
chr7 (361-545)||(8012176-8012364)
chr7 (361-545)||(9085927-9086115)
chr7 (361-548)||(12173806-12173998)
chr7 (363-548)||(13031569-13031759)
chr7 (361-548)||(14426997-14427189)
chr7 (361-548)||(16556288-16556480)
chr7 (361-548)||(16609182-16609374)
chr7 (361-545)||(24735416-24735604)
chr7 (361-545)||(42866507-42866695)
chr7 (361-545)||(2715684-2715872)
chr7 (363-548)||(4428533-4428724)
chr7 (361-545)||(15216978-15217166)
chr7 (361-545)||(40052126-40052314)
chr7 (361-548)||(16316058-16316250)
chr7 (361-545)||(8618030-8618218)
chr7 (361-545)||(18419794-18419982)
chr7 (361-532)||(48236435-48236611)
chr7 (361-524)||(13649183-13649351)
chr7 (361-545)||(167526-167714)
chr7 (361-545)||(467049-467237)
chr7 (361-545)||(5710932-5711120)
chr7 (361-545)||(11005846-11006034)
chr7 (361-545)||(15887746-15887934)
chr7 (361-545)||(21002476-21002664)
chr7 (361-545)||(17960192-17960380)
chr7 (363-545)||(4212657-4212843)
chr7 (363-553)||(19144032-19144221)
chr7 (363-553)||(20743431-20743620)
chr7 (419-548)||(21695897-21696028)
chr7 (361-548)||(2265013-2265205)
chr7 (361-545)||(6877325-6877513)
chr7 (365-545)||(9160394-9160578)
chr7 (362-554)||(12597493-12597683)
chr7 (361-546)||(13137409-13137598)
chr7 (361-520)||(5686146-5686309)
chr7 (361-520)||(22089767-22089930)
chr7 (363-477)||(26822757-26822871)
chr7 (459-545)||(22089910-22089997)
chr7 (418-545)||(25214841-25214969)
chr7 (459-545)||(5686289-5686376)
chr7 (362-476)||(14303943-14304059)
chr7 (419-513)||(15756756-15756850)
chr7 (361-449)||(26699219-26699310)
chr7 (361-404)||(9433908-9433951)
chr7 (425-477)||(1775134-1775186)
chr7 (363-524)||(17890867-17891030)
chr7 (462-548)||(13649330-13649416)
chr7 (361-477)||(4821959-4822079)
chr7 (500-553)||(14303907-14303960)
chr7 (500-548)||(4822061-4822109)
chr7 (363-404)||(7592143-7592184)
chr7 (363-404)||(15201869-15201910)
chr7 (501-545)||(26699164-26699208)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (330-555)||(3462-3685)
scaffold0040 (361-545)||(70272-70460)
scaffold0040 (361-548)||(934-1125)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (330-553)||(13654362-13654584)
chr3 (330-553)||(11514246-11514469)
chr3 (330-553)||(16793803-16794025)
chr3 (361-553)||(14008071-14008266)
chr3 (361-553)||(12397601-12397797)
chr3 (330-483)||(21317754-21317906)
chr3 (361-548)||(22141231-22141424)
chr3 (361-548)||(49665872-49666065)
chr3 (361-545)||(5627387-5627575)
chr3 (361-545)||(5875665-5875853)
chr3 (361-529)||(16476938-16477110)
chr3 (361-545)||(24660578-24660766)
chr3 (361-545)||(39372732-39372920)
chr3 (365-548)||(12962581-12962769)
chr3 (361-545)||(1054385-1054573)
chr3 (361-545)||(5511355-5511543)
chr3 (361-545)||(5546993-5547181)
chr3 (361-545)||(8775353-8775541)
chr3 (361-545)||(12296188-12296376)
chr3 (363-548)||(16658123-16658313)
chr3 (419-545)||(16812308-16812434)
chr3 (361-545)||(18484722-18484910)
chr3 (361-545)||(20721773-20721961)
chr3 (361-545)||(41684338-41684526)
chr3 (361-545)||(9390590-9390779)
chr3 (361-529)||(29905555-29905728)
chr3 (361-529)||(29946720-29946893)
chr3 (361-529)||(29995874-29996047)
chr3 (361-548)||(52920892-52921084)
chr3 (361-545)||(14581875-14582063)
chr3 (365-545)||(4744402-4744586)
chr3 (361-529)||(9005876-9006048)
chr3 (361-545)||(13122322-13122510)
chr3 (361-548)||(18142333-18142525)
chr3 (361-545)||(17962086-17962275)
chr3 (361-548)||(30053734-30053927)
chr3 (361-545)||(10654669-10654857)
chr3 (361-545)||(13382651-13382839)
chr3 (361-545)||(13393245-13393433)
chr3 (361-545)||(14466251-14466439)
chr3 (361-545)||(15662076-15662264)
chr3 (361-545)||(16670515-16670703)
chr3 (361-545)||(20683168-20683356)
chr3 (361-545)||(37867107-37867295)
chr3 (361-545)||(38195403-38195591)
chr3 (363-545)||(12248835-12249021)
chr3 (361-524)||(15833880-15834049)
chr3 (363-545)||(6500389-6500575)
chr3 (361-529)||(16390984-16391156)
chr3 (361-545)||(19779046-19779234)
chr3 (361-545)||(28324218-28324406)
chr3 (418-553)||(14131408-14131545)
chr3 (361-529)||(14321068-14321241)
chr3 (361-545)||(18006990-18007179)
chr3 (361-545)||(6220087-6220275)
chr3 (361-529)||(23757958-23758130)
chr3 (361-545)||(4404947-4405137)
chr3 (361-529)||(15226367-15226540)
chr3 (361-507)||(31113366-31113516)
chr3 (361-545)||(7803918-7804106)
chr3 (361-545)||(11216093-11216281)
chr3 (361-456)||(29951015-29951113)
chr3 (361-456)||(30000169-30000267)
chr3 (450-551)||(15648214-15648315)
chr3 (363-440)||(19643124-19643201)
chr3 (363-545)||(18851069-18851257)
chr3 (361-483)||(9993343-9993468)
chr3 (459-548)||(15834111-15834202)
chr3 (363-491)||(17033987-17034114)
chr3 (450-551)||(15552533-15552634)
chr3 (363-450)||(17909469-17909559)
chr3 (361-448)||(1793952-1794042)
chr3 (361-404)||(20627114-20627157)
chr3 (364-403)||(9295050-9295089)
chr3 (500-550)||(21317882-21317932)
chr3 (419-476)||(2728363-2728419)
chr3 (363-404)||(28352726-28352767)
chr3 (372-404)||(48987267-48987299)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (361-553)||(18776452-18776644)
chr4 (361-545)||(14777834-14778022)
chr4 (361-548)||(13575589-13575780)
chr4 (362-553)||(13306478-13306667)
chr4 (361-545)||(10750541-10750729)
chr4 (361-545)||(10964310-10964498)
chr4 (361-545)||(27657315-27657503)
chr4 (361-545)||(10291216-10291405)
chr4 (361-548)||(19620531-19620722)
chr4 (361-529)||(15206790-15206962)
chr4 (361-545)||(36019015-36019203)
chr4 (420-553)||(19887810-19887941)
chr4 (361-545)||(16818732-16818921)
chr4 (361-548)||(13004328-13004520)
chr4 (361-548)||(15139710-15139901)
chr4 (363-545)||(18762476-18762662)
chr4 (361-529)||(11536558-11536730)
chr4 (419-553)||(10327863-10327998)
chr4 (361-545)||(15474587-15474777)
chr4 (361-545)||(451255-451443)
chr4 (361-545)||(11515747-11515935)
chr4 (361-545)||(16256548-16256736)
chr4 (361-545)||(17918731-17918919)
chr4 (361-545)||(21997092-21997280)
chr4 (361-545)||(24640962-24641150)
chr4 (361-545)||(40469981-40470169)
chr4 (361-545)||(16305801-16305991)
chr4 (361-545)||(24027477-24027666)
chr4 (361-545)||(30936465-30936653)
chr4 (330-407)||(14356746-14356822)
chr4 (460-545)||(19571768-19571854)
chr4 (493-554)||(13890775-13890836)
chr4 (361-477)||(55755273-55755392)
chr4 (460-545)||(39520241-39520327)
chr4 (363-491)||(19053676-19053803)
chr4 (361-404)||(5874080-5874123)
chr4 (361-404)||(19954500-19954543)
chr4 (330-405)||(19888722-19888796)
chr4 (362-405)||(24620020-24620063)
chr4 (419-515)||(22222167-22222264)
chr4 (364-403)||(50066858-50066897)
chr4 (363-404)||(26821119-26821160)
chr4 (363-404)||(54690919-54690960)
chr4 (501-545)||(55755246-55755290)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (361-546)||(60019-60207)
scaffold0011 (354-545)||(134823-135020)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (361-548)||(6564-6756)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (361-548)||(14099-14291)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (361-545)||(88917-89106)
chr5 (361-545)||(13523683-13523871)
chr5 (361-548)||(21099169-21099361)
chr5 (361-545)||(23706895-23707083)
chr5 (361-548)||(5430345-5430537)
chr5 (361-545)||(6985804-6985992)
chr5 (361-545)||(14040103-14040291)
chr5 (361-545)||(23478858-23479048)
chr5 (361-545)||(27042795-27042983)
chr5 (361-545)||(39491497-39491685)
chr5 (361-548)||(21660710-21660903)
chr5 (361-545)||(9346050-9346238)
chr5 (361-545)||(14447600-14447788)
chr5 (361-545)||(22685509-22685697)
chr5 (361-545)||(23306352-23306540)
chr5 (361-545)||(23372018-23372206)
chr5 (361-545)||(24588671-24588859)
chr5 (361-545)||(24817451-24817639)
chr5 (361-545)||(27470067-27470255)
chr5 (361-545)||(30228062-30228250)
chr5 (361-545)||(35225579-35225767)
chr5 (361-545)||(42052867-42053055)
chr5 (361-545)||(17617185-17617374)
chr5 (361-545)||(17729042-17729231)
chr5 (361-545)||(31358659-31358848)
chr5 (361-548)||(30743496-30743686)
chr5 (361-545)||(36583106-36583294)
chr5 (361-524)||(14558583-14558750)
chr5 (363-545)||(36697737-36697923)
chr5 (361-545)||(20797186-20797374)
chr5 (361-545)||(21414798-21414986)
chr5 (361-545)||(31843466-31843654)
chr5 (361-545)||(15993894-15994082)
chr5 (361-545)||(22156611-22156799)
chr5 (361-545)||(23405937-23406125)
chr5 (361-545)||(34062111-34062299)
chr5 (361-545)||(39361821-39362009)
chr5 (361-545)||(40400526-40400714)
chr5 (361-545)||(1109727-1109915)
chr5 (361-545)||(5291141-5291329)
chr5 (361-545)||(19477476-19477664)
chr5 (361-545)||(24926721-24926909)
chr5 (361-545)||(20561814-20562002)
chr5 (363-551)||(25935725-25935912)
chr5 (361-545)||(27603983-27604168)
chr5 (459-545)||(14558726-14558813)
chr5 (361-545)||(31448027-31448215)
chr5 (429-553)||(16791758-16791882)
chr5 (361-451)||(17447294-17447387)
chr5 (361-483)||(21519614-21519739)
chr5 (363-404)||(24421430-24421471)
chr5 (363-404)||(30445834-30445875)
chr5 (363-404)||(30455206-30455247)
chr5 (372-404)||(5609278-5609310)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (363-548)||(7408-7598)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (361-545)||(61708-61896)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (358-545)||(12235-12426)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (364-553)||(28769974-28770163)
chr2 (361-529)||(22751610-22751783)
chr2 (361-545)||(11404876-11405064)
chr2 (361-545)||(22764325-22764513)
chr2 (361-548)||(22454416-22454608)
chr2 (361-545)||(10267628-10267816)
chr2 (361-545)||(10278205-10278393)
chr2 (361-548)||(28711139-28711331)
chr2 (361-545)||(43346041-43346229)
chr2 (361-548)||(24850092-24850284)
chr2 (361-545)||(19312374-19312563)
chr2 (361-548)||(24377551-24377742)
chr2 (363-550)||(20569948-20570139)
chr2 (363-545)||(24813989-24814175)
chr2 (361-545)||(4210525-4210713)
chr2 (361-545)||(22959738-22959926)
chr2 (361-545)||(27222034-27222222)
chr2 (361-545)||(34803766-34803954)
chr2 (361-545)||(40222967-40223155)
chr2 (361-548)||(22318094-22318286)
chr2 (361-545)||(24424925-24425113)
chr2 (361-545)||(29244856-29245044)
chr2 (361-545)||(43083282-43083470)
chr2 (361-545)||(9907568-9907756)
chr2 (361-545)||(24337810-24337998)
chr2 (361-545)||(35253652-35253834)
chr2 (361-545)||(35264261-35264443)
chr2 (361-545)||(28731294-28731482)
chr2 (361-545)||(9772712-9772900)
chr2 (361-496)||(26867739-26867877)
chr2 (361-545)||(28379224-28379414)
chr2 (361-545)||(21171838-21172027)
chr2 (363-556)||(18848820-18849012)
chr2 (361-483)||(20417098-20417223)
chr2 (367-477)||(29410139-29410248)
chr2 (373-493)||(33241107-33241227)
chr2 (373-493)||(33249028-33249148)
chr2 (381-477)||(27639783-27639876)
chr2 (372-404)||(1799550-1799582)
chr2 (483-551)||(29410345-29410413)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (361-553)||(87383-87574)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (361-545)||(128303-128492)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (361-548)||(36134661-36134853)
chr1 (361-545)||(3172211-3172399)
chr1 (361-545)||(7507925-7508113)
chr1 (361-545)||(20883275-20883463)
chr1 (361-545)||(35648086-35648274)
chr1 (361-545)||(38095665-38095853)
chr1 (363-548)||(22464193-22464383)
chr1 (361-545)||(5833841-5834029)
chr1 (361-545)||(20255540-20255728)
chr1 (361-545)||(36246407-36246595)
chr1 (361-545)||(51655859-51656047)
chr1 (361-548)||(20953857-20954049)
chr1 (363-548)||(21134563-21134753)
chr1 (361-545)||(47617934-47618123)
chr1 (361-545)||(153703-153891)
chr1 (361-545)||(12623212-12623400)
chr1 (363-545)||(21878359-21878544)
chr1 (362-477)||(18516672-18516787)
chr1 (364-548)||(19717999-19718188)
chr1 (361-545)||(35400560-35400748)
chr1 (369-553)||(20109364-20109552)
chr1 (363-545)||(22643399-22643584)
chr1 (361-547)||(20909916-20910106)
chr1 (361-545)||(12731135-12731323)
chr1 (361-545)||(12741728-12741916)
chr1 (361-545)||(19169749-19169937)
chr1 (361-545)||(4167847-4168035)
chr1 (361-545)||(19179548-19179736)
chr1 (361-545)||(21864249-21864437)
chr1 (418-545)||(23067507-23067635)
chr1 (361-529)||(7744494-7744660)
chr1 (425-547)||(26898558-26898680)
chr1 (361-545)||(7679837-7680025)
chr1 (369-545)||(26561074-26561254)
chr1 (500-552)||(18516638-18516690)
chr1 (361-402)||(23065434-23065475)
chr1 (468-545)||(5649804-5649882)
chr1 (494-546)||(7744431-7744483)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (361-548)||(120-312)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (361-545)||(4090-4278)
[»] scaffold0537 (1 HSPs)
scaffold0537 (361-545)||(4121-4309)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (361-545)||(10691-10879)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (348-548)||(8370-8576)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (363-548)||(11013-11203)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (361-548)||(4443-4635)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (361-548)||(30304-30495)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (361-545)||(17478-17666)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (363-548)||(23150-23340)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (361-548)||(9674-9866)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (361-545)||(31774-31962)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (361-545)||(58959-59147)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (361-545)||(176001-176189)
scaffold0017 (385-545)||(53262-53426)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (361-548)||(19814-20007)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (361-548)||(143578-143770)
scaffold0007 (358-520)||(58726-58892)
scaffold0007 (459-512)||(58692-58746)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (361-545)||(3617-3805)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (361-545)||(211204-211392)
scaffold0014 (361-545)||(217073-217261)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (363-545)||(5933-6119)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (361-548)||(8991-9183)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (361-545)||(1377-1565)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (361-545)||(9315-9503)
[»] scaffold0435 (1 HSPs)
scaffold0435 (419-548)||(4751-4881)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (361-545)||(6572-6760)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (361-545)||(9805-9993)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (361-548)||(24787-24979)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (361-548)||(7797-7990)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (361-548)||(15011-15207)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (361-548)||(34237-34430)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (361-514)||(7215-7372)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (361-545)||(12695-12884)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (361-548)||(17199-17391)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (361-545)||(3924-4112)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (363-548)||(7884-8075)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (361-545)||(46998-47186)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (361-548)||(5041-5233)
scaffold0028 (363-404)||(95437-95478)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (361-545)||(192583-192771)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (361-548)||(21131-21324)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (361-545)||(2509-2697)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (361-545)||(2668-2856)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (361-545)||(15542-15730)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (361-548)||(12967-13157)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (361-511)||(36244-36399)
scaffold0120 (361-511)||(42606-42761)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (361-548)||(41137-41329)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (361-529)||(9696-9868)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (361-545)||(23278-23466)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (361-545)||(52954-53142)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (361-548)||(4208-4400)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (361-548)||(11886-12079)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (361-544)||(32906-33095)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (361-548)||(60316-60508)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (361-483)||(2220-2346)
scaffold0473 (500-548)||(2196-2244)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (418-545)||(3777-3905)
scaffold0398 (418-545)||(12052-12180)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (425-477)||(9947-9999)
scaffold0364 (500-553)||(9913-9965)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (463-545)||(3311-3394)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (361-404)||(3439-3482)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (425-551)||(41887-42015)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (464-545)||(30530-30612)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (361-475)||(10281-10399)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (363-450)||(37574-37664)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (451-548)||(3998-4096)
scaffold0069 (363-442)||(4880-4963)
[»] scaffold0754 (1 HSPs)
scaffold0754 (419-515)||(5049-5146)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (363-404)||(2678-2719)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (363-404)||(27125-27166)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 330 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 31127076 - 31126847
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31127076 tcatcaaaacttaaggtggt--aatgttaaacacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattgttgt 31126979  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  31126978 taatctaattaacaagttgactttaaggtatgaggtttgtaagctcccc-tgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagtttta 31126880  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaatcattaaa 561  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31126879 tccaagttaattaaattcattttaatcattaaa 31126847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 20462372 - 20462556
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20462372 acattttgttccaacaatctctccttttttgatgatgacaaacattaatgttaatagtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtctg 20462471  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||| |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20462472 aggtttttaagctcccattaagtctaatagctcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcaagttaattaaatt 20462556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 358 - 548
Target Start/End: Original strand, 13602639 - 13602834
Alignment:
Q  358 aaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |  | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13602639 aaaacattttgttccaacaatctcctccttttttatgatgacaaacattggtatttaaaatgtgcaattattgttaatctaattaacaagttgactgtaa 13602738  T
Q  455 gg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13602739 gggtatgaggtttgtaagctccccatgagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 13602834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 16931043 - 16931231
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  16931043 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatattcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 16931142  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16931143 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 16931231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19288933 - 19288745
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagt---caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | || | |||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  19288933 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacagacaatagtatttaaagtgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctaggt 19288834  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19288833 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 19288745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17982106 - 17981918
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  17982106 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 17982007  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17982006 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 17981918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17984295 - 17984107
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  17984295 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 17984196  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17984195 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 17984107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 18543570 - 18543758
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||   ||||    
T  18543570 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaagaagttgactactaggt 18543669  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18543670 atgaggtttgtaagctccccccgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 18543758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 26026069 - 26026257
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  26026069 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 26026168  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26026169 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 26026257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27342304 - 27342492
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  27342304 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 27342403  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27342404 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27342492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27403044 - 27403232
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  27403044 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 27403143  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27403144 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27403232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 369 - 548
Target Start/End: Original strand, 21625595 - 21625779
Alignment:
Q  369 ttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tctgaggt 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  21625595 ttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaaagtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataagggtatgaggt 21625694  T
Q  465 ttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21625695 ttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggttcgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 21625779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Original strand, 16742706 - 16742870
Alignment:
Q  381 ccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatg 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |     
T  16742706 ccccctttttgatgatgacaaacataagtgttaatagtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttacagtctgaagtttgtaagctcccccta 16742805  T
Q  481 agtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||| |||| ||  | |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  16742806 agtctaatagctcagatggtgagttttgtaagctccccctaggttctatcaaggttaattaaatt 16742870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 11236141 - 11236330
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  11236141 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 11236240  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11236241 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 11236330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 17043301 - 17043489
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||    
T  17043301 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttaacctaattaacacgttgacttttggg 17043400  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  17043401 tatgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagcctttaaggtgaggtttgaaagctccccctaaattctatactagttaattaaatt 17043489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12727034 - 12726846
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  12727034 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 12726935  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12726934 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 12726846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19461565 - 19461377
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  19461565 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactgccaggt 19461466  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||  ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19461465 ataaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaagtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 19461377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32311271 - 32311083
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  32311271 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 32311172  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctta-aggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32311171 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttgaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 32311083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 17048238 - 17048433
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt------aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||      |||  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||      
T  17048238 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaacaatgttcaattgttgttaacctaattaacacattgacttttg 17048337  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17048338 ggtgtgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagtactctaaaggtgaggtttggaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 17048433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18925315 - 18925128
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |   |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||      
T  18925315 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtattaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctgggat 18925216  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  18925215 agaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 18925128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25686285 - 25686110
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt------aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||      |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  25686285 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacta 25686186  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25686185 ggtatgaggtttgtaagctcccccttagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 25686110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 3661992 - 3662180
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  3661992 acattttgttgcaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 3662091  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3662092 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 3662180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 362 - 545
Target Start/End: Original strand, 27385044 - 27385230
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtc 458  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   | |     
T  27385044 cattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggata 27385143  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  27385144 -gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 27385230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 362 - 545
Target Start/End: Original strand, 27475457 - 27475643
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtc 458  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   | |     
T  27475457 cattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggata 27475556  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  27475557 -gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 27475643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 4631498 - 4631683
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   | |      
