View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15877_high_5 (Length: 339)

Name: NF15877_high_5
Description: NF15877
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15877_high_5
NF15877_high_5
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (11-325)||(22536239-22536553)
chr5 (11-325)||(29751108-29751426)
chr5 (11-325)||(29720266-29720583)
chr5 (11-325)||(29722426-29722743)
chr5 (21-325)||(10593170-10593479)
chr5 (23-325)||(25078034-25078341)
chr5 (23-325)||(25136003-25136310)
chr5 (23-325)||(40380006-40380311)
chr5 (23-325)||(40382217-40382522)
chr5 (23-312)||(16546545-16546838)
chr5 (23-312)||(16544323-16544616)
chr5 (11-321)||(16409377-16409691)
chr5 (11-321)||(9789176-9789490)
chr5 (11-321)||(18441600-18441914)
chr5 (11-321)||(26177785-26178098)
chr5 (11-321)||(26170676-26170978)
chr5 (26-278)||(25412672-25412932)
chr5 (11-278)||(30182484-30182760)
chr5 (11-278)||(13342956-13343232)
chr5 (39-276)||(13239674-13239921)
chr5 (11-278)||(36074039-36074317)
chr5 (126-278)||(37439161-37439313)
chr5 (107-274)||(213465-213633)
chr5 (107-308)||(32636824-32637024)
chr5 (107-274)||(40147261-40147428)
chr5 (107-285)||(28278316-28278493)
chr5 (107-278)||(42428427-42428598)
chr5 (21-278)||(13488108-13488374)
chr5 (107-274)||(5058047-5058212)
chr5 (26-294)||(33831590-33831866)
chr5 (39-274)||(16452003-16452247)
chr5 (107-278)||(533769-533940)
chr5 (39-278)||(8565943-8566192)
chr5 (21-278)||(28750652-28750918)
chr5 (110-278)||(39468546-39468714)
chr5 (107-251)||(13695713-13695859)
chr5 (107-272)||(27637615-27637781)
chr5 (107-278)||(42426232-42426403)
chr5 (21-274)||(31182878-31183138)
chr5 (110-278)||(538028-538196)
chr5 (26-267)||(30682930-30683178)
chr5 (121-274)||(16640941-16641091)
chr5 (110-263)||(9049354-9049506)
chr5 (107-274)||(27015531-27015690)
chr5 (110-274)||(3075659-3075823)
chr5 (111-278)||(38747009-38747176)
chr5 (197-278)||(19806454-19806534)
chr5 (113-276)||(316769-316933)
chr5 (161-276)||(33906028-33906144)
chr5 (161-278)||(42309932-42310048)
chr5 (209-269)||(4160702-4160762)
chr5 (161-223)||(10054867-10054929)
chr5 (192-274)||(42926977-42927058)
chr5 (230-275)||(38882340-38882384)
chr5 (230-274)||(18596881-18596924)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (11-321)||(27647765-27648075)
chr6 (21-325)||(16554781-16555091)
chr6 (21-325)||(16631337-16631647)
chr6 (21-325)||(16653024-16653334)
chr6 (23-325)||(6027162-6027466)
chr6 (21-325)||(16578464-16578774)
chr6 (21-325)||(16616606-16616916)
chr6 (23-325)||(25421219-25421526)
chr6 (23-325)||(34166994-34167300)
chr6 (23-312)||(33342066-33342359)
chr6 (23-311)||(34164772-34165064)
chr6 (11-321)||(3072712-3073026)
chr6 (11-321)||(412004-412318)
chr6 (80-325)||(13153886-13154135)
chr6 (11-325)||(6097399-6097707)
chr6 (11-294)||(2171512-2171804)
chr6 (21-278)||(31404671-31404937)
chr6 (21-278)||(5406196-5406461)
chr6 (21-278)||(5410521-5410786)
chr6 (11-278)||(30834532-30834809)
chr6 (21-278)||(16452325-16452592)
chr6 (107-278)||(5413391-5413561)
chr6 (107-283)||(3808699-3808877)
chr6 (107-274)||(21588931-21589098)
chr6 (107-274)||(21593664-21593831)
chr6 (107-278)||(33160348-33160521)
chr6 (110-274)||(17758026-17758191)
chr6 (107-274)||(2972940-2973107)
chr6 (107-278)||(9183028-9183199)
chr6 (107-274)||(17762990-17763158)
chr6 (26-278)||(16568953-16569193)
chr6 (109-274)||(26830124-26830289)
chr6 (110-274)||(5043630-5043795)
chr6 (21-274)||(28137409-28137671)
chr6 (110-278)||(26954283-26954450)
chr6 (178-278)||(5409066-5409164)
chr6 (107-251)||(3038926-3039071)
chr6 (107-274)||(22424826-22424995)
chr6 (107-278)||(33211182-33211353)
chr6 (141-282)||(603081-603222)
chr6 (107-224)||(4045423-4045542)
chr6 (161-274)||(26800642-26800755)
chr6 (21-174)||(16567111-16567265)
chr6 (230-274)||(19643894-19643938)
chr6 (230-294)||(21356021-21356084)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (11-325)||(6716402-6716719)
chr3 (11-325)||(54635027-54635344)
chr3 (11-325)||(45282885-45283207)
chr3 (23-325)||(25637342-25637649)
chr3 (23-325)||(3617363-3617670)
chr3 (23-330)||(4600685-4600998)
chr3 (23-325)||(4598469-4598777)
chr3 (23-325)||(10211309-10211617)
chr3 (23-311)||(10056133-10056425)
chr3 (23-311)||(10058355-10058647)
chr3 (23-311)||(10060577-10060869)
chr3 (23-311)||(10062799-10063091)
chr3 (23-311)||(10065021-10065313)
chr3 (23-325)||(10209089-10209397)
chr3 (11-321)||(800993-801307)
chr3 (72-321)||(7779957-7780208)
chr3 (11-315)||(23200098-23200410)
chr3 (23-198)||(10067243-10067419)
chr3 (11-321)||(23197893-23198211)
chr3 (21-278)||(45095070-45095335)
chr3 (11-294)||(9636106-9636400)
chr3 (11-278)||(5258140-5258417)
chr3 (11-141)||(6718586-6718718)
chr3 (110-278)||(19683885-19684054)
chr3 (21-278)||(5260319-5260586)
chr3 (107-278)||(7762265-7762437)
chr3 (107-278)||(37408458-37408630)
chr3 (107-285)||(49199458-49199638)
chr3 (118-278)||(7764476-7764636)
chr3 (21-278)||(9581188-9581454)
chr3 (107-278)||(34491212-34491383)
chr3 (107-285)||(43401790-43401970)
chr3 (107-274)||(4569952-4570120)
chr3 (107-278)||(29196383-29196555)
chr3 (110-278)||(39153358-39153526)
chr3 (111-285)||(30236129-30236303)
chr3 (107-282)||(43403736-43403913)
chr3 (21-278)||(40734403-40734669)
chr3 (107-274)||(6095600-6095767)
chr3 (107-278)||(44331545-44331716)
chr3 (107-278)||(44700476-44700646)
chr3 (107-274)||(54593704-54593871)
chr3 (21-278)||(32744433-32744689)
chr3 (110-267)||(22835010-22835167)
chr3 (109-278)||(31314447-31314616)
chr3 (107-274)||(41819523-41819691)
chr3 (110-278)||(760850-761018)
chr3 (26-278)||(29682269-29682530)
chr3 (107-278)||(40735383-40735554)
chr3 (109-267)||(32891105-32891264)
chr3 (21-278)||(5236454-5236719)
chr3 (107-278)||(23391906-23392077)
chr3 (107-278)||(29813063-29813234)
chr3 (107-274)||(46860474-46860642)
chr3 (111-278)||(51398818-51398985)
chr3 (107-267)||(53921511-53921671)
chr3 (39-278)||(16498952-16499200)
chr3 (107-254)||(29810868-29811016)
chr3 (125-285)||(46173376-46173535)
chr3 (165-285)||(40913352-40913471)
chr3 (110-278)||(9666463-9666632)
chr3 (235-311)||(10067435-10067512)
chr3 (167-274)||(55301972-55302079)
chr3 (110-285)||(47304254-47304429)
chr3 (107-224)||(51352161-51352278)
chr3 (107-179)||(5433971-5434046)
chr3 (110-278)||(23410326-23410494)
chr3 (119-178)||(28253363-28253423)
chr3 (207-266)||(27305719-27305777)
chr3 (107-241)||(36018852-36018987)
chr3 (165-224)||(4075520-4075581)
chr3 (112-224)||(4055813-4055926)
chr3 (127-180)||(25517069-25517121)
chr3 (206-274)||(2075076-2075143)
chr3 (127-179)||(4386875-4386926)
chr3 (107-204)||(31340271-31340369)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (11-325)||(3439406-3439723)
chr8 (11-322)||(25689857-25690172)
chr8 (23-325)||(15290438-15290744)
chr8 (23-325)||(15470807-15471113)
chr8 (23-321)||(42575276-42575578)
chr8 (11-321)||(2627637-2627951)
chr8 (11-278)||(31218152-31218429)
chr8 (21-278)||(34254327-34254591)
chr8 (21-278)||(34256503-34256767)
chr8 (11-278)||(17982548-17982825)
chr8 (21-278)||(44303759-44304027)
chr8 (107-307)||(42498193-42498394)
chr8 (121-277)||(1746216-1746371)
chr8 (11-278)||(19945355-19945633)
chr8 (107-278)||(15212786-15212957)
chr8 (107-274)||(42434992-42435159)
chr8 (21-278)||(43036328-43036594)
chr8 (107-274)||(4283524-4283691)
chr8 (107-278)||(33352150-33352321)
chr8 (109-278)||(40321082-40321251)
chr8 (107-274)||(18655400-18655567)
chr8 (107-278)||(27811278-27811449)
chr8 (107-278)||(3303667-3303838)
chr8 (107-278)||(40221745-40221916)
chr8 (109-285)||(10930189-10930365)
chr8 (121-278)||(12702631-12702787)
chr8 (107-274)||(8965692-8965859)
chr8 (107-268)||(18141821-18141981)
chr8 (107-268)||(1292471-1292631)
chr8 (21-278)||(4731563-4731829)
chr8 (110-278)||(6598975-6599143)
chr8 (110-278)||(6674428-6674596)
chr8 (107-266)||(30291606-30291767)
chr8 (110-248)||(40328782-40328922)
chr8 (111-278)||(5689275-5689442)
chr8 (107-277)||(9765745-9765914)
chr8 (113-254)||(30143346-30143488)
chr8 (110-278)||(1345368-1345536)
chr8 (111-274)||(11383989-11384152)
chr8 (107-294)||(19491680-19491867)
chr8 (182-278)||(4743211-4743306)
chr8 (110-219)||(44353796-44353906)
chr8 (111-278)||(41366612-41366778)
chr8 (161-269)||(10015136-10015241)
chr8 (138-274)||(4162528-4162663)
chr8 (192-274)||(4733792-4733873)
chr8 (161-269)||(18106087-18106191)
chr8 (107-267)||(3772192-3772352)
chr8 (166-274)||(3073875-3073981)
chr8 (111-193)||(41364927-41365011)
chr8 (107-263)||(8153764-8153914)
chr8 (161-267)||(7597669-7597776)
chr8 (39-224)||(10929722-10929906)
chr8 (112-215)||(10240159-10240264)
chr8 (120-187)||(41266982-41267051)
chr8 (128-179)||(1822313-1822365)
chr8 (128-179)||(1856758-1856810)
chr8 (131-179)||(6813771-6813818)
chr8 (112-250)||(11712024-11712164)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (11-325)||(20343799-20344116)
chr7 (11-325)||(24789743-24790061)
chr7 (23-325)||(18392144-18392449)
chr7 (23-325)||(18388708-18389013)
chr7 (23-325)||(6594506-6594811)
chr7 (23-307)||(6592306-6592593)
chr7 (23-325)||(32060270-32060579)
chr7 (11-321)||(43504107-43504421)
chr7 (11-321)||(39731271-39731583)
chr7 (23-177)||(1562103-1562257)
chr7 (11-294)||(35853810-35854102)
chr7 (11-294)||(25766940-25767227)
chr7 (11-294)||(48408697-48408992)
chr7 (21-278)||(29990960-29991225)
chr7 (107-278)||(23555039-23555212)
chr7 (107-278)||(34310712-34310884)
chr7 (184-325)||(1560613-1560757)
chr7 (39-278)||(25615785-25616025)
chr7 (107-278)||(41317431-41317602)
chr7 (107-285)||(22269973-22270150)
chr7 (11-278)||(4178670-4178945)
chr7 (21-278)||(19502083-19502350)
chr7 (107-278)||(14069830-14070001)
chr7 (107-278)||(14379858-14380029)
chr7 (107-278)||(30024729-30024900)
chr7 (107-274)||(8359316-8359485)
chr7 (107-278)||(27347817-27347988)
chr7 (110-278)||(41649008-41649175)
chr7 (107-272)||(29608737-29608902)
chr7 (107-270)||(6431971-6432134)
chr7 (107-278)||(8153342-8153513)
chr7 (107-278)||(18126644-18126815)
chr7 (21-278)||(38671219-38671485)
chr7 (126-294)||(2390302-2390469)
chr7 (107-274)||(3258995-3259162)
chr7 (107-274)||(4508707-4508874)
chr7 (161-274)||(32358055-32358167)
chr7 (107-254)||(48491579-48491727)
chr7 (107-274)||(48599335-48599502)
chr7 (107-274)||(4253529-4253697)
chr7 (107-278)||(31732966-31733137)
chr7 (107-278)||(48489431-48489602)
chr7 (107-269)||(2360978-2361140)
chr7 (107-285)||(26417316-26417493)
chr7 (39-266)||(47673953-47674189)
chr7 (110-274)||(31105394-31105558)
chr7 (107-278)||(4586161-4586332)
chr7 (107-278)||(36146405-36146576)
chr7 (107-278)||(47676133-47676304)
chr7 (107-276)||(43864244-43864413)
chr7 (11-278)||(1113552-1113828)
chr7 (110-278)||(495980-496148)
chr7 (126-267)||(23565069-23565210)
chr7 (132-277)||(2759195-2759339)
chr7 (107-274)||(4510549-4510716)
chr7 (107-274)||(4512391-4512558)
chr7 (161-285)||(6359942-6360065)
chr7 (107-278)||(12097864-12098027)
chr7 (107-264)||(23343975-23344130)
chr7 (128-269)||(22328395-22328538)
chr7 (107-178)||(24525992-24526065)
chr7 (172-274)||(18396384-18396486)
chr7 (192-278)||(24525499-24525584)
chr7 (107-274)||(36574517-36574683)
chr7 (200-276)||(30814530-30814605)
chr7 (107-216)||(31518795-31518905)
chr7 (192-267)||(31518988-31519063)
chr7 (112-267)||(3904624-3904780)
chr7 (11-109)||(24514934-24515033)
chr7 (126-179)||(28617182-28617234)
chr7 (176-236)||(5116675-5116735)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (11-325)||(40282279-40282596)
chr1 (21-325)||(9036329-9036637)
chr1 (11-325)||(9987104-9987421)
chr1 (11-325)||(21053860-21054177)
chr1 (23-325)||(44203547-44203852)
chr1 (11-325)||(20622186-20622504)
chr1 (11-321)||(51765290-51765611)
chr1 (106-278)||(13316348-13316521)
chr1 (110-297)||(8550765-8550952)
chr1 (11-278)||(20762567-20762844)
chr1 (107-285)||(42297964-42298143)
chr1 (107-274)||(37168297-37168465)
chr1 (107-278)||(3189330-3189502)
chr1 (107-278)||(3198147-3198319)
chr1 (107-278)||(3206986-3207158)
chr1 (107-274)||(13547090-13547257)
chr1 (107-278)||(28265551-28265722)
chr1 (110-278)||(834164-834332)
chr1 (107-287)||(29136247-29136427)
chr1 (107-274)||(11348698-11348865)
chr1 (107-274)||(13549001-13549168)
chr1 (107-278)||(28220223-28220394)
chr1 (107-274)||(47255340-47255508)
chr1 (107-278)||(37033068-37033241)
chr1 (107-278)||(3156865-3157036)
chr1 (107-278)||(44455160-44455331)
chr1 (107-274)||(7482231-7482399)
chr1 (107-274)||(47115171-47115340)
chr1 (107-278)||(4552634-4552805)
chr1 (107-274)||(31925708-31925875)
chr1 (107-278)||(45644351-45644523)
chr1 (107-278)||(49918350-49918521)
chr1 (107-278)||(28223418-28223589)
chr1 (107-278)||(37503554-37503722)
chr1 (21-278)||(31659143-31659409)
chr1 (107-274)||(193611-193778)
chr1 (107-294)||(23555248-23555433)
chr1 (107-278)||(50167172-50167343)
chr1 (107-278)||(50169207-50169378)
chr1 (39-278)||(13659333-13659582)
chr1 (21-278)||(196904-197171)
chr1 (107-270)||(34603576-34603740)
chr1 (110-278)||(46064921-46065089)
chr1 (107-276)||(19754494-19754664)
chr1 (39-278)||(3847118-3847367)
chr1 (107-278)||(37559864-37560037)
chr1 (107-251)||(1833522-1833667)
chr1 (107-294)||(41360914-41361101)
chr1 (112-250)||(22079322-22079461)
chr1 (138-254)||(15820338-15820455)
chr1 (107-278)||(19752685-19752857)
chr1 (192-274)||(28242391-28242472)
chr1 (107-278)||(30476443-30476614)
chr1 (121-274)||(927977-928130)
chr1 (121-265)||(37282701-37282846)
chr1 (110-278)||(40122193-40122363)
chr1 (107-278)||(13137973-13138142)
chr1 (107-180)||(37879005-37879079)
chr1 (110-179)||(8871143-8871213)
chr1 (192-294)||(36683766-36683866)
chr1 (192-274)||(37876767-37876848)
chr1 (107-278)||(10925223-10925397)
chr1 (129-193)||(48382441-48382505)
chr1 (161-224)||(16455676-16455739)
chr1 (126-188)||(32736953-32737015)
chr1 (126-188)||(35109494-35109556)
chr1 (121-224)||(3460710-3460815)
chr1 (161-246)||(5459961-5460046)
chr1 (112-211)||(12318585-12318685)
chr1 (230-275)||(15916626-15916671)
chr1 (230-275)||(31422862-31422906)
chr1 (161-224)||(6808507-6808571)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (11-321)||(6266593-6266907)
chr2 (23-325)||(12647334-12647639)
chr2 (86-325)||(13655977-13656221)
chr2 (11-321)||(4484284-4484604)
chr2 (11-321)||(32289467-32289780)
chr2 (11-321)||(30833240-30833560)
chr2 (11-278)||(4503129-4503405)
chr2 (11-278)||(45099650-45099926)
chr2 (11-278)||(36205661-36205936)
chr2 (21-278)||(5723252-5723517)
chr2 (107-278)||(2334414-2334586)
chr2 (107-278)||(6595002-6595175)
chr2 (21-278)||(36988072-36988338)
chr2 (107-274)||(45726929-45727096)
chr2 (107-278)||(29867869-29868040)
chr2 (39-278)||(34139767-34140017)
chr2 (107-274)||(35446885-35447052)
chr2 (36-278)||(38312159-38312411)
chr2 (110-278)||(723741-723909)
chr2 (110-278)||(14633822-14633991)
chr2 (107-278)||(36773562-36773733)
chr2 (112-274)||(33648176-33648340)
chr2 (21-254)||(42362257-42362500)
chr2 (107-278)||(11151588-11151759)
chr2 (107-272)||(1631735-1631900)
chr2 (107-278)||(17057366-17057537)
chr2 (107-278)||(17085349-17085520)
chr2 (107-278)||(36318006-36318177)
chr2 (110-278)||(11690504-11690672)
chr2 (107-285)||(24398055-24398237)
chr2 (107-287)||(42288099-42288278)
chr2 (107-240)||(13121769-13121901)
chr2 (107-278)||(33162447-33162618)
chr2 (107-274)||(26353184-26353351)
chr2 (107-278)||(11067305-11067476)
chr2 (161-274)||(17490149-17490261)
chr2 (107-224)||(7815323-7815441)
chr2 (200-278)||(39284930-39285007)
chr2 (107-274)||(11049550-11049721)
chr2 (199-278)||(17450671-17450748)
chr2 (161-274)||(7451173-7451284)
chr2 (165-263)||(28671989-28672088)
chr2 (115-179)||(24885669-24885734)
chr2 (111-178)||(14202501-14202569)
chr2 (230-275)||(42064725-42064770)
chr2 (230-294)||(1345590-1345653)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (23-306)||(8395519-8395804)
chr4 (23-306)||(8393310-8393595)
chr4 (23-311)||(5138204-5138496)
chr4 (23-311)||(5135978-5136271)
chr4 (23-325)||(7124815-7125122)
chr4 (23-325)||(7122596-7122903)
chr4 (11-315)||(31495275-31495583)
chr4 (11-278)||(13992289-13992559)
chr4 (21-274)||(29999806-30000068)
chr4 (39-278)||(56178633-56178882)
chr4 (107-276)||(52095361-52095530)
chr4 (111-285)||(2209717-2209893)
chr4 (21-278)||(48142947-48143215)
chr4 (126-278)||(5370079-5370232)
chr4 (107-271)||(41964415-41964580)
chr4 (107-278)||(9927455-9927626)
chr4 (107-278)||(12739547-12739718)
chr4 (107-278)||(36463386-36463557)
chr4 (107-285)||(26364236-26364414)
chr4 (107-274)||(46703500-46703669)
chr4 (107-285)||(54883020-54883198)
chr4 (109-278)||(46147388-46147557)
chr4 (107-274)||(8648139-8648306)
chr4 (107-274)||(12073392-12073560)
chr4 (126-278)||(12743922-12744073)
chr4 (126-278)||(12745311-12745462)
chr4 (107-278)||(26175633-26175804)
chr4 (107-278)||(34570411-34570582)
chr4 (107-274)||(40632445-40632612)
chr4 (107-274)||(41639426-41639593)
chr4 (107-278)||(48893635-48893810)
chr4 (111-285)||(50262690-50262865)
chr4 (107-274)||(6542180-6542349)
chr4 (107-276)||(36994524-36994693)
chr4 (107-278)||(47038408-47038577)
chr4 (110-274)||(379383-379548)
chr4 (110-274)||(6655959-6656123)
chr4 (107-254)||(8665408-8665556)
chr4 (107-278)||(27416962-27417133)
chr4 (107-278)||(45687179-45687351)
chr4 (11-278)||(5429574-5429850)
chr4 (107-274)||(37229722-37229890)
chr4 (110-274)||(50673848-50674011)
chr4 (109-285)||(12119540-12119718)
chr4 (107-278)||(5871820-5871991)
chr4 (107-274)||(31474150-31474318)
chr4 (107-276)||(37740625-37740794)
chr4 (107-276)||(54199906-54200074)
chr4 (110-278)||(52467351-52467519)
chr4 (107-274)||(4587958-4588126)
chr4 (107-224)||(12747806-12747924)
chr4 (107-278)||(52082660-52082825)
chr4 (114-274)||(5207843-5208003)
chr4 (107-266)||(35662441-35662600)
chr4 (126-224)||(12744097-12744195)
chr4 (107-224)||(12745486-12745604)
chr4 (133-269)||(26699447-26699585)
chr4 (107-224)||(24969112-24969230)
chr4 (192-278)||(29254580-29254665)
chr4 (181-278)||(13009441-13009536)
chr4 (161-250)||(33989899-33989989)
chr4 (107-274)||(51337064-51337231)
chr4 (111-179)||(48142473-48142542)
chr4 (110-278)||(3913451-3913618)
chr4 (112-274)||(44967829-44967992)
chr4 (107-195)||(41639263-41639353)
chr4 (112-152)||(29056363-29056403)
chr4 (161-248)||(33089933-33090021)
chr4 (107-193)||(55085445-55085532)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (23-325)||(2552-2857)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (23-325)||(3674-3979)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (21-311)||(6186-6478)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (11-321)||(11115-11435)
scaffold0491 (11-321)||(8689-9009)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (11-276)||(434428-434703)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (107-294)||(11557-11745)
scaffold0286 (11-59)||(22239-22286)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (11-278)||(812-1087)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (107-278)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (107-274)||(18004-18171)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (107-276)||(20414-20583)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (107-274)||(7327-7494)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (39-278)||(149094-149343)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (131-274)||(10515-10656)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (242-325)||(1-85)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (111-219)||(80338-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (161-263)||(27453-27556)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22536553 - 22536239
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22536553 caaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaatcattgagtgtcttgg 22536454  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536453 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 22536354  T
Q  211 agtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct 310  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536353 agtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct 22536254  T
Q  311 tttatattgtgattg 325  Q
    ||||| |||||||||    
T  22536253 tttatcttgtgattg 22536239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29751426 - 29751108
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29751426 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 29751327  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751326 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 29751227  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg-cttttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29751226 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctc 29751127  T
Q  307 cccttttatattgtgattg 325  Q
     |||||||| |||||||||    
T  29751126 tccttttatcttgtgattg 29751108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 29720266 - 29720583
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29720266 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 29720365  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720366 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 29720465  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  29720466 gatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctct 29720565  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  29720566 ccttttatcttgtgattg 29720583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 29722426 - 29722743
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29722426 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 29722525  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722526 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 29722625  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  29722626 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctct 29722725  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  29722726 ccttttatcttgtgattg 29722743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 10593170 - 10593479
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593170 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 10593269  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10593270 ggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 10593369  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttat 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||    
T  10593370 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttctacttccctctccttgtttat 10593469  T
Q  316 attgtgattg 325  Q
     |||||||||    
T  10593470 cttgtgattg 10593479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 25078034 - 25078341
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078034 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 25078133  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25078134 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 25078233  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  25078234 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatct 25078333  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  25078334 tgtgattg 25078341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 25136003 - 25136310
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136003 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 25136102  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25136103 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 25136202  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  25136203 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatct 25136302  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  25136303 tgtgattg 25136310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 40380006 - 40380311
