View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1590_high_52 (Length: 311)

Name: NF1590_high_52
Description: NF1590
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1590_high_52
NF1590_high_52
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (17-156)||(12143072-12143212)
chr1 (17-156)||(7553017-7553157)
chr1 (17-156)||(23767415-23767555)
chr1 (19-156)||(49814302-49814440)
chr1 (17-156)||(19315640-19315780)
chr1 (17-156)||(38473627-38473767)
chr1 (17-156)||(41106016-41106156)
chr1 (17-156)||(46825531-46825671)
chr1 (17-157)||(19274559-19274700)
chr1 (17-156)||(7651662-7651802)
chr1 (17-156)||(28425364-28425504)
chr1 (21-156)||(49094712-49094848)
chr1 (21-156)||(45350718-45350852)
chr1 (19-156)||(25988272-25988410)
chr1 (17-156)||(16705870-16706010)
chr1 (17-156)||(33325727-33325867)
chr1 (17-156)||(36157679-36157818)
chr1 (17-157)||(50533383-50533524)
chr1 (17-156)||(23228195-23228335)
chr1 (17-156)||(26549388-26549528)
chr1 (17-156)||(33674017-33674157)
chr1 (17-156)||(46051450-46051590)
chr1 (17-156)||(50689943-50690083)
chr1 (19-156)||(36781173-36781311)
chr1 (17-156)||(7608767-7608907)
chr1 (21-156)||(9878785-9878921)
chr1 (21-156)||(9962755-9962891)
chr1 (21-156)||(26069896-26070032)
chr1 (17-154)||(24204474-24204612)
chr1 (21-156)||(45670487-45670623)
chr1 (17-156)||(18892329-18892469)
chr1 (21-156)||(48669397-48669533)
chr1 (17-156)||(48802332-48802472)
chr1 (21-155)||(41982237-41982372)
chr1 (17-121)||(12964646-12964750)
chr1 (21-156)||(37216900-37217036)
chr1 (17-156)||(46095076-46095216)
chr1 (17-156)||(52146993-52147133)
chr1 (22-156)||(5400876-5401010)
chr1 (21-185)||(34971084-34971258)
chr1 (21-126)||(48319078-48319183)
chr1 (17-156)||(6711440-6711580)
chr1 (21-156)||(8141487-8141623)
chr1 (17-156)||(17983899-17984039)
chr1 (21-156)||(21965069-21965205)
chr1 (17-133)||(33194676-33194792)
chr1 (17-156)||(43396675-43396815)
chr1 (17-156)||(52067652-52067792)
chr1 (17-156)||(52349925-52350065)
chr1 (21-156)||(18782090-18782226)
chr1 (21-138)||(9974846-9974963)
chr1 (17-156)||(40721342-40721483)
chr1 (21-133)||(16506813-16506925)
chr1 (17-156)||(18917524-18917664)
chr1 (17-133)||(30281631-30281747)
chr1 (22-156)||(33714362-33714495)
chr1 (22-156)||(21929526-21929666)
chr1 (21-156)||(25800648-25800781)
chr1 (17-95)||(50099220-50099298)
chr1 (72-156)||(44978769-44978854)
chr1 (17-65)||(44979281-44979329)
chr1 (17-61)||(32373650-32373694)
chr1 (19-61)||(17989864-17989906)
chr1 (17-47)||(49973942-49973972)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (17-156)||(47281125-47281265)
chr7 (17-156)||(1469494-1469634)
chr7 (17-156)||(47271981-47272121)
chr7 (17-157)||(44544409-44544550)
chr7 (17-157)||(47219145-47219286)
chr7 (17-156)||(35600123-35600263)
chr7 (17-156)||(38427564-38427704)
chr7 (21-157)||(33884323-33884460)
chr7 (17-156)||(31684135-31684275)
chr7 (17-156)||(47294292-47294432)
chr7 (17-152)||(8162717-8162853)
chr7 (17-156)||(11476557-11476697)
chr7 (17-156)||(23842305-23842445)
chr7 (17-156)||(27364340-27364480)
chr7 (17-156)||(30798369-30798509)
chr7 (17-156)||(30876259-30876399)
chr7 (17-156)||(40851274-40851414)
chr7 (17-156)||(48628805-48628945)
chr7 (21-156)||(37393999-37394135)
chr7 (30-156)||(2960641-2960768)
chr7 (22-156)||(7336065-7336199)
chr7 (21-152)||(4923220-4923352)
chr7 (17-156)||(41113377-41113517)
chr7 (17-156)||(42979339-42979479)
chr7 (17-156)||(43752777-43752917)
chr7 (17-156)||(45723492-45723632)
chr7 (17-133)||(3797548-3797664)
chr7 (21-156)||(11050262-11050398)
chr7 (17-156)||(30971942-30972082)
chr7 (17-125)||(41139445-41139553)
chr7 (17-156)||(43968260-43968400)
chr7 (40-156)||(221298-221415)
chr7 (17-156)||(29248342-29248482)
chr7 (21-152)||(44800415-44800547)
chr7 (17-152)||(47579091-47579228)
chr7 (17-133)||(27774108-27774224)
chr7 (21-133)||(37354288-37354400)
chr7 (17-156)||(47119991-47120133)
chr7 (21-156)||(18353148-18353284)
chr7 (17-110)||(40520918-40521011)
chr7 (17-77)||(39034062-39034122)
chr7 (105-156)||(42888937-42888989)
chr7 (17-60)||(43025112-43025155)
chr7 (17-66)||(29739781-29739829)
chr7 (29-68)||(12583313-12583352)
chr7 (102-156)||(5106127-5106181)
chr7 (182-211)||(34378514-34378543)
chr7 (17-61)||(29739670-29739713)
chr7 (182-210)||(44551065-44551093)
chr7 (182-214)||(44800705-44800737)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (17-156)||(6739956-6740096)
chr5 (21-156)||(14717609-14717745)
chr5 (17-156)||(27457198-27457338)
chr5 (17-156)||(31710282-31710422)
chr5 (19-152)||(39002030-39002164)
chr5 (17-157)||(30863253-30863394)
chr5 (17-156)||(3352003-3352143)
chr5 (17-156)||(8215900-8216040)
chr5 (17-156)||(30297750-30297890)
chr5 (17-156)||(35342180-35342320)
chr5 (17-156)||(38964115-38964254)
chr5 (17-156)||(39824556-39824696)
chr5 (17-152)||(40074950-40075086)
chr5 (17-157)||(41282342-41282483)
chr5 (17-156)||(4015875-4016015)
chr5 (17-156)||(8689572-8689712)
chr5 (17-156)||(11000729-11000869)
chr5 (21-156)||(14952328-14952464)
chr5 (17-156)||(16095961-16096100)
chr5 (17-156)||(20079259-20079399)
chr5 (17-156)||(26593281-26593421)
chr5 (17-156)||(33760471-33760611)
chr5 (12-156)||(23128914-23129059)
chr5 (17-156)||(6251972-6252112)
chr5 (21-156)||(6600137-6600273)
chr5 (17-156)||(11692148-11692288)
chr5 (17-156)||(19659502-19659642)
chr5 (17-156)||(30208403-30208543)
chr5 (17-152)||(42993518-42993654)
chr5 (17-152)||(43166274-43166410)
chr5 (17-133)||(16752116-16752232)
chr5 (21-156)||(20408537-20408673)
chr5 (25-152)||(1052541-1052669)
chr5 (17-156)||(28078406-28078546)
chr5 (17-119)||(6331377-6331479)
chr5 (21-156)||(19398194-19398330)
chr5 (17-133)||(26035371-26035487)
chr5 (21-156)||(27116100-27116236)
chr5 (21-156)||(11935450-11935585)
chr5 (17-152)||(8694866-8695002)
chr5 (25-133)||(444962-445070)
chr5 (17-156)||(27509978-27510111)
chr5 (230-294)||(20509227-20509288)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (17-156)||(33151696-33151836)
chr3 (17-156)||(1017044-1017184)
chr3 (21-156)||(1687655-1687791)
chr3 (17-156)||(20813442-20813582)
chr3 (21-156)||(35346472-35346608)
chr3 (17-156)||(38446476-38446616)
chr3 (17-156)||(51562162-51562302)
chr3 (22-156)||(21890175-21890310)
chr3 (22-156)||(42016878-42017013)
chr3 (17-156)||(20086315-20086455)
chr3 (17-156)||(20760072-20760212)
chr3 (17-156)||(21564496-21564636)
chr3 (17-156)||(21656518-21656658)
chr3 (17-156)||(31122662-31122802)
chr3 (17-130)||(19268521-19268634)
chr3 (17-156)||(26455582-26455722)
chr3 (21-156)||(32650821-32650957)
chr3 (17-152)||(36314977-36315113)
chr3 (17-152)||(41250886-41251022)
chr3 (17-156)||(47329176-47329316)
chr3 (21-156)||(10618481-10618617)
chr3 (17-152)||(19664541-19664677)
chr3 (17-156)||(29677476-29677616)
chr3 (17-156)||(37247956-37248096)
chr3 (17-156)||(42107100-42107240)
chr3 (21-156)||(50287570-50287706)
chr3 (17-156)||(53196014-53196154)
chr3 (17-151)||(22851996-22852131)
chr3 (17-149)||(12748391-12748524)
chr3 (17-156)||(44798268-44798407)
chr3 (19-156)||(3697148-3697286)
chr3 (19-133)||(50977866-50977980)
chr3 (19-133)||(51080998-51081112)
chr3 (17-126)||(1448764-1448873)
chr3 (17-156)||(27070740-27070880)
chr3 (17-156)||(35608132-35608272)
chr3 (21-156)||(40922166-40922302)
chr3 (17-156)||(48651248-48651388)
chr3 (17-156)||(52821050-52821190)
chr3 (17-156)||(53925980-53926120)
chr3 (19-156)||(20913755-20913893)
chr3 (19-156)||(20921873-20922011)
chr3 (17-133)||(50364912-50365028)
chr3 (21-133)||(51475271-51475383)
chr3 (17-152)||(55164120-55164256)
chr3 (17-156)||(33473240-33473380)
chr3 (17-117)||(28699685-28699785)
chr3 (17-156)||(39069726-39069866)
chr3 (17-156)||(45380261-45380401)
chr3 (19-133)||(34019462-34019576)
chr3 (17-94)||(44152700-44152777)
chr3 (32-152)||(38924003-38924124)
chr3 (48-123)||(42641213-42641288)
chr3 (17-81)||(47473230-47473294)
chr3 (116-156)||(44152772-44152813)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (17-157)||(6503718-6503859)
chr6 (17-156)||(3408189-3408329)
chr6 (19-156)||(2390267-2390405)
chr6 (17-152)||(1915348-1915484)
chr6 (17-156)||(2707459-2707599)
chr6 (17-156)||(9382519-9382659)
chr6 (17-156)||(10256237-10256377)
chr6 (17-156)||(8178250-8178390)
chr6 (17-156)||(12626636-12626776)
chr6 (21-156)||(17428273-17428409)
chr6 (17-156)||(26230933-26231073)
chr6 (21-156)||(26393010-26393146)
chr6 (17-156)||(29050272-29050412)
chr6 (21-156)||(30379021-30379157)
chr6 (21-156)||(17943040-17943176)
chr6 (17-156)||(3258808-3258948)
chr6 (21-156)||(16193314-16193450)
chr6 (28-156)||(2598100-2598229)
chr6 (17-156)||(11133873-11134014)
chr6 (21-156)||(1077241-1077377)
chr6 (17-133)||(26936607-26936723)
chr6 (32-138)||(35223919-35224025)
chr6 (21-156)||(26196322-26196458)
chr6 (17-156)||(6785102-6785239)
chr6 (71-156)||(31375971-31376057)
chr6 (21-156)||(25820550-25820686)
chr6 (21-156)||(10931149-10931288)
chr6 (100-156)||(12612972-12613029)
chr6 (79-156)||(12612849-12612927)
chr6 (182-211)||(3408395-3408424)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (17-156)||(2533272-2533412)
chr8 (17-156)||(3875908-3876048)
chr8 (21-156)||(37933646-37933782)
chr8 (22-156)||(15847117-15847252)
chr8 (19-156)||(35884431-35884569)
chr8 (17-156)||(513308-513447)
chr8 (17-156)||(1293486-1293626)
chr8 (17-156)||(35443311-35443451)
chr8 (17-156)||(36400071-36400211)
chr8 (21-156)||(38107103-38107239)
chr8 (17-156)||(22683989-22684129)
chr8 (17-156)||(43806534-43806674)
chr8 (21-156)||(259982-260117)
chr8 (21-156)||(655804-655939)
chr8 (21-156)||(841539-841674)
chr8 (17-133)||(7434886-7435002)
chr8 (17-152)||(9056343-9056479)
chr8 (17-156)||(28707447-28707587)
chr8 (17-156)||(38633711-38633851)
chr8 (17-156)||(28496356-28496495)
chr8 (17-156)||(23972296-23972437)
chr8 (21-156)||(38208756-38208893)
chr8 (32-156)||(41536528-41536653)
chr8 (17-133)||(23935233-23935349)
chr8 (17-157)||(39513339-39513480)
chr8 (21-156)||(440844-440980)
chr8 (17-133)||(12010549-12010665)
chr8 (17-156)||(33651841-33651981)
chr8 (21-156)||(40301894-40302030)
chr8 (17-156)||(24430572-24430712)
chr8 (17-133)||(29485287-29485402)
chr8 (17-156)||(42988228-42988367)
chr8 (21-156)||(4649154-4649290)
chr8 (17-156)||(13797089-13797228)
chr8 (21-156)||(36218782-36218917)
chr8 (19-133)||(6016207-6016321)
chr8 (17-95)||(24193356-24193433)
chr8 (93-156)||(24193131-24193195)
chr8 (23-82)||(8137180-8137239)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (17-156)||(4544986-4545126)
chr4 (17-156)||(11795155-11795295)
chr4 (17-156)||(42273802-42273942)
chr4 (17-156)||(15985010-15985150)
chr4 (17-156)||(28264643-28264783)
chr4 (17-156)||(31973591-31973731)
chr4 (17-156)||(33807781-33807921)
chr4 (17-156)||(55517186-55517326)
chr4 (19-156)||(8882014-8882152)
chr4 (19-156)||(24458632-24458770)
chr4 (19-156)||(26017425-26017563)
chr4 (18-158)||(33174019-33174160)
chr4 (17-156)||(12196469-12196609)
chr4 (21-156)||(23135007-23135143)
chr4 (17-156)||(28159954-28160094)
chr4 (17-156)||(31591076-31591215)
chr4 (21-156)||(32317957-32318093)
chr4 (17-156)||(40988633-40988773)
chr4 (17-156)||(48707734-48707874)
chr4 (22-156)||(49118616-49118751)
chr4 (19-156)||(2055280-2055418)
chr4 (17-157)||(32118714-32118855)
chr4 (20-156)||(48149502-48149639)
chr4 (17-156)||(5227390-5227530)
chr4 (17-152)||(19496107-19496243)
chr4 (17-156)||(28812288-28812427)
chr4 (17-156)||(35930040-35930179)
chr4 (17-156)||(39995168-39995308)
chr4 (22-156)||(44490324-44490459)
chr4 (17-156)||(9339124-9339267)
chr4 (17-156)||(17847097-17847236)
chr4 (21-156)||(30467004-30467140)
chr4 (17-156)||(39700045-39700185)
chr4 (17-133)||(24623148-24623264)
chr4 (21-156)||(25734224-25734360)
chr4 (21-156)||(48551765-48551901)
chr4 (17-155)||(10588580-10588719)
chr4 (19-157)||(37381848-37381987)
chr4 (17-156)||(14564796-14564936)
chr4 (21-156)||(23553069-23553204)
chr4 (17-156)||(30141109-30141249)
chr4 (17-156)||(50542355-50542495)
chr4 (17-156)||(51371048-51371188)
chr4 (17-156)||(17993018-17993158)
chr4 (17-133)||(19168820-19168936)
chr4 (17-156)||(33693334-33693474)
chr4 (19-156)||(50276139-50276274)
chr4 (17-156)||(31208748-31208884)
chr4 (17-156)||(22298517-22298658)
chr4 (21-156)||(25730244-25730380)
chr4 (17-133)||(42549647-42549762)
chr4 (17-98)||(56555200-56555281)
chr4 (77-156)||(20534225-20534305)
chr4 (155-185)||(31973751-31973781)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (17-156)||(16246194-16246334)
chr2 (17-156)||(27328584-27328724)
chr2 (17-156)||(33865268-33865408)
chr2 (17-156)||(921022-921162)
chr2 (17-156)||(28650427-28650567)
chr2 (17-156)||(40854609-40854749)
chr2 (17-151)||(771981-772116)
chr2 (17-157)||(36211046-36211187)
chr2 (17-156)||(7378963-7379103)
chr2 (17-156)||(11949427-11949567)
chr2 (17-156)||(34253142-34253282)
chr2 (17-156)||(41500503-41500643)
chr2 (20-156)||(2056929-2057066)
chr2 (17-157)||(17134229-17134370)
chr2 (17-156)||(9276574-9276714)
chr2 (21-156)||(37838301-37838437)
chr2 (19-156)||(7297235-7297373)
chr2 (17-157)||(36444228-36444369)
chr2 (17-156)||(1106560-1106700)
chr2 (17-152)||(2456010-2456146)
chr2 (17-156)||(12759751-12759890)
chr2 (17-156)||(19180422-19180561)
chr2 (21-152)||(25087801-25087933)
chr2 (17-156)||(33106970-33107110)
chr2 (19-152)||(2314980-2315114)
chr2 (17-150)||(3430631-3430765)
chr2 (17-156)||(8899682-8899821)
chr2 (17-156)||(37732194-37732334)
chr2 (17-156)||(38751048-38751188)
chr2 (17-156)||(42629962-42630102)
chr2 (17-156)||(43249413-43249553)
chr2 (17-156)||(2094411-2094551)
chr2 (17-133)||(8396576-8396692)
chr2 (17-152)||(29737748-29737884)
chr2 (21-133)||(37654112-37654224)
chr2 (21-156)||(17484551-17484687)
chr2 (18-156)||(45124120-45124259)
chr2 (17-118)||(41178059-41178160)
chr2 (17-133)||(19916012-19916128)
chr2 (66-156)||(14630663-14630754)
chr2 (71-156)||(23671812-23671898)
chr2 (18-156)||(9331757-9331896)
chr2 (17-69)||(23672962-23673014)