T  4631498 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggata- 4631596  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  4631597 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 4631683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 546
Target Start/End: Original strand, 22802607 - 22802797
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |     
T  22802607 acattttgttccaacattctccctctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtttaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaaga 22802706  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  22802707 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattc 22802797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 19483268 - 19483459
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  19483268 acattttgttccaacaatctccccctttttcatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactctttggg 19483367  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19483368 taggaggtttgtaagctccccttgagtcaaatagtactttaaggtgagttttgtaagc-tcccctgagttctatccatgttaattaaattcat 19483459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 550
Target Start/End: Original strand, 25593014 - 25593207
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||  | |||| |   | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25593014 acattttgttccaacaatctccccgtttttattgatgacaaacacttgtattaaaatgtttaattgttgttaatctaattaacaagttgactattagggt 25593113  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattt 550  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25593114 atgaggtttgtaagctcccgctaagtccaatagtcctttaagatgaggtttgtaagctcccccgaagttctatacaagttaattaaattcattt 25593207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 25788327 - 25788515
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  25788327 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 25788426  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  25788427 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 25788515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 26865398 - 26865586
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  26865398 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 26865497  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26865498 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 26865586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 34817378 - 34817190
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  34817378 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 34817279  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  34817278 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 34817190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 549
Target Start/End: Original strand, 16877703 - 16877897
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatag---tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  16877703 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaaaatttcaattgttgttaatctaattaagacgttgactgttagg 16877802  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatt 549  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  16877803 gtatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtacattatggtgaggtttgtaagctccccatgagttatatccatgttaattaaaatcatt 16877897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13553208 - 13553081
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttccc 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||     
T  13553208 caattgttgttaatctaattaacaagttgactttagagtctgaggtttgtatgcttcccctaagtatgatagtttaaaagatgaggtttgtaagcttcct 13553109  T
Q  519 ctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  13553108 ctaagttctatcctgattaattaaattc 13553081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Original strand, 13913659 - 13913844
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||  ||    
T  13913659 ttttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacggggattg 13913758  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||    
T  13913759 aggtttgtaagctccccctaagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcgttaattaaatt 13913844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9122718 - 9122530
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  9122718 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 9122619  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  9122618 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 9122530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20112367 - 20112181
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtct 459  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20112367 ttttcttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactattagggttt 20112268  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  20112267 aaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactttaaggcgaggtttgtaagctccccttgagttctatccatgttaattaaatt 20112181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25735108 - 25734929
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----------aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact 450  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||          |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25735108 acattttattccaacaatttccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttttaaaaaaaaatgttcaattcttgttgatctaattaacaagttgact 25735009  T
Q  451 ttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25735008 acaaggtatgaggtttgtaagctcaccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 25734929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27373406 - 27373594
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  27373406 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 27373505  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||||    
T  27373506 ttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctaatcttattaattaaatt 27373594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27463756 - 27463944
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  27463756 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 27463855  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||||    
T  27463856 ttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctaatcttattaattaaatt 27463944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32972134 - 32971946
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  32972134 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 32972035  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| | ||||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32972034 tagaggtttgtaagctccccctaagtctaacagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 32971946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20062225 - 20062057
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  20062225 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggg 20062126  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagtt 525  Q
    | ||| |||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20062125 cagagttttgaaagctccccctgagtcttatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagtt 20062057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 545
Target Start/End: Original strand, 25794481 - 25794658
Alignment:
Q  372 caacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgt 468  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||   |||||||||    
T  25794481 caacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggatagaggtttgt 25794580  T
Q  469 aagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  25794581 aagctccccctgagtctaatagatatttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 25794658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 545
Target Start/End: Original strand, 12358800 - 12358928
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||   |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  12358800 tcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggatagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctcc 12358899  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12358900 ccctgagttctattcttattaattaaatt 12358928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Original strand, 12855631 - 12855756
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  12855631 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 12855730  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  12855731 tagaggtttgtaagctccccctgagt 12855756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Original strand, 1559525 - 1559619
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagc 513  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1559525 caattgttgttgatttaattaagaagttgacttcagagtctgaggtttaaaagttccccttgagtctgatagtccataaggtgaggtttgtaagc 1559619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14069720 - 14069599
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt-----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaag 455  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||     |||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||    |    
T  14069720 acatttttttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaaatgttcaattgttgttgatttaattaacaagttgactactgg 14069621  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14069620 gtttgaggtttgtaagctcccc 14069599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Original strand, 18378742 - 18378868
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  18378742 acatttttttccaacaatctccccttttttaaagatgataaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaataaacaagttgactataaggg 18378841  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||    
T  18378842 tttgaggtttgtaagctccccctgagt 18378868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 545
Target Start/End: Original strand, 25589931 - 25590013
Alignment:
Q  464 tttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  25589931 tttgtaaactccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 25590013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 547
Target Start/End: Original strand, 21235598 - 21235651
Alignment:
Q  494 ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattca 547  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21235598 ttaaggtgaggtttggaagctccccctgagttctatccaagttaattaaattca 21235651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 546
Target Start/End: Original strand, 18378844 - 18378890
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18378844 tgaggtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattaaattc 18378890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 491
Target Start/End: Original strand, 21747571 - 21747617
Alignment:
Q  445 ttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt 491  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21747571 ttgacttcagggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctaatagt 21747617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 401
Target Start/End: Original strand, 29918491 - 29918531
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaa 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29918491 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgataacaa 29918531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 13487229 - 13487130
Alignment:
Q  425 ttgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||  || |||| ||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13487229 ttgttgatttaattaacaagtagacttaagagtttgaggtttgtaagccacctatgaatctgatagtccacggggtgaggtttgtaagctccccctaagt 13487130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18419735 - 18419694
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18419735 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 18419694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4365925 - 4365646
Alignment:
Q  15 atgaacttaaagtttggttccgaatatgaactttgtacatgcttaaaaagaaagaaagatatttgtttagatgaactagagaaatcctgaaaactactga 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4365925 atgaacttgaagtttggttccggatatgaactttgtacatgcttaaaaagaaagaaagatacttgtttagatgaactagagaaagcctgaaaactactgc 4365826  T
Q  115 acaaaacatgttcagtgcgtgatttttcataaattcttggaacaatatttttagacgggaccaattgcatcatg-------ttcttatgttagctgactg 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| || ||||||||| |     
T  4365825 acaaaacatgttcagtgtgtgatttttcataaattcttggaacaatatttttagacgggaccaattgcatcatgttcatacttcataggttagctgaata 4365726  T
Q  208 tcttcaataaaatccacagaatttttagactttgtatgactgtacgatcataatttttattgattgcagctctggattaa 287  Q
     ||||||||||||| | | |||||| |||| | |||||||| | || | ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4365725 ccttcaataaaatctagaaaattttcagacatcgtatgactatccgtttatagtttttatcgattgcaactctggattaa 4365646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 330 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23192306 - 23192082
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaaa-cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| | ||||    
T  23192306 tcatcaaaacttaaggtggt--aatgttaaactcattttgttccaacaatctccgactttttgatgatgacaaacaccagtattaatggtcaaatgttgt 23192209  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23192208 taatctaattaactagttgactttaggatttgaggtttgtaagctccccatgagtctgataatttttaaggtgaggtttgtaaactccccctaagttcta 23192109  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaatc 555  Q
    || |  ||||||| |||||||||||||    
T  23192108 tcaatgttaattatattcattttaatc 23192082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 23784020 - 23784208
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  23784020 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactcctaggt 23784119  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23784120 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctaccactaagttctatacaagttaattaaatt 23784208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 209763 - 209575
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  209763 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattattgttgatctaattaataagttgactactggga 209664  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  209663 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 209575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 723386 - 723198
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  723386 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattattgttgatctaattaataagttgactactggga 723287  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  723286 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 723198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3358811 - 3358623
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  3358811 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 3358712  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3358711 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 3358623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 9341816 - 9342004
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9341816 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9341915  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9341916 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 9342004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17518714 - 17518527
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||     
T  17518714 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactgccaggta 17518615  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17518614 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 17518527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Original strand, 21288883 - 21289074
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||     
T  21288883 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactaatagggta 21288982  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21288983 tgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 21289074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 545
Target Start/End: Original strand, 3833427 - 3833618
Alignment:
Q  358 aaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  3833427 aaaacatttggttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacta 3833526  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  3833527 ggtatgatgtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 3833618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 44481774 - 44481963
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  44481774 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 44481873  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  44481874 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 44481963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3598000 - 3597808
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  3598000 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattaatatttaaaatgttcaattggtgttaatctaattaacacgttgactattaggg 3597901  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  3597900 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaataatactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattacattcat 3597808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20382051 - 20381861
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |     
T  20382051 attttgttccaataatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgattataagggta 20381952  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  20381951 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaagctgaggtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattcaattcat 20381861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 23371252 - 23371440
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  23371252 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 23371351  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  23371352 atgagttttgtaagctccccctgagtctaataggcctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 23371440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 29077401 - 29077589
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  29077401 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 29077500  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29077501 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 29077589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 29087652 - 29087840
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  29087652 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 29087751  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29087752 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 29087840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 36078607 - 36078795
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  36078607 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 36078706  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36078707 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36078795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 36293573 - 36293761
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  36293573 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 36293672  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36293673 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36293761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 548
Target Start/End: Original strand, 19927515 - 19927717
Alignment:
Q  351 taatgctaaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttg 447  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19927515 taatgttaacacattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgagaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttg 19927614  T
Q  448 actttaagg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  19927615 actataagggtatgaggtttgtaagctccccctgaatccaatagtactttaaggtaaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgtcaattaaatt 19927714  T
Q  546 cat 548  Q
    |||    
T  19927715 cat 19927717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15335713 - 15335521
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  15335713 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgaaaaaccatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacatgttgactattaggg 15335614  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  15335613 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaataatactttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctatccatgttaattaaattcat 15335521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15424778 - 15424586
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  15424778 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgaaaaaccatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacatgttgactattaggg 15424679  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  15424678 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaataatactttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctatccatgttaattaaattcat 15424586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15516082 - 15515890
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  15516082 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgaaaaaccatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacatgttgactattaggg 15515983  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  15515982 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaataatactttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctatccatgttaattaaattcat 15515890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 20259210 - 20259038
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  20259210 acattatgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 20259111  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20259110 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaataggcctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagtcctat 20259038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21045840 - 21045668
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  21045840 acattatgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 21045741  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21045740 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaataggcctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagtcctat 21045668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 22663634 - 22663826
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22663634 acattttgttcccacaatctccccccttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatttaattaacacgttgactttaaggg 22663733  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||  || |||||||||||    
T  22663734 tatgaggtttgtaagctccccttgagtccaatagttctttaaggtgaggtttgtaagttccccctgatttctatccatgtttattaaattcat 22663826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32087875 - 32087691
Alignment:
Q  365 tttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || | ||    
T  32087875 tttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggacaga 32087776  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32087775 ggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 32087691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 242494 - 242682
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  242494 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgtttaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 242593  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  242594 cagaggtttgtaagctccccctgagtttaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 242682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 795864 - 796052
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  795864 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgtttaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 795963  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  795964 cagaggtttgtaagctccccctgagtttaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 796052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 23352760 - 23352593
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag---tcaattattgttaatctaattaacaagttgac-tttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||| |    || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23352760 acattttgttccaacaatctcctcctttttgatgatgacaaacacttgtattaaaaaggctccattgttgttaatctaattaacaagttgacttttaggg 23352661  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23352660 tctgaggtttgtaagctcccc-taagtccaatagctttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagt 23352593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 30324903 - 30324715
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  30324903 acattttgttccaacaatctcccccgttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaataagttgacttctggga 30324804  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  30324803 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 30324715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23469052 - 23468865
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||  |||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    ||      
T  23469052 acattttgttccaacaatctccccatttttgatgatgacaaacaatagtatttaaatgttcaattgttgttgatctaattaaagagttgactactgggat 23468953  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23468952 agaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactaattaattaaatt 23468865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15780319 - 15780131
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  15780319 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 15780220  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  15780219 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 15780131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15790908 - 15790720
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  15790908 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 15790809  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  15790808 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 15790720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 19129401 - 19129589
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  19129401 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 19129500  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  19129501 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 19129589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23184911 - 23184724
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |     
T  23184911 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaagata 23184812  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  23184811 tgaggtttgtaagctccccctaagttcaatagtactttaaggtgaggtttgtaaactccccctgaattctatccatgttaattaaatt 23184724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24497819 - 24497631
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  | | | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24497819 cattttgttccaacaatctttctctttttgatgatgacaaaatcaaatattaatagtcacttgttgttaatctaattaacaacttgactttagggtctga 24497720  T
Q  462 ggtttgtaagctccc-catgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatt 549  Q
    ||||| |||| |||| | |  || | ||||| ||||||||||  ||| |||| | ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24497719 ggtttctaagatccctcctaggtttaatagtccttaaggtgaattttataagttccccttaagatatatccaagttaattaaattcatt 24497631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 19419039 - 19419227
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  19419039 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 19419138  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||| |||| ||||||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19419139 tagagttttgaaagctccccctaggtcttatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcattaattaaatt 19419227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 545
Target Start/End: Original strand, 6151827 - 6151913
Alignment:
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6151827 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 6151913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 553
Target Start/End: Original strand, 18773201 - 18773299
Alignment:
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  18773201 gtctgaggtttgtaagttccccctgagtccaatagtcctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaaattctatacaagttaattaaattcatcttaa 18773299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 461 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24308405 - 24308315
