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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15906_low_8 (Length: 533)

Name: NF15906_low_8
Description: NF15906
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15906_low_8
NF15906_low_8
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (52-522)||(10795597-10796067)
chr8 (38-522)||(40264507-40264991)
chr8 (3-522)||(43604593-43605111)
chr8 (38-522)||(41386090-41386577)
chr8 (38-519)||(29259498-29259985)
chr8 (38-512)||(7148414-7148888)
chr8 (38-430)||(43489259-43489650)
chr8 (38-522)||(41964815-41965290)
chr8 (38-512)||(9457886-9458360)
chr8 (38-505)||(2113170-2113635)
chr8 (83-522)||(4655492-4655930)
chr8 (40-385)||(42275351-42275681)
chr8 (38-143)||(41965406-41965511)
chr8 (378-522)||(39371398-39371542)
chr8 (40-77)||(4655421-4655458)
chr8 (478-517)||(43489714-43489753)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (38-512)||(43056910-43057385)
chr7 (38-522)||(47913553-47914040)
chr7 (38-522)||(152231-152715)
chr7 (54-522)||(47912629-47913100)
chr7 (38-522)||(35089329-35089816)
chr7 (38-430)||(33474862-33475256)
chr7 (38-522)||(27417880-27418351)
chr7 (38-522)||(30111181-30111647)
chr7 (38-430)||(12252752-12253127)
chr7 (479-517)||(12252652-12252690)
chr7 (476-517)||(33475315-33475356)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (38-522)||(30589215-30589699)
chr3 (38-521)||(24150060-24150543)
chr3 (3-522)||(26292793-26293314)
chr3 (38-512)||(26005092-26005569)
chr3 (38-512)||(19551395-19551872)
chr3 (38-522)||(36054242-36054713)
chr3 (40-522)||(38629041-38629509)
chr3 (38-429)||(50899749-50900144)
chr3 (105-521)||(35731309-35731727)
chr3 (38-301)||(23753927-23754185)
chr3 (38-301)||(23697351-23697609)
chr3 (38-301)||(23715807-23716065)
chr3 (38-301)||(23734263-23734521)
chr3 (224-522)||(26556415-26556715)
chr3 (256-518)||(2124932-2125196)
chr3 (336-430)||(23697604-23697698)
chr3 (336-430)||(23716060-23716154)
chr3 (336-430)||(23734516-23734610)
chr3 (336-430)||(23754180-23754274)
chr3 (478-517)||(23697762-23697801)
chr3 (478-517)||(23716217-23716256)
chr3 (478-517)||(23734673-23734712)
chr3 (478-517)||(23754335-23754374)
chr3 (439-467)||(50899706-50899734)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (38-518)||(42217674-42218154)
chr4 (38-522)||(8583233-8583718)
chr4 (41-427)||(3435294-3435680)
chr4 (38-430)||(42315247-42315640)
chr4 (38-367)||(7820424-7820753)
chr4 (220-430)||(56398552-56398770)
chr4 (38-228)||(56397783-56397973)
chr4 (38-166)||(44930254-44930382)
chr4 (264-367)||(7808724-7808827)
chr4 (245-346)||(44930371-44930472)
chr4 (439-522)||(3435050-3435133)
chr4 (476-512)||(7820756-7820792)
chr4 (476-512)||(42315672-42315708)
chr4 (476-512)||(56398829-56398865)
chr4 (439-467)||(44930476-44930504)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (4-522)||(52705731-52706251)
chr1 (41-522)||(26882048-26882530)
chr1 (38-522)||(45318841-45319329)
chr1 (38-512)||(45535131-45535609)
chr1 (285-430)||(14389005-14389150)
chr1 (38-154)||(39758313-39758432)
chr1 (38-154)||(39763667-39763786)
chr1 (243-390)||(39758447-39758602)
chr1 (243-390)||(39763801-39763956)
chr1 (476-517)||(14389212-14389253)
chr1 (255-290)||(14387660-14387695)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (40-522)||(81006-81490)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (40-522)||(34038-34522)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (38-522)||(13950023-13950506)
chr5 (38-430)||(3603790-3604179)
chr5 (38-289)||(40410969-40411220)
chr5 (275-522)||(11632918-11633165)
chr5 (476-511)||(3603694-3603729)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (38-506)||(20687-21154)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (65-518)||(3109586-3110038)
chr6 (38-508)||(29864989-29865459)
chr6 (38-522)||(6475975-6476421)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (38-430)||(7487468-7487865)
chr2 (120-522)||(42626632-42627037)
chr2 (71-522)||(45547341-45547769)
chr2 (129-430)||(21735989-21736290)
chr2 (175-522)||(6288779-6289126)
chr2 (38-262)||(29941325-29941549)
chr2 (139-367)||(35172007-35172220)
chr2 (327-522)||(29941549-29941753)
chr2 (38-128)||(6289127-6289217)
chr2 (353-430)||(35171755-35171832)
chr2 (38-89)||(21736289-21736340)
chr2 (477-517)||(21735887-21735927)
chr2 (38-77)||(35172338-35172377)
chr2 (476-517)||(35171651-35171692)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10796067 - 10795597
Alignment:
Q  52 ttcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacata 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10796067 ttcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacata 10795968  T
Q  152 acttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgt 251  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10795967 acttttactttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgt 10795868  T
Q  252 tcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttt 351  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10795867 tcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgttacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacttaacttatttt 10795768  T
Q  352 taggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattac 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  10795767 taggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattac 10795668  T
Q  452 actcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    |||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10795667 actcatggattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgtgatttgttggtctgt 10795597  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 40264991 - 40264507
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40264991 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcattcctctaacttgca 40264892  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40264891 cttttcttaacatgacttttacgttcattaaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 40264792  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40264791 atcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctagatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 40264692  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  40264691 aacataacttatttttagatctatttattttgatatcatatgtccatgatttttaagattaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 40264592  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40264591 ttgaagaaatattacactcattgattcaatg-tttttttcggttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 40264507  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 43605111 - 43604593
Alignment:
Q  3 tttgtaatactcttccaaattcttttcnnnnnnnnacgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43605111 tttgtaatactcttccaaattctttt--tttttttacgtttcttccaaattcttttttgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaa 43605014  T
Q  103 acttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaat 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43605013 acttattgtcgaaatcatcatgcatctaacttgcacttttcttaacataacttgtacattcattaaaaaaaagaatatattgtataatcttgtggttaat 43604914  T
Q  203 ttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatg 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43604913 ttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatg 43604814  T
Q  303 catttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43604813 catttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttagatctatttattttgatattatatgtccagaatttttaagatcaatcaa 43604714  T
Q  403 tctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgt 501  Q
     |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||| ||||||    
T  43604713 cctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttgttttcgattgatttataactgtatttttgt 43604614  T
Q  502 ttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  43604613 ttttgagattttttggtctgt 43604593  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 41386577 - 41386090
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41386577 acgtttcttccaaattcttttctgttctattgtaacaatcgcaggttatatatgttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 41386478  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386477 tttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgaataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 41386378  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcattttt-caatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41386377 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttccaatcaaattattataatcaataaact 41386278  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  41386277 aacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 41386178  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatg--nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41386177 ttgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttttccggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 41386090  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 29259985 - 29259498
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29259985 acgtttcttccaaattcttttctgttctattgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 29259886  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29259885 cttttcttaacataacttttacgttaattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattatcataaaaa 29259786  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29259785 tcacaactttacgtttattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 29259686  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc---nnnn 434  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||           
T  29259685 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgccagtagtatattatctaatagtcttttttt 29259586  T
Q  435 nnnngaagaaatattacactcattgattcaatg---nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtc 519  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29259585 tttttaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttttccggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtc 29259498  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Original strand, 7148414 - 7148888