chr2 (182-221)||(17134435-17134474)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (17-156)||(218885-219026)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (17-156)||(114-254)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (21-156)||(5028-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (22-156)||(47967-48102)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (21-156)||(5190-5325)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (17-133)||(1998-2114)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (17-156)||(252439-252579)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (21-139)||(11362-11480)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (21-156)||(13099-13235)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (21-156)||(59609-59745)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (77-156)||(599-679)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (77-156)||(1914-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (77-156)||(3372-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (77-156)||(1877-1957)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (17-69)||(290-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (17-67)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 12143072 - 12143212
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12143072 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12143171  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12143172 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12143212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7553157 - 7553017
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7553017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23767555 - 23767415
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 23767415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 49814302 - 49814440
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814302 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 49814401  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49814402 caactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgatt 49814440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 19315640 - 19315780
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 19315780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38473767 - 38473627
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 38473627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 41106016 - 41106156
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 41106156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 46825531 - 46825671
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46825531 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46825630  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46825631 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 46825671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 19274559 - 19274700
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattt 19274700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 7651662 - 7651802
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7651662 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 7651761  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7651762 atcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7651802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28425504 - 28425364
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgatt 28425364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49094848 - 49094712
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094848 cattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 49094749  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49094748 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 49094712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45350852 - 45350718
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45350852 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattacca 45350753  T
Q  121 actatgttatctagaatagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  45350752 actatgttatctacaatag-gttgtttgaaacgatt 45350718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25988410 - 25988272
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25988410 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 25988311  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25988310 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 25988272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 16705870 - 16706010
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgatt 16706010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 33325727 - 33325867
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33325867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36157818 - 36157679
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36157818 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
     |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36157718 -ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 36157679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 50533383 - 50533524
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgattt 50533524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23228335 - 23228195
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgatt 23228195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 26549388 - 26549528
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgatt 26549528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 33674017 - 33674157
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgatt 33674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 46051450 - 46051590
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgatt 46051590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 50689943 - 50690083
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 50690083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36781311 - 36781173
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36781311 agcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36781212  T
Q  119 caactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36781211 caactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgatt 36781173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7608907 - 7608767
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 7608767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9878921 - 9878785
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878921 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9878822  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9878821 actattttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 9878785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 9962755 - 9962891
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962755 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9962854  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
T  9962855 actatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgatt 9962891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 26069896 - 26070032
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26069896 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattacca 26069995  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26069996 actatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 26070032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24204612 - 24204474
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacga 154  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45670623 - 45670487
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45670623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 45670525  T
Q  120 aactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45670524 aactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 45670487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 18892329 - 18892469
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 18892469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48669533 - 48669397
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48669533 cattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcacca 48669434  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48669433 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 48669397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48802472 - 48802332
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48802472 agagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 48802373  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48802372 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 48802332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41982372 - 41982237
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  41982372 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatca 41982273  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgat 155  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  41982272 actatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgat 41982237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 12964646 - 12964750
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  117 accaa 121  Q
    |||||    
T  12964746 accaa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 37216900 - 37217036
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37216900 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 37216999  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37217000 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37217036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46095216 - 46095076
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  46095216 agagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 46095117  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46095116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 46095076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 52146993 - 52147133
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgatt 52147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 5400876 - 5401010
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5400876 attatccaccatttg-catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 5400974  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  5400975 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaaagatt 5401010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 34971084 - 34971258
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  34971084 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattacca 34971183  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacga---------tttggaacttttgaaacttaaaggatcactt 185  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34971184 actatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattcaaaaactttgggacttttgaaacttaaaggatcactt 34971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48319183 - 48319078
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48319183 cattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 48319084  T
Q  121 actatg 126  Q
    ||||||    
T  48319083 actatg 48319078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 6711440 - 6711580
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711440 agagcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6711539  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6711540 accaactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgatt 6711580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8141623 - 8141487
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8141623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaa 8141524  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8141523 attatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 8141487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17984039 - 17983899
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17984039 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17983940  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||||||||||| || | || |||||| |||||||||||    
T  17983939 acaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgatt 17983899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 21965069 - 21965205
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21965069 cattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattacca 21965168  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21965169 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 21965205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33194792 - 33194676
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  33194692 accaactatgctatcta 33194676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 43396675 - 43396815
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | ||||| || |||||| | || || |||||||||||||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgatt 43396815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52067792 - 52067652
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52067792 agagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaatt 52067693  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || || ||||  ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  52067692 acaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 52067652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52350065 - 52349925
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgatt 52349925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18782226 - 18782090
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18782226 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatca 18782127  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18782126 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgatt 18782090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 9974846 - 9974963
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9974846 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 9974945  T