Alignment:
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatttt 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  24308405 aggtttgtaagctccccttgagtttgatagttcatgaggtgagttttgtaagttccccctaagttctatccaagttaaataaattcctttt 24308315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 24502358 - 24502209
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | ||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |  || |||    
T  24502358 attttgttccaacaatctcctcctttttgatgatgacaaacataagtatttaaaa--caattattgttgatttaattaacaagttgacttcagagtttga 24502261  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagct 514  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  24502260 ggtttgtcagct-cccttgaatctgatagtccataacgtgaggtttctaagct 24502209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18685083 - 18684955
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacact-actttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa- 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | | ||    |||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  18685083 acattttgttccaacaatctccccatttttgatggtgacaaacacttagtatttaaaaatgttcaattgttgttaatttaattaacaagttaactttaag 18684984  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18684983 ggtatgaggtttgtaagctccccctgagt 18684955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18730648 - 18730520
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacact-actttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa- 454  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | | ||    |||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  18730648 acattttgttccaacaatctccccatttttgatggtgacaaacacttagtatttaaaaatgttcaattgttgttaatttaattaacaagttaactttaag 18730549  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18730548 ggtatgaggtttgtaagctccccctgagt 18730520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Original strand, 19225622 - 19225747
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  ||     
T  19225622 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactattggga 19225721  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  19225722 tagaggtttgtaagctccccctgagt 19225747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13688141 - 13688022
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  13688141 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 13688042  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13688041 cagaggtttgtaagctcccc 13688022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22164006 - 22163893
Alignment:
Q  433 ctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatcc 531  Q
    |||||||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22164006 ctaattaacaagttgattactaggtacgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatac 22163907  T
Q  532 aaattaattaaatt 545  Q
    || |||||| ||||    
T  22163906 aagttaattgaatt 22163893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 549
Target Start/End: Original strand, 18566284 - 18566470
Alignment:
Q  366 ttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtt 465  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||   | | |||| |||||||| |||| ||||  | ||||| | | |||||||||    
T  18566284 ttgttctaacaatctctccctttttgatgatgacaaacacaagtattttgaataaatt-ttgttaatttaatcaacagttagacttcaggatctgaggtt 18566382  T
Q  466 tgtaagctccccatgagtct--gatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta-tccaaattaattaaattcatt 549  Q
    || ||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  18566383 tgcaagctccccctgattctatgatagtctattaaggtgaggtttgtaagctccccctaagtcctattccaagttaaataaattcatt 18566470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 407
Target Start/End: Original strand, 18773111 - 18773157
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18773111 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacacta 18773157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 26111904 - 26112092
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata--gtcaattattgttaatctaattaacaagttga-ctttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |   |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |  | ||     
T  26111904 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaacgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactgaga 26112003  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |  |||| |||||| |||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  26112004 t-agaggattgtaatctccccctgagtataatacatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttttattcttattaattaaatt 26112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Original strand, 6151742 - 6151785
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6151742 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 6151785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 456
Target Start/End: Original strand, 22745950 - 22746048
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta--cttttaatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||   ||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22745950 acattttgttccaacaatctcccacttttttatgatgacaaacattagtatttaaaaagtgcaattgttgctaatctaattaacaagttgactataagg 22746048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 459 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23352617 - 23352528
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  23352617 tgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagctttttaaggtgatgtttgtaagctccccctaagttctatac-aagtaattaaattcat 23352528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Original strand, 24646817 - 24646943
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| || | ||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24646817 acatattgttccaacaatctccccattttttatgatgaaaaacattagtatttaaaatgtgcaattgtttttaatctaattaacaagttgactataaggg 24646916  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  24646917 tttgaagtttgtaagctccccttgagt 24646943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 428 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24308480 - 24308435
Alignment:
Q  428 ttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagct 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24308480 ttaatctaattaacaagttgactatcaggtctgagatttgtaagct 24308435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Original strand, 18154422 - 18154465
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18154422 acattttgtttcaacaatgtccccctttttgatgatgacaaaca 18154465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 549
Target Start/End: Original strand, 24646923 - 24646968
Alignment:
Q  504 gtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatt 549  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24646923 gtttgtaagctccccttgagttctatccaagttaattaaattcatt 24646968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13688039 - 13687995
Alignment:
Q  501 gaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13688039 gaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 13687995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 361 - 393
Target Start/End: Original strand, 16189479 - 16189511
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgat 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16189479 acattttgttccaacaatctccccctttttgat 16189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 330 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 18361347 - 18361117
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18361347 tcatcaaaacttaaggtggc--aatgttaaacacattttgttccaacaatctcctccttttttatgatgacaaacactagtattaatagtcaattgttgt 18361250  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18361249 taatctaattaacaagttgactttagggtctgaggtttgtaagctccccctgagtttgatagttcttaaggtgaggtttgtaagttccccctgagttcta 18361150  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaatcattaaa 561  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18361149 tccaagttaattaaattcattttaatcattaaa 18361117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 9763131 - 9763321
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttg-atgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9763131 attttcttccaacaatctccccatttttttatgatgacaaacacaagtattaatagtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtctga 9763230  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9763231 ggtttgaaagctcccc-taagtcttatagtttgtaaggtgagttttgtaagctccccctgagttctatccaaattaattaaatctattttaa 9763321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9709513 - 9709322
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9709513 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggt 9709414  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  9709413 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaacgtgaggtttctaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 9709322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 362 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 11571974 - 11571788
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11571974 cattttgttccgacaatctcccc-tttttgatgatgacaaacattagtattaatagtcaattgttgttaatttaattaagaagttgactttatggtctga 11571876  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatt 549  Q
    | |||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |   | |||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  11571875 gatttgtaagctccccctaagtctaatattccttaaggtgaggtttgtaaactccgtttgagttctattcaagttaattagattcatt 11571788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 332134 - 332326
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagt---caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || | ||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  332134 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacgataatatttaaaaatttgcaattgttgttaatctaattaacaagttgaatgtaggg 332233  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  332234 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtattttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 332326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 9803623 - 9803812
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgag 462  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9803623 attttgttccaacaatgtcctcattttttatgatgacaaacacaagtattaatagtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtatgag 9803722  T
Q  463 gtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||| ||||||||| | | ||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9803723 gtttgaaagctcccc-taaatcttatagtttgtaaggtgagttttgtaagctccttctgaattctatccaaattaattaaatctattttaa 9803812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 11096699 - 11096887
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  11096699 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 11096798  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11096799 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 11096887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13260296 - 13260106
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  13260296 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataagggta 13260197  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13260196 tgaggtttgtaagctccccctaagtcgaatagtactttaaggtgaggtttttaagctccccttgagttctatccaagttaattaaattcat 13260106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 26400359 - 26400171
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  26400359 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 26400260  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26400259 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 26400171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13172079 - 13171911
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-t 457  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  | |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13172079 acattttgttccaacaatttccccctttttgatgatcacaaacacttgtattaaaaagttcaattgttgttaatctaattaacaagttgacttttagggt 13171980  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttc 526  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171979 atgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagctcttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttc 13171911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22577694 - 22577505
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22577694 acattttgttccaacaatctccccctttttaatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgagtataaggg 22577595  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22577594 tttgaggtttgtaagctccccctaagtcctatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattaaatt 22577505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 1988220 - 1988408
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  1988220 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 1988319  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  1988320 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 1988408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 8012364 - 8012176
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  8012364 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 8012265  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8012264 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 8012176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 9085927 - 9086115
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9085927 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9086026  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9086027 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 9086115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12173998 - 12173806
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  12173998 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 12173899  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||| |||||||||| || |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12173898 tatgaggtttctaagctccccctgtgtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcatgttaattaaattcat 12173806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13031759 - 13031569
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  13031759 attttgttccaataatcacccccttttcgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataagggtt 13031660  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  13031659 tgaggtttttaagctcccccaaagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccataataattaaattcat 13031569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 14426997 - 14427189
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  14426997 acatttcgttccaacaatctccccctttttaatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 14427096  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14427097 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaataatactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 14427189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16556480 - 16556288
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  16556480 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatattcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 16556381  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16556380 tatgaggtttgtaagctctccatgagtccaatagtactttaaggtgtggtttgtaagctccccttgagttctcaccatattaattaaattcat 16556288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 16609182 - 16609374
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  16609182 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatattcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 16609281  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16609282 tatgaggtttgtaagctctccatgagtccaatagtactttaaggtgtggtttgtaagctccccttgagttctcaccatattaattaaattcat 16609374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24735416 - 24735604
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  24735416 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 24735515  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaa-ggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24735516 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttatggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 24735604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 42866507 - 42866695
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  42866507 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 42866606  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  42866607 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 42866695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 2715872 - 2715684
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  2715872 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggg 2715773  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  2715772 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 2715684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4428724 - 4428533
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||     
T  4428724 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgacaattagggta 4428625  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4428624 tgaggtttgtaagctcccccttagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttatatccatgttaattaaattcat 4428533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 15216978 - 15217166
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||    
T  15216978 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagatgactactaggt 15217077  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  15217078 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaaattctatactcgttaattaaatt 15217166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40052314 - 40052126
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  40052314 acattttgttccaacaatctctccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 40052215  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  40052214 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 40052126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16316250 - 16316058
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  16316250 acattttgtttcaacaatctccccctttttgatggtgacaaacattattatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttggctataagga 16316151  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||   ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16316150 tttgaggtttgtaagctccccctaagtacaatagtactctaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcaagttaattaaattcat 16316058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 8618030 - 8618218
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  8618030 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 8618129  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8618130 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 8618218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 18419794 - 18419982
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  18419794 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatcaaattaacaagttgactactaggt 18419893  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  18419894 aagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagactattaaggtaaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 18419982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 48236611 - 48236435
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  48236611 acattttgtttcatcaatctccctctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 48236512  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatcca 532  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48236511 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtattttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatcca 48236435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 524
Target Start/End: Original strand, 13649183 - 13649351
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13649183 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattattgttaatctaattaacaagttgactataaggg 13649282  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    | ||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13649283 tttgaagtttgtaagttccccctaagtccaatagtactctaaggtgtggtttgtaagctccccctaagt 13649351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 167526 - 167714
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  167526 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 167625  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  167626 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctctccctaagttctattcttattaattaaatt 167714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 467237 - 467049
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  467237 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 467138  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  467137 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 467049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 5710932 - 5711120
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  5710932 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 5711031  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  5711032 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 5711120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 11005846 - 11006034
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  11005846 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaacagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 11005945  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11005946 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 11006034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15887934 - 15887746
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  15887934 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 15887835  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  15887834 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 15887746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21002664 - 21002476
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  21002664 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 21002565  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  21002564 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctctaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 21002476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17960380 - 17960192
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta-cttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |   |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  17960380 acattttgttccaacaatctccccctttttgacgatgacaaacaatagcatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 17960281  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17960280 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 17960192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 4212657 - 4212843
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||       
T  4212657 attttgttccaacaatctccccctttttaatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactgggata 4212756  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4212757 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 4212843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 19144032 - 19144221
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  | | ||| | |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  || |||    
T  19144032 attttgttccaacaatctccccttttttgatgatgaccaacataagtatttgaaa--caattgttgtcaatctaattaacaagttgacttcagagtatga 19144129  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    | |||||||||||| | |||||| || ||| | |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19144130 gatttgtaagctccgcctgagtcagacagtccctaagatgaggtttataagctccccctaagttcaatcctgattaattaaattcattttaa 19144221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 553
Target Start/End: Original strand, 20743431 - 20743620
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  | | ||| | |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  || |||    
T  20743431 attttgttccaacaatctccccttttttgatgatgaccaacataagtatttgaaa--caattgttgtcaatctaattaacaagttgacttcagagtatga 20743528  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    | |||||||||||| | |||||| || ||| | |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20743529 gatttgtaagctccgcctgagtcagacagtccctaagatgaggtttataagctccccctaagttcaatcctgattaattaaattcattttaa 20743620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 548
Target Start/End: Original strand, 21695897 - 21696028
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  21695897 caattgttgttaatctaattaacaagttgactgtaagggtttgaggtttgtaatctccccctaagtcgaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctcc 21695996  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21695997 ccctgagttttatccaagttaattaaattcat 21696028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2265205 - 2265013
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| || || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||     
T  2265205 acattttgttccaacaatctcctcattttttatgatgacaatcaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgtctgtgaggg 2265106  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  2265105 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaagtttgtaagcttcccctgagttctattcatgttaattaaattcat 2265013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6877513 - 6877325
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||   |||  ||||||  |||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  6877513 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgataaacaatagtatttaaaatgttcaattgatgttgatctaattaataagttgaccactggga 6877414  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  6877413 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagcttcccctgagttctattcttattaattaaatt 6877325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 9160394 - 9160578
Alignment:
Q  365 tttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |  ||   ||    
T  9160394 tttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatttaattaataagttgactattgggataga 9160493  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  9160494 tgtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 9160578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12597683 - 12597493
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||   | || || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  12597683 cattttgttccagcaat-atccccttttttatgatgacaaacacaagtattaatacatagttgttattaatctaattaacaagttaactttaggg-ctga 12597586  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaat 554  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||| |  |||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12597585 ggtttgtaagctctccctaagtatgatagtccagaaggtgaggtttttaagttccccttaagttttatccaggttaattaaatttattttaat 12597493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13137598 - 13137409
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gtc-aattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13137598 acattttgttccaacaatctcaccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgtaattgttattaatccaattaacaagttgactttaaggg 13137499  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    | || ||||| | |||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  13137498 tatgcggtttatcagctccccctaagtctgatagtactcttaggtgaggtttataagc-tcccatgagttctatccaagttaattaaattc 13137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 520
Target Start/End: Original strand, 5686146 - 5686309
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  5686146 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 5686245  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccct 520  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5686246 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctctaaggtgaggtttgtaagctccccct 5686309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 520
Target Start/End: Original strand, 22089767 - 22089930
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  22089767 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 22089866  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccct 520  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22089867 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccct 22089930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 477
