View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15894_low_27 (Length: 223)

Name: NF15894_low_27
Description: NF15894
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15894_low_27
NF15894_low_27
[»] chr3 (168 HSPs)
chr3 (1-223)||(6501392-6501614)
chr3 (1-223)||(9994282-9994504)
chr3 (1-219)||(6490742-6490960)
chr3 (1-223)||(9982274-9982496)
chr3 (1-223)||(12238002-12238224)
chr3 (1-223)||(12249828-12250050)
chr3 (1-223)||(39673272-39673494)
chr3 (1-223)||(13557198-13557420)
chr3 (1-223)||(19778009-19778231)
chr3 (1-223)||(19788646-19788868)
chr3 (1-223)||(23756922-23757144)
chr3 (1-223)||(23767518-23767740)
chr3 (1-223)||(6180917-6181139)
chr3 (1-223)||(6221091-6221313)
chr3 (1-223)||(13121286-13121508)
chr3 (1-223)||(13131528-13131750)
chr3 (1-223)||(14475845-14476067)
chr3 (1-223)||(24383908-24384132)
chr3 (1-223)||(4175146-4175368)
chr3 (1-223)||(5537410-5537632)
chr3 (1-223)||(5547994-5548216)
chr3 (1-223)||(37866069-37866291)
chr3 (1-223)||(37885202-37885424)
chr3 (1-223)||(5866085-5866309)
chr3 (1-223)||(5876684-5876908)
chr3 (1-223)||(20720735-20720959)
chr3 (1-223)||(23647372-23647595)
chr3 (1-223)||(20684168-20684389)
chr3 (1-223)||(23635333-23635555)
chr3 (1-223)||(37759293-37759515)
chr3 (1-223)||(504557-504780)
chr3 (1-223)||(526923-527146)
chr3 (1-223)||(4743361-4743584)
chr3 (1-223)||(4753948-4754171)
chr3 (1-223)||(5580023-5580247)
chr3 (1-223)||(5628407-5628631)
chr3 (1-223)||(18483667-18483890)
chr3 (1-223)||(35187000-35187223)
chr3 (1-223)||(41683301-41683524)
chr3 (1-223)||(41693870-41694093)
chr3 (1-223)||(8774280-8774503)
chr3 (1-223)||(10098691-10098914)
chr3 (1-223)||(16385698-16385921)
chr3 (1-223)||(24659523-24659746)
chr3 (1-223)||(38194347-38194570)
chr3 (1-223)||(38204883-38205106)
chr3 (1-223)||(39382313-39382536)
chr3 (1-223)||(10627330-10627553)
chr3 (1-223)||(12297190-12297415)
chr3 (1-223)||(5510319-5510542)
chr3 (1-223)||(5520497-5520720)
chr3 (1-223)||(11272773-11272997)
chr3 (1-223)||(13373055-13373279)
chr3 (1-223)||(13394243-13394467)
chr3 (1-223)||(24670103-24670326)
chr3 (1-223)||(39371676-39371899)
chr3 (1-223)||(10655652-10655875)
chr3 (1-223)||(20673583-20673805)
chr3 (1-223)||(24706944-24707167)
chr3 (1-223)||(12287368-12287593)
chr3 (1-223)||(28314621-28314845)
chr3 (1-223)||(1794873-1795095)
chr3 (1-223)||(9391593-9391815)
chr3 (1-223)||(29461602-29461824)
chr3 (1-223)||(29472454-29472676)
chr3 (1-223)||(48336865-48337087)
chr3 (1-223)||(13383649-13383873)
chr3 (1-223)||(11163454-11163675)
chr3 (1-223)||(11217114-11217336)
chr3 (1-223)||(19887743-19887965)
chr3 (1-223)||(933250-933473)
chr3 (1-223)||(28325237-28325459)
chr3 (1-223)||(1784460-1784682)
chr3 (1-223)||(9381047-9381269)
chr3 (1-223)||(11206463-11206685)
chr3 (1-223)||(7794996-7795219)
chr3 (1-223)||(7804907-7805130)
chr3 (1-223)||(4403897-4404118)
chr3 (1-223)||(4433384-4433605)
chr3 (1-223)||(13262062-13262284)
chr3 (4-223)||(9535235-9535455)
chr3 (5-223)||(8740515-8740733)
chr3 (1-223)||(38314318-38314539)
chr3 (1-223)||(17910391-17910617)
chr3 (1-223)||(14258453-14258676)
chr3 (1-223)||(14322081-14322302)
chr3 (1-223)||(16076550-16076774)
chr3 (1-188)||(8996381-8996569)
chr3 (1-223)||(27883005-27883228)
chr3 (1-188)||(9006933-9007121)
chr3 (1-223)||(1053330-1053554)
chr3 (9-223)||(16671552-16671766)
chr3 (1-223)||(29933950-29934173)
chr3 (1-223)||(29983104-29983327)
chr3 (1-223)||(17281824-17282047)
chr3 (1-219)||(1063759-1063979)
chr3 (118-223)||(14465332-14465437)
chr3 (1-117)||(13601857-13601973)
chr3 (1-135)||(15194516-15194651)
chr3 (1-223)||(29906571-29906794)
chr3 (1-223)||(29947736-29947959)
chr3 (1-223)||(29996890-29997113)
chr3 (1-136)||(28168734-28168870)
chr3 (1-139)||(8784894-8785034)
chr3 (1-121)||(18857426-18857545)
chr3 (24-219)||(2246013-2246207)
chr3 (1-223)||(13199635-13199861)
chr3 (124-223)||(8784989-8785088)
chr3 (80-223)||(15663096-15663240)
chr3 (82-223)||(15651461-15651603)
chr3 (1-223)||(17006609-17006837)
chr3 (24-169)||(15663180-15663323)
chr3 (108-223)||(17961073-17961191)
chr3 (1-223)||(31114379-31114606)
chr3 (1-83)||(19121370-19121452)
chr3 (1-223)||(22150661-22150889)
chr3 (1-78)||(33650824-33650901)
chr3 (1-223)||(51989538-51989765)
chr3 (10-78)||(24393356-24393424)
chr3 (108-223)||(28168811-28168927)
chr3 (1-216)||(41045157-41045379)
chr3 (1-223)||(13953678-13953906)
chr3 (1-169)||(15651545-15651717)
chr3 (24-223)||(14580786-14580987)
chr3 (1-54)||(11530421-11530474)
chr3 (1-223)||(15832823-15833051)
chr3 (124-223)||(18006038-18006136)
chr3 (137-220)||(21735868-21735951)
chr3 (80-223)||(15848700-15848845)
chr3 (80-223)||(49989759-49989904)
chr3 (80-223)||(51340509-51340654)
chr3 (4-137)||(17017448-17017586)
chr3 (24-134)||(27172514-27172622)
chr3 (1-221)||(12753140-12753366)
chr3 (80-223)||(11909557-11909702)
chr3 (24-137)||(10528818-10528931)
chr3 (125-223)||(52919976-52920075)
chr3 (80-137)||(18006023-18006081)
chr3 (1-138)||(37412051-37412193)
chr3 (80-137)||(45862162-45862220)
chr3 (80-223)||(13931456-13931599)
chr3 (82-223)||(8729505-8729648)
chr3 (82-223)||(9081392-9081535)
chr3 (85-223)||(27849689-27849827)
chr3 (84-168)||(12756018-12756103)
chr3 (125-219)||(8874641-8874737)
chr3 (1-33)||(35579002-35579034)
chr3 (80-138)||(4243694-4243753)
chr3 (125-164)||(11074019-11074058)
chr3 (1-32)||(13076516-13076547)
chr3 (108-223)||(27172565-27172681)
chr3 (110-223)||(45862105-45862220)
chr3 (137-223)||(12410314-12410399)
chr3 (80-165)||(15848670-15848756)
chr3 (110-222)||(37412134-37412248)
chr3 (80-117)||(8710418-8710455)
chr3 (80-117)||(9062305-9062342)
chr3 (108-223)||(10528871-10528988)
chr3 (80-136)||(13410623-13410680)
chr3 (1-50)||(17769645-17769697)
chr3 (108-165)||(18005989-18006049)
chr3 (1-50)||(19070946-19070998)
chr3 (125-165)||(8710404-8710444)
chr3 (125-165)||(9062291-9062331)
chr3 (137-221)||(16305665-16305749)
chr3 (76-175)||(16879508-16879608)
chr3 (80-139)||(22770433-22770493)
chr3 (1-29)||(27849640-27849668)
[»] chr6 (112 HSPs)
chr6 (1-223)||(26043786-26044008)
chr6 (1-223)||(9123532-9123754)
chr6 (1-223)||(9112895-9113117)
chr6 (1-223)||(32962334-32962556)
chr6 (1-223)||(32972953-32973175)
chr6 (1-223)||(12854595-12854817)
chr6 (1-223)||(12865121-12865343)
chr6 (1-223)||(12717236-12717460)
chr6 (1-223)||(12727885-12728109)
chr6 (4-223)||(27372409-27372628)
chr6 (4-223)||(27462759-27462978)
chr6 (4-223)||(27505519-27505738)
chr6 (1-223)||(3660957-3661179)
chr6 (1-223)||(3671621-3671843)
chr6 (1-223)||(4630444-4630667)
chr6 (1-223)||(16930024-16930247)
chr6 (1-223)||(17982901-17983125)
chr6 (1-223)||(17985110-17985334)
chr6 (1-223)||(25985654-25985878)
chr6 (1-223)||(26025032-26025255)
chr6 (1-223)||(26035606-26035829)
chr6 (1-223)||(27341267-27341490)
chr6 (1-223)||(27402007-27402230)
chr6 (1-223)||(27412666-27412889)
chr6 (1-223)||(31983026-31983249)
chr6 (1-223)||(32301443-32301666)
chr6 (1-223)||(32312132-32312355)
chr6 (1-223)||(34818192-34818416)
chr6 (1-223)||(34807560-34807785)
chr6 (1-223)||(16959195-16959418)
chr6 (1-223)||(26864359-26864582)
chr6 (1-223)||(26874983-26875206)
chr6 (1-223)||(29384325-29384548)
chr6 (1-223)||(33198901-33199124)
chr6 (1-223)||(20030304-20030526)
chr6 (1-223)||(20063055-20063277)
chr6 (1-223)||(25787276-25787497)
chr6 (1-223)||(28251963-28252184)
chr6 (1-223)||(28357110-28357331)
chr6 (1-223)||(16123935-16124158)
chr6 (1-223)||(12827266-12827488)
chr6 (1-223)||(18926164-18926385)
chr6 (1-223)||(7376158-7376381)
chr6 (1-223)||(7751635-7751858)
chr6 (1-223)||(27384007-27384229)
chr6 (1-223)||(32756974-32757194)
chr6 (1-223)||(31571988-31572210)
chr6 (1-223)||(29765109-29765331)
chr6 (1-223)||(17746184-17746407)
chr6 (1-223)||(27166843-27167065)
chr6 (1-220)||(5844659-5844879)
chr6 (1-223)||(18826639-18826861)
chr6 (1-223)||(18835034-18835256)
chr6 (1-169)||(27474391-27474559)
chr6 (1-169)||(27503889-27504057)
chr6 (95-223)||(27504013-27504141)
chr6 (1-119)||(10404043-10404161)
chr6 (1-223)||(22308360-22308584)
chr6 (1-120)||(12353157-12353277)
chr6 (1-115)||(25583486-25583600)
chr6 (95-223)||(27474515-27474642)
chr6 (1-106)||(11147708-11147813)
chr6 (34-223)||(25687150-25687338)
chr6 (24-223)||(25518285-25518483)
chr6 (1-223)||(11235066-11235293)
chr6 (24-223)||(17742104-17742302)
chr6 (1-223)||(21127647-21127874)
chr6 (124-223)||(12353252-12353351)
chr6 (122-223)||(4292420-4292521)
chr6 (1-175)||(7586711-7586889)
chr6 (137-223)||(11147650-11147736)
chr6 (1-79)||(12416901-12416978)
chr6 (1-139)||(31931021-31931163)
chr6 (1-137)||(17047157-17047297)
chr6 (1-139)||(18554868-18555010)
chr6 (1-137)||(11205543-11205683)
chr6 (108-223)||(31931101-31931217)
chr6 (1-139)||(12953586-12953728)
chr6 (127-223)||(18554968-18555064)
chr6 (80-219)||(14070582-14070722)
chr6 (26-223)||(19453027-19453225)
chr6 (80-223)||(18027227-18027370)
chr6 (1-223)||(20635137-20635365)
chr6 (80-221)||(17608814-17608957)
chr6 (24-139)||(19289837-19289950)
chr6 (80-223)||(22386303-22386448)
chr6 (127-223)||(12953532-12953628)
chr6 (24-134)||(17063827-17063935)
chr6 (2-106)||(9934131-9934235)
chr6 (82-219)||(14051901-14052039)
chr6 (80-138)||(24719301-24719360)
chr6 (80-138)||(24729086-24729145)
chr6 (80-137)||(14051954-14052012)
chr6 (124-221)||(17047254-17047352)
chr6 (124-223)||(17063895-17063994)
chr6 (181-223)||(31543296-31543338)
chr6 (1-50)||(14757796-14757848)
chr6 (76-223)||(17446162-17446310)
chr6 (1-72)||(22292465-22292538)
chr6 (76-188)||(23006548-23006661)
chr6 (76-188)||(23781705-23781818)
chr6 (1-33)||(1902308-1902340)
chr6 (154-221)||(18172738-18172806)
chr6 (154-221)||(18226995-18227063)
chr6 (1-33)||(27819055-27819087)
chr6 (1-33)||(30120483-30120515)
chr6 (76-221)||(24729032-24729179)
chr6 (154-223)||(19625382-19625452)
chr6 (127-223)||(19289782-19289879)
chr6 (125-157)||(10820696-10820728)
chr6 (80-183)||(14923759-14923863)
chr6 (80-139)||(32335364-32335424)
[»] chr5 (140 HSPs)
chr5 (1-223)||(10755001-10755223)
chr5 (3-223)||(40390866-40391086)
chr5 (1-223)||(40401528-40401750)
chr5 (1-223)||(15992858-15993080)
chr5 (1-223)||(16003420-16003642)
chr5 (1-223)||(27602947-27603169)
chr5 (1-223)||(39352997-39353219)
chr5 (1-223)||(39364990-39365212)
chr5 (1-223)||(5290104-5290327)
chr5 (1-223)||(5300675-5300898)
chr5 (1-223)||(6131300-6131522)
chr5 (1-223)||(9347051-9347273)
chr5 (1-223)||(23362620-23362842)
chr5 (1-223)||(34772419-34772641)
chr5 (1-223)||(34783364-34783586)
chr5 (1-223)||(14557544-14557768)
chr5 (1-223)||(14568181-14568405)
chr5 (1-223)||(30069432-30069655)
chr5 (1-223)||(36582086-36582309)
chr5 (1-223)||(36592641-36592864)
chr5 (1-223)||(9336464-9336686)
chr5 (1-223)||(22147032-22147253)
chr5 (1-223)||(22157615-22157836)
chr5 (1-223)||(22559946-22560168)
chr5 (1-223)||(27622296-27622518)
chr5 (1-223)||(9376990-9377213)
chr5 (1-223)||(14041106-14041329)
chr5 (1-223)||(15693560-15693783)
chr5 (1-223)||(15740477-15740700)
chr5 (1-223)||(15769637-15769860)
chr5 (1-223)||(17607568-17607791)
chr5 (1-223)||(17618183-17618406)
chr5 (1-223)||(17719426-17719649)
chr5 (1-223)||(17730078-17730301)
chr5 (1-223)||(23296786-23297010)
chr5 (1-223)||(23307354-23307578)
chr5 (1-223)||(23707951-23708175)
chr5 (1-223)||(24567598-24567821)
chr5 (1-223)||(24816414-24816637)
chr5 (1-223)||(24827002-24827225)
chr5 (1-223)||(27041740-27041963)
chr5 (1-223)||(27052364-27052587)
chr5 (1-223)||(27460670-27460893)
chr5 (1-223)||(27471069-27471292)
chr5 (1-223)||(30227023-30227247)
chr5 (1-223)||(30237550-30237774)
chr5 (1-223)||(31349042-31349265)
chr5 (1-223)||(31359656-31359879)
chr5 (1-223)||(35216015-35216238)
chr5 (1-223)||(35226599-35226822)
chr5 (1-223)||(39490477-39490701)
chr5 (1-223)||(39501667-39501891)
chr5 (1-223)||(40513516-40513740)
chr5 (1-223)||(27204301-27204523)
chr5 (1-223)||(14030553-14030776)
chr5 (1-223)||(14446529-14446752)
chr5 (1-223)||(14457141-14457364)
chr5 (1-223)||(23697293-23697517)
chr5 (1-223)||(24808421-24808644)
chr5 (1-223)||(31833992-31834218)
chr5 (1-223)||(31844470-31844696)
chr5 (1-223)||(33951327-33951551)
chr5 (1-223)||(36688203-36688426)
chr5 (1-223)||(36698769-36698992)
chr5 (1-223)||(37728780-37729003)
chr5 (1-223)||(37740096-37740319)
chr5 (1-223)||(42043293-42043517)
chr5 (1-223)||(42053868-42054092)
chr5 (1-223)||(22676625-22676850)
chr5 (1-223)||(22686516-22686741)
chr5 (1-223)||(43043200-43043422)
chr5 (1-223)||(6976317-6976542)
chr5 (1-223)||(6986807-6987032)
chr5 (1-223)||(20798205-20798427)
chr5 (1-223)||(31419172-31419394)
chr5 (1-223)||(1121431-1121653)
chr5 (1-223)||(1108673-1108895)
chr5 (1-223)||(23406955-23407177)
chr5 (1-223)||(36084970-36085192)
chr5 (1-223)||(36229248-36229470)
chr5 (1-223)||(42395493-42395715)
chr5 (1-223)||(8522350-8522573)
chr5 (1-223)||(43621422-43621645)
chr5 (1-223)||(31449063-31449285)
chr5 (1-223)||(20552324-20552547)
chr5 (1-223)||(21702653-21702875)
chr5 (1-223)||(23392910-23393132)
chr5 (1-223)||(19464480-19464703)
chr5 (1-223)||(20562834-20563057)
chr5 (1-223)||(34063130-34063352)
chr5 (1-223)||(17446225-17446447)
chr5 (1-223)||(19478510-19478733)
chr5 (1-219)||(34052473-34052691)
chr5 (1-223)||(24925666-24925890)
chr5 (1-223)||(24982947-24983171)
chr5 (1-223)||(17456841-17457063)
chr5 (1-223)||(21705493-21705722)
chr5 (1-223)||(37407157-37407378)
chr5 (1-139)||(7031685-7031823)
chr5 (1-223)||(20625275-20625499)
chr5 (1-223)||(106629-106852)
chr5 (1-223)||(20417413-20417635)
chr5 (1-223)||(32753474-32753696)
chr5 (108-223)||(7031762-7031877)
chr5 (1-223)||(20215613-20215841)
chr5 (1-223)||(40228070-40228299)
chr5 (1-141)||(21420290-21420431)
chr5 (1-223)||(23477788-23478015)
chr5 (1-139)||(13522637-13522779)
chr5 (1-137)||(40033321-40033463)
chr5 (1-136)||(35543694-35543833)
chr5 (24-139)||(13403702-13403817)
chr5 (1-139)||(36096215-36096357)
chr5 (1-139)||(36097672-36097814)
chr5 (1-223)||(32160161-32160389)
chr5 (127-223)||(35543637-35543733)
chr5 (80-222)||(12078357-12078502)
chr5 (1-139)||(20168630-20168772)
chr5 (127-223)||(13522737-13522834)
chr5 (80-223)||(25112374-25112519)
chr5 (80-223)||(25171465-25171610)
chr5 (127-223)||(36096160-36096257)
chr5 (127-223)||(36097617-36097714)
chr5 (125-223)||(20550432-20550531)
chr5 (1-223)||(11208506-11208733)
chr5 (108-223)||(1914940-1915057)
chr5 (137-221)||(13533474-13533559)
chr5 (24-137)||(1914887-1915000)
chr5 (1-137)||(23487964-23488104)
chr5 (154-223)||(20168575-20168645)
chr5 (108-223)||(13403755-13403872)
chr5 (76-175)||(20567296-20567396)
chr5 (80-139)||(23589238-23589298)
chr5 (125-223)||(643200-643299)
chr5 (95-222)||(16607020-16607149)
chr5 (1-50)||(26013262-26013310)
chr5 (80-168)||(26013304-26013393)
chr5 (154-223)||(26056025-26056093)
chr5 (108-219)||(40033268-40033381)
chr5 (124-223)||(23488061-23488161)
[»] chr4 (108 HSPs)
chr4 (1-223)||(5022379-5022601)
chr4 (5-223)||(18752884-18753102)
chr4 (1-223)||(18763494-18763716)
chr4 (1-223)||(48370774-48370996)
chr4 (1-223)||(450219-450441)
chr4 (1-223)||(15561474-15561696)
chr4 (1-223)||(19955357-19955579)
chr4 (1-223)||(21996056-21996278)
chr4 (1-223)||(22006654-22006876)
chr4 (1-223)||(27815340-27815562)
chr4 (1-223)||(30926889-30927111)
chr4 (1-223)||(17917694-17917917)
chr4 (1-223)||(4947980-4948202)
chr4 (1-223)||(14844048-14844270)
chr4 (1-223)||(19944722-19944944)
chr4 (1-223)||(30937467-30937689)
chr4 (1-223)||(40470982-40471204)
chr4 (1-223)||(460800-461022)
chr4 (1-223)||(40454744-40454966)
chr4 (1-223)||(36017978-36018201)
chr4 (1-223)||(36028531-36028754)
chr4 (1-223)||(49517777-49518000)
chr4 (1-223)||(17928342-17928565)
chr4 (1-223)||(24028480-24028705)
chr4 (1-222)||(25656778-25656999)
chr4 (1-223)||(27656241-27656465)
chr4 (1-223)||(27666814-27667038)
chr4 (1-223)||(29042051-29042274)
chr4 (1-223)||(16255509-16255731)
chr4 (1-223)||(16266102-16266324)
chr4 (4-223)||(52703434-52703653)
chr4 (1-223)||(18130634-18130859)
chr4 (1-223)||(10740989-10741212)
chr4 (1-223)||(10954758-10954981)
chr4 (1-223)||(24639890-24640113)
chr4 (1-223)||(55745647-55745870)
chr4 (1-223)||(10909050-10909272)
chr4 (1-223)||(10751563-10751786)
chr4 (1-223)||(10965332-10965555)
chr4 (1-223)||(18078301-18078525)
chr4 (1-223)||(55756258-55756481)
chr4 (4-223)||(16316976-16317195)
chr4 (1-223)||(10695284-10695505)
chr4 (4-223)||(16304752-16304971)
chr4 (1-223)||(14836497-14836719)
chr4 (1-223)||(5873014-5873235)
chr4 (1-223)||(3370356-3370580)
chr4 (3-223)||(4986805-4987025)
chr4 (1-223)||(3390096-3390320)
chr4 (1-223)||(15207782-15208004)
chr4 (1-223)||(19580883-19581105)
chr4 (1-223)||(10300176-10300399)
chr4 (1-223)||(11535486-11535709)
chr4 (1-152)||(25008538-25008689)
chr4 (1-223)||(31267187-31267411)
chr4 (1-139)||(47152528-47152665)
chr4 (1-223)||(24713069-24713295)
chr4 (1-220)||(11514676-11514896)
chr4 (1-118)||(19143504-19143621)
chr4 (1-223)||(49002376-49002598)
chr4 (1-223)||(55650965-55651187)
chr4 (1-223)||(19241660-19241887)
chr4 (1-72)||(8183486-8183557)
chr4 (1-78)||(10290267-10290345)
chr4 (1-139)||(23508784-23508926)
chr4 (1-221)||(18775076-18775301)
chr4 (1-53)||(19570659-19570711)
chr4 (137-223)||(4987052-4987138)
chr4 (1-139)||(16819825-16819967)
chr4 (127-223)||(23508884-23508980)
chr4 (1-139)||(14711253-14711397)
chr4 (1-139)||(14778917-14779061)
chr4 (1-223)||(18007480-18007707)
chr4 (127-223)||(16819770-16819867)
chr4 (80-223)||(33377903-33378048)
chr4 (110-223)||(1671908-1672023)
chr4 (62-139)||(17994267-17994343)
chr4 (1-137)||(36210587-36210728)
chr4 (137-223)||(39532191-39532277)
chr4 (108-223)||(47152473-47152589)
chr4 (155-223)||(8997675-8997743)
chr4 (23-117)||(8997740-8997831)
chr4 (80-139)||(18773578-18773637)
chr4 (127-221)||(18775816-18775911)
chr4 (80-221)||(7222001-7222142)
chr4 (126-223)||(17994212-17994310)
chr4 (125-223)||(23123055-23123156)
chr4 (1-34)||(9920958-9920991)
chr4 (154-223)||(17526857-17526925)
chr4 (76-188)||(19889495-19889608)
chr4 (76-223)||(41115232-41115381)
chr4 (1-33)||(17199074-17199106)
chr4 (80-223)||(18394034-18394177)
chr4 (1-33)||(28050206-28050238)
chr4 (1-33)||(49509620-49509652)
chr4 (125-223)||(17788514-17788613)
chr4 (80-214)||(32491310-32491444)
chr4 (80-137)||(1671908-1671966)
chr4 (154-223)||(17539965-17540035)
chr4 (1-50)||(19052754-19052803)
chr4 (125-223)||(3105895-3105995)
chr4 (80-164)||(9266769-9266854)
chr4 (76-223)||(13890317-13890466)
chr4 (96-168)||(14154528-14154601)
chr4 (108-223)||(14711198-14711315)
chr4 (108-223)||(14778862-14778979)
chr4 (76-175)||(16325024-16325124)
chr4 (80-135)||(24619175-24619231)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (1-223)||(51629620-51629844)
chr1 (1-223)||(51656881-51657105)
chr1 (1-223)||(4177467-4177689)
chr1 (1-223)||(35012480-35012702)
chr1 (1-223)||(5640143-5640365)
chr1 (1-223)||(10998217-10998439)
chr1 (1-223)||(12730099-12730321)
chr1 (1-223)||(12740692-12740914)
chr1 (1-223)||(12898414-12898636)
chr1 (1-223)||(21863213-21863435)
chr1 (1-223)||(33084113-33084336)
chr1 (1-223)||(5650700-5650922)
chr1 (1-223)||(19178511-19178733)
chr1 (1-223)||(19187390-19187612)
chr1 (1-223)||(35404825-35405049)
chr1 (1-223)||(35649124-35649348)
chr1 (1-223)||(38094626-38094850)
chr1 (1-223)||(38105251-38105475)
chr1 (3-223)||(12614749-12614969)
chr1 (3-223)||(12624214-12624434)
chr1 (1-223)||(7689892-7690117)
chr1 (1-223)||(21877318-21877541)
chr1 (1-223)||(5832769-5832992)
chr1 (1-223)||(5843371-5843594)
chr1 (1-223)||(7506852-7507076)
chr1 (1-223)||(7517449-7517673)
chr1 (1-223)||(36236862-36237086)
chr1 (1-223)||(36247409-36247633)
chr1 (1-223)||(3171173-3171396)
chr1 (1-223)||(3181775-3181998)
chr1 (1-223)||(47608364-47608587)
chr1 (1-223)||(47618972-47619195)
chr1 (3-223)||(35638472-35638691)
chr1 (1-223)||(2538087-2538310)
chr1 (1-223)||(148646-148869)
chr1 (1-223)||(5973310-5973532)
chr1 (1-223)||(20441749-20441971)
chr1 (1-223)||(154721-154944)
chr1 (1-223)||(4250997-4251223)
chr1 (1-223)||(7677396-7677618)
chr1 (62-223)||(4166872-4167033)
chr1 (1-223)||(18382336-18382558)
chr1 (1-223)||(39586523-39586744)
chr1 (1-223)||(17956790-17957013)
chr1 (1-223)||(39194526-39194750)
chr1 (1-223)||(12944760-12944983)
chr1 (1-223)||(20196125-20196348)
chr1 (1-136)||(23580816-23580951)
chr1 (1-223)||(11195501-11195725)
chr1 (83-223)||(47194896-47195036)
chr1 (1-120)||(9050994-9051113)
chr1 (1-223)||(18311406-18311630)
chr1 (1-223)||(22610408-22610634)
chr1 (1-165)||(47194755-47194919)
chr1 (1-223)||(14388560-14388785)
chr1 (1-223)||(674997-675219)
chr1 (4-223)||(41133050-41133271)
chr1 (108-223)||(9050920-9051036)
chr1 (124-223)||(23580759-23580857)
chr1 (1-223)||(5929125-5929351)
chr1 (1-139)||(46181367-46181509)
chr1 (1-73)||(16710385-16710457)
chr1 (1-223)||(28379408-28379637)
chr1 (25-223)||(22018775-22018974)
chr1 (80-223)||(22642392-22642537)
chr1 (1-223)||(23926477-23926706)
chr1 (80-223)||(34255955-34256099)
chr1 (108-223)||(46181313-46181429)
chr1 (80-142)||(19965763-19965825)
chr1 (1-139)||(28473676-28473818)
chr1 (1-54)||(4717683-4717736)
chr1 (24-139)||(20884370-20884483)
chr1 (1-223)||(17370456-17370684)
chr1 (127-223)||(20867287-20867383)
chr1 (62-223)||(26548695-26548856)
chr1 (75-216)||(19037499-19037642)
chr1 (127-223)||(20884316-20884412)
chr1 (1-139)||(45071117-45071259)
chr1 (1-137)||(20251219-20251361)
chr1 (62-165)||(22642346-22642448)
chr1 (62-139)||(52351174-52351250)
chr1 (95-223)||(22654989-22655119)
chr1 (82-222)||(26280491-26280633)
chr1 (83-223)||(8698357-8698497)
chr1 (1-223)||(19170764-19170992)
chr1 (108-223)||(28473756-28473873)
chr1 (1-139)||(44200458-44200604)
chr1 (80-223)||(31358825-31358967)
chr1 (80-138)||(9346299-9346358)
chr1 (80-138)||(16233624-16233683)
chr1 (76-221)||(17025404-17025551)
chr1 (80-137)||(21543566-21543624)
chr1 (126-223)||(52351119-52351217)
chr1 (122-223)||(2819749-2819849)
chr1 (1-34)||(25218042-25218075)
chr1 (1-34)||(36551159-36551192)
chr1 (127-223)||(45071062-45071159)
chr1 (80-223)||(7309312-7309459)
chr1 (1-33)||(13223605-13223637)
chr1 (1-33)||(24049120-24049152)
chr1 (1-33)||(36100092-36100124)
chr1 (110-223)||(21543566-21543681)
chr1 (1-31)||(9749843-9749873)
chr1 (98-139)||(20867341-20867383)
chr1 (154-223)||(21028365-21028435)
chr1 (80-137)||(26280547-26280605)
chr1 (108-223)||(20251301-20251418)
chr1 (82-134)||(22639779-22639832)
chr1 (76-139)||(18130506-18130570)
[»] chr8 (90 HSPs)
chr8 (1-223)||(6318939-6319161)
chr8 (1-223)||(26110866-26111088)
chr8 (1-223)||(9856900-9857122)
chr8 (1-223)||(43247960-43248182)
chr8 (1-223)||(3220267-3220489)
chr8 (1-223)||(18449005-18449227)
chr8 (1-223)||(19128383-19128605)
chr8 (1-223)||(32078119-32078341)
chr8 (1-223)||(32088692-32088914)
chr8 (1-223)||(36292554-36292778)
chr8 (1-223)||(36303157-36303381)
chr8 (1-223)||(6150704-6150925)
chr8 (1-223)||(6160659-6160880)
chr8 (1-223)||(241457-241681)
chr8 (1-223)||(252042-252266)
chr8 (1-223)||(794812-795036)
chr8 (1-223)||(849390-849614)
chr8 (1-223)||(3349050-3349273)
chr8 (1-223)||(3359647-3359870)
chr8 (1-223)||(9340778-9341001)
chr8 (1-223)||(9367922-9368145)
chr8 (1-223)||(44480725-44480948)
chr8 (1-223)||(44491341-44491564)
chr8 (1-223)||(26120541-26120766)
chr8 (1-223)||(19138915-19139137)
chr8 (1-223)||(31214647-31214869)
chr8 (1-223)||(210576-210800)
chr8 (1-223)||(724199-724423)
chr8 (1-223)||(29076365-29076588)
chr8 (1-223)||(29086616-29086839)
chr8 (1-223)||(36077571-36077794)
chr8 (1-223)||(36088157-36088380)
chr8 (1-223)||(15791722-15791945)
chr8 (1-223)||(20161654-20161876)
chr8 (1-223)||(13688991-13689215)
chr8 (1-223)||(23469884-23470106)
chr8 (1-223)||(15781133-15781356)
chr8 (1-223)||(19224569-19224791)
chr8 (1-223)||(19417986-19418209)
chr8 (1-223)||(19428561-19428784)
chr8 (1-223)||(16746635-16746857)
chr8 (1-223)||(30315119-30315346)
chr8 (1-223)||(18153372-18153594)
chr8 (3-223)||(18157893-18158113)
chr8 (9-223)||(18769560-18769775)
chr8 (1-223)||(40213591-40213814)
chr8 (1-140)||(13697185-13697326)
chr8 (1-223)||(22167447-22167673)
chr8 (1-223)||(22136282-22136508)
chr8 (1-120)||(20195620-20195739)
chr8 (1-223)||(3843156-3843378)
chr8 (1-223)||(20260042-20260264)
chr8 (1-223)||(21046672-21046894)
chr8 (108-223)||(20195697-20195813)
chr8 (80-223)||(7018805-7018954)
chr8 (1-169)||(7018894-7019066)
chr8 (1-155)||(23363762-23363920)
chr8 (1-54)||(15998808-15998861)
chr8 (1-54)||(23270531-23270584)
chr8 (62-223)||(40002702-40002863)
chr8 (1-223)||(17519574-17519801)
chr8 (1-51)||(26735573-26735623)
chr8 (3-223)||(45568432-45568658)
chr8 (1-137)||(19460627-19460767)
chr8 (1-137)||(19558305-19558445)
chr8 (1-137)||(23271689-23271829)
chr8 (80-223)||(21298504-21298649)
chr8 (24-139)||(22211869-22211982)
chr8 (80-223)||(28902958-28903103)
chr8 (1-60)||(23290535-23290593)
chr8 (80-223)||(21287894-21288039)
chr8 (127-223)||(22211814-22211911)
chr8 (1-137)||(29379015-29379157)
chr8 (96-221)||(15934150-15934277)
chr8 (129-223)||(19956854-19956949)
chr8 (80-223)||(1210259-1210405)
chr8 (125-223)||(19942770-19942868)
chr8 (80-137)||(21540474-21540532)
chr8 (85-138)||(24678970-24679024)
chr8 (76-188)||(18557517-18557630)
chr8 (80-223)||(21540444-21540589)
chr8 (76-219)||(26832560-26832705)
chr8 (80-223)||(12541134-12541277)
chr8 (80-129)||(17879155-17879205)
chr8 (108-223)||(19460707-19460824)
chr8 (108-223)||(19558385-19558502)
chr8 (104-223)||(22462154-22462275)
chr8 (87-223)||(33052374-33052510)
chr8 (1-29)||(12541090-12541118)
chr8 (82-138)||(27739408-27739464)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (1-223)||(9763176-9763398)
chr2 (1-223)||(16768541-16768763)
chr2 (1-223)||(30489232-30489454)
chr2 (1-223)||(43082252-43082474)
chr2 (1-223)||(1099603-1099825)
chr2 (1-223)||(7006215-7006437)
chr2 (1-223)||(9773712-9773934)
chr2 (1-223)||(11389217-11389439)
chr2 (1-223)||(22915272-22915494)
chr2 (1-223)||(22960740-22960962)
chr2 (1-223)||(24328142-24328364)
chr2 (1-223)||(24338812-24339034)
chr2 (1-223)||(43092861-43093083)
chr2 (1-223)||(4099412-4099634)
chr2 (1-223)||(4209487-4209709)
chr2 (1-223)||(4220079-4220301)
chr2 (1-223)||(17857845-17858067)
chr2 (1-223)||(11395580-11395804)
chr2 (1-223)||(11405896-11406120)
chr2 (1-223)||(18393045-18393269)
chr2 (1-223)||(29243820-29244042)
chr2 (1-223)||(29254399-29254621)
chr2 (1-223)||(34790625-34790847)
chr2 (1-223)||(34804768-34804990)
chr2 (1-223)||(36252252-36252474)
chr2 (1-223)||(10266591-10266814)
chr2 (1-223)||(10277168-10277391)
chr2 (1-223)||(32217470-32217694)
chr2 (1-223)||(34477526-34477749)
chr2 (1-223)||(40221930-40222153)
chr2 (1-223)||(40250791-40251014)
chr2 (1-223)||(35263188-35263411)
chr2 (1-223)||(35273813-35274036)
chr2 (1-223)||(39170503-39170726)
chr2 (1-223)||(27220978-27221201)
chr2 (1-223)||(9897982-9898207)
chr2 (3-223)||(9908570-9908793)
chr2 (1-223)||(35252579-35252802)
chr2 (1-223)||(43345005-43345228)
chr2 (1-223)||(43354620-43354843)
chr2 (1-223)||(28732310-28732532)
chr2 (1-223)||(2561086-2561308)
chr2 (1-223)||(24415429-24415651)
chr2 (1-223)||(24427994-24428216)
chr2 (1-223)||(18769313-18769534)
chr2 (1-219)||(28721728-28721946)
chr2 (1-223)||(21172874-21173098)
chr2 (1-223)||(26866670-26866892)
chr2 (1-223)||(26879259-26879481)
chr2 (1-223)||(38586495-38586719)
chr2 (1-223)||(27978790-27979012)
chr2 (1-223)||(28065319-28065541)
chr2 (1-161)||(21650975-21651136)
chr2 (1-216)||(36785214-36785431)
chr2 (1-223)||(967912-968135)
chr2 (36-223)||(22763288-22763474)
chr2 (2-223)||(24274624-24274845)
chr2 (34-223)||(22773990-22774178)
chr2 (1-223)||(17970678-17970900)
chr2 (1-223)||(1041746-1041969)
chr2 (1-223)||(19355913-19356139)
chr2 (1-90)||(30794407-30794497)
chr2 (1-137)||(19302918-19303058)
chr2 (1-137)||(19498457-19498597)
chr2 (1-223)||(23393130-23393357)
chr2 (1-223)||(20647019-20647246)
chr2 (80-223)||(24802010-24802155)
chr2 (80-223)||(24814977-24815122)
chr2 (1-139)||(38033296-38033439)
chr2 (1-139)||(19313482-19313624)
chr2 (108-223)||(19313427-19313544)
chr2 (80-221)||(1083507-1083650)
chr2 (83-168)||(16587510-16587596)
chr2 (80-188)||(21911363-21911473)
chr2 (108-223)||(19300420-19300537)
chr2 (62-137)||(19300477-19300551)
chr2 (183-223)||(21650939-21650979)
chr2 (80-138)||(21845679-21845738)
chr2 (76-223)||(22382968-22383118)
chr2 (125-223)||(24843741-24843840)
chr2 (108-223)||(19498400-19498517)
chr2 (104-223)||(26619564-26619685)
chr2 (125-164)||(21548821-21548860)
chr2 (62-139)||(22754978-22755054)
chr2 (154-223)||(18702307-18702377)
chr2 (154-223)||(25918281-25918350)
chr2 (1-29)||(14794452-14794480)
chr2 (155-223)||(15671074-15671140)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-223)||(2295-2517)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-223)||(11962-12184)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (1-223)||(166503-166725)
chr7 (1-223)||(177095-177317)
chr7 (1-223)||(9084892-9085114)
chr7 (1-223)||(9094606-9094828)
chr7 (1-223)||(21003478-21003700)
chr7 (1-223)||(48710961-48711183)
chr7 (1-223)||(468051-468273)
chr7 (1-223)||(6867695-6867917)
chr7 (1-223)||(6878327-6878549)
chr7 (1-223)||(20989261-20989483)
chr7 (1-223)||(26653795-26654017)
chr7 (1-223)||(26700124-26700346)
chr7 (1-223)||(37343808-37344030)
chr7 (1-223)||(2706082-2706306)
chr7 (1-223)||(26390566-26390790)
chr7 (1-223)||(26401208-26401432)
chr7 (1-223)||(26294499-26294722)
chr7 (1-223)||(5685127-5685349)
chr7 (1-223)||(9432872-9433094)
chr7 (1-223)||(22099346-22099568)
chr7 (1-223)||(17961194-17961418)
chr7 (1-223)||(24734359-24734583)
chr7 (1-223)||(24744306-24744530)
chr7 (1-223)||(40042578-40042802)
chr7 (1-223)||(40053127-40053351)
chr7 (1-223)||(8627555-8627779)
chr7 (1-223)||(14746139-14746362)
chr7 (1-223)||(24931073-24931296)
chr7 (1-223)||(9443468-9443690)
chr7 (1-223)||(22088731-22088953)
chr7 (1-223)||(1987147-1987370)
chr7 (1-223)||(1997768-1997991)
chr7 (1-223)||(2716686-2716910)
chr7 (1-223)||(11004792-11005015)
chr7 (1-223)||(17950588-17950812)
chr7 (1-223)||(42865434-42865657)
chr7 (1-223)||(42876060-42876283)
chr7 (1-223)||(8616993-8617216)
chr7 (1-223)||(588821-589043)
chr7 (1-223)||(4222215-4222438)
chr7 (1-223)||(1367238-1367460)
chr7 (1-223)||(3165343-3165565)
chr7 (1-223)||(8002535-8002758)
chr7 (1-223)||(8013180-8013403)
chr7 (1-223)||(15888798-15889020)
chr7 (1-223)||(20490615-20490837)
chr7 (1-223)||(21770412-21770634)
chr7 (1-223)||(30049128-30049350)
chr7 (1-223)||(31116980-31117202)
chr7 (1-223)||(9159339-9159561)
chr7 (1-223)||(9169794-9170016)
chr7 (1-223)||(40055223-40055445)
chr7 (63-223)||(455269-455429)
chr7 (1-188)||(17064034-17064222)
chr7 (83-223)||(11095744-11095884)
chr7 (1-223)||(18418721-18418944)
chr7 (1-223)||(18440802-18441025)
chr7 (1-223)||(38403681-38403905)
chr7 (1-222)||(3476812-3477033)
chr7 (1-139)||(4211646-4211785)
chr7 (1-221)||(48381793-48382015)
chr7 (1-136)||(540721-540857)
chr7 (1-223)||(8933171-8933393)
chr7 (1-120)||(44280132-44280251)
chr7 (1-219)||(29589595-29589818)
chr7 (1-223)||(15215923-15216146)
chr7 (1-223)||(12734635-12734857)
chr7 (1-120)||(38594256-38594374)
chr7 (1-183)||(13681927-13682109)
chr7 (1-223)||(26210019-26210241)
chr7 (108-223)||(540798-540915)
chr7 (108-223)||(44280209-44280325)
chr7 (108-223)||(4211724-4211839)
chr7 (1-223)||(8999409-8999638)
chr7 (1-139)||(24882945-24883087)
chr7 (1-72)||(25212471-25212542)
chr7 (25-223)||(11087519-11087718)
chr7 (1-54)||(19986159-19986212)
chr7 (108-223)||(38594181-38594298)
chr7 (1-52)||(20967277-20967328)
chr7 (108-222)||(24882892-24883007)
chr7 (1-67)||(457618-457684)
chr7 (35-223)||(4433056-4433244)
chr7 (1-221)||(4412485-4412711)
chr7 (1-223)||(13175080-13175308)
chr7 (80-177)||(23125439-23125537)
chr7 (155-223)||(2501533-2501600)
chr7 (80-139)||(16308289-16308349)
chr7 (1-50)||(11015412-11015463)
chr7 (80-223)||(25806885-25807030)
chr7 (1-223)||(602177-602404)
chr7 (80-164)||(9802671-9802756)
chr7 (80-222)||(13263274-13263414)
chr7 (80-177)||(11572762-11572860)
chr7 (75-188)||(13172909-13173023)
chr7 (157-223)||(18362087-18362153)
chr7 (110-165)||(9802671-9802727)
chr7 (132-223)||(19237556-19237648)
chr7 (80-139)||(20094640-20094700)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-223)||(30735-30959)
scaffold0133 (1-223)||(42949-43176)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-223)||(40882-41104)
scaffold0047 (1-223)||(33331-33553)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-223)||(7271-7493)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-219)||(7317-7535)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (1-223)||(7564-7788)
scaffold0105 (1-223)||(37387-37611)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-223)||(37163-37385)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (1-223)||(14188-14410)
scaffold0028 (1-223)||(54552-54774)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-223)||(11035-11257)
scaffold0068 (1-223)||(8188-8417)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-223)||(2647-2870)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-188)||(12581-12770)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-221)||(1598-1818)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-223)||(40105-40328)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-223)||(35139-35364)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (1-223)||(57212-57436)
scaffold0084 (1-223)||(855-1083)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-223)||(4900-5122)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-223)||(10717-10940)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1-221)||(29074-29297)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-223)||(15331-15554)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-223)||(16205-16432)
scaffold0012 (34-223)||(127284-127473)
scaffold0012 (154-223)||(8084-8154)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (1-223)||(18814-19051)
scaffold0099 (88-223)||(17385-17525)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (1-223)||(59325-59552)
scaffold0017 (1-223)||(40779-41008)
scaffold0017 (137-219)||(175062-175144)
scaffold0017 (1-90)||(174984-175074)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (1-142)||(1-143)
scaffold0570 (1-223)||(2141-2368)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (62-223)||(32474-32635)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-80)||(23376-23455)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-100)||(1-99)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-71)||(8650-8720)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (1-68)||(1-68)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (1-139)||(955-1097)
scaffold2071 (127-223)||(901-997)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (1-139)||(10275-10417)
scaffold0544 (127-223)||(10221-10317)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (1-139)||(1525-1667)
scaffold0443 (108-223)||(1470-1587)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-223)||(475719-475947)
scaffold0002 (1-223)||(482239-482467)
scaffold0002 (1-50)||(100223-100272)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (80-223)||(6921-7066)
scaffold0018 (80-165)||(7010-7096)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (24-139)||(29282-29395)
scaffold0001 (127-223)||(29228-29324)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (127-223)||(58065-58161)
scaffold0073 (1-139)||(57965-58107)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-139)||(60669-60813)
scaffold0005 (108-223)||(60751-60868)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (1-139)||(347-489)
scaffold0547 (127-223)||(447-544)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-219)||(61146-61372)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (62-223)||(4600-4761)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-188)||(165135-165327)
scaffold0011 (83-188)||(59060-59166)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-49)||(155682-155730)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (24-137)||(304-415)
scaffold0090 (24-137)||(4684-4795)
scaffold0090 (108-223)||(355-472)
scaffold0090 (108-223)||(4735-4852)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (82-223)||(13542-13685)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (80-223)||(1596-1741)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (80-223)||(4366-4511)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (80-222)||(3866-4011)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (24-120)||(13975-14068)
scaffold0349 (108-165)||(14026-14084)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (1-42)||(4437-4478)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (80-223)||(35145-35290)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (1-41)||(1816-1856)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (80-175)||(20890-20986)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (154-223)||(961-1031)
scaffold0752 (154-223)||(1576-1646)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (80-137)||(1-59)
scaffold0211 (80-167)||(1-89)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (80-223)||(4480-4625)
scaffold0040 (80-119)||(8279-8318)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (80-223)||(1403-1548)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (1-123)||(5331-5456)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-134)||(38487-38623)
scaffold0149 (127-223)||(38428-38523)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (82-221)||(144405-144546)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (124-223)||(2281-2381)
scaffold0220 (80-137)||(2338-2396)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (110-223)||(10250-10365)
scaffold0207 (82-219)||(20123-20262)
scaffold0207 (1-165)||(19978-20147)
scaffold0207 (80-137)||(10250-10308)
scaffold0207 (80-137)||(20151-20209)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (82-219)||(38556-38695)
scaffold0132 (80-137)||(38609-38667)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (115-152)||(4829-4866)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (80-223)||(11259-11404)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (76-223)||(32255-32404)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (1-33)||(4332-4364)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-33)||(61136-61168)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (127-223)||(59721-59817)
scaffold0007 (61-139)||(59775-59852)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-32)||(1493-1524)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (192-223)||(2769-2800)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (125-223)||(158653-158752)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (80-137)||(9497-9557)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (154-223)||(5202-5272)
scaffold0273 (86-137)||(22546-22598)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (139-223)||(5901-5986)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (154-223)||(7666-7733)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (104-223)||(244750-244870)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 168)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6501614 - 6501392
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501614 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 6501515  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501514 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 6501415  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6501414 tgaacacttgatatacaatcagt 6501392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9994504 - 9994282
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994504 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 9994405  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994404 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9994305  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9994304 tgaacacttgatatacaatcagt 9994282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6490960 - 6490742
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490960 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 6490861  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490860 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 6490761  T
Q  201 tgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6490760 tgaacacttgatatacaat 6490742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9982496 - 9982274
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982496 tgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 9982397  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982396 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9982297  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9982296 tgaacacttgatatacaatcagt 9982274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12238224 - 12238002
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12238224 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagaacacacgcaaga 12238125  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238124 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 12238025  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12238024 tgaacacttgatatacaatcagt 12238002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12250050 - 12249828
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250050 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 12249951  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249950 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 12249851  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12249850 tgaacacttgatatacaatcagt 12249828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39673494 - 39673272
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39673494 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 39673395  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673394 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 39673295  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39673294 tgaacacttgatatacaatcagt 39673272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13557198 - 13557420
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13557198 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 13557297  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557298 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 13557397  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13557398 tgaacacttgatatacaatcagt 13557420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19778009 - 19778231
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19778009 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19778108  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778109 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 19778208  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19778209 tgaacacttgatatacaatcagt 19778231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19788646 - 19788868
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19788646 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19788745  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788746 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 19788845  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19788846 tgaacacttgatatacaatcagt 19788868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23756922 - 23757144
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23756922 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23757021  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757022 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 23757121  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23757122 tgaacacttgatatacaatcagt 23757144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23767518 - 23767740
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23767518 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23767617  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767618 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 23767717  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23767718 tgaacacttgatatacaatcagt 23767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6181139 - 6180917
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6181139 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6181040  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6181039 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 6180940  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6180939 tgaacacttgatatacaatcagt 6180917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6221313 - 6221091
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6221313 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6221214  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6221213 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 6221114  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6221113 tgaacacttgatatacaatcagt 6221091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13121286 - 13121508
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13121286 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 13121385  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13121386 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 13121485  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13121486 tgaacacttgatatacaatcagt 13121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13131528 - 13131750
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13131528 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 13131627  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13131628 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 13131727  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13131728 tgaacacttgatatacaatcagt 13131750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14475845 - 14476067
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14475845 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 14475944  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14475945 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 14476044  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14476045 tgaacacttgatatacaatcagt 14476067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24384132 - 24383908
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24384132 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24384033  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384032 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24383933  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24383932 attgaacacttgatatacaatcagt 24383908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4175368 - 4175146
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4175368 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4175269  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4175268 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 4175169  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4175168 tgaacacttgatatacaatcagt 4175146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5537632 - 5537410
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5537632 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 5537533  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5537532 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 5537433  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5537432 tgaacacttgatatacaatcagt 5537410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5548216 - 5547994
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5548216 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 5548117  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5548116 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 5548017  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5548016 tgaacacttgatatacaatcagt 5547994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37866069 - 37866291
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37866069 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 37866168  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37866169 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 37866268  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37866269 tgaacacttgatatacaatcagt 37866291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37885202 - 37885424
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37885202 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 37885301  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37885302 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 37885401  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37885402 tgaacacttgatatacaatcagt 37885424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5866309 - 5866085
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5866309 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 5866210  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866209 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5866110  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5866109 attgaacacttgatatacaatcagt 5866085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5876908 - 5876684
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5876908 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 5876809  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876808 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5876709  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5876708 attgaacacttgatatacaatcagt 5876684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20720735 - 20720959
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  20720735 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 20720834  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720835 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 20720934  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20720935 attgaacacttgatatacaatcagt 20720959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23647372 - 23647595
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23647372 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 23647471  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23647472 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 23647571  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23647572 ttgaacacttgatatacaatcagt 23647595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20684389 - 20684168
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20684389 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20684291  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20684290 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 20684191  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20684190 tgaacacttgatatacaatcagt 20684168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23635333 - 23635555
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23635333 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23635432  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23635433 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgact 23635532  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23635533 tgaacacttgatatacaatcagt 23635555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37759293 - 37759515
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37759293 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 37759392  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37759393 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 37759492  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37759493 tgaacacttgatatacaatcagt 37759515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 504780 - 504557
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  504780 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 504682  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504681 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 504582  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  504581 attgaacacttgatatacaatcagt 504557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 527146 - 526923
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  527146 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 527048  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527047 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 526948  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  526947 attgaacacttgatatacaatcagt 526923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4743361 - 4743584
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4743361 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 4743459  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743460 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 4743559  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4743560 attgaacacttgatatacaatcagt 4743584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4753948 - 4754171