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380006 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 40380105  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40380106 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 40380205  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  40380206 agagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttg 40380305  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  40380306 tgattg 40380311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 40382217 - 40382522
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382217 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 40382316  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40382317 aggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 40382416  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  40382417 agagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttg 40382516  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  40382517 tgattg 40382522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Original strand, 16546545 - 16546838
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16546545 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattaggaa 16546644  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16546645 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 16546744  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttt 312  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  16546745 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttt 16546838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Original strand, 16544323 - 16544616
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544323 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 16544422  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16544423 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 16544522  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttt 312  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  16544523 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttt 16544616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 16409377 - 16409691
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  16409377 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 16409475  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  16409476 tggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 16409574  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  16409575 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccc 16409674  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  16409675 tctccttttatcttgtg 16409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9789490 - 9789176
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  9789490 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 9789392  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  9789391 tggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 9789293  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  9789292 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccc 9789193  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || || ||||| |||||    
T  9789192 tctccgtttatcttgtg 9789176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18441914 - 18441600
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  18441914 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 18441816  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  18441815 tggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 18441717  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  18441716 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccc 18441617  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || || ||||| |||||    
T  18441616 tctccgtttatcttgtg 18441600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 26177785 - 26178098
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  26177785 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 26177883  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  26177884 tggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 26177981  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  26177982 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccc 26178081  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  26178082 tctccttttatcttgtg 26178098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 26170676 - 26170978
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  26170676 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 26170774  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||||||||| |    
T  26170775 tggtgagattgg-aaaagggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcat 26170862  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccct 305  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  26170863 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccct 26170962  T
Q  306 ccccttttatattgtg 321  Q
    | |||||||| |||||    
T  26170963 ctccttttatcttgtg 26170978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 25412672 - 25412932
Alignment:
Q  26 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  25412672 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 25412769  T
Q  116 ttgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  25412770 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagt 25412867  T
Q  214 ggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25412868 ggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct 25412932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 30182484 - 30182760
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  30182484 caaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 30182581  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |    
T  30182582 tgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg-a 30182679  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30182680 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 30182760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 13342956 - 13343232
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  13342956 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 13343053  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||       
T  13343054 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-- 13343150  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13343151 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13239921
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-tgg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||||| |||| |||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 225  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaga 13239870  T
Q  226 aaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13239871 tcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat 13239921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36074317 - 36074039
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  36074317 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 36074220  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat----ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatccctttt 194  Q
    ||       |||||||||||||||     |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  36074219 tgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg 36074121  T
Q  195 gtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36074120 --aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 36074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439313
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 37439258  T
Q  224 gtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439259 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213633
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 308
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32637024
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||   ||||||    
T  32636922 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttcc 32637019  T
Q  304 ctccc 308  Q
    |||||    
T  32637020 ctccc 32637024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147428
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40147359 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278493
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28278414 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat-tcttggtg 28278493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42428500 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 13488108 - 13488374
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||| |||||||||||||           
T  13488108 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattg 13488205  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  13488206 gtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 13488303  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  13488304 tgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 13488374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058212
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttc--tgtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5058143 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831866
Alignment:
Q  26 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  115 attgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgata 211  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgata 33831785  T
Q  212 gtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  33831786 gtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct-ttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Original strand, 16452003 - 16452247
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaatgg- 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||     
T  16452003 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatggg 16452101  T
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 225  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||     
T  16452102 tagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagaga 16452199  T
Q  226 aaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16452200 taaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 16452247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533940
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  533867 cattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8566192 - 8565943
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||    
T  8566192 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 8566094  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8566093 gtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcattgatagtggattggagag 8565996  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
       ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8565995 atcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28750918 - 28750652
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  28750918 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 28750821  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||| |    
T  28750820 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcat 28750723  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  28750722 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatct 28750652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468546
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 39468617  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39468616 tgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaatct 39468546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaa 251  Q
     || |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695759 attaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637615
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 272  Q
    || || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426232
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42426305 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaatct 42426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 31182878 - 31183138
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt--gt-agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||  || || || |||||||||||||||||           
T  31182878 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 31182975  T
Q  110 gtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| || |||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31182976 gtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtatccc-tttgtaagaactcattg 31183073  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||| ||||||||||||    |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31183074 atactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 31183138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538196
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 538125  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  538126 tgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  26 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 115  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  116 ttgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaa--ctctttgat 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||| |||||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggtt----ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcattgat 30682986  T
Q  211 agtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682985 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640941
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact---tgatagtggatt 16640996  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  16640995 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tagggccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049354
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgttt-ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt 9049409  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 263  Q
    || ||||||||||||||   ||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  9049408 gacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015690
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       | || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat-------acccatttgtatctcttt-gtaagaactc 27015621  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||||||||||| | ||   ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27015622 attgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3075823 - 3075659
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |    
T  3075823 gtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaattcgt 3075726  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||  || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3075725 tgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaaca 3075659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 278
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747176
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||| || ||||| ||    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttggaaaaactcatt 38747106  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  38747107 gatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggtcaataatct 38747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806534
Alignment:
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316933
Alignment:
Q  113 agattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 210  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgat 316867  T
Q  211 agtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    | ||||| |||| |   ||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  316868 aatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906028
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||| | | ||||||||||||  ||||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggac 33906045  T
Q  260 cgaactgggtgaacaat 276  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  33906044 cgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309932
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| | |||   ||||||||| ||| ||||| | |||||| |||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagttt-gac 42309951  T
Q  260 cgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  42309950 cgaattggataaacaatct 42309932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 269
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 269  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10054929 - 10054867
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  10054929 aagctaatttcttataaccttttgtatctc-tttgtaatgaactcattgatagtgtattggaga 10054867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 42926977 - 42927058
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||   |||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42926977 tttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 42927058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Original strand, 38882340 - 38882384
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 275  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38882340 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaa 38882384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 18596881 - 18596924
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18596881 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 27647765 - 27648075
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27647765 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaatcattgagtgtcttgg 27647864  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647865 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 27647964  T
Q  211 agtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27647965 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctcct 27648064  T
Q  311 tttatattgtg 321  Q
    ||||| |||||    
T  27648065 tttatcttgtg 27648075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 16554781 - 16555091
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554781 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 16554880  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16554881 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 16554980  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 314  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16554981 tggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 16555080  T
Q  315 tattgtgattg 325  Q
    | |||||||||    
T  16555081 tcttgtgattg 16555091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 16631337 - 16631647
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631337 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 16631436  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16631437 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 16631536  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 314  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16631537 tggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 16631636  T
Q  315 tattgtgattg 325  Q
    | |||||||||    
T  16631637 tcttgtgattg 16631647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 16653024 - 16653334
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653024 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 16653123  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16653124 ggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 16653223  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 314  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16653224 tggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 16653323  T
Q  315 tattgtgattg 325  Q
    | |||||||||    
T  16653324 tcttgtgattg 16653334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 6027162 - 6027466
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027162 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6027261  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6027262 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6027361  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  6027362 agagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccct-ccattttatcttg 6027460  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  6027461 tgattg 6027466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16578774 - 16578464
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578774 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 16578675  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16578674 ggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 16578575  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 314  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16578574 tggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 16578475  T
Q  315 tattgtgattg 325  Q
    | |||||||||    
T  16578474 tcttgtgattg 16578464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 16616606 - 16616916
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616606 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 16616705  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggat 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16616706 ggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 16616805  T
Q  218 tggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--ttta 314  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16616806 tggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgttta 16616905  T
Q  315 tattgtgattg 325  Q
    | |||||||||    
T  16616906 tcttgtgattg 16616916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 25421219 - 25421526
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421219 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 25421318  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25421319 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 25421418  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |    
T  25421419 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatct 25421518  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  25421519 tgtgattg 25421526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 34166994 - 34167300
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166994 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 34167093  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaac-tctttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  34167094 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggattg 34167193  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatatt 318  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  34167194 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatctt 34167293  T
Q  319 gtgattg 325  Q
    |||||||    
T  34167294 gtgattg 34167300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33342359 - 33342066
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342359 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 33342260  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33342259 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 33342160  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttt 312  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  33342159 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttt 33342066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 34164772 - 34165064
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164772 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 34164871  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34164872 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 34164971  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  34164972 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 34165064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3073026 - 3072712