Q  121 actatgttatctagaata 138  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  9974946 actatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 40721342 - 40721483
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggg-ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgatt 40721483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16506925 - 16506813
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16506925 cattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattacca 16506826  T
Q  121 actatgttatcta 133  Q
    |||||| ||||||    
T  16506825 actatgctatcta 16506813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 18917524 - 18917664
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18917524 agagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaatt 18917623  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |  || |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  18917624 attaaatatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 18917664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 30281631 - 30281747
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  30281731 accaactatgctatcta 30281747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33714495 - 33714362
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33714495 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtggtg-ttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 33714398  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  33714397 ctatgttatctacaataggatttgtttgaaacgatt 33714362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 21929526 - 21929666
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtacc-------aaagatgagttcaaggaagcaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  21929526 attatccaccatttgccat--ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaa 21929623  T
Q  115 ttaccaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21929624 ttaccaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 21929666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 25800648 - 25800781
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtacca----aagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25800648 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaatt 25800741  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25800742 accaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 25800781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Original strand, 50099220 - 50099298
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || || |||||||||||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaaaagtcatatttggtaccaaa 50099298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44978854 - 44978769
Alignment:
Q  72 ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  44978854 ttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgatt 44978769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 44979329 - 44979281
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 32373694 - 32373650
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17989906 - 17989864
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 61  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17989906 agcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 47
Target Start/End: Original strand, 49973942 - 49973972
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973942 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaa 49973972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47281265 - 47281125
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47281265 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47281166  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47281165 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1469634 - 1469494
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1469494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 47271981 - 47272121
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47272121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 44544409 - 44544550
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 44544550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 47219145 - 47219286
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 47219286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35600263 - 35600123
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35600263 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35600164  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35600163 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 35600123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38427704 - 38427564
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 38427564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 33884323 - 33884460
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884323 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 33884422  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33884423 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattt 33884460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31684275 - 31684135
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31684135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47294432 - 47294292
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47294292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8162853 - 8162717
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8162853 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaatt 8162754  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8162753 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8162717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11476697 - 11476557
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11476557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 23842305 - 23842445
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 23842445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27364480 - 27364340
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27364480 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 27364381  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  27364380 accaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgatt 27364340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30798509 - 30798369
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798509 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30798410  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  30798409 accaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgatt 30798369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 30876259 - 30876399
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgatt 30876399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 40851274 - 40851414
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgatt 40851414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 48628805 - 48628945
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 48628945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37394135 - 37393999
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37394135 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactacca 37394036  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37394035 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37393999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2960768 - 2960641
Alignment:
Q  30 ccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgtta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2960768 ccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgcta 2960669  T
Q  130 tctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2960668 tctacaataggacttgtttgaaacgatt 2960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 7336065 - 7336199
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7336065 attattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaa 7336164  T
Q  122 ctatgttatctagaatagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7336165 ctatgctatctacaatagaactgtttgaaacgatt 7336199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 4923220 - 4923352
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4923220 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 4923319  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  4923320 actatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 41113377 - 41113517
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41113377 agagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 41113476  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  41113477 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 41113517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42979479 - 42979339
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgatt 42979339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43752917 - 43752777
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 43752777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45723632 - 45723492
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || || |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 45723492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3797664 - 3797548
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    | |||||||| ||||||    
T  3797564 atcaactatgctatcta 3797548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11050398 - 11050262
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11050398 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattacca 11050299  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11050298 aatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11050262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30972082 - 30971942
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 30971942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41139553 - 41139445
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  117 accaactat 125  Q
    |||||||||    
T  41139453 accaactat 41139445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43968400 - 43968260
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 43968260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Original strand, 221298 - 221415
Alignment:
Q  40 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata- 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||     
T  221298 tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatag 221397  T
Q  139 gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||    
T  221398 gacttgtttgaaacgatt 221415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248482
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  29248342 agagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 29248441  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  29248442 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaatgatt 29248482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44800547 - 44800415
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44800547 cattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattacca 44800448  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  44800447 actatgttatctacaacaggacttgtttgaaac 44800415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47579228 - 47579091
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagc-aat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaac 47579091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 27774108 - 27774224
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27774108 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaatt 27774207  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  27774208 accaactatgctatcta 27774224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37354400 - 37354288
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37354400 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 37354301  T
Q  121 actatgttatcta 133  Q
    |||||| ||||||    
T  37354300 actatgctatcta 37354288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 47119991 - 47120133
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  117 accaac--tatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||  |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgatt 47120133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 18353148 - 18353284
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  18353148 cattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattacca 18353247  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  18353248 actatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgatt 18353284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 40520918 - 40521011
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40520918 agagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 39034062 - 39034122
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttagga 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034062 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 156
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888989
Alignment:
Q  105 aaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42888989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 43025112 - 43025155
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 60  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025112 agagcaatatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaatt 43025155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 29739781 - 29739829
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 66  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29739781 agagcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 12583313 - 12583352
Alignment:
Q  29 accatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 68  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12583313 accatttttcatgcgtaaaaagatgactaattttaagtgg 12583352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106181
