View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15868_high_3 (Length: 437)

Name: NF15868_high_3
Description: NF15868
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15868_high_3
NF15868_high_3
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (27-427)||(27284177-27284581)
chr6 (43-427)||(16755815-16756204)
chr6 (27-427)||(29555537-29555941)
chr6 (28-427)||(27623522-27623927)
chr6 (43-427)||(27063477-27063864)
chr6 (45-427)||(13518009-13518395)
chr6 (27-427)||(27355926-27356330)
chr6 (60-427)||(28166506-28166878)
chr6 (27-427)||(22928696-22929102)
chr6 (45-427)||(27491130-27491516)
chr6 (67-427)||(26110226-26110589)
chr6 (76-427)||(4763791-4764146)
chr6 (45-427)||(16680136-16680523)
chr6 (27-427)||(8899514-8899918)
chr6 (76-427)||(29507444-29507801)
chr6 (67-427)||(26772444-26772807)
chr6 (51-427)||(29579018-29579397)
chr6 (27-427)||(34458323-34458725)
chr6 (27-427)||(4539573-4539978)
chr6 (38-427)||(30551815-30552208)
chr6 (27-427)||(33370246-33370650)
chr6 (27-427)||(27200165-27200569)
chr6 (27-427)||(27248664-27249068)
chr6 (27-427)||(28213433-28213838)
chr6 (66-427)||(13292766-13293125)
chr6 (65-427)||(16937840-16938205)
chr6 (27-427)||(4531267-4531671)
chr6 (44-427)||(4778876-4779264)
chr6 (43-427)||(26791811-26792199)
chr6 (43-424)||(14139218-14139597)
chr6 (43-424)||(27013728-27014106)
chr6 (43-427)||(26926763-26927135)
chr6 (44-427)||(27031019-27031403)
chr6 (43-427)||(27208899-27209283)
chr6 (43-427)||(27239945-27240329)
chr6 (129-427)||(26666473-26666774)
chr6 (43-427)||(24869705-24870087)
chr6 (66-427)||(27025163-27025524)
chr6 (44-427)||(24299575-24299957)
chr6 (66-427)||(15406348-15406709)
chr6 (66-427)||(15418135-15418496)
chr6 (88-415)||(20174589-20174930)
chr6 (88-415)||(22161061-22161402)
chr6 (27-124)||(23851450-23851547)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (66-427)||(12661558-12661922)
chr2 (65-427)||(39896087-39896452)
chr2 (43-427)||(37383673-37384061)
chr2 (43-427)||(27809697-27810087)
chr2 (65-427)||(22922001-22922369)
chr2 (44-427)||(254510-254897)
chr2 (44-427)||(37945723-37946111)
chr2 (45-427)||(34867681-34868066)
chr2 (43-427)||(34160840-34161230)
chr2 (44-427)||(9343845-9344232)
chr2 (76-427)||(27122554-27122907)
chr2 (65-427)||(19410342-19410710)
chr2 (43-427)||(12592806-12593198)
chr2 (44-427)||(39045680-39046067)
chr2 (44-427)||(16167475-16167862)
chr2 (44-427)||(13930402-13930791)
chr2 (43-427)||(3788490-3788877)
chr2 (38-427)||(21697031-21697427)
chr2 (27-427)||(37679749-37680155)
chr2 (27-427)||(37695014-37695420)
chr2 (27-427)||(12710459-12710863)
chr2 (44-427)||(31882284-31882670)
chr2 (27-427)||(11629043-11629446)
chr2 (27-427)||(21671028-21671435)
chr2 (43-427)||(32055798-32056185)
chr2 (44-427)||(37931369-37931763)
chr2 (38-427)||(16823195-16823588)
chr2 (38-427)||(16897892-16898285)
chr2 (43-427)||(34297152-34297533)
chr2 (27-427)||(40239489-40239892)
chr2 (95-427)||(31868644-31868979)
chr2 (27-427)||(27782212-27782616)
chr2 (27-427)||(27396303-27396717)
chr2 (27-427)||(19450276-19450689)
chr2 (43-427)||(28888275-28888658)
chr2 (43-427)||(34268784-34269167)
chr2 (44-427)||(23122436-23122818)
chr2 (43-423)||(27428315-27428692)
chr2 (66-427)||(20843931-20844296)
chr2 (291-427)||(23117044-23117180)
chr2 (44-100)||(31887682-31887738)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (27-427)||(3047-3453)
scaffold0159 (191-427)||(17952-18194)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (27-427)||(32296574-32296979)
chr3 (44-427)||(4790544-4790932)
chr3 (44-427)||(5727940-5728328)
chr3 (44-427)||(47029415-47029803)
chr3 (44-427)||(5717030-5717418)
chr3 (44-427)||(5764040-5764428)
chr3 (65-427)||(31958366-31958734)
chr3 (27-427)||(29658879-29659283)
chr3 (65-427)||(5603224-5603592)
chr3 (65-427)||(24334156-24334524)
chr3 (43-427)||(10402110-10402497)
chr3 (43-427)||(22381492-22381879)
chr3 (27-427)||(16422128-16422532)
chr3 (76-424)||(5590275-5590627)
chr3 (43-427)||(17970777-17971163)
chr3 (27-427)||(16618400-16618808)
chr3 (43-427)||(6536654-6537042)
chr3 (44-427)||(10649033-10649420)
chr3 (27-427)||(48471872-48472280)
chr3 (43-427)||(22864759-22865145)
chr3 (43-427)||(22879818-22880204)
chr3 (27-427)||(28027236-28027638)
chr3 (38-427)||(4340587-4340980)
chr3 (51-427)||(18286266-18286645)
chr3 (51-427)||(18301567-18301946)
chr3 (43-427)||(20071994-20072384)
chr3 (44-427)||(4422880-4423267)
chr3 (27-427)||(18248683-18249087)
chr3 (27-427)||(28109862-28110271)
chr3 (76-427)||(11104272-11104628)
chr3 (43-427)||(7079183-7079576)
chr3 (43-427)||(8217593-8217983)
chr3 (44-427)||(5019675-5020061)
chr3 (65-427)||(28345154-28345519)
chr3 (43-427)||(5472949-5473336)
chr3 (38-427)||(17978861-17979255)
chr3 (44-427)||(51787984-51788371)
chr3 (27-427)||(29142665-29143072)
chr3 (76-427)||(31030156-31030504)
chr3 (27-427)||(4629730-4630133)
chr3 (27-427)||(21680646-21681049)
chr3 (44-427)||(18231155-18231542)
chr3 (44-427)||(18057222-18057612)
chr3 (45-424)||(18336591-18336968)
chr3 (27-427)||(20570757-20571161)
chr3 (27-427)||(19700431-19700847)
chr3 (66-427)||(4727617-4727976)
chr3 (50-427)||(32445122-32445494)
chr3 (66-427)||(6207884-6208245)
chr3 (44-427)||(15735011-15735393)
chr3 (66-427)||(35886748-35887109)
chr3 (44-427)||(8283369-8283767)
chr3 (44-427)||(4689613-4689994)
chr3 (43-427)||(5658095-5658480)
chr3 (182-427)||(15886652-15886895)
chr3 (43-153)||(15886894-15887006)
chr3 (44-129)||(8002522-8002607)
chr3 (110-193)||(27561018-27561101)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (66-423)||(11555382-11555742)
chr5 (39-427)||(3795539-3795932)
chr5 (45-427)||(18369300-18369686)
chr5 (44-427)||(30174471-30174859)
chr5 (45-427)||(33881133-33881519)
chr5 (43-427)||(28655247-28655636)
chr5 (44-427)||(40467321-40467708)
chr5 (44-427)||(13318596-13318982)
chr5 (66-424)||(9544478-9544842)
chr5 (65-427)||(6880331-6880697)
chr5 (27-427)||(9323466-9323869)
chr5 (27-427)||(22894405-22894808)
chr5 (43-427)||(13436442-13436836)
chr5 (43-427)||(37665254-37665642)
chr5 (27-427)||(12138165-12138568)
chr5 (45-427)||(24729977-24730363)
chr5 (67-427)||(30158063-30158427)
chr5 (43-427)||(37746090-37746484)
chr5 (27-427)||(37352412-37352816)
chr5 (27-427)||(2517054-2517459)
chr5 (66-427)||(23631997-23632364)
chr5 (60-427)||(18494536-18494906)
chr5 (27-427)||(32590044-32590447)
chr5 (43-427)||(15752626-15753008)
chr5 (43-427)||(37760987-37761376)
chr5 (43-404)||(30035431-30035795)
chr5 (44-427)||(13180561-13180944)
chr5 (44-427)||(34622524-34622912)
chr5 (45-427)||(8659240-8659625)
chr5 (27-427)||(31820178-31820580)
chr5 (45-427)||(11329644-11330032)
chr5 (38-427)||(33522382-33522776)
chr5 (50-427)||(43084270-43084651)
chr5 (66-427)||(5643828-5644191)
chr5 (27-427)||(26486385-26486778)
chr5 (43-424)||(31437469-31437847)
chr5 (27-427)||(33298522-33298930)
chr5 (43-427)||(18122184-18122572)
chr5 (44-427)||(41680710-41681098)
chr5 (27-427)||(28953548-28953952)
chr5 (27-420)||(25206266-25206670)
chr5 (27-420)||(25270422-25270826)
chr5 (43-427)||(15652528-15652914)
chr5 (43-427)||(22992892-22993272)
chr5 (66-427)||(23897902-23898261)
chr5 (43-427)||(33783492-33783875)
chr5 (66-427)||(24975877-24976236)
chr5 (43-427)||(24608250-24608634)
chr5 (44-427)||(30940642-30941023)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (43-427)||(12034-12421)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (43-427)||(9510-9897)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (27-427)||(39856630-39857032)
chr4 (45-427)||(14104554-14104939)
chr4 (44-427)||(20332290-20332678)
chr4 (44-427)||(40099504-40099892)
chr4 (45-427)||(30759775-30760159)
chr4 (45-427)||(33667671-33668055)
chr4 (43-427)||(54839400-54839787)
chr4 (44-427)||(27157180-27157569)
chr4 (43-427)||(14753362-14753749)
chr4 (43-427)||(5700549-5700937)
chr4 (43-427)||(34182832-34183218)
chr4 (44-427)||(24586229-24586617)
chr4 (27-427)||(5011870-5012275)
chr4 (27-427)||(1906245-1906654)
chr4 (27-427)||(18794485-18794889)
chr4 (43-423)||(24118672-24119055)
chr4 (38-424)||(21975708-21976098)
chr4 (43-427)||(36338394-36338774)
chr4 (66-427)||(31120378-31120744)
chr4 (27-427)||(15276497-15276904)
chr4 (27-427)||(15380106-15380510)
chr4 (66-427)||(6575894-6576251)
chr4 (27-427)||(15233809-15234217)
chr4 (66-427)||(1673892-1674258)
chr4 (124-427)||(36324185-36324484)
chr4 (44-427)||(14671026-14671410)
chr4 (44-427)||(17019062-17019445)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (66-427)||(5164402-5164767)
chr7 (65-427)||(24586289-24586654)
chr7 (43-427)||(5154079-5154466)
chr7 (44-427)||(26518789-26519174)
chr7 (65-427)||(4138999-4139367)
chr7 (27-427)||(26268839-26269247)
chr7 (27-427)||(4205368-4205772)
chr7 (44-427)||(26678858-26679246)
chr7 (27-427)||(16047294-16047695)
chr7 (43-427)||(45737296-45737686)
chr7 (66-427)||(11418533-11418898)
chr7 (27-427)||(31084376-31084781)
chr7 (27-427)||(26313603-26314006)
chr7 (44-427)||(26663666-26664054)
chr7 (27-427)||(16745274-16745679)
chr7 (33-427)||(26441238-26441637)
chr7 (27-427)||(5141088-5141493)
chr7 (27-427)||(11446867-11447271)
chr7 (44-427)||(31558148-31558535)
chr7 (67-427)||(45393238-45393602)
chr7 (43-405)||(26509471-26509839)
chr7 (44-427)||(2160566-2160955)
chr7 (41-427)||(16443757-16444148)
chr7 (44-427)||(39206893-39207280)
chr7 (43-424)||(2779247-2779626)
chr7 (27-427)||(3451297-3451702)
chr7 (43-427)||(31129900-31130282)
chr7 (27-427)||(10847562-10847968)
chr7 (130-427)||(26595750-26596053)
chr7 (66-427)||(10910680-10911039)
chr7 (43-427)||(16512194-16512576)
chr7 (44-129)||(26531926-26532011)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (43-427)||(18796704-18797093)
chr8 (44-427)||(33248365-33248751)
chr8 (65-427)||(28355780-28356148)
chr8 (27-427)||(19680430-19680833)
chr8 (43-427)||(9360620-9361007)
chr8 (65-427)||(31483700-31484068)
chr8 (39-427)||(29835317-29835708)
chr8 (44-427)||(31360527-31360914)
chr8 (76-427)||(15773605-15773960)
chr8 (66-427)||(44567002-44567369)
chr8 (43-427)||(18715478-18715868)
chr8 (66-427)||(21342000-21342366)
chr8 (27-427)||(12086553-12086958)
chr8 (27-427)||(19202205-19202598)
chr8 (76-427)||(19910992-19911349)
chr8 (76-390)||(33264762-33265079)
chr8 (27-427)||(22074759-22075164)
chr8 (43-424)||(19655180-19655562)
chr8 (27-427)||(27602744-27603141)
chr8 (44-427)||(2131098-2131479)
chr8 (43-427)||(22138904-22139286)
chr8 (27-299)||(16260205-16260480)
chr8 (44-427)||(19694094-19694477)
chr8 (83-427)||(14569194-14569540)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (44-427)||(3647147-3647534)
chr1 (45-427)||(28591085-28591470)
chr1 (76-427)||(10968698-10969054)
chr1 (43-427)||(28155726-28156116)
chr1 (27-427)||(20334283-20334689)
chr1 (44-427)||(41787177-41787566)
chr1 (60-427)||(10951108-10951480)
chr1 (27-405)||(51644204-51644588)
chr1 (27-427)||(16201895-16202307)
chr1 (27-427)||(20466761-20467173)
chr1 (27-427)||(21891630-21892020)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (27-427)||(1639-2043)
scaffold0322 (27-427)||(12028-12443)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (43-427)||(4471-4862)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (43-427)||(8797-9184)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (44-427)||(18584-18973)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (43-427)||(9912-10299)
scaffold0143 (43-427)||(33295-33680)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (27-427)||(13931-14336)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (27-427)||(15551-15962)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (27-427)||(25097-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (44-427)||(6065-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (66-427)||(24774-25135)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (27-208)||(359-540)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (266-427)||(12-173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (27-191)||(26241-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (92-197)||(40744-40855)
scaffold0099 (320-427)||(40497-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284177
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctacttt 27284382  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284381 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 27284282  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27284281 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagt 27284182  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  27284181 ctgtg 27284177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 16755815 - 16756204
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16755815 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 16755914  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755915 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 16756014  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaac--actttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756015 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 16756114  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16756115 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16756204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555941
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttc 29555736  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555737 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaa 29555836  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  29555837 acctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccctccaggatagt 29555936  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  29555937 ctgtg 29555941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 28 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623522
Alignment:
Q  28 catcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 127  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  128 tttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctacttt 225  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  226 caaagctatatacaaaacatttt-ctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 27623528  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  27623527 tctgtg 27623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063864
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 27063675  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063676 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27063775  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27063776 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27063864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13518009
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 13518196  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518195 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13518096  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  13518095 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 13518009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355926
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27356130 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 27356031  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  27356030 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 27355931  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  27355930 ctgtg 27355926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 60 - 427
Target Start/End: Original strand, 28166506 - 28166878
Alignment:
Q  60 tttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctg 159  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28166506 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctg 28166605  T
Q  160 accaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatctt 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||    
T  28166606 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctatttt 28166705  T
Q  260 gataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 354  Q
    ||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166706 gataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 28166805  T
Q  355 tgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28166806 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928696
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22928903  T
Q  227 aaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||    
T  22928902 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagc 22928803  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928802 aaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 22928703  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  22928702 gtctgtg 22928696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 27491130 - 27491516
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27491130 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27491229  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491230 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaaca 27491329  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491330 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27491429  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  27491430 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 27491516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 67 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26110589 - 26110226
Alignment:
Q  67 gaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110589 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca 26110490  T
Q  167 ctcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat- 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26110489 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 26110390  T
Q  266 --aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 363  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110389 acaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 26110290  T
Q  364 gagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  26110289 gagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 26110226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Original strand, 4763791 - 4764146
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763791 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 4763890  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgct 271  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||    
T  4763891 atctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgct 4763989  T
Q  272 tgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763990 tgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4764089  T
Q  371 tgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4764090 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4764146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680523
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  244 -attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
     ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16680336 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggta 16680435  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  16680436 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 16680523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899514
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 8899720  T
Q  226 caaagctatatacaaaac-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899719 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 8899620  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  8899619 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 8899520  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  8899519 tctgtg 8899514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Original strand, 29507444 - 29507801
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507444 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 29507543  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct--atttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgc 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||    
T  29507544 atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgc 29507643  T
Q  271 ttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29507644 ttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagt 29507743  T
Q  370 atgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29507744 atgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 29507801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 67 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26772807 - 26772444
Alignment:
Q  67 gaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26772807 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 26772708  T
Q  167 ctcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat- 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26772707 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 26772609  T
Q  266 --aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
      |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26772608 acaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgag 26772509  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26772508 cgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26772444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 51 - 427
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579397
Alignment:
Q  51 aattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 150  Q
    |||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttcc 29579216  T
Q  251 ttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 346  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29579217 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaa 29579316  T