Target Start/End: Original strand, 26822757 - 26822871
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgag 462  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| | | || | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  26822757 attttgttcgaacaatctttccctttttgatgatgacaaacacaagtatttaaaaacaattgttgttaatctaattaacaagttgacttcagagtctgag 26822856  T
Q  463 gtttgtaagctcccc 477  Q
    |||||||||||||||    
T  26822857 gtttgtaagctcccc 26822871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 545
Target Start/End: Original strand, 22089910 - 22089997
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22089910 tgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 22089997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 25214969 - 25214841
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||   |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  25214969 tcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactgggatagaggtttgaaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctcc 25214870  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  25214869 ccctgagttctatactcattaattaaatt 25214841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 459 - 545
Target Start/End: Original strand, 5686289 - 5686376
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  5686289 tgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctctaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 5686376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14304059 - 14303943
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgac-tttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | | |||| |   |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14304059 cattttgttccaacaatcttcccatttt-gatgatgacaaacaccagtattaaaatgttcaattgttgttaatttaattaacaagttgacttttagggtc 14303961  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccc 476  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14303960 tgaggtttgtaagctccc 14303943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15756850 - 15756756
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagc 513  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15756850 caattgttgttgatttaattaagaagttgacttcagagtctgaggtttaaaagttccccttgagtctgatagtccataaggtgaggtttgtaagc 15756756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26699310 - 26699219
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgac 449  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  26699310 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgac 26699219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Original strand, 9433908 - 9433951
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9433908 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 9433951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1775186 - 1775134
Alignment:
Q  425 ttgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1775186 ttgttaatctaattaacaggtagacttcagggtctgaggtttgtaagctcccc 1775134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 17891030 - 17890867
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgag 462  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | | || | || ||||| |||||||| |||| || ||||||| || || |||| |     
T  17891030 attttgttccaacaatctccctctttttgatgatcacaaacacaaatattta-agacaattgttgttaatataataaataagttgagttcaatgtct-aa 17890933  T
Q  463 gtttgtaagctccccatgagtctgatagttc----ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    |||||  |||||| ||  |||| ||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17890932 gtttgggagctccacacaagtccgatagttcatatataagatgaggtttgtaagcttcccctaagt 17890867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 548
Target Start/End: Original strand, 13649330 - 13649416
Alignment:
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||||||||||||||| | ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13649330 ggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactctaaggtgaggtttgtaagctccccct-ggttttatccaagttaattaaattcat 13649416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 477
Target Start/End: Original strand, 4821959 - 4822079
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||    
T  4821959 acattttgttctaacaatattccccttttttatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaaaacgttgactataaggg 4822058  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  4822059 tatgaggtttgtaagcccccc 4822079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 500 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14303960 - 14303907
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14303960 tgaggtttgtaagctccctctaagttctatacaagttaattaaattcagtttaa 14303907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 548
Target Start/End: Original strand, 4822061 - 4822109
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4822061 tgaggtttgtaagccccccctaagttctatccatgttaattaaattcat 4822109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7592184 - 7592143
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7592184 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 7592143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15201910 - 15201869
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15201910 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 15201869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 26699208 - 26699164
Alignment:
Q  501 gaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26699208 gaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 26699164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 330 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3685 - 3462
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  3685 tcatcaaaacttaaggtggt--aatgttaaacacagtttgttccaataatctccccctttttgatgatgacaaacactagtattaatggtcaattgttgt 3588  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  3587 taatctaattaacaagttgactttagggtatgaggtttgtatgctccccctgagtttgatagttcttaaggtgaggtttgtaagc-tcccatgagtttta 3489  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaatc 555  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3488 tccaagttaattaaattcattttaatc 3462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 70272 - 70460
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  70272 acattttgttccaacaatctcccattttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 70371  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  70372 atgaggtttgtaagctccccctgattctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 70460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 934
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || | ||   |||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1125 acattttgttccaacaatctccccgttttagatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcacttgttgttaatttaattaacaagttgactttaaggg 1026  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||  |||    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  1025 tatgaggtttgtaagccccccttgagtccaatatactttaaggtgaggtttgtaaactccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 330 - 553
Target Start/End: Original strand, 13654362 - 13654584
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  13654362 tcatcaaaacttaaggtgat--aatgttaaacacattttgttccagcaatctctccctttttgatgatgacaaacactagtattaatggtcaattgttgt 13654459  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||| || ||| |||||| ||    
T  13654460 taatctaattaacaagttgactttagggtctgaggtttgtaagctccccttgagtctaatagttcttaagacgaagtttgtaaactccccttaagttata 13654559  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  13654560 tccaagttaattaaattcattttaa 13654584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 330 - 553
Target Start/End: Original strand, 11514246 - 11514469
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  11514246 tcatcaaaacttaaggtgac--aatgttaaacacattttgttccaacaatctccctctttttgatgatgacaaacactagtattaatagtcaattgttgt 11514343  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctcccc-atgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttct 527  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  11514344 taatctaattaacaagttgaacttagggtctgaggttcgtaagctcccctctgagtctaatagttcttaaggtgagacttgtaagcttcccctgagttct 11514443  T
Q  528 atccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  11514444 attcaagttaattaaattcattttaa 11514469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 330 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16794025 - 16793803
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag-tcaattattg 427  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| | ||||  | |||||| |||    
T  16794025 tcatcaaaacttaaggtggt--aaagttaaacacattttgttccaacaatctctcccatttttatgatgacaaacactagtattaaatgctcaattgttg 16793928  T
Q  428 ttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttct 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16793927 ttaatctaattaacaagttgactttagggtctgtggtttgtaagctcccc-tgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttct 16793829  T
Q  528 atccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  16793828 atctaagttaattaaattcattttaa 16793803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 553
Target Start/End: Original strand, 14008071 - 14008266
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-t 457  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14008071 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacacttgtattgaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgacttttagggt 14008170  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14008171 ctgaggtttgtaagctccccctaagtccaattgctcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcaagttaattaaattcattttaa 14008266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 361 - 553
Target Start/End: Original strand, 12397601 - 12397797
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaa--tagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  12397601 acattttgttccaacaatcttccccttttttatgatgacaaacactattattaaattgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgaccaatagggt 12397700  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12397701 ctgaggtttataagctcccactgagtctaatagtcctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaggttctatacaagttaattaaattcattttaa 12397797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 330 - 483
Target Start/End: Original strand, 21317754 - 21317906
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgt 428  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  21317754 tcatcaaaacttaaggtggt--aatgttaaacacattttgttccaacaatcttccgctttttgatgatgacaaacactagtattaatggtcaattgttgt 21317851  T
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21317852 taatctaattaacaagttgactttagggtatgaggtttgtaagttccccctgagt 21317906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 22141231 - 22141424
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||    |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  22141231 acattttgttccaacaatctcccccttttttatgatgacaaacaatagtattttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactattagg 22141330  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22141331 gtatgaggtttgtaagctccccttgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 22141424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49666065 - 49665872
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  49666065 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgattattaggg 49665966  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  49665965 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 49665872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5627575 - 5627387
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  5627575 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 5627476  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5627475 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 5627387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5875853 - 5875665
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  5875853 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 5875754  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5875753 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 5875665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Original strand, 16476938 - 16477110
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  16476938 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 16477037  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16477038 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 16477110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24660578 - 24660766
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  24660578 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 24660677  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24660678 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 24660766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 39372732 - 39372920
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  39372732 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 39372831  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  39372832 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 39372920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12962769 - 12962581
Alignment:
Q  365 tttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gtc-aattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tctg 460  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12962769 tttgttcaaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgtaattgttgttaatctaattaacaagttgactataagggtttg 12962670  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12962669 aggtttataagctccccttgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctttccctaagttctattcaagttaattaaattcat 12962581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 1054385 - 1054573
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  1054385 acattttgtttcaacaatctcctcctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 1054484  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  1054485 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 1054573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 5511355 - 5511543
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  5511355 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 5511454  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5511455 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 5511543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5547181 - 5546993
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  5547181 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 5547082  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5547081 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 5546993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 8775353 - 8775541
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  8775353 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 8775452  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8775453 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 8775541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12296376 - 12296188
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  12296376 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 12296277  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12296276 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 12296188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16658313 - 16658123
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |     
T  16658313 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgaatataagggta 16658214  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16658213 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgaaagctccccctgagttccatccatgttaattaaattcat 16658123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 545
Target Start/End: Original strand, 16812308 - 16812434
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttccc 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16812308 caattgttgttaatctaattaacaagttgactatagggtatgaggtttgtaagctccacctgagtccaatagtacttaaggtgaggtttgtaagctcccc 16812407  T
Q  519 ctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    
T  16812408 ctgagttctatccaagttaattaaatt 16812434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 18484722 - 18484910
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  18484722 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 18484821  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18484822 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 18484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 20721773 - 20721961
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  20721773 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 20721872  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  20721873 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 20721961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 41684338 - 41684526
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  41684338 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 41684437  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  41684438 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 41684526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9390779 - 9390590
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9390779 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9390680  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9390679 tagaggtttgtaagctccccatgagtctaatagatcttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcattaattaaatt 9390590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 29905728 - 29905555
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  29905728 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattattgttgatctaattaacaagttgactactaggt 29905629  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc--ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  29905628 atgaggtttgtaagctgcccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtgtgtaagctccccctgagttctat 29905555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 29946893 - 29946720
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  29946893 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattattgttgatctaattaacaagttgactactaggt 29946794  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc--ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  29946793 atgaggtttgtaagctgcccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtgtgtaagctccccctgagttctat 29946720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 29996047 - 29995874
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  29996047 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattattgttgatctaattaacaagttgactactaggt 29995948  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc--ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  29995947 atgaggtttgtaagctgcccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtgtgtaagctccccctgagttctat 29995874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 52920892 - 52921084
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  52920892 acattttgttccaacaatctcccccttttttatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataaggg 52920991  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  52920992 tttgaggtttgtaagctctccctgagtgcaatagtacttcaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcatgttaattaaattcat 52921084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 14581875 - 14582063
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||    
T  14581875 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttaacctaattaacacgttgacttttggg 14581974  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  14581975 tatgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagcctttaaggtgaggtttgaaagctccccctaaattctatacttgttaattaaatt 14582063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 365 - 545
Target Start/End: Original strand, 4744402 - 4744586
Alignment:
Q  365 tttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || | ||    
T  4744402 tttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggacaga 4744501  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4744502 ggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 4744586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 9006048 - 9005876
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  9006048 acattttggtccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactcctaggt 9005949  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      |||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9005948 aagaggtttgtaagctccccctgagtctagtagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 9005876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 13122322 - 13122510
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  13122322 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 13122421  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13122422 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 13122510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18142525 - 18142333
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagtc-aattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||  || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18142525 acattttgttccaacaatctctccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaaagtgtaattgttgttaatctaattaacaagttgactataaggg 18142426  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  18142425 tatgaggtttgaatgctccccctaagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 18142333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 17962086 - 17962275
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  17962086 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttcagaattgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactgttgg 17962185  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  17962186 gtatgaggtttgtaagctccccctcagtctaatagcttttaaggtgaggtttgaaagctccccctaaattctatacttgttaattaaatt 17962275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30053927 - 30053734
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  30053927 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgaccattaggg 30053828  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  30053827 tatgaggtttgtaagctcccccttagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctcccactgagttatatccatgttaattaaattcat 30053734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10654857 - 10654669
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  10654857 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 10654758  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  10654757 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 10654669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13382839 - 13382651
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  13382839 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 13382740  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  13382739 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 13382651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13393433 - 13393245
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  13393433 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 13393334  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  13393333 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 13393245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 14466251 - 14466439
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  14466251 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgtttaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 14466350  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14466351 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 14466439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15662264 - 15662076
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||    || |    
T  15662264 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgaccactagat 15662165  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |   |||||||||||    
T  15662164 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctcctcctaagttctatactcgttaattaaatt 15662076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16670703 - 16670515
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   || |    
T  16670703 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgaaaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactagat 16670604  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  16670603 atgagatttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 16670515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20683356 - 20683168
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  20683356 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 20683257  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  20683256 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 20683168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 37867107 - 37867295
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  37867107 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 37867206  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  37867207 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 37867295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 38195403 - 38195591
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  38195403 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 38195502  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38195503 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 38195591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12249021 - 12248835
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||       
T  12249021 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggata 12248922  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12248921 gaggtttgtaagctccccctgagtataatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 12248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 524
Target Start/End: Original strand, 15833880 - 15834049
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  15833880 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactatttggg 15833979  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15833980 tatgaggtttgtaagctccccctaaatctaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagt 15834049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6500575 - 6500389
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaa--tagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||       
T  6500575 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaactgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggata 6500476  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  6500475 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgagatttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 6500389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 16391156 - 16390984
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    ||     
T  16391156 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaataagttgactactggga 16391057  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16391056 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctat 16390984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 19779046 - 19779234
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  19779046 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 19779145  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  19779146 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 19779234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28324406 - 28324218
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  28324406 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaacagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 28324307  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  28324306 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 28324218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 418 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14131545 - 14131408
