View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15899_high_4 (Length: 334)

Name: NF15899_high_4
Description: NF15899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15899_high_4
NF15899_high_4
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (24-333)||(10000307-10000617)
chr7 (24-333)||(16418506-16418816)
chr7 (26-221)||(15950730-15950927)
chr7 (23-221)||(15760050-15760250)
chr7 (26-221)||(13758490-13758687)
chr7 (26-221)||(18979960-18980157)
chr7 (23-221)||(14250834-14251034)
chr7 (53-221)||(7822848-7823018)
chr7 (53-221)||(7830159-7830329)
chr7 (53-221)||(27101603-27101773)
chr7 (53-221)||(27108951-27109121)
chr7 (53-221)||(27176553-27176723)
chr7 (53-221)||(38783695-38783865)
chr7 (26-221)||(15927688-15927885)
chr7 (24-204)||(48622603-48622783)
chr7 (55-109)||(13572910-13572964)
chr7 (42-172)||(13910975-13911106)
chr7 (42-108)||(16478913-16478979)
chr7 (42-109)||(10989643-10989710)
chr7 (203-297)||(371132-371227)
chr7 (42-111)||(2437689-2437758)
chr7 (130-247)||(13321107-13321227)
chr7 (23-88)||(18253779-18253844)
chr7 (44-88)||(15862174-15862218)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (24-333)||(7218-7528)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (24-333)||(5888567-5888877)
chr2 (26-333)||(23774145-23774453)
chr2 (23-221)||(23777981-23778181)
chr2 (24-197)||(21142040-21142214)
chr2 (26-221)||(8943966-8944163)
chr2 (26-221)||(12641581-12641778)
chr2 (26-221)||(12728512-12728709)
chr2 (26-221)||(34824595-34824792)
chr2 (44-221)||(3798560-3798739)
chr2 (26-221)||(12635807-12636004)
chr2 (26-221)||(42177908-42178105)
chr2 (26-204)||(16935731-16935910)
chr2 (26-204)||(17006391-17006570)
chr2 (53-221)||(11231304-11231474)
chr2 (53-221)||(22513151-22513321)
chr2 (53-221)||(24685747-24685917)
chr2 (53-221)||(28775773-28775943)
chr2 (42-109)||(19886612-19886679)
chr2 (203-280)||(15633273-15633351)
chr2 (203-280)||(28031356-28031434)
chr2 (203-280)||(17204391-17204469)
chr2 (203-280)||(24826836-24826914)
chr2 (203-280)||(25213108-25213186)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (26-333)||(6606-6914)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (26-333)||(22035456-22035764)
chr1 (26-333)||(7640873-7641181)
chr1 (53-221)||(18059724-18059894)
chr1 (26-221)||(17148687-17148884)
chr1 (43-204)||(46523527-46523689)
chr1 (53-221)||(17004758-17004928)
chr1 (45-221)||(38055049-38055227)
chr1 (203-333)||(20254320-20254451)
chr1 (53-204)||(19962465-19962617)
chr1 (26-109)||(22228042-22228125)
chr1 (26-109)||(22232739-22232822)
chr1 (203-297)||(21650157-21650252)
chr1 (55-109)||(5072352-5072406)
chr1 (55-109)||(18601082-18601136)
chr1 (43-92)||(45051673-45051722)
chr1 (42-105)||(2116492-2116555)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (26-333)||(26339028-26339336)
chr4 (26-333)||(22352003-22352294)
chr4 (24-333)||(22738277-22738588)
chr4 (26-204)||(17145596-17145775)
chr4 (26-221)||(18169090-18169287)
chr4 (25-204)||(19020624-19020804)
chr4 (26-221)||(7132004-7132201)
chr4 (53-193)||(18248367-18248508)
chr4 (26-221)||(20000843-20001040)
chr4 (26-204)||(15287184-15287363)
chr4 (26-204)||(15294293-15294472)
chr4 (42-109)||(10644453-10644520)
chr4 (130-204)||(8374646-8374720)
chr4 (42-109)||(47357888-47357955)
chr4 (203-297)||(14996170-14996265)
chr4 (203-297)||(19697490-19697585)
chr4 (203-297)||(19708075-19708170)
chr4 (203-280)||(14500334-14500412)
chr4 (203-280)||(16522878-16522956)
chr4 (53-109)||(8378385-8378441)
chr4 (203-280)||(9295754-9295832)
chr4 (236-279)||(32460847-32460890)
chr4 (150-204)||(40885626-40885679)
chr4 (236-280)||(9795276-9795320)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (26-333)||(23688-23996)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (26-317)||(29869715-29870007)
chr6 (23-221)||(1556125-1556325)
chr6 (44-221)||(18086780-18086959)
chr6 (26-221)||(16232012-16232209)
chr6 (26-221)||(23977889-23978086)
chr6 (53-221)||(22225704-22225874)
chr6 (27-221)||(13620734-13620930)
chr6 (53-221)||(10488819-10488989)
chr6 (53-221)||(16376339-16376509)
chr6 (53-221)||(16383663-16383833)
chr6 (26-199)||(19610161-19610335)
chr6 (53-221)||(16556105-16556275)
chr6 (53-221)||(16632661-16632831)
chr6 (53-204)||(19299375-19299527)
chr6 (53-168)||(22251532-22251648)
chr6 (42-109)||(16825703-16825770)
chr6 (42-108)||(1650056-1650122)
chr6 (53-119)||(25175787-25175853)
chr6 (59-204)||(29666011-29666157)
chr6 (203-280)||(32276881-32276959)
chr6 (203-297)||(19629373-19629468)
chr6 (42-109)||(27653934-27654001)
chr6 (237-280)||(16300133-16300176)
chr6 (208-281)||(18823510-18823584)
chr6 (203-281)||(18839360-18839439)
chr6 (203-280)||(4991132-4991210)
chr6 (161-247)||(27740931-27741019)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (26-333)||(23328566-23328874)
chr5 (26-333)||(24616171-24616478)
chr5 (26-333)||(24712547-24712854)
chr5 (26-333)||(24745565-24745872)
chr5 (23-221)||(23514681-23514881)
chr5 (26-221)||(10777909-10778106)
chr5 (26-204)||(7425462-7425641)
chr5 (26-204)||(11212004-11212183)
chr5 (26-221)||(1219459-1219656)
chr5 (26-198)||(17471527-17471700)
chr5 (26-221)||(35791037-35791234)
chr5 (53-221)||(21932347-21932517)
chr5 (53-221)||(21938517-21938687)
chr5 (53-221)||(22883050-22883220)
chr5 (53-221)||(35582156-35582326)
chr5 (53-221)||(36989736-36989906)
chr5 (42-109)||(18777943-18778010)
chr5 (55-109)||(27010075-27010129)
chr5 (42-109)||(12608-12675)
chr5 (42-109)||(25426862-25426929)
chr5 (42-109)||(19500133-19500200)
chr5 (42-109)||(21073546-21073613)
chr5 (42-109)||(22366432-22366499)
chr5 (203-280)||(7528960-7529038)
chr5 (42-111)||(4199936-4200005)
chr5 (53-109)||(43443357-43443413)
chr5 (203-277)||(17909568-17909643)
chr5 (42-108)||(29188235-29188301)
chr5 (203-280)||(108950-109028)
chr5 (203-280)||(9730500-9730578)
chr5 (203-280)||(16105703-16105781)
chr5 (148-196)||(32950840-32950888)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (23-204)||(12902026-12902208)
chr3 (26-221)||(18911113-18911310)
chr3 (26-333)||(12264731-12265041)
chr3 (44-221)||(25058859-25059038)
chr3 (24-197)||(44229130-44229304)
chr3 (53-221)||(49232556-49232726)
chr3 (26-198)||(15468279-15468452)
chr3 (26-198)||(22275353-22275526)
chr3 (53-221)||(1467705-1467875)
chr3 (23-221)||(5228433-5228632)
chr3 (53-221)||(12811961-12812131)
chr3 (26-173)||(18896983-18897131)
chr3 (44-109)||(41270309-41270374)
chr3 (24-204)||(54651595-54651776)
chr3 (42-109)||(16821373-16821440)
chr3 (203-281)||(19946757-19946836)
chr3 (55-109)||(55316453-55316507)
chr3 (208-280)||(14285021-14285094)
chr3 (203-277)||(11477308-11477383)
chr3 (203-297)||(16934091-16934186)
chr3 (42-92)||(15615084-15615134)
chr3 (23-88)||(15936571-15936636)
chr3 (23-88)||(15938413-15938478)
chr3 (203-297)||(8268862-8268957)
chr3 (203-297)||(8275962-8276057)
chr3 (203-280)||(9303217-9303295)
chr3 (288-333)||(44228993-44229038)
chr3 (148-204)||(11986236-11986292)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (26-221)||(13720867-13721064)
chr8 (26-221)||(22006197-22006394)
chr8 (26-221)||(16872990-16873187)
chr8 (53-221)||(271326-271496)
chr8 (53-221)||(644424-644594)
chr8 (53-221)||(830159-830329)
chr8 (26-221)||(13662204-13662401)
chr8 (26-199)||(16195374-16195548)
chr8 (23-221)||(22088730-22088930)
chr8 (53-221)||(15319125-15319295)
chr8 (53-221)||(15499494-15499664)
chr8 (55-109)||(21844536-21844590)
chr8 (55-109)||(21851929-21851983)
chr8 (42-108)||(24549216-24549282)
chr8 (54-109)||(30120956-30121011)
chr8 (42-108)||(6774209-6774275)
chr8 (203-280)||(22147498-22147576)
chr8 (55-108)||(16674356-16674409)
chr8 (203-280)||(22886387-22886464)
chr8 (203-281)||(2545005-2545084)
chr8 (203-297)||(3431398-3431493)
chr8 (236-280)||(21494600-21494644)
chr8 (203-297)||(18612449-18612544)
chr8 (203-297)||(18619354-18619449)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (26-221)||(153946-154143)
scaffold0023 (42-109)||(169863-169930)
scaffold0023 (42-110)||(36326-36394)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (26-197)||(7395-7567)
scaffold0191 (288-333)||(7659-7704)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (26-221)||(1453-1650)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (26-221)||(1514-1711)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (24-204)||(54013-54193)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (27-221)||(10279-10475)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (53-221)||(31429-31599)
scaffold0107 (54-221)||(39766-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (53-221)||(39223-39393)
scaffold0076 (53-109)||(43231-43287)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (24-204)||(3552-3732)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (44-198)||(2536-2691)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (53-221)||(29282-29452)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (24-221)||(34095-34294)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (42-247)||(3056-3263)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (55-109)||(64487-64541)
scaffold0026 (23-88)||(108001-108066)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (26-109)||(12066-12149)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (26-172)||(3892-4039)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (42-105)||(9300-9363)
scaffold0215 (42-105)||(16198-16261)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (55-109)||(269-323)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (59-204)||(45168-45314)
scaffold0066 (59-204)||(54554-54700)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (121-221)||(31-132)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (42-111)||(21067-21136)
scaffold0139 (42-89)||(14013-14060)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (42-110)||(31626-31694)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (26-109)||(5151-5234)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (55-109)||(1268-1322)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (203-297)||(11788-11882)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (26-111)||(10687-10772)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (53-108)||(13287-13342)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (203-277)||(17761-17836)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (203-297)||(5264-5359)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (210-280)||(49972-50043)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (203-280)||(5698-5776)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (203-280)||(165083-165161)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (203-279)||(34530-34607)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (203-280)||(130616-130694)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (148-204)||(56169-56225)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (211-280)||(13409-13479)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (209-277)||(6339-6408)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Original strand, 10000307 - 10000617
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10000307 tcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 10000406  T