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4753948 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 4754046  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754047 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 4754146  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4754147 attgaacacttgatatacaatcagt 4754171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5580247 - 5580023
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5580247 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 5580148  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580147 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5580048  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5580047 attgaacacttgatatacaatcagt 5580023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5628631 - 5628407
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5628631 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 5628532  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628531 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5628432  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5628431 attgaacacttgatatacaatcagt 5628407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18483667 - 18483890
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18483667 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 18483765  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483766 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 18483865  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18483866 attgaacacttgatatacaatcagt 18483890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35187000 - 35187223
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35187000 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 35187098  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187099 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35187198  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35187199 attgaacacttgatatacaatcagt 35187223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41683301 - 41683524
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41683301 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 41683399  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683400 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 41683499  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  41683500 attgaacacttgatatacaatcagt 41683524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41693870 - 41694093
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41693870 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 41693968  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693969 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 41694068  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  41694069 attgaacacttgatatacaatcagt 41694093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8774280 - 8774503
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8774280 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 8774378  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774379 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 8774478  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8774479 attgaacacttgatatacaatcagt 8774503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10098691 - 10098914
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10098691 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 10098789  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098790 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 10098889  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10098890 attgaacacttgatatacaatcagt 10098914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16385698 - 16385921
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16385698 tgcacttccaaggagattttactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 16385796  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385797 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 16385896  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16385897 attgaacacttgatatacaatcagt 16385921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24659523 - 24659746
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24659523 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24659621  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24659622 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttga 24659721  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24659722 attgaacacttgatatacaatcagt 24659746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38194347 - 38194570
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38194347 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 38194445  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194446 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 38194545  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  38194546 attgaacacttgatatacaatcagt 38194570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38204883 - 38205106
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38204883 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 38204981  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204982 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 38205081  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  38205082 attgaacacttgatatacaatcagt 38205106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39382313 - 39382536
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39382313 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 39382411  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382412 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 39382511  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39382512 attgaacacttgatatacaatcagt 39382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10627553 - 10627330
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10627553 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaaga 10627454  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10627453 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgac 10627354  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10627353 ttgaacacttgatatacaatcagt 10627330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12297415 - 12297190
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12297415 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 12297316  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12297315 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12297216  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12297215 aattgaacacttgatatacaatcagt 12297190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5510319 - 5510542
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5510319 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 5510417  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510418 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5510517  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5510518 attgaacacttgatatacaatcagt 5510542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5520497 - 5520720
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5520497 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 5520595  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520596 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5520695  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5520696 attgaacacttgatatacaatcagt 5520720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11272997 - 11272773
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  11272997 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 11272898  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272897 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 11272798  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11272797 attgaacacttgatatacaatcagt 11272773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13373279 - 13373055
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  13373279 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaa 13373180  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373179 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 13373080  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13373079 attgaacacttgatatacaatcagt 13373055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13394467 - 13394243
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  13394467 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaa 13394368  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394367 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 13394268  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13394267 attgaacacttgatatacaatcagt 13394243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24670103 - 24670326
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24670103 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24670201  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24670202 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttga 24670301  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  24670302 attgaacacttgatatataatcagt 24670326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39371676 - 39371899
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  39371676 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaa 39371774  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371775 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 39371874  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39371875 attgaacacttgatatacaatcagt 39371899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10655875 - 10655652
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10655875 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaaga 10655776  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10655775 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgac 10655676  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10655675 ttgaacacttgatatacaatcagt 10655652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20673805 - 20673583
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20673805 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 20673707  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20673706 agtcttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 20673607  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20673606 ttgaacacttgatatacaatcagt 20673583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24707167 - 24706944
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  24707167 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 24707068  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24707067 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagatttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgac 24706968  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24706967 ttgaacacttgatatacaatcagt 24706944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12287593 - 12287368
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12287593 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 12287494  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12287493 gagtcttccaatgctcaagcactaaccaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12287394  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12287393 aattgaacacttgatatacaatcagt 12287368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28314845 - 28314621
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28314845 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 28314747  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28314746 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttg 28314647  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28314646 aattgaacacttgatatacaatcagt 28314621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1795095 - 1794873
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1795095 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1794996  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1794995 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 1794896  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  1794895 taaacacttgatatacaatcagt 1794873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9391815 - 9391593
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9391815 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9391716  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  9391715 gtcttcccatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 9391616  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9391615 tgaacacttgatatacaatcagt 9391593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29461824 - 29461602
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29461824 tgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 29461725  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  29461724 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 29461625  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29461624 tgaacacttgatatacaatcagt 29461602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29472676 - 29472454
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29472676 tgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 29472577  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  29472576 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 29472477  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29472476 tgaacacttgatatacaatcagt 29472454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 48336865 - 48337087
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48336865 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 48336964  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  48336965 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgact 48337064  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48337065 tgaacacttgatatacaatcagt 48337087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13383873 - 13383649
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||    
T  13383873 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaa 13383774  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383773 gagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 13383674  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13383673 attgaacacttgatatacaatcagt 13383649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11163454 - 11163675
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11163454 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaaga 11163552  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  11163553 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgact 11163652  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11163653 tgaacacttgatatacaatcagt 11163675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11217336 - 11217114
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11217336 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaaga 11217237  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  11217236 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 11217137  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11217136 tgaacacttgatatacaatcagt 11217114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19887965 - 19887743
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19887965 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19887866  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  19887865 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 19887766  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19887765 tgaacacttgatatacaatcagt 19887743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 933250 - 933473
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  933250 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 933349  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||||    
T  933350 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataggtttgac 933449  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  933450 ttgaacacttgatatacaatcagt 933473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28325459 - 28325237
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28325459 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 28325361  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28325360 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagca--caggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttg 28325263  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28325262 aattgaacacttgatatacaatcagt 28325237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1784682 - 1784460
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1784682 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1784583  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1784582 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 1784483  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  1784482 taaacacttgatatacaatcagt 1784460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9381269 - 9381047
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  9381269 tgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaaga 9381170  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  9381169 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 9381070  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9381069 tgaacacttgatatacaatcagt 9381047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11206685 - 11206463
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11206685 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaaga 11206586  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  11206585 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 11206486  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11206485 tgaacacttgatatacaatcagt 11206463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7795219 - 7794996
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7795219 tgcacttcgaaggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaag 7795120  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  7795119 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 7795020  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7795019 ttgaacacttgatatacaatcagt 7794996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7805130 - 7804907
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7805130 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaag 7805031  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| | ||||||||    
T  7805030 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatataatgaaataagtttgac 7804931  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7804930 ttgaacacttgatatacaatcagt 7804907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4403897 - 4404118
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4403897 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 4403995  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  4403996 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgact 4404095  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4404096 tgaacacttcatatacaatcagt 4404118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4433384 - 4433605
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4433384 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 4433482  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  4433483 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgact 4433582  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4433583 tgaacacttcatatacaatcagt 4433605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13262284 - 13262062
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13262284 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaaga 13262185  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  13262184 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgacc 13262086  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  13262085 ttaaacacttgatatacaatcagt 13262062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 9535235 - 9535455
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9535235 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 9535334  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  9535335 cttccaatgctcaagcgctaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttg 9535434  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9535435 aacacttgatatacaatcagt 9535455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8740733 - 8740515
Alignment:
Q  5 cttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8740733 cttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtc 8740635  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  8740634 ttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttga 8740535  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8740534 acacttgatatacaatcagt 8740515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38314318 - 38314539
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    
T  38314318 tgcagttccaaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacagacaaga 38314416  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  38314417 gtctaccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgact 38314516  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38314517 tgaacacttgatatacaatcagt 38314539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17910617 - 17910391
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17910617 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaag 17910518  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac---aaaaatacagagaattgagttt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||  ||| |   |||    
T  17910517 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaagaaaaatacaatgaaatattttt 17910418  T
Q  197 gacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  17910417 gatttgaacacttgatatgcaatcagt 17910391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14258676 - 14258453
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14258676 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 14258578  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagag-aattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |   |||||    
T  14258577 gtcttccaatgctcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaaatatctttga 14258478  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14258477 cttgaacacttgatatacaatcagt 14258453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14322302 - 14322081
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  14322302 tgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa-tgctcaaccacacaggcaaga 14322204  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  14322203 gtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgacc 14322105  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14322104 ttgaacacttgatatacaatcagt 14322081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16076550 - 16076774
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  16076550 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 16076648  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  16076649 gagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttg 16076747  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16076748 atgttgaacacttgatatacaatcagt 16076774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8996569 - 8996381
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  8996569 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaag 8996471  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 188  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8996470 agttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 8996381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27883005 - 27883228
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  27883005 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 27883103  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  27883104 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 27883202  T
Q  199 -cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  27883203 ccttgaacacttgatatacaatcagt 27883228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9007121 - 9006933
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||    
T  9007121 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaag 9007023  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9007022 agtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 9006933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1053330 - 1053554
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  1053330 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 1053428  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||    |||||    
T  1053429 gagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaagacacagaa-aatgtttg 1053527  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  1053528 actttgaacacttgatatacaatcagt 1053554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671552
Alignment:
Q  9 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
Q  108 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgatttgaaca 16671569  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  16671568 cttgatatacaatcagt 16671552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29934173 - 29933950
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  29934173 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 29934076  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||     || |    
T  29934075 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaaaatgtttgg 29933976  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  29933975 gattgaacacttgatatacaatcagt 29933950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29983327 - 29983104
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  29983327 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 29983230  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||     || |    
T  29983229 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaaaatgtttgg 29983130  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  29983129 gattgaacacttgatatacaatcagt 29983104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17282047 - 17281824
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  17282047 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 17281950  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||    
T  17281949 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttg 17281851  T
Q  198 actt-gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17281850 actttgaacacttgatatactatcagt 17281824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 1063759 - 1063979
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  1063759 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 1063857  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||    |||||    
T  1063858 gagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaacgaaaagacacagaa-aatgtttg 1063956  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaat 219  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1063957 actttgaacacttgatatacaat 1063979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465437
Alignment:
Q  118 cactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatataca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatataca 14465431  T
Q  218 atcagt 223  Q
    ||||||    
T  14465432 atcagt 14465437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 13601857 - 13601973
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13601857 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 13601956  T
Q  101 gtcttccaatgctcaag 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  13601957 gtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15194651 - 15194516
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15194651 tgcacttcctaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacacaag 15194552  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15194551 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29906794 - 29906571
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  29906794 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 29906697  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  29906696 gagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 29906598  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29906597 agattgaacacttgatatacaatcagt 29906571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29947959 - 29947736
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  29947959 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 29947862  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  29947861 gagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 29947763  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29947762 agattgaacacttgatatacaatcagt 29947736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29997113 - 29996890
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  29997113 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 29997016  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  29997015 gagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 29996917  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29996916 agattgaacacttgatatacaatcagt 29996890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 28168734 - 28168870
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28168734 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaaga 28168833  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 136  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28168834 gtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 8784894 - 8785034
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8784894 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 8784992  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  8784993 gagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaat 8785034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18857545 - 18857426
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18857545 tgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 18857447  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcact 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18857446 gtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 2246013 - 2246207
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 123  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2246013 ataatcacacagattacaactgctcaatactctcaag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 2246109  T
Q  124 -gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaat 219  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2246110 agcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaat 2246207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13199861 - 13199635
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |    
T  13199861 tgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcagg 13199765  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||    
T  13199764 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgt 13199665  T
Q  195 ttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13199664 ttgactttgaacacttgatatacaatcagt 13199635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 8784989 - 8785088
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8784989 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 8785088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15663096
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaa 15663141  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15663140 ttacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 15663096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651461
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |    
T  15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 15651504  T
Q  181 acagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651503 acacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 15651461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17006609 - 17006837
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  17006609 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 17006706  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    |    
T  17006707 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacacagaaaattg 17006806  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17006807 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 17006837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15663323 - 15663180
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  15663323 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 15663227  T
Q  123 agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 169  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  15663226 agcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 15663180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 17961073 - 17961191
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttct--aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaa 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||| ||||||||    
T  17961073 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaatataaagaaattggttggacttgaa 17961172  T
Q  205 cacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17961173 cacttgatatacaatcagt 17961191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31114606 - 31114379
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||  ||  ||||||||||| ||     
T  31114606 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaataa--tgctcaagcacgcag 31114510  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  31114509 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 31114410  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31114409 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 31114379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19121452 - 19121370
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgct 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  19121452 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22150661 - 22150889
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  22150661 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 22150758  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    | ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  22150759 gaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 22150858  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22150859 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 22150889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 33650824 - 33650901
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  33650824 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51989765 - 51989538
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||| | ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  51989765 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacag 51989669  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||| || |    |    
T  51989668 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaacagaattacacagtaaattg 51989569  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  51989568 tttgagtttgaacacttgatatactatcagt 51989538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24393424 - 24393356
Alignment:
Q  10 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24393424 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 28168811 - 28168927
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  28168811 aatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgaccttgaac 28168909  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28168910 acttgatatacaatcagt 28168927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41045157 - 41045379
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  41045157 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaagcacgca 41045254  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||        
T  41045255 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaagtt 41045354  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatac 216  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  41045355 gtttgagtttgaacacttgatatac 41045379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 13953678 - 13953906
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  13953678 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacaca 13953774  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  13953775 agcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaatt 13953874  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13953875 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 13953906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15651717 - 15651545
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||||||||||  |     
T  15651717 tgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgtag 15651621  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 169  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  15651620 gcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaat 15651545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 14580786 - 14580987
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagcact 121  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||     
T  14580786 ataatctcacagattacaactgctcaatactttcaag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacg 14580882  T
Q  122 aag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagag-aattgagtttga-cttgaacacttgatatacaa 218  Q
     || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| || || |  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  14580883 caggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatatgtttgagtttgaacacttgatatacaa 14580982  T
Q  219 tcagt 223  Q
    |||||    
T  14580983 tcagt 14580987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 11530421 - 11530474
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11530421 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15832823 - 15833051
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  15832823 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgca 15832919  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  15832920 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 15833019  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15833020 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 15833051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 18006038 - 18006136
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18006038 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacacaaatacaagaaattg-gtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 18006136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21735951
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatc 21735951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848845
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaacagaa 15848799  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15848800 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 15848845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 49989759 - 49989904
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  49989759 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 49989858  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49989859 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 49989904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340654
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||   | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaacagaa 51340608  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  51340609 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 51340654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 17017448 - 17017586
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  17017448 acttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggca 17017545  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17017546 agagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 27172514 - 27172622
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  27172514 ataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 27172610  T
Q  123 agcaagagactt 134  Q
    ||||||||||||    
T  27172611 agcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12753366 - 12753140
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  12753366 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacaca 12753270  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  12753269 ggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 12753170  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12753169 gtttgagtttgaacacttgatatacaatca 12753140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11909702 - 11909557
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  11909702 tgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 11909603  T
Q  179 atacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11909602 ttacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatacaatcagt 11909557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 10528818 - 10528931
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 121  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  10528818 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcataaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 10528915  T
Q  122 aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||||||||||||    
T  10528916 aagcaagagacttcta 10528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 52919976 - 52920075
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52919976 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 52920075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006081
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 37412051 - 37412193
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  37412051 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacaca 37412147  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaa 138  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37412148 agcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45862220 - 45862162
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45862220 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 45862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 13931456 - 13931599
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  ||| ||||||  ||  ||||| |||||   | | ||||||||||||| ||||||||     
T  13931456 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagaaagagatatcctatgctcaagcaaaaaagtaagagacttctaaacaaacaaat 13931555  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13931556 -tacaaagaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 13931599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8729648 - 8729505
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||| |||||| || |    
T  8729648 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 8729549  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  8729548 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagt 8729505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9081535 - 9081392
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    ||||| |||| | |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||| |||||| || |    
T  9081535 ctcaaacacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcactgacgcaagagacttcttatgttcaagcacaaaagtaagagacttctaaacaaacacaatt 9081436  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  9081435 acacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagt 9081392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 27849689 - 27849827
Alignment:
Q  85 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 183  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  27849689 aagcacaaaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaac-aaattaca 27849787  T
Q  184 gagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     | || | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  27849788 cataaataagtttggtttggacacttgatatacaatcagt 27849827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12756103 - 12756018
Alignment:
Q  84 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 168  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12756103 caagcacacaagcaagagattttcaatgctcaatcacaattgaaagagacttccaatgcttaagcacacaagcaagagacttctaa 12756018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8874737 - 8874641
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa-tcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8874737 caagagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttctaattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaat 8874641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 35579034 - 35579002
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35579034 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243694
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaa 4243694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 164
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 164  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 13076516 - 13076547
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcaca 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13076516 tgcacttccaaggagatttcactataatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 27172565 - 27172681
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca-gagaattgagtttgac-ttgaa 204  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| || |||| || |||||  |||||| |||||    
T  27172565 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacaagaaaattg--tttgacgttgaa 27172662  T
Q  205 cacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27172663 cacttgatatacaatcagt 27172681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45862220 - 45862105
Alignment:
Q  110 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||  ||||||  ||||||    
T  45862220 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattatacagaaaatt--gtttgagtttgaac 45862123  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| |||||||||||||    
T  45862122 acttaatatacaatcagt 45862105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12410399 - 12410314
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  12410399 aatgctcaagcacacaagcaagagacttctaaacaaac-aaattacaaagaaataagtttggtttgaacaatttatatacaatcagt 12410314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Original strand, 15848670 - 15848756
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15848670 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Original strand, 37412134 - 37412248
Alignment:
Q  110 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacac 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||    
T  37412134 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaaacaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 37412233  T
Q  208 ttgatatacaatcag 222  Q
    |||||||||||||||    
T  37412234 ttgatatacaatcag 37412248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 117
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 117
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 10528871 - 10528988
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  10528871 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagtttgaac 10528970  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10528971 acttgatatacaatcagt 10528988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17769697 - 17769645
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17769697 tgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006049
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa--tgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttc 18006049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19070998 - 19070946
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19070998 tgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710444
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 8710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062331
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 9062331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16305749 - 16305665
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||||  ||||||| || |||||||||||    
T  16305749 aatgctgaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaactacagagaaagatgtttggtttgaacaattaatatacaatca 16305665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Original strand, 16879508 - 16879608
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  16879508 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatactcaagcacaaacacaagagagttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac 16879607  T
Q  175 a 175  Q
    |    
T  16879608 a 16879608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770433
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 22770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 27849640 - 27849668
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27849640 tgcacttccaaggagatttcactataatc 27849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 112)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26043786 - 26044008
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26043786 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaaga 26043885  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043886 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 26043985  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26043986 tgaacacttgatatacaatcagt 26044008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9123754 - 9123532
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9123754 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9123655  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123654 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9123555  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9123554 tgaacacttgatatacaatcagt 9123532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9113117 - 9112895
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9113117 tgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9113018  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113017 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9112918  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9112917 tgaacacttgatatacaatcagt 9112895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32962556 - 32962334
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32962556 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 32962457  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32962456 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 32962357  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32962356 tgaacacttgatatacaatcagt 32962334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32973175 - 32972953
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32973175 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 32973076  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32973075 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 32972976  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32972975 tgaacacttgatatacaatcagt 32972953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12854595 - 12854817
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12854595 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12854694  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12854695 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12854794  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12854795 tgaacacttgatatacaatcagt 12854817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12865121 - 12865343
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12865121 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12865220  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12865221 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12865320  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12865321 tgaacacttgatatacaatcagt 12865343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12717460 - 12717236
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12717460 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 12717361  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717360 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12717261  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12717260 attgaacacttgatatacaatcagt 12717236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12728109 - 12727885