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  3073026 caaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtct 3072928  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  3072927 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 3072829  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  3072828 attgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccc 3072729  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  3072728 tctccttttatcttgtg 3072712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 412004 - 412318
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  412004 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtctt 412102  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||     
T  412103 ggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 412201  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  412202 ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccc 412301  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  412302 tctccttttatcttgtg 412318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 325
Target Start/End: Original strand, 13153886 - 13154135
Alignment:
Q  80 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13153886 accttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac 13153985  T
Q  179 cttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13153986 ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 13154085  T
Q  277 ctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattgtgattg 325  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  13154086 ctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 13154135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6097707 - 6097399
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||| |    
T  6097707 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttt 6097608  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||||||||| |    
T  6097607 tggtgagattggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcat 6097519  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccct 305  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6097518 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccct 6097419  T
Q  306 ccccttttatattgtgattg 325  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  6097418 ctccttgtatcttgtgattg 6097399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2171804 - 2171512
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  2171804 caaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 2171706  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 198  Q
    ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2171705 tgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctcttt-gtaa 2171608  T
Q  199 gaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2171607 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 2171512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31404937 - 31404671
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  31404937 aactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcag 31404839  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  31404838 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 31404741  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404740 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31404671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5406461 - 5406196
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  5406461 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 5406364  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  5406363 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 5406266  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5406265 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5406196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5410786 - 5410521
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  5410786 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 5410689  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  5410688 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 5410591  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5410590 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30834809 - 30834532
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| |||  |||||||||||||    
T  30834809 caaaggaagcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtct 30834712  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  30834711 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg- 30834614  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30834613 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct 30834532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16452592 - 16452325
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  16452592 aactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 16452495  T
Q  111 tgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttg-tatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||| | |||||||| |    
T  16452494 tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactcat 16452397  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452396 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 16452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5413561 - 5413391
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  5413561 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 5413464  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413463 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct 5413391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808699
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttgg 283  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3808779 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttgg 3808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589098
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589029 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593831
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21593762 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160348
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaac 33160424  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33160423 tcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 33160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758191
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17758124 tgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972940
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2973009 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183028
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9183101 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9183028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763158
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17763088 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569193
Alignment:
Q  26 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 121  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  122 aaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattg 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccttt------------gtaagaactcattgatagtggattg 16569135  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16569136 gagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830124
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||     
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26830191 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043795
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5043728 tgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28137671 - 28137409
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  28137671 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 28137574  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||| |    
T  28137573 gtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaactcat 28137476  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28137475 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||| ||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaagaactcatt 26954353  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26954352 gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5409164 - 5409066
Alignment:
Q  178 ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 277  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5409164 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatc 5409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3038974  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaa 251  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3038973 ctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424826
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---ttttgtatcccttttgtaagaa 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  202 ctctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||| || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22424897 ctcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | || ||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33211255 catttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 603222 - 603081
Alignment:
Q  141 ttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctc 238  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |    
T  603222 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctcccc 603124  T
Q  239 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 282  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  603123 aagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctcttg 603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  205 tttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4045523 attgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800755
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 258  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 26800739  T
Q  259 ccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26800740 ccgaactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 16567111 - 16567265
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagat 116  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||   ||||    
T  16567111 aactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg---agat 16567205  T
Q  117 tgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  16567206 tgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 19643894 - 19643938
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19643894 tctctccttcagagtaggtcaaatttggaccgaacttggtaaaca 19643938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21356084 - 21356021
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  21356084 tctctcctccagattaggtcatatt-ggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttt 21356021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 6716402 - 6716719
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6716402 caaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 6716501  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716502 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 6716601  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716602 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctcc 6716701  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6716702 ccttttatcttgtgattg 6716719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 54635027 - 54635344
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54635027 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 54635126  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635127 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 54635226  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54635227 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctct 54635326  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  54635327 ccttttatcttgtgattg 54635344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 45282885 - 45283207
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  45282885 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtctt 45282984  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc---ttttgtaagaactc- 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  45282985 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactca 45283084  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283085 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 45283184  T
Q  305 tcccct--tttatattgtgattg 325  Q
    || |||  ||||| |||||||||    
T  45283185 tctccttgtttatcttgtgattg 45283207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 25637342 - 25637649
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637342 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 25637441  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25637442 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 25637541  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatat 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  25637542 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatct 25637641  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  25637642 tgtgattg 25637649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 3617363 - 3617670
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617363 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 3617462  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3617463 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 3617562  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  3617563 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatct 3617662  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  3617663 tgtgattg 3617670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4600998 - 4600685
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600998 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 4600899  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4600898 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 4600799  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tttata 316  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||  |||||     
T  4600798 gagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatc 4600699  T
Q  317 ttgtgattgatgat 330  Q
    ||||||||| ||||    
T  4600698 ttgtgattgttgat 4600685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4598777 - 4598469
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598777 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 4598678  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4598677 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 4598578  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tttata 316  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||  |||||     
T  4598577 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatc 4598478  T
Q  317 ttgtgattg 325  Q
    |||||||||    
T  4598477 ttgtgattg 4598469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 10211309 - 10211617
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211309 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10211408  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10211409 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10211508  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tttata 316  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||  |||||     
T  10211509 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatc 10211608  T
Q  317 ttgtgattg 325  Q
    |||||||||    
T  10211609 ttgtgattg 10211617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 10056133 - 10056425
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056133 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10056232  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10056233 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10056332  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10056333 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10056425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 10058355 - 10058647
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058355 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10058454  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10058455 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10058554  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10058555 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10058647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 10060577 - 10060869
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060577 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10060676  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10060677 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10060776  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10060777 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10060869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 10062799 - 10063091
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062799 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10062898  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10062899 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10062998  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10062999 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10063091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 10065021 - 10065313
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065021 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10065120  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10065121 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10065220  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10065221 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10065313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 10209089 - 10209397
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209089 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10209188  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10209189 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10209288  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tttata 316  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||  |||||     
T  10209289 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatc 10209388  T
Q  317 ttgtgattg 325  Q
    |||||||||    
T  10209389 ttgtgattg 10209397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 800993 - 801307
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  800993 caaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtct 801091  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  801092 tggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 801190  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  801191 attgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccc 801290  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  801291 tctccttttatcttgtg 801307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779957
Alignment:
Q  72 tgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaat 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  169 ttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtggg 7780010  T
Q  269 tgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7780009 tgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtg 7779957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23200410 - 23200098
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  23200410 caaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 23200312  T
Q  108 tg------gtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaa 198  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  23200311 tgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaa 23200214  T
Q  199 gaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttctt 298  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  23200213 gaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttctt 23200115  T
Q  299 cttccctccccttttat 315  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23200114 cttccctctccttttat 23200098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 10067243 - 10067419
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067243 ctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 10067342  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10067343 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 10067419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23198211 - 23197893
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  23198211 caaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 23198113  T
Q  108 tg------gtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaa 198  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  23198112 tgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaa 23198015  T
Q  199 gaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttctt 298  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  23198014 gaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcct 23197916  T
Q  299 cttccctccccttttatattgtg 321  Q
    |||| ||| |||||||| |||||    
T  23197915 cttctctctccttttatcttgtg 23197893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 45095070 - 45095335
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  45095070 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 45095167  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  45095168 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 45095265  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095266 atagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45095335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9636400 - 9636106
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  9636400 caaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 9636302  T
Q  108 tggt-------gagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||||       ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  9636301 tggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgt 9636204  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9636203 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 9636106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5258417 - 5258140
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  5258417 caaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 5258320  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  5258319 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg- 5258222  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5258221 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5258140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 6718586 - 6718718
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6718586 caaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 6718685  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6718686 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683885
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683956 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 19683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5260586 - 5260319
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt------ 111  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||          