Q  124 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000407 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatgat 10000506  T
Q  223 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10000507 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgctgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatact 10000606  T
Q  323 taattatggat 333  Q
    |||||||||||    
T  10000607 taattatggat 10000617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16418816 - 16418506
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16418816 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 16418717  T
Q  124 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16418716 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 16418617  T
Q  223 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16418616 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 16418517  T
Q  323 taattatggat 333  Q
    |||||||||||    
T  16418516 taattatggat 16418506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 15950730 - 15950927
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15950730 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15950829  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  15950830 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 15950927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 15760050 - 15760250
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  15760050 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 15760149  T
Q  122 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  15760150 ttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 15760249  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  15760250 a 15760250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13758687 - 13758490
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  13758687 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 13758588  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13758587 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13758490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 18979960 - 18980157
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18979960 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18980059  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18980060 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18980157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 14250834 - 14251034
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||| ||||||  ||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  || | ||    
T  14250834 atcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctatt 14250933  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  14250934 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 14251033  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  14251034 a 14251034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7823018 - 7822848
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  7823018 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 7822919  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7822918 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 7822848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7830329 - 7830159
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  7830329 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 7830230  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  7830229 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 7830159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 27101603 - 27101773
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27101603 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27101702  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27101703 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 27108951 - 27109121
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27108951 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27109050  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27109051 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27109121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27176723 - 27176553
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  27176723 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 27176624  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  27176623 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 27176553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 38783695 - 38783865
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  38783695 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 38783794  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  38783795 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 38783865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15927885 - 15927688
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  15927885 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 15927786  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  15927785 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 15927688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 48622603 - 48622783
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  | || || |  ||    
T  48622603 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattt 48622702  T
Q  123 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||||||||    
T  48622703 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaa 48622783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13572964 - 13572910
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572964 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 13572910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13910975 - 13911106
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 140  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  13910975 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 13911074  T
Q  141 tgttatggtatgtttgtggatgaaattacatg 172  Q
      | || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  13911075 gttaattgtatgattgttggtgaaattacatg 13911106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 16478913 - 16478979
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16478913 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctctt 16478979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10989710 - 10989643
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  10989710 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttg 10989643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 371227 - 371132
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  371227 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgccgagacatgttgttgt 371132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 2437758 - 2437689
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2437758 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 2437689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13321227 - 13321107
Alignment:
Q  130 catgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatttgtga 228  Q
    |||||||||||  | || ||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||| || ||     
T  13321227 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgc 13321128  T
Q  229 taagttg--tgttgaattgag 247  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  13321127 taagttgattgttgaattgag 13321107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 18253779 - 18253844
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 88  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18253779 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 18253844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15862218 - 15862174
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 88  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862218 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7528 - 7218
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7528 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 7429  T
Q  124 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7428 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 7329  T
Q  223 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  7328 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 7229  T
Q  323 taattatggat 333  Q
    |||||||||||    
T  7228 taattatggat 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Original strand, 5888567 - 5888877
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5888567 tcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg 5888666  T
Q  124 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgat 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5888667 cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgat 5888766  T
Q  223 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  5888767 ttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaccatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtataca 5888866  T
Q  323 taattatggat 333  Q
    |||||||||||    
T  5888867 taattatggat 5888877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23774453 - 23774145
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23774453 atcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 23774354  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23774353 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23774254  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23774253 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 23774154  T
Q  325 attatggat 333  Q
    |||||||||    
T  23774153 attatggat 23774145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 23777981 - 23778181
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  23777981 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 23778080  T
Q  122 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  23778081 ttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 23778180  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  23778181 a 23778181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21142214 - 21142040
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | ||    
T  21142214 tcatcataatcaattcaaaaattttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctatt 21142116  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 197  Q
    | ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21142115 ttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 21142040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8944163 - 8943966
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  8944163 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 8944064  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  8944063 ttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 8943966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 12641581 - 12641778
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  12641581 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 12641680  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12641681 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 12641778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12728709 - 12728512
