View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1588_high_6 (Length: 215)

Name: NF1588_high_6
Description: NF1588
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1588_high_6
NF1588_high_6
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (18-210)||(16204463-16204655)
chr1 (18-210)||(10966302-10966494)
chr1 (18-210)||(20336845-20337037)
chr1 (18-209)||(10948714-10948905)
chr1 (18-210)||(28153373-28153565)
chr1 (18-210)||(28588622-28588814)
chr1 (18-210)||(21894177-21894369)
chr1 (18-210)||(3644773-3644965)
chr1 (18-210)||(41789739-41789931)
chr1 (19-206)||(51641856-51642043)
chr1 (18-210)||(20464613-20464805)
chr1 (25-142)||(22489665-22489782)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (18-209)||(24588849-24589040)
chr7 (18-210)||(2158206-2158398)
chr7 (18-210)||(16747831-16748023)
chr7 (18-210)||(45390852-45391044)
chr7 (18-210)||(2106477-2106669)
chr7 (18-210)||(5162015-5162207)
chr7 (18-210)||(10913183-10913375)
chr7 (18-210)||(11421093-11421285)
chr7 (18-210)||(26316162-26316354)
chr7 (18-210)||(26666228-26666420)
chr7 (18-203)||(16044947-16045132)
chr7 (25-210)||(31127546-31127731)
chr7 (18-210)||(2776886-2777078)
chr7 (18-210)||(4141560-4141752)
chr7 (18-210)||(26512010-26512202)
chr7 (18-210)||(26681420-26681612)
chr7 (18-210)||(39209453-39209645)
chr7 (18-210)||(3448938-3449130)
chr7 (18-210)||(4203021-4203213)
chr7 (18-210)||(5131628-5131820)
chr7 (18-210)||(16446320-16446512)
chr7 (18-210)||(16514744-16514936)
chr7 (18-210)||(22145827-22146019)
chr7 (18-210)||(26271400-26271592)
chr7 (18-210)||(26534187-26534379)
chr7 (18-210)||(31086936-31087128)
chr7 (18-209)||(11444519-11444710)
chr7 (18-210)||(31560704-31560896)
chr7 (19-210)||(26516425-26516616)
chr7 (18-210)||(5143654-5143846)
chr7 (18-206)||(26438889-26439077)
chr7 (18-210)||(45734945-45735131)
chr7 (18-210)||(10842308-10842500)
chr7 (18-210)||(10845252-10845444)
chr7 (25-117)||(2557174-2557266)
chr7 (25-117)||(15193722-15193814)
chr7 (25-117)||(16127225-16127317)
chr7 (25-117)||(29090155-29090247)
chr7 (27-81)||(797966-798020)
chr7 (20-80)||(1893019-1893079)
chr7 (20-142)||(25727130-25727252)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (18-209)||(30554389-30554580)
chr6 (18-210)||(8902075-8902267)
chr6 (18-210)||(13295323-13295515)
chr6 (18-210)||(14141766-14141958)
chr6 (18-210)||(16753453-16753645)
chr6 (18-210)||(24302129-24302321)
chr6 (18-210)||(26789448-26789640)
chr6 (18-210)||(27011363-27011555)
chr6 (18-210)||(27061138-27061330)
chr6 (18-210)||(27197817-27198009)
chr6 (18-210)||(27251226-27251418)
chr6 (18-210)||(28164123-28164315)
chr6 (18-210)||(29553189-29553381)
chr6 (18-209)||(16940400-16940591)
chr6 (19-210)||(34460878-34461069)
chr6 (25-210)||(27286736-27286921)
chr6 (18-210)||(3699715-3699907)
chr6 (18-210)||(13520564-13520756)
chr6 (18-210)||(26922009-26922201)
chr6 (18-210)||(27022768-27022960)
chr6 (18-210)||(27358482-27358674)
chr6 (18-210)||(27448825-27449017)
chr6 (18-210)||(27488765-27488957)
chr6 (18-210)||(29505048-29505240)
chr6 (18-210)||(4528917-4529109)
chr6 (18-210)||(4720507-4720699)
chr6 (18-210)||(4776512-4776704)
chr6 (18-210)||(16677772-16677964)
chr6 (18-210)||(22931256-22931448)
chr6 (18-210)||(23853701-23853893)
chr6 (18-210)||(24867348-24867540)
chr6 (18-210)||(26112784-26112976)
chr6 (18-210)||(28211086-28211278)
chr6 (18-210)||(29576646-29576838)
chr6 (18-210)||(33372803-33372995)
chr6 (18-210)||(4542146-4542338)
chr6 (18-210)||(27626083-27626275)
chr6 (18-191)||(27180088-27180261)
chr6 (18-191)||(27268978-27269151)
chr6 (18-210)||(4761395-4761587)
chr6 (18-210)||(26774999-26775191)
chr6 (18-210)||(15420692-15420884)
chr6 (18-210)||(17088815-17089007)
chr6 (19-210)||(20172180-20172371)
chr6 (19-210)||(22163620-22163811)
chr6 (60-210)||(15408905-15409055)
chr6 (18-86)||(22455610-22455678)
chr6 (25-117)||(18120108-18120200)
chr6 (25-117)||(18212134-18212226)
chr6 (25-142)||(23971210-23971327)
chr6 (20-140)||(25707645-25707765)
chr6 (20-80)||(27545536-27545596)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (18-209)||(33520022-33520213)
chr5 (20-209)||(5641432-5641621)
chr5 (18-210)||(25203920-25204112)
chr5 (18-210)||(25268075-25268267)
chr5 (18-210)||(8661801-8661993)
chr5 (18-210)||(9547035-9547227)
chr5 (18-210)||(18124742-18124934)
chr5 (18-210)||(30155673-30155865)
chr5 (18-210)||(33296170-33296362)
chr5 (18-206)||(41678347-41678535)
chr5 (18-210)||(3793183-3793375)
chr5 (18-210)||(9321118-9321310)
chr5 (18-210)||(11552997-11553189)
chr5 (18-210)||(13183119-13183311)
chr5 (18-210)||(23629612-23629804)
chr5 (18-210)||(24587016-24587208)
chr5 (18-210)||(26484036-26484228)
chr5 (18-210)||(31435106-31435298)
chr5 (18-210)||(37767317-37767509)
chr5 (18-209)||(22892105-22892296)
chr5 (18-210)||(12135817-12136009)
chr5 (18-210)||(18497051-18497243)
chr5 (18-210)||(22995443-22995635)
chr5 (18-206)||(30033070-30033258)
chr5 (18-210)||(30172111-30172303)
chr5 (18-210)||(33878772-33878964)
chr5 (18-210)||(40469876-40470068)
chr5 (18-210)||(6877947-6878139)
chr5 (18-210)||(13439009-13439201)
chr5 (18-210)||(24973548-24973740)
chr5 (18-210)||(28956111-28956303)
chr5 (18-210)||(30938277-30938469)
chr5 (18-210)||(37354969-37355161)
chr5 (18-210)||(37667812-37668004)
chr5 (18-206)||(37758625-37758813)
chr5 (19-206)||(24727612-24727799)
chr5 (18-203)||(15655091-15655276)
chr5 (18-210)||(2514704-2514896)
chr5 (18-210)||(11327279-11327471)
chr5 (18-210)||(13321156-13321348)
chr5 (18-206)||(18371864-18372052)
chr5 (19-210)||(31822733-31822924)
chr5 (18-210)||(33781131-33781319)
chr5 (18-210)||(28652884-28653076)
chr5 (18-210)||(34620160-34620352)
chr5 (18-210)||(43081897-43082089)
chr5 (18-210)||(32592600-32592792)
chr5 (18-206)||(15755182-15755370)
chr5 (18-210)||(29887523-29887715)
chr5 (25-117)||(3483622-3483714)
chr5 (20-80)||(20388445-20388505)
chr5 (27-87)||(34469273-34469333)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (18-209)||(21973349-21973540)
chr4 (18-209)||(31122942-31123133)
chr4 (18-210)||(15231520-15231712)
chr4 (18-210)||(27159746-27159938)
chr4 (18-210)||(1903902-1904094)
chr4 (18-210)||(33670229-33670421)
chr4 (18-210)||(40102066-40102258)
chr4 (19-210)||(54837040-54837231)
chr4 (18-210)||(5009523-5009715)
chr4 (18-210)||(6573506-6573698)
chr4 (18-210)||(18313607-18313799)
chr4 (18-210)||(20334850-20335042)
chr4 (18-210)||(24116310-24116502)
chr4 (18-210)||(24588790-24588982)
chr4 (18-210)||(34185389-34185581)
chr4 (18-210)||(17016694-17016886)
chr4 (18-210)||(18797043-18797235)
chr4 (18-206)||(14102191-14102379)
chr4 (18-206)||(36340950-36341138)
chr4 (19-209)||(30757409-30757599)
chr4 (18-183)||(14759762-14759927)
chr4 (18-210)||(14668664-14668856)
chr4 (18-210)||(39854285-39854477)
chr4 (54-210)||(5698219-5698375)
chr4 (18-210)||(15281366-15281558)
chr4 (63-209)||(15384778-15384924)
chr4 (25-137)||(14725301-14725413)
chr4 (25-117)||(19767994-19768086)
chr4 (20-80)||(1881658-1881718)
chr4 (25-69)||(15387948-15387992)
chr4 (20-80)||(18044709-18044769)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (18-209)||(18228792-18228983)
chr3 (18-210)||(5714669-5714861)
chr3 (18-210)||(5725579-5725771)
chr3 (18-210)||(5766597-5766789)
chr3 (18-210)||(11106831-11107023)
chr3 (18-210)||(17981421-17981613)
chr3 (18-210)||(18304126-18304318)
chr3 (18-210)||(18334226-18334418)
chr3 (18-210)||(22384050-22384242)
chr3 (18-210)||(4627381-4627573)
chr3 (18-210)||(6205499-6205691)
chr3 (18-206)||(8215331-8215519)
chr3 (18-210)||(18273524-18273716)
chr3 (18-210)||(18288825-18289017)
chr3 (18-210)||(19698086-19698278)
chr3 (18-210)||(28112426-28112618)
chr3 (18-210)||(32294224-32294416)
chr3 (20-210)||(20069638-20069828)
chr3 (18-210)||(4343148-4343340)
chr3 (18-210)||(4725227-4725419)
chr3 (18-210)||(4793107-4793299)
chr3 (18-210)||(21678299-21678491)
chr3 (18-210)||(24331759-24331951)
chr3 (18-210)||(31032708-31032900)
chr3 (18-206)||(32442747-32442935)
chr3 (19-210)||(47027050-47027241)
chr3 (18-210)||(4687251-4687443)
chr3 (18-210)||(5017310-5017502)
chr3 (18-210)||(5605786-5605978)
chr3 (18-210)||(5653681-5653873)
chr3 (18-210)||(7076802-7076994)
chr3 (18-210)||(8285942-8286134)
chr3 (18-210)||(10399740-10399932)
chr3 (18-210)||(15737566-15737758)
chr3 (18-210)||(15889177-15889369)
chr3 (18-210)||(18054858-18055050)
chr3 (18-210)||(28342773-28342965)
chr3 (18-210)||(35884362-35884554)
chr3 (19-209)||(51785620-51785810)
chr3 (25-210)||(8299574-8299759)
chr3 (18-210)||(4420511-4420703)
chr3 (18-210)||(5470584-5470776)
chr3 (18-210)||(5592829-5593021)
chr3 (18-210)||(29145228-29145420)
chr3 (18-210)||(31960927-31961119)
chr3 (19-210)||(20573315-20573506)
chr3 (18-210)||(6539214-6539406)
chr3 (18-210)||(18246337-18246529)
chr3 (18-210)||(22867320-22867512)
chr3 (18-210)||(22882379-22882571)
chr3 (18-210)||(28024878-28025070)
chr3 (18-210)||(48469523-48469715)
chr3 (18-210)||(29661442-29661634)
chr3 (18-210)||(8000156-8000348)
chr3 (18-210)||(10646669-10646861)
chr3 (18-206)||(16620966-16621154)
chr3 (83-210)||(17973333-17973460)
chr3 (18-87)||(17992526-17992595)
chr3 (25-117)||(11924923-11925015)
chr3 (25-117)||(7088592-7088684)
chr3 (25-117)||(16432008-16432100)
chr3 (25-117)||(22960056-22960148)
chr3 (20-80)||(4450373-4450433)
chr3 (27-87)||(20443722-20443782)
chr3 (25-80)||(6571957-6572012)
chr3 (27-80)||(15919122-15919175)
chr3 (25-117)||(15705076-15705168)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (18-209)||(16825757-16825948)
chr2 (18-209)||(16895532-16895723)
chr2 (18-210)||(21699589-21699781)
chr2 (18-210)||(37682313-37682505)
chr2 (18-210)||(37697578-37697770)
chr2 (18-210)||(40237142-40237334)
chr2 (18-210)||(11631602-11631794)
chr2 (18-210)||(27779868-27780060)
chr2 (18-210)||(27819625-27819817)
chr2 (18-210)||(34158478-34158670)
chr2 (18-210)||(34294788-34294980)
chr2 (18-210)||(37929003-37929195)
chr2 (18-210)||(39048237-39048429)
chr2 (18-210)||(13932965-13933157)
chr2 (18-210)||(20841547-20841739)
chr2 (18-210)||(22924566-22924758)
chr2 (18-210)||(27120158-27120350)
chr2 (18-210)||(31879920-31880112)
chr2 (18-210)||(31889909-31890101)
chr2 (18-210)||(34865318-34865510)
chr2 (18-209)||(3786127-3786318)
chr2 (19-210)||(27807338-27807529)
chr2 (18-210)||(257071-257263)
chr2 (18-210)||(12659170-12659362)
chr2 (18-210)||(19412919-19413111)
chr2 (18-206)||(21673597-21673785)
chr2 (18-210)||(27430859-27431051)
chr2 (18-210)||(32053437-32053629)
chr2 (18-210)||(34271338-34271530)
chr2 (18-210)||(37948280-37948472)
chr2 (19-210)||(12590443-12590634)
chr2 (18-210)||(9346404-9346596)
chr2 (18-210)||(16165114-16165306)
chr2 (18-210)||(23124987-23125178)
chr2 (18-210)||(28885913-28886105)
chr2 (18-206)||(37381311-37381499)
chr2 (19-210)||(12713019-12713210)
chr2 (18-210)||(19452841-19453033)
chr2 (25-209)||(27395203-27395387)
chr2 (18-206)||(39893703-39893891)
chr2 (25-117)||(34701717-34701809)
chr2 (25-117)||(42394176-42394268)
chr2 (20-80)||(26723824-26723884)
chr2 (20-80)||(34533991-34534051)
chr2 (18-53)||(27828094-27828129)
chr2 (27-81)||(21760162-21760216)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (18-210)||(19657731-19657923)
chr8 (18-210)||(18713118-18713310)
chr8 (18-210)||(31358162-31358354)
chr8 (18-210)||(15771208-15771400)
chr8 (18-210)||(19204752-19204944)
chr8 (18-210)||(19691732-19691924)
chr8 (18-210)||(14561258-14561450)
chr8 (18-210)||(27605295-27605487)
chr8 (18-210)||(29832960-29833152)
chr8 (27-210)||(18794347-18794530)
chr8 (18-209)||(19678081-19678272)
chr8 (18-210)||(2133650-2133842)
chr8 (18-210)||(12089113-12089305)
chr8 (18-206)||(31486265-31486453)
chr8 (18-210)||(44564618-44564810)
chr8 (18-210)||(28358342-28358534)
chr8 (18-210)||(33246003-33246195)
chr8 (18-210)||(33262368-33262560)
chr8 (18-210)||(9358259-9358451)
chr8 (25-209)||(22077316-22077500)
chr8 (18-210)||(21344561-21344753)
chr8 (25-117)||(14212680-14212772)
chr8 (25-117)||(22412579-22412671)
chr8 (20-80)||(16768959-16769019)
chr8 (25-117)||(19844808-19844900)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (18-209)||(22621-22812)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (18-210)||(9671-9863)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (18-210)||(7595-7787)
scaffold0143 (18-210)||(30928-31120)
scaffold0143 (18-210)||(19705-19897)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (18-210)||(9657-9849)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (18-210)||(16216-16408)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (18-210)||(11357-11549)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (18-210)||(3702-3894)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (18-210)||(13206-13398)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (18-210)||(9680-9872)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (18-210)||(5608-5800)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (18-210)||(11584-11776)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (25-209)||(22758-22942)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (26-210)||(118762-118946)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (20-185)||(5125-5290)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (25-169)||(43183-43333)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (83-210)||(1979-2109)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (25-117)||(10860-10952)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16204655 - 16204463
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16204655 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcccgctggaagatg 16204556  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16204555 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16204463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 10966302 - 10966494
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966302 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 10966401  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10966402 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10966494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20337037 - 20336845
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20337037 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 20336938  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  20336937 ctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccccttgatgat 20336845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 10948714 - 10948905
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10948714 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 10948813  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10948814 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatga 10948905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28153373 - 28153565
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28153373 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 28153472  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28153473 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 28153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28588622 - 28588814