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7148414 acgtttcttccaaattcttttctgttttactgtaacaatggtagattatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaccttgca 7148513  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148514 cttttcttaacataatttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactggataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 7148613  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7148614 tcacaactttacgttaattggtattataataatttttctacttgcatttctctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataattaataaacta 7148713  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  7148714 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccaaaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 7148813  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148814 ttaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcgattgatttataactgtacttttgtttttgagattt 7148888  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Original strand, 43489259 - 43489650
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43489259 acgtttcatccaaattcttttttgttctactgtaacaatggcagattatatattttgtttggcaaacttattctcgaaatcatcatacctctaacttgca 43489358  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489359 cttttcttaacata-cttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 43489457  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43489458 tcaaaactttacgttctttggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 43489557  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43489558 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc 43489650  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 41965290 - 41964815
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         || |||||||||| ||    
T  41965290 acgtttattccaaattcttttctgttctaatgtaacaatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattgtc---------atacctctaacttaca 41965200  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41965199 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgaataattttgtggttaatttaccatttacctatatatcaaattattataaaaa 41965100  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  41965099 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacca 41965000  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctattta-ttttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||           
T  41964999 acataacttatttttaggtctatttatttttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgttagtagtatattatctaatagt-tttttt 41964901  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41964900 ttgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttacggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 41964815  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Original strand, 9457886 - 9458360
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9457886 acgtttcttccaaattcttttctgttctaccgtaacaatggcaggatatatattttgtttggcaaactt-ttgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 9457984  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  9457985 cttttcttaacataacttttacgttcaataaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctttttttcaaattattataaaaa 9458084  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  9458085 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctaaatgcaacatgcatttttcaattaaattataataatcaataaacta 9458184  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnn 436  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  9458185 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccatgatttttaagattaaccaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 9458284  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
       |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9458285 tttaagaaatattacactcattgattcaatattttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 9458360  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 38 - 505
Target Start/End: Original strand, 2113170 - 2113635
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  2113170 acgtttcttccaaaatcttttctgctctactgtaataatggcaggttatatattttgtttggcaaact-attgtcgaaatcaccatgcatctaacttgca 2113268  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113269 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatcctgtggtta-tttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 2113367  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2113368 tcacaactttacgt-cattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 2113466  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnn 436  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||           
T  2113467 aaataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgttagtactatattatctaatagtcttttttt 2113566  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgttttt 505  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2113567 tggaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttccggttgatttataattgtacatttgttttt 2113635  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 83 - 522
Target Start/End: Original strand, 4655492 - 4655930
Alignment:
Q  83 ttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  4655492 ttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtac 4655591  T
Q  183 tgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4655592 tgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcaaaactttacgttcattggaattataataatttttctacttgc 4655691  T
Q  283 atttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtcca 382  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4655692 attttt-tacctgtaacatgcatttttcaatcaatttattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttgttttgatatcatatgtcta 4655790  T
Q  383 gaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggtt 480  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  4655791 gaatttttaagatcaattaacctgctagtagtatattatctaatagtctttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttttcggtt 4655890  T
Q  481 gatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4655891 gatttataattttacttttg--tttgagattttttggtctgt 4655930  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 40 - 385
Target Start/End: Original strand, 42275351 - 42275681
Alignment:
Q  40 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcact 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||               ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42275351 gtttcttccaaattcttttttgttctactgtaacaatggtaggttatatatt---------------attgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcact 42275435  T
Q  140 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaataaga--acgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42275436 tttcttaacataacttttacgtt-attaaaaaaaaaataacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattat-ataaaaa 42275533  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42275534 tcacaactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctttaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 42275633  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaa 385  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42275634 acataacttatttttaggtctatttattttgatattatatgtccagaa 42275681  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41965511 - 41965406
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41965511 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaaaaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 41965412  T
Q  138 cttttc 143  Q
    ||||||    
T  41965411 cttttc 41965406  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 378 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 39371542 - 39371398
Alignment:
Q  378 gtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncg 477  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  39371542 gtccaaaattttcaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcg 39371443  T
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39371442 gttgatttatagctgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 39371398  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Original strand, 4655421 - 4655458
Alignment:
Q  40 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655421 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatg 4655458  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 478 - 517
Target Start/End: Original strand, 43489714 - 43489753
Alignment:
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43489714 gttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgg 43489753  T

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Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 43057385 - 43056910
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43057385 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 43057286  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43057285 cttttcttaacataatttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctatctatatatcaaattattataaaaa 43057186  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057185 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 43057086  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  43057085 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 43056986  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43056985 tgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 43056910  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 47914040 - 47913553
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47914040 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggtaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 47913941  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47913940 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 47913841  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47913840 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 47913741  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  47913740 acatagcttatttttaggtctatttattttgatattatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc-tttttt 47913642  T
Q  438 ngaagaaa---tattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||   ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47913641 tgaagaaatattattacactcattgattcaatgttttgttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 47913553  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Original strand, 152231 - 152715