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  12728709 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 12728610  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12728609 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 12728512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34824792 - 34824595
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  34824792 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 34824693  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  34824692 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 34824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Original strand, 3798560 - 3798739
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||| | |||||||||||      
T  3798560 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatga 3798659  T
Q  143 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  3798660 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 3798739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 12635807 - 12636004
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  12635807 atcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 12635906  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  12635907 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 12636004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 42177908 - 42178105
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| |    
T  42177908 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttc 42178007  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  42178008 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 42178105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16935910 - 16935731
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || || |  ||||    
T  16935910 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttc 16935811  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16935810 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 16935731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17006570 - 17006391
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || || |  ||||    
T  17006570 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttc 17006471  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17006470 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 17006391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 11231304 - 11231474
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  11231304 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 11231403  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  11231404 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 11231474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 22513151 - 22513321
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  22513151 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 22513250  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22513251 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22513321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 24685747 - 24685917
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  24685747 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 24685846  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  24685847 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 24685917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 28775773 - 28775943
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  28775773 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 28775872  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  28775873 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 28775943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 19886612 - 19886679
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19886612 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 19886679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15633351 - 15633273
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15633351 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaattgatgttgttgttg 15633273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 28031356 - 28031434
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28031356 aattatgcttaattgatgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 28031434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17204469 - 17204391
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17204469 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 17204391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 24826836 - 24826914
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24826836 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 24826914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25213186 - 25213108
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25213186 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 25213108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6914 - 6606
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6914 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 6815  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6814 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatgattt 6715  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6714 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttattgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 6615  T
Q  325 attatggat 333  Q
    ||| |||||    
T  6614 attgtggat 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22035764 - 22035456
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22035764 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 22035665  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22035664 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 22035565  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22035564 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 22035465  T
Q  325 attatggat 333  Q
    |||||||||    
T  22035464 attatggat 22035456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 7640873 - 7641181
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7640873 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 7640972  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  7640973 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 7641072  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  7641073 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtgtactta 7641172  T
Q  325 attatggat 333  Q
    |||||||||    
T  7641173 attatggat 7641181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 18059724 - 18059894
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  18059724 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 18059823  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  18059824 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 18059894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17148884 - 17148687
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  17148884 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 17148785  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  17148784 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 17148687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46523689 - 46523527
Alignment:
Q  43 attttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatt 141  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||     
T  46523689 attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 46523590  T
Q  142 gttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  46523589 tttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 46523527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17004928 - 17004758
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  17004928 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 17004829  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  17004828 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 17004758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 38055049 - 38055227
Alignment:
Q  45 tttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgt 143  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||  | || |||| ||| ||| | | |||||||||  |    
T  38055049 tttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgat 38055148  T
Q  144 tatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  38055149 tatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 38055227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20254451 - 20254320
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagt 301  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||| ||    
T  20254451 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggt 20254352  T
Q  302 gaataataacttgggtatatataattatggat 333  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  20254351 gaattatgacttgggtatacataattatggat 20254320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 19962465 - 19962617
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || |  |||||| |   |||||||||  |||||||||    
T  19962465 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtat 19962564  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19962565 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22228125 - 22228042
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22228125 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttg 22228042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22232822 - 22232739
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22232822 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttg 22232739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 21650157 - 21650252
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  21650157 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgagacatgttgttgt 21650252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 5072352 - 5072406
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5072352 ctcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 5072406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 18601082 - 18601136
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18601082 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttg 18601136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45051722 - 45051673
Alignment:
Q  43 attttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatg 92  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45051722 attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 45051673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2116555 - 2116492
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 105  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  2116555 aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26339336 - 26339028
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26339336 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 26339237  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26339236 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatgattt 26339137  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  26339136 gtgataagttgtgttgaattgaggagagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 26339037  T
Q  325 attatggat 333  Q