Q  347 atgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  29579317 atgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 29579397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458323
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 34458527  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34458526 ctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 34458428  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  34458427 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 34458328  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  34458327 ctgtg 34458323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539573
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct-actt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  225 tcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4539778 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 4539679  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4539678 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 4539579  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  4539578 tctgtg 4539573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551815
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 30552009  T
Q  238 c-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30552008 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 30551909  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30551908 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30551815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370246
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 33370452  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  33370451 caaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcg 33370352  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33370351 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccaggatag 33370252  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  33370251 tctgtg 33370246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200569
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27200363  T
Q  226 caaagctatatacaaaa-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacact-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200364 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27200463  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  27200464 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-ta 27200562  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  27200563 gtctgtg 27200569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248664
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27248870  T
Q  226 caaagctatatacaaaa-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacact-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248869 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27248770  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  27248769 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-ta 27248671  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  27248670 gtctgtg 27248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213838
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28213633 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 28213732  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  28213733 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 28213832  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  28213833 tctgtg 28213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13293125 - 13292766
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13293125 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 13293026  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata-- 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  13293025 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 13292926  T
Q  264 -ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292925 gataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 13292831  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     ||| || || || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13292830 tgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16938205 - 16937840
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16938205 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccac 16938106  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||    
T  16938105 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataa 16938007  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938006 tggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 16937907  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  16937906 agcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 16937840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531671
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 4531466  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531467 aaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 4531566  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctat-ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4531567 acccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 4531665  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  4531666 tctgtg 4531671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779264
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaa 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779076 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4779175  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4779176 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4779264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 26791811 - 26792199
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26791811 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26791910  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791911 aatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26792009  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
     ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792010 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26792109  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  26792110 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 26792199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139218
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 14139398  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139397 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggta 14139303  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  14139302 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 14139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014106
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 27013927  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013928 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 27014021  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  27014022 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 27014106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927135
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatt 26926961  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
     |||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926962 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 26927061  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||               ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  26927062 acattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 26927135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 27031019 - 27031403
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27031019 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27031118  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27031119 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27031218  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||| |||||| || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031219 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27031314  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27031315 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27031403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 27208899 - 27209283
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27208899 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27208998  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27208999 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27209098  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat-------aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||       |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27209099 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27209191  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209192 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27209283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27240329 - 27239945
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27240329 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27240230  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27240229 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27240130  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat-------aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||       |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27240129 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27240037  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240036 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27239945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666473
Alignment:
Q  129 ttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaa 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  229 agctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  325 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 26666476  T
Q  425 gtg 427  Q
    |||    
T  26666475 gtg 26666473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 24869705 - 24870087
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24869705 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24869804  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  24869805 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 24869904  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  24869905 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 24869997  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  24869998 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 24870087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 27025163 - 27025524
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27025163 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 27025262  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| | || ||    
T  27025263 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaat 27025362  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27025363 aatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgca 27025455  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27025456 tgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27025524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24299957 - 24299575
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24299957 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24299858  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||    
T  24299857 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaa 24299758  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    | ||| | |||| | || |||||    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24299757 cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggt 24299663  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24299662 acattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24299575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15406709 - 15406348
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15406709 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15406610  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||    
T  15406609 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 15406510  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    |||||| ||||||||||  | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15406509 aatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 15406417  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15406416 tgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15406348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15418496 - 15418135
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15418496 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15418397  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||    
T  15418396 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 15418297  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    |||||| ||||||||||  | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15418296 aatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 15418204  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15418203 tgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15418135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 415
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174930
Alignment:
Q  88 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  188 ctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttg-aaacaaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||| |||||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 20174788  T
Q  281 cactttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatga 373  Q
    || | | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |         
T  20174789 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 20174888  T
Q  374 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 415  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174889 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161061
Alignment:
Q  88 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  188 ctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttg-aaacaaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||| |||||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaa 22161203  T
Q  281 cactttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatga 373  Q
    || | | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |         
T  22161202 cattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcat 22161103  T
Q  374 tgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 415  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161102 caatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 12661558 - 12661922
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12661558 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 12661657  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata-- 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  12661658 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 12661757  T
Q  264 -ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661758 gataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 12661857  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12661858 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12661922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Original strand, 39896087 - 39896452
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39896087 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccac 39896186  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39896187 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 39896286  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 361  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896287 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 39896386  T
Q  362 gcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39896387 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 37383673 - 37384061
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37383673 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 37383772  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383773 gagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37383872  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383873 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37383972  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37383973 acatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37384061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 27809697 - 27810087
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27809697 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27809796  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt--cttctactttcaaagctatataca 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27809797 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  240 aaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27810087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22922369 - 22922001
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22922369 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 22922270  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22922269 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 22922170  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922169 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 22922070  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22922069 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254510
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254697 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 254599  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  254598 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 254510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945723
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945911 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37945812  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37945811 acattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37945723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868066
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaaca 34867879  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867880 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34867979  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34867980 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34868066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161230
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34161039  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaaca---ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161040 cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34161139  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34161140 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34161230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343845
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 9344033  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||| || || |||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344032 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9343933  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9343932 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9343845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Original strand, 27122554 - 27122907
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27122554 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatac 27122653  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgctt 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||    
T  27122654 atcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgctt 27122752  T
Q  273 gaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122753 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27122852  T
Q  373 atgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27122853 ttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27122907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19410710 - 19410342
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19410710 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 19410611  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19410610 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 19410511  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19410510 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgca 19410411  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19410410 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 19410342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 12592806 - 12593198
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12592806 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12592905  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592906 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 12593005  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12593006 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaaca 12593105  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12593106 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12593198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045680
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 39045868  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||| || || |||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045867 attttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39045768  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39045767 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167862
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 16167673  T
Q  243 c-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
      ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167674 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16167773  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16167774 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16167862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930402
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  243 -cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
     |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930591 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 13930492  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  13930491 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtg 13930402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 3788490 - 3788877
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||    
T  3788490 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcgg 3788589  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788590 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 3788688  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788689 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 3788788  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3788789 acattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3788877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697031
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgta 21697228  T
Q  238 c--aaaacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 329  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697227 caaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 21697129  T
Q  330 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21697128 caacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtg 21697031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679749
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37679957  T
Q  226 caaagctatatacaaaa-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37679956 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37679857  T
Q  320 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37679856 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggat 37679757  T
Q  420 agtctgtg 427  Q
    ||||||||    
T  37679756 agtctgtg 37679749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695014
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37695222  T
Q  226 caaagctatatacaaaa-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37695221 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37695122  T
Q  320 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37695121 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggat 37695022  T
Q  420 agtctgtg 427  Q
    ||||||||    
T  37695021 agtctgtg 37695014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710459
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 12710665  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710664 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 12710565  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||    
T  12710564 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatag 12710465  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  12710464 tctgtg 12710459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882670
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31882482  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31882483 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggta 31882582  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31882583 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31882670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629043
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttttattttc 11629248  T
Q  227 aaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11629247 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaaca 11629148  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  11629147 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 11629049  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  11629048 tctgtg 11629043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671028
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 21671237  T
Q  226 caaagctatatacaaaa-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaa 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21671236 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaa 21671137  T
Q  319 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21671136 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 21671037  T
Q  419 tagtctgtg 427  Q
    |||||||||    
T  21671036 tagtctgtg 21671028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 32055798 - 32056185
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32055798 tgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32055897  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055898 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 32055996  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055997 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 32056096  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  32056097 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 32056185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931763
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt------cttctactttcaaagctatat 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  237 acaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37931569 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 37931668  T
Q  333 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  37931669 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 37931763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823195
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16823389  T
Q  238 c-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16823388 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16823289  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16823288 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16823195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898285
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16898091  T
Q  238 c-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16898092 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16898191  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16898192 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16898285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297533
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34297351  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297352 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 34297445  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  34297446 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 34297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239892
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  226 caaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 40239886  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  40239887 tctgtg 40239892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 95 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868644
Alignment:
Q  95 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgct 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  195 tttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaa 290  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31868879 tttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaa 31868781  T
Q  291 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31868780 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaata 31868681  T
Q  391 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31868680 tatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31868644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782616
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 27782410  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782411 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 27782510  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  27782511 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 27782610  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  27782611 tctgtg 27782616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396717
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 27396502  T
Q  227 aaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctatt 311  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||           ||||||||  ||    
T  27396503 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtccttt 27396602  T
Q  312 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 411  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396603 ttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 27396701  T
Q  412 cccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||    
T  27396702 cccaggatagtctgtg 27396717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450276
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 19450490  T
Q  227 aaagctatatac-----aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg------aaaactttttgtctattt 312  Q
    |||| ||| |||     |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||      |||| ||||||||| |||    
T  19450489 aaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttt 19450390  T
Q  313 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 412  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19450389 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttcc 19450291  T
Q  413 ccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||    
T  19450290 ccaggatagtctgtg 19450276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888658
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 28888474  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  28888475 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28888568  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28888569 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28888658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34269167 - 34268784
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34269167 tgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtgg 34269068  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  34269067 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 34268968  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||||||||||||||  || |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  34268967 acattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34268875  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  34268874 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtg 34268784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23122818 - 23122436
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  23122818 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgg 23122719  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23122718 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 23122619  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||| |||||| || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122618 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 23122525  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23122524 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23122436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428315
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||||||| |||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | |||    
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaa 27428493  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||| | ||||||||||  |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  27428492 acattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27428401  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27428400 gtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtc 27428315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 20843931 - 20844296
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  20843931 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacac 20844030  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--acaaaacattttctttcta-tcttg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||||| | ||     
T  20844031 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctattttta 20844130  T
Q  261 ataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatg 356  Q
    |||||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20844131 ataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatg 20844225  T
Q  357 catgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20844226 catgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20844296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 291 - 427
Target Start/End: Original strand, 23117044 - 23117180
Alignment:
Q  291 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaata 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23117044 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 23117143  T
Q  391 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23117144 tgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23117180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31887738 - 31887682
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccacc 100  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31887738 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3047
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctact 223  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctact 3254  T
Q  224 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3253 ttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagc 3154  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3153 aaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 3054  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  3053 gtctgtg 3047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 427
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18194
Alignment:
Q  191 tgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacact 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  285 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatt 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18151  T
Q  385 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18152 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296979
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  225 tcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatag 32296973  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  32296974 tctgtg 32296979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4790932 - 4790544
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4790932 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 4790833  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790832 attcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 4790733  T
Q  243 -cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
     |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790732 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4790633  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4790632 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4790544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728328
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728140 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5728239  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5728240 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029803
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029615 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 47029714  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47029715 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 47029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717418
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717230 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5717329  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5717330 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5717418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764040
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764228 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5764129  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5764128 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5764040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31958734 - 31958366
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31958734 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31958635  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31958634 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31958535  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31958534 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 31958435  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31958434 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31958366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658879
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29659083 aaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 29658984  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  29658983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 29658884  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  29658883 ctgtg 29658879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5603592 - 5603224
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5603592 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 5603493  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5603492 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 5603393  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5603392 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgca 5603293  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5603292 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5603224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Original strand, 24334156 - 24334524
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24334156 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24334255  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24334256 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 24334355  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24334356 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 24334455  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24334456 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24334524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 10402110 - 10402497
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10402110 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 10402209  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10402210 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaa 10402308  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402309 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10402408  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10402409 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10402497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22381879 - 22381492
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381879 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22381780  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381779 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 22381680  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22381679 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgt 22381580  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22381579 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22381492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422532
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccgg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16422326  T
Q  227 aaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16422327 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagc 16422425  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422426 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 16422525  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  16422526 gtctgtg 16422532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 76 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5590627 - 5590275
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590627 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 5590528  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgct 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  5590527 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 5590428  T
Q  272 tgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5590427 tgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtat 5590328  T
Q  372 gatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5590327 gttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970777
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatt 17970965  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
     |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970964 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 17970865  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17970864 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17970777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618400
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16618609  T
Q  227 aaagctatatac---aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaa 317  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||   |||| |||||||| |||||| ||    
T  16618608 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aa 16618510  T