T  5260586 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattgg 5260489  T
Q  112 -gagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
     |||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |    
T  5260488 tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcat 5260391  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5260390 tgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5260319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762437
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 7762362  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762363 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 37408458 - 37408630
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  37408458 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 37408555  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37408556 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct 37408630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199458
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199540 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 49199458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 278
Target Start/End: Original strand, 7764476 - 7764636
Alignment:
Q  118 gggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtgg 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  7764476 gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtgg 7764573  T
Q  216 attggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7764574 attggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct 7764636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 9581188 - 9581454
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  9581188 aactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 9581285  T
Q  110 gtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9581286 gtgggattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 9581383  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581384 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34491310 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401790
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401872 tcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 43401790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570120
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4570050 cattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29196456 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153358
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttta-taagaactcat 39153429  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153428 tgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 285
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236303
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  30236227 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtg 30236303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403736
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 282  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403815 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 43403736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 40734403 - 40734669
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  40734403 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 40734500  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |    
T  40734501 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaactcat 40734598  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40734599 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095600
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095669 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
      |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44331643 tattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44700548 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593871
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54593802 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32744689 - 32744433
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagatt 117  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |||  ||||||||| | ||| |||||||    
T  32744689 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtattttg-tgagatt 32744593  T
Q  118 gggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtg 214  Q
    |  ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32744592 gaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaactctttgatagtg 32744496  T
Q  215 gattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| ||||  |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32744495 gattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32744433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 22835070  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835069 tgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314616
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactct 31314544  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  31314545 ttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 31314616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819523
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  41819593 tcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 760850 - 761018
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 760947  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  760948 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct 761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 278
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  26 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  115 attgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgata 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaagaactcattgata 29682464  T
Q  212 gtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29682465 gtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 40735383 - 40735554
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40735383 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaagaact 40735480  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40735481 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct 40735554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcg 32891203  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891204 ttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5236719 - 5236454
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  5236719 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 5236622  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  5236621 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5236524  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| |||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5236523 tgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct 5236454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391906
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23391979 ctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 23391906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaact 29813160  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29813161 catttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860642
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  46860572 cattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 278
Target Start/End: Original strand, 51398818 - 51398985
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  51398818 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 51398915  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  51398916 gatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 51398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 16498952 - 16499200
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  16498952 tctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacgg 16499050  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     ||||||||||||||  ||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16499051 atagaaattagggttgttt--ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 16499147  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
       ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16499148 atcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811016
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtt 254  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810966 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 285
Target Start/End: Original strand, 46173376 - 46173535
Alignment:
Q  125 tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  46173376 tggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggag 46173473  T
Q  223 agtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    ||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactagatcaacaatttcttggtg 46173535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 285
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913471
Alignment:
Q  165 taatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaa 40913449  T
Q  264 ctgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  40913450 ctgggtcaacaatctcttggtg 40913471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9666632 - 9666463
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||| ||||    
T  9666632 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttata-cctctttgtaagaattctt 9666534  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9666533 tgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9666463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067512
Alignment:
Q  235 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 10067512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  167 atttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 265  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaact 55301981  T
Q  266 gggtgaaca 274  Q
     ||||||||    
T  55301980 tggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 285
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304429
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47304352 tgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatttattggtg 47304429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352161
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||     
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  206 ttgatagtggattggagag 224  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  51352179 ttgagagtggatttgagag 51352161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  107 ttggtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23410494 - 23410326
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||  ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  23410494 gtgaaatttggaaaatgggtagaaattatg-tttattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt-gtaagaactctt 23410397  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  23410396 agataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaacgaattgggtcaacaatct 23410326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253363
Alignment:
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 266  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctc-tttgtaagaac 36018949  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccag 241  Q
    || || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4075581 - 4075520
Alignment:
Q  165 taatttcttgtaacct--tttgtatcccttttgtaagaa-ctctttgatagtggattggagag 224  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4075581 taatttcttgtaacctcttttgtatcacttt-gtaagaaactctttgatagtggattggagag 4075520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055813
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaac--cttttgtatcccttttgtaag-aactcttt 207  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactcatt 4055830  T
Q  208 gatagtggattggagag 224  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4055829 gatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25517121 - 25517069
Alignment:
Q  127 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 180  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25517121 gtagaaattagggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttataacct 25517069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2075143 - 2075076
Alignment:
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  2075143 ttgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaaca 2075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 179
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386926
Alignment:
Q  127 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 4386926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31340369 - 31340271
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31340369 ttggtgagattgggaaaattggtagaaatt-gaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31340272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 3439406 - 3439723
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  3439406 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtctt 3439505  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439506 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 3439605  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3439606 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctct 3439705  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3439706 ccttttatcttgtgattg 3439723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Original strand, 25689857 - 25690172
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25689857 caaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 25689956  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689957 ggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 25690056  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgctt-ttgttttcttcttccctc 306  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690057 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctc 25690156  T
Q  307 cccttttatattgtga 322  Q
    ||||||||| ||||||    
T  25690157 cccttttatcttgtga 25690172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 15290438 - 15290744
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290438 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 15290537  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15290538 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 15290637  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatatt 318  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15290638 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatctt 15290737  T
Q  319 gtgattg 325  Q
    |||||||    
T  15290738 gtgattg 15290744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 15470807 - 15471113
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470807 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 15470906  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15470907 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 15471006  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatatt 318  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  15471007 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatctt 15471106  T
Q  319 gtgattg 325  Q
    |||||||    
T  15471107 gtgattg 15471113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42575578 - 42575276
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575578 ctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 42575479  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42575478 aggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 42575379  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatatt 318  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  42575378 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatctt 42575279  T
Q  319 gtg 321  Q
    |||    
T  42575278 gtg 42575276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 2627637 - 2627951
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2627637 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtct 2627735  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||    
T  2627736 tggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactc 2627834  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2627835 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttttcctcttccc 2627934  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  2627935 tctccttttatcttgtg 2627951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 31218152 - 31218429
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  31218152 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 31218249  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  31218250 tgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg- 31218347  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218348 aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31218429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34254591 - 34254327
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gt 111  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||    
T  34254591 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 34254494  T
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  34254493 gagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaacttattga 34254396  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254395 tagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34254327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34256767 - 34256503
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gt 111  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||  | | |||  |||||||||||||||       ||    
T  34256767 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 34256670  T
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  34256669 gagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattga 34256572  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256571 tagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34256503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 17982548 - 17982825
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  17982548 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 17982645  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  17982646 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg- 17982743  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982744 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 17982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 44303759 - 44304027
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  44303759 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 44303856  T
Q  111 tgagattgggaaaat---ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  44303857 tgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactca 44303954  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44303955 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct 44304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 307
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498394
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaac 42498290  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttc 302  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||    
T  42498291 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttccctcttc 42498389  T
Q  303 cctcc 307  Q
     ||||    
T  42498390 tctcc 42498394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1746371 - 1746216
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  1746371 aaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcattgatagtggatt 1746275  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 277  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746274 ggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 1746216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19945633 - 19945355
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  19945633 caaaggaagcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 19945536  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttg 195  Q
    ||       |||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  19945535 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg 19945437  T
Q  196 taagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19945436 -aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 19945355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212957
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15212884 cattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 15212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434992
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435061 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 43036328 - 43036594
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  43036328 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 43036425  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  43036426 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 43036523  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43036524 tgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283691
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4283622 cattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33352248 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactct 40321179  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40321180 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655567
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | ||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655498 cattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27811376 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303667
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3303740 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221916
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40221843 cgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 40221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930189
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |     
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtg 10930189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12702787 - 12702631
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  12702787 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctcttt-gtaagaactcattgatattggatt 12702690  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12702689 ggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12702631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965692
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8965760 attgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 268  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1292534  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 268  Q
    | ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 cattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 4731563 - 4731829
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  4731563 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 4731660  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  4731661 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 4731758  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  4731759 tgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct 4731829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6599073 tgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6674526 tgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291767