    |||||||||    
T  26339036 attatggat 26339028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 22352003 - 22352294
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352003 atcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgctgtttct 22352102  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                  
T  22352103 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgc-------------- 22352188  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22352189 ---ctaagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22738588 - 22738277
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| | || || |  ||    
T  22738588 tcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattt 22738489  T
Q  123 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||     
T  22738488 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatgg 22738389  T
Q  222 tttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtata 320  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  22738388 tttatgatgagttgttattgaattga-gtgtgaatcaagttccaatggatgttgttgttgcttagacatgttgttgagggtgaattatgacttgggtata 22738290  T
Q  321 tataattatggat 333  Q
      ||||| |||||    
T  22738289 cttaattgtggat 22738277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 17145596 - 17145775
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | || || | ||| |    
T  17145596 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttc 17145695  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17145696 ttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaa 17145775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18169287 - 18169090
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18169287 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18169188  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  18169187 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 18169090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19020804 - 19020624
Alignment:
Q  25 catcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgttt 123  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  |||    
T  19020804 catcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 19020705  T
Q  124 cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19020704 cttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19020624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 7132004 - 7132201
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  7132004 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 7132103  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  7132104 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 7132201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18248508 - 18248367
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | ||||||||||   |||||||||    
T  18248508 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtat 18248409  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18248408 gtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 18248367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20001040 - 20000843
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  20001040 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 20000941  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  20000940 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 20000843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 15287184 - 15287363
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15287184 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15287283  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15287284 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 15287363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 15294293 - 15294472
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  15294293 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 15294392  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15294393 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaa 15294472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10644520 - 10644453
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644520 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 10644453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8374720 - 8374646
Alignment:
Q  130 catgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8374720 catgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 8374646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 47357955 - 47357888
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47357955 aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 47357888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14996265 - 14996170
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  14996265 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 14996170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 19697490 - 19697585
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19697490 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19697585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 19708075 - 19708170
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19708075 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19708170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 14500334 - 14500412
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14500334 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 14500412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16522956 - 16522878
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16522956 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8378441 - 8378385
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  8378441 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 8378385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9295832 - 9295754
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9295832 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9295754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Original strand, 32460847 - 32460890
Alignment:
Q  236 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgtt 279  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32460847 tgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 40885626 - 40885679
Alignment:
Q  150 atgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40885626 atgtttgttggtgaaattacatg-ttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa 40885679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9795320 - 9795276
Alignment:
Q  236 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  9795320 tgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9795276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 23688 - 23996
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23688 atcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttgttgtttct 23787  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23788 tatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23887  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  23888 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtgtactta 23987  T
Q  325 attatggat 333  Q
    |||||||||    
T  23988 attatggat 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 29869715 - 29870007
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29869715 atcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 29869814  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29869815 tatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 29869914  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29869915 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggt 29870007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1556325 - 1556125
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  1556325 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 1556226  T
Q  122 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  1556225 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 1556126  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  1556125 a 1556125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Original strand, 18086780 - 18086959
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||      
T  18086780 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 18086879  T
Q  143 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18086880 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18086959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16232209 - 16232012
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  16232209 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 16232110  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  16232109 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 16232012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23978086 - 23977889
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  23978086 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 23977987  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  23977986 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 23977889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 22225704 - 22225874
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  | || || | ||| ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  22225704 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 22225803  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22225804 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22225874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 13620734 - 13620930
Alignment:
Q  27 tcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-ct 125  Q
    |||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| ||    
T  13620734 tcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttct 13620833  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13620834 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13620930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10488989 - 10488819
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  10488989 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 10488890  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  10488889 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 10488819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 16376339 - 16376509
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16376339 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16376438  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16376439 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16376509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 16383663 - 16383833
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16383663 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16383762  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16383763 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16383833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19610335 - 19610161
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  19610335 atcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 19610236  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagtt 199  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19610235 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 19610161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 16556105 - 16556275