Alignment:
Q  102 ttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaatagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    ||||||||||||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataagaatgtttgaaacgatt 5106181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34378543 - 34378514
Alignment:
Q  182 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34378543 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacc 34378514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 29739670 - 29739713
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 61  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  29739670 agagcattatccaccatttaccatgcct-aaaagatgactaattt 29739713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 210
Target Start/End: Original strand, 44551065 - 44551093
Alignment:
Q  182 acttaaaaggacctttaaatgcatttgac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44551065 acttaaaaggacctttaaatgcatttgac 44551093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 214
Target Start/End: Original strand, 44800705 - 44800737
Alignment:
Q  182 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacctaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44800705 acttaaaaggacatttaaatgcatttgacctaa 44800737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6740096 - 6739956
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6739956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 14717609 - 14717745
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717609 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14717708  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14717709 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 14717745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27457338 - 27457198
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 27457198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 31710282 - 31710422
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgatt 31710422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39002164 - 39002030
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 39002065  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39002064 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaac 39002030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 30863253 - 30863394
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattt 30863394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3352143 - 3352003
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 3352003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 8215900 - 8216040
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 8216040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30297890 - 30297750
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 30297750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 35342180 - 35342320
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgatt 35342320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38964254 - 38964115
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38964115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 39824556 - 39824696
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 39824696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 40074950 - 40075086
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 40075086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 41282342 - 41282483
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattt 41282483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4016015 - 4015875
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgatt 4015875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 8689572 - 8689712
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgatt 8689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11000869 - 11000729
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 14952328 - 14952464
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952328 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14952427  T
Q  121 actatgttatctagaa-tagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14952428 actatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgatt 14952464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16096100 - 16095961
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacc-aagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 16095961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20079399 - 20079259
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 20079259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26593421 - 26593281
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 26593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33760611 - 33760471
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33760471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23129059 - 23128914
Alignment:
Q  12 agcagagagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129059 agcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 23128960  T
Q  112 caattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23128959 caattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgatt 23128914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 6251972 - 6252112
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6252112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6600273 - 6600137
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600273 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 6600174  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6600173 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11692288 - 11692148
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgatt 11692148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19659642 - 19659502
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19659642 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaatt 19659543  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  19659542 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgatt 19659502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30208543 - 30208403
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgatt 30208403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 42993518 - 42993654
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaac 42993654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 43166410 - 43166274
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 43166274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 16752116 - 16752232
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  16752216 accaactatgttatcta 16752232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 20408537 - 20408673
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20408537 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattacca 20408636  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20408637 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 20408673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052669
Alignment:
Q  25 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 124  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  125 tgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaac 1052669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28078546 - 28078406
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 28078406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Original strand, 6331377 - 6331479
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  117 acc 119  Q
    |||    
T  6331477 acc 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19398330 - 19398194
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19398330 cattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattacca 19398231  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19398230 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgatt 19398194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26035487 - 26035371
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26035387 accaactatggtatcta 26035371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27116236 - 27116100
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27116236 cattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattacca 27116137  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  27116136 actatgctatctacaataggacttgtttaaaatgatt 27116100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 11935450 - 11935585
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11935450 cattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattacca 11935548  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11935549 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11935585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 8694866 - 8695002
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    | ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaac 8695002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 444962 - 445070
Alignment:
Q  25 atccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 124  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  444962 atccaccatttgccacgcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaacta 445061  T
Q  125 tgttatcta 133  Q
    || ||||||    
T  445062 tgctatcta 445070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 27509978 - 27510111
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ccttttag------tttttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  117 accaactatg-ttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  27510071 accaactatgcttat-tacaataggacttgtttgaaacgatt 27510111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20509288 - 20509227
Alignment:
Q  230 aaagcttcctatagttgaacattaatcactgtagtaattaaagtaacattctcaatatgtaactt 294  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20509288 aaagcttcctatagttgaaca---atcactatagtaatcaaagtaacattcacaatatgtaactt 20509227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 33151696 - 33151836
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33151696 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 33151795  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33151796 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33151836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 1017044 - 1017184
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1017184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 1687655 - 1687791
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687655 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1687754  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1687755 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 1687791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20813582 - 20813442
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20813582 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20813483  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  20813482 accaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 20813442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35346608 - 35346472
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346608 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 35346509  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35346508 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 35346472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 38446476 - 38446616
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38446616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 51562162 - 51562302
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51562162 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 51562261  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  51562262 accaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgatt 51562302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 21890175 - 21890310
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890175 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 21890274  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21890275 atatgttatctataataggacttgtttgaaacgatt 21890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 42016878 - 42017013
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42016878 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 42016977  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42016978 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 42017013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20086455 - 20086315
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20086455 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20086356  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20086355 accaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgatt 20086315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20760212 - 20760072
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760212 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20760113  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20760112 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 20760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 21564496 - 21564636
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 21564636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 21656518 - 21656658
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 21656658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 31122662 - 31122802
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 31122802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 19268521 - 19268634
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19268521 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 19268620  T
Q  117 accaactatgttat 130  Q
    ||||||||||||||    