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagctt 515  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||   |||| |||| |||||||||||||||||||     
T  14131545 tcaattgttggtaatctaattaacaagttgacttttagggtctgaggtttgtaaggtccccctaagtgcaatagctctttaaggtgaggtttgtaagctc 14131446  T
Q  516 cccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14131445 cccctaagttctatacaagttaattaaattcaatttaa 14131408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 14321241 - 14321068
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  14321241 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctagg 14321142  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
       |||||||| ||||  ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14321141 atagaggtttgaaagcaacccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctat 14321068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 18006990 - 18007179
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |  |    
T  18006990 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttcagaattgttcaattgttgttaatctaatgaacacgttgactgttgg 18007089  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  18007090 gtatgaggttcgtaagctccccctgagtctaatggcttttaaggtgaggtttgaaagctccccctaaattctatacttgttaattaaatt 18007179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6220275 - 6220087
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  6220275 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 6220176  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  6220175 tagaggtttgtaaactccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 6220087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Original strand, 23757958 - 23758130
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  23757958 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 23758057  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23758058 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctat 23758130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 4404947 - 4405137
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||     
T  4404947 acattttgttccatcaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggga 4405046  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctc--cccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  4405047 tagaggtttgtaagctctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 4405137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15226540 - 15226367
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  15226540 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactagg 15226441  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
        ||||||| ||||  ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15226440 aaaaaggtttgaaagcaacccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 15226367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31113516 - 31113366
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  31113516 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgacgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactgccaggt 31113417  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggttt 507  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  31113416 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatttttaaggtgaggttt 31113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 7804106 - 7803918
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  7804106 acattttgttctaacattctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 7804007  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  7804006 cagagttttgaaagctccccctgagtcttatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 7803918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11216281 - 11216093
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |    ||     
T  11216281 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaataccggga 11216182  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  11216181 tagaggtttgtaagctcccccagagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 11216093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 361 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29951113 - 29951015
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951113 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttaagg 29951015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 361 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30000267 - 30000169
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30000267 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttaagg 30000169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 551
Target Start/End: Original strand, 15648214 - 15648315
Alignment:
Q  450 tttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttccccta-agttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15648214 tttatggtctgaggtttgtaagatccccctgagtctaatagtccttaaggtgaggtttgtaagc-tcccttagagttctattcaagttacttaaattcat 15648312  T
Q  549 ttt 551  Q
    |||    
T  15648313 ttt 15648315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19643201 - 19643124
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaa 440  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19643201 attttgttccattaatctccccctttttgatgatgacaaacacaagtattaatagtcaattgttgttaatctaattaa 19643124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18851257 - 18851069
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |   ||| |    
T  18851257 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgac-tactggtat 18851159  T
Q  460 -gaggtttgtaag--ctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  18851158 agaggtttgtaagctctccccctgagtctaatagatctttaagttgaggtttgtaagccccccctgagttctatactcattaattaaatt 18851069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 9993468 - 9993343
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9993468 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9993369  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  9993368 tagaggtttgtaagctccccctgagt 9993343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 459 - 548
Target Start/End: Original strand, 15834111 - 15834202
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||||||||||||||| || | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  15834111 tgaggtttgtaagctcgccctaagtccaatagtactcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 15834202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17034114 - 17033987
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgag 462  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||   |  ||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||    
T  17034114 attttgttccaaccatctccccctttttgatgatgacaaacataagtatttggaa-caattgttgttaatctaattaacatattgatttcaaggtctaag 17034016  T
Q  463 gtttgtaagctccccatgagtctgatagt 491  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17034015 atttgtaagttcctcatgagtctgatagt 17033987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 551
Target Start/End: Original strand, 15552533 - 15552634
Alignment:
Q  450 tttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatt 549  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15552533 tttagggtccgaggtttgtaagatccccctgagtctaatagtccttaaggtgaggtttgtaagcgcccttggagttctattcaagttacttaaattcatt 15552632  T
Q  550 tt 551  Q
    ||    
T  15552633 tt 15552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17909559 - 17909469
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  17909559 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgact 17909469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1794042 - 1793952
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttga 448  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  1794042 acattttgttccaacaatatccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttga 1793952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20627157 - 20627114
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20627157 acattttgttcctacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 20627114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 403
Target Start/End: Original strand, 9295050 - 9295089
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaac 403  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9295050 ttttgtttcaacaatctccccctttttgatgatgacaaac 9295089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 550
Target Start/End: Original strand, 21317882 - 21317932
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattt 550  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21317882 tgaggtttgtaagttccccctgagttctatccaagttagttaaattcattt 21317932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 476
Target Start/End: Original strand, 2728363 - 2728419
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccc 476  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  2728363 caattgttgttaat-taattaacaagttgacttcaaggtctaagttttctaagctccc 2728419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 28352726 - 28352767
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28352726 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 28352767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48987299 - 48987267
Alignment:
Q  372 caacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48987299 caacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 48987267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 361 - 553
Target Start/End: Original strand, 18776452 - 18776644
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  18776452 acattgtgttccaacaatctccccctttttgatgatcacaaacacttatattaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgattttagggtat 18776551  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18776552 gaggtttgtcagctcccc-tgagtttgatagttcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattaaattcattttaa 18776644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14778022 - 14777834
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  14778022 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgactaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttccaggt 14777923  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14777922 atgaggtttgtaagctccccctgagtcctatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 14777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13575780 - 13575589
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13575780 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggt 13575681  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13575680 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaacgtgaggtttctaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 13575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 362 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13306667 - 13306478
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13306667 cattttgttccaacaatctcccccttttttttgatgacaaatatttgtattaattgtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtctga 13306568  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||| || || | ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  13306567 ggtttgtaagatctccctaagtttaatagttcttaaggtgagttttgtaaact--ccccgagttcaattcaagttaattaaattcattttaa 13306478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10750729 - 10750541
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  10750729 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 10750630  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10750629 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 10750541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10964498 - 10964310
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  10964498 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 10964399  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10964398 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 10964310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27657315 - 27657503
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||   ||     
T  27657315 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgtcgttgatctaattaataagttgacttctggga 27657414  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27657415 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27657503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 10291216 - 10291405
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  10291216 acattttgtttcaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 10291315  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  10291316 ttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 10291405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19620722 - 19620531
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  19620722 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatttaattaacaagttgactataaggg 19620623  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19620622 tatgaggtttgtaagctcccc-taagtccaatagtactttaaggtgaagtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattaaattcat 19620531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15206962 - 15206790
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||     
T  15206962 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctagga 15206863  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15206862 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctat 15206790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 36019015 - 36019203
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  36019015 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 36019114  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36019115 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36019203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 420 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19887941 - 19887810
Alignment:
Q  420 aattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccc 519  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | | || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19887941 aattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtctgaggtttgtaagctccccctaaat-taattgttcttaaggtgagttttgtaagc-tcccc 19887844  T
Q  520 taagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19887843 tgagttctatccatattaattaaattcattttaa 19887810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16818921 - 16818732
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  16818921 acattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 16818822  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16818821 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 16818732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13004520 - 13004328
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgacttt-aagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13004520 acattttgttccaacaatctcctcatttttgatgatgacaaacattaatatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttaaaag 13004421  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  13004420 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatattactttaaggtgaggtttgtaagctctccctgaattctatccatgttaattaaattcat 13004328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 15139710 - 15139901
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||     
T  15139710 acattttgttcaaa-aatctcaccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaaattgactatatggg 15139808  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15139809 tttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagtactttaaggggaggtttgtaagctccccctgagttctatccatattaattaaattcat 15139901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18762662 - 18762476
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||       
T  18762662 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggata 18762563  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  18762562 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 18762476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Original strand, 11536558 - 11536730
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  11536558 acattttgttacaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 11536657  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  11536658 ttgaggtttgtaagctccccctaagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccttatgttctat 11536730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10327998 - 10327863
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgata-gttcttaaggtgaggtttgtaagcttcc 517  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||||  ||    
T  10327998 caattgttgttaaattaattaacaagttgactttagggtctgaggttcgtaagctccccctaagtctgataggtccagaaggtgaggtttgtaagcaccc 10327899  T
Q  518 cctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  10327898 cctaagttctatccatgttaattaaatttattttaa 10327863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15474777 - 15474587
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact--ttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  |    
T  15474777 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaatgaacaagttgactattttgg 15474678  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15474677 gtaagaggtttgtaagctccc-ataagtccaatagtactcttaagatgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaatt 15474587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 451255 - 451443
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  451255 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 451354  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  451355 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 451443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 11515747 - 11515935
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |    
T  11515747 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtaattaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacaagat 11515846  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |   |||||||||||    
T  11515847 aagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtcagctcgccctaagttctatactcgttaattaaatt 11515935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 16256548 - 16256736
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     |      
T  16256548 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggaa 16256647  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16256648 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 16256736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 17918731 - 17918919
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  17918731 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 17918830  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  17918831 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 17918919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 21997092 - 21997280
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  21997092 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 21997191  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  21997192 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 21997280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24640962 - 24641150
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  24640962 acattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 24641061  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24641062 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 24641150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40470169 - 40469981
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  40470169 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 40470070  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  40470069 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 40469981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 16305801 - 16305991
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||     
T  16305801 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggga 16305900  T
Q  458 ctgaggtttgtaag--ctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  16305901 tagaggtttgtaagctctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 16305991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24027666 - 24027477
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  24027666 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 24027567  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  24027566 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 24027477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 30936653 - 30936465
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     |      
T  30936653 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggaa 30936554  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  30936553 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 30936465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14356822 - 14356746
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta 407  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14356822 tcatcaaaacttaaggtggt--aatgttaaacacattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacacta 14356746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 460 - 545
Target Start/End: Original strand, 19571768 - 19571854
Alignment:
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  19571768 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 19571854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 493 - 554
Target Start/End: Original strand, 13890775 - 13890836
Alignment:
Q  493 cttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaat 554  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13890775 cttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcattttaat 13890836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 55755392 - 55755273
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  55755392 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 55755293  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  55755292 cagaggtttgtaagctcccc 55755273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 460 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39520327 - 39520241
Alignment:
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||    
T  39520327 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcgttaattaaatt 39520241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 491
Target Start/End: Original strand, 19053676 - 19053803
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgag 462  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | | || | || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||    
T  19053676 attttgttccaagaatcttcccctttttgatgatgaaaaacacaagtattta-agacaattgttgttaatttaattaacgagttgacttcagagtctaag 19053774  T
Q  463 gtttgtaagctccccatgagtctgatagt 491  Q
    || ||||||||  || |||||||||||||    
T  19053775 gtgtgtaagctttccctgagtctgatagt 19053803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Original strand, 5874080 - 5874123
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5874080 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 5874123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19954543 - 19954500
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19954543 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 19954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19888796 - 19888722
Alignment:
Q  330 tcatcaaaacttaaggtggtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacac 405  Q
    |||||||||| || ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19888796 tcatcaaaacgtatggtggt--aatgttaaacacattttgttccaacaatctcccccgttttgatgatgacaaacac 19888722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 405
Target Start/End: Original strand, 24620020 - 24620063
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacac 405  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24620020 cattttgttccaacaatctccctctttttgatgatgacaaacac 24620063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22222264 - 22222167
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaagg--tgaggtttgtaagctt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22222264 caattgttgttaatctaattaacaggtagacttcttggtatgaggtttgcaaactccccataagtctgacag-tcttagggtttgaggtttgtaagctt 22222167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 403
Target Start/End: Original strand, 50066858 - 50066897
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaac 403  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50066858 ttttgtttcaacaatctccccctttttgatgatgacaaac 50066897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26821160 - 26821119
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26821160 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 26821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 54690919 - 54690960
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54690919 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 54690960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 55755290 - 55755246
Alignment:
Q  501 gaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  55755290 gaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 55755246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 361 - 546
Target Start/End: Original strand, 60019 - 60207
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaag-gt 457  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  60019 acattatgttccaacaatctccccctttttgatgatgagaaacactagtattaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgacttttagagt 60118  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  60119 ctgaggtttgtaagctccccctgagtctgatagttcttaaggtgagttttgtaagttccccctgagttctatccatgttaattaaattc 60207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 354 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 135020 - 134823
Alignment:
Q  354 tgctaaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact 450  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  135020 tgctaacacattttcttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgact 134921  T
Q  451 -ttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  134920 attagggtatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtaattttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttttatccatgttaattaaatt 134823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6756 - 6564
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  6756 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacattgactttaaggg 6657  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6656 tatgaggtttgtaagctccccttgagtccaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 6564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 14099 - 14291
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact--tttaatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14099 acattttgttccaacaatctcccccttgttgatgatgacaaacattagtattttaaatgtgcaattattgttaatctaattaacaagttgactataaggg 14198  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14199 tatgaggtttgtaagctctccctaagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccaagttaattaaattcat 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 89106 - 88917
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  89106 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaatttgactataaggg 89007  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  89006 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctcccccttagttctatccaagttaattaaatt 88917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 13523683 - 13523871
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaa--tagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  13523683 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaactgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 13523782  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13523783 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 13523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21099361 - 21099169
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21099361 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactggtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaaattgactttaaggg 21099262  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21099261 tatgaggtttgtaagctccccctgagttcaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattagattcat 21099169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23707083 - 23706895