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28588622 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28588721  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28588722 cttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 28588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21894369 - 21894177
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21894369 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaggttgcacgctggcagatg 21894270  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21894269 ctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21894177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 3644773 - 3644965
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3644773 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 3644872  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3644873 cttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 3644965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41789931 - 41789739
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41789931 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 41789832  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41789831 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 41789739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 51641856 - 51642043
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51641856 ttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgc 51641955  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  51641956 ttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 51642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 20464613 - 20464805
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20464613 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 20464712  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  20464713 ctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 20464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Original strand, 22489665 - 22489782
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || ||| ||||| | ||||    
T  22489665 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgt 22489764  T
Q  125 atgaatatgatattgtgt 142  Q
      || |||||||| ||||    
T  22489765 ccgagtatgatatcgtgt 22489782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24589040 - 24588849
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24589040 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 24588941  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24588940 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 24588849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 2158206 - 2158398
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2158206 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 2158305  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  2158306 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16748023 - 16747831
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16748023 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16747924  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16747923 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16747831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 45390852 - 45391044
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45390852 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 45390951  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45390952 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45391044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2106669 - 2106477
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2106669 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 2106570  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2106569 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2106477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5162015 - 5162207
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  5162015 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcaggtg 5162114  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5162115 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5162207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10913375 - 10913183
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10913375 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 10913276  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10913275 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10913183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11421285 - 11421093
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11421285 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 11421186  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11421185 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 11421093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26316354 - 26316162
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26316354 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 26316255  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26316254 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26666420 - 26666228
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666420 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 26666321  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26666320 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26666228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 16044947 - 16045132
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16044947 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggtagatg 16045046  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctct 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16045047 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 16045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 31127546 - 31127731
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31127546 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgt 31127645  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31127646 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31127731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 2776886 - 2777078
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2776886 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 2776985  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2776986 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2777078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4141752 - 4141560
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4141752 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 4141653  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4141652 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4141560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26512202 - 26512010
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26512202 tttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 26512103  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26512102 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26512010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26681612 - 26681420
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  26681612 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgcgggcagatg 26681513  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26681512 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26681420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39209645 - 39209453
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39209645 tttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 39209546  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39209545 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39209453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 3448938 - 3449130
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3448938 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 3449037  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3449038 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 3449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4203021 - 4203213
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4203021 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaaatatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4203120  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4203121 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4203213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5131628 - 5131820
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  5131628 tttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatg 5131727  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5131728 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5131820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16446512 - 16446320
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16446512 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16446413  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16446412 ctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacctctcgatgat 16446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16514936 - 16514744
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16514936 tttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatagatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16514837  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16514836 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16514744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 22145827 - 22146019
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22145827 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 22145926  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22145927 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcgaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22146019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26271592 - 26271400
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26271592 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttacgggaaagattgcacgctggcagatg 26271493  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26271492 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26271400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26534379 - 26534187
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26534379 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 26534280  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  26534279 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 26534187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31087128 - 31086936
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31087128 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 31087029  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  31087028 cttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 31086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 11444519 - 11444710
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11444519 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 11444618  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11444619 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 11444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31560896 - 31560704
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  31560896 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 31560797  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31560796 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31560704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 26516425 - 26516616
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26516425 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgc 26516524  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26516525 ttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5143846 - 5143654
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5143846 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcagccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 5143747  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  5143746 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctctcgatgat 5143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 26438889 - 26439077
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  26438889 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 26438988  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26438989 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 26439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 45734945 - 45735131
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45734945 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat------tatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 45735038  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45735039 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10842500 - 10842308
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  10842500 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 10842401  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10842400 ctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 10845252 - 10845444
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  10845252 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 10845351  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10845352 ctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10845444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 2557174 - 2557266
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  2557174 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 2557266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 15193722 - 15193814
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  15193722 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 15193814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16127317 - 16127225
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  16127317 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 16127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 29090155 - 29090247
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  29090155 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 29090247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 798020 - 797966
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 81  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  798020 tcatactacttggttgatatctaggatggatccgatcaagtacatctttgagaaa 797966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1893079 - 1893019
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1893079 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 1893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Original strand, 25727130 - 25727252
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgct 119  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| |||||| ||||| |    
T  25727130 tggttaatcacactacttggttgatgtccaaaatggacccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgctggcagatgtt 25727229  T