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12728109 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 12728010  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728009 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 12727910  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12727909 attgaacacttgatatacaatcagt 12727885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27372409 - 27372628
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27372409 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtc 27372508  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372509 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 27372608  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27372609 acacttgatatacaatcagt 27372628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27462759 - 27462978
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27462759 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtc 27462858  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462859 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 27462958  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27462959 acacttgatatacaatcagt 27462978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27505519 - 27505738
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27505519 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtc 27505618  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505619 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 27505718  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27505719 acacttgatatacaatcagt 27505738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3660957 - 3661179
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3660957 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 3661056  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3661057 gtcttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 3661156  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3661157 tgaacacttgatatacaatcagt 3661179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3671621 - 3671843
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3671621 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 3671720  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3671721 gtcttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 3671820  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3671821 tgaacacttgatatacaatcagt 3671843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4630444 - 4630667
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4630444 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 4630542  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630543 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 4630642  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4630643 attgaacacttgatatacaatcagt 4630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16930024 - 16930247
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16930024 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 16930122  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930123 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 16930222  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16930223 attgaacacttgatatacaatcagt 16930247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17983125 - 17982901
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17983125 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 17983026  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983025 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17982926  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17982925 attgaacacttgatatacaatcagt 17982901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17985334 - 17985110
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17985334 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 17985235  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985234 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17985135  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17985134 attgaacacttgatatacaatcagt 17985110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25985654 - 25985878
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25985654 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 25985753  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985754 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 25985853  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  25985854 attgaacacttgatatacaatcagt 25985878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26025032 - 26025255
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26025032 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 26025130  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025131 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26025230  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26025231 attgaacacttgatatacaatcagt 26025255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26035606 - 26035829
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26035606 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 26035704  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035705 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26035804  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26035805 attgaacacttgatatacaatcagt 26035829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27341267 - 27341490
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27341267 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27341365  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341366 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27341465  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27341466 attgaacacttgatatacaatcagt 27341490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27402007 - 27402230
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27402007 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27402105  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402106 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27402205  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27402206 attgaacacttgatatacaatcagt 27402230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27412666 - 27412889
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27412666 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27412764  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412765 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27412864  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27412865 attgaacacttgatatacaatcagt 27412889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31983249 - 31983026
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31983249 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 31983151  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983150 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 31983051  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  31983050 attgaacacttgatatacaatcagt 31983026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32301666 - 32301443
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32301666 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 32301568  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301567 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 32301468  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  32301467 attgaacacttgatatacaatcagt 32301443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32312355 - 32312132
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32312355 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 32312257  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312256 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 32312157  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  32312156 attgaacacttgatatacaatcagt 32312132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34818416 - 34818192
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  34818416 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 34818317  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818316 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 34818217  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  34818216 attgaacacttgatatacaatcagt 34818192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34807785 - 34807560
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  34807785 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgca 34807686  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807685 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 34807586  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  34807585 aattgaacacttgatatacaatcagt 34807560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16959195 - 16959418
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16959195 tgcacttccaaagagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 16959293  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959294 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 16959393  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16959394 attgaacacttgatatacaatcagt 16959418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26864359 - 26864582
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26864359 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 26864457  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864458 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26864557  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26864558 attgaacacttgatatacaatcagt 26864582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26874983 - 26875206
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26874983 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 26875081  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875082 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26875181  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26875182 attgaacacttgatatacaatcagt 26875206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29384325 - 29384548
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29384325 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 29384423  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384424 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 29384523  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29384524 attgaacacttgatatacaatcagt 29384548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33198901 - 33199124
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33198901 tgcacttctaaggagatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 33199000  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33199001 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgag 33199100  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33199101 ttgaacacttgatatacaatcagt 33199124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20030526 - 20030304
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20030526 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20030427  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||    
T  20030426 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgact 20030327  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20030326 tgaacacttgatatacaatcagt 20030304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20063277 - 20063055
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20063277 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20063178  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||    
T  20063177 gtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgact 20063078  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20063077 tgaacacttgatatacaatcagt 20063055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 25787276 - 25787497
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25787276 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaaga 25787374  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  25787375 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 25787474  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25787475 tgaacacttgatatacaatcagt 25787497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28252184 - 28251963
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28252184 tgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaaga 28252085  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28252084 gacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgact 28251986  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28251985 tgaacacttgatatacaatcagt 28251963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28357331 - 28357110
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28357331 tgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaaga 28357232  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28357231 gacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagacaattgagtttgact 28357133  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28357132 tgaacacttgatatacaatcagt 28357110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16124158 - 16123935
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16124158 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16124059  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  16124058 gtcttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacc 16123959  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  16123958 ttgaacacttgatgtacaatcagt 16123935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12827266 - 12827488
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12827266 tgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12827365  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  12827366 gtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 12827465  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12827466 tgaacacttgatatacaatcagt 12827488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18926385 - 18926164
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18926385 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatt-ctcaagcacacaggcaaga 18926287  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  18926286 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 18926187  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18926186 tgaacacttgatatacaatcagt 18926164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7376381 - 7376158
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  7376381 tgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaag 7376282  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  7376281 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 7376182  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7376181 ttgaacacttgatatacaatcagt 7376158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7751858 - 7751635
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7751858 tgcacttccaaagagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaag 7751759  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  7751758 agacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgaa 7751659  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7751658 ttgaacacttgatatacaatcagt 7751635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27384007 - 27384229
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27384007 tgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaag 27384106  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  27384107 agacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagtttgat 27384205  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27384206 ttgaacacttgatatacaatcagt 27384229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32756974 - 32757194
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32756974 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct--aagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaaga 32757071  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  32757072 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgacc 32757170  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32757171 ttgaacacttgatatacaatcagt 32757194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31571988 - 31572210
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  31571988 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 31572086  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  31572087 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 31572185  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31572186 cttgaacacttgatatacaatcagt 31572210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29765109 - 29765331
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  29765109 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 29765207  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||    
T  29765208 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaa-aatgtttga 29765306  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29765307 attgaacacttgatatacaatcagt 29765331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17746407 - 17746184
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  17746407 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 17746309  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  17746308 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 17746210  T
Q  199 c-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||| |||||||    
T  17746209 ctttgaacacttgatatataatcagt 17746184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27167065 - 27166843
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  27167065 tgcactttcaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 27166967  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  27166966 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 27166868  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||||||||||||| |||||||||    
T  27166867 attgaacacttgatacacaatcagt 27166843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 5844659 - 5844879
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  5844659 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaag 5844757  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  5844758 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 5844856  T
Q  199 -cttgaacacttgatatacaatc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  5844857 ccttgaacacttgatatacaatc 5844879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18826861 - 18826639
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18826861 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgag 18826763  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  18826762 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 18826664  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18826663 tttgaacacttgatatacaatcagt 18826639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18835256 - 18835034
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  18835256 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgag 18835158  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | || |||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  18835157 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 18835059  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18835058 tttgaacacttgatatacaatcagt 18835034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 27474391 - 27474559
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27474391 tgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaag 27474490  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  27474491 agacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 27503889 - 27504057
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27503889 tgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaag 27503988  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  27503989 agacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27504057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504141
Alignment:
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagt 27504112  T
Q  195 ttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27504113 ttgatttgaacacttgatatacaatcagt 27504141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10404161 - 10404043
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10404161 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 10404062  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagca 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10404061 gtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22308360 - 22308584
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  22308360 tgcacttcgaaggagattttcaataataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 22308458  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    |||||    
T  22308459 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaaat-gtttg 22308557  T
Q  198 actt-gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22308558 actttgaacacttgatatacaatcagt 22308584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 12353157 - 12353277
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12353157 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaag 12353256  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12353257 agtcttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 25583486 - 25583600
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25583486 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcatga 25583585  T
Q  101 gtcttccaatgctca 115  Q
    |||||||||||||||    
T  25583586 gtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474642
Alignment:
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagt 27474613  T
Q  195 ttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27474614 ttgatttgaacacttgatatacaatcagt 27474642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11147813 - 11147708
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11147813 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 11147714  T
Q  101 gtcttc 106  Q
    ||||||    
T  11147713 gtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25687338 - 25687150
Alignment:
Q  34 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagac 132  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25687338 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtc 25687241  T
Q  133 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25687240 ttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaacaaaattacacataa-aatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 25687150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 25518285 - 25518483
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta- 122  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  |||||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||||     
T  25518285 ataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactac 25518381  T
Q  123 agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25518382 agcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatca 25518481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11235066 - 11235293
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  11235066 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 11235162  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  11235163 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 11235262  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11235263 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 11235293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17742302 - 17742104
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 123  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17742302 ataatcgcacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaa 17742206  T
Q  124 -gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatc 220  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17742205 agcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaacagaattacatagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatc 17742107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21127647 - 21127874
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  21127647 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 21127743  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  21127744 gcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 21127843  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21127844 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 21127874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353351
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 12353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 223
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292521
Alignment:
Q  122 aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttgatatacaatca 4292519  T
Q  222 gt 223  Q
    ||    
T  4292520 gt 4292521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7586889 - 7586711
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     ||||||||  |||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  7586889 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 7586793  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 175  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7586792 gcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 7586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147650
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 11147650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12416978 - 12416901
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12416978 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 31931021 - 31931163
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  31931021 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 31931117  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31931118 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 17047157 - 17047297
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||  ||     
T  17047157 tgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcatgcag 17047253  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047254 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 18554868 - 18555010
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  18554868 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 18554964  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18554965 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 11205543 - 11205683
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  11205543 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 11205639  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11205640 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 31931101 - 31931217
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  31931101 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 31931200  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  31931201 cttgatatacaatcagt 31931217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12953728 - 12953586
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  12953728 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 12953632  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12953631 gctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaat 12953586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 18554968 - 18555064
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554968 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 18555064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14070722 - 14070582
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14070722 tgctcaagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 14070624  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14070623 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaat 14070582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19453225 - 19453027
Alignment:
Q  26 aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa- 123  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  ||||   ||||||||||||||     
T  19453225 aatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaa 19453128  T
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19453127 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgtgtttgaacacttgatatacaatcag 19453028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027227
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||    
T  18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac-aaa 18027272  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| |||| | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18027271 ttacacagaaataagtttggtttgaacacttgatataaaatcagt 18027227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20635137 - 20635365
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  20635137 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aactgctcaagcacgca 20635233  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  20635234 ggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 20635333  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  20635334 gtttgagtttgaacacttgaaatacaatcagt 20635365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17608957 - 17608814
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  17608957 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 17608858  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17608857 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 17608814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
Q  123 agcaagagacttctaat 139  Q
    || ||||||||||||||    
T  19289853 aggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 22386303 - 22386448
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  22386303 tgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 22386402  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22386403 ttacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 22386448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12953628 - 12953532
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||| || |||| | || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12953628 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaatcaaacagaattacacaaaaatttgtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 12953532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 17063827 - 17063935
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17063827 ataatctcacagattacaattgttcaatactatcatg-tatgagacttctcaaa--tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaa 17063923  T
Q  123 agcaagagactt 134  Q
    ||||||||||||    
T  17063924 agcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9934235 - 9934131
Alignment:
Q  2 gcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || ||    
T  9934235 gcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgag 9934138  T
Q  100 agtcttc 106  Q
    |||||||    
T  9934137 agtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14052039 - 14051901
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |    
T  14052039 ctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaatt 14051941  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
    ||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14051940 acacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaat 14051901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719301
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24719301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729086
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051954
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 221
Target Start/End: Original strand, 17047254 - 17047352
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17047254 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgactttgaacacttgatatacaatca 17047352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 17063895 - 17063994
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac-agagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| || ||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17063895 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaacagaattacaagaaaatt--gtttgacgttgaacacttgatatacaatca 17063992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31543338 - 31543296
Alignment:
Q  181 acagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31543338 acagagaattgagtttcagttgaacacttgatatacaatcagt 31543296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 14757796 - 14757848
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14757796 tgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17446310 - 17446162
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  17446310 aaactactcaagcacaacagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaac 17446211  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17446210 agaattacaaagaa-aatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 17446162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22292465 - 22292538
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 72  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  22292465 tgcatttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23006661 - 23006548
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  23006661 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaac 23006562  T
Q  175 aaaaatacagagaa 188  Q
    | || |||| ||||    
T  23006561 ataattacacagaa 23006548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 23781705 - 23781818
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  23781705 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaac 23781804  T
Q  175 aaaaatacagagaa 188  Q
    | || |||| ||||    
T  23781805 ataattacacagaa 23781818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 1902308 - 1902340
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902308 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18172806 - 18172738
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18172806 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 18172738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 18226995 - 18227063
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18226995 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 18227063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 27819087 - 27819055
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819087 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 30120515 - 30120483
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120515 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24729179 - 24729032
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||| |  | ||||||| ||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  24729179 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac 24729080  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    | || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24729079 acaattacacagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatca 24729032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 19625382 - 19625452
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19625382 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 19625452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19289879 - 19289782
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19289879 agagacttcctatgctcaagcactaaaggaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcagt 19289782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 157
Target Start/End: Original strand, 10820696 - 10820728
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaa 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10820696 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 10820728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14923863 - 14923759
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| |||  ||||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  14923863 tgctcaatcacacaagaaagagacttcaaatattcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaaa 14923764  T
Q  179 ataca 183  Q
     ||||    
T  14923763 ttaca 14923759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 32335364 - 32335424
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32335364 tgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataat 32335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 140)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10755223 - 10755001
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10755223 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaaga 10755124  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755123 gtcttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 10755024  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10755023 tgaacacttgatatacaatcagt 10755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40391086 - 40390866
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40391086 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 40390987  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40390986 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttg 40390887  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40390886 aacacttgatatacaatcagt 40390866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40401750 - 40401528
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40401750 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 40401651  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40401650 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 40401551  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40401550 tgaacacttgatatacaatcagt 40401528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15992858 - 15993080
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15992858 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 15992957  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15992958 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 15993057  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15993058 tgaacacttgatatacaatcagt 15993080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16003420 - 16003642
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16003420 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16003519  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16003520 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 16003619  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16003620 tgaacacttgatatacaatcagt 16003642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27602947 - 27603169
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27602947 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 27603046  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603047 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 27603146  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27603147 tgaacacttgatatacaatcagt 27603169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39353219 - 39352997
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39353219 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 39353120  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39353119 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 39353020  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39353019 tgaacacttgatatacaatcagt 39352997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39365212 - 39364990
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39365212 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 39365113  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39365112 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 39365013  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39365012 tgaacacttgatatacaatcagt 39364990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5290104 - 5290327
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5290104 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 5290203  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290204 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 5290303  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5290304 ttgaacacttgatatacaatcagt 5290327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5300675 - 5300898
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5300675 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 5300774  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300775 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 5300874  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5300875 ttgaacacttgatatacaatcagt 5300898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6131522 - 6131300
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6131522 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6131423  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6131422 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 6131323  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6131322 tgaacacttgatatacaatcagt 6131300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9347273 - 9347051
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9347273 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9347174  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9347173 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 9347074  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9347073 tgaacacttgatatacaatcagt 9347051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23362842 - 23362620
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23362842 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23362743  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23362742 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttgaat 23362643  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23362642 tgaacacttgatatacaatcagt 23362620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34772641 - 34772419
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34772641 tgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 34772542  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772541 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 34772442  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34772441 tgaacacttgatatacaatcagt 34772419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34783586 - 34783364
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34783586 tgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 34783487  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783486 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 34783387  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34783386 tgaacacttgatatacaatcagt 34783364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14557544 - 14557768
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14557544 tgcacttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14557643  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557644 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14557743  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14557744 attgaacacttgatatacaatcagt 14557768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14568181 - 14568405
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14568181 tgcacttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14568280  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568281 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14568380  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14568381 attgaacacttgatatacaatcagt 14568405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30069432 - 30069655
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30069432 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaag 30069531  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069532 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 30069631  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30069632 ttgaacacttgatatacaatcagt 30069655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36582086 - 36582309
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36582086 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 36582185  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36582186 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaa 36582285  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36582286 ttgaacacttgatatacaatcagt 36582309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36592641 - 36592864
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36592641 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 36592740  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36592741 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgaa 36592840  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36592841 ttgaacacttgatatacaatcagt 36592864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9336686 - 9336464
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9336686 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9336587  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9336586 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 9336487  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9336486 tgaacacttgatatacaatcagt 9336464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22147253 - 22147032
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22147253 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22147155  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22147154 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22147055  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22147054 tgaacacttgatatacaatcagt 22147032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22157836 - 22157615
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22157836 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22157738  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22157737 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22157638  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22157637 tgaacacttgatatacaatcagt 22157615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22560168 - 22559946
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22560168 tgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22560069  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22560068 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgact 22559969  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22559968 tgaacacttgatatacaatcagt 22559946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27622296 - 27622518
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27622296 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaaga 27622395  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622396 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 27622495  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27622496 tgaacactttatatacaatcagt 27622518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9376990 - 9377213
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9376990 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 9377088  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377089 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 9377188  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9377189 attgaacacttgatatacaatcagt 9377213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14041329 - 14041106
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14041329 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14041231  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041230 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14041131  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14041130 attgaacacttgatatacaatcagt 14041106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15693560 - 15693783
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15693560 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 15693658  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693659 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 15693758  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15693759 attgaacacttgatatacaatcagt 15693783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15740700 - 15740477
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15740700 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 15740602  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740601 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 15740502  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15740501 attgaacacttgatatacaatcagt 15740477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15769860 - 15769637
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15769860 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 15769762  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769761 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 15769662  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15769661 attgaacacttgatatacaatcagt 15769637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17607791 - 17607568
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17607791 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 17607693  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607692 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17607593  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17607592 attgaacacttgatatacaatcagt 17607568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17618406 - 17618183
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17618406 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 17618308  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618307 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17618208  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17618207 attgaacacttgatatacaatcagt 17618183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17719649 - 17719426
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17719649 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 17719551  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719550 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17719451  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17719450 attgaacacttgatatacaatcagt 17719426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17730301 - 17730078
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17730301 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 17730203  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730202 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17730103  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17730102 attgaacacttgatatacaatcagt 17730078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23297010 - 23296786
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23297010 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 23296911  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296910 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 23296811  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23296810 attgaacacttgatatacaatcagt 23296786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23307578 - 23307354
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23307578 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 23307479  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307478 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 23307379  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23307378 attgaacacttgatatacaatcagt 23307354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23708175 - 23707951
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23708175 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 23708076  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708075 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 23707976  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23707975 attgaacacttgatatacaatcagt 23707951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24567821 - 24567598
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24567821 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24567723  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567722 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24567623  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24567622 attgaacacttgatatacaatcagt 24567598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24816414 - 24816637
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24816414 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24816512  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816513 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24816612  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24816613 attgaacacttgatatacaatcagt 24816637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24827002 - 24827225