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  ||     
T  23707083 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactattggga 23706984  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23706983 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 23706895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 5430345 - 5430537
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  5430345 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgttcaattgttgttaatctaactaacacgttgactataaggg 5430444  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5430445 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcatgttaattaaattcat 5430537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6985992 - 6985804
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  6985992 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 6985893  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6985892 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 6985804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14040291 - 14040103
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  14040291 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 14040192  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14040191 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 14040103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 23478858 - 23479048
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt-----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaag 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||     |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  23478858 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaaatgttcaattcttgttgatctaattaacaagttgactatcag 23478957  T
Q  456 gtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23478958 gtatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagactattaaggtgatgtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 23479048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27042795 - 27042983
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  27042795 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 27042894  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27042895 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27042983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 39491497 - 39491685
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  39491497 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 39491596  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  39491597 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 39491685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 21660710 - 21660903
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||    
T  21660710 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgaatatttagg 21660809  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21660810 taagaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 21660903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9346238 - 9346050
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9346238 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9346139  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9346138 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 9346050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 14447600 - 14447788
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  14447600 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 14447699  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14447700 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 14447788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22685697 - 22685509
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  22685697 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactgctggga 22685598  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22685597 cagaggtttttaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 22685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23306540 - 23306352
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  23306540 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 23306441  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23306440 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 23306352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23372206 - 23372018
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  23372206 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 23372107  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23372106 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 23372018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24588671 - 24588859
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  24588671 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 24588770  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24588771 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 24588859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24817451 - 24817639
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  24817451 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 24817550  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24817551 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 24817639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27470255 - 27470067
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  27470255 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 27470156  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27470155 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27470067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 30228062 - 30228250
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  30228062 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 30228161  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  30228162 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 30228250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35225767 - 35225579
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  35225767 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 35225668  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35225667 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 35225579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 42053055 - 42052867
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  42053055 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 42052956  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  42052955 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 42052867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17617374 - 17617185
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  17617374 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 17617275  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17617274 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 17617185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17729231 - 17729042
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  17729231 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 17729132  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17729131 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 17729042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31358848 - 31358659
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  31358848 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 31358749  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  31358748 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 31358659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 30743496 - 30743686
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  30743496 acattttgttacaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 30743595  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  30743596 tatgaggtttgtaagctcccc-tgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagc-tcccccgagttctatccatgttaattaaattcat 30743686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 36583106 - 36583294
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  ||||||  |||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  36583106 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgatgttgatctaattaataagttgactactgggg 36583205  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36583206 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 524
Target Start/End: Original strand, 14558583 - 14558750
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  14558583 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 14558682  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14558683 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagt 14558750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 36697923 - 36697737
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || |     
T  36697923 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggaca 36697824  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctta-aggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36697823 gaggtttgtaagctccccccgagtctaatagttctttgaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36697737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20797374 - 20797186
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||     
T  20797374 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaatttttgttgatctaattaataagttgacttctggga 20797275  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  20797274 tagaggtttgtaagctccccttgagtctaatagatctttaaggtgatgtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 20797186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 21414798 - 21414986
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    |||     
T  21414798 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaaaaagttgacaactagga 21414897  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21414898 aagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcattaattaaatt 21414986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31843654 - 31843466
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  31843654 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 31843555  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  31843554 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 31843466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 15993894 - 15994082
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  15993894 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 15993993  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  15993994 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 15994082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22156799 - 22156611
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  22156799 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 22156700  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
       ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22156699 tataggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 22156611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23406125 - 23405937
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  23406125 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatataaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 23406026  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23406025 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatacttattaattaaatt 23405937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 34062299 - 34062111
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    ||     
T  34062299 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaatcagttgactactggga 34062200  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  34062199 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 34062111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 39362009 - 39361821
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  39362009 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 39361910  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  39361909 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 39361821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40400714 - 40400526
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  40400714 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 40400615  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  40400614 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 40400526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 1109727 - 1109915
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  1109727 acattttgttccaacaatctccccctttctgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaataagttgacttctggga 1109826  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |  ||||||||||||    
T  1109827 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagccccccttgagttctattcttattaattaaatt 1109915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 5291141 - 5291329
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  5291141 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 5291240  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttct-taaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  5291241 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctctaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 5291329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19477664 - 19477476
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    ||     
T  19477664 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaatgagttgactactggga 19477565  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  19477564 tagaggtttgaaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 19477476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 24926721 - 24926909
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  24926721 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 24926820  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||| |||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  24926821 tagagttttgaaagctccccctgagtcttatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 24926909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20562002 - 20561814
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  20562002 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 20561903  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||| |||| ||||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  20561902 tagagttttgaaagctccccctgagtttaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 20561814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 25935912 - 25935725
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  | | ||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||    
T  25935912 attttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacataagtatttaaaa--caaatgttgttaatctaattaacaagttgacttcaggatttga 25935815  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatttt 551  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| | |  | | ||||||||||||||| |||||||||  ||||    |||||||||||||||||    
T  25935814 ggtttgtaagctccccctgagttagataatccaaaggttgaggtttgtaagctccccctaagtcttatcttggttaattaaattcatttt 25935725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27603983 - 27604168
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || | | |     |||||| |||||||||| ||||||||     ||   |    
T  27603983 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgatctaattaataagttgaccactgggatag 27604082  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  27604083 aggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 27604168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 545
Target Start/End: Original strand, 14558726 - 14558813
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14558726 tgaggtttgtaagctccccctaagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 14558813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31448215 - 31448027
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  31448215 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaataatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 31448116  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  31448115 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaagtgaggtttgtaagctctccctgagttctattctcattaattaaatt 31448027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 553
Target Start/End: Original strand, 16791758 - 16791882
Alignment:
Q  429 taatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttcta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    |  ||   ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16791758 taatctaattaacaagttgacttcaaggtatgaggtttgcaagctccccttgagtctgatagtgtagagagttcagtttgtaagctccccctaaattcta 16791857  T
Q  529 tccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |  |  |||||||||||||||||||    
T  16791858 tataggttaattaaattcattttaa 16791882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 451
Target Start/End: Original strand, 17447294 - 17447387
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17447294 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactt 17447387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21519739 - 21519614
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  21519739 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgaaaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 21519640  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  21519639 tagaggtttgtaagctccccctgagt 21519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24421471 - 24421430
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24421471 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 24421430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 30445834 - 30445875
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30445834 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 30445875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 30455206 - 30455247
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30455206 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 30455247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5609310 - 5609278
Alignment:
Q  372 caacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5609310 caacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 5609278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7598
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7408 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaactgttgttaatctaattaacacgttgactttaagggta 7507  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  7508 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 7598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 61708 - 61896
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  61708 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgactaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttccaggt 61807  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  61808 atgaggtttgtaagctccccctgagtcttatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 61896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 358 - 545
Target Start/End: Original strand, 12235 - 12426
Alignment:
Q  358 aaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  12235 aaaacattttgttccaataatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactatca 12334  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12335 ggtatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 364 - 553
Target Start/End: Original strand, 28769974 - 28770163
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgagg 463  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||    
T  28769974 ttttgttccgacaatctcccccttttttatgatgacaaacacaagcattaatagacaattgttgttaatttaattaacgagctgactttaggatctgagg 28770073  T
Q  464 tttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28770074 tttgtaagtttcccataagtttgattgtccataaggtgaggtttgcaagctccccctaagttctatccaggttaattaaattcattttaa 28770163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 22751783 - 22751610
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  22751783 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacaaggt 22751684  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc--ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22751683 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctat 22751610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11405064 - 11404876
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  11405064 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 11404965  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11404964 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 11404876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 22764325 - 22764513
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  22764325 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaataatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 22764424  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  22764425 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 22764513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22454608 - 22454416
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22454608 acattttgttccaacaatctccctgtttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaaattgactttaaggg 22454509  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22454508 tacgaggtttgtaatctccccctgagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacatgttaattaaattcat 22454416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 10267628 - 10267816
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  10267628 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 10267727  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10267728 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 10267816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 10278205 - 10278393
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  10278205 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 10278304  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10278305 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 10278393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28711331 - 28711139
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  28711331 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatataaaattttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 28711232  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28711231 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccatctgagttctatccatgttaattaaattcat 28711139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 43346041 - 43346229
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  43346041 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 43346140  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43346141 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 43346229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24850284 - 24850092
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24850284 acattttgttctaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaatttttgttaatctaattaacaagttgaatttaaggg 24850185  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24850184 tatgaggtttgtaagcaccccctgagtttaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccatgagttctatctatgttaattaaattcat 24850092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19312563 - 19312374
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||    
T  19312563 acattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttcttggg 19312464  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19312463 acagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 19312374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 24377551 - 24377742
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  24377551 acattttgttccaacaatctccccctttatgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgatttaagggt 24377650  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
     | |||||||||||||||||   ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24377651 ataaggtttgtaagctcccccaaagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctcccccttagttctatccatgttaattaaattcat 24377742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 550
Target Start/End: Original strand, 20569948 - 20570139
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtct 459  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20569948 attttgttacaacaatttccccctttttgatgatgacaaacacttgtattaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgactattagggtat 20570047  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattt 550  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| || |||||||||||||||||||||   | || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20570048 gaggtttgtaagctccccctaagtcctatagctctttaaggtgaggtttgtaagctcttcatacgttctatacaagttaattaaattcattt 20570139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24814175 - 24813989
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  24814175 attttgttccaacaatctccccatttttgatgatgacaaataatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaaattgactatcaggtat 24814076  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24814075 gaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccctctaagttctatacaagttaattaaatt 24813989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 4210525 - 4210713
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  4210525 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 4210624  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4210625 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 4210713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22959926 - 22959738
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  22959926 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 22959827  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22959826 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 22959738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 27222034 - 27222222
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  27222034 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 27222133  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27222134 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 27222222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 34803954 - 34803766
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  34803954 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 34803855  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  34803854 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 34803766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 40222967 - 40223155
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  40222967 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 40223066  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  40223067 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 40223155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 22318094 - 22318286
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  22318094 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacaataatatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactaaaaggg 22318193  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaa-ggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||   ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22318194 tatgaagtttgtaagcttcccctgagttcaatagtactttatggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 22318286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24425113 - 24424925
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| || ||||||| |||||||||    ||     
T  24425113 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatttaattaataagttgactactggga 24425014  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  24425013 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 24424925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 29244856 - 29245044
