View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15912_low_4 (Length: 353)

Name: NF15912_low_4
Description: NF15912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15912_low_4
NF15912_low_4
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (10-307)||(22072913-22073210)
chr7 (10-309)||(16219541-16219835)
chr7 (10-304)||(47831807-47832099)
chr7 (25-309)||(16056343-16056624)
chr7 (14-353)||(810910-811248)
chr7 (10-304)||(67745-68036)
chr7 (14-288)||(18005650-18005922)
chr7 (29-353)||(20219970-20220290)
chr7 (25-313)||(12901338-12901629)
chr7 (14-304)||(44014182-44014464)
chr7 (96-353)||(15116565-15116821)
chr7 (96-353)||(15113028-15113284)
chr7 (10-304)||(15754718-15755008)
chr7 (10-353)||(28505081-28505419)
chr7 (10-353)||(34200786-34201124)
chr7 (10-347)||(11995816-11996148)
chr7 (182-309)||(16324175-16324302)
chr7 (13-133)||(3564363-3564482)
chr7 (10-180)||(16495402-16495567)
chr7 (13-133)||(48273392-48273511)
chr7 (10-134)||(2280117-2280238)
chr7 (10-133)||(13647325-13647447)
chr7 (10-130)||(38227481-38227599)
chr7 (10-130)||(12698831-12698951)
chr7 (13-130)||(18456415-18456530)
chr7 (13-133)||(456321-456439)
chr7 (13-133)||(11972496-11972614)
chr7 (13-133)||(14949166-14949284)
chr7 (13-133)||(15376757-15376875)
chr7 (13-133)||(16232520-16232638)
chr7 (13-133)||(16410059-16410177)
chr7 (13-133)||(18640272-18640390)
chr7 (13-133)||(20385167-20385285)
chr7 (13-133)||(21189639-21189757)
chr7 (17-133)||(24275175-24275289)
chr7 (13-133)||(32125491-32125609)
chr7 (13-133)||(41522917-41523035)
chr7 (13-133)||(41525379-41525497)
chr7 (14-133)||(11393331-11393448)
chr7 (10-133)||(18430709-18430830)
chr7 (10-130)||(9509189-9509308)
chr7 (10-130)||(16386249-16386369)
chr7 (13-133)||(24702238-24702356)
chr7 (13-133)||(27216860-27216978)
chr7 (13-133)||(44116509-44116627)
chr7 (155-304)||(9389526-9389675)
chr7 (13-126)||(16213684-16213795)
chr7 (13-173)||(17061919-17062077)
chr7 (25-190)||(1867937-1868101)
chr7 (13-133)||(3386333-3386451)
chr7 (32-190)||(12255733-12255892)
chr7 (25-192)||(14044761-14044928)
chr7 (25-192)||(14354791-14354958)
chr7 (13-122)||(13869346-13869453)
chr7 (10-130)||(26211995-26212115)
chr7 (10-130)||(10589039-10589158)
chr7 (13-133)||(13831373-13831491)
chr7 (25-133)||(15144037-15144143)
chr7 (13-133)||(24704688-24704803)
chr7 (10-190)||(19486686-19486865)
chr7 (17-133)||(38898420-38898535)
chr7 (33-190)||(15008441-15008597)
chr7 (12-111)||(40443393-40443490)
chr7 (13-63)||(20110556-20110606)
chr7 (10-80)||(27847881-27847951)
chr7 (28-134)||(10063816-10063921)
chr7 (16-79)||(18154894-18154956)
chr7 (38-139)||(14036282-14036384)
chr7 (38-139)||(14346312-14346414)
chr7 (14-63)||(14932802-14932851)
chr7 (14-63)||(15356237-15356286)
chr7 (14-63)||(15360351-15360400)
chr7 (250-353)||(9177445-9177548)
chr7 (261-347)||(9751336-9751423)
chr7 (13-63)||(26356106-26356156)
chr7 (13-63)||(26358558-26358608)
chr7 (36-82)||(48991206-48991252)
chr7 (261-353)||(39267426-39267519)
chr7 (11-63)||(2832509-2832561)
chr7 (29-133)||(12756715-12756817)
chr7 (14-79)||(12187019-12187083)
chr7 (14-79)||(17138113-17138177)
chr7 (14-63)||(19649557-19649606)
chr7 (31-79)||(9177718-9177766)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (10-304)||(21329326-21329618)
chr5 (10-307)||(26011861-26012154)
chr5 (29-353)||(20026720-20027043)
chr5 (10-353)||(21501935-21502277)