Q  318 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16618509 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttccccagg 16618410  T
Q  418 atagtctgtg 427  Q
    ||||||||||    
T  16618409 atagtctgtg 16618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536654
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 6536843  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536842 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 6536743  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6536742 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 6536654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649420
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 10649231  T
Q  243 c-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
      ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649232 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10649331  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10649332 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10649420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 48471872 - 48472280
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471872 tcatcaaaagttcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 48471971  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471972 ctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 48472071  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472072 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaa 48472171  T
Q  319 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48472172 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 48472271  T
Q  419 tagtctgtg 427  Q
    |||||||||    
T  48472272 tagtctgtg 48472280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864759
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22864947  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864946 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22864847  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  22864846 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22864759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879818
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactat-gctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22880006  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880005 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22879906  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  22879905 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22879818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027638
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttc 28027434  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 323  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027435 aaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28027534  T
Q  324 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28027535 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 28027634  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  28027635 tgtg 28027638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340587
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatat 236  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 4340782  T
Q  237 acaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 332  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340781 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 4340682  T
Q  333 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4340681 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 51 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286266
Alignment:
Q  51 aattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 150  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18286447  T
Q  251 ttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 345  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18286446 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18286347  T
Q  346 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18286346 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18286266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 51 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301567
Alignment:
Q  51 aattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgc 150  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18301748  T
Q  251 ttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 345  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18301747 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18301648  T
Q  346 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18301647 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072384
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 20072192  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072193 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 20072292  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20072293 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20072384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423267
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 4423078  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423079 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4423178  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4423179 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4423267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249087
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18248883 aaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 18248982  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  18248983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 18249082  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  18249083 ctgtg 18249087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109862
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactt 224  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 28110072  T
Q  225 tcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaac----actttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110071 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 28109972  T
Q  318 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  28109971 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaag 28109872  T
Q  418 atagtctgtg 427  Q
    ||| ||||||    
T  28109871 ataatctgtg 28109862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11104628 - 11104272
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11104628 tgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatac 11104529  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||| ||||||||   |||||    
T  11104528 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgc 11104429  T
Q  271 ttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104428 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 11104329  T
Q  371 tgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11104328 tgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11104272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079576
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatatac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  239 aaaacattttctttcta-tcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 7079482  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  7079483 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 7079576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 8217593 - 8217983
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8217593 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtgg 8217692  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217693 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaa 8217791  T
Q  242 ac-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217792 aatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8217891  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8217892 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020061
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatc 5019873  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019874 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5019973  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  5019974 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 5020061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Original strand, 28345154 - 28345519
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28345154 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 28345253  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  28345254 cactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataa 28345352  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacactttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345353 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 28345452  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  28345453 agcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28345519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473336
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5473147  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||| ||| || ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473148 acattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5473246  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5473247 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5473336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978861
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 17979056  T
Q  238 c-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 332  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979055 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaa 17978956  T
Q  333 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  17978955 cagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788371
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 51788182  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
     |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788183 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 51788282  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  51788283 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 51788371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142665
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctacttt 29142873  T
Q  226 caaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaag 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  29142872 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaa 29142773  T
Q  320 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  29142772 caaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggat 29142673  T
Q  420 agtctgtg 427  Q
    ||||||||    
T  29142672 agtctgtg 29142665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31030504 - 31030156
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030504 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 31030405  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata---ataatgctt 272  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  31030404 gtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctc 31030305  T
Q  273 gaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  31030304 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtg 31030211  T
Q  373 atgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31030210 ttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630133
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 4629928  T
Q  226 caaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629929 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4630028  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  4630029 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 4630127  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  4630128 tctgtg 4630133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681049
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  226 caaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 21681043  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  21681044 tctgtg 21681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231542
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 18231354  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18231355 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggta 18231454  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18231455 cagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18231542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 18057222 - 18057612
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18057222 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18057321  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  18057322 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 18057421  T
Q  243 -cattttctttctatctt-gataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
     ||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18057422 acattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 18057521  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057522 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 18057612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 45 - 424
Target Start/End: Original strand, 18336591 - 18336968
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    |||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18336591 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18336690  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336691 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18336790  T
Q  244 attttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    |||||||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336791 attttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18336885  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18336886 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 18336968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570757
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 20570963  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570962 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 20570863  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  20570862 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 20570763  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  20570762 tctgtg 20570757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 19700431 - 19700847
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700431 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 19700530  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  19700531 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 19700630  T
Q  227 aaagctatatac-----------aaaacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta 309  Q
    |||||||| |||           |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||    
T  19700631 aaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta 19700730  T
Q  310 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  19700731 ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattct 19700829  T
Q  410 tccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19700830 tccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 4727617 - 4727976
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4727617 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 4727716  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-tcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  4727717 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataa 4727816  T
Q  265 t----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4727817 tgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatg 4727909  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4727910 agcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 4727976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 50 - 427
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445494
Alignment:
Q  50 gaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 149  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttc 32445321  T
Q  250 tttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 346  Q
    ||||| | ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445322 tttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 32445414  T
Q  347 atgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  32445415 atg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 32445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 6207884 - 6208245
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6207884 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6207983  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||    
T  6207984 cactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaat 6208083  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6208084 aatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgca 6208176  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6208177 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 6208245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735011
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaa 15735195  T
Q  243 cattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    ||||| | ||||| | || |||||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735194 catttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15735100  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15735099 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15735011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 35886748 - 35887109
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35886748 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 35886847  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||    
T  35886848 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 35886947  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  35886948 aatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacataca 35887040  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  35887041 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 35887109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283369
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  243 cattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctga 328  Q
    ||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  8283567 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctga 8283468  T
Q  329 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8283467 gcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8283369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 4689613 - 4689994
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  4689613 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 4689712  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||    
T  4689713 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaa 4689811  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  4689812 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 4689904  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  4689905 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtg 4689994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 5658095 - 5658480
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5658095 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5658194  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |    
T  5658195 agtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaa 5658294  T
Q  240 aaacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||    |||||||||||||||||  || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| |||||||    
T  5658295 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaaca 5658388  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  5658389 gggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtg 5658480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886652
Alignment:
Q  182 ttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctatcttga-taat----aatgcttgaa 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| |||||| || | ||||    |||||| |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  276 acaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatg 375  Q
     ||||||  ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttg 15886704  T
Q  376 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  15886703 gtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtg 15886652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15887006 - 15886894
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatctgt 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  15887006 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgt 15886907  T
Q  141 ggagtcacgcctt 153  Q
    |||||||||||||    
T  15886906 ggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 129  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561018
Alignment:
Q  110 aattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcctgtgc 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcctgtgc 27561018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 66 - 423
Target Start/End: Original strand, 11555382 - 11555742
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11555382 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11555481  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11555482 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 11555581  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555582 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 11555681  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  11555682 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 11555742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 39 - 427