T  19268621 accaactatgttat 19268634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 26455582 - 26455722
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 26455722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32650957 - 32650821
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650957 cattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 32650858  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  32650857 actatgctatctataatagaacttgtttgaaatgatt 32650821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 36315113 - 36314977
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 36314977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 41250886 - 41251022
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 41251022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47329316 - 47329176
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgatt 47329176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10618617 - 10618481
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10618617 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 10618518  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10618517 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgatt 10618481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 19664541 - 19664677
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 29677476 - 29677616
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677476 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29677575  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  29677576 acaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgatt 29677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 37247956 - 37248096
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37248096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42107240 - 42107100
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42107100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 50287570 - 50287706
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  50287570 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattacca 50287669  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50287670 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 50287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 53196014 - 53196154
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacgatt 53196154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 151
Target Start/End: Original strand, 22851996 - 22852131
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaa 151  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 12748391 - 12748524
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttga 149  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 44798268 - 44798407
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44798268 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 44798366  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44798367 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44798407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 3697148 - 3697286
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3697148 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattac 3697247  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3697248 caactatactatctacaataggacttgtttgaaaggatt 3697286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 50977866 - 50977980
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50977866 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 50977965  T
Q  119 caactatgttatcta 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  50977966 caactatgctatcta 50977980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 51080998 - 51081112
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51080998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 51081097  T
Q  119 caactatgttatcta 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  51081098 caactatgctatcta 51081112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1448873 - 1448764
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  117 accaactatg 126  Q
    ||||||||||    
T  1448773 accaactatg 1448764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27070880 - 27070740
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27070880 agagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 27070781  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27070780 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 27070740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35608272 - 35608132
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35608272 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 35608173  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  35608172 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaacgatt 35608132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40922302 - 40922166
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40922302 cattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 40922203  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40922202 actatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgatt 40922166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 48651248 - 48651388
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48651248 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 48651347  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  48651348 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 48651388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52821190 - 52821050
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52821190 agagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 52821091  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  52821090 accaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgatt 52821050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 53926120 - 53925980
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgatt 53925980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20913893 - 20913755
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20913893 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20913794  T
Q  119 caactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20913793 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 20913755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20922011 - 20921873
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20922011 agcattattcaccattcgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattat 20921912  T
Q  119 caactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20921911 caactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 20921873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50365028 - 50364912
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  50364928 accaactatgttatcta 50364912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51475383 - 51475271
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475383 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 51475284  T
Q  121 actatgttatcta 133  Q
    |||||| ||||||    
T  51475283 actatgctatcta 51475271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 55164256 - 55164120
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaac 55164120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33473380 - 33473240
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgatt 33473240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 28699685 - 28699785
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  117 a 117  Q
    |    
T  28699785 a 28699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 39069726 - 39069866
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgatt 39069866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45380401 - 45380261
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  117 a-ccaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 45380261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 34019462 - 34019576
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||     
T  34019462 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattat 34019561  T
Q  119 caactatgttatcta 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  34019562 caactatgctatcta 34019576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 44152700 - 44152777
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaa 44152777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38924124 - 38924003
Alignment:
Q  32 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatc 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38924124 atttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaattaccaactattttatc 38924025  T
Q  132 tagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    ||  ||| ||||||||||||||    
T  38924024 tacgataggacttgtttgaaac 38924003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641213
Alignment:
Q  48 aagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 123  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 42641213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 47473230 - 47473294
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagcca 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 44152772 - 44152813
Alignment:
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44152772 taccaactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgatt 44152813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 6503718 - 6503859
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattt 6503859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 3408189 - 3408329
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 3408329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 2390267 - 2390405
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390267 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2390366  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2390367 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2390405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1915484 - 1915348
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 1915348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 2707459 - 2707599
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2707599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 9382519 - 9382659
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9382519 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9382618  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  9382619 accaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgatt 9382659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 10256237 - 10256377
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 10256377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8178390 - 8178250
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8178390 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8178291  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  8178290 accaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgatt 8178250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 12626636 - 12626776
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12626776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17428409 - 17428273
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428409 cattattcaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 17428310  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17428309 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17428273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26231073 - 26230933
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26231073 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaact 26230974  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  26230973 accaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgatt 26230933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26393146 - 26393010
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393146 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 26393047  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  26393046 actatgctatctacaatagaagttttttgaaacgatt 26393010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 29050272 - 29050412
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 29050412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 30379021 - 30379157
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379021 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 30379120  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30379121 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 30379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 17943040 - 17943176
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17943040 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattacca 17943139  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  17943140 attatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 17943176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3258948 - 3258808
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  117 acc-aactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 3258808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 16193314 - 16193450
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193314 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 16193413  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  16193414 actattttatctgcattagaacttgtttgaaacgatt 16193450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2598229 - 2598100
Alignment:
Q  28 caccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  2598229 caccatttgccatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatga 2598130  T
Q  128 tatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2598129 tatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2598100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 11133873 - 11134014