Q  120 cttgtatgaatatgatattgtgt 142  Q
     |||| ||| |||||||||||||    
T  25727230 attgtctgagtatgatattgtgt 25727252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30554580 - 30554389
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30554580 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 30554481  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30554480 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 30554389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8902267 - 8902075
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  8902267 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaatattgcacgctggcagatg 8902168  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8902167 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8902075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13295515 - 13295323
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13295515 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 13295416  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13295415 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14141958 - 14141766
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14141958 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 14141859  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14141858 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 14141766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 16753453 - 16753645
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16753453 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16753552  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16753553 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16753645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24302321 - 24302129
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24302321 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctgacagatg 24302222  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24302221 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 24302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 26789448 - 26789640
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26789448 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 26789547  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26789548 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26789640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27011363 - 27011555
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27011363 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 27011462  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27011463 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27011555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27061138 - 27061330
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27061138 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 27061237  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27061238 cttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27197817 - 27198009
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27197817 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27197916  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27197917 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27198009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27251418 - 27251226
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27251418 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27251319  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27251318 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27251226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28164123 - 28164315
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28164123 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28164222  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28164223 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28164315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 29553189 - 29553381
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29553189 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 29553288  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29553289 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29553381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16940591 - 16940400
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16940591 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16940492  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16940491 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16940400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34461069 - 34460878
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34461069 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgc 34460970  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34460969 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 34460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27286921 - 27286736
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27286921 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctattactgggaagattgcacgttggcagatgctcttgt 27286822  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27286821 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcctatcaacctcttgatgat 27286736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 3699715 - 3699907
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3699715 tttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 3699814  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3699815 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3699907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13520756 - 13520564
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13520756 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 13520657  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13520656 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13520564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 26922009 - 26922201
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26922009 tttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 26922108  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26922109 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26922201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27022768 - 27022960
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27022768 tttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27022867  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27022868 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27022960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27358674 - 27358482
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27358674 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27358575  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27358574 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27358482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27449017 - 27448825
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27449017 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27448918  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27448917 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27448825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27488765 - 27488957
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27488765 tttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27488864  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27488865 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 29505048 - 29505240
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29505048 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 29505147  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29505148 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4528917 - 4529109
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4528917 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 4529016  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4529017 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4529109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4720699 - 4720507
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4720699 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 4720600  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4720599 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4720507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4776512 - 4776704
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4776512 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4776611  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4776612 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4776704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 16677772 - 16677964
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16677772 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatgtctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 16677871  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16677872 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaagggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22931448 - 22931256
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22931448 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 22931349  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22931348 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23853893 - 23853701
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23853893 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 23853794  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23853793 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23853701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 24867348 - 24867540
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  24867348 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatg 24867447  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  24867448 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26112976 - 26112784
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  26112976 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 26112877  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26112876 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 26112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28211086 - 28211278
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  28211086 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 28211185  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28211186 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 29576646 - 29576838
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29576646 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 29576745  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29576746 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29576838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33372995 - 33372803
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33372995 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 33372896  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33372895 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33372803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4542338 - 4542146
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4542338 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 4542239  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4542238 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccaatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27626275 - 27626083
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  27626275 tttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatg 27626176  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27626175 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 27180088 - 27180261
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  27180088 tttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 27180187  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgc 191  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27180188 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 27180261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27269151 - 27268978
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  27269151 tttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 27269052  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgc 191  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27269051 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 27268978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4761395 - 4761587
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4761395 tttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 4761494  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4761495 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26775191 - 26774999
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26775191 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 26775092  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26775091 cttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26774999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15420884 - 15420692
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  15420884 tttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatg 15420785  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15420784 cttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17089007 - 17088815
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  17089007 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgactgttacagggaagattgcacgatggcagatg 17088908  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17088907 ctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaatggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 17088815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 20172180 - 20172371
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  20172180 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgc 20172279  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  20172280 ttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 20172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22163811 - 22163620
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  22163811 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgc 22163712  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  22163711 ttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 22163620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15409055 - 15408905
Alignment:
Q  60 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  15409055 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaaggga 15408956  T
Q  160 atcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15408955 atcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15408905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22455678 - 22455610