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24827002 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 24827100  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827101 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24827200  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24827201 attgaacacttgatatacaatcagt 24827225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27041740 - 27041963
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27041740 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27041838  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041839 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27041938  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27041939 attgaacacttgatatacaatcagt 27041963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27052364 - 27052587
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27052364 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27052462  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052463 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27052562  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27052563 attgaacacttgatatacaatcagt 27052587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27460893 - 27460670
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27460893 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27460795  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460794 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27460695  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27460694 attgaacacttgatatacaatcagt 27460670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27471292 - 27471069
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27471292 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 27471194  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471193 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27471094  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27471093 attgaacacttgatatacaatcagt 27471069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30227023 - 30227247
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30227023 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 30227122  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227123 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 30227222  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  30227223 attgaacacttgatatacaatcagt 30227247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30237550 - 30237774
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30237550 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 30237649  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237650 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 30237749  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  30237750 attgaacacttgatatacaatcagt 30237774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31349265 - 31349042
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31349265 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 31349167  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349166 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 31349067  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  31349066 attgaacacttgatatacaatcagt 31349042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31359879 - 31359656
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31359879 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 31359781  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359780 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 31359681  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  31359680 attgaacacttgatatacaatcagt 31359656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35216238 - 35216015
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35216238 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 35216140  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216139 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35216040  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35216039 attgaacacttgatatacaatcagt 35216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35226822 - 35226599
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35226822 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 35226724  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226723 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35226624  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35226623 attgaacacttgatatacaatcagt 35226599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39490477 - 39490701
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39490477 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 39490576  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490577 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 39490676  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39490677 attgaacacttgatatacaatcagt 39490701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39501667 - 39501891
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39501667 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 39501766  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501767 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 39501866  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39501867 attgaacacttgatatacaatcagt 39501891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40513516 - 40513740
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40513516 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 40513615  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513616 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 40513715  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  40513716 attgaacacttgatatacaatcagt 40513740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27204523 - 27204301
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27204523 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaaga 27204424  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27204423 gtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 27204324  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27204323 tgaacacttgatatacaatcagt 27204301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14030776 - 14030553
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14030776 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14030678  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030677 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14030578  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14030577 attgaacacttgatatacaatcagt 14030553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14446529 - 14446752
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14446529 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14446627  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446628 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14446727  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14446728 attgaacacttgatatacaatcagt 14446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14457141 - 14457364
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14457141 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 14457239  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457240 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 14457339  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14457340 attgaacacttgatatacaatcagt 14457364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23697517 - 23697293
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  23697517 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaa 23697418  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697417 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 23697318  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23697317 attgaacacttgatatacaatcagt 23697293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24808644 - 24808421
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24808644 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 24808546  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808545 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24808446  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24808445 attgaacacttgatatacaatcagt 24808421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31834218 - 31833992
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  31834218 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgc 31834119  T
Q  97 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834118 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 31834019  T
Q  197 gacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  31834018 gaattgaacacttgatatacaatcagt 31833992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31844696 - 31844470
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  31844696 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgc 31844597  T
Q  97 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844596 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 31844497  T
Q  197 gacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  31844496 gaattgaacacttgatatacaatcagt 31844470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33951327 - 33951551
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  33951327 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 33951426  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951427 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 33951526  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  33951527 attgaacacttgatatacaatcagt 33951551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36688426 - 36688203
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36688426 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaa 36688328  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688327 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36688228  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36688227 attgaacacttgatatacaatcagt 36688203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36698992 - 36698769
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36698992 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaa 36698894  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698893 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36698794  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36698793 attgaacacttgatatacaatcagt 36698769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37728780 - 37729003
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37728780 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 37728878  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728879 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 37728978  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  37728979 attgaacacttgatatacaatcagt 37729003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37740096 - 37740319
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37740096 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 37740194  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740195 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 37740294  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  37740295 attgaacacttgatatacaatcagt 37740319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42043517 - 42043293
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42043517 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 42043418  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043417 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42043318  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  42043317 atcgaacacttgatatacaatcagt 42043293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42054092 - 42053868
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42054092 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 42053993  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053992 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42053893  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  42053892 atcgaacacttgatatacaatcagt 42053868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22676850 - 22676625
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22676850 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 22676751  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22676750 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 22676651  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  22676650 aattgaacacttgatatacaatcagt 22676625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22686741 - 22686516
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22686741 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 22686642  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22686641 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 22686542  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  22686541 aattgaacacttgatatacaatcagt 22686516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43043200 - 43043422
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43043200 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 43043299  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43043300 gtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgact 43043399  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43043400 tgaacacttgatatacaatcagt 43043422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6976542 - 6976317
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6976542 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 6976443  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6976442 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttga 6976343  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  6976342 aattgaacacttgatatacaatcagt 6976317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6987032 - 6986807
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6987032 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 6986933  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg- 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6986932 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaagatacagagaattgagtttga 6986833  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  6986832 aattgaacacttgatatacaatcagt 6986807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20798427 - 20798205
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20798427 tgcacttccaaggatatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20798328  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20798327 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgact 20798228  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20798227 tgaacacttgatatacaatcagt 20798205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31419394 - 31419172
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31419394 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaaga 31419295  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31419294 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgact 31419195  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31419194 tgaacacttgatatacaatcagt 31419172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1121431 - 1121653
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1121431 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1121530  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  1121531 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 1121630  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1121631 tgaacacttgatatacaatcagt 1121653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1108673 - 1108895
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1108673 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1108772  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  1108773 gtcttccaatgctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 1108872  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1108873 tgaacacttgatatacaatcagt 1108895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23407177 - 23406955
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23407177 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23407078  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  23407077 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 23406978  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23406977 tgaacacttgatatacaatcagt 23406955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36085192 - 36084970
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36085192 tgcacttccaaggagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 36085093  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  36085092 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 36084993  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36084992 tgaacacttgatatacaatcagt 36084970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36229470 - 36229248
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36229470 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaaga 36229371  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  36229370 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 36229271  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36229270 tgaacacttgatatacaatcagt 36229248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42395715 - 42395493
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  42395715 tgcacttccaagaagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaaga 42395616  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  42395615 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 42395516  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42395515 tgaacacttgatatacaatcagt 42395493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8522573 - 8522350
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8522573 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 8522474  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  8522473 agtcttccaatgctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgac 8522374  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8522373 ttgaacacttgatatacaatcagt 8522350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43621422 - 43621645
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43621422 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 43621521  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  43621522 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 43621621  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43621622 ttgaacacttgatatacaatcagt 43621645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31449285 - 31449063
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31449285 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaccacacacgcaaga 31449186  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31449185 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgact 31449086  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  31449085 tgaacacttgatatataatcagt 31449063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20552547 - 20552324
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20552547 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 20552448  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  20552447 agtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 20552348  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20552347 ttgaacacttgatatacaatcagt 20552324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21702653 - 21702875
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21702653 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaaga 21702752  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  ||||||||    
T  21702753 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgact 21702852  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21702853 tgaacacttgatatacaatcagt 21702875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23393132 - 23392910
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23393132 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaa 23393033  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  23393032 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 23392933  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23392932 tgaacgcttgatatacaatcagt 23392910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19464703 - 19464480
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19464703 tgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 19464604  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  19464603 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 19464504  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19464503 ttgaacacttgatatacaatcagt 19464480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20563057 - 20562834
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20563057 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaagcaag 20562958  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  20562957 agtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 20562858  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20562857 ttgaacacttgatatacaatcagt 20562834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34063352 - 34063130
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34063352 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 34063254  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||    
T  34063253 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgac 34063154  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34063153 ttgaacacttgatatacaatcagt 34063130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17446225 - 17446447
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17446225 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 17446323  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |  |||||||    
T  17446324 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgac 17446423  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  17446424 ttgaacactagatatacaatcagt 17446447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19478733 - 19478510
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19478733 tgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 19478634  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  19478633 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 19478534  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19478533 ttgaacacttgatatacaatcagt 19478510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34052691 - 34052473
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34052691 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 34052593  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||    
T  34052592 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgac 34052493  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34052492 ttgaacacttgatatacaat 34052473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24925666 - 24925890
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24925666 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaa 24925765  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  24925766 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttga 24925865  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24925866 cttgaacacttgatatacaatcagt 24925890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24982947 - 24983171
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24982947 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaa 24983046  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  24983047 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttga 24983146  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24983147 cttgaacacttgatatacaatcagt 24983171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17456841 - 17457063
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17456841 tgcacttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 17456939  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | | |  |||||||    
T  17456940 gtcttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacaggggaatatgtttgac 17457039  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17457040 ttgaacacttgatatacaatcagt 17457063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21705493 - 21705722
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatg-------ctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21705493 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacaca 21705592  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |    
T  21705593 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatg 21705692  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705693 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 21705722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37407378 - 37407157
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  37407378 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaaga 37407280  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||| |    
T  37407279 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgacc 37407181  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  37407180 ttgaacacttgatatataatcagt 37407157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 7031685 - 7031823
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7031685 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 7031784  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031785 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20625499 - 20625275
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  20625499 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaa 20625401  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||    
T  20625400 gaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttg 20625302  T
Q  198 actt-gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20625301 actttgaacacttgatatacaatcagt 20625275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 106852 - 106629
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | ||||||||| || || |    
T  106852 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--ttctcaagcacgcaggcga 106755  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||    
T  106754 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-agtgtttg 106656  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  106655 actttgaacacttgatatacaatcagt 106629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20417635 - 20417413
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  20417635 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcatgcga 20417539  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  20417538 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 20417440  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20417439 actttgaacacttgatatacaatcagt 20417413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32753474 - 32753696
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-actataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  32753474 tgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 32753570  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  32753571 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 32753669  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32753670 attttgaacacttgatatacaatcagt 32753696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 7031762 - 7031877
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7031762 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaaca 7031860  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  7031861 cttgatatacaatcagt 7031877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20215841 - 20215613
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  20215841 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacag 20215744  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaattg 191  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||     
T  20215743 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaacagaattatacagaaaatt- 20215645  T
Q  192 agtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20215644 -gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 20215613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40228070 - 40228299
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  40228070 tgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 40228167  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  40228168 ggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 40228267  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40228268 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 40228299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21420290 - 21420431
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||  || |||||||| || || |    
T  21420290 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa--tggtcaagcacgcaggcga 21420387  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgc 141  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21420388 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23477788 - 23478015
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||     
T  23477788 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcag 23477884  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    |    
T  23477885 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacactgaaaattg 23477984  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23477985 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 23478015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 13522637 - 13522779
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  13522637 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 13522733  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13522734 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40033463 - 40033321
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  40033463 tgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 40033366  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40033365 ggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 40033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35543833 - 35543694
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||  ||     
T  35543833 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcag 35543737  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 136  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35543736 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-t 121  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||      
T  13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
Q  122 aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13403800 aagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36096357 - 36096215
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  36096357 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 36096261  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36096260 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36097814 - 36097672
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  36097814 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 36097718  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36097717 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32160161 - 32160389
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || | ||||||||||||    
T  32160161 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattactcaagcacaca 32160257  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  32160258 ggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 32160357  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32160358 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 32160389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35543733 - 35543637
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543733 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctgatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 35543637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078502
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctt--aagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||  | ||||||||||| ||| |||||||    
T  12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagacttttaa-caaacaa 12078455  T
Q  177 a-aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    | | || | |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12078456 agattataaagaatattgtttgaattgaacacttgatatacaatcag 12078502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20168772 - 20168630
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  20168772 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 20168676  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20168675 gcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 13522737 - 13522834
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13522737 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 13522834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25112519 - 25112374
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  25112519 tgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 25112420  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  25112419 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacctgatatacaatcagt 25112374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25171610 - 25171465
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  25171610 tgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 25171511  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  25171510 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacctgatatacaatcagt 25171465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36096257 - 36096160
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36096257 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 36096160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36097714 - 36097617
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36097714 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 36097617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 20550432 - 20550531
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  20550432 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaaattacaaagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaagcagt 20550531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11208733 - 11208506
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactatcaa--aatatgagacttcacaaaactgctcaagcacac 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  11208733 tgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatacta-caactagtatgagacttcaaaa---tgctcaagcacac 11208638  T
Q  93 acgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaat 189  Q
    | ||||||  |||||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | ||   |||||| |||    
T  11208637 a-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattgtacagaaaat 11208539  T
Q  190 tgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11208538 t--gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 11208506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 1914940 - 1915057
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  1914940 aatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1915039  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1915040 acttgatatacaatcagt 1915057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533559
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaataacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatca 13533559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 1914887 - 1915000
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 121  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  1914887 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcacta 1914984  T
Q  122 aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||||||||||||    
T  1914985 aagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 23487964 - 23488104
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||     
T  23487964 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcag 23488060  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23488061 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20168645 - 20168575
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20168645 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactctgaacacttgatatacaatcagt 20168575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 13403755 - 13403872
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    ||||||  ||||||    
T  13403755 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattgtttgagtttgaac 13403854  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  13403855 acttgatatactatcagt 13403872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Original strand, 20567296 - 20567396
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  20567296 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaac 20567395  T
Q  175 a 175  Q
    |    
T  20567396 a 20567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589298
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 23589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 643299 - 643200
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  643299 caagagacttctcatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgagcttgaacatttgatatacaatcagt 643200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Original strand, 16607020 - 16607149
Alignment:
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||||    |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||| |  |    
T  16607020 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacaattgcaagatacttctattcaaacagaactacaaagaaatatg 16607119  T
Q  194 tttgac-ttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16607120 tttgaggttgaacacttgatatacaatcag 16607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 26013262 - 26013310
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26013262 tgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Original strand, 26013304 - 26013393
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 168  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  26013304 tgctcaagcacacaaacaagagacttcagatgctcaatcacaactgaaagagacttccaatgcttaagcatgcaagcaagacacttctaa 26013393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26056093 - 26056025
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26056093 gcaagagacttctaaacaaacaaat-tacacagaaataactttggtttgaacacttgatatacaatcagt 26056025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40033381 - 40033268
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  40033381 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 40033282  T
Q  206 acttgatatacaat 219  Q
    ||||||||||||||    
T  40033281 acttgatatacaat 40033268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 23488061 - 23488161
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23488061 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcag 23488160  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  23488161 t 23488161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 108)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5022379 - 5022601
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022379 tgcacttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 5022478  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022479 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 5022578  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5022579 tgaacacttgatatacaatcagt 5022601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18753102 - 18752884
Alignment:
Q  5 cttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753102 cttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct 18753003  T
Q  105 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753002 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaa 18752903  T
Q  205 cacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18752902 cacttgatatacaatcagt 18752884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18763716 - 18763494
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763716 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 18763617  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763616 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 18763517  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18763516 tgaacacttgatatacaatcagt 18763494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 48370774 - 48370996
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48370774 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 48370873  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370874 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 48370973  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48370974 tgaacacttgatatacaatcagt 48370996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 450219 - 450441
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  450219 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 450318  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  450319 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 450418  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  450419 tgaacacttgatatacaatcagt 450441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15561696 - 15561474
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15561696 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 15561597  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15561596 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 15561497  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15561496 tgaacacttgatatacaatcagt 15561474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19955579 - 19955357
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19955579 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19955480  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19955479 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19955380  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19955379 tgaacacttgatatacaatcagt 19955357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21996056 - 21996278
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21996056 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 21996155  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21996156 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 21996255  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21996256 tgaacacttgatatacaatcagt 21996278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22006654 - 22006876
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22006654 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22006753  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22006754 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22006853  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22006854 tgaacacttgatatacaatcagt 22006876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27815562 - 27815340
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27815562 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 27815463  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815462 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 27815363  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27815362 tgaacacttgatatacaatcagt 27815340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30927111 - 30926889
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30927111 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 30927012  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30927011 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 30926912  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30926911 tgaacacttgatatacaatcagt 30926889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17917694 - 17917917
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17917694 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaag 17917793  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17917794 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgag 17917893  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17917894 ttgaacacttgatatacaatcagt 17917917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4947980 - 4948202
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4947980 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4948079  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4948080 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 4948179  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4948180 tgaacacttgatatacaatcagt 4948202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14844270 - 14844048
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14844270 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 14844171  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14844170 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 14844071  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14844070 tgaacacttgatatacaatcagt 14844048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19944944 - 19944722
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19944944 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19944845  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19944844 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19944745  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19944744 tgaacacttgatatacaatcagt 19944722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30937689 - 30937467
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30937689 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 30937590  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30937589 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacggagaattgagtttgaat 30937490  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30937489 tgaacacttgatatacaatcagt 30937467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40471204 - 40470982
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40471204 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 40471105  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40471104 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgact 40471005  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40471004 tgaacacttgatatacaatcagt 40470982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 460800 - 461022
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  460800 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 460899  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  460900 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 460999  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  461000 tgaacacttgatatacaatcagt 461022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40454966 - 40454744
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40454966 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 40454867  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40454866 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgact 40454767  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40454766 tgaacacttgatatacaatcagt 40454744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36017978 - 36018201
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36017978 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 36018076  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018077 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36018176  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36018177 attgaacacttgatatacaatcagt 36018201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36028531 - 36028754
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36028531 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 36028629  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028630 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36028729  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36028730 attgaacacttgatatacaatcagt 36028754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 49517777 - 49518000
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49517777 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 49517875  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517876 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 49517975  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  49517976 attgaacacttgatatacaatcagt 49518000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17928342 - 17928565
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17928342 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaag 17928441  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17928442 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgag 17928541  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17928542 ttgaacacttgatatacaatcagt 17928565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24028705 - 24028480
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  24028705 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgca 24028606  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028605 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 24028506  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  24028505 agttgaacacttgatatacaatcagt 24028480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25656778 - 25656999
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25656778 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 25656877  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25656878 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgact 25656977  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25656978 tgaacacttgatatacaatcag 25656999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27656241 - 27656465
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27656241 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 27656340  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656341 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27656440  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27656441 attgaacacttgatatacaatcagt 27656465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27666814 - 27667038
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27666814 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 27666913  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666914 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 27667013  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27667014 attgaacacttgatatacaatcagt 27667038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29042274 - 29042051
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29042274 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 29042176  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042175 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 29042076  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29042075 attgaacacttgatatacaatcagt 29042051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16255509 - 16255731
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16255509 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16255607  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16255608 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaa 16255707  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16255708 ttgaacacttgatatacaatcagt 16255731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16266102 - 16266324
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16266102 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16266200  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16266201 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaattacagagaattgagtttgaa 16266300  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16266301 ttgaacacttgatatacaatcagt 16266324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 52703434 - 52703653
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52703434 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtc 52703533  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  52703534 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttaa 52703633  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52703634 acacttgatatacaatcagt 52703653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18130859 - 18130634