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  152231 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcattcctctaacttgca 152330  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152331 cttttcttaacatgacttttacgttcattaaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 152430  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  152431 atcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctagatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 152530  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  152531 aacataacttatttttagatctatttattttgatatcatatgtccatgatttttaagattaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 152630  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  152631 ttgaagaaatattacactcattgattcaatg-tttttttcggttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 152715  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 522
Target Start/End: Original strand, 47912629 - 47913100
Alignment:
Q  54 cttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912629 cttttctgttctactgtaacaatggtaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataac 47912728  T
Q  154 ttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttc 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912729 ttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactatataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttc 47912828  T
Q  254 attggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttactttta 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  47912829 attggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacatagcttattttta 47912928  T
Q  354 ggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaa---tatta 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||   |||||    
T  47912929 ggtctatttattttgatattatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc-tttttttgaagaaatattatta 47913027  T
Q  451 cactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47913028 cactcattgattcaatgttttgttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 47913100  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35089816 - 35089329
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatatttt--gtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttg 135  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35089816 acgttttttccaaattcttttatattctactgtaacaacgacatattatatattttttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttg 35089717  T
Q  136 cacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaa 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089716 catttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtattgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaa 35089617  T
Q  236 aatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaat 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089616 aatcacaactttacgttcatcggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaat 35089517  T
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnn 435  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  35089516 taacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccataatttttaagattaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcttttt 35089417  T
Q  436 nnngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
       ||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35089416 tttgaagaaaaattacactcattgattcaatgtttttttttcggttgatttataactgtacttttatttttgagattttttggtctgt 35089329  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Original strand, 33474862 - 33475256
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33474862 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcatgttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 33474961  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa--gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33474962 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaaagaacgaactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaa 33475061  T
Q  236 aatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaat 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33475062 aatcacaactttatgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatatttcaatcaaattattataatcaataaac 33475161  T
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33475162 tatcataacttatttttaggtctatttatttggatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc 33475256  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 27418351 - 27417880
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||               ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27418351 acgtttcttccaaattcttttctgttctactataacaatgacagattatatatt---------------attgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 27418267  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418266 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 27418167  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27418166 atcacaactttttgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 27418067  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  27418066 aacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 27417967  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27417966 ttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttgttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 27417880  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Original strand, 30111181 - 30111647
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||               || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30111181 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcagattatatatt---------------atcgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 30111265  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111266 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 30111365  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30111366 atcacaactttttgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 30111465  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  30111466 aacataa-----ttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 30111560  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30111561 tttaagaaatattacactcattgattcaatgttttgttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 30111647  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12253127 - 12252752
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  12253127 acgtttctttcaaattcttttctgttctactataacaatggcaagttatatattttgttcggcaaacttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttaca 12253028  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12253027 cttttcttaacataacttttatgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatatacctatatatcaaattattataaaaa 12252928  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||              |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12252927 tcacaattttacgttcattg---ttataata--------------atttttctacttgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 12252845  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12252844 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc 12252752  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12252690 - 12252652
Alignment:
Q  479 ttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12252690 ttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgg 12252652  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 517
Target Start/End: Original strand, 33475315 - 33475356
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33475315 cggctgatttataactgtacttttgtttttgaaattttttgg 33475356  T

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Target: chr3 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Original strand, 30589215 - 30589699
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30589215 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatgacaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 30589314  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30589315 cttttcttaacataacttttacgttaattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 30589414  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30589415 tcacaactttacattcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacttgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 30589514  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  30589515 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaatctgctagtagtttattatctaatagtcttttttt 30589614  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30589615 tgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttccggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttttttgtctgt 30589699  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24150543 - 24150060
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24150543 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaaaaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 24150444  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24150443 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctatctatatatcaaattattataaaaa 24150344  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24150343 tcaaaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 24150244  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  24150243 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccaaaaattttaagatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 24150144  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctg 521  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24150143 tgaagaaatattatactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttttttgtctg 24150060  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26293314 - 26292793
Alignment:
Q  3 tttgtaatactcttccaaattcttttcnnnnnnnnacgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26293314 tttgtaatactcttccaaattctttttttttttttacttttcttccaaattcttttctattctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaa 26293215  T
Q  103 acttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaat 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  26293214 acttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttccacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaggaacatactgtataatcttgtggttaat 26293115  T
Q  203 ttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatg 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26293114 ttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcacgactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatg 26293015  T