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 86  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455678 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 18120108 - 18120200
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  18120108 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 18120200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18212226 - 18212134
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  18212226 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 18212134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23971327 - 23971210
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| ||||||  | ||| ||||| | ||||    
T  23971327 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgcttgatggcagatgttattgt 23971228  T
Q  125 atgaatatgatattgtgt 142  Q
      || |||||||||||||    
T  23971227 ccgagtatgatattgtgt 23971210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Original strand, 25707645 - 25707765
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgct 119  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||| | || ||||  ||||| || ||| |||||||    
T  25707645 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatttttgagaagcctgctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgct 25707744  T
Q  120 cttgtatgaatatgatattgt 140  Q
     ||||  || |||||||||||    
T  25707745 attgtccgagtatgatattgt 25707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 27545536 - 27545596
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27545536 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 27545596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 33520022 - 33520213
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33520022 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 33520121  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33520122 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 33520213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 5641432 - 5641621
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgct 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5641432 tggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgct 5641531  T
Q  120 cttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5641532 tttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 5641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 25203920 - 25204112
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25203920 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 25204019  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25204020 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25204112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 25268075 - 25268267
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25268075 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 25268174  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25268175 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25268267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8661993 - 8661801
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8661993 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 8661894  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8661893 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8661801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9547227 - 9547035
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9547227 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 9547128  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9547127 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9547035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18124934 - 18124742
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18124934 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 18124835  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18124834 ctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18124742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 30155673 - 30155865
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30155673 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 30155772  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30155773 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 30155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 33296170 - 33296362
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33296170 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 33296269  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33296270 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 41678347 - 41678535
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41678347 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 41678446  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  41678447 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 41678535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 3793183 - 3793375
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3793183 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggacccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 3793282  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3793283 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 9321118 - 9321310
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9321118 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 9321217  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9321218 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9321310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 11552997 - 11553189
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11552997 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 11553096  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11553097 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11553189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13183311 - 13183119
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13183311 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 13183212  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13183211 cttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13183119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 23629612 - 23629804
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23629612 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 23629711  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23629712 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 24587016 - 24587208
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24587016 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 24587115  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  24587116 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 26484036 - 26484228
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26484036 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 26484135  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26484136 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 31435106 - 31435298
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31435106 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 31435205  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31435206 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37767509 - 37767317
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37767509 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 37767410  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37767409 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 22892105 - 22892296
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22892105 tttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 22892204  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22892205 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgttgatcaccttgcctatcaaccgctcgatga 22892296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 12135817 - 12136009
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12135817 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 12135916  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12135917 cttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18497243 - 18497051
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18497243 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 18497144  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18497143 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18497051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22995635 - 22995443
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22995635 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 22995536  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22995535 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22995443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 30033070 - 30033258
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30033070 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 30033169  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30033170 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 30033258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 30172111 - 30172303
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30172111 tttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 30172210  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30172211 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 30172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 33878772 - 33878964
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33878772 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 33878871  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33878872 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33878964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40470068 - 40469876
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40470068 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 40469969  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40469968 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 6877947 - 6878139
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6877947 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 6878046  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6878047 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 6878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13439201 - 13439009
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13439201 tttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatg 13439102  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13439101 cttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13439009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 24973548 - 24973740
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  24973548 tttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatg 24973647  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  24973648 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24973740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28956303 - 28956111
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28956303 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28956204  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28956203 cttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28956111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 30938277 - 30938469
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30938277 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 30938376  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  30938377 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 30938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37355161 - 37354969
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  37355161 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 37355062  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37355061 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37354969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37668004 - 37667812
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37668004 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 37667905  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37667904 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttaatgat 37667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 37758625 - 37758813
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37758625 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 37758724  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  37758725 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 37758813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 24727612 - 24727799
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24727612 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgc 24727711  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24727712 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 24727799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15655276 - 15655091
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  15655276 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcgcgctggcagatg 15655177  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctct 203  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  15655176 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 15655091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 2514704 - 2514896
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2514704 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 2514803  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2514804 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 11327279 - 11327471
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  11327279 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 11327378  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11327379 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11327471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13321348 - 13321156
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13321348 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgttggcagatg 13321249  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13321248 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcgatcaaaggtagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 13321156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18372052 - 18371864
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18372052 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatcagatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 18371953  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  18371952 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 18371864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31822924 - 31822733
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  31822924 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgc 31822825  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31822824 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 33781131 - 33781319