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 266  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  30291705 ctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 248
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||     
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggt 248  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  40328880 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 278
Target Start/End: Original strand, 5689275 - 5689442
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  5689275 tgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtg-gtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 5689372  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5689373 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 277
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765914
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9765842  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 277  Q
    | |||||||||||||||||||     ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  9765843 cattgatagtggattggagag-ctgctctctcccccagattaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  113 agattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattga 30143443  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtt 254  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143444 tagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345368
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  | |||||| |||| | |||||||| |    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1345438 tgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct 1345368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384152
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| | ||    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt 11384086  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11384087 gatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491680
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 19491770  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    | |||||||||||||  ||||   ||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  19491769 cgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 19491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743211
Alignment:
Q  182 ttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353906
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt-gtaagaactcat 44353893  T
Q  207 tgatagtggattg 219  Q
    |||||||||||||    
T  44353894 tgatagtggattg 44353906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41366778 - 41366612
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41366778 tgagattgagaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 41366681  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41366680 tatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggacaacaatct 41366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015241
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttt--aggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttggac 10015231  T
Q  260 cgaactgggt 269  Q
    ||||||||||    
T  10015232 cgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Original strand, 4162528 - 4162663
Alignment:
Q  138 ggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctc 235  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||    
T  4162528 ggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctc 4162625  T
Q  236 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4162626 cccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733873
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4733792 tttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttggac 18106097  T
Q  260 cgaactgggt 269  Q
    ||||||||||    
T  18106096 cgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 3772192 - 3772352
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| |    
T  3772192 ttggtgagattgagaaaattgatagaaattagg-tttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaactcatttgtatatcttt-gtaagaatt 3772289  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
      |||||||||||||||||||   ||||| ||   |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3772290 tattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaag-ttggaccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073875
Alignment:
Q  166 aatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 264  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctcttt-gtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-ttgggccgaac 3073885  T
Q  265 tgggtgaaca 274  Q
    ||||| ||||    
T  3073884 tgggtaaaca 3073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41365011 - 41364927
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365011 tgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Original strand, 8153764 - 8153914
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    | ||   |||  ||||||| ||| |||||| |||||||||  | |||||||||||||     
T  8153764 ttggtgagattgagaaaatggtagaaattagggtttctgagctttg---ttg--aagctaaattcgtgtaactcttttgtatatc-tttgtaagaactca 8153857  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 263  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8153858 ttgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 7597669 - 7597776
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||   || |||    
T  7597669 aagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttagac 7597768  T
Q  260 cgaactgg 267  Q
    ||||||||    
T  7597769 cgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 10929722 - 10929906
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg- 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||       |||||||  |||||||||     
T  10929722 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaacattgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatggg 10929820  T
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||        ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10929821 tagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac--------tc---tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 10929906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 10240159 - 10240264
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    |||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||| | ||| ||| ||||   |||||||| ||||    
T  10240159 gagattgggacaaagatagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattga 10240258  T
Q  210 tagtgg 215  Q
    ||||||    
T  10240259 tagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Original strand, 41266982 - 41267051
Alignment:
Q  120 gaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtat 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  41266982 gaaaatggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtat 41267051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 1822313 - 1822365
Alignment:
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1822313 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1822365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 1856758 - 1856810
Alignment:
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1856758 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1856810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6813818 - 6813771
Alignment:
Q  131 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6813818 aaattaggttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 6813771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11712164 - 11712024
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    ||||||| ||||||  || |||||||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||   || ||||| ||||    
T  11712164 gagattgagaaaataatataaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattga 11712065  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtca 250  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||  || |||||||||    
T  11712064 tagtggattgaagagatcaatctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 20343799 - 20344116
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20343799 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt 20343898  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-ttt 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20343899 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcattt 20343998  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20343999 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctc 20344097  T
Q  307 cccttttatattgtgattg 325  Q
     |||||||| |||||||||    
T  20344098 tccttttatcttgtgattg 20344116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 24789743 - 24790061
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24789743 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 24789842  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24789843 ggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaaaactcttt 24789942  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg-cttttgttttcttcttccctc 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  24789943 gatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctc 24790042  T
Q  307 cccttttatattgtgattg 325  Q
     |||||||| |||||||||    
T  24790043 tccttttatcttgtgattg 24790061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18392449 - 18392144
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392449 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 18392350  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18392349 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 18392250  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  18392249 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttg 18392150  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  18392149 tgattg 18392144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18389013 - 18388708
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389013 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 18388914  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18388913 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 18388814  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||    
T  18388813 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctctttgtatcttg 18388714  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  18388713 tgattg 18388708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6594811 - 6594506
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594811 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6594712  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6594711 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6594612  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  6594611 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttg 6594512  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  6594511 tgattg 6594506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6592593 - 6592306
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592593 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 6592494  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6592493 atgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6592394  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcc 307  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  6592393 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctcc 6592306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32060579 - 32060270
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060579 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 32060480  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc--ttttgt-aagaactc-tttgatagtgga 216  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32060479 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtgga 32060380  T
Q  217 ttggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttat 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   |||||    
T  32060379 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttat 32060280  T
Q  316 attgtgattg 325  Q
     |||||||||    
T  32060279 cttgtgattg 32060270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43504421 - 43504107
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  43504421 caaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtct 43504323  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  43504322 tggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 43504224  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  43504223 attgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccc 43504124  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  43504123 tctccttttatcttgtg 43504107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 39731271 - 39731583
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  39731271 caaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 39731369  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  39731370 tggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 39731468  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccct 305  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  39731469 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcctcttccct 39731567  T
Q  306 ccccttttatattgtg 321  Q
    | |||||||| |||||    
T  39731568 ctccttttatcttgtg 39731583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1562257 - 1562103
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562257 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 1562158  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 177  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562157 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Original strand, 35853810 - 35854102
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  35853810 caaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 35853907  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  35853908 tgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gta 35854005  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35854006 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 35854102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25767227 - 25766940
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||    
T  25767227 caaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 25767132  T
Q  109 g----gtgagattgg-gaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgtaaga 200  Q
    |     |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  25767131 gttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aaga 25767034  T
Q  201 actctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25767033 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 25766940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Original strand, 48408697 - 48408992
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  48408697 caaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 48408795  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       ||||||||||||||| || |||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||     
T  48408796 tgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttga 48408894  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  48408895 aataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgttt 48408992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 29990960 - 29991225
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  29990960 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 29991057  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  29991058 tgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc-taataactcattg 29991155  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991156 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29991225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555212
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaac 23555136  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555137 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310786 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560613
Alignment:
Q  184 gtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  283 gtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttatattgtgattg 325  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg 1560613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616025
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatgg-tagaaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  134 ttagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatc 231  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatc 25615978  T
Q  232 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25615979 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct 25616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41317504 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270150
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
      |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22270071 gattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atctcttggtg 22270150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 4178670 - 4178945
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  4178670 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 4178767  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |    
T  4178768 tgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--a 4178864  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4178865 agaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct 4178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 19502083 - 19502350
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagag--agaatcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||       |    
T  19502083 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtgg 19502180  T
Q  111 tgagattgggaaaatgg--tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||| |||||  |  ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |    
T  19502181 tgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19502278  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19502279 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct 19502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069830
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14069903 cattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379858
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14379931 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024729
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  30024802 ctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 30024729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359316
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8359387 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347988
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27347915 cattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27347988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41649175 - 41649008
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41649175 gtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 41649078  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41649077 gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608902
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 272  Q
    | ||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29608835 cattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 270  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8153440 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126815
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18126741  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||     ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  18126742 cattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct 18126815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38671485 - 38671219
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  38671485 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 38671388  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  38671387 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcacttt-gtaagaactcat 38671290  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38671289 tgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38671219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 2390302 - 2390469
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  2390302 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatatatagtggattggaga 2390399  T
Q  224 gtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2390400 gatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgttgttgttt 2390469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259162
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3259093 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508707
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4508776 cattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358055
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 32358070  T
Q  260 cgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||||||||    
T  32358069 cgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaact 48491676  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtt 254  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491677 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599335
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48599404 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253529
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||| |||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  4253597 attgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31733137 - 31732966
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31733137 ttggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31733040  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31733039 cattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489602
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48489529 cattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 48489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 269  Q
    | ||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 cattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417493
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  26417414 cgttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtg 26417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 47673993  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 266  Q
       ||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673992 atcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105394
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |    
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcat 31105461  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31105460 tgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586332
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaact 4586258  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  4586259 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggtcgacaatct 4586332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146405
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  36146478 cattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 36146405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47676304 - 47676133