Q  303 catttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26293014 catttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtgtatttattttgatagcatatgtccagaatttttaagatcaatcaa 26292915  T
Q  403 tctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatg---nnnnnnnncggttgatttataactgtactttt 499  Q
     |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||    
T  26292914 cctgctagtagtatattatctaatagtc-tttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttttttcggttgatttataactgtactttt 26292816  T
Q  500 gtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26292815 gtttttgagattttttggtctgt 26292793  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26005569 - 26005092
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26005569 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatgacatgttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 26005470  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005469 cttttcttaacataacttttacgttaattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 26005370  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26005369 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 26005270  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||           
T  26005269 acataacttaatttttggtttatttattttgatatcatatgtccataatttttaagatcaatcaacctgctagtagta-attatctaatagtcttttttt 26005171  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatg----nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005170 tgaagaaatattacactcattgattcaatgtttttttttcttcagttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 26005092  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19551872 - 19551395
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19551872 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgta-caatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 19551774  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19551773 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 19551674  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19551673 ttaaaactttacgttcattagtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttgaatcaaattattataatcaataaacta 19551574  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-----nn 432  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||           
T  19551573 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcagaatttttaagatcaatcaacctgctagtggtatattatctaacagtcttttttt 19551474  T
Q  433 nnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19551473 ttttttgaagaaatattacactcattgattcaatg-tttttttcggttgatttataactatacttttgtttttgagattt 19551395  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 36054713 - 36054242
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||               ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36054713 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcagattatatatt---------------attgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 36054629  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054628 cttttcttaacataatttttacgttcattaaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 36054529  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36054528 atcacaactttttgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 36054429  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnn 436  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  36054428 aacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtctttttt 36054329  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatg-nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36054328 ttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttgttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 36054242  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 40 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 38629509 - 38629041
Alignment:
Q  40 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcact 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38629509 gtttctttcaaattcttttctgttctactgtaacaatggcagattatatattttgt-----------attgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcact 38629421  T
Q  140 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatc 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629420 tttcttaacataatttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatc 38629321  T
Q  240 acaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaac 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38629320 acaactttacgttcattggtattataataatttt-----ttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaac 38629226  T
Q  340 gtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnng 439  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |    
T  38629225 ataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttg 38629126  T
Q  440 aagaaatattacactcattgattcaatg--nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38629125 aagaaatattacactcattgattcaatgttttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgatctgt 38629041  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 38 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50900144 - 50899749
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50900144 acgtttcttccaaattcttttctgttatactctaacaatggcatgttatatattttgtttggcaaattt--tgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 50900047  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaa------taagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattatta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900046 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaaaataataatgtactgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattatta 50899947  T
Q  232 taaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50899946 taaaaatcacaactttacgttaataggtataataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaat 50899847  T
Q  332 aaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagt 429  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50899846 aaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaattaacctgctagtagtatattatctaatagt 50899749  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 105 - 521
Target Start/End: Original strand, 35731309 - 35731727
Alignment:
Q  105 ttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa--gaacgtattgtataatcttgtggttaat 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  35731309 ttattgttgaaatcatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaaagaatttattgtataattttgtggttaat 35731408  T
Q  203 ttatcatctacctata-tatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacat 301  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35731409 ttaccatctacctataatatcaaattattataaaaatcaaaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacat 35731508  T
Q  302 gcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatca 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35731509 gcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatattatatgtccagaatttttaagatcaatca 35731608  T
Q  402 atctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgt 501  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  35731609 acctgctagtagtattttatctaatagtc-tttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgt 35731707  T
Q  502 ttttgagatttgttggtctg 521  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  35731708 ttttgagattttttggtctg 35731727  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 23753927 - 23754185
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23753927 acgtttcttccaaattcttttctattctattgtaacaatggcaggttatatattttgtttgg-----ttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 23754021  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23754022 ctttttttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattgtaaaaa 23754121  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23754122 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacat 23754185  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 23697351 - 23697609
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23697351 acgtttcttccaaattcttttatgttctattgtaacaatggcaggttatatattttgtttgg-----ttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttgca 23697445  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697446 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatattgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 23697545  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacat 301  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23697546 tcacaattttacgttcattagtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacat 23697609  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 23715807 - 23716065
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23715807 acgtttcttccaaattcttttatgttctattgtaacaatggcaggttatatattttgtttgg-----ttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttgca 23715901  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23715902 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatattgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 23716001  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacat 301  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23716002 tcacaattttacgttcattagtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacat 23716065  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 23734263 - 23734521
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23734263 acgtttcttccaaattcttttatgttctattgtaacaatggcaggttatatattttgtttgg-----ttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttgca 23734357  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23734358 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatattgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 23734457  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacat 301  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23734458 tcacaattttacgttcattagtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacat 23734521  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 224 - 522
Target Start/End: Original strand, 26556415 - 26556715
Alignment:
Q  224 aattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattatta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26556415 aattattataaaaatcacaactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctataacatgcatttttcaatcaaattatta 26556514  T
Q  324 taatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatct 423  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26556515 taatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtttattatct 26556614  T
Q  424 aatagtc---nnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtct 520  Q
    |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26556615 aatagtctttttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatg-tttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtct 26556713  T
Q  521 gt 522  Q
    ||    
T  26556714 gt 26556715  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 256 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2125196 - 2124932
Alignment:
Q  256 tggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttagg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  2125196 tggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcattttttaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttagg 2125097  T
Q  356 tctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactc 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |    
T  2125096 tctatttatttttatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacatgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacacac 2124997  T
Q  456 attgattcaatg--nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggt 518  Q
    ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124996 attgattcaatgttttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggt 2124932  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 23697604 - 23697698
Alignment:
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23697604 taacataatttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcagaatttttaagatcaatcaacatgctagtagtatattatctaatagtc 23697698  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 23716060 - 23716154
Alignment:
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23716060 taacataatttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcagaatttttaagatcaatcaacatgctagtagtatattatctaatagtc 23716154  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 23734516 - 23734610
Alignment:
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23734516 taacataatttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcagaatttttaagatcaatcaacatgctagtagtatattatctaatagtc 23734610  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 430
Target Start/End: Original strand, 23754180 - 23754274
Alignment:
Q  336 taacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23754180 taacataatttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcataatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc 23754274  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 517
Target Start/End: Original strand, 23697762 - 23697801
Alignment:
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23697762 gttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttgg 23697801  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 517
Target Start/End: Original strand, 23716217 - 23716256
Alignment:
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23716217 gttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttgg 23716256  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 517
Target Start/End: Original strand, 23734673 - 23734712
Alignment:
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23734673 gttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttgg 23734712  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 478 - 517
Target Start/End: Original strand, 23754335 - 23754374
Alignment:
Q  478 gttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23754335 gttgattaataactgtacttttgtttttgagattttttgg 23754374  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 50899734 - 50899706
Alignment:
Q  439 gaagaaatattacactcattgattcaatg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50899734 gaagaaatattacactcattgattcaatg 50899706  T

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Target: chr4 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 42218154 - 42217674
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42218154 acgtttcttccaaattcttttctattctactgtaacaatggcagattatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 42218055  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218054 cttttcttaacataacttttacgttcatttaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 42217955  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42217954 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 42217855  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||           
T  42217854 acataacttatttttaagtctattcattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacatgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 42217755  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggt 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42217754 tgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttctgttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggt 42217674  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8583718 - 8583233
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8583718 acgtttcatccaaattcttttctgttctactataacaatggcaggtcatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 8583619  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583618 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 8583519  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8583518 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 8583419  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||           
T  8583418 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtctagaatttttaagatcaatcaacctgttagtagtatattatctaatagtcttttttt 8583319  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatg--nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8583318 tgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttttcggttgatttataa-tgtacttttgtttttgagatttttttgtctgt 8583233  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3435680 - 3435294
Alignment:
Q  41 tttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcactt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3435680 tttcttccaaattctcttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttacactt 3435581  T
Q  141 ttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435580 ttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatca 3435481  T
Q  241 caactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacg 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  3435480 caactttacgttcattgctattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaaca 3435381  T
Q  341 taacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaata 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3435380 taacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttcaggatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaata 3435294  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Original strand, 42315247 - 42315640
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42315247 acgtttctttcaaattcttttctattctactgtaacaatgacaggttatatattttgttttgcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 42315346  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42315347 cttttcttaacataacttttacgttcaataaaaaaaaagaacgtattgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaa 42315446  T
Q  237 atcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42315447 atcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaact 42315546  T
Q  337 aacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42315547 aacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgttgagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtgtattatctaatagtc 42315640  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 7820424 - 7820753
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7820424 acgtttcttccaaattcttttatgttctactataacaatgacaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 7820523  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7820524 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaaagtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 7820623  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7820624 tcacaactttaagttcattggtattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 7820723  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttatttt 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7820724 acataacttatttttaggtctatttatttt 7820753  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 220 - 430
Target Start/End: Original strand, 56398552 - 56398770
Alignment:
Q  220 atcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctac-------atgtaacatgcatttttcaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  56398552 atcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgtaacatgcatttttcaa 56398651  T
Q  313 -tcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagt 411  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  56398652 atcaaattattataatcaataaactaacgtaacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtcctgaatttttaagatcaatcaacctgctagt 56398751  T
Q  412 agtatattatctaatagtc 430  Q
    |||||||||||||||||||    
T  56398752 agtatattatctaatagtc 56398770  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 56397783 - 56397973
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  56397783 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgcaacaatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaatttgca 56397882  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaatta 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56397883 cttttcttaatataatttttacgttcattaaaaaaaagaacgtactgtataatgttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaatta 56397973  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Original strand, 44930254 - 44930382
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44930254 acgtttcttccaaattcttttctgttctactataacaatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 44930353  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcatt 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44930354 cttttcttaatataacttttacgttcatt 44930382  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 264 - 367