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  29244856 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 29244955  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  29244956 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 29245044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 43083282 - 43083470
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  43083282 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 43083381  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  43083382 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 43083470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9907756 - 9907568
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  9907756 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 9907657  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  9907656 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtaaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 9907568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24337998 - 24337810
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  24337998 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 24337899  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  24337898 tagaggtttgtaagctccccctgagtctagtagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 24337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 35253652 - 35253834
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || | || ||  |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || | |    
T  35253652 acattttgttccaacaatctccccctttt-gatgat--ctaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggacag 35253748  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35253749 aggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 35253834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 35264261 - 35264443
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || | || ||  |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || | |    
T  35264261 acattttgttccaacaatctccccctttt-gatgat--ctaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggacag 35264357  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35264358 aggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 35264443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28731482 - 28731294
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaa--tagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||  |  |||||| ||||| || ||||||| |||||||||    ||     
T  28731482 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaactgttcaattgttgttgatttaattaataagttgactactggga 28731383  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  28731382 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggagaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 28731294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9772900 - 9772712
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  9772900 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 9772801  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  9772800 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaagacgaggtttctaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 9772712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 361 - 496
Target Start/End: Original strand, 26867739 - 26867877
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  26867739 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctggga 26867838  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctta 496  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  26867839 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctta 26867877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28379414 - 28379224
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  28379414 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatcacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 28379315  T
Q  458 ctgaggtttgtaag--ctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      ||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  28379314 tagaggtttgtaagctctccccctgagtctaatagatctttaagttgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 28379224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21172027 - 21171838
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  ||||||  |||| |||||||||| |||||||||    ||    
T  21172027 acattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgctgttgatctaattaataagttgactactggg 21171928  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
       |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  21171927 atagaggtttgaaagctccccctaagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 21171838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 556
Target Start/End: Original strand, 18848820 - 18849012
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | | ||| | |  ||||| || || || |||||||||| |||||||  | ||| ||    
T  18848820 attttgttccaacattctcccccttttttatgatgacaaacacaagtatttgaaa--caattgttattgatttaattaacaaattgacttccatgtcaga 18848917  T
Q  462 ggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaatca 556  Q
    | |||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||||| || ||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  18848918 gatttgtaagcttcccctaagtctgatagtccataaggcgaggtttgtaagctcttcctaaattttatccaggttaattaaatttattttgatca 18849012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 20417223 - 20417098
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  20417223 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttaaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctggga 20417124  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
      |||||||||||||||||| |||||    
T  20417123 tagaggtttgtaagctccccctgagt 20417098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 477
Target Start/End: Original strand, 29410139 - 29410248
Alignment:
Q  367 tgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||| | |  ||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||    
T  29410139 tgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacacaggtatttgaaa--caattgttgttaatctaattaacatgtagacttaagggtatgaggtt 29410236  T
Q  466 tgtaagctcccc 477  Q
    ||||||||||||    
T  29410237 tgtaagctcccc 29410248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 493
Target Start/End: Original strand, 33241107 - 33241227
Alignment:
Q  373 aacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagc 472  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||    
T  33241107 aacaatctccccatttttgttgatgacagacacaagtattaatggtcaattgttgttaatcagattaacaatttgactgaagggtctgaggtttttaagc 33241206  T
Q  473 tccccatgagtctgatagttc 493  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  33241207 tccccctaagtctaatagttc 33241227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 493
Target Start/End: Original strand, 33249028 - 33249148
Alignment:
Q  373 aacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagc 472  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||    
T  33249028 aacaatctccccatttttgttgatgacagacacaagtattaatggtcaattgttgttaatcagattaacaatttgactgaagggtctgaggtttttaagc 33249127  T
Q  473 tccccatgagtctgatagttc 493  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  33249128 tccccctaagtctaatagttc 33249148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27639876 - 27639783
Alignment:
Q  381 ccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||   |||||||||| ||||||    
T  27639876 ccccctttttgatgatgacaaacacaagtattaatattcaattgttattaatttaattaacaagttaactttagggt---aggtttgtaatctcccc 27639783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1799582 - 1799550
Alignment:
Q  372 caacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1799582 caacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 1799550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 483 - 551
Target Start/End: Original strand, 29410345 - 29410413
Alignment:
Q  483 tctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatttt 551  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||    
T  29410345 tctgatagtttctaaggtgaggtttgtaagtcccccctaagttttattctcgttaattaaattcatttt 29410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 361 - 553
Target Start/End: Original strand, 87383 - 87574
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctg 460  Q
    |||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  87383 acattttgttccaaaaaactcccc-tttttgatgatgacaaacaccagtatcaatggtcaattgttgttaatctaatcaacaagttgactttagggtgtg 87481  T
Q  461 aggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    | ||||||||||||||| | ||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  87482 atgtttgtaagctccccctaagtccaatatctcttaaggtgaggtttgtaagctacccttgagttctattcaagttaattaaattcattttaa 87574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 128303 - 128492
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  128303 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacaaggt 128402  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  128403 gtgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatcttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 128492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 36134661 - 36134853
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  36134661 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgagtataaggg 36134760  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  36134761 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 36134853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 3172211 - 3172399
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||   ||     
T  3172211 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgtcgttgatctaattaataagttgacttctggga 3172310  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3172311 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 3172399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 7507925 - 7508113
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  7507925 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 7508024  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  7508025 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 7508113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20883463 - 20883275
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  20883463 acattttattccagcaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacaaggt 20883364  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20883363 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgaaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 20883275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35648274 - 35648086
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  35648274 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 35648175  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35648174 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 35648086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 38095665 - 38095853
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  38095665 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 38095764  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38095765 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 38095853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22464383 - 22464193
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgacttta-aggtc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||     
T  22464383 attttgttccaacaatctccccctttttgatgctgacaaacattagtatttaaaatgctcaatttttgttaatctaatgaacacgttgactatagaggta 22464284  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22464283 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagcttcgcctgagttctatccatgttaattaaattcat 22464193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 5833841 - 5834029
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  5833841 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 5833940  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5833941 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 5834029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 20255540 - 20255728
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  20255540 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatccaattaacaagttgactaccaggt 20255639  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20255640 atgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 20255728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 36246595 - 36246407
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  36246595 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 36246496  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36246495 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 36246407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 51656047 - 51655859
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  51656047 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 51655948  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  51655947 cagaggtttgtaagctccccctaagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 51655859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20954049 - 20953857
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20954049 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataaggg 20953950  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||  ||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  20953949 tttgaggtttgtaagctctccctaagtccaatagtactttaaggtgaggtttttaggctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 20953857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21134753 - 21134563
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  21134753 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaataatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacactttgactattagggta 21134654  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21134653 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcatgttaattaaattcat 21134563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 47618123 - 47617934
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||    
T  47618123 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggg 47618024  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  47618023 acagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 47617934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 153891 - 153703
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  153891 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaataagttgacttctggga 153792  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  153791 tagaggtttgtaagctccccctgagtccaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12623400 - 12623212
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    |||     
T  12623400 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactagga 12623301  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12623300 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 12623212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 21878359 - 21878544
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   | |      
T  21878359 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttctggata- 21878457  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  21878458 gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 21878544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 362 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18516787 - 18516672
Alignment:
Q  362 cattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctga 461  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18516787 cattttgttccaacaatctccccctttttggtgatgacaaagattggtattaaatgtcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttagggtctga 18516688  T
Q  462 ggtttgtaagctcccc 477  Q
    ||||||||||||||||    
T  18516687 ggtttgtaagctcccc 18516672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 364 - 548
Target Start/End: Original strand, 19717999 - 19718188
Alignment:
Q  364 ttttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-ggtct 459  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||   ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19717999 ttttcttccaacaatctctccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatatgtaattgttgttaatctaattaacaagttgactttaagggtat 19718098  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  19718099 gaggtttgtaagctccctctgagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctcatcctgaattctatccatgttaattaaattcat 19718188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 35400748 - 35400560
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  35400748 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 35400649  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35400648 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 35400560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20109552 - 20109364
Alignment:
Q  369 ttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtctgaggtt 465  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | |||| |   |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20109552 ttccaacaatctccccatttttgatgatgacatacacttgtattaaaatgttcaattgttgttaacctaattaacaagttgactattagggtctgaggtt 20109453  T
Q  466 tgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    |||||||||||| | ||||  | |  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  20109452 tgtaagctccccctaagtccaaaatatctttaaggtgagatttgtaagctccccctaagttctattcaagttaattaaatttattttaa 20109364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Original strand, 22643399 - 22643584
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| |    
T  22643399 attttgttccaacaatctcccctttttt-atgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactaccaggtat 22643497  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22643498 gaggtttgtaagctccccctgagtcaaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctcccactaagttctatacaagttaattaaatt 22643584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 547
Target Start/End: Original strand, 20909916 - 20910106
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgac-tttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||  |||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| |||    
T  20909916 acattttgttccaacaatctccccctctttgatgatgacaaacactagtattacaatgttcaattgttgttaatttaattaacaagtaaacttttagggt 20910015  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattca 547  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  20910016 ctgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtcctttaaggtgcggtttgtaagctctccctaaatcatatacaagttaattaaattca 20910106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 12731135 - 12731323
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  12731135 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 12731234  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12731235 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 12731323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 12741728 - 12741916
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  12741728 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 12741827  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12741828 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 12741916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19169937 - 19169749
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  19169937 acattttgttccaacaatcttcccctttttaatgatgacaaacaatagtatttaaaattttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactctcaagt 19169838  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  19169837 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtaagatttgtaagcttcccttaagttctatacgagttaattaaatt 19169749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 4167847 - 4168035
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||   | ||     
T  4167847 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaagttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactgaga 4167946  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  4167947 ta-gaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 4168035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 19179548 - 19179736
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  19179548 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 19179647  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  19179648 tagaggtttgtaagctcccgctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 19179736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 21864249 - 21864437
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  | |||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  21864249 acattttgtttcaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttaaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 21864348  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21864349 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 21864437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 418 - 545
Target Start/End: Original strand, 23067507 - 23067635
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||||||||||||||| || |    
T  23067507 tcaattgttgttgatctaattaacaagttgactaccaggtatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaaactcc 23067606  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23067607 ccctaagttctatacaagttaattaaatt 23067635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 7744660 - 7744494
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactt-taagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  7744660 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatattca---attgttaatctaattaacaag-tgacttcttagg 7744565  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7744564 --tgaggtttgtaagctccccttgagtctaatagtccttttgggtgaggtttgtaagc-tcccctaagttctat 7744494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 425 - 547
Target Start/End: Original strand, 26898558 - 26898680
Alignment:
Q  425 ttgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagt 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26898558 ttgttaatctaattaaccagttgacttcatagtatgaggtttgtaagctcctcctgagtctgatagtccataaggtgaggtttgcaagctccccctaagt 26898657  T
Q  525 tctatccaaattaattaaattca 547  Q
      |||| | |||| |||||||||    
T  26898658 catatctagattatttaaattca 26898680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 7679837 - 7680025
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  7679837 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 7679936  T
Q  458 ctgaggtttgtaagct-ccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||| ||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  7679937 tagaggtttgaaagctcccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagc-tcccctgagttctattcttattaattaaatt 7680025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 545
Target Start/End: Original strand, 26561074 - 26561254
Alignment:
Q  369 ttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtt 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    || | ||| ||    
T  26561074 ttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggggcagagttt 26561173  T
Q  466 tgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    || || |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  26561174 tgaaatctccccctgagtcttatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctctactcattaattaaatt 26561254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18516690 - 18516638
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcatttta 552  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18516690 tgaggtttgtaagctccccctaagttctatccaggttaattaaattcatttta 18516638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Original strand, 23065434 - 23065475
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaa 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23065434 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaa 23065475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5649882 - 5649804
Alignment:
Q  468 taagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  5649882 taagctccccctgaatctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 5649804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 494 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 7744483 - 7744431
Alignment:
Q  494 ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattc 546  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  7744483 ttaaggtgaggtttgtaagctctccttaaattctatacaagttaattaaattc 7744431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 120
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  312 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactataaggg 213  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  212 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatattattttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatcttaattaaattcat 120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4278 - 4090
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   || |    
T  4278 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactagat 4179  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4178 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagcttcctctaagttctatacaagttaattaaatt 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4309 - 4121
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  4309 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaactatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 4210  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4209 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagagctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 4121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10879 - 10691
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  10879 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactgtcaggt 10780  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10779 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctaaacaagttaattaaatt 10691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 348 - 548
Target Start/End: Original strand, 8370 - 8576
Alignment:
Q  348 gtgtaatgctaaa-acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaa 443  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  8370 gtgtaatgttaaacacattttgttccaacaatctccccctttttgataatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattattgttaatctaattaacaa 8469  T
Q  444 gttgactttaagg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaatta 541  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  8470 gttgactataagggtatgaggtttgtaagctcccattgagttcaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaatta 8569  T
Q  542 aattcat 548  Q
    |||||||    
T  8570 aattcat 8576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Original strand, 11013 - 11203
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |     
T  11013 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacactaatatttaaaatgttcaattattgttaatctaattaacatgttgaccataagggta 11112  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  11113 tgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttttatccatgttaattaaattcat 11203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4443
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4635 acattttgtttcaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactgtaaggg 4536  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4535 tatgaggtttgtaagctgcccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 4443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30495 - 30304
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  30495 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataaggg 30396  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  30395 tatgaggtttgtaagctcccc-taagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagtttcccctgagttctatccatgttaattaaattcat 30304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 17478 - 17666
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  17478 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactaacaggt 17577  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  17578 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaatttctatacaagttaattaaatt 17666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Original strand, 23150 - 23340