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33781131 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 33781230  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33781231 cttttgtctgaatatgatattgtgttca----acaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28652884 - 28653076
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28652884 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28652983  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28652984 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28653076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 34620160 - 34620352
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34620160 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 34620259  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34620260 ttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34620352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 43081897 - 43082089
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43081897 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 43081996  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  43081997 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 43082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32592792 - 32592600
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32592792 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 32592693  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32592692 ttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 32592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15755370 - 15755182
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15755370 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 15755271  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15755270 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 15755182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29887715 - 29887523
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29887715 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcactctggcagatg 29887616  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | || ||||| |||||||| ||||||    
T  29887615 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgataatctcgcctaccaacctctcgatgat 29887523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3483714 - 3483622
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3483714 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 3483622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20388505 - 20388445
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20388505 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 20388445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 34469273 - 34469333
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgct 87  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34469273 tcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgct 34469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 21973349 - 21973540
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21973349 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 21973448  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21973449 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 21973540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31123133 - 31122942
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31123133 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 31123034  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31123033 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 31122942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 15231520 - 15231712
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15231520 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaggttgcacgctggcagatg 15231619  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15231620 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 15231712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27159938 - 27159746
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27159938 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27159839  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27159838 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 1903902 - 1904094
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1903902 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 1904001  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  1904002 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttaatgat 1904094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33670421 - 33670229
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33670421 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 33670322  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33670321 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40102258 - 40102066
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40102258 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 40102159  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40102158 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40102066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 54837040 - 54837231
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  54837040 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgc 54837139  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  54837140 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 54837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5009523 - 5009715
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5009523 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 5009622  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5009623 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 6573506 - 6573698
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6573506 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 6573605  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6573606 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18313799 - 18313607
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18313799 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18313700  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18313699 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20335042 - 20334850
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20335042 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 20334943  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20334942 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccctgcttaccaacctcttgatgat 20334850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 24116310 - 24116502
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24116310 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 24116409  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24116410 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 24116502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24588982 - 24588790
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24588982 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 24588883  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24588882 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34185581 - 34185389
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34185581 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 34185482  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34185481 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 17016694 - 17016886
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17016694 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 17016793  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17016794 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17016886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18797235 - 18797043
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18797235 tttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 18797136  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18797135 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18797043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 14102191 - 14102379
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14102191 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 14102290  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14102291 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 14102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36341138 - 36340950
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36341138 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 36341039  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  36341038 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 36340950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 30757409 - 30757599
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30757409 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgc 30757508  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30757509 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 30757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14759927 - 14759762
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14759927 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 14759828  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgat 183  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14759827 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgat 14759762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 14668664 - 14668856
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  14668664 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatg 14668763  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14668764 cttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14668856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 39854285 - 39854477
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854285 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 39854384  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  39854385 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 39854477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 210
Target Start/End: Original strand, 5698219 - 5698375
Alignment:
Q  54 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaa 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5698219 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5698318  T
Q  154 aaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5698319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15281558 - 15281366
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  15281558 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 15281459  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||   ||||||| ||| ||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15281458 ctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccgcttgatgat 15281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15384924 - 15384778
Alignment:
Q  63 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15384924 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatc 15384825  T
Q  163 aaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15384824 aaaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatga 15384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14725413 - 14725301
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||    
T  14725413 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgt 14725314  T
Q  125 atgaatatgatat 137  Q
      |||||||||||    
T  14725313 ccgaatatgatat 14725301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 19767994 - 19768086
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  19767994 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 19768086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1881718 - 1881658
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1881718 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 1881658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15387992 - 15387948
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  15387992 aatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtat 15387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 18044709 - 18044769
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18044709 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 18044769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 18228792 - 18228983
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18228792 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 18228891  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18228892 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 18228983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5714669 - 5714861
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714669 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 5714768  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5714769 cttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5725579 - 5725771
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5725579 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 5725678  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5725679 cttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5725771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5766789 - 5766597
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5766789 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 5766690  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5766689 cttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5766597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11107023 - 11106831
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11107023 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 11106924  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11106923 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17981613 - 17981421
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17981613 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 17981514  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17981513 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 17981421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18304318 - 18304126
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18304318 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18304219  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18304218 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 18334226 - 18334418
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18334226 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18334325  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18334326 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22384242 - 22384050
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22384242 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 22384143  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22384142 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22384050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4627381 - 4627573