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| || | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16556105 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16556204  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16556205 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16556275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 16632661 - 16632831
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| || | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  16632661 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 16632760  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16632761 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 16632831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19299527 - 19299375
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || | ||| ||| |   |||||||||  |||||||||    
T  19299527 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtat 19299428  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19299427 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 22251532 - 22251648
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  22251532 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 22251631  T
Q  152 gtttgtggatgaaatta 168  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  22251632 gtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 16825703 - 16825770
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16825703 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 16825770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 1650056 - 1650122
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1650056 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 1650122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25175853 - 25175787
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgtt 119  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  25175853 ttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgtt 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29666157 - 29666011
Alignment:
Q  59 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||||| | | || |||| ||| |||||  ||||||||||  | || ||||| ||||    
T  29666157 tgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgt 29666058  T
Q  158 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666057 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaa 29666011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 32276881 - 32276959
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32276881 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 32276959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19629468 - 19629373
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  19629468 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 19629373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 27653934 - 27654001
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27653934 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttg 27654001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Original strand, 16300133 - 16300176
Alignment:
Q  237 gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16300133 gttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16300176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Original strand, 18823510 - 18823584
Alignment:
Q  208 tgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 281  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18823510 tgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 18823584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 281
Target Start/End: Original strand, 18839360 - 18839439
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 281  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839360 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 18839439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4991210 - 4991132
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4991210 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 4991132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27741019 - 27740931
Alignment:
Q  161 tgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tgttgaattgag 247  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||    
T  27741019 tgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgag 27740931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23328874 - 23328566
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23328874 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 23328775  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23328774 tatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 23328675  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23328674 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 23328575  T
Q  325 attatggat 333  Q
    ||| |||||    
T  23328574 attgtggat 23328566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24616478 - 24616171
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24616478 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24616379  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24616378 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24616279  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24616278 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24616180  T
Q  325 attatggat 333  Q
    ||| |||||    
T  24616179 attgtggat 24616171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24712854 - 24712547
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24712854 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24712755  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24712754 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24712655  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24712654 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24712556  T
Q  325 attatggat 333  Q
    ||| |||||    
T  24712555 attgtggat 24712547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24745872 - 24745565
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24745872 atcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgtttct 24745773  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatgattt 224  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24745772 tatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatgattt 24745673  T
Q  225 gtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatata 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24745672 gtgataagttgtgttggattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgac-aaacatgttgttgtgagtgaattataacttgggtatactta 24745574  T
Q  325 attatggat 333  Q
    ||| |||||    
T  24745573 attgtggat 24745565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23514881 - 23514681
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgt 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |    
T  23514881 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 23514782  T
Q  122 ttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||    
T  23514781 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatg 23514682  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  23514681 a 23514681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 10777909 - 10778106
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  10777909 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 10778008  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  10778009 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 10778106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7425641 - 7425462
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||| |    
T  7425641 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttc 7425542  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  7425541 ttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 7425462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 11212004 - 11212183
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  11212004 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 11212103  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  11212104 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaa 11212183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 1219459 - 1219656
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  1219459 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 1219558  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1219559 ttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 1219656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Original strand, 17471527 - 17471700
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  17471527 atcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 17471626  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 198  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17471627 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 17471700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 35791037 - 35791234
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||| |    
T  35791037 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttc 35791136  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  35791137 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatga 35791234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 21932347 - 21932517
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  21932347 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 21932446  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21932447 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 21932517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 21938517 - 21938687
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  21938517 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 21938616  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21938617 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 21938687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 22883050 - 22883220
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  22883050 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 22883149  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22883150 gtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22883220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35582326 - 35582156
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  35582326 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 35582227  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  35582226 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 35582156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 36989736 - 36989906
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| | | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  36989736 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 36989835  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36989836 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 36989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 18777943 - 18778010