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795932
Alignment:
Q  39 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatct 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  139 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatat 236  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatat 3795738  T
Q  237 acaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795739 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 3795838  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3795839 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3795932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369300
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18369487  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369486 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18369387  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18369386 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174859
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174671 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30174770  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30174771 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881519
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 33881332  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881333 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33881432  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  33881433 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 33881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 28655247 - 28655636
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28655247 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 28655346  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655347 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28655445  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||||||||| || |||||   |||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655446 cattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28655545  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28655546 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28655636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467321
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 40467509  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||| || || |||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467508 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40467409  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40467408 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318596
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 13318783  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318782 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13318683  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  13318682 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 13318596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 66 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9544842 - 9544478
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9544842 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 9544743  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9544742 actcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 9544644  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
       |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544643 gacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 9544544  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  9544543 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 9544478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Original strand, 6880331 - 6880697
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6880331 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6880430  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6880431 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataa 6880530  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880531 tgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 6880630  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  6880631 agcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 6880697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323869
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 9323664  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9323665 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 9323764  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  9323765 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 9323864  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  9323865 ctgtg 9323869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894808
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22894604  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22894605 aaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaa 22894703  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22894704 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccccaggatagt 22894803  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  22894804 ctgtg 22894808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13436836 - 13436442
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13436836 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 13436737  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436736 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaa 13436637  T
Q  241 aaca-ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 332  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436636 aacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13436537  T
Q  333 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13436536 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13436442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665254
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 37665443  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37665442 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacaggg 37665343  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  37665342 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 37665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138568
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 12138363  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12138364 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 12138463  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  12138464 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 12138563  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  12138564 ctgtg 12138568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730363
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaata 24730175  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730176 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 24730275  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  24730276 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 24730363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 67 - 427
Target Start/End: Original strand, 30158063 - 30158427
Alignment:
Q  67 gaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca 166  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30158063 gaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 30158162  T
Q  167 ctcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat- 265  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  30158163 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatg 30158262  T
Q  266 --aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
      |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158263 acaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgag 30158362  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30158363 cgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30158427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746090
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746284 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37746185  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg---atg---atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37746184 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37746090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352412
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 37352618  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttcta-tcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352617 caaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 37352518  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||     
T  37352517 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataa 37352418  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  37352417 tctgtg 37352412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517459
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattcta-ttttcttctactttc 2517252  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaaca---ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517253 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 2517352  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  2517353 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctccaggata 2517452  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  2517453 gtctgtg 2517459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 23631997 - 23632364
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23631997 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 23632096  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23632097 actcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 23632196  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 359  Q
       ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632197 gacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 23632296  T
Q  360 gagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||    
T  23632297 gagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtg 23632364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 60 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18494906 - 18494536
Alignment:
Q  60 tttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctg 159  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18494906 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccg 18494807  T
Q  160 accaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatct 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||| |    
T  18494806 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattt 18494708  T
Q  259 tgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 355  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494707 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 18494608  T
Q  356 gcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18494607 gcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18494536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590044
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttc 32590249  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590248 aaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 32590149  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  32590148 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 32590049  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  32590048 ctgtg 32590044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15753008 - 15752626
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15753008 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 15752909  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15752908 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 15752810  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    ||||||||||||    |||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752809 cattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15752714  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  15752713 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 15752626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 37760987 - 37761376
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  37760987 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcgg 37761086  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761087 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37761185  T
Q  242 acattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37761186 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37761285  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  37761286 gcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtg 37761376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 404
Target Start/End: Original strand, 30035431 - 30035795
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30035431 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 30035530  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035531 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 30035629  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035630 cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30035729  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30035730 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcag 30035795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180561
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  242 acattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180744 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13180650  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  13180649 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 13180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622912
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622724 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34622823  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  34622824 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 34622912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8659625 - 8659240
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8659625 cttgtgaattcaaagtttc-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggag 8659527  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659526 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 8659428  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659427 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 8659328  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8659327 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8659240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820178
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttc 31820382  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31820381 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 31820282  T
Q  324 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  31820281 cctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtc 31820182  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  31820181 tgtg 31820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11330032
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||     
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaat 11329842  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
      |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329843 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 11329942  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11329943 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11330032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 38 - 427
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522776
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatat 236  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatat 33522581  T
Q  237 ac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 332  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522582 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 33522681  T
Q  333 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33522682 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33522776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 50 - 427
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084651
Alignment:
Q  50 gaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacg 149  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attt 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  248 tctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 344  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  345 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 43084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 5643828 - 5644191
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5643828 ggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 5643927  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5643928 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 5644026  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 361  Q
       ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5644027 gacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatga 5644125  T
Q  362 gcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  5644126 gcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtg 5644191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486778
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||           |||    
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctat-----------ttt 26486573  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486574 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26486673  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26486674 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26486773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437847
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31437668  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437669 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31437762  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  31437763 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 31437847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298930
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactt 33298721  T
Q  225 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaa 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33298722 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaa 33298821  T
Q  319 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 418  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33298822 acaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 33298921  T
Q  419 tagtctgtg 427  Q
    |||||||||    
T  33298922 tagtctgtg 33298930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122184
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
      |||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122372 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18122273  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  18122272 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 18122184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 41680710 - 41681098
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41680710 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 41680809  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41680810 gtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41680909  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    | ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680910 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 41681009  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41681010 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41681098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953548
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggata 28953555  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  28953554 gtctgtg 28953548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 420
Target Start/End: Original strand, 25206266 - 25206670
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25206266 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25206365  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  25206366 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25206465  T
Q  226 caaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 314  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25206466 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25206565  T
Q  315 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 414  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  25206566 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccct 25206664  T
Q  415 aggata 420  Q
    ||||||    
T  25206665 aggata 25206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 420
Target Start/End: Original strand, 25270422 - 25270826
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25270422 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25270521  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  25270522 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25270621  T
Q  226 caaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 314  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25270622 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25270721  T
Q  315 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 414  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  25270722 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccct 25270820  T