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttc-aaggaagcaat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11133873 agagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaat 11133972  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  11133973 taccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgatt 11134014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 1077241 - 1077377
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077241 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1077340  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  1077341 actatgctatctacaacatgacttatttgaaacgatt 1077377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 26936607 - 26936723
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26936607 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 26936706  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26936707 atcaactatgctatcta 26936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35224025 - 35223919
Alignment:
Q  32 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatc 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35224025 atttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 35223926  T
Q  132 tagaata 138  Q
    || ||||    
T  35223925 tacaata 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26196458 - 26196322
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  26196458 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgttg-ttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattacca 26196360  T
Q  120 aactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  26196359 aactatgttatctacaataggacttggttgaaccgatt 26196322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6785239 - 6785102
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  6785239 agagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca--- 6785143  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  6785142 accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 6785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376057
Alignment:
Q  71 gttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31376057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25820686 - 25820550
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25820686 cattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattacca 25820587  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  25820586 actatgctatctacgataggaattgtttgaaacgatt 25820550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10931288 - 10931149
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgt----catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10931288 cattatccaccatttctcatgcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 10931189  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||| | | || ||||||||||| ||||||    
T  10931188 a-caactatgctatccacattaggacttgtttgatacgatt 10931149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612972
Alignment:
Q  100 agttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12612972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612849
Alignment:
Q  79 ccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 12612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 211
Target Start/End: Original strand, 3408395 - 3408424
Alignment:
Q  182 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3408395 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacc 3408424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 2533272 - 2533412
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2533412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 3875908 - 3876048
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875908 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3876007  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3876008 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 3876048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 37933646 - 37933782
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933646 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37933745  T
Q  121 actatgttatcta-gaatagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37933746 actatgctatctacgataagacttgtttgaaacgatt 37933782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847252
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 15847252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35884569 - 35884431
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884569 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35884470  T
Q  119 caactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35884469 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 35884431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 513308 - 513447
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 513447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 1293486 - 1293626
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 1293626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 35443311 - 35443451
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35443311 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35443410  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35443411 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 35443451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36400211 - 36400071
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36400211 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36400112  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36400111 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 36400071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 38107103 - 38107239
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107103 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 38107202  T
Q  121 actatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38107203 actatgctatctacaataagacttgtttgaaacgatt 38107239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22684129 - 22683989
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 22683989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43806674 - 43806534
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 43806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 259982 - 260117
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259982 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 260080  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  260081 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 260117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 655939 - 655804
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655939 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 655841  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  655840 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 841674 - 841539
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  841674 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 841576  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  841575 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 841539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 7434886 - 7435002
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  7434986 accaactatgttatcta 7435002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9056479 - 9056343
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9056479 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 9056380  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9056379 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaac 9056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28707587 - 28707447
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgatt 28707447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38633851 - 38633711
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgatt 38633711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28496495 - 28496356
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496495 agagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28496397  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28496396 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28496356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23972437 - 23972296
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccattt-gtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 115  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23972437 agagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 23972338  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23972337 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 23972296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 38208756 - 38208893
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaag-atgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38208756 cattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattacc 38208855  T
Q  120 aactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38208856 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 38208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41536653 - 41536528
Alignment:
Q  32 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41536653 atttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgctatc 41536554  T
Q  132 tagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || |||| ||||||||||||||||||    
T  41536553 tacaataggacttgtttgaaacgatt 41536528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 23935233 - 23935349
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    | |||||||| ||||||    
T  23935333 atcaactatgctatcta 23935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39513480 - 39513339
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39513480 agagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 39513381  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||    
T  39513380 accaactatgttatctacattaggacttatttgaaacaattt 39513339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 440844 - 440980
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  440844 cattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 440943  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  440944 actatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 440980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 12010549 - 12010665
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12010549 agagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatt 12010648  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12010649 accaactatgctatcta 12010665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 33651841 - 33651981
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgatt 33651981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40302030 - 40301894
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  40302030 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattacca 40301931  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  40301930 actatgctatctacaatatgacttttttgaaacgatt 40301894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24430712 - 24430572
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24430572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 29485287 - 29485402
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  29485386 accaactatgttatcta 29485402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42988367 - 42988228
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  42988367 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaatt 42988268  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    | ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  42988267 atcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgatt 42988228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 4649154 - 4649290
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4649154 cattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattacca 4649253  T
Q  121 actatgttatctagaa-tagacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  4649254 attatgctatctacaattggacttgtttgaaacgatt 4649290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 13797089 - 13797228
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacgatt 13797228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36218917 - 36218782
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36218917 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatca 36218819  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  36218818 actatattatctacatcatgacttgtttgaaacgatt 36218782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 6016207 - 6016321
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  6016207 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattac 6016306  T
Q  119 caactatgttatcta 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  6016307 caactatgctatcta 6016321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24193433 - 24193356
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaa 95  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtaccaaa 24193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193131
Alignment:
Q  93 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24193131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 8137180 - 8137239
Alignment:
Q  23 ttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccag 82  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8137180 ttatccaccatttgctatgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4545126 - 4544986
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 4544986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11795295 - 11795155
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11795295 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11795196  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11795195 accaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgatt 11795155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 42273802 - 42273942