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18130859 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 18130760  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18130759 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttg 18130660  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  18130659 aattgaacacttgatatacaatcagt 18130634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10741212 - 10740989
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10741212 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10741114  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10741113 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttga 10741014  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10741013 attgaacacttgatatacaatcagt 10740989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10954981 - 10954758
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10954981 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10954883  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10954882 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttga 10954783  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10954782 attgaacacttgatatacaatcagt 10954758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24639890 - 24640113
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24639890 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 24639988  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639989 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24640088  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24640089 attgaacacttgatatacaatcagt 24640113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55745870 - 55745647
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  55745870 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 55745772  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745771 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 55745672  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  55745671 attgaacacttgatatacaatcagt 55745647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10909050 - 10909272
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10909050 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 10909149  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  10909150 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 10909249  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10909250 tgaacacttgatatacaatcagt 10909272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10751786 - 10751563
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10751786 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10751688  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10751687 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttga 10751588  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10751587 attgaacacttgatatacaatcagt 10751563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10965555 - 10965332
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10965555 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10965457  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10965456 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaatacagagaattgagtttga 10965357  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10965356 attgaacacttgatatacaatcagt 10965332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18078525 - 18078301
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18078525 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 18078426  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18078425 gaggcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttga 18078326  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  18078325 cttgaacgcttgatatacaatcagt 18078301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 55756481 - 55756258
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  55756481 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 55756383  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55756382 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttga 55756283  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  55756282 attgaacacttgatatacaatcagt 55756258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 16316976 - 16317195
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16316976 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtc 16317075  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  16317076 ttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttga 16317175  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16317176 acacttgatatacaatcagt 16317195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10695284 - 10695505
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10695284 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaaga 10695382  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  10695383 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgact 10695482  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10695483 tgaacacttgatatacaatcagt 10695505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 16304752 - 16304971
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16304752 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtc 16304851  T
Q  104 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  16304852 ttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaaaatacaatgaaataagtttgacttga 16304951  T
Q  204 acacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16304952 acacttgatatacaatcagt 16304971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14836719 - 14836497
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  14836719 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaaga 14836620  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  14836619 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 14836520  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14836519 tgaacacttgatatacaatcagt 14836497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5873014 - 5873235
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||    
T  5873014 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaaga 5873112  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  5873113 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaatatgtttgact 5873212  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5873213 tgaacacttgatatacaatcagt 5873235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3370356 - 3370580
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  3370356 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 3370455  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  3370456 agtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgat 3370555  T
Q  200 t-tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3370556 tatgaacacttgatatacaatcagt 3370580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4987025 - 4986805
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4987025 cacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagt 4986926  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||    
T  4986925 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttg 4986826  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4986825 aacacttgatatacaatcagt 4986805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3390096 - 3390320
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  3390096 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 3390195  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga- 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  3390196 agtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgat 3390295  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  3390296 gatgaacacttgatatacaatcagt 3390320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15208004 - 15207782
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||    
T  15208004 tgcacttccaaggagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaaga 15207906  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |  |||||||    
T  15207905 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgac 15207806  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15207805 ttgaacacttgatatacaatcagt 15207782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19580883 - 19581105
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  19580883 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggaaaga 19580981  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa-aaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||| ||| |  |||||||    
T  19580982 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaaaaagaaatacagggaaatatgtttgac 19581081  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19581082 ttgaacacttgatatacaatcagt 19581105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10300176 - 10300399
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  10300176 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggctag 10300274  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  10300275 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttga 10300374  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10300375 cttgaacacttgatatacaatcagt 10300399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11535486 - 11535709
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  11535486 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 11535584  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  11535585 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 11535683  T
Q  199 c-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11535684 ctttgaacacttgatatacaatcagt 11535709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 25008538 - 25008689
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25008538 tgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 25008637  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25008638 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 25008689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31267411 - 31267187
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  31267411 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 31267313  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  31267312 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttg 31267214  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  31267213 actttgaacacttgatatacaatcagt 31267187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 47152665 - 47152528
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47152665 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 47152567  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47152566 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24713069 - 24713295
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || | |||    
T  24713069 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaaaa-tgctcaagcacgcaggaaag 24713167  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttct----aatcaaacaaaaatacagagaattgagtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||| |||||      ||||||||||||||||||||    |||    
T  24713168 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcagacgagaggcttctgtacgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtt 24713266  T
Q  196 tga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24713267 tgaccttgaacacttgatatacaatcagt 24713295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 11514676 - 11514896
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  11514676 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 11514773  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||    
T  11514774 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacatagaa-aatgtttg 11514872  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatc 220  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  11514873 actttgaacacttgatatacaatc 11514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19143621 - 19143504
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19143621 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaaga 19143522  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagc 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19143521 gtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49002598 - 49002376
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  49002598 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcatgcga 49002502  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  49002501 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 49002403  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  49002402 actttgaacacttgatatacaatcagt 49002376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 55650965 - 55651187
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-actataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  55650965 tgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 55651061  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  55651062 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 55651160  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  55651161 acattgaacacttgatatacaatcagt 55651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19241660 - 19241887
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  19241660 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 19241756  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  19241757 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 19241856  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19241857 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 19241887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8183557 - 8183486
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8183557 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 10290267 - 10290345
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  10290267 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 23508784 - 23508926
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  23508784 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 23508880  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23508881 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18775301 - 18775076
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |  |||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  18775301 tgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactgcctag-tgggagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 18775205  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  18775204 gcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 18775105  T
Q  194 tttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18775104 tttgactttgaacacttgatatacaatca 18775076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 19570659 - 19570711
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570659 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Original strand, 4987052 - 4987138
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4987052 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgatatacaatcagt 4987138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16819967 - 16819825
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  16819967 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaactag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 16819871  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16819870 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 23508884 - 23508980
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508884 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 23508980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14711397 - 14711253
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  14711397 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 14711300  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14711299 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14779061 - 14778917
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  14779061 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 14778964  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14778963 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18007707 - 18007480
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||   ||| ||||||||||| ||     
T  18007707 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc--aaattgctcaagcacgcag 18007611  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  18007610 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 18007511  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18007510 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 18007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16819867 - 16819770
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16819867 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 16819770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 33377903 - 33378048
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | ||    
T  33377903 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaa 33378002  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||  ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33378003 ttacgcagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 33378048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1672023
Alignment:
Q  110 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacac 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 1672007  T
Q  208 ttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  1672008 ttgatatacaatcagt 1672023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17994343 - 17994267
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17994343 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 17994267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36210728 - 36210587
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |  | ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||     
T  36210728 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaa--tgctcaagcacgcag 36210631  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36210630 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532191
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagagaa-aatgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 39532191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47152589 - 47152473
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga-gtttgacttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||   | |||||||||||||    
T  47152589 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagtcttctaatcaaacaaagatacagggaaaatatgtttgacttgaac 47152491  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||||||||||||||    
T  47152490 acatgatatacaatcagt 47152473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8997743 - 8997675
Alignment:
Q  155 caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8997743 caagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgtcttgaacacttgatatacaatcagt 8997675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
Q  23 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 117  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773637
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttctaat 18773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18775911 - 18775816
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||||| ||| || |||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18775911 agagacttccaatactcaagcactcgggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaagattgtttgactttgaacacttgatatacaatca 18775816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 7222001 - 7222142
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||  |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||     
T  7222001 tgctcaagcacataagcaagagacttcaaacactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaacaaat 7222100  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatca 221  Q
     |||| |||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  7222101 -tacacagaaataagttttatttgaacacttgatatgcaatca 7222142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17994310 - 17994212
Alignment:
Q  126 aagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17994310 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 17994212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 23123055 - 23123156
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa--tcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23123055 caagagacttctaatgctcaagcacaatggcaagagacttctaaattcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 23123154  T
Q  222 gt 223  Q
    ||    
T  23123155 gt 23123156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 9920991 - 9920958
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9920991 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17526925 - 17526857
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17526925 gcaaaagacttctaaacaaacaaat-tacaaagaattcagtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 17526857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19889608 - 19889495
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19889608 aaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaac 19889509  T
Q  175 aaaaatacagagaa 188  Q
    | || |||| ||||    
T  19889508 agaattacacagaa 19889495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41115381 - 41115232
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||    
T  41115381 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgcttaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaac 41115282  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  41115281 agaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatgtacaatcagt 41115232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 17199106 - 17199074
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199106 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 18394034 - 18394177
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||| ||| |||| ||||| ||||||  |  ||||||||||| || ||||||||     
T  18394034 tgctcaagaacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaacagatttcttatgctcaagcacaaaaacaagagacttcaaaacaaacaaat 18394133  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||  | || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18394134 -tacgaaaaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 18394177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 28050206 - 28050238
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050206 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 49509620 - 49509652
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49509620 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17788613 - 17788514
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17788613 caagagaattcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 17788514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491310
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||| || |||  |  |||||||||||||| ||||| |||    
T  32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttctaaacaaac-aaa 32491346  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatat 214  Q
     |||| |||| | |||||   |||||||||||||||    
T  32491345 ttacaaagaaataagtttagtttgaacacttgatat 32491310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671966
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1671966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 17539965 - 17540035
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  17539965 gcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatataatcagt 17540035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 19052754 - 19052803
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19052754 tgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3105995 - 3105895
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa--tcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3105995 caagagacttctattgctcaagcacaaatgcaagagacttctgaattcaaacagaattacaaagaaaattgtttgaaatgaacacttgatatacaatcag 3105896  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  3105895 t 3105895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Original strand, 9266769 - 9266854
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 164  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  9266769 tgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 13890317 - 13890466
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  ||| || ||||  ||||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||    
T  13890317 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaatagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagtcttctaaacaaac 13890416  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttgacttg-aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || |||| |||| |  ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13890417 acaattacacagaaatatgtttgaggtggaacacttgatatacaatcagt 13890466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14154601 - 14154528
Alignment:
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 168  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  14154601 caagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaa 14154528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14711315 - 14711198
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  14711315 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 14711216  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14711215 acttgatatactatcagt 14711198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14778979 - 14778862
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  14778979 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 14778880  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14778879 acttgatatactatcagt 14778862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16325124 - 16325024
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  16325124 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaagattcttcttatgctcaagcacaaaagcaatagacttctaatcaaac 16325025  T
Q  175 a 175  Q
    |    
T  16325024 a 16325024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 135
Target Start/End: Original strand, 24619175 - 24619231
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 135  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24619175 tgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51629844 - 51629620
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51629844 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 51629745  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629744 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 51629645  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  51629644 attgaacacttgatatacaatcagt 51629620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51657105 - 51656881
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51657105 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 51657006  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657005 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 51656906  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  51656905 attgaacacttgatatacaatcagt 51656881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4177467 - 4177689
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4177467 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4177566  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177567 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 4177666  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4177667 tgaacacttgatatacaatcagt 4177689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35012480 - 35012702
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35012480 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 35012579  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012580 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 35012679  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35012680 tgaacacttgatatacaatcagt 35012702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5640365 - 5640143
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5640365 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 5640266  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5640265 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 5640166  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5640165 tgaacacttgatatacaatcagt 5640143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10998439 - 10998217
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10998439 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 10998340  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10998339 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 10998240  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10998239 tgaacacttgatatacaatcagt 10998217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12730099 - 12730321
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12730099 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12730198  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12730199 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12730298  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12730299 tgaacacttgatatacaatcagt 12730321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12740692 - 12740914
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12740692 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12740791  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12740792 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12740891  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12740892 tgaacacttgatatacaatcagt 12740914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12898636 - 12898414
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12898636 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12898537  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12898536 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12898437  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12898436 tgaacacttgatatacaatcagt 12898414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21863213 - 21863435
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21863213 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 21863312  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21863313 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 21863412  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21863413 tgaacacttgatatacaatcagt 21863435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 33084113 - 33084336
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33084113 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 33084212  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084213 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 33084312  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33084313 ttgaacacttgatatacaatcagt 33084336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5650922 - 5650700
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5650922 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaaga 5650823  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5650822 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 5650723  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5650722 tgaacacttgatatacaatcagt 5650700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19178511 - 19178733
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19178511 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19178610  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19178611 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19178710  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19178711 tgaacacttgatatacaatcagt 19178733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19187390 - 19187612
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19187390 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19187489  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19187490 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19187589  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19187590 tgaacacttgatatacaatcagt 19187612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35405049 - 35404825
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35405049 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 35404950  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35404949 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35404850  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35404849 attgaacacttgatatacaatcagt 35404825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35649348 - 35649124
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35649348 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 35649249  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649248 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35649149  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35649148 attgaacacttgatatacaatcagt 35649124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38094626 - 38094850
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38094626 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 38094725  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094726 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 38094825  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  38094826 attgaacacttgatatacaatcagt 38094850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38105251 - 38105475
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38105251 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 38105350  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105351 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 38105450  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  38105451 attgaacacttgatatacaatcagt 38105475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12614969 - 12614749
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12614969 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 12614870  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12614869 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12614770  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12614769 aacacttgatatacaatcagt 12614749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12624434 - 12624214
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12624434 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 12624335  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12624334 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattg 12624235  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12624234 aacacttgatatacaatcagt 12624214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7690117 - 7689892
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact---gctcaagcacacacgca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7690117 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgca 7690018  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690017 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 7689918  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  7689917 aattgaacacttgatatacaatcagt 7689892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21877318 - 21877541
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21877318 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 21877417  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21877418 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 21877517  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21877518 ttgaacacttgatatacaatcagt 21877541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5832769 - 5832992
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5832769 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 5832867  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832868 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5832967  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5832968 attgaacacttgatatacaatcagt 5832992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5843371 - 5843594
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5843371 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 5843469  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843470 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 5843569  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5843570 attgaacacttgatatacaatcagt 5843594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7506852 - 7507076
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7506852 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 7506951  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506952 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 7507051  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  7507052 attgaacacttgatatacaatcagt 7507076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7517449 - 7517673
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7517449 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 7517548  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517549 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 7517648  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  7517649 attgaacacttgatatacaatcagt 7517673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36237086 - 36236862
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36237086 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 36236987  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36236986 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36236887  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36236886 attgaacacttgatatacaatcagt 36236862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36247633 - 36247409
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36247633 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 36247534  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247533 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36247434  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36247433 attgaacacttgatatacaatcagt 36247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3171173 - 3171396
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3171173 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 3171271  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171272 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 3171371  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  3171372 attgaacacttgatatacaatcagt 3171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3181775 - 3181998
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3181775 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 3181873  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181874 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 3181973  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  3181974 attgaacacttgatatacaatcagt 3181998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47608587 - 47608364
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47608587 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 47608489  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608488 gagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 47608389  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  47608388 attgaacacttgatatacaatcagt 47608364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47619195 - 47618972
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47619195 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 47619097  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619096 gagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 47618997  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  47618996 attgaacacttgatatacaatcagt 47618972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35638691 - 35638472
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35638691 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagt 35638592  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35638591 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat-cagagaattgagtttgaattg 35638493  T
Q  203 aacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35638492 aacacttgatatacaatcagt 35638472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2538087 - 2538310
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2538087 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 2538185  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538186 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 2538285  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2538286 attgaacacttgatatacaatcagt 2538310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 148869 - 148646
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  148869 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 148770  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  148769 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgac 148670  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  148669 ttgaacacttgatatacaatcagt 148646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5973310 - 5973532
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5973310 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 5973409  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  5973410 gtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatgcaatgaattaagtttgact 5973509  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5973510 tgaacacttgatatacaatcagt 5973532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20441971 - 20441749
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20441971 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20441872  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  20441871 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 20441772  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20441771 tgaacacttgatatacaatcagt 20441749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 154944 - 154721
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  154944 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaag 154845  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  154844 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgac 154745  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  154744 ttgaacacttgatatacaatcagt 154721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4251223 - 4250997
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc----acaaaactgctcaagcacacacgc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||||||||||||||    
T  4251223 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgc 4251124  T
Q  97 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  4251123 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagttt 4251024  T
Q  197 gacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4251023 gacttgaacacttgatatacaatcagt 4250997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7677396 - 7677618
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7677396 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaaga 7677495  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  7677496 gttttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 7677595  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7677596 tgaacacttgatatacaatcagt 7677618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 4166872 - 4167033
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4166872 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 4166971  T
Q  162 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4166972 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 4167033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18382558 - 18382336
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18382558 tgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacatgcaaga 18382460  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    |||||||    
T  18382459 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaacatgtttgac 18382360  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18382359 ttgaacacttgatatacaatcagt 18382336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39586523 - 39586744
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39586523 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 39586621  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||   ||| | ||||||| |    
T  39586622 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaaaataccatgaaataagtttgatt 39586721  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  39586722 tgaacacttgatatactatcagt 39586744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17956790 - 17957013
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa-gcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17956790 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaagcacacacgcaag 17956889  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga- 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  17956890 agtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgat 17956988  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17956989 cttgaatacttgatatacaatcagt 17957013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39194750 - 39194526
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  39194750 tgcacttccagctagatttcactacaatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 39194651  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  39194650 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttga 39194551  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39194550 cttgaacacttgatatacaatcagt 39194526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12944760 - 12944983
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  12944760 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaag 12944858  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  12944859 agacttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttga 12944958  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12944959 cttgaacacttgatatacaatcagt 12944983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20196348 - 20196125
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||    
T  20196348 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgag 20196250  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    |||||    
T  20196249 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaaatacagagaa-aatgtttg 20196151  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20196150 aattgaacacttgatatacaatcagt 20196125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23580951 - 23580816
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23580951 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaaga 23580852  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580851 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11195725 - 11195501
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11195725 tgcacttccaaggagattttcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaa 11195627  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  11195626 gagtcttccaatgatcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttg 11195528  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11195527 actttgaacacttgatatactatcagt 11195501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47195036
Alignment:
Q  83 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 182  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 47194995  T
Q  183 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194996 aatgaaataagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 47195036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9051113 - 9050994
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9051113 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaaga 9051014  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9051013 gtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18311630 - 18311406
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  18311630 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 18311532  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||| ||||    |||||    
T  18311531 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacataattacacagaa-aatgtttg 18311433  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  18311432 actttgaacacttgatatacaatcagt 18311406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22610634 - 22610408
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  22610634 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 22610538  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  22610537 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 22610438  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22610437 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 22610408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47194755 - 47194919
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  47194755 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaaga 47194853  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||| ||||    
T  47194854 gtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttc 47194919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14388785 - 14388560
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  14388785 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 14388687  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaacaaaaatacagagaattgagttt 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| | ||    ||||    
T  14388686 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaatcaaacagaattacaca-aaaaatgttt 14388588  T
Q  197 gac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14388587 gactttgaacacttgatatacaatcagt 14388560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 674997 - 675219
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  674997 tgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 675093  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||    |||||    
T  675094 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacataa-aatgtttg 675192  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  675193 actttgaacacttgatatacaatcagt 675219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41133271 - 41133050
Alignment:
Q  4 acttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || |    
T  41133271 acttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgaggg 41133175  T
Q  102 tcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat---acagagaattgagtttg 197  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||  |||||    
T  41133174 acttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacataaattacacagaaaatt--gtttg 41133077  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||||| |||||||||||||||||    
T  41133076 actttgaactcttgatatacaatcagt 41133050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050920
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaaca 9050937  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  9050936 cttgatatacaatcagt 9050920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23580857 - 23580759
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580857 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 23580759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5929125 - 5929351
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  5929125 tgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 5929220  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    |    
T  5929221 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacaaaaaattg 5929320  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5929321 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 5929351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 46181509 - 46181367
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  46181509 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcat 46181413  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46181412 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 16710385 - 16710457
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16710385 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28379408 - 28379637
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28379408 tgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacaca 28379505  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
      |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||        