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18777943 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttg 18778010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27010129 - 27010075
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010129 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 27010075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12675 - 12608
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12675 aattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 12608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25426929 - 25426862
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25426929 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 25426862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19500200 - 19500133
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  19500200 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttg 19500133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 21073546 - 21073613
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21073546 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 21073613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 22366432 - 22366499
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22366432 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttg 22366499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7529038 - 7528960
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7529038 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 7528960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Original strand, 4199936 - 4200005
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  4199936 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgtt 4200005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Original strand, 43443357 - 43443413
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43443357 ttctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttg 43443413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17909643 - 17909568
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 277  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  17909643 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttg 17909568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 29188235 - 29188301
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29188235 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 29188301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 108950 - 109028
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  108950 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 109028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 9730500 - 9730578
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  9730500 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttg 9730578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16105781 - 16105703
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16105781 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 16105703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32950888 - 32950840
Alignment:
Q  148 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaa 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  32950888 gtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaa 32950840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 12902026 - 12902208
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||    
T  12902026 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatt 12902125  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12902126 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 12902208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18911310 - 18911113
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  18911310 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 18911211  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  18911210 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 18911113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 12264731 - 12265041
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  12264731 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 12264830  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg-at 222  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| |     
T  12264831 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaa 12264930  T
Q  223 ttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgtgagtgaataataacttgggtatat 321  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| || ||  || | ||| || |||||||||| |   ||   ||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  12264931 ttttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatg-ttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatac 12265029  T
Q  322 ataattatggat 333  Q
    ||||||||||||    
T  12265030 ataattatggat 12265041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25059038 - 25058859
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||      
T  25059038 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 25058939  T
Q  143 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25058938 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 25058859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44229304 - 44229130
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || || | ||    
T  44229304 tcatcataatcaattcaaattttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctatt 44229206  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 197  Q
    | ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44229205 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 44229130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49232726 - 49232556
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  49232726 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtat 49232627  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  49232626 gtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 49232556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Original strand, 15468279 - 15468452
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||| |||| || | ||| |    
T  15468279 atcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttc 15468378  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 198  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15468379 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 15468452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22275526 - 22275353
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || ||   ||| |    
T  22275526 atcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttc 22275427  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 198  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22275426 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 22275353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 1467705 - 1467875
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  1467705 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 1467804  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1467805 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 1467875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5228632 - 5228433
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | || |||| ||    
T  5228632 atcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatt 5228534  T
Q  123 tc-ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga-attttgcttaattgatg 220  Q
    || || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  5228533 tccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatg 5228434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12812131 - 12811961
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | |  || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  12812131 ttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 12812032  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaattt-tgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12812031 gtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatga 12811961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 18896983 - 18897131
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  18896983 atcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 18897082  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatgg 173  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18897083 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatgg 18897131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 41270374 - 41270309
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41270374 ttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 41270309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54651776 - 54651595
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtt 122  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||    
T  54651776 tcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattt 54651677  T
Q  123 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| | |||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  54651676 tcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 54651595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16821440 - 16821373
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16821440 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttg 16821373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19946836 - 19946757
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 281  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19946836 aattatgcttaattgatgatttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 19946757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 55316507 - 55316453
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  55316507 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 55316453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14285094 - 14285021
Alignment:
Q  208 tgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14285094 tgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 14285021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 11477308 - 11477383
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtg-ttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 277  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11477308 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 11477383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 16934091 - 16934186
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  16934091 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 16934186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15615134 - 15615084
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatg 92  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15615134 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 15615084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 15936571 - 15936636
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 88  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15936571 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15936636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 15938413 - 15938478