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273802 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42273901  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42273902 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 42273942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 15985010 - 15985150
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgatt 15985150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 28264643 - 28264783
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28264783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 31973591 - 31973731
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973591 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31973690  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31973691 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 31973731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33807921 - 33807781
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 33807781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55517326 - 55517186
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55517326 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 55517227  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  55517226 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 55517186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8882152 - 8882014
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8882152 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattat 8882053  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8882052 caactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgatt 8882014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24458770 - 24458632
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24458770 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24458671  T
Q  119 caactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24458670 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 24458632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 26017425 - 26017563
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26017425 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 26017524  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26017525 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 26017563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33174160 - 33174019
Alignment:
Q  18 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33174160 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatta 33174061  T
Q  118 ccaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatttg 158  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33174060 ccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatttg 33174019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 12196469 - 12196609
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 12196609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23135143 - 23135007
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135143 cattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 23135044  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23135043 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 23135007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28160094 - 28159954
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgatt 28159954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 31591076 - 31591215
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31591215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 32317957 - 32318093
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgatt 32318093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 40988633 - 40988773
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48707874 - 48707734
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagatt 48707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 49118616 - 49118751
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49118616 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 49118715  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49118716 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 49118751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 2055280 - 2055418
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2055280 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattat 2055379  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2055380 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 2055418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 32118714 - 32118855
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattt 32118855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 48149502 - 48149639
Alignment:
Q  20 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149502 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 48149601  T
Q  120 aactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  48149602 aactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgatt 48149639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 5227390 - 5227530
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5227390 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 5227489  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5227490 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 5227530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19496243 - 19496107
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496243 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19496144  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  19496143 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaac 19496107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28812427 - 28812288
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggtg-ttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28812288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 35930040 - 35930179
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 35930179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39995308 - 39995168
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39995308 agaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 39995209  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39995208 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 39995168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 44490324 - 44490459
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44490324 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 44490423  T
Q  122 ctatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44490424 ctatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44490459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9339267 - 9339124
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaa---gatgagttcaaggaagca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  114 attaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 9339124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17847236 - 17847097
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17847097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30467140 - 30467004
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30467140 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattacca 30467041  T
Q  121 actatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30467040 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 30467004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 39700045 - 39700185
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39700045 agagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 39700144  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39700145 accaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgatt 39700185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 24623148 - 24623264
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24623248 accaactatgctatcta 24623264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25734360 - 25734224
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25734360 cattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattacca 25734261  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  25734260 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgatt 25734224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48551901 - 48551765
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48551901 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattacca 48551802  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48551801 accatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 48551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 10588580 - 10588719
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10588580 agagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 10588679  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgat 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10588680 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgat 10588719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 37381848 - 37381987
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37381848 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattac 37381947  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37381948 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgattt 37381987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 14564796 - 14564936
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 14564936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 23553069 - 23553204
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23553069 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 23553167  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  23553168 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 23553204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30141249 - 30141109
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgatt 30141109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 50542495 - 50542355
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgatt 50542355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 51371188 - 51371048
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51371188 agagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 51371089  T
Q  117 accaactatgttatctagaatag-acttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51371088 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 51371048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17993158 - 17993018
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgatt 17993018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19168936 - 19168820
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  19168836 accaactatgctatcta 19168820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33693474 - 33693334
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33693474 agagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33693375  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  33693374 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgatt 33693334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 50276274 - 50276139
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50276274 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50276178  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50276177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 50276139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 31208748 - 31208884
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31208748 agagcattatccaccatttatcatgttta----gatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31208843  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31208844 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 31208884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 22298517 - 22298658
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaa-agatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 115  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgatt 22298658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 25730244 - 25730380
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25730244 cattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattacca 25730343  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25730344 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 25730380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42549762 - 42549647
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42549762 agagcattttccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaatt 42549664  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  42549663 accaactatgttatcta 42549647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 56555281 - 56555200
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  56555281 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534305
Alignment:
Q  77 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgatt 20534305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 185
Target Start/End: Original strand, 31973751 - 31973781
Alignment:
Q  155 tttggaacttttgaaacttaaaggatcactt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31973751 tttggaacttttgaaacttaaaggatcactt 31973781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16246334 - 16246194
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 16246194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 27328584 - 27328724
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 27328724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33865408 - 33865268