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactacttt-taata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tc 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |     
T  23150 attttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatataaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacatgttgactataagggta 23249  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  23250 tgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagtattttaaggtaaggtttgtaagctccccctaaattctatccatgttaattaaattcat 23340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 9674 - 9866
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  9674 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgaggacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatataattaacacgttgactttaaggg 9773  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  9774 tatgaggtttgtaagctctccctgagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgaattctatccatgttaattaaattcat 9866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 31774 - 31962
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  31774 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 31873  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  31874 cagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagttctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 31962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 58959 - 59147
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   || | |||||| |||||  || ||||||||||||||||   ||||    
T  58959 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaaattcaattgttgttggtcaaattaacaagttgactactaggt 59058  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  59059 atgaggtttttaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 59147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 176001 - 176189
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||   |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  176001 acattttgttccaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatattcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 176100  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  176101 ttgaggtttgtaagctcccccggagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 176189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 53426 - 53262
Alignment:
Q  385 ctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatga 481  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| |||    
T  53426 ctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactgccaggtttgtggtttgtaagctccccctga 53327  T
Q  482 gtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53326 gtccaatagatttttaaggtgaggtttgtaaactccccctaagttctatacaaattaattaaatt 53262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20007 - 19814
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  20007 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactattttgg 19908  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19907 taagaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactcttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 19814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 143578 - 143770
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  143578 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatttaattaacaagttgactataaggg 143677  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  143678 tatgaggtttgtaagcttcccctgagtccaatagtactttaagatgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 58892 - 58726
Alignment:
Q  358 aaaacattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa 454  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  58892 aaaacattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaacgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacta 58793  T
Q  455 ggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccct 520  Q
    ||| |||||||||||||||| || | ||||| | ||  | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  58792 ggtatgaggtttgtaagctctccctaagtctaacagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccct 58726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 58746 - 58692
Alignment:
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaag 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  58746 tgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaag 58692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3805 - 3617
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   || |    
T  3805 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactagtt 3706  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  3705 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 211204 - 211392
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  211204 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 211303  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  211304 atgaggtttgtaagctccccctaagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacttgttaattaaatt 211392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 217073 - 217261
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  217073 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 217172  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  217173 atgaggtttgtaagctccccctaagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacttgttaattaaatt 217261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 363 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6119 - 5933
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtct 459  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  6119 attttgttccaacaatctccccatttttgatgatgacaaataatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaatttgactttcaggtat 6020  T
Q  460 gaggtttgtaagctccccatgagtctgatag-ttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6019 gaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacttttaaggtgaggtttgtaagctccctctaagttctatacaagttaattaaatt 5933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9183 - 8991
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9183 acattttgttccaacaatctccccatttttgatgatgacaaccattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattaacaagttgactataaggg 9084  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9083 tacgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaatcttcccctgagttctatacatgttaattaaattcat 8991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 1377 - 1565
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| || |||| ||||||||||||   ||||    
T  1377 acattttattccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatttaatgaacaagttgactgctaggt 1476  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1477 atgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaagttaattaaatt 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9503 - 9315
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||   ||||    
T  9503 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaaattgactgctaggt 9404  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9403 aagaggtttgtaagctcccccttagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctcccactaagttctatacaagttaattaaatt 9315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 419 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4751
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg-tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcc 517  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  4881 caattgttgttaatctaattaacaagttgacttaaagggtatgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactttaggtgaggtttgtaagctccc 4782  T
Q  518 cctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4781 cctgagttctatccaagttaattaaattcat 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 6760 - 6572
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  6760 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgacttctggga 6661  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||    
T  6660 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcgttaattaaatt 6572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 9805 - 9993
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  9805 acattttgttccaacaatctccccctttctgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactacaaggt 9904  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9905 ataaggtttgtaagctccccctgagtccaatagacctttaaggtgagttttgtaagctcctcctaagttctatacaagttaattaaatt 9993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24979 - 24787
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgacttt-aagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24979 acattttgttccaacaatctcctcatttttgatgatgacaaacattaatatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgactttaaaag 24880  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  24879 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatattactttaaggtgaggtttgtaagctctccctgaattctatccatgttaattaaattcat 24787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 7797 - 7990
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  7797 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactattttgg 7896  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
       |||||||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  7897 aaagaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactcttaaggtgaggtttgtaggctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 7990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15207 - 15011
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  15207 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaagttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactatttggg 15108  T
Q  457 tctgaggtttgtaa----gctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    |  |||||||||||    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  15107 taagaggtttgtaattaagctccccctgagtctaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 15011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34430 - 34237
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  34430 acattttgttccaacaatctcctcctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactattaggg 34331  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34330 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtacttttagggtgaagtttgtaagctccccctgagttctattcatgttaattaaattcat 34237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 514
Target Start/End: Original strand, 7215 - 7372
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  7215 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagttgactactaggt 7314  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagct 514  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  7315 atgaggtttgtaagctccccctaagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagct 7372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12695
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  12884 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaagttgactactggga 12785  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagct-tcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12784 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatcttcaaggtgaggtttgtaagctcccccctgagttctatactcattaattaaatt 12695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17391 - 17199
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta-cttttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  17391 acattttgtttcaacaatctccccttttttgatgatgacaaacaatagcatttaaaatgttcaattattgttaatctaattaacatgttgactattaggg 17292  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17291 tatgag-tttgtaagctccccttgagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccctctgagttctatccatgttaattaaattcat 17199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3924
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||     
T  4112 acattttgttctaacaatctccccctttttaatgatgacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgacttttggga 4013  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||||||||||    
T  4012 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctattcttattaattaaatt 3924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 363 - 548
Target Start/End: Original strand, 7884 - 8075
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaaggtc 458  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||     
T  7884 attttgttctaacaatcttcccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactatttgggta 7983  T
Q  459 tgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  7984 tgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 47186 - 46998
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  47186 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 47087  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  47086 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatccttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctattcttattaattaaatt 46998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5233 - 5041
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || | ||   |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5233 acattttgttccaacaatctcccctttttcgatgatgacaaacaatagtgtttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacatgttgactataaggg 5134  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctta-aggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5133 tatgaggtttgtaagctccccctgagtccaatagtagtttgaggtgagctttgtaagctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 95437 - 95478
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  95437 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 95478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 192583 - 192771
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||     
T  192583 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgactactggga 192682  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  192683 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctatactcattaattaaatt 192771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 21131 - 21324
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaatag--tcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |   |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||    
T  21131 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgataaacaatagtatttaaaacgttcaattgttgttaatttaattaacatgttgactatttggg 21230  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt--aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  21231 tatgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagtcatatccatgttaattaaattcat 21324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 2509 - 2697
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  2509 acattttgttccaacaatctcccccattttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatccaattaacaagttgactgccaggt 2608  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||| ||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2609 aagaggtttgaaagctccccctaagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatacaggttaattaaatt 2697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 2668 - 2856
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  ||||||  |||| |||||||||||||| | |||   ||||    
T  2668 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgatgttgatctaattaacaagataactactaggt 2767  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  2768 atgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaaattctatactcgttaattaaatt 2856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 15542 - 15730
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||    
T  15542 acattttgttccaacaatctccccttttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaacaagctgactactaggt 15641  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
     |||||||||||||||| || ||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  15642 atgaggtttgtaagctctccctgagtttaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 15730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 12967
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || || || || |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  13157 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcagttgtttttaat--aattaacaagttgactataaggg 13060  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13059 tttgaggtttgtaagctccccttgagtccaatagtactttaaggtgaggtttgttatctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 36399 - 36244
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  36399 acattttgttccaacaatctccccctctttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattatcaagttgactataaggg 36300  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaa 511  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  36299 tttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagtattttaaggtgagttttgtaa 36244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 511
Target Start/End: Original strand, 42606 - 42761
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  42606 acattttgttccaacaatctccccctctttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcaattgttgttaatctaattatcaagttgactataaggg 42705  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt-tcttaaggtgaggtttgtaa 511  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  42706 tttgaggtttgtaagctccccctgagtctaatagtattttaaggtgagttttgtaa 42761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 41137 - 41329
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaag-g 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||   |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  41137 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgataacaaacactagtatttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacaaattgactataagag 41236  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccc-taagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| | ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41237 tatgagttttgtaagct-cccttgagtcgaatagtactttaaggtaaagtttgtaagctcccccttgagttctattcaagttaattaaattcat 41329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 9868 - 9696
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| || || ||||||||||||||||||||   ||||    
T  9868 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgtttttgatctaattaacaagttgactaccaggt 9769  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttc-ttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctat 529  Q
      |||||||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9768 aagaggtttgtaagctccccctaagtctaatagacctttaaggcgaggtttgtaagccccccctaagttctat 9696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Original strand, 23278 - 23466
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |    ||     
T  23278 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgttcaattgttgttgacctaattaataagttgaatactggga 23377  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23378 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 23466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 53142 - 52954
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||   |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||     ||     
T  53142 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaatgttcaattgttgttgatctaattaataagttgaccactggga 53043  T
Q  458 ctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  53042 tagaggtttgtaagctccccctgagtctaataaatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 52954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4400 - 4208
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  4400 acattttgttccaacaatctcccccttttttatgatgacaaacattagtatttaaaatatgcaattgttgttaatctaattaacaagttgaccataaggg 4301  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctga--tagttcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||  ||||||||||||||   ||||  |  || || |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4300 tttgacttttgtaagctcccccgaagtccaaaatactt-ttaaggtgaggtttgtaagctcaccctgagttctatccaagttaattaaattcat 4208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Original strand, 11886 - 12079
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt--aatagt-caattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||  || ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||    
T  11886 acattttgttccaacaatctccctctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaagttcaattgttgttaatctaattaacacgctgactatttggg 11985  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagt--tcttaaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||   ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||    
T  11986 tatgaggtttgtaagctccccctaagtccagtagtacttttaaggtgaggtttgtaagctccccttgagttctatccatgttaattaagttcat 12079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 544
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33095
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact--tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg 456  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |  ||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  32906 acattttgttctaacaatctctcccttttttatgatgacaaacattagtattttaaaatgtgcaattgctgttaatctaattaacaagttgattgtacgg 33005  T
Q  457 -tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaat 544  Q
     | ||||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  33006 gtttgaggtttgtaagctccccctaagtccaatagtactttaaggtgaggtttgtaagctcccccggagttctatccaagttaattaaat 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 361 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 60508 - 60316
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactact-tttaata-gt-caattattgttaatctaattaacaagttgactttaagg- 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || | ||||| | || || || || ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  60508 acattttgttccaacaatctccccaattttgatgatgacaaacattagtatttaaaatgtgcagttgtttttattctaattaacaagttgactataaggg 60409  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  60408 tttgaggtttgtaaactccccctgagtccaatagtactttaaagtgaggtttgttatctccccctgagttctatccatgttaattaaattcat 60316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 2346 - 2220
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacacta---cttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact-ttaagg 456  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||   |||  |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  2346 acattttgttccaataatctccccctttttggtgatgacaaacaatagtacttaaaatgttcaattgttgttaatctaattaacacgttgactattaggg 2247  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctccccatgagt 483  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||    
T  2246 tatgaggtttgtaagctccccctgagt 2220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 500 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2244 - 2196
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2244 tgaggtttgtaagctccccctgagttctatcaatgttaattaaattcat 2196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3905 - 3777
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||   |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  3905 tcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggatagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctcc 3806  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  3805 ccctgagttctattcttattaattaaatt 3777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12180 - 12052
Alignment:
Q  418 tcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttc 516  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||   |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  12180 tcaattgttgttgatctaattaataagttgactactgggatagaggtttgtaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctcc 12081  T
Q  517 ccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  12080 ccctgagttctattcttattaattaaatt 12052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 9999 - 9947
Alignment:
Q  425 ttgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctcccc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9999 ttgttaatctaattaacaagttgactttagggtatgaggtttgtaagctcccc 9947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9965 - 9913
Alignment:
Q  500 tgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcattttaa 553  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9965 tgaggtttgtaagctccccttaagt-ctatccatgttaattaaattcattttaa 9913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3394 - 3311
Alignment:
Q  463 gtttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  3394 gtttctaagctccccctgagtctaatagatctttaaggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcttattaattaaatt 3311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Original strand, 3439 - 3482
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3439 acattttgttccaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 42015 - 41887
Alignment:
Q  425 ttgttaatctaattaacaagt---tgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaaggtgaggtttgtaagcttccccta 521  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  42015 ttgttaatctagttaacaagtcgttgactctagggtttgagttttgtaagctacccttgagtctgacaatcctaaaggtgagttttgtgagcttccc-ta 41917  T
Q  522 agttctatccaaattaattaaattcatttt 551  Q
    |||||||| |   |||||||||||||||||    
T  41916 agttctatgctggttaattaaattcatttt 41887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 545
Target Start/End: Original strand, 30530 - 30612
Alignment:
Q  464 tttgtaagctccccatgagtctgatagttctt-aaggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaatt 545  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||    
T  30530 tttgtaagctccccctgagtctaatagacctttaaggtgaggtttgtaagctccccctaagttctatactcgttaattaaatt 30612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 475
Target Start/End: Original strand, 10281 - 10399
Alignment:
Q  361 acattttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaa---cactacttttaatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgactttaa-gg 456  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   || || ||  |||  |||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  10281 acattttgttccaacaatctcaccctttttgatgatgacaaacagcagtatttaaaattttcaattgttgtgaatctagttaacaagttgattataaggg 10380  T
Q  457 tctgaggtttgtaagctcc 475  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  10381 tttgaggtttgcaagctcc 10399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37664 - 37574
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt---aatagtcaattattgttaatctaattaacaagttgact 450  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || | ||   |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37664 attttgttccaacaatctctccctttttgatgatgacaagcaatagtatttaaaatgttcaatttttgttgatctaattaacaagttgact 37574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4096 - 3998
Alignment:
Q  451 ttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaa-ggtgaggtttgtaagcttcccctaagttctatccaaattaattaaattcat 548  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||||||||||    
T  4096 ttaaggtatgaggtttgtaagctccctctaagtccaatagtactttatggtgaggtttgtaagctccccctgagttctattcatggtaattaaattcat 3998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4963 - 4880
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaacactactttt----aatagtcaattattgttaatctaattaaca 442  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4963 attttgttccaacaatctctccctttttgatgatgacaaacaatagtatttaaaaatgttcaattgttgttaatctaattaaca 4880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0754 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0754
Description:

Target: scaffold0754; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 515
Target Start/End: Original strand, 5049 - 5146
Alignment:
Q  419 caattattgttaatctaattaacaagttgactttaaggtctgaggtttgtaagctccccatgagtctgatagttcttaagg--tgaggtttgtaagctt 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5049 caattgttgttaatctaattaacaggtagacttcttggtatgaggtttgcaaactccccataagtctgacag-tcttagggtttgaggtttgtaagctt 5146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2719 - 2678
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2719 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 2678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 27125 - 27166
Alignment:
Q  363 attttgttccaacaatcaccccctttttgatgatgacaaaca 404  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27125 attttgtctcaacaatctccccctttttgatgatgacaaaca 27166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University