T  28379506 aacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaatt 28379605  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28379606 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 28379637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 22018775 - 22018974
Alignment:
Q  25 taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  22018775 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaa 22018872  T
Q  124 -gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
     | ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22018873 agaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 22018972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642537
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 22642491  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22642492 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 22642537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23926477 - 23926706
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| |||   |||||||| || ||    
T  23926477 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaat--tgctcaaggacgca 23926574  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||        
T  23926575 ggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatt 23926674  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23926675 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 23926706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34256099 - 34255955
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 179  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||     
T  34256099 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaacagaat 34256000  T
Q  180 tacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34255999 tacacagaaaattgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 34255955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 46181429 - 46181313
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  46181429 aatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 46181330  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  46181329 cttgatatacaatcagt 46181313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965763
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 142  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgct 19965763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 28473676 - 28473818
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  28473676 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 28473772  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28473773 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 4717683 - 4717736
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4717683 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
T  20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
Q  123 agcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||    
T  20884386 agcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17370456 - 17370684
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  17370456 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgca 17370552  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | || |||| ||||        
T  17370553 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacagaaaatt 17370652  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17370653 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 17370684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867287
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 20867287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26548856 - 26548695
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||    
T  26548856 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagag 26548759  T
Q  161 acttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26548758 acttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgattttgaacacttgatatacaatcagt 26548695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19037642
Alignment:
Q  75 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 173  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19037598  T
Q  174 caaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatac 216  Q
    || || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||    
T  19037599 cagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatac 19037642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20884412 - 20884316
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884412 agagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 20884316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 45071259 - 45071117
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  45071259 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 45071163  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45071162 gctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 20251219 - 20251361
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  20251219 tgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaaaaa--tgctcaagcacgca 20251316  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20251317 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Original strand, 22642346 - 22642448
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||    
T  22642346 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 22642443  T
Q  161 acttc 165  Q
    |||||    
T  22642444 acttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52351250 - 52351174
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52351250 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 52351174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655119
Alignment:
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 22655088  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22655089 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 22655119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26280633 - 26280491
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26280633 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaaatt 26280534  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26280533 acacagaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcag 26280491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 8698357 - 8698497
Alignment:
Q  83 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 181  Q
    ||||||||||| | || || |||| ||| ||||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  8698357 tcaagcacacaagaaaaagacttcaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaat-ta 8698455  T
Q  182 cagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8698456 caaagaattaagtttcgtttgaacacttgatatacaatcagt 8698497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19170992 - 19170764
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  19170992 tgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgca 19170896  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||        
T  19170895 ggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacaaaaaatt 19170796  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19170795 gtttgagttttaacacttgatatacaatcagt 19170764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 28473756 - 28473873
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  28473756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 28473855  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28473856 acttgatatacaatcagt 28473873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44200458 - 44200604
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca----c 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||    |    
T  44200458 tgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcatgcgc 44200554  T
Q  91 acacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
     |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44200555 gcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaat 44200604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 31358825 - 31358967
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||| |  | ||||||||||||||| ||||||||     
T  31358825 tgctcaagcacacaagcaaaaaacttcaaattctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat 31358924  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31358925 -tacaaagaaataagtttgg-ttgaacacttgatatacaatcagt 31358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346358
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaa 9346358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16233683 - 16233624
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16233683 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttctaa 16233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17025551 - 17025404
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  17025551 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaac 17025452  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    | || ||||  |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17025451 agaattacaaggaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 17025404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543624
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52351217 - 52351119
Alignment:
Q  126 aagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52351217 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 52351119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2819849 - 2819749
Alignment:
Q  122 aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2819849 aagcaaaagatttccaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaat-tacaaagaaatatgtttggtttgaacacttgatatacaatca 2819751  T
Q  222 gt 223  Q
    ||    
T  2819750 gt 2819749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 25218075 - 25218042
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218075 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 36551192 - 36551159
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551192 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45071159 - 45071062
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45071159 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttttaacacttgatatacaatcagt 45071062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 7309312 - 7309459
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa--tcaaacaa 176  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||  |||||||     
T  7309312 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagagacttctaaattcaaacag 7309411  T
Q  177 aaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||| ||||    || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7309412 aattacacagaaaattgtctgaggttgaacacttgatatacaatcagt 7309459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 13223605 - 13223637
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223605 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 24049152 - 24049120
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049152 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 36100092 - 36100124
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36100092 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543681
Alignment:
Q  110 tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacac 207  Q
    |||||||||||  |||||||||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||    
T  21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacac 21543665  T
Q  208 ttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  21543666 ttgatatacaatcagt 21543681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 9749873 - 9749843
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcac 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749873 tgcacttccaaggagatttcactataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867341
Alignment:
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 21028365 - 21028435
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21028365 gcaagatacttctattcaaacagaattacaaagaatatagtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 21028435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280547
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 20251301 - 20251418
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  20251301 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 20251400  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20251401 acttgatatacaatcagt 20251418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18130570 - 18130506
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18130570 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 18130506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 90)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6319161 - 6318939
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6319161 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6319062  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319061 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 6318962  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6318961 tgaacacttgatatacaatcagt 6318939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26110866 - 26111088
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26110866 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 26110965  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110966 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 26111065  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26111066 tgaacacttgatatacaatcagt 26111088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9857122 - 9856900
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9857122 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9857023  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9857022 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 9856923  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9856922 tgaacacttgatatacaatcagt 9856900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43247960 - 43248182
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43247960 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 43248059  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248060 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 43248159  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43248160 tgaacacttgatatacaatcagt 43248182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3220267 - 3220489
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3220267 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 3220366  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220367 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 3220466  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3220467 tgaacacttgatatacaatcagt 3220489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18449005 - 18449227
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18449005 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 18449104  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18449105 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 18449204  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18449205 tgaacacttgatatacaatcagt 18449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19128383 - 19128605
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19128383 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 19128482  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19128483 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19128582  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19128583 tgaacacttgatatacaatcagt 19128605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32078341 - 32078119
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32078341 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 32078242  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32078241 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 32078142  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32078141 tgaacacttgatatacaatcagt 32078119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32088914 - 32088692
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32088914 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 32088815  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  32088814 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaat 32088715  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32088714 tgaacacttgatatacaatcagt 32088692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36292554 - 36292778
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36292554 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 36292653  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36292654 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 36292753  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36292754 attgaacacttgatatacaatcagt 36292778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36303157 - 36303381
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36303157 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 36303256  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36303257 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagagttgagtttga 36303356  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36303357 attgaacacttgatatacaatcagt 36303381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6150704 - 6150925
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6150704 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6150802  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6150803 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 6150902  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6150903 tgaacacttgatatacaatcagt 6150925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6160659 - 6160880
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6160659 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6160757  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6160758 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 6160857  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6160858 tgaacacttgatatacaatcagt 6160880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 241457 - 241681
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  241457 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 241556  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241557 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 241656  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  241657 attaaacacttgatatacaatcagt 241681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 252042 - 252266
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  252042 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 252141  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252142 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 252241  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  252242 attaaacacttgatatacaatcagt 252266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 794812 - 795036
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  794812 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 794911  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794912 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 795011  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  795012 attaaacacttgatatacaatcagt 795036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 849614 - 849390
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  849614 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 849515  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849514 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 849415  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  849414 attaaacacttgatatacaatcagt 849390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3349273 - 3349050
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3349273 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 3349175  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349174 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 3349075  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  3349074 attgaacacttgatatacaatcagt 3349050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3359870 - 3359647
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3359870 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 3359772  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359771 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 3359672  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  3359671 attgaacacttgatatacaatcagt 3359647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9340778 - 9341001
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9340778 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 9340876  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340877 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 9340976  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9340977 attgaacacttgatatacaatcagt 9341001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9367922 - 9368145
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9367922 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 9368020  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368021 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 9368120  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9368121 attgaacacttgatatacaatcagt 9368145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 44480725 - 44480948
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44480725 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 44480823  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480824 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 44480923  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  44480924 attgaacacttgatatacaatcagt 44480948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 44491341 - 44491564
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44491341 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 44491439  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491440 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 44491539  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  44491540 attgaacacttgatatacaatcagt 44491564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26120541 - 26120766
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  26120541 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgca 26120640  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120641 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 26120740  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  26120741 aattgaacacttgatatacaatcagt 26120766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19138915 - 19139137
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19138915 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaaga 19139014  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19139015 gtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 19139114  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19139115 tgaacacttgatatacaatcagt 19139137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31214647 - 31214869
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31214647 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 31214746  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31214747 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgact 31214846  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  31214847 taaacacttgatatacaatcagt 31214869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 210800 - 210576
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  210800 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 210701  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  210700 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattga 210601  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  210600 attaaacacttgatatacaatcagt 210576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 724423 - 724199
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  724423 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 724324  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  724323 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagattga 724224  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  724223 attaaacacttgatatacaatcagt 724199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29076365 - 29076588
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29076365 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 29076463  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076464 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 29076563  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29076564 attgaacacttgatatacaatcagt 29076588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29086616 - 29086839
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29086616 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 29086714  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086715 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 29086814  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29086815 attgaacacttgatatacaatcagt 29086839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36077571 - 36077794
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36077571 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 36077669  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077670 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36077769  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36077770 attgaacacttgatatacaatcagt 36077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36088157 - 36088380
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36088157 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 36088255  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088256 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 36088355  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36088356 attgaacacttgatatacaatcagt 36088380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15791945 - 15791722
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15791945 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaag 15791846  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15791845 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 15791746  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15791745 ttgaacacttgatatacaatcagt 15791722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20161876 - 20161654
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20161876 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20161777  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  20161776 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 20161677  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20161676 tgaacacttgatatacaatcagt 20161654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13689215 - 13688991
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13689215 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 13689116  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689115 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 13689016  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13689015 attgaacacttgatatacaatcagt 13688991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23470106 - 23469884
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23470106 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 23470007  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  23470006 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 23469907  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23469906 tgaacacttgatatacaatcagt 23469884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15781356 - 15781133
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15781356 tgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaag 15781257  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15781256 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 15781157  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15781156 ttgaacacttgatatacaatcagt 15781133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19224569 - 19224791
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19224569 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaaga 19224668  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19224669 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 19224768  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19224769 tgaacacttgatatacaatcagt 19224791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19417986 - 19418209
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19417986 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 19418085  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  19418086 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 19418185  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19418186 ttgaacacttgatatacaatcagt 19418209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19428561 - 19428784
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19428561 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 19428660  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  19428661 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgac 19428760  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19428761 ttgaacacttgatatacaatcagt 19428784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16746635 - 16746857
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16746635 tgcacttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16746734  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16746735 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 16746834  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16746835 tgaacacttgatatacaatcagt 16746857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30315346 - 30315119
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  30315346 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaaga 30315247  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggc-----aagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtt 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  30315246 gtcttccgatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtt 30315147  T
Q  196 tgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30315146 tgacttgaacacttgatatacaatcagt 30315119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18153372 - 18153594
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18153372 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaaga 18153470  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  || |  |||||||    
T  18153471 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaattacaggaaaatatgtttgac 18153570  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18153571 ttgaacacttgatatacaatcagt 18153594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 18157893 - 18158113
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18157893 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaagagt 18157991  T
Q  103 cttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa-tacagagaattgagtttgactt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  || |  |||||||||    
T  18157992 cttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaattacaggaaaatatgtttgactt 18158091  T
Q  202 gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18158092 gaacacttgatatacaatcagt 18158113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18769775 - 18769560
Alignment:
Q  9 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18769775 caaggagatttcaccataatcacaaagattaaaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttcca 18769676  T
Q  109 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca-aaaatacagagaattgagtttgacttgaacac 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  18769675 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacac 18769576  T
Q  208 ttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  18769575 ttgatatacaatcagt 18769560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40213814 - 40213591
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |    
T  40213814 tgcacttccaaggagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaa 40213715  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagag-aattgagtttgac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  40213714 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaatacagagaaaatatgtttgac 40213615  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  40213614 ttgaacacttgatatgcaatcagt 40213591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13697326 - 13697185
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13697326 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaa 13697227  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697226 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22167673 - 22167447
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  22167673 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 22167577  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  22167576 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 22167477  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22167476 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 22167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22136508 - 22136282
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  22136508 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 22136412  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  22136411 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 22136312  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136311 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 22136282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 20195620 - 20195739
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20195620 tgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20195719  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  20195720 gtcttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3843156 - 3843378
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  3843156 tgcacttccaaggagatttccagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 3843252  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  3843253 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 3843351  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  3843352 actttgaacacttgatatacaatcagt 3843378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20260264 - 20260042
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  20260264 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 20260168  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  20260167 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 20260069  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20260068 actttgaacacttgatatacaatcagt 20260042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21046894 - 21046672
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  21046894 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 21046798  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  21046797 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 21046699  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21046698 actttgaacacttgatatacaatcagt 21046672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20195813
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 20195796  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  20195797 cttgatatacaatcagt 20195813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018805
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcagg----caagagacttctaatcaaac 174  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgatcgagagacttctaatcaaac 7018855  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7018854 ataattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 7018805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7019066 - 7018894
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  7019066 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 7018970  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 169  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
T  7018969 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 7018894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 23363762 - 23363920
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||| | || |    
T  23363762 tgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcagg 23363859  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggc 155  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23363860 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15998861 - 15998808
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998861 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 23270584 - 23270531
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23270584 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 40002702 - 40002863
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 160  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||    
T  40002702 tatgagacttca--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 40002799  T
Q  161 acttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40002800 acttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 40002863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17519801 - 17519574
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  17519801 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 17519704  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    |    
T  17519703 gcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattg 17519605  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17519604 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 17519574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 26735623 - 26735573
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735623 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45568658 - 45568432
Alignment:
Q  3 cacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacg 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| |    
T  45568658 cacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacagg 45568562  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    ||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||    
T  45568561 caaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaaaattgt 45568462  T
Q  195 ttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45568461 ttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 45568432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19460627 - 19460767
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  19460627 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 19460723  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19460724 gcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19558305 - 19558445
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  19558305 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 19558401  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19558402 gcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23271829 - 23271689
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  23271829 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 23271733  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23271732 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298649
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 21298603  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21298604 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 21298649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22211982 - 22211869
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  22211982 ataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 22211886  T
Q  123 agcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||    
T  22211885 agcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 28902958 - 28903103
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  28902958 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 28903057  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28903058 ttacaaagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 28903103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 23290535 - 23290593
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23290535 tgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaa 23290593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 21287894 - 21288039
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21287894 tgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 21287993  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21287994 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 21288039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22211911 - 22211814
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22211911 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 22211814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 29379015 - 29379157
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  29379015 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 29379112  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29379113 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934150
Alignment:
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    ||    
T  15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaaattacaaagaaaattgt 15934178  T
Q  195 ttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15934177 ttgaggttgaacacttgatatacaatca 15934150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19956949 - 19956854
Alignment:
Q  129 agacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg-acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19956949 agacttcctatgctcaagcacgcaagcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatttgtttgaagttgaacacttgatatacaatcagt 19956854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210259
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt-cta-atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||| |||||||    
T  1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaa 1210306  T
Q  177 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || |||| ||||    |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1210305 aattacacagaaagatgtttggtttggacacttgatatacaatcagt 1210259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 19942770 - 19942868
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19942770 caagagacttctaatggtcaagcacaactgcaagagacttataatcaaacagaattacaaagaaaaatgtttgaggtgaacacttgatatacaatcagt 19942868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 21540474 - 21540532
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21540474 tgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttcta 21540532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678970
Alignment:
Q  85 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttctaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaa 24678970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 18557517 - 18557630
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  18557517 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaac 18557616  T
Q  175 aaaaatacagagaa 188  Q
    | || |||| ||||    
T  18557617 agaattacaaagaa 18557630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 21540444 - 21540589
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| ||    
T  21540444 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaacagaa 21540543  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21540544 ttacacagaaaattgtttgagtttgaatacttgatatacaatcagt 21540589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 219
Target Start/End: Original strand, 26832560 - 26832705
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||     |||||||||||||| ||||||    
T  26832560 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaagtcaagagacttcctatgctcaagcaaaactgcaagagacttctattcaaac 26832659  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaat 219  Q
    | || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26832660 agaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaat 26832705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 12541134 - 12541277
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||| | || |||| |||| ||| ||||||||| | || |||| | |||  ||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||     
T  12541134 tgctcaagcacaaaagctagagacttcaaatactcaagcacaatagaaagatatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttcaaaacaaacaaat 12541233  T
Q  179 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| | || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12541234 -tacacaaaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 12541277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879205
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 19460707 - 19460824
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  19460707 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 19460806  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  19460807 acttgatatactatcagt 19460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 19558385 - 19558502
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  19558385 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 19558484  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  19558485 acttgatatactatcagt 19558502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22462275 - 22462154
Alignment:
Q  104 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-tt 201  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||| |   ||||||||||||| | ||||| || |||| |||| |  ||||||  ||    
T  22462275 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacacctacaagagacttctatttaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 22462176  T
Q  202 gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22462175 gaacacttgatatacaatcagt 22462154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 223
Target Start/End: Original strand, 33052374 - 33052510
Alignment:
Q  87 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaga 185  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||||   | ||||||||||||||| ||||| ||| || | |    
T  33052374 gcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcaaaaatgcaagagacttctaaacaaac-aaattataca 33052472  T
Q  186 gaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| | ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33052473 gaaatcagtttggattgaacatttgatgtacaatcagt 33052510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 12541090 - 12541118
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541090 tgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 27739408 - 27739464
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 138  Q
    |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27739408 ctcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagcagaaagcaagagacttctaa 27739464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9763398 - 9763176
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9763398 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9763299  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9763298 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 9763199  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9763198 tgaacacttgatatacaatcagt 9763176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16768541 - 16768763
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16768541 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 16768640  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768641 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 16768740  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16768741 tgaacacttgatatacaatcagt 16768763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30489454 - 30489232
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30489454 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaaga 30489355  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30489354 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatactgagaattgagtttgaat 30489255  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30489254 tgaacacttgatatacaatcagt 30489232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43082252 - 43082474
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43082252 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 43082351  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082352 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 43082451  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43082452 tgaacacttgatatacaatcagt 43082474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1099825 - 1099603
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1099825 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1099726  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1099725 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 1099626  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1099625 tgaacacttgatatacaatcagt 1099603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7006437 - 7006215
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7006437 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 7006338  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7006337 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 7006238  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7006237 tgaacacttgatatacaatcagt 7006215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9773934 - 9773712
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9773934 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9773835  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9773834 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 9773735  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9773734 tgaacacttgatatacaatcagt 9773712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11389439 - 11389217
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11389439 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 11389340  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11389339 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 11389240  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11389239 tgaacacttgatatacaatcagt 11389217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22915494 - 22915272
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22915494 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22915395  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22915394 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22915295  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22915294 tgaacacttgatatacaatcagt 22915272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22960962 - 22960740
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22960962 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 22960863  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22960862 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22960763  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22960762 tgaacacttgatatacaatcagt 22960740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24328364 - 24328142
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24328364 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 24328265  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24328264 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 24328165  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24328164 tgaacacttgatatacaatcagt 24328142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24339034 - 24338812
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24339034 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaaga 24338935  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24338934 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 24338835  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24338834 tgaacacttgatatacaatcagt 24338812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43092861 - 43093083
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43092861 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 43092960  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092961 gtcttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 43093060  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43093061 tgaacacttgatatacaatcagt 43093083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4099412 - 4099634