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47676304 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47676207  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |  |||||||||| |||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47676206 caatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 47676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864413
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
      |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43864342 aattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 43864413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 1113552 - 1113828
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtc 106  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||    || || ||||||||||||||    
T  1113552 caaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtc 1113649  T
Q  107 ttg-------gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgt 196  Q
    |||       ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||    
T  1113650 ttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gt 1113747  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  1113748 aagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct 1113828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495980
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||| |    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  496050 tgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct 495980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 23565112  T
Q  224 gtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    |   ||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565111 gatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759195
Alignment:
Q  132 aattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaa 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaa 2759242  T
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 277  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatc 2759195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4510716 - 4510549
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4510716 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4510619  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||| |||    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4510618 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4512558 - 4512391
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4512558 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4512461  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||| |||    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4512460 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359942
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||| | ||| | ||||||||| |||||     
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttggat 6359968  T
Q  260 cgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  6359967 cgaactgggtcaacaatttcttggtg 6359942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097864
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| ||        ||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct--------aact 12097937  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  12097936 ctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 12097864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 264
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344130
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 264  Q
     |||||| | |||||||||    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344074 attgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22328538 - 22328395
Alignment:
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 225  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| || || |||||||||| |||||     
T  22328538 tagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagaga 22328439  T
Q  226 aaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 269  Q
      ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328438 tcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Original strand, 18396384 - 18396486
Alignment:
Q  172 ttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  18396384 ttgtaacattttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaa 18396483  T
Q  272 aca 274  Q
    |||    
T  18396484 aca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525499
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  24525584 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct 24525499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574517
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaa-ggtagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||||||| ||||||||   ||||  ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36574584 attgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggtaaaca 36574517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 276
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814605
Alignment:
Q  200 aactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 30814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518905
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  204 ctttgatagtgga 216  Q
    | |||| ||||||    
T  31518893 cattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 267
Target Start/End: Original strand, 31518988 - 31519063
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518988 tttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3904780 - 3904624
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtga-acttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||  | ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||||| ||||    
T  3904780 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattga 3904681  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 267  Q
    |||| |||  |||||   |||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3904680 tagt-gatcagagagatcaatctctccctcagagtaggtcattgttggaccgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24515033 - 24514934
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  24515033 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 24514936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 179
Target Start/End: Original strand, 28617182 - 28617234
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  28617182 ggtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 28617234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 236
Target Start/End: Original strand, 5116675 - 5116735
Alignment:
Q  176 aaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcc 236  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  5116675 aaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 40282279 - 40282596
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40282279 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 40282378  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282379 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 40282478  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  40282479 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctct 40282578  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40282579 ccttttatcttgtgattg 40282596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Original strand, 9036329 - 9036637
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036329 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 9036428  T
Q  119 ggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036429 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 9036528  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccct--tttata 316  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  9036529 gaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatc 9036628  T
Q  317 ttgtgattg 325  Q
    |||||||||    
T  9036629 ttgtgattg 9036637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 9987104 - 9987421
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9987104 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 9987203  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9987204 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaagaactcatt 9987302  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg-cttttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9987303 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctc 9987402  T
Q  307 cccttttatattgtgattg 325  Q
     |||||||| |||||||||    
T  9987403 tccttttatcttgtgattg 9987421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 21053860 - 21054177
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21053860 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtctt 21053959  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053960 ggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 21054059  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcc 307  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  21054060 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctct 21054159  T
Q  308 ccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21054160 ccttttatcttgtgattg 21054177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 44203547 - 44203852
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203547 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 44203646  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44203647 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 44203746  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  44203747 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttg 44203846  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  44203847 tgattg 44203852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20622504 - 20622186
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  20622504 caaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtctt 20622405  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatccctttt--gtaagaactct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20622404 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactct 20622306  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccct 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20622305 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccct 20622206  T
Q  306 ccccttttatattgtgattg 325  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  20622205 ctccttttatcttgtgattg 20622186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 51765290 - 51765611
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  51765290 caaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtctt 51765388  T
Q  109 g------gtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgta 197  Q
    |      ||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  51765389 gttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgta 51765488  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  51765489 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcc 51765587  T
Q  298 tcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  51765588 tcttccctctccttttatcttgtg 51765611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  106 cttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316423 tcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550765
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8550854 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttttct 8550765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 20762567 - 20762844
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||| |||    
T  20762567 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatct 20762664  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       ||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||    
T  20762665 tgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttc-gt 20762762  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20762763 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 20762844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297964
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298045 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 42297964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168465
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168395 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189502
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3189427  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189428 cattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198319
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3198244  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198245 cattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3198319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207158
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaact 3207083  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3207084 cattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3207158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547090
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547159 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265551
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28265624 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834164
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 834235  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  834234 tgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136427
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgct 287  Q
    | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  29136345 cattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaac-atttcttggtgct 29136427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348865
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11348796 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549001
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13549070 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220223
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28220296 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255340
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47255410 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37033143 tcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 3156865 - 3157036
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3156865 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3156962  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3156963 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 3157036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455331
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaact 44455257  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  44455258 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacgatct 44455331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482231
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7482301 tcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115340
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     | |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47115269 ccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552634
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaagaact 4552708  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||| ||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4552707 cattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925708
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31925777 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45644424 cattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918521
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49918448 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 49918521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223418
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28223491 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503554
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacctt--gtatctcttt-gtaagaactc 37503627  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  37503626 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct 37503554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 31659143 - 31659409
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  31659143 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 31659240  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  |    
T  31659241 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacttat 31659338  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31659339 tgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193778
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  193709 cattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555248
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  23555335 cattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-ttggatcgaactgagtaaac-atttcttggtgcgtttgttt 23555248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50167245 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169207
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  50169280 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 50169207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13659582 - 13659333
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  13659582 tctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacgg 13659484  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13659483 atagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 13659386  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
       ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13659385 atcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 197171 - 196904
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  197171 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 197074  T
Q  110 gtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |    
T  197073 gtgagattgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 196976  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  196975 tgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 196904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 270  Q
    || ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 46064921 - 46065089
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||| |    
T  46064921 gtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcat 46065018  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  46065019 tcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754664
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19754592 tcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaat 19754664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3847367 - 3847118
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  3847367 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgg 3847269  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||  ||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3847268 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 3847171  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
        |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3847170 atccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 3847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559864
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaac 37559940  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || ||||||||| |||||||||   ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  37559939 tcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 37559864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaa 251  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833620 cattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361101
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 41361011  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    | |||||||||||||  ||||   ||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  41361012 cgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 41361101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 250
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattga 22079420  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtca 250  Q
    || ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||    
T  22079421 tattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 15820338 - 15820455
Alignment:
Q  138 ggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctc 235  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  15820338 ggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctc 15820436  T
Q  236 ctccagagtaggtcaagtt 254  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15820437 atccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  107 ttggtgagattggg-aaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19752782  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || ||||||| |||||||||||   ||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19752783 tcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242472
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476443
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30476517  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||| ||||||||| ||   ||||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30476516 cattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 30476443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 928130 - 927977
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  928130 aaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactcattaatagtggatt 928032  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||   || |||| | |||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  928031 agagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggtaaaca 927977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282701
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||  |||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggatt 37282747  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 265  Q
    ||||||  |||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||    
T  37282746 ggagagataaatctctcctttggagtaggtcaa-tttggactgaact 37282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122193
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactctt 40122266  T
Q  207 tg--atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||  |||||||||| |||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  40122265 tgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 40122193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13138142 - 13137973
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||     
T  13138142 ttggtgagattga-aaaatggatagaaattagg--tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaaca 13138047  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13138046 cattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879005
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacct 37879005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871143
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaacc 8871143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683866
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttg 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||    
T  36683766 tttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactgagtaaac-atctcttggtgtgtttg 36683863  T
Q  292 ttt 294  Q
    |||    
T  36683864 ttt 36683866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876767
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37876848 tttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 10925223 - 10925397