Target Start/End: Original strand, 7808724 - 7808827
Alignment:
Q  264 taataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctattta 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7808724 taataatttttctacttgcatttttctacttgtaacatgcatttgtcaatcaaattattataatcaataaagtaacgtcacttatttttaggtctattta 7808823  T
Q  364 tttt 367  Q
    ||||    
T  7808824 tttt 7808827  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Original strand, 44930371 - 44930472
Alignment:
Q  245 tttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaac 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44930371 tttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacttataacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataac 44930470  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  44930471 tt 44930472  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3435133 - 3435050
Alignment:
Q  439 gaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3435133 gaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtgcttttgtttttgagattttttgatctgt 3435050  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 512
Target Start/End: Original strand, 7820756 - 7820792
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7820756 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 7820792  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 512
Target Start/End: Original strand, 42315672 - 42315708
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42315672 cggttgatttataattgtacttttgtttttgagattt 42315708  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 512
Target Start/End: Original strand, 56398829 - 56398865
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56398829 cggttgatttataactgtactcttgtttttgagattt 56398865  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 467
Target Start/End: Original strand, 44930476 - 44930504
Alignment:
Q  439 gaagaaatattacactcattgattcaatg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930476 gaagaaatattacactcattgattcaatg 44930504  T

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Target: chr1 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 522
Target Start/End: Original strand, 52705731 - 52706251
Alignment:
Q  4 ttgtaatactcttccaaattcttttcnnnnnnnnacgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52705731 ttgtaatactcttccaaattcattttttttttctacgtttcttccaaattcttttctgttatactgtaacaatggcagattatatattttgtttgacaaa 52705830  T
Q  104 cttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  52705831 cttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgtggttaatt 52705930  T
Q  204 tatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgc 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  52705931 taccatctacctatatatctaattattataaaaatcacaactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctataacatgc 52706030  T
Q  304 atttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaat 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  52706031 atttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaac 52706130  T
Q  404 ctgctagtagtatattatctaatagtc--nnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgt 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  52706131 ctgctagtagtttattatctaatagtcttttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgt 52706230  T
Q  502 ttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  52706231 ttttgagattttttggtctgt 52706251  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26882530 - 26882048
Alignment:
Q  41 tttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcactt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26882530 tttcttccaaattcttttctgttctactataacaatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcactt 26882431  T
Q  141 ttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26882430 ttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagactgtattgtataatcttatggttaatttaccatctacctatatatcaaattgttataaaaatca 26882331  T
Q  241 caactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  26882330 caactttacgttcattggtatgataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaagaaactaaca 26882231  T
Q  341 taacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnnnng 439  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||              
T  26882230 taacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtaggatattatctaatagtctttttttttt 26882131  T
Q  440 aagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26882130 aagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttttttgtctgt 26882048  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Original strand, 45318841 - 45319329
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45318841 acgtttcttccaaattcttttctgttatactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 45318940  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318941 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 45319040  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45319041 tcacaactttacattcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 45319140  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||           
T  45319141 acataacttatttttaggtgtatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaatttgctagtagtttattatctaatagtcttttttt 45319240  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatg---nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttg-tttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45319241 tgaagaaatattacacttattgattcaatgttttttttttccggttgatttataactgtacttttgttttttgagattttttggtctgt 45319329  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 38 - 512
Target Start/End: Original strand, 45535131 - 45535609
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45535131 acgtttcttccaaattcttttctgttttattgtaacaatggcaagatatatattttgtttggcaaatttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgta 45535230  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa----gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattata 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45535231 cttttcttaacataacatttacgttcattaaaaaaaaaaaagaacgtactgtataatcttatggttaatttatcatctacttatatatcaaattattata 45535330  T
Q  234 aaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataa 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45535331 aaaatcacaactctacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttccacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataa 45535430  T
Q  334 attaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnn 433  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||       
T  45535431 attaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtctagaatttttaagatcaatcaacctgctagtag--tattatctaatagtc-tt 45535527  T
Q  434 nnnnngaagaaatattacactcattgattcaatg---nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagattt 512  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45535528 tttttgaagtaatattacactcattgattcaatgttttttttttccgattgatttataactgtacttttgtttttgagattt 45535609  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 285 - 430
Target Start/End: Original strand, 14389005 - 14389150
Alignment:
Q  285 ttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccaga 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14389005 ttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccaga 14389104  T
Q  385 atttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14389105 atttttaagatcaatcaacctactagtagtatattatctaatagtc 14389150  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 39758313 - 39758432
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttcta--ctgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaactta-ttgtcgaaattatcatgcctctaactt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39758313 acgtttcttcaaaattcttttctgttctatactatgacgatggcaggttatatattttgtttggcaaacttgcttgtcgaaatcatcatgcctctgactt 39758412  T
Q  135 gcacttttcttaacataact 154  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  39758413 gcacttttcttaacagaact 39758432  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 39763667 - 39763786
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttcta--ctgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaactta-ttgtcgaaattatcatgcctctaactt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39763667 acgtttcttcaaaattcttttctgttctatactatgacgatggcaggttatatattttgtttggcaaacttgcttgtcgaaatcatcatgcctctgactt 39763766  T
Q  135 gcacttttcttaacataact 154  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  39763767 gcacttttcttaacagaact 39763786  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Original strand, 39758447 - 39758602
Alignment:
Q  243 actttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacat---gtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaata-aattaa 338  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  39758447 actttatgttcattgacattataataatttttctacttgcttttttcttcctataataacatgcatttttcaatcaaattattataatgaatagacttaa 39758546  T
Q  339 cgtaacttacttt----taggtctatttattttgatatcatatgtccagaattttt 390  Q
    | ||||||| |||     | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39758547 cataacttattttaatgcatgtctatttattttgatatcatatgcccataattttt 39758602  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Original strand, 39763801 - 39763956
Alignment:
Q  243 actttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacat---gtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaata-aattaa 338  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  39763801 actttatgttcattgacattataataatttttctacttgcttttttcttcctataataacatgcatttttcaatcaaattattataatgaatagacttaa 39763900  T
Q  339 cgtaacttacttt----taggtctatttattttgatatcatatgtccagaattttt 390  Q
    | ||||||| |||     | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39763901 cataacttattttaatgcatgtctatttattttgatatcatatgcccataattttt 39763956  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 517
Target Start/End: Original strand, 14389212 - 14389253
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14389212 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgg 14389253  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 290
Target Start/End: Original strand, 14387660 - 14387695
Alignment:
Q  255 ttggtattataataaattttctacttgcatttttct 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14387660 ttggtattataataatttttctacttgcatttttct 14387695  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 81490 - 81006
Alignment:
Q  40 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcact 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  81490 gtttcttctaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttgcact 81391  T
Q  140 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81390 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgttgttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatc 81291  T
Q  240 acaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaac 339  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  81290 ataactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaac 81191  T
Q  340 gtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc--nnnnnnn 437  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  81190 ataatttatttttaggtttatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttt 81091  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  81090 tgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 81006  T

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Target: scaffold0153 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 34522 - 34038
Alignment:
Q  40 gtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcact 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34522 gtttcttctaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcaaaatcatcatgcctctaacttgcact 34423  T
Q  140 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34422 tttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtaccgtataatcttgttgttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatc 34323  T
Q  240 acaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaac 339  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34322 ataactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcatttttctaccagtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaac 34223  T
Q  340 gtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc--nnnnnnn 437  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  34222 ataatttatttttaggtttatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttt 34123  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34122 tgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 34038  T

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Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 13950506 - 13950023
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13950506 acgtttctttcaaattcttttctgttctactgtaacaatggcagattatatattttgtttggcaaacttattgttgaaatcatcatgcctctaacttgca 13950407  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13950406 tttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaa-aatgtattgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 13950308  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13950307 tcacaactttacgtttattggtattataataatttttctacttgtatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaacta 13950208  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatag-tcnnnnnn 436  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |           
T  13950207 acgtaactta-ttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagcatattatctaatggttttttttt 13950109  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13950108 ttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataattgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 13950023  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3604179 - 3603790
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3604179 acgtttcttccaaattcttttttgttctactgtagcaatggcaggttatatattttgtttgacaaacttattctcgaaatcatcatgcctctaacttgca 3604080  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgt----------tcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3604079 cttttcttaacataacttttacgttcataaaagttcattaaaaaaaagaacgtattgtataatcttatggttaatttaccatctacctatatatcaaatt 3603980  T
Q  228 attataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataat 327  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||              |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3603979 attataaaaatcaaaattttacgttcattgatattataata--------------atttttctacctgtaacatgcatttttaaatcaaattattataat 3603894  T
Q  328 caataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaa-tttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaat 426  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3603893 caataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtctagaattttttaagatcaatcaacctgctagtagtacattatctaat 3603794  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 289
Target Start/End: Original strand, 40410969 - 40411220
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40410969 acgtttcttccaaattcttttctattctactgtaacaatgacaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 40411068  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40411069 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaa 40411168  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40411169 tcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttc 40411220  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 275 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11633165 - 11632918
Alignment:
Q  275 ctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11633165 ctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatca 11633066  T
Q  375 tatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnn 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||           
T  11633065 tatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttt 11632966  T
Q  475 ncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11632965 tcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 11632918  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3603729 - 3603694
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagatt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3603729 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagatt 3603694  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21154 - 20687
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21154 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggatatatattttgtttggcaaactt-ttgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 21056  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21055 cttttcttaacataacttttacgttcaataaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctgtatatcaaattattataaaaa 20956  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20955 tcacaacttttcgttcattggtattataataatttttctgcttgcatttttctaaatgcaacatgcatttttcaatcaaattataataatcaataaacta 20856  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnn 437  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  20855 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccatgatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 20756  T
Q  438 ngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttg 506  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20755 tgaagaaatattacactcattgattcaatattttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttg 20687  T

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Target: chr6 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3110038 - 3109586
Alignment:
Q  65 tactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3110038 tactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaatttattgtcgaaatcatcatgcctctgacttgcacttttcttaacataacttttacgt-ca 3109940  T
Q  165 ttaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattat 264  Q
    ||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3109939 ttaaaaaaaagaatctactatataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattat 3109840  T
Q  265 aataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttat 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3109839 aataatttttctacttgcatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttat 3109740  T
Q  365 tttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattca 464  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  3109739 tttgatatcatatatccagaatttttaaaatcaataaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattca 3109640  T
Q  465 atgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggt 518  Q
    |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3109639 atgttttttttcggttgatttataattgtacttttgtttttgagattttttggt 3109586  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 38 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 29865459 - 29864989
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29865459 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggatatatattttgtttggcaaactt-ttgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 29865361  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29865360 cttttcttaacataacttttacgttcaataaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctgtatatcaaattattataaaaa 29865261  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29865260 tcacaacttttcgttcattggtattataataatttttctgcttgcatttttctaaatgcaacatgcatttttcaatcaaattataataatcaataaacta 29865161  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnn 436  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  29865160 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccatgatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 29865061  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgag 508  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865060 ttgaagaaatattacactcattgattcaatattttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgag 29864989  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 6476421 - 6475975
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||               ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6476421 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatgccatgttatatatt---------------attgtcgaaatcatcatgcctataacttgca 6476337  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6476336 cttttcttaacataacttttacgtt-attaaaaaaaagaacgt----tataatcttgtggttaatttaccatctacctatatataaaattattataaaaa 6476242  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaatta 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6476241 tcacaactttacgttcattgatattataataatttttctacttgcattt---------------------ttcaatcaaattattataatcaataaacta 6476163  T