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4099412 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4099511  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4099512 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 4099611  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  4099612 tgaacacttgatattcaatcagt 4099634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4209487 - 4209709
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4209487 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4209586  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4209587 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 4209686  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  4209687 tgaacacttgatatataatcagt 4209709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4220079 - 4220301
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4220079 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 4220178  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4220179 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 4220278  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4220279 tgaacacttgatatacaatcagt 4220301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17858067 - 17857845
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17858067 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 17857968  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17857967 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 17857868  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17857867 tgaacacttgatatacaatcagt 17857845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11395804 - 11395580
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11395804 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 11395705  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395704 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 11395605  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11395604 attgaacacttgatatacaatcagt 11395580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11406120 - 11405896
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11406120 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 11406021  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406020 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 11405921  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11405920 attgaacacttgatatacaatcagt 11405896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18393269 - 18393045
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18393269 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 18393170  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393169 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 18393070  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18393069 attgaacacttgatatacaatcagt 18393045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29243820 - 29244042
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29243820 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 29243919  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29243920 gtcttccaatgctcaagcactaagaaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 29244019  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29244020 tgaacacttgatatacaatcagt 29244042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29254399 - 29254621
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29254399 tgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 29254498  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29254499 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 29254598  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29254599 tgaacacttgatatacaatcagt 29254621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34790847 - 34790625
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34790847 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaaga 34790748  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34790747 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 34790648  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34790647 tgaacacttgatatacaatcagt 34790625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34804990 - 34804768
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34804990 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaaga 34804891  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34804890 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 34804791  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34804790 tgaacacttgatatacaatcagt 34804768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36252474 - 36252252
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36252474 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaaga 36252375  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36252374 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 36252275  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36252274 tgaacacttgatatacaatcagt 36252252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10266591 - 10266814
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10266591 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10266689  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266690 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 10266789  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10266790 attgaacacttgatatacaatcagt 10266814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10277168 - 10277391
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10277168 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 10277266  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277267 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 10277366  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  10277367 attgaacacttgatatacaatcagt 10277391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32217470 - 32217694
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32217470 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 32217569  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217570 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 32217669  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  32217670 attgaacacttgatatacaatcagt 32217694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 34477526 - 34477749
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34477526 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 34477625  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  34477626 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaatacagagaattgagtttgaa 34477725  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34477726 ttgaacacttgatatacaatcagt 34477749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40221930 - 40222153
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40221930 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 40222029  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40222030 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 40222129  T
Q  201 tgaacacttga-tatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  40222130 tgaacacttgattatacaatcagt 40222153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40250791 - 40251014
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40250791 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 40250890  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40250891 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 40250990  T
Q  201 tgaacacttga-tatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  40250991 tgaacacttgattatacaatcagt 40251014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35263188 - 35263411
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35263188 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 35263286  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263287 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35263386  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35263387 attgaacacttgatatacaatcagt 35263411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35273813 - 35274036
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35273813 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 35273911  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273912 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 35274011  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35274012 attgaacacttgatatacaatcagt 35274036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39170726 - 39170503
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39170726 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 39170628  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39170627 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaatacagagaattgagtttga 39170528  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39170527 attgaacacttgatatacaatcagt 39170503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27220978 - 27221201
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27220978 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 27221076  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27221077 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatatagagaattgagtttga 27221176  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  27221177 attgaacacttgatatacaatcagt 27221201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9898207 - 9897982
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  9898207 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgca 9898108  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9898107 agagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttta 9898008  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  9898007 agttgaacacttcatatacaatcagt 9897982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9908793 - 9908570
Alignment:
Q  3 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  9908793 cacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 9908694  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9908693 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgag 9908594  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9908593 ttgaacacttcatatacaatcagt 9908570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35252579 - 35252802
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35252579 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 35252677  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35252678 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagttgaa 35252777  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  35252778 tttgaacacttgatatacaatcagt 35252802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43345005 - 43345228
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43345005 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 43345103  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345104 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 43345203  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  43345204 attgaacacttgatatacaatcagt 43345228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43354620 - 43354843
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43354620 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 43354718  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354719 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 43354818  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  43354819 attgaacacttgatatacaatcagt 43354843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28732532 - 28732310
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28732532 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 28732433  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  28732432 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 28732333  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28732332 tgaacacttgatatacaatcagt 28732310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2561086 - 2561308
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2561086 tgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 2561185  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  2561186 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaaatttgact 2561285  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2561286 tgaacacttgatatacaatcagt 2561308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24415651 - 24415429
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24415651 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 24415552  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24415551 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgact 24415452  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24415451 tgaacacttgatatacaatcagt 24415429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24428216 - 24427994
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24428216 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 24428117  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24428116 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgact 24428017  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24428016 tgaacacttgatatacaatcagt 24427994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18769534 - 18769313
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18769534 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 18769436  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  18769435 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 18769336  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18769335 tgaacacttgatatacaatcagt 18769313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28721946 - 28721728
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28721946 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 28721847  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||  | |||||||||    
T  28721846 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgatataagtttgact 28721747  T
Q  201 tgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28721746 tgaacacttgatatacaat 28721728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21173098 - 21172874
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  21173098 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 21172999  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  21172998 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttga 21172899  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21172898 cttgaacacttgatatacaatcagt 21172874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26866670 - 26866892
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26866670 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaaga 26866768  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |  |||||||    
T  26866769 gtcttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgac 26866868  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26866869 ttgaacacttgatatacaatcagt 26866892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 26879259 - 26879481
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  26879259 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaaga 26879357  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||| |  |||||||    
T  26879358 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatatagggaaatatgtttgac 26879457  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26879458 ttgaacacttgatatacaatcagt 26879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38586719 - 38586495
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||||    
T  38586719 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaa 38586620  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    ||||||    
T  38586619 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttga 38586521  T
Q  199 -cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  38586520 ccttgaacacttgatatacaatcagt 38586495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27979012 - 27978790
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  27979012 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaag 27978914  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  27978913 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgac 27978815  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27978814 cttgaacacttgatatacaatcagt 27978790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28065541 - 28065319
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  28065541 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaag 28065443  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||||||     
T  28065442 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttgac 28065344  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28065343 cttgaacacttgatatacaatcagt 28065319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21651136 - 21650975
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21651136 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 21651038  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21651037 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagaga 21650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36785431 - 36785214
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  36785431 tgcacttccaaggagattttcactaagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaa 36785333  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  36785332 gagtcttccaatggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttg 36785234  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatac 216  Q
    || |||||||||||||||||    
T  36785233 actttgaacacttgatatac 36785214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 968135 - 967912
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  968135 tgcacttccaaggagatttgctctaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 968038  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  968037 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 967939  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  967938 actttgaacacttgatatacaatcagt 967912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 223
Target Start/End: Original strand, 22763288 - 22763474
Alignment:
Q  36 attacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagactt 134  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22763288 attacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctt 22763385  T
Q  135 ctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22763386 ctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 22763474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 24274624 - 24274845
Alignment:
Q  2 gcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||    
T  24274624 gcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgag 24274720  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  24274721 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-tatgtttga 24274819  T
Q  199 c-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  24274820 ctttgaacacttgatatacaatcagt 24274845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 22773990 - 22774178
Alignment:
Q  34 agattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagac 132  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22773990 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtc 22774087  T
Q  133 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22774088 ttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaacaaaattacacagaa-aatgtttgagattgaacacttgatatacaatcagt 22774178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17970900 - 17970678
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  17970900 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactaactag-tatgaaacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 17970804  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  17970803 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 17970705  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  17970704 actttgaacacttgatatacaatcagt 17970678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1041746 - 1041969
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  1041746 tgcacttccaaggagattttcactaataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 1041843  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||    
T  1041844 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaacaacaatacacagaa-aaagtttg 1041942  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  1041943 actttgaacacttgatatacaatcagt 1041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19355913 - 19356139
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  |||  ||||||||||| ||     
T  19355913 tgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcctaaa--tgctcaagcacgcag 19356009  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  19356010 gcaagagacttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 19356109  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19356110 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 19356139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 30794407 - 30794497
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcac 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30794407 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19303058 - 19302918
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  19303058 tgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 19302962  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19302961 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19498597 - 19498457
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  19498597 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 19498501  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498500 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23393357 - 23393130
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||     
T  23393357 tgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcag 23393261  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  23393260 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 23393161  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23393160 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 23393130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20647246 - 20647019
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||   ||| ||||||||||| ||     
T  20647246 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc--aaattgctcaagcacgcag 20647150  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  20647149 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 20647050  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20647049 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 20647019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24802155 - 24802010
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  24802155 tgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 24802056  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24802055 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 24802010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24815122 - 24814977
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  24815122 tgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 24815023  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24815022 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 24814977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38033439 - 38033296
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  38033439 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca-aaaaatgctcaagcacgcag 38033342  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38033341 gcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 38033296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19313624 - 19313482
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  19313624 tgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccgag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 19313528  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19313527 gcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19313544 - 19313427
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||    
T  19313544 aatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19313445  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19313444 acttgatatacaatcagt 19313427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 1083507 - 1083650
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  1083507 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 1083606  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1083607 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacatttgatatacaatca 1083650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587510
Alignment:
Q  83 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 168  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaa 16587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911363
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaa 21911374  T
Q  178 aatacagagaa 188  Q
    | |||| ||||    
T  21911373 attacacagaa 21911363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19300537 - 19300420
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||    
T  19300537 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaac 19300438  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19300437 acttgatatacaatcagt 19300420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19300551 - 19300477
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19300551 tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21650979 - 21650939
Alignment:
Q  183 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21650979 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 21650939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845738
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaa 21845738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 22382968 - 22383118
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  22382968 aaactactcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaac 22383067  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttga--cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || |||| | || |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  22383068 agaattacacaaaaatttgtttgagggttgaacacttgatatactatcagt 22383118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 24843741 - 24843840
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24843741 caagagacttcctatgctcaagcacaacggcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 24843840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19498517 - 19498400
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  19498517 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaagttgtttgagtttgaac 19498418  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19498417 acttgatatacaatcagt 19498400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26619685 - 26619564
Alignment:
Q  104 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-tt 201  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||    
T  26619685 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 26619586  T
Q  202 gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26619585 gaacacttgatatacaatcagt 26619564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21548860 - 21548821
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21548860 caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagactt 21548821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 22754978 - 22755054
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22754978 tatgagacttcacaga--tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 18702307 - 18702377
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18702307 gcaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 18702377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 25918281 - 25918350
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25918281 gcaagagacttctaaataaacaaaattacatagaaggatgtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 25918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 14794480 - 14794452
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14794480 tgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15671140 - 15671074
Alignment:
Q  155 caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15671140 caagagacttctaaacaaacaaat-taca-agaaataagtttggattgaacacttgatatacaatcagt 15671074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2295 - 2517
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2295 tgcacttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 2394  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2395 gtcttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 2494  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2495 tgaacacttgatatacaatcagt 2517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11962 - 12184
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11962 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 12061  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12062 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 12161  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12162 tgaacacttgatatacaatcagt 12184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 166503 - 166725
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  166503 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 166602  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  166603 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 166702  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  166703 tgaacacttgatatacaatcagt 166725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 177095 - 177317
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  177095 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 177194  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  177195 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 177294  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  177295 tgaacacttgatatacaatcagt 177317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9084892 - 9085114
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9084892 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9084991  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9084992 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 9085091  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9085092 tgaacacttgatatacaatcagt 9085114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9094606 - 9094828
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9094606 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9094705  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9094706 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 9094805  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9094806 tgaacacttgatatacaatcagt 9094828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21003700 - 21003478
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21003700 tgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 21003601  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003600 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 21003501  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21003500 tgaacacttgatatacaatcagt 21003478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48711183 - 48710961
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48711183 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 48711084  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48711083 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 48710984  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48710983 tgaacacttgatatacaatcagt 48710961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 468273 - 468051
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  468273 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 468174  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  468173 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 468074  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  468073 tgaacacttgatatacaatcagt 468051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6867917 - 6867695
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6867917 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6867818  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6867817 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 6867718  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6867717 tgaacacttgatatacaatcagt 6867695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6878549 - 6878327
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6878549 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 6878450  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6878449 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 6878350  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6878349 tgaacacttgatatacaatcagt 6878327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20989261 - 20989483
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20989261 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20989360  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989361 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 20989460  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20989461 tgaacacttgatatacaatcagt 20989483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26654017 - 26653795
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26654017 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 26653918  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26653917 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 26653818  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26653817 tgaacacttgatatacaatcagt 26653795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26700346 - 26700124
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26700346 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 26700247  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26700246 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 26700147  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26700146 tgaacacttgatatacaatcagt 26700124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37343808 - 37344030
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37343808 tgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 37343907  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37343908 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 37344007  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37344008 tgaacacttgatatacaatcagt 37344030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2706306 - 2706082
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2706306 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 2706207  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706206 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 2706107  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2706106 attgaacacttgatatacaatcagt 2706082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26390790 - 26390566
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26390790 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 26390691  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390690 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26390591  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26390590 attgaacacttgatatacaatcagt 26390566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26401432 - 26401208
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26401432 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 26401333  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401332 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 26401233  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  26401232 attgaacacttgatatacaatcagt 26401208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26294722 - 26294499
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26294722 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaag 26294623  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26294622 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 26294523  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26294522 ttgaacacttgatatacaatcagt 26294499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 5685127 - 5685349
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5685127 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 5685226  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685227 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 5685326  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5685327 tgaacacttgatatacaatcagt 5685349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9432872 - 9433094
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9432872 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaaga 9432971  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432972 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9433071  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  9433072 tgaacacttgatattcaatcagt 9433094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22099346 - 22099568
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22099346 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaaga 22099445  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22099446 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22099545  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22099546 tgaacacttgatatacaatcagt 22099568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17961418 - 17961194
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17961418 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 17961319  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961318 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17961219  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17961218 attgaacacttgatatacaatcagt 17961194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24734359 - 24734583
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  24734359 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 24734458  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734459 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24734558  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24734559 attgaacacttgatatacaatcagt 24734583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24744306 - 24744530
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  24744306 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaa 24744405  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744406 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 24744505  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24744506 attgaacacttgatatacaatcagt 24744530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40042802 - 40042578
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40042802 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 40042703  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042702 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 40042603  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  40042602 attgaacacttgatatacaatcagt 40042578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40053351 - 40053127
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40053351 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 40053252  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053251 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 40053152  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  40053151 attgaacacttgatatacaatcagt 40053127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8627555 - 8627779
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8627555 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 8627654  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627655 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 8627754  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8627755 attgaacacttgatatacaatcagt 8627779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14746362 - 14746139
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa-gcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14746362 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaag 14746263  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14746262 agtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagttttac 14746163  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14746162 ttgaacacttgatatacaatcagt 14746139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24931296 - 24931073
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact-gctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  24931296 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaag 24931197  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24931196 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgag 24931097  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24931096 ttgaacacttgatatacaatcagt 24931073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9443468 - 9443690
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9443468 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaaga 9443567  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443568 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 9443667  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  9443668 tgaacacttgatattcaatcagt 9443690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22088731 - 22088953
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  22088731 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaaga 22088830  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22088831 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 22088930  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22088931 tgaacacttgatatacaatcagt 22088953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1987147 - 1987370
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1987147 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 1987245  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987246 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 1987345  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  1987346 attgaacacttgatatacaatcagt 1987370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1997768 - 1997991
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1997768 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 1997866  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997867 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 1997966  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  1997967 attgaacacttgatatacaatcagt 1997991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2716910 - 2716686
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2716910 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 2716811  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716810 gagtcttccaatggtcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 2716711  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2716710 attgaacacttgatatacaatcagt 2716686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11004792 - 11005015
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11004792 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 11004890  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004891 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 11004990  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11004991 attgaacacttgatatacaatcagt 11005015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17950812 - 17950588
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17950812 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 17950713  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950712 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 17950613  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17950612 attgaacacttgatatacaatcagt 17950588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 42865434 - 42865657
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42865434 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 42865532  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865533 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42865632  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  42865633 attgaacacttgatatacaatcagt 42865657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 42876060 - 42876283
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42876060 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 42876158  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876159 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 42876258  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  42876259 attgaacacttgatatacaatcagt 42876283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8616993 - 8617216
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8616993 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaag 8617092  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8617093 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaa 8617192  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8617193 ttgaacacttgatatacaatcagt 8617216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 588821 - 589043
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  588821 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 588920  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  588921 gtcttccaatgttcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgact 589020  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  589021 tgaacacttgatatacaatcagt 589043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4222215 - 4222438
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  4222215 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 4222313  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222314 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 4222413  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4222414 attgaacacttgatatacaatcagt 4222438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1367238 - 1367460
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1367238 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 1367337  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  1367338 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 1367437  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1367438 tgaacacttgatatacaatcagt 1367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3165343 - 3165565
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3165343 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 3165442  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3165443 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 3165542  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3165543 tgaacacttgatatacaatcagt 3165565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8002758 - 8002535
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8002758 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaa 8002660  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002659 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 8002560  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8002559 attgaacacttgatatacaatcagt 8002535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8013403 - 8013180
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8013403 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaa 8013305  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013304 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 8013205  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8013204 attgaacacttgatatacaatcagt 8013180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15889020 - 15888798
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15889020 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 15888921  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  15888920 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgact 15888821  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15888820 tgaacacttgatatacaatcagt 15888798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20490615 - 20490837
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20490615 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 20490714  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  20490715 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 20490814  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  20490815 cgaacacttgatatacaatcagt 20490837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21770634 - 21770412
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21770634 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 21770535  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  21770534 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 21770435  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21770434 tgaacacttgatatacaatcagt 21770412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30049128 - 30049350
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30049128 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 30049227  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  30049228 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 30049327  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30049328 tgaacacttgatatacaatcagt 30049350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31117202 - 31116980
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31117202 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 31117103  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  31117102 gtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 31117003  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31117002 tgaacacttgatatacaatcagt 31116980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9159339 - 9159561
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9159339 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9159438  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  9159439 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 9159538  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  9159539 tgaacacttgataaacaatcagt 9159561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9169794 - 9170016
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9169794 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 9169893  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  9169894 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgact 9169993  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  9169994 tgaacacttgataaacaatcagt 9170016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40055445 - 40055223
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  40055445 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaga 40055346  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-c 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||| |    
T  40055345 gtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacacagaa-aaagtttgacc 40055247  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40055246 ttgaacacttgatatacaatcagt 40055223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455269
Alignment:
Q  63 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagac 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagac 455330  T
Q  163 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  455329 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 455269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17064222 - 17064034
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  17064222 tgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaagcaag 17064124  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17064123 agtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 17064034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095884
Alignment:
Q  83 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatac 11095843  T
Q  183 agagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11095844 agagaattgagtttgaattgaacacttgatatacaatcagt 11095884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18418721 - 18418944
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  18418721 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 18418818  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||    
T  18418819 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-agtgtttg 18418917  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  18418918 actttgaacacttgatatacaatcagt 18418944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18440802 - 18441025