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt---aaga 200  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||   ||||    
T  10925223 ttggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaaga 10925320  T
Q  201 actctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | || ||||||||||||||||||    ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10925321 attcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 10925397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  129 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttt 193  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455739
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 16455739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 188
Target Start/End: Original strand, 32736953 - 32737015
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32736953 ggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 188
Target Start/End: Original strand, 35109494 - 35109556
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 188  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35109494 ggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacctatttgtatc 35109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460815
Alignment:
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||   ||||||   |||||||| ||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgatt 3460809  T
Q  219 ggagag 224  Q
    ||||||    
T  3460810 ggagag 3460815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460046
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtag 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||   |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||| || |||||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaacattttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318585
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| ||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattga 12318587  T
Q  210 ta 211  Q
    ||    
T  12318586 ta 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Original strand, 15916626 - 15916671
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 275  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15916626 tctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgggtaaacaa 15916671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31422906 - 31422862
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 275  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31422906 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgagctgggtgaacaa 31422862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808571
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||||||||||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagag 6808571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 6266593 - 6266907
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtctt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6266593 caaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtctt 6266692  T
Q  109 ggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266693 ggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcttt 6266792  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg-cttttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6266793 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctc 6266892  T
Q  307 cccttttatattgtg 321  Q
     || ||||| |||||    
T  6266893 tccgtttatcttgtg 6266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12647639 - 12647334
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647639 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 12647540  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12647539 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 12647440  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  12647439 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttg 12647340  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  12647339 tgattg 12647334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13656221 - 13655977
Alignment:
Q  86 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13656221 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13656122  T
Q  186 atcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttgg 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13656121 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 13656022  T
Q  284 tgctt-ttgttttcttcttccctcccct--tttatattgtgattg 325  Q
    || || |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  13656021 tgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg 13655977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4484604 - 4484284
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  4484604 caaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtct 4484506  T
Q  108 tg------gtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||      |||| |||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4484505 tgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgta 4484407  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  4484406 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttct 4484308  T
Q  298 tcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  4484307 tcttccctctccttttatcttgtg 4484284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 32289467 - 32289780
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  32289467 caaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 32289565  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  32289566 tggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 32289663  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
    ||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||    
T  32289664 ttgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccc 32289763  T
Q  305 tccccttttatattgtg 321  Q
    || |||||||| |||||    
T  32289764 tctccttttatcttgtg 32289780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 30833240 - 30833560
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| |  |||||||||||||||    
T  30833240 caaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtct 30833338  T
Q  108 tg------gtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||      ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30833339 tgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgta 30833437  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  30833438 agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcc 30833536  T
Q  298 tcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  30833537 tcttccctctccttttatcttgtg 30833560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4503405 - 4503129
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  4503405 caaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 4503308  T
Q  108 tggt-------gagattgggaaaa--tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt 196  Q
    || |       |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||       
T  4503307 tgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-- 4503211  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503210 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 4503129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 45099650 - 45099926
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  45099650 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 45099747  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||       
T  45099748 tgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-- 45099844  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099845 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45099926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36205936 - 36205661
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  36205936 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 36205839  T
Q  108 tg-------gtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   |    
T  36205838 tgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--a 36205742  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205741 agaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36205661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5723517 - 5723252
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  5723517 aactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 5723420  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  5723419 tgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 5723322  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723321 atagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 5723252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2334586 - 2334414
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  2334586 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt-gtaagaact 2334489  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2334488 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6595002
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6595077 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 6595002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36988338 - 36988072
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |    
T  36988338 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 36988241  T
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    || |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  36988240 tgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt 36988143  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988142 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36988072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727096
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45727027 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868040
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  29867967 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 29868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34140017 - 34139767
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||    
T  34140017 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 34139919  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34139918 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 34139820  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
       ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34139819 atcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446885
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35446954 cattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 278
Target Start/End: Original strand, 38312159 - 38312411
Alignment:
Q  36 ggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  38312159 ggttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 38312257  T
Q  125 tgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgga 221  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38312258 tgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatctcattgatagtggattgga 38312355  T
Q  222 gagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||   ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38312356 gagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 723909 - 723741
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  723909 gtgagattggaaaactgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 723812  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  723811 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14633991 - 14633822
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14633991 gtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcat 14633893  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  14633892 agatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 14633822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtag-aaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36773660 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648340
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||   |||||||| ||||    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattga 33648275  T
Q  210 tagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33648276 tagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 42362257 - 42362500
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  42362257 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattt 42362354  T
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  42362355 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 42362452  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtt 254  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362453 tgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151588
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||| |||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11151661 cttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631735
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 272  Q
    | ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1631802 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17057537 - 17057366
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17057537 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17057440  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17057439 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17057366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17085520 - 17085349
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17085520 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17085423  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17085422 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17085349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318006
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36318079 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690672
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |    
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaaatcgt 11690601  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  11690602 tgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 11690672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398237
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaa--aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    || |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  24398155 tcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtg 24398237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288099
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgct 287  Q
    | |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  42288180 cattgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaataatttcttggtgct 42288099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||     
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc-tttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctcca 240  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  13121867 ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162447
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | ||||||||||||| |||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33162520 cattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 33162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353351
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatct-ttttgtaagtactc 26353282  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     |||||||||||||||||||   | |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26353283 attgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaaca 26353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067476
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 11067402  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | || ||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11067403 catttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct 11067476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490149
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggac 17490164  T
Q  260 cgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||| ||||    
T  17490163 cgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactc 7815343  T
Q  205 tttgatagtggattggagag 224  Q
     || ||||||||||||||||    
T  7815342 atttatagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285007
Alignment:
Q  200 aactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 11049550 - 11049721
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttc---attgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| |||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||| | |||||||||    
T  11049550 ttggtgagattaggaaaatggtataaattagggtttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctc-tttgtaaga 11049648  T
Q  201 actctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||   |||||||||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  11049649 actcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataataggtcaa-attggactgaactgggtaaaca 11049721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 278
Target Start/End: Original strand, 17450671 - 17450748
Alignment:
Q  199 gaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17450671 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 274
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451284
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga- 7451269  T
Q  260 cgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||||||||    
T  7451270 cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  165 taatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 263  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Original strand, 24885669 - 24885734
Alignment:
Q  115 attgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24885669 attgggaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc 24885734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14202569 - 14202501
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14202569 tgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac 14202501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Original strand, 42064725 - 42064770
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 275  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42064725 tctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaa 42064770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Original strand, 1345590 - 1345653
Alignment:
Q  230 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  1345590 tctctcccccagagtaggtcatatt-ggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgttt 1345653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 8395519 - 8395804
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395519 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 8395618  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgga 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8395619 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 8395718  T
Q  222 gagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  8395719 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 8395804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 8393310 - 8393595
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393310 ctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 8393409  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgga 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8393410 aagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 8393509  T
Q  222 gagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctc 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  8393510 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 8393595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 5138204 - 5138496
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138204 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 5138303  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattg 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5138304 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 5138403  T
Q  220 gagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  5138404 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 5138496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 5135978 - 5136271
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135978 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 5136077  T
Q  122 aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5136078 aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 5136177  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  5136178 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 5136271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 7124815 - 7125122
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124815 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 7124914  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7124915 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 7125014  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |    
T  7125015 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatct 7125114  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  7125115 tgtgattg 7125122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 7122596 - 7122903
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122596 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 7122695  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7122696 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 7122795  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatat 317  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||   ||||| |    
T  7122796 ggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatct 7122895  T
Q  318 tgtgattg 325  Q
    ||||||||    
T  7122896 tgtgattg 7122903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31495583 - 31495275
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  31495583 caaagggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtct 31495485  T
Q  108 tggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  31495484 tggtgagattgggaaaagggtagaaattaggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 31495386  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccc 304  Q
     |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31495385 attgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccc 31495286  T
Q  305 tccccttttat 315  Q
    || ||||||||    
T  31495285 tctccttttat 31495275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13992559 - 13992289
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  13992559 caaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 13992461  T
Q  108 tggtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  13992460 tggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt--gtaagaact 13992364  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992363 cattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct 13992289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30000068 - 29999806
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------g 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||       |    
T  30000068 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattgg 29999971  T
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttg 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  29999970 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattg 29999872  T
Q  209 atagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999871 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29999806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 56178882 - 56178633