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4627381 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4627480  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4627481 ctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4627573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 6205499 - 6205691
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  6205499 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatg 6205598  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6205599 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6205691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 8215331 - 8215519
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8215331 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 8215430  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  8215431 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 8215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18273716 - 18273524
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18273716 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18273617  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18273616 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18289017 - 18288825
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18289017 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18288918  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18288917 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18288825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 19698086 - 19698278
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  19698086 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcccgctggcagatg 19698185  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19698186 ctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28112618 - 28112426
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28112618 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28112519  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28112518 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 32294224 - 32294416
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32294224 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 32294323  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32294324 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 32294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 20069638 - 20069828
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgct 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20069638 tggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctagcagatgct 20069737  T
Q  120 cttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20069738 gttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 20069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4343340 - 4343148
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4343340 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4343241  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4343240 ttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4343148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4725227 - 4725419
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4725227 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4725326  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4725327 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggaaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4725419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4793299 - 4793107
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4793299 tttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4793200  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4793199 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 21678299 - 21678491
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21678299 tttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 21678398  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  21678399 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 21678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 24331759 - 24331951
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24331759 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 24331858  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24331859 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24331951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31032900 - 31032708
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31032900 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 31032801  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  31032800 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctctagatgat 31032708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 32442747 - 32442935
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  32442747 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatg 32442846  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  32442847 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 32442935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 47027050 - 47027241
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47027050 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgc 47027149  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47027150 ttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 47027241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4687251 - 4687443
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4687251 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4687350  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  4687351 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagacagtcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4687443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5017310 - 5017502
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5017310 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 5017409  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5017410 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5017502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5605978 - 5605786
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5605978 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatg 5605879  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5605878 cttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5653681 - 5653873
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  5653681 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgacaggtg 5653780  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  5653781 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcctgcctaccaacctcttgatgat 5653873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 7076802 - 7076994
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7076802 tttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 7076901  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  7076902 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7076994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8286134 - 8285942
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  8286134 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatg 8286035  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8286034 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 10399740 - 10399932
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10399740 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 10399839  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10399840 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttaatgat 10399932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15737758 - 15737566
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15737758 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 15737659  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15737658 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaatgtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15889369 - 15889177
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15889369 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccggtaaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 15889270  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15889269 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 18054858 - 18055050
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18054858 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18054957  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18054958 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18055050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28342773 - 28342965
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  28342773 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 28342872  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28342873 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28342965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 35884362 - 35884554
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35884362 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 35884461  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  35884462 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaattaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 35884554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 51785620 - 51785810
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51785620 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgc 51785719  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  51785720 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 51785810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 8299574 - 8299759
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8299574 aatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgt 8299673  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8299674 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagaattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8299759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4420511 - 4420703
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4420511 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 4420610  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4420611 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4420703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 5470584 - 5470776
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5470584 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 5470683  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5470684 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5593021 - 5592829
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5593021 tttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacactggcagatg 5592922  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5592921 cttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5592829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29145420 - 29145228
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  29145420 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttaccgggaagattgcacgctggcagatg 29145321  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29145320 cttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29145228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31961119 - 31960927
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  31961119 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 31961020  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31961019 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaagacagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20573506 - 20573315
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20573506 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgc 20573407  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20573406 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 20573315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6539406 - 6539214
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  6539406 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttacggggaagattgcacgctggcagatg 6539307  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6539306 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 6539214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 18246337 - 18246529
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18246337 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 18246436  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18246437 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18246529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22867512 - 22867320
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22867512 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 22867413  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22867412 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22882571 - 22882379
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22882571 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 22882472  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22882471 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28024878 - 28025070
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28024878 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 28024977  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28024978 ttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28025070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 48469523 - 48469715
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48469523 tttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcgcgctggcagatg 48469622  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  48469623 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 48469715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29661634 - 29661442
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29661634 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatg 29661535  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  29661534 cttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 29661442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 8000156 - 8000348
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  8000156 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 8000255  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  8000256 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 8000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 10646669 - 10646861
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10646669 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 10646768  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  10646769 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 10646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16621154 - 16620966