Q  338 acgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc-nnnnnn 436  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           
T  6476162 acataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttt 6476063  T
Q  437 nngaagaaatattacactcattgattcaatg--nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6476062 tttaagaaatattacactcattggttcaatgttttttttttcagttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 6475975  T

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Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 38 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7487865 - 7487468
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7487865 acgtttcttcaaaattcttttctgttctactgtaacaatgacagattatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaattatcatgcctcttacttgca 7487766  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataa-----gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattat 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7487765 cctttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaaaaaaagaacgtactgtataatcttatggttaatttatcatctacttatatatcaaattattat 7487666  T
Q  233 aaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7487665 aaaaatcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgcatttttcaaactgtaacctgcatttttcaatcaaattattataatcaata 7487566  T
Q  333 aattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7487565 aactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtc 7487468  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 120 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 42627037 - 42626632
Alignment:
Q  120 tcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatat 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42627037 tcatacctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctatctatat 42626938  T
Q  220 atcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaatt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626937 atcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtatcataataatttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaatt 42626838  T
Q  320 attataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatatt 419  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42626837 attataatcaataaactaacataacttatttttaattctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatatt 42626738  T
Q  420 atctaatagtc---nnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttg 516  Q
    |||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  42626737 atctaatagtctttttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttt 42626638  T
Q  517 gtctgt 522  Q
    ||||||    
T  42626637 gtctgt 42626632  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 71 - 522
Target Start/End: Original strand, 45547341 - 45547769
Alignment:
Q  71 aacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaa 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45547341 aacaatgacaggttatatattttgtttgacaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgcacttttcttaacataatttttacgttcattaaaa 45547440  T
Q  171 ataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaa 270  Q
    | ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45547441 aaaa--atgtactgtataatcttgtggttaatttaccatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataat 45547538  T
Q  271 ttttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgat 370  Q
    ||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45547539 ttttctacttgcattt---------------------ttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttattttttggtctatttattttgat 45547617  T
Q  371 atcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnn 470  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||        
T  45547618 atcatatgtcaagaatttttaagatcaatcaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatattt 45547717  T
Q  471 nnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45547718 tttttcggttgatttataaccgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 45547769  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 129 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21736290 - 21735989
Alignment:
Q  129 taacttgcacttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaatta 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736290 taacttgcatttttcttaacataacttttacgttcgttaaaaaaaagaacgtattgtataattttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaatta 21736191  T
Q  229 ttataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736190 ttataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataatttttctacttgtatttttctacctgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatc 21736091  T
Q  329 aataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatag 428  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21736090 aataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagctcaatcaacctgctagtagtatattatataatag 21735991  T
Q  429 tc 430  Q
    ||    
T  21735990 tc 21735989  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 175 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 6289126 - 6288779
Alignment:
Q  175 gaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaatcacaactttacgttcattggtattataataaatttt 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6289126 gaacgtactgtataatcttgtggttaacttaccatctacctatatgtcaaattattataaaaatcacaactttacgttctttggtattataataattttt 6289027  T
Q  275 ctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6289026 ctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatca 6288927  T
Q  375 tatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtcnnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatgnnnnnnn 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||           
T  6288926 tatgtccagaatttttaagatcaattaacctgctagtagtatattatctaatagtcttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttt 6288827  T
Q  475 ncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttggtctgt 522  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6288826 tcggttgatttataattgtacttttgtttttgagattttttggtctgt 6288779  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 262
Target Start/End: Original strand, 29941325 - 29941549
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctctaacttgca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29941325 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcatgttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaatcatcatgcctctaacttgca 29941424  T
Q  138 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941425 cttttcttaacataacttttacgttcattaaaaaaaagaatgtactgtataatcttgtggttaatttacaatctacctatatatcaaattattataaaaa 29941524  T
Q  238 tcacaactttacgttcattggtatt 262  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  29941525 tcaaaattttacgttcattggtatt 29941549  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 139 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35172220 - 35172007
Alignment:
Q  139 ttttcttaacataacttttacgttcattaaaaataagaacgtattgtataatcttgtggttaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35172220 ttttcttaacataacttttacgttcattaaaaa-aagaacgtattgtataatcttgtgattaatttatcatctacctatatatcaaattattataaaaat 35172122  T
Q  239 cacaactttacgttcattggtattataataaattttctacttgcatttttctacatgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaattaa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35172121 cacaactttacgttcattggtattataataatttttctact--------------tgtaacatgcatttttcaatcaaattattataatcaataaactaa 35172036  T
Q  339 cgtaacttacttttaggtctatttatttt 367  Q
    | ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  35172035 cataacttatttttaggtctttttttttt 35172007  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 327 - 522
Target Start/End: Original strand, 29941549 - 29941753
Alignment:
Q  327 tcaataaattaacgtaacttacttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaat 426  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29941549 tcaataaactaacataacttatttttaggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaagatcaatcaacctgctaatagtatattatctaat 29941648  T
Q  427 agtc-----nnnnnnnngaagaaatattacactcattgattcaatg----nnnnnnnncggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||             |||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29941649 agtctttttttttttttgaagaaatattacactcattgattcaatgttttttttttttcggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgg 29941748  T
Q  518 tctgt 522  Q
    |||||    
T  29941749 tctgt 29941753  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6289217 - 6289127
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattgtcgaaattatcatgcctc 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6289217 acgtttattccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatatattttgtttggcaaacttattatcgaaatcatcatgcctc 6289127  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 35171832 - 35171755
Alignment:
Q  353 aggtctatttattttgatatcatatgtccagaatttttaaaatcaatcaatctgctagtagtatattatctaatagtc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35171832 aggtctatttattttgatatcatatgtccagaaattttaagattaatcaacatgccagtagtatattatctaatagtc 35171755  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21736340 - 21736289
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatggcaggttatata 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21736340 acgtttctttcaaattcttttctgttctactgtaacaatggcatgttatata 21736289  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21735927 - 21735887
Alignment:
Q  477 ggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21735927 ggttgatttataactgtacttttgtttttgagattttttgg 21735887  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 35172377 - 35172338
Alignment:
Q  38 acgtttcttccaaattcttttctgttctactgtaacaatg 77  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35172377 acgtttcttccaaattcttttatgttctactgtaacaatg 35172338  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 35171692 - 35171651
Alignment:
Q  476 cggttgatttataactgtacttttgtttttgagatttgttgg 517  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35171692 cggttaatttataattgtacttttgtttttgagattttttgg 35171651  T

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