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 88  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15938413 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15938478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 8268862 - 8268957
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  8268862 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgt 8268957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 8275962 - 8276057
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  8275962 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgt 8276057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 9303217 - 9303295
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9303217 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 9303295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44229038 - 44228993
Alignment:
Q  288 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggat 333  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  44229038 atgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggat 44228993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 11986236 - 11986292
Alignment:
Q  148 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11986236 gtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatgaa 11986292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 13720867 - 13721064
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  13720867 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 13720966  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  13720967 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 13721064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 22006197 - 22006394
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  22006197 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 22006296  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  22006297 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 22006394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 16872990 - 16873187
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  16872990 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttc 16873089  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  16873090 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 16873187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 271326 - 271496
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  271326 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 271425  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  271426 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 271496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 644594 - 644424
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  644594 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 644495  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  644494 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 644424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 830329 - 830159
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  830329 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 830230  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  830229 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 830159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 13662204 - 13662401
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||| | || || | ||| |    
T  13662204 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 13662303  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  13662304 ttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 13662401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16195548 - 16195374
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||| || | || || | | |||    
T  16195548 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttc 16195449  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagtt 199  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16195448 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 16195374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 22088730 - 22088930
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    |||||||||||||  | |||  |||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||    
T  22088730 atcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 22088829  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatg 220  Q
    | ||| | | |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  22088830 ttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 22088929  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  22088930 a 22088930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 15319125 - 15319295
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |  | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  15319125 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 15319224  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||    
T  15319225 gtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatga 15319295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 15499494 - 15499664
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |  | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  15499494 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 15499593  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||    
T  15499594 gtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatga 15499664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 21844536 - 21844590
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844536 ctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 21851929 - 21851983
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851929 ctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21851983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24549282 - 24549216
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24549282 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 24549216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30121011 - 30120956
Alignment:
Q  54 tctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30121011 tctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 30120956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 6774209 - 6774275
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  6774209 aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 6774275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22147576 - 22147498
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22147576 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaaattttaattgatgttgttgttg 22147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Original strand, 16674356 - 16674409
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16674356 ctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 16674409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22886464 - 22886387
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22886464 aattatgcttaattgatgaactatgacatgttgttgtgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 22886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2545084 - 2545005
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttga 281  Q
    |||| |||||||||||||| || | | | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2545084 aattatgcttaattgatgaattataacatgttgttgttgaattgaggtgggaatcaagtttcaattgatgttgttgttga 2545005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 3431398 - 3431493
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  3431398 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 3431493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 21494600 - 21494644
Alignment:
Q  236 tgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21494600 tgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 21494644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18612544 - 18612449
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18612544 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 18612449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18619449 - 18619354
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18619449 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 18619354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 153946 - 154143
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  ||||    
T  153946 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 154045  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  154046 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 154143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 169863 - 169930
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  169863 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 169930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 36394 - 36326
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 110  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36394 aattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgt 36326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7567
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  ||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||| || || | ||| |    
T  7395 atcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 7494  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaag 197  Q
    || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7495 ttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaag 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 333
Target Start/End: Original strand, 7659 - 7704
Alignment:
Q  288 atgttgttgtgagtgaataataacttgggtatatataattatggat 333  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  7659 atgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 1453 - 1650
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |  || | ||| |    
T  1453 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttc 1552  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1553 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 1650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 1514 - 1711
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-c 124  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| |||| | || || | ||| |    
T  1514 atcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttc 1613  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1614 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatga 1711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54193 - 54013
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttg-tt 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  | || || || ||    
T  54193 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttt 54094  T
Q  123 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  54093 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 54013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 10279 - 10475
Alignment:
Q  27 tcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttct 125  Q
    |||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||    
T  10279 tcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttct 10378  T