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  18440802 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 18440899  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||    
T  18440900 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaa-agtgtttg 18440998  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  18440999 actttgaacacttgatatacaatcagt 18441025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38403905 - 38403681
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||    
T  38403905 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaa 38403807  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    |||||    
T  38403806 gagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacaga-aaaaatgtttg 38403708  T
Q  198 a-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38403707 attttgaacacttgatatacaatcagt 38403681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3477033 - 3476812
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  3477033 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 3476937  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||    
T  3476936 gagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttg 3476837  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3476836 acttgaacacttgatatacaatcag 3476812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 4211646 - 4211785
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  4211646 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaa 4211744  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211745 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 48381793 - 48382015
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  48381793 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 48381891  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    |||||    
T  48381892 gggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacagaattacacagaa-aatgtttg 48381990  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  48381991 actttgaacacttgatatacaatca 48382015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 540721 - 540857
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  540721 tgcacttccaaggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 540820  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 136  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  540821 gtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8933171 - 8933393
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  8933171 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 8933267  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  8933268 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 8933366  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8933367 actttgaacacttgatatacaatcagt 8933393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 44280132 - 44280251
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44280132 tgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 44280231  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  44280232 gtcttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 29589595 - 29589818
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  29589595 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcag 29589691  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  29589692 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 29589791  T
Q  194 tttgac-ttgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29589792 tttgactttgaacacttgatatacaat 29589818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15215923 - 15216146
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttca-cta--taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgca 97  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||     
T  15215923 tgcacttccaaggagattttaactaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcg 15216019  T
Q  98 agagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa--atacagagaattgagt 194  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||   ||    
T  15216020 agagacttccaatgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaaattatacagaaaat---gt 15216116  T
Q  195 ttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15216117 ttgactttgaacacttgatatacaatcagt 15216146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12734857 - 12734635
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  12734857 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 12734761  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||| ||||    |||||    
T  12734760 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagttacacagaa-aatgtttg 12734662  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  12734661 actttgaacacttgatatacaatcagt 12734635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38594374 - 38594256
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38594374 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaaga 38594276  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  38594275 gtcttctaatgctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 13681927 - 13682109
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  13681927 tgcacttcgaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 13682023  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 183  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13682024 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattaca 13682109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26210241 - 26210019
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  26210241 tgcacttccaaggagattcccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 26210145  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    |||||    
T  26210144 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 26210046  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  26210045 actttgaacacttgatatacaatcagt 26210019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 540798 - 540915
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa-atacagagaattgagtttgacttgaac 205  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  540798 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 540897  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  540898 acttgatatacaatcagt 540915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280325
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 44280308  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  44280309 cttgatatacaatcagt 44280325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 4211724 - 4211839
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4211724 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4211822  T
Q  207 cttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  4211823 cttgatatacaatcagt 4211839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8999638 - 8999409
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  8999638 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 8999541  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||        
T  8999540 ggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatt 8999441  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8999440 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 8999409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24883087 - 24882945
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  24883087 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 24882991  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24882990 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25212542 - 25212471
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  25212542 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11087718 - 11087519
Alignment:
Q  25 taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |    
T  11087718 taatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 11087621  T
Q  123 agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||  ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11087620 agcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacccagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatca 11087521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19986212 - 19986159
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986212 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38594298 - 38594181
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||   |||||    
T  38594298 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaaaaagtttgataatgaac 38594199  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38594198 acttgatatacaatcagt 38594181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 20967277 - 20967328
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967277 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24883007 - 24882892
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaaca 206  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||||||||||    
T  24883007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 24882908  T
Q  207 cttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  24882907 cttgatatacaatcag 24882892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 457684 - 457618
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  457684 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4433244 - 4433056
Alignment:
Q  35 gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagac 132  Q
    |||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  4433244 gattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaa 4433148  T
Q  133 ttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4433147 tttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 4433056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4412711 - 4412485
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  4412711 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacaca 4412615  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || || | ||||        
T  4412614 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattaaacagaaaatt 4412515  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4412514 gtttgagtttgaacacttgatatacaatca 4412485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13175308 - 13175080
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |  | | ||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  13175308 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 13175211  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    || | || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |    
T  13175210 gctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattg 13175111  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13175110 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 13175080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125537
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaacaaa 23125537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2501600 - 2501533
Alignment:
Q  155 caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2501600 caagagacttctaaacaaacgaaattacaaagaata-agtttgagttgaacacttgatatacaatcagt 2501533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308289
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaat 16308289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 11015412 - 11015463
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcactataatcacaaa-gattacaaatgctcaa 50  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11015412 tgcacttccaaggagattttcactataatcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 25806885 - 25807030
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc--aagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||  ||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  25806885 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaa 25806984  T
Q  177 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |  || | |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25806985 at-tataaagaaataagtttggtttgaacacttgatatacaatcagt 25807030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 602177 - 602404
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcaca-aagattacaaatgctcaatactatcaaaa-tatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||   | || |||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  602177 tgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatacttaaacaagtatgagacttcagat---tgctcaagcacaca 602273  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa-tcaaacaaaaatacagagaattg 191  Q
     ||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||       
T  602274 -gcaagagacttcta-tgctcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaagcaagagacttctaattcaaacagaattacatagaaaat 602371  T
Q  192 agtttg-acttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  602372 tgtttgaatttgaacacttgatatacaatcagt 602404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802756
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 164  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Original strand, 13263274 - 13263414
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag--cactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| |    
T  13263274 tgctcaagcacacaagcaaaagacttcaaattctcaagtacacta-gcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta-tcaaacaga 13263371  T
Q  178 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
      |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13263372 t-tacaaagaata-agtttgagatgaacacttgatatacaatcag 13263414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572762
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| || |||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttctaaacaaacaaa 11572762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13173023 - 13172909
Alignment:
Q  75 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 173  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||  || || ||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  13173023 aaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttccgatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 13172924  T
Q  174 caaaaatacagagaa 188  Q
    || || |||| ||||    
T  13172923 cagaattacaaagaa 13172909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18362153 - 18362087
Alignment:
Q  157 agagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18362153 agaggcttctaaacaaacaaaattacacagaaagatgtttgatttgaacacttgatatacaatcagt 18362087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 165
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
Q  110 tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19237648 - 19237556
Alignment:
Q  132 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||| ||| || | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19237648 cttcttatgctcaagcacataagcaagagacttctattcaaactaaattataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 19237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 20094640 - 20094700
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  20094640 tgctcaagcacacaaacaagagtctttcaatgctcgagcacacaagcaatagacttctaat 20094700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30735 - 30959
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30735 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaa 30834  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30835 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 30934  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  30935 attgaacacttgatatacaatcagt 30959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43176 - 42949
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat-gctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacg 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || |||||||||||| ||||     ||||||||||||||||    
T  43176 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaaaaaaaatgctcaagcacacacg 43077  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| | ||||    
T  43076 caagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaacaaaaataccaagaaataagtt 42977  T
Q  196 tgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42976 tgacttgaacacttgatatacaatcagt 42949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41104 - 40882
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41104 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 41005  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41004 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaat 40905  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40904 tgaacacttgatatacaatcagt 40882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33553 - 33331
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  33553 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaaga 33454  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  33453 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 33354  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33353 tgaacacttgatatacaatcagt 33331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7493 - 7271
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7493 tgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 7394  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7393 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagt 7294  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7293 tgaacacttgatatacaatcagt 7271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7535 - 7317
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7535 tgcacttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 7436  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7435 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgact 7336  T
Q  201 tgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7335 tgaacacttgatatacaat 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7564 - 7788
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7564 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 7663  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7664 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 7763  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  7764 attgaacacttgatatacaatcagt 7788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37611 - 37387
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact--gctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37611 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaa 37512  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37511 gagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga 37412  T
Q  199 cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  37411 attgaacacttgatatacaatcagt 37387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37385 - 37163
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37385 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 37286  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  37285 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgact 37186  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37185 tgaacacttgatatacaatcagt 37163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14188 - 14410
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14188 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 14287  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  14288 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgact 14387  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14388 tgaacacttgatatacaatcagt 14410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54774 - 54552
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54774 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaga 54675  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  54674 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaactttgact 54575  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54574 tgaacacttgatatacaatcagt 54552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11035
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11257 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaaga 11158  T
Q  101 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  ||||||||    
T  11157 gtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgact 11058  T
Q  201 tgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11057 tgaacacttgatatacaatcagt 11035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8188
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat-------actatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |  || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8417 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacaca 8318  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |    
T  8317 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatg 8218  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217 tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 8188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2870 - 2647
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2870 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaag 2771  T
Q  100 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||||    
T  2770 agtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgac 2671  T
Q  200 ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2670 ttgaacacttgatatacaatcagt 2647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12770 - 12581
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  12770 tgcacttccaaggagattttcactaagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaa 12672  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12671 gagtcttccaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa 12581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1598 - 1818
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  1598 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcactag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 1694  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||    
T  1695 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttg 1794  T
Q  198 acttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1795 acttgaacacttgatatacaatca 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 40105 - 40328
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  40105 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 40202  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  40203 gagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaa-aatgtttg 40301  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  40302 actttgaacacttgatatacaatcagt 40328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 35139 - 35364
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |    
T  35139 tgcacttccaaggagatttctactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcagg 35235  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagt 194  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||    
T  35236 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatagt 35335  T
Q  195 ttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35336 tagacttgaacacttgatatacaatcagt 35364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 57436 - 57212
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  57436 tgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcga 57338  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||    |||||    
T  57337 gagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaacaaaaatacacagaaaat-gtttg 57239  T
Q  198 actt-gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  57238 actttgaacacttgatatacaatcagt 57212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1083 - 855
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || | ||||||||||||    
T  1083 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattactcaagcacaca 987  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
      |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||| || |||| ||||        
T  986 gacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaatt 887  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  886 gtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4900 - 5122
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |    
T  4900 tgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcga 4996  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    |||||    
T  4997 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaaat-gtttg 5095  T
Q  198 actt-gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5096 actttgaacacttgatatacaatcagt 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10940 - 10717
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |  ||||||||||| || |  |    
T  10940 tgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaga--tgctcaagcacgcaggtga 10843  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    |||||    
T  10842 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaataaaaatacacagaaaat-gtttg 10744  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  10743 acattgaacacttgatatacaatcagt 10717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 29074 - 29297
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  29074 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 29169  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    |    
T  29170 gagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattg 29269  T
Q  194 tttgacttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29270 tttgacttgaacacttgatatacaatca 29297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15331 - 15554
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |    
T  15331 tgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctgaagcacgcaggcga 15428  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttg 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    |||||    
T  15429 gagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaacaaaattacacagaa-aatgtttg 15527  T
Q  198 ac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  15528 actttgaacacttgatatacaatcagt 15554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16205 - 16432
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||||||||| | || |    
T  16205 tgcacttccaaggagatttccactaaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcagg 16302  T
Q  96 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||||    |    
T  16303 cgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaacagaattacacagaa-aatg 16401  T
Q  194 tttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16402 tttgactttgaacacttgatatacaatcagt 16432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 127284 - 127473
Alignment:
Q  34 agattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagaga 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  127284 agattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagt 127381  T
Q  132 cttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  127382 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaattacacataa-aatgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 127473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8154 - 8084
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8154 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 8084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18814 - 19051
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatc-acaaagatta--caaatgctc-aatactatcaaaatatgagacttcacaaaa---ctgctcaagcacaca 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| || || ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||    
T  18814 tgcacttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaagtatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacaca 18913  T
Q  94 cgcaagagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagacttctaat-gcttaagcacgcaggc-aagagacttctaatcaaac-aaaaatacagag 186  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  |    
T  18914 cgcaagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagctcaagcacacaggcaaagaggcttctgatcaaacaaaaaatacaatg 19013  T
Q  187 aattgagtttgacttgaacacttgat-atacaatcagt 223  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19014 aaataagtttgacttgaacacttgataatacaatcagt 19051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17525 - 17385
Alignment:
Q  88 cacacacgcaa-gagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat--caaacaaaaataca 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  17525 cacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatacaaaacaaaaataca 17426  T
Q  184 gagaattgag-tttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
      ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17425 atgaaataagttttgacttgaacacttgatatacaatcagt 17385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 59552 - 59325
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  59552 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 59456  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||    |    
T  59455 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacataaaattg 59356  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  59355 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 59325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41008 - 40779
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  41008 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgta 40911  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattga 192  Q
     ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||        
T  40910 ggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaatt 40811  T
Q  193 gtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  40810 gtttgagtttgaacacttgatatactatcagt 40779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175144
Alignment:
Q  137 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaat 219  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgatatacaat 175144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 174984 - 175074
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagattt-cactataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcac 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  174984 tgcacttccaaggagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 1
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  143 tgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaa 46  T
Q  99 gagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgct 142  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  45 gagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2368 - 2141
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||     
T  2368 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcatgcat 2271  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | || |||| | ||    |    
T  2270 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaatagaattacacataaaattg 2172  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2171 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 2141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 32474 - 32635
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||    
T  32474 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 32571  T
Q  161 acttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32572 acttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 32635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 23376 - 23455
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23376 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 99 - 1
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  99 tgcaattccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8720 - 8650
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8720 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  68 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1097 - 955
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  1097 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 1001  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1000 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 901
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  997 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10417 - 10275
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  10417 tgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 10321  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10320 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10317 - 10221
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 10221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1525
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  1667 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 1571  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1570 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 1525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1470
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  1587 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 1488  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1487 acttgatatacaatcagt 1470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 475947 - 475719
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  475947 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 475850  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
     |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | || |||| ||||    |    
T  475849 acaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacagaaaattg 475750  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  475749 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 475719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 482467 - 482239
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  482467 tgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcag 482370  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgag 193  Q
     |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| | || |||| ||||    |    
T  482369 acaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaaagaattacacagaaaattg 482270  T
Q  194 tttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  482269 tttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 482239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 100223 - 100272
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100223 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6921
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 6967  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6966 ttacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 6921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7096 - 7010
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  7096 tgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29395 - 29282
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  29395 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcactaa 29299  T
Q  123 agcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||||||||    
T  29298 agcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29324 - 29228
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29324 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 29228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 58065 - 58161
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58065 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 57965 - 58107
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||   |     
T  57965 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgtag 58061  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  58062 gcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 60669 - 60813
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  60669 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgca 60766  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  60767 ggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 60751 - 60868
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||    
T  60751 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtttgaac 60850  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  60851 acttgatatactatcagt 60868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 347 - 489
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  347 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 443  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  444 gcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 447 - 544
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  447 agagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 61146 - 61372
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||| || ||||||||||||  |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  61146 tgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaa--tgctcaagcacgca 61243  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa--gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattg 191  Q
     ||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||       
T  61244 ggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaat 61343  T
Q  192 agtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  61344 tgtttgagtttgaacacttgatatacaat 61372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 4600 - 4761
Alignment:
Q  62 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagag 160  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||    
T  4600 tatgagacttca--aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagag 4697  T
Q  161 acttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||     |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4698 acttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 4761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 165327 - 165135
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  165327 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacaca 165231  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa-gagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaa 188  Q
     ||||||| |||||  |||||||||||  || || ||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  165230 ggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaaattacacagaa 165135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59166
Alignment:
Q  83 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 181  Q
    ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||  ||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  59060 tcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaacagaatta 59159  T
Q  182 cagagaa 188  Q
    || ||||    
T  59160 caaagaa 59166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 155730 - 155682
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctca 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  155730 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 304 - 415
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  304 ataatcacacatattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaa 400  T
Q  123 agcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||||    
T  401 agcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 4684 - 4795
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 122  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  4684 ataatcacacatattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaa 4780  T
Q  123 agcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||||    
T  4781 agcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 355 - 472
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgactt-gaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||| ||||    
T  355 aatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaac 454  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  455 acttgatatacaatcagt 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 223
Target Start/End: Original strand, 4735 - 4852
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgactt-gaac 205  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||||| ||||    
T  4735 aatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaacataattacacagaaaattgtttgactttgaac 4834  T
Q  206 acttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4835 acttgatatacaatcagt 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 13542 - 13685
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13542 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaaaat 13641  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13642 ataaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 13685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1596
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  1741 tgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 1642  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  1641 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacagtcagt 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4366
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  4511 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 4412  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  4411 ttacatagaaaattgtttgagtttaaacacttgatatacaatcagt 4366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3866
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc-aatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||| ||| |||||| |    
T  4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaacaca 3912  T
Q  178 aatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    | |||| |||||   ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  3911 attacacagaataatgtttgagattgaacacttaatatacaatcag 3866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 13975 - 14068
Alignment:
Q  24 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 120  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13975 ataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttatcaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14084
Alignment:
Q  108 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14026 aatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 4478 - 4437
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 35145 - 35290
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  35145 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaa 35244  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| | ||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35245 ttacacataaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 35290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 1816 - 1856
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1816 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20986 - 20890
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 175  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20986 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 20890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 961 - 1031
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  961 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 1031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1646
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1576 gcaagagacttctaatcaaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgatatacaatcagt 1646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 1
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 167  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  89 tgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4480
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| |    
T  4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaacaca 4526  T
Q  178 aatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4525 attaca-agaaaaatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 4480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1548 - 1403
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||| ||    
T  1548 tgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaacagaa 1449  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  1448 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacagtcagt 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5456 - 5331
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||     
T  5456 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttcccaaa--ttctcaagcacgcag 5360  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 123  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||    
T  5359 gcgagagacttccaatgctcaagcactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38623 - 38487
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacac 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||     
T  38623 tgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaaa--tgctcaagcacgcag 38527  T
Q  95 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 134  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38526 gcgagagactt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38523 - 38428
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||  ||||||||| || | || ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38523 agagacttc-aatgctcaagcactaaagcaagagactttaaatcaaacagaattgcatagaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 38428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 144405 - 144546
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||| || |    
T  144405 ctcaagcacaaatgcaagagatttcctatgctgaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacagaatt 144504  T
Q  181 acagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatca 221  Q
    ||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  144505 acaaagaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatca 144546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2381 - 2281
Alignment:
Q  124 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgact-tgaacacttgatatacaatcag 222  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2381 gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattgtttgagtgtgaacacttgatatacaatcag 2282  T
Q  223 t 223  Q
    |    
T  2281 t 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2396 - 2338
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2396 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10365
Alignment:
Q  110 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacac 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||     |||||  ||||||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaattacacagaaaattatttgagtttgaacac 10349  T
Q  208 ttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  10350 ttgatatacaatcagt 10365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20262
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||  || |    
T  20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaactgaatt 20222  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
    ||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20223 acacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaat 20262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19978 - 20147
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacaca 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  19978 tgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgca 20074  T
Q  94 cgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 165  Q
     ||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||| |   | || ||||||||||||||||||||||    
T  20075 agcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagactcccttttctcaagcacgcaggcaagagacttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10308
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20209
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38695 - 38556
Alignment:
Q  82 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 180  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| || |    
T  38695 ctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacagaatt 38596  T
Q  181 acagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaat 219  Q
    ||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38595 acatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaat 38556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38667 - 38609
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38667 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4829
Alignment:
Q  115 aagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4866 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11404
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 178  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11259 tgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaacagaa 11358  T
Q  179 atacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
     |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  11359 ttacacagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatgcaatcagt 11404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32404 - 32255
Alignment:
Q  76 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 174  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| || |||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||    
T  32404 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatactcaagaactaaatcaagagacttcatatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaac 32305  T
Q  175 aaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    | || ||||  ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32304 agaattacaatgaaatttgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 32255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 4332 - 4364
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4332 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 61168 - 61136
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61168 tgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 59817 - 59721
Alignment:
Q  127 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |   |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59817 agagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaatcaaacagaatgacacaaaaaattgtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 59721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 59852 - 59775
Alignment:
Q  61 atatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 139  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  59852 atatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaat 59775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1524
Alignment:
Q  1 tgcacttccaaggagatttcactataatcaca 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1493 tgcacttccaaggagatttcactataatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2800 - 2769
Alignment:
Q  192 agtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2800 agtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 2769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 158653 - 158752
Alignment:
Q  125 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  158653 caagagacttcctatgctcaagcacacaagaaagagacttctattcaaacagaattacaaagaaatttgtttgaggttgaaaacttgatatacaatcagt 158752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9557
Alignment:
Q  80 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact---aagcaagagacttcta 137  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9497 tgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttcta 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 5202 - 5272
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgac-ttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5202 gcaagagacttctattcaaacataattacaaagaaatatgtttgaggttgaacacttgatatacaatcagt 5272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 22546 - 22598
Alignment:
Q  86 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 137  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22546 agcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 22598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 223
Target Start/End: Original strand, 5901 - 5986
Alignment:
Q  139 tgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-cttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5901 tgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaacagaattacatagaaaattgtttgagtttgaacacttgatatacaatcagt 5986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Original strand, 7666 - 7733
Alignment:
Q  154 gcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7666 gcaagagacttctaaacaaacaaatc-acacagaaataagtttga-ttgaacacttgatatacaatcagt 7733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 244870 - 244750
Alignment:
Q  104 ttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttga-ctt 201  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || |||| |||| |  ||||||  ||    
T  244870 ttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagagttctattcaaacagaattacaaagaaatatgtttgaggtt 244771  T
Q  202 gaacacttgatatacaatcagt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  244770 gaa-acttgatatacaatcagt 244750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University