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  16621154 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcagataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatg 16621055  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16621054 ctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 16620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973333
Alignment:
Q  83 ctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  183 tcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17973333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17992595 - 17992526
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgct 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17992595 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11925015 - 11924923
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  11925015 aatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 11924923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 7088684 - 7088592
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  7088684 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 7088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 16432008 - 16432100
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  16432008 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 16432100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 22960056 - 22960148
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22960056 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 22960148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 4450373 - 4450433
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4450373 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 4450433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 20443722 - 20443782
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgct 87  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  20443722 tcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgct 20443782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 6571957 - 6572012
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  6571957 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaa 6572012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Original strand, 15919122 - 15919175
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15919122 tcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaa 15919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 15705076 - 15705168
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||  | ||| | || |||| |||||| |||||| |||||    
T  15705076 aatcatacaacttggttgatatccaagatggacccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaaccggaaggattgctcgctggcagatg 15705168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16825948 - 16825757
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16825948 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 16825849  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16825848 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16825757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 16895532 - 16895723
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16895532 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 16895631  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16895632 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16895723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21699781 - 21699589
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21699781 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcatgctggcagatg 21699682  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21699681 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37682505 - 37682313
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37682505 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 37682406  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37682405 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37697770 - 37697578
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37697770 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 37697671  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37697670 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 40237142 - 40237334
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40237142 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 40237241  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40237242 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11631794 - 11631602
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11631794 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 11631695  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11631694 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11631602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27779868 - 27780060
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27779868 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27779967  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27779968 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27780060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27819625 - 27819817
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27819625 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27819724  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27819725 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27819817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 34158478 - 34158670
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34158478 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 34158577  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34158578 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34158670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 34294788 - 34294980
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34294788 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 34294887  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34294888 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 37929003 - 37929195
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37929003 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 37929102  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37929103 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39048429 - 39048237
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39048429 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatg 39048330  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39048329 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39048237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13933157 - 13932965
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13933157 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 13933058  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13933057 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13932965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 20841547 - 20841739
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20841547 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 20841646  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20841647 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 20841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22924758 - 22924566
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22924758 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 22924659  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22924658 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 27120158 - 27120350
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  27120158 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcgcgctggcagatg 27120257  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27120258 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27120350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 31879920 - 31880112
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31879920 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 31880019  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31880020 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 31880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31890101 - 31889909
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31890101 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 31890002  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31890001 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 34865318 - 34865510
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34865318 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 34865417  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34865418 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 34865510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 3786127 - 3786318
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3786127 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 3786226  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3786227 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 3786318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 27807338 - 27807529
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27807338 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgc 27807437  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27807438 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27807529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 257263 - 257071
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  257263 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 257164  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  257163 cttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 257071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 12659170 - 12659362
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12659170 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 12659269  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12659270 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19413111 - 19412919
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19413111 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagatcgcacgctggcagatg 19413012  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19413011 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 19412919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21673785 - 21673597
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21673785 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 21673686  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21673685 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 21673597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27431051 - 27430859
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  27431051 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatg 27430952  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27430951 cttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 32053437 - 32053629
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  32053437 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgattaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgatggcagatg 32053536  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32053537 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcagaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 32053629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34271530 - 34271338
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34271530 tttggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 34271431  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34271430 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34271338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37948472 - 37948280
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37948472 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 37948373  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37948372 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttgtcaacctcttgatgat 37948280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 12590443 - 12590634
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12590443 ttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgc 12590542  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12590543 ttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12590634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9346596 - 9346404
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9346596 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 9346497  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9346496 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 16165114 - 16165306
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16165114 tttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatg 16165213  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16165214 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16165306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23125178 - 23124987
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23125178 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 23125079  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23125078 cttttatctgaatacgatattgtgttca-aactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 23124987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 28885913 - 28886105
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  28885913 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatg 28886012  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28886013 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 28886105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 37381311 - 37381499
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  37381311 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacggtggcagatg 37381410  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  37381411 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 37381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12713210 - 12713019
Alignment:
Q  19 ttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12713210 ttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgc 12713111  T
Q  119 tcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12713110 ttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 12713019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19453033 - 19452841
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19453033 tttggtgaatcatataacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 19452934  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19452933 ctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 27395203 - 27395387
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  27395203 aatcatacaacttgggtgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgt 27395302  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395303 ctgaatatgatattttgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 27395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 39893703 - 39893891