Q  415 aggata 420  Q
    ||||||    
T  25270821 aggata 25270826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15652914 - 15652528
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15652914 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15652815  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15652814 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 15652715  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| | | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  15652714 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggta 15652615  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15652614 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15652528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22993272 - 22992892
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22993272 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22993173  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22993172 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 22993073  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| || |||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993072 cattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22992979  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22992978 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22992892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 23897902 - 23898261
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  23897902 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccacc 23898001  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctatcttga 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| || |    
T  23898002 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaa 23898101  T
Q  262 taat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 357  Q
    ||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23898102 taatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgc 23898191  T
Q  358 atgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  23898192 atgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtg 23898261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 33783492 - 33783875
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33783492 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33783591  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  33783592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 33783691  T
Q  242 acattttctttcta--tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    |||||||| |||||  | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||||||    
T  33783692 acattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacag 33783784  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33783785 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33783875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 24975877 - 24976236
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24975877 ggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 24975976  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgata 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||    
T  24975977 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaata 24976076  T
Q  264 at----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 359  Q
    ||    |||||| ||||||||||  |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24976077 atgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcat 24976168  T
Q  360 gagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  24976169 gagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtg 24976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 24608250 - 24608634
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24608250 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 24608349  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  24608350 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 24608449  T
Q  241 aacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  24608450 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 24608542  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24608543 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24608634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 30940642 - 30941023
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  30940642 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 30940741  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30940742 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 30940841  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  30940842 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30940933  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30940934 gtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12421
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaa 12232  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12233 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 12332  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9510
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9897 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9798  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797 agtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9698  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9598  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9597 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857032
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttc 39856828  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856829 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 39856928  T
Q  324 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  39856929 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 39857028  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  39857029 tgtg 39857032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104939
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaaca 14104753  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 341  Q
    |||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104754 ttttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 14104853  T
Q  342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14104854 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14104939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332290
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    | ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332478 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 20332379  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20332378 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20332290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099504
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099692 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40099593  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40099592 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40099504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760159
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatca 30759973  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 341  Q
    ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30759974 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 30760073  T
Q  342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30760074 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30760159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667671
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatca 33667857  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 341  Q
    ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33667856 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 33667757  T
Q  342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33667756 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33667671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 54839400 - 54839787
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54839400 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 54839499  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54839500 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 54839598  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54839599 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 54839698  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  54839699 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 54839787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27157569 - 27157180
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27157569 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 27157470  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27157370  T
Q  242 ac-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157369 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27157270  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27157269 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27157180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753362
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 14753551  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14753550 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacaggg 14753451  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14753450 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14753362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700937
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 5700747  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5700748 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 5700847  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5700848 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5700937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182832
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 34183019  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183018 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34182920  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  34182919 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 34182832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24586617 - 24586229
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24586617 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 24586518  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586517 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 24586418  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586417 acattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggt 24586318  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586317 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012275
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5012070 caaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagca 5012169  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5012170 aacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 5012269  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  5012270 tctgtg 5012275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906654
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttc 1906444  T
Q  227 aaagctatataca----aaacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 316  Q
    ||||| || ||||    ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  1906445 aaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-a 1906543  T
Q  317 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1906544 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccag 1906643  T
Q  417 gatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||    
T  1906644 gatagtctgtg 1906654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794485
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||    || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 18794691  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacact-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794690 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 18794591  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  18794590 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 18794491  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  18794490 tctgtg 18794485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 43 - 423
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119055
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaa 24118871  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24118872 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggt 24118971  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  24118972 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 24119055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 38 - 424
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976098
Alignment:
Q  38 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 137  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  138 tgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 21975907  T
Q  238 c-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 333  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21975908 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 21976007  T
Q  334 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21976008 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338394
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 36338575  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338574 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 36338481  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  36338480 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 36338394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31120744 - 31120378
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31120744 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccacc 31120645  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31120644 actcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataa 31120545  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31120544 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatg 31120445  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31120444 agcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276497
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 15276705  T
Q  227 aaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaa 318  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |||    
T  15276704 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaa 15276606  T
Q  319 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 418  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15276605 gtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccagga 15276506  T
Q  419 tagtctgtg 427  Q
    |||||||||    
T  15276505 tagtctgtg 15276497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380106
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15380311  T
Q  227 aaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15380310 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagca 15380212  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380211 agcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 15380112  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  15380111 tctgtg 15380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 6575894 - 6576251
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6575894 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 6575993  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata-- 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  6575994 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 6576093  T
Q  264 -ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6576094 gataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgag 6576186  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6576187 cgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6576251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234217
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||| | |||   |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15234008  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaa 317  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||  |||||| |||||||       ||||||||||||||| ||    
T  15234009 aaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aa 15234107  T
Q  318 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15234108 agcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccagg 15234207  T
Q  418 atagtctgtg 427  Q
    ||||||||||    
T  15234208 atagtctgtg 15234217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 1673892 - 1674258
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1673892 ggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccacc 1673991  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgata 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  1673992 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgata 1674091  T
Q  264 at----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 357  Q
    ||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1674092 atgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgc 1674190  T
Q  358 atgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1674191 atgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtg 1674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 124 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324185
Alignment:
Q  124 aagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  224 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||      |||||||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagc 36324291  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||    
T  36324290 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggata 36324192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 14671026 - 14671410
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14671026 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14671125  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-a 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| |    
T  14671126 agttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaga 14671225  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  14671226 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 14671319  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  14671320 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 14671410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 17019062 - 17019445
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17019062 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 17019161  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||    
T  17019162 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaa 17019261  T
Q  241 aacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    ||||||||| |||||| || |||||    |||||| ||||||||||  |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  17019262 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17019355  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17019356 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17019445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 5164402 - 5164767
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5164402 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccacc 5164501  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaag-ctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5164502 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataa 5164601  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 361  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5164602 taacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatga 5164701  T
Q  362 gcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5164702 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24586654 - 24586289
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586654 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24586555  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24586554 cactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataa 24586455  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 361  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586454 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 24586355  T
Q  362 gcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586354 gtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 5154079 - 5154466
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5154079 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5154178  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  5154179 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 5154278  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154279 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5154378  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5154379 catccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5154466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 26518789 - 26519174
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26518789 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26518888  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26518889 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatc 26518987  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518988 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 26519087  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26519088 attcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26519174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4139367 - 4138999