Q  126 tatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  10379 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatga 10475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31599 - 31429
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  31599 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 31500  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  31499 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 31429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39766
Alignment:
Q  54 tctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg-ttgttgtttcttatacatgaattgattgttatggtatg 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||| | | |||||||||||  |||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  153 tttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatga 39766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39393 - 39223
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||    
T  39393 ttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtat 39294  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  39293 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 39223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43287 - 43231
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43287 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttg 43231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3732 - 3552
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttg-tt 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||  | || ||||| ||    
T  3732 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttt 3633  T
Q  123 tcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  3632 tcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacat-gttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2691 - 2536
Alignment:
Q  44 ttttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattg 142  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||   || || | ||| ||| | |||||||||||      
T  2691 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgc 2592  T
Q  143 ttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2591 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29452 - 29282
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgattgttatggtat 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || |  |||||| | | ||||||| |  ||||| |||    
T  29452 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttat 29353  T
Q  152 gtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgatga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  29352 gtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Original strand, 34095 - 34294
Alignment:
Q  24 tcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcat-gttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtt 122  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||  | | ||    
T  34095 tcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctatt 34193  T
Q  123 t-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa-ttttgcttaattgatg 220  Q
    | ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  34194 ttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatg 34293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3263 - 3056
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgt-ttcttatacatgaattgat 140  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || |||| | ||  ||| |||||||||||    
T  3263 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgat 3164  T
Q  141 tgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg--aattttgcttaattgatgatttgtgataagttg-tg 237  Q
      | || ||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||    
T  3163 gataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttcaat-tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttg 3066  T
Q  238 ttgaattgag 247  Q
    ||||||||||    
T  3065 ttgaattgag 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 64487 - 64541
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64487 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 64541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 108066 - 108001
Alignment:
Q  23 atcatcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaatt 88  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  108066 atcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 108001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12149
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatg-ttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12066 atcataatcaatttcaaatttttcat-ttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4039 - 3892
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttc 124  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |  ||||    
T  4039 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttc 3940  T
Q  125 ttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatg 172  Q
    || | |||||||||||  | || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  3939 ttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 3892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 9300 - 9363
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 105  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9300 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 105
Target Start/End: Original strand, 16198 - 16261
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 105  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 323 - 269
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323 ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45314 - 45168
Alignment:
Q  59 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgtttct-tatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||| || || | |||   | | |||||||||||  | || ||||| ||||    
T  45314 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 45215  T
Q  158 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45214 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaa 45168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54700 - 54554
Alignment:
Q  59 tgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgattgttatggtatgtttgt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| | || || | ||| ||| | |||||||||||  | || ||||| ||||    
T  54700 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54601  T
Q  158 ggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  54600 gggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa 54554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 31 - 132
Alignment:
Q  121 tttcttatacatgaattgattgttatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtg-aattttgcttaattgat 219  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| | ||||||||||    
T  31 tttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatacttaattgat 130  T
Q  220 ga 221  Q
    ||    
T  131 ga 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Original strand, 21067 - 21136
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21067 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 21136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 89
Target Start/End: Original strand, 14013 - 14060
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattc 89  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14013 aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattc 14060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 31626 - 31694
Alignment:
Q  42 aattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgt 110  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31626 aattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgt 31694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Original strand, 5151 - 5234
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5151 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttg 5234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1322
Alignment:
Q  55 ctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1268 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11882 - 11788
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgtgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  11882 aattatgcttaattgatgaatcatgacatgttttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 11788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 10687 - 10772
Alignment:
Q  26 atcataatcaatttcaaattttgaatcttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgtt 111  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  10687 atcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgtt 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 108
Target Start/End: Original strand, 13287 - 13342
Alignment:
Q  53 ttctcatgttgtaagaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13287 ttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17836 - 17761
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 277  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17836 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5359 - 5264
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttgacaaaacatgttgttgt 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  5359 aattatgcttaattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgt 5264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 280
Target Start/End: Original strand, 49972 - 50043
Alignment:
Q  210 cttaattgatgatttgtgataagttgtg-ttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49972 cttaattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 50043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 5698 - 5776
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5698 aattatgcttaattaatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 165083 - 165161
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  165083 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttg 165161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 34530 - 34607
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgtt 279  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  34530 aattatgcttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgaaaatcaagtttcaattgatgttgttgtt 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 130694 - 130616
Alignment:
Q  203 aattttgcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  130694 aattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 56169 - 56225
Alignment:
Q  148 gtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaa 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  56169 gtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa 56225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 280
Target Start/End: Original strand, 13409 - 13479
Alignment:
Q  211 ttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttgttg 280  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13409 ttaattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtggaaatcaagtttcaattgatgttgttgttg 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 277
Target Start/End: Original strand, 6339 - 6408
Alignment:
Q  209 gcttaattgatgatttgtgataagttgt-gttgaattgaggtgagaaacaagtttcaatggatgttgttg 277  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6339 gcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University