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  39893703 tttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 39893802  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  39893803 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 39893891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 34701717 - 34701809
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  34701717 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 34701809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 42394176 - 42394268
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  42394176 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 42394268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26723884 - 26723824
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26723884 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 26723824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34534051 - 34533991
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  34534051 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 34533991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 53
Target Start/End: Original strand, 27828094 - 27828129
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaat 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828094 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27828129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21760216 - 21760162
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaa 81  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21760216 tcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaa 21760162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19657923 - 19657731
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19657923 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagttgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 19657824  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19657823 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 18713118 - 18713310
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18713118 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 18713217  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18713218 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18713310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 31358162 - 31358354
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31358162 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 31358261  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31358262 cttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 15771208 - 15771400
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15771208 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 15771307  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15771308 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19204944 - 19204752
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19204944 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 19204845  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19204844 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 19691732 - 19691924
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19691732 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 19691831  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19691832 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19691924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 14561258 - 14561450
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14561258 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 14561357  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14561358 cttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27605487 - 27605295
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27605487 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 27605388  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27605387 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 29832960 - 29833152
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29832960 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 29833059  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29833060 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 29833152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 18794347 - 18794530
Alignment:
Q  27 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  18794347 tcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtct 18794446  T
Q  127 gaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18794447 gaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18794530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 19678081 - 19678272
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19678081 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 19678180  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19678181 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 19678272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2133842 - 2133650
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  2133842 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatg 2133743  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  2133742 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2133650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12089305 - 12089113
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  12089305 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 12089206  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12089205 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 12089113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31486453 - 31486265
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  31486453 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatg 31486354  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttga 206  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31486353 cttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 31486265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 44564618 - 44564810
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44564618 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 44564717  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || || |||||||||||||||    
T  44564718 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatctggcttaccaacctcttgatgat 44564810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28358534 - 28358342
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28358534 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatg 28358435  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28358434 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28358342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 33246003 - 33246195
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  33246003 tttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgacagatg 33246102  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33246103 ctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 33246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 33262368 - 33262560
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33262368 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 33262467  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33262468 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33262560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 9358259 - 9358451
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9358259 tttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatg 9358358  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9358359 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9358451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22077500 - 22077316
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  22077500 aatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgt 22077401  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077400 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21344753 - 21344561
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  | | | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  21344753 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaaccgcccagctcaagtatatctctgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgacagatg 21344654  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21344653 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 21344561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 14212680 - 14212772
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  14212680 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 14212772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 22412579 - 22412671
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22412579 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 22412671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 16768959 - 16769019
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16768959 tggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 16769019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 19844808 - 19844900
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  19844808 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactagaaggattgctcgctggcagatg 19844900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22812 - 22621
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22812 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 22713  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22712 cttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 9671 - 9863
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9671 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 9770  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9771 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 7595 - 7787
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7595 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 7694  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  7695 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 30928 - 31120
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30928 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 31027  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31028 ctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 19705 - 19897
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  19705 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatg 19804  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19805 ctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 9657 - 9849
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9657 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 9756  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9757 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 16216 - 16408
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16216 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 16315  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16316 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11549 - 11357
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11549 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 11450  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11449 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 3702 - 3894
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3702 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatg 3801  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3802 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 3894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 13206 - 13398
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13206 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatg 13305  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13306 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 9680 - 9872
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  9680 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcaagctggcagatg 9779  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9780 ctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccttttgatgat 9872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5800 - 5608
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5800 tttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatg 5701  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5700 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11776
Alignment:
Q  18 tttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  11584 tttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatg 11683  T
Q  118 ctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11684 cttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 22758 - 22942
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  22758 aatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgt 22857  T
Q  125 atgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 209  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118762
Alignment:
Q  26 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgta 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  126 tgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 118762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5290 - 5125
Alignment:
Q  20 tggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgct 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  5290 tggtaaatcatactacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatcttcgagaagcctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgct 5191  T
Q  120 cttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaacattctcgccgatca 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5190 cttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 43183
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagt-atatctttgag-aaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgc-tct 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |    
T  43333 aatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgctttt 43234  T
Q  122 tgtatgaatat-gatattgtgttc-agaactc-aaaaggcaatcaaaggta 169  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  43233 tgtctgaatatagatattgtgttcaaaaactcaaaaaggcaatcaaaggta 43183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2109
Alignment:
Q  83 ctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatgctcttgtatgaatatgatattgtgttcagaactcaaaaggcaatcaaaggtaac---attctcgc 179  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |   ||||| ||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  180 cgatcaccttgcctatcaacctcttgatgat 210  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 10860 - 10952
Alignment:
Q  25 aatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggaagatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  10860 aatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 10952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University