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4139367 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 4139268  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaact-ctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4139267 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 4139168  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139167 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 4139068  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4139067 tgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4138999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268839
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 26269048  T
Q  227 aaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269047 aaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 26268948  T
Q  319 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  26268947 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 26268848  T
Q  419 tagtctgtg 427  Q
    |||||||||    
T  26268847 tagtctgtg 26268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205772
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 4205566  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4205567 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 4205666  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4205667 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataa 4205766  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  4205767 tctgtg 4205772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678858
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679046 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26678947  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26678946 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26678858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047695
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtc 16047493  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 323  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16047494 aaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaag 16047591  T
Q  324 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16047592 cctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccgggatagtc 16047691  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  16047692 tgtg 16047695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737686
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 45737494  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737495 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 45737594  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  45737595 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 45737686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11418898 - 11418533
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11418898 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11418799  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11418798 actcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 11418699  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 361  Q
       |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11418698 gacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacga 11418599  T
Q  362 gcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  11418598 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtg 11418533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084376
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctacttt 31084582  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31084581 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagca 31084482  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  31084481 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 31084382  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  31084381 tctgtg 31084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313603
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 26313808  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313807 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26313708  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26313707 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26313608  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  26313607 ctgtg 26313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663666
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663854 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26663755  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  26663754 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 26663666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745274
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16745481  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca--ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745480 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 16745381  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||    
T  16745380 aaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcaggata 16745281  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  16745280 gtctgtg 16745274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 33 - 427
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441637
Alignment:
Q  33 gaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  133 gaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaag 230  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  231 ctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  328 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26441637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141088
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 5141295  T
Q  226 caaagctatatac-aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagc 320  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5141294 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagc 5141195  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  5141194 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 5141095  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  5141094 gtctgtg 5141088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447271
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 11447065  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447066 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 11447165  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||    
T  11447166 aacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatag 11447265  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  11447266 tctgtg 11447271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558148
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 31558337  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558336 cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31558237  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  31558236 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 31558148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 67 - 427
Target Start/End: Original strand, 45393238 - 45393602
Alignment:
Q  67 gaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacca 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45393238 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 45393337  T
Q  167 ctcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat- 265  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  45393338 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatg 45393437  T
Q  266 --aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 362  Q
      ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393438 acaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 45393537  T
Q  363 cgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  45393538 cgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 45393602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 43 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26509839 - 26509471
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26509839 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 26509740  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509739 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaa 26509640  T
Q  241 aacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509639 aacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26509540  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509539 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 2160566 - 2160955
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2160566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2160665  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||    
T  2160666 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 2160765  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2160766 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacaggg 2160865  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160866 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 2160955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16444148 - 16443757
Alignment:
Q  41 tgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgt 140  Q
    |||||||| ||||||| | ||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16444148 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 16444049  T
Q  141 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  16444048 ggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 16443949  T
Q  239 aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16443948 aaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 16443850  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443849 gggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 16443757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206893
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 39207082  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
     |||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207081 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39206982  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39206981 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39206893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779626
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 2779446  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779447 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 2779541  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  2779542 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 2779626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451702
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 3451495  T
Q  227 aaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca---ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451496 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 3451595  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3451596 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 3451695  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    || ||||    
T  3451696 gtatgtg 3451702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130282
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31130099  T
Q  243 cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130100 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31130194  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  31130195 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 31130282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847968
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttc 10847761  T
Q  227 aaagctatatac---aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaa 317  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||    
T  10847762 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aa 10847860  T
Q  318 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 417  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847861 agtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttccccagg 10847958  T
Q  418 atagtctgtg 427  Q
    ||||||||||    
T  10847959 atagtctgtg 10847968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 130 - 427
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596053
Alignment:
Q  130 tgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttca 227  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  228 aagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  324 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 26596049  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  26596050 tgtg 26596053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10911039 - 10910680
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10911039 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 10910940  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgata 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||    
T  10910939 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaata 10910840  T
Q  264 at----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 359  Q
    ||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  10910839 atgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcat 10910748  T
Q  360 gagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10910747 gagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16512576 - 16512194
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16512576 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 16512477  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16512476 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 16512377  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  16512376 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 16512285  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16512284 gtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 129  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 18796704 - 18797093
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  18796704 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtg 18796803  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796804 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 18796903  T
Q  242 a-cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    | |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796904 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18797003  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18797004 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18797093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 33248365 - 33248751
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33248365 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33248464  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248465 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 33248564  T
Q  244 attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248565 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33248664  T
Q  341 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33248665 attcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33248751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28356148 - 28355780
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28356148 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 28356049  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa---ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28356048 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 28355949  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355948 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 28355849  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28355848 tgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28355780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680833
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 19680628  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19680629 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19680728  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  19680729 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 19680828  T
Q  423 ctgtg 427  Q
    |||||    
T  19680829 ctgtg 19680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9361007
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 9360818  T
Q  242 acattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360819 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9360918  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9360919 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9361007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 65 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31484068 - 31483700
Alignment:
Q  65 gggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31484068 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31483969  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattt--ttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31483968 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31483869  T
Q  262 taat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31483868 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgca 31483769  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31483768 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31483700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 39 - 427
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835708
Alignment:
Q  39 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatct 138  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  139 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttctactttcaaagctatata 29835515  T
Q  238 caaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835516 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 29835615  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  29835616 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtg 29835708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360914
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 31360725  T
Q  243 c-attttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
      ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360726 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31360825  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31360826 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Original strand, 15773605 - 15773960
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773605 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 15773704  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgctt 272  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||    
T  15773705 gtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgctt 15773804  T
Q  273 gaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 371  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773805 gaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 15773904  T
Q  372 gatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15773905 gttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15773960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Original strand, 44567002 - 44567369
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44567002 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 44567101  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44567102 actctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 44567200  T
Q  266 ---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
       |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567201 gacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 44567300  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  44567301 taagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 44567369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715868
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18715676  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715677 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18715776  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18715777 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18715868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21342366 - 21342000
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342366 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 21342267  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21342266 cactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 21342167  T
Q  265 t---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 360  Q
    |   |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342166 tgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 21342067  T
Q  361 agcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  21342066 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtg 21342000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086553
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12086758 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 12086659  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  12086658 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 12086559  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  12086558 tctgtg 12086553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202205
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaat-ttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||           |||    
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctat-----------ttt 19202410  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19202409 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19202310  T