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg- 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||| ||     
T  56178882 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggg 56178784  T
Q  128 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 225  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  56178783 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaga 56178686  T
Q  226 aaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178685 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 56178633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095361
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095432 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat 52095361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 285
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209893
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209815 tgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 2209893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 48142947 - 48143215
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 109  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  48142947 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 48143044  T
Q  110 gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||     
T  48143045 gtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttca-taagaactca 48143142  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48143143 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 48143215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5370232 - 5370079
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 222  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||    
T  5370232 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggactagag 5370135  T
Q  223 agtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5370134 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 5370079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 271
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 271  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927455
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9927529  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  9927528 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 9927455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739547
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12739620 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36463459 ctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364414
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    | || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  26364334 cattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtg 26364414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703669
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  46703598 tcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883198
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    | ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54883118 cattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtg 54883198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactct 46147460  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46147459 ttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648306
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8648237 cattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073560
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  12073490 cattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743922
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12743976  T
Q  224 gtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12743975 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745311
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12745365  T
Q  224 gtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12745364 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175633
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggt-agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26175706 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34570582 - 34570411
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt-ttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  34570582 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaact 34570485  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  34570484 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 34570411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632612
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40632543 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639593
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41639524 catcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893635
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaag 199  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  200 aactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48893712 aactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 50262865 - 50262690
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  50262865 tgagattgggaaaatggatcgaaattacggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 50262768  T
Q  208 gatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    |||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262767 gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 50262690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542180
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaa--tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 202  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  203 tctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6542250 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 6542180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994693
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaact 36994621  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36994622 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| ||||     
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaaggactca 47038480  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47038479 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379548
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  |    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  379481 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 6655959 - 6656123
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  6655959 gtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 6656056  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6656057 tgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtt 254  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  8665506 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416962
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27417035 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggta-gaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||    |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45687252 cattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 5429574 - 5429850
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgt---agagagaatcattgagtgtc 106  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||    
T  5429574 caaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtc 5429671  T
Q  107 ttg-------gtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgt 196  Q
    |||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||    
T  5429672 ttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gt 5429769  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5429770 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229722
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  205 tttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
     || ||||||||||||||||   |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37229790 atttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtaaaca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50674011 - 50673848
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||   || |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  50674011 gtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattg--tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 50673915  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50673914 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 285
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119718
Alignment:
Q  109 ggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactct 205  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||     
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  206 ttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 285  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12119640 tttatagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtg 12119718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5871991
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5871918 ctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474318
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31474248  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31474249 cattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 37740625 - 37740794
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  37740625 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 37740722  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  37740723 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaat 37740794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199906
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54199977  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    | ||||||||| ||| |||||   | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54199976 cattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaag-ttgga-cgaactgggtcaacaat 54199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52467519 - 52467351
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||| |||| ||    
T  52467519 gtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactttt 52467422  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52467421 tgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588126
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4588057 cattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttggaccaaactgggtaaaca 4588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747806
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12747827  T
Q  204 ctttgatagtggattggagag 224  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  12747826 cattgatagtggattggagag 12747806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082660
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52082728  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    |||||||||||       |||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  52082727 ctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct 52082660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207843
Alignment:
Q  114 gattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactctttgata 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||  ||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactcattgata 5207905  T
Q  212 gtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    |||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5207904 gtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 35662441 - 35662600
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  35662441 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 35662538  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 266  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662539 cattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744097
Alignment:
Q  126 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 223  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12744098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745486
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 12745507  T
Q  204 ctttgatagtggattggagag 224  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  12745506 cattgatagtggattggagag 12745486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699447
Alignment:
Q  133 attagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaat 230  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||| ||||||||||||   |||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaat 26699486  T
Q  231 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 269  Q
    ||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699485 ctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 24969209  T
Q  204 ctttgatagtggattggagag 224  Q
      |||||||||||||||||||    
T  24969210 aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 278
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254665
Alignment:
Q  192 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29254580 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29254665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13009536 - 13009441
Alignment:
Q  181 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  13009536 tttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtgtcaacaatct 13009441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtca 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   || ||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 51337064 - 51337231
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattaggg-tttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| |||||| ||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  51337064 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagctttt-aagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaact 51337161  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | ||||||||| ||| |||||   |||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51337162 cattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142473
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc 48142473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 278
Target Start/End: Original strand, 3913451 - 3913618
Alignment:
Q  110 gtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  |||| |||||||||| |    
T  3913451 gtgagattgggaaaatgagtagaaattagagct-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttttaacccatttgtatatcttt-gtaagaactcat 3913548  T
Q  207 tgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||| || ||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  3913549 tgatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagagtatgtaaag-ttgtatcgaactgggtcaacaatct 3913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967829
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||   || ||||| ||||     
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctctttgtaaaaaactcgttgag 44967893  T
Q  211 agtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||| |||| ||| |   ||||||||| ||||| || ||||   ||||||||| |||||| ||||    
T  44967892 agtagattagagggatcaatctctcccccagaataagtcactgttggaccgacctgggtaaaca 44967829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 152
Target Start/End: Original strand, 29056363 - 29056403
Alignment:
Q  112 gagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  29056363 gagattgggaaaatggtaggaattagagtttgttctttgtg 29056403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Original strand, 33089933 - 33090021
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggt 248  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  33089933 aagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55085532 - 55085445
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgt-aaccttttgtatcccttt 193  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  55085532 ttggtgagattggaaaataggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctcttt 55085445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2857 - 2552
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 2758  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2757 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 2658  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  2657 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttg 2558  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  2557 tgattg 2552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3979 - 3674
Alignment:
Q  23 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3979 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 3880  T
Q  123 aatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3879 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 3780  T
Q  221 agagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattg 319  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  3779 agagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttg 3680  T
Q  320 tgattg 325  Q
    ||||||    
T  3679 tgattg 3674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Original strand, 6186 - 6478
Alignment:
Q  21 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6186 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6285  T
Q  121 aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6286 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 6385  T
Q  219 ggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctcccctt 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  6386 ggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgttattgttttcttcttccctctcctt 6478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11115
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  11435 caaagggagtaactctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtct 11337  T
Q  108 tg------gtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||      ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11336 tgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgta 11238  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  11237 agaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcc 11139  T
Q  298 tcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  11138 tcttccctctccttttatcttgtg 11115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9009 - 8689
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcattgagtgtct 107  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  ||| |  || ||||||||||||    
T  9009 caaagggagtaactctaggctttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattgagtgtct 8911  T
Q  108 tg------gtgagattggga--aaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||      ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8910 tgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgta 8812  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttttct 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  8811 agaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgttttcc 8713  T
Q  298 tcttccctccccttttatattgtg 321  Q
    |||||||||  ||||||| |||||    
T  8712 tcttccctcttcttttatcttgtg 8689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 434428 - 434703
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  434428 caaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 434525  T
Q  108 tg-------gtgagattggg--aaaatggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgt 196  Q
    ||       |||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  434526 tgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gt 434623  T
Q  197 aagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434624 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 294
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11745
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaa-tggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgttt 294  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11655 cattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 11745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 22239 - 22286
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 59  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22239 caaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 812 - 1087
Alignment:
Q  11 caaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtct 107  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  812 caaaggcagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtct 909  T
Q  108 tg------gtgagattgggaaaat--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgta 197  Q
    ||      |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |    
T  910 tgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--a 1006  T
Q  198 agaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1007 acaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 278
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  114700 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18004
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18074 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20414
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 276  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20485 ctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 20414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7494
Alignment:
Q  107 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  204 ctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    | |||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7425 cattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 149343 - 149094
Alignment:
Q  39 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg---tagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaatgg 127  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  149343 tctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacgg 149245  T
Q  128 -tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 224  Q
     |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  149244 atagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 149147  T
Q  225 taaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 278  Q
       ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  149146 atcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10656
Alignment:
Q  131 aaattagggtttgttcattgtgaact--tgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||       
T  10515 aaattagggtttgttctttgtgagctcttgt---gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattgaagagatc 10610  T
Q  228 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10611 aatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 325
Target Start/End: Original strand, 1 - 85
Alignment:
Q  242 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctccccttttatattgtgattg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattg 85  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80338
Alignment:
Q  111 tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| |     
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcata 80350  T
Q  208 gatagtggattg 219  Q
    ||||||| ||||    
T  80349 gatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27556 - 27453
Alignment:
Q  161 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaaaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 259  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   || ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||   ||||||    
T  27556 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggac 27457  T
Q  260 cgaa 263  Q
    ||||    
T  27456 cgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University