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865408 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33865309  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33865308 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 33865268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 921022 - 921162
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921022 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 921121  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  921122 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 921162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28650567 - 28650427
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28650567 agagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaatt 28650468  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28650467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 28650427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 40854609 - 40854749
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40854749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 772116 - 771981
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaa 151  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 36211046 - 36211187
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaacaattt 36211187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 7378963 - 7379103
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 7379103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11949567 - 11949427
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11949567 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11949468  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11949467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 11949427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 34253142 - 34253282
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 34253282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41500643 - 41500503
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41500643 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41500544  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41500543 accaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgatt 41500503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 2056929 - 2057066
Alignment:
Q  20 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056929 gcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 2057028  T
Q  120 aactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2057029 aactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgatt 2057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 17134229 - 17134370
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattt 17134370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 9276574 - 9276714
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 9276714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 37838301 - 37838437
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37838301 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattacca 37838400  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37838401 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 37838437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7297373 - 7297235
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  7297373 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattac 7297274  T
Q  119 caactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7297273 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 7297235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36444369 - 36444228
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36444369 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36444270  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgattt 157  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  36444269 accaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgattt 36444228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1106700 - 1106560
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgatt 1106560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 2456010 - 2456146
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 2456146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12759890 - 12759751
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 12759751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 19180422 - 19180561
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180422 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19180520  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    || ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19180521 actaactatactatctacaataagacttgtttgaaacgatt 19180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25087933 - 25087801
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25087933 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatca 25087834  T
Q  121 actatgttatctagaat-agacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  25087833 actatgttatatacaataagacttgtttgaaac 25087801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33107110 - 33106970
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33107110 agagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33107011  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  33107010 accaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgatt 33106970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2315114 - 2314980
Alignment:
Q  19 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2315114 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 2315015  T
Q  119 caactatgttatctagaat-agacttgtttgaaac 152  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  2315014 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaac 2314980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3430765 - 3430631
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaa 150  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 8899682 - 8899821
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8899682 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaatt 8899781  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  8899782 accaactatgctatctacaatatgacttg-ttgaaacgatt 8899821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37732334 - 37732194
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  117 accaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgatt 37732194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 38751048 - 38751188
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgatt 38751188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 42629962 - 42630102
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42629962 agagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 42630061  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | ||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  42630062 atcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgatt 42630102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43249553 - 43249413
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  43249553 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaatt 43249454  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||    
T  43249453 accaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgatt 43249413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2094551 - 2094411
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 2094411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8396692 - 8396576
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    | |||||||| ||||||    
T  8396592 atcaactatgctatcta 8396576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 29737748 - 29737884
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaac 152  Q
    | |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaac 29737884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 37654112 - 37654224
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37654112 cattattcatcatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37654211  T
Q  121 actatgttatcta 133  Q
    |||||||||||||    
T  37654212 actatgttatcta 37654224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17484687 - 17484551
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17484687 cattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacca 17484588  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17484587 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17484551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 45124120 - 45124259
Alignment:
Q  18 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45124120 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatta 45124219  T
Q  118 ccaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  45124220 ccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgatt 45124259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 41178160 - 41178059
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41178061  T
Q  117 ac 118  Q
    ||    
T  41178060 ac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19916128 - 19916012
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  19916028 accaactatgctatcta 19916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 156
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630754
Alignment:
Q  66 tgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 14630754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23671898 - 23671812
Alignment:
Q  71 gttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23671898 gttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgatt 23671812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331896
Alignment:
Q  18 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  118 ccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgatt 9331896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23673014 - 23672962
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg 23672962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 221
Target Start/End: Original strand, 17134435 - 17134474
Alignment:
Q  182 acttaaaaggacctttaaatgcatttgacctaacaattat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17134435 acttaaaaggacctttaaatgcatttgaccaaaaaattat 17134474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 218885 - 219026
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggg-gttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  116 taccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 114 - 254
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgatt 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5164 - 5028
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5164 cattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattacca 5065  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5064 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 47967 - 48102
Alignment:
Q  22 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47967 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaa 48066  T
Q  122 ctatgttatctagaat-agacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||| || || |||  ||||||||| ||||||||    
T  48067 ctatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgatt 48102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5325
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5190 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 5288  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  5289 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgatt 5325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1998
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  117 accaactatgttatcta 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  2014 accaactatgctatcta 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 252579 - 252439
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  117 accaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgatt 252439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 11362 - 11480
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11362 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattacca 11461  T
Q  121 actatgttatctagaatag 139  Q
    |||||| || ||| |||||    
T  11462 actatgctacctacaatag 11480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 13099 - 13235
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13099 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 13198  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13199 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 13235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59609
Alignment:
Q  21 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggggttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  59745 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 59646  T
Q  121 actatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  59645 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 59609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Original strand, 599 - 679
Alignment:
Q  77 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | || ||||||||||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgatt 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1914
Alignment:
Q  77 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | || ||||||||||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgatt 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3372
Alignment:
Q  77 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgatt 3372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1957
Alignment:
Q  77 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctagaata-gacttgtttgaaacgatt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgatt 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 290
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtggg 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19831
Alignment:
Q  17 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University