Q  323 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  19202309 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 19202210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19911349 - 19910992
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911349 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 19911250  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctatcttgataat---aatgc 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  19911249 atcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgc 19911150  T
Q  271 ttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19911149 ttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgt 19911050  T
Q  370 atgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  19911049 atgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtg 19910992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 76 - 390
Target Start/End: Original strand, 33264762 - 33265079
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33264762 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatac 33264861  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgctt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  33264862 atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 33264960  T
Q  273 gaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 371  Q
    ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264961 gaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 33265060  T
Q  372 gatgatgtctatttcaata 390  Q
    |   |||||||||||||||    
T  33265061 gtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074759
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22074965  T
Q  227 aaagctatatac---aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||   ||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22074964 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagc 22074866  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22074865 aagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggata 22074766  T
Q  421 gtctgtg 427  Q
    |||||||    
T  22074765 gtctgtg 22074759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19655562 - 19655180
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatctgt 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19655562 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 19655463  T
Q  141 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  19655462 ggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaa 19655363  T
Q  240 aaacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 334  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||      ||||| |||||||||||||||||||    
T  19655362 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaaca 19655270  T
Q  335 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 424  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19655269 gggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtct 19655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602744
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27602942  T
Q  227 aaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||        |||||||||||    
T  27602941 aaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagc 27602850  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27602849 aaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggata 27602751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2131479 - 2131098
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2131479 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2131380  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2131379 gtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 2131280  T
Q  243 cattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 337  Q
    ||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131279 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 2131187  T
Q  338 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2131186 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 2131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 22138904 - 22139286
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22138904 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 22139003  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  22139004 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 22139103  T
Q  241 aacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||    ||||||||||||||||   ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22139104 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacag 22139194  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22139195 ggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22139286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 299
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16260403  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16260404 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 19694094 - 19694477
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19694094 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19694193  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  19694194 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 19694293  T
Q  242 acattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  19694294 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 19694387  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  19694388 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 19694477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 427
Target Start/End: Original strand, 14569194 - 14569540
Alignment:
Q  83 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569194 tgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatt 14569293  T
Q  183 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-tcttgataat----aatgctt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| | || |||||    ||||||     
T  14569294 tgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctc 14569393  T
Q  273 gaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 372  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  14569394 gaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtg 14569485  T
Q  373 atgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  14569486 ttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtg 14569540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 3647147 - 3647534
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgga 143  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3647147 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 3647246  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647247 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 3647346  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647347 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 3647446  T
Q  340 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3647447 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3647534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591470
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 144  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 28591284  T
Q  245 ttttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 341  Q
    || ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591285 ttctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 28591384  T
Q  342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28591385 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28591470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 76 - 427
Target Start/End: Original strand, 10968698 - 10969054
Alignment:
Q  76 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10968698 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 10968797  T
Q  176 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgc 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  10968798 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgc 10968897  T
Q  271 ttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968898 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 10968997  T
Q  371 tgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||    
T  10968998 tgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtg 10969054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156116
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28155924  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca----ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155925 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28156024  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28156025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28156116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334283
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 20334490  T
Q  227 aaagctatatac---aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaag 319  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20334489 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaag 20334391  T
Q  320 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334390 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 20334291  T
Q  420 agtctgtg 427  Q
    ||||||||    
T  20334290 agtctgtg 20334283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41787566 - 41787177
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41787566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 41787467  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41787466 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 41787368  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787367 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 41787268  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41787267 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41787177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 60 - 427
Target Start/End: Original strand, 10951108 - 10951480
Alignment:
Q  60 tttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctg 159  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10951108 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctg 10951207  T
Q  160 accaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10951208 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttatt 10951307  T
Q  258 ttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 354  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10951308 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaaca 10951407  T
Q  355 tgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  10951408 tgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 10951480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 405
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644588
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-tttttcttctactt 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  225 tcaaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644404 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagc 51644503  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51644504 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201895
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 16202108  T
Q  227 aaagctatatac-----aaaacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa---ctttttgtctatttt 313  Q
    ||||| || |||     ||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||| |||||||||    
T  16202107 aaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctatttt 16202008  T
Q  314 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 413  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  16202007 g-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctc 16201909  T
Q  414 caggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||    
T  16201908 caggatagtctgtg 16201895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467173
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttc 20466960  T
Q  227 aaagctatatacaaaa--cattttctttctatcttgata---ataatgcttgaaacaaacactttgaaaatt--------gaaaactttttgtctatttt 313  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  || ||||||         |||| ||  ||||||||||    
T  20466961 aaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctatttt 20467060  T
Q  314 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 413  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467061 g-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 20467159  T
Q  414 caggatagtctgtg 427  Q
    || |||||||||||    
T  20467160 catgatagtctgtg 20467173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891630
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-tttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||  ||    
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttttatgtt 21891821  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 320  Q
    ||           ||||||||||| ||||| | || |||||    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||      || | |||||||||||    
T  21891820 ca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagc 21891736  T
Q  321 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  21891735 aaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 21891637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2043
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttctacttt 1837  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1838 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagca 1937  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||    
T  1938 aacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatag 2037  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  2038 tctgtg 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12443
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctacttt 12227  T
Q  226 caaagctat-----------atacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctat 310  Q
    |||||||||           | | ||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  12228 caaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctat 12327  T
Q  311 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328 tttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 12426  T
Q  411 ccccaggatagtctgtg 427  Q
    | |||||||||||||||    
T  12427 ctccaggatagtctgtg 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4471
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgt 140  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4862 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 4763  T
Q  141 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4762 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 4663  T
Q  240 aaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4662 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacag 4563  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4562 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8797
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 8986  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8985 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 8886  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8885 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18973
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18584 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 18683  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 18782  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacacttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18882  T
Q  337 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18883 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10299
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  9912 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatga 10011  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10012 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaa 10110  T
Q  243 cattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 338  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 cattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10210  T
Q  339 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10211 acattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33680
Alignment:
Q  43 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtg 141  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  142 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33494  T
Q  241 aacattttctttctatcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||||| |||||| || |||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33495 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacag 33589  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33590 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14336
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  126 gctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 225  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaaca-ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14131 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 14230  T
Q  322 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 421  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  14231 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 14330  T
Q  422 tctgtg 427  Q
    ||||||    
T  14331 tctgtg 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15962
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 15749  T
Q  226 caaagctatatacaaaacattttctttctatctt----gataataatgcttgaaacaaaca------ctttgaaaattgaaaactttttgtctattttg- 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||| | |||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15750 caaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 15849  T
Q  315 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  15850 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 15949  T
Q  415 aggatagtctgtg 427  Q
    |||||||||||||    
T  15950 aggatagtctgtg 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 427
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25509
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 226  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 25296  T
Q  227 aaagctatatac---aaaacattttctttctatcttgataat---aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctatttt 313  Q
    |||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||||||| ||||    
T  25297 aaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgtttt 25396  T
Q  314 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 413  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25397 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 25495  T
Q  414 caggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||    
T  25496 caggatagtctgtg 25509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6449
Alignment:
Q  44 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 142  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6065 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6164  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--acaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||    
T  6165 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaa 6264  T
Q  241 aacattttctttcta-tcttgataat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 335  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  6265 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6357  T
Q  336 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6358 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25135 - 24774
Alignment:
Q  66 ggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccac 164  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25135 ggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 25036  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-tcttgat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||    
T  25035 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 24936  T
Q  263 aat----aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 358  Q
    |||    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24935 aatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 24843  T
Q  359 tgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24842 tgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactc 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 427
Target Start/End: Original strand, 12 - 173
Alignment:
Q  266 aatgcttgaaacaaacactttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcg 364  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12 aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagca 110  T
Q  365 agagtatgatgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 427  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111 agtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtg 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26241
Alignment:
Q  27 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtggtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  127 ctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgt 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgt 26241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40744
Alignment:
Q  92 tgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatctgt-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaa-tttga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattttga 40756  T
Q  186 gcctgtgctttt 197  Q
    | ||||||||||    
T  40755 gtctgtgctttt 40744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40497
Alignment:
Q  320 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgatgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || || || |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  418 atagtctgtg 427  Q
    ||||| ||||    
T  40506 atagtatgtg 40497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University