chr5 (29-353)||(22177999-22178323)
chr5 (14-297)||(21565546-21565827)
chr5 (10-353)||(19660618-19660956)
chr5 (14-353)||(22959314-22959649)
chr5 (10-304)||(19668898-19669189)
chr5 (232-353)||(25743940-25744061)
chr5 (10-130)||(21729066-21729185)
chr5 (10-130)||(21808391-21808510)
chr5 (10-133)||(9077952-9078074)
chr5 (29-179)||(22144068-22144217)
chr5 (10-119)||(21997547-21997655)
chr5 (13-134)||(22412187-22412306)
chr5 (13-130)||(24529223-24529339)
chr5 (13-133)||(264812-264930)
chr5 (13-133)||(10732984-10733102)
chr5 (13-133)||(20909012-20909130)
chr5 (10-130)||(24493569-24493687)
chr5 (10-130)||(25421532-25421651)
chr5 (13-133)||(39363384-39363502)
chr5 (10-132)||(1096467-1096588)
chr5 (10-130)||(8286844-8286964)
chr5 (10-130)||(13025311-13025429)
chr5 (10-130)||(13095495-13095613)
chr5 (10-130)||(23390498-23390617)
chr5 (13-133)||(29329934-29330052)
chr5 (13-133)||(42245409-42245527)
chr5 (13-133)||(36154827-36154942)
chr5 (10-109)||(36314577-36314675)
chr5 (13-133)||(20902053-20902172)
chr5 (13-122)||(39245136-39245243)
chr5 (13-133)||(2154658-2154776)
chr5 (13-133)||(11581243-11581361)
chr5 (10-130)||(25431395-25431513)
chr5 (13-133)||(29345980-29346098)
chr5 (13-122)||(10775731-10775838)
chr5 (13-133)||(29348453-29348571)
chr5 (13-133)||(29350926-29351044)
chr5 (16-122)||(18319089-18319193)
chr5 (186-304)||(21741374-21741492)
chr5 (10-130)||(22075018-22075138)
chr5 (13-122)||(31061068-31061175)
chr5 (13-122)||(38619434-38619541)
chr5 (13-133)||(32027393-32027511)
chr5 (13-97)||(20918028-20918110)
chr5 (14-122)||(23064512-23064618)
chr5 (10-190)||(40725853-40726032)
chr5 (10-81)||(21293020-21293090)
chr5 (63-167)||(29448055-29448159)
chr5 (29-133)||(37723922-37724023)
chr5 (157-353)||(15796566-15796762)
chr5 (217-292)||(27988770-27988845)
chr5 (13-63)||(20806854-20806904)
chr5 (16-122)||(24067110-24067214)
chr5 (261-353)||(24767117-24767210)
chr5 (14-63)||(26704075-26704124)
chr5 (14-63)||(26973808-26973857)
chr5 (20-110)||(18418590-18418678)
chr5 (12-63)||(17517269-17517320)
chr5 (26-80)||(26732884-26732937)
chr5 (77-134)||(20766118-20766174)
chr5 (119-180)||(21741486-21741545)
chr5 (261-353)||(22119973-22120066)
chr5 (97-180)||(10753603-10753685)
chr5 (97-180)||(21871525-21871607)
chr5 (14-97)||(21873254-21873336)
chr5 (97-180)||(21875805-21875887)
chr5 (97-180)||(22120149-22120231)
chr5 (29-80)||(26740697-26740747)
chr5 (149-180)||(36314685-36314716)
chr5 (29-79)||(15796438-15796487)
chr5 (14-79)||(22032323-22032387)
chr5 (63-130)||(18356367-18356432)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (10-307)||(6520368-6520662)
chr8 (14-307)||(21285601-21285892)
chr8 (29-350)||(17266775-17267096)
chr8 (10-288)||(38855097-38855372)
chr8 (29-353)||(37116366-37116689)
chr8 (29-353)||(20498581-20498904)
chr8 (29-353)||(24353039-24353365)
chr8 (93-353)||(22364745-22365003)
chr8 (25-353)||(983182-983512)
chr8 (10-309)||(23760665-23760962)
chr8 (10-353)||(5866057-5866395)
chr8 (10-353)||(17140916-17141254)
chr8 (10-353)||(21490995-21491333)
chr8 (24-304)||(21673718-21673995)
chr8 (14-300)||(26355533-26355815)
chr8 (10-353)||(21249384-21249722)
chr8 (10-134)||(16092340-16092463)
chr8 (10-353)||(21255222-21255560)
chr8 (10-130)||(18818411-18818530)
chr8 (11-130)||(28649046-28649164)
chr8 (10-130)||(7372778-7372897)
chr8 (7-124)||(6759255-6759371)
chr8 (13-133)||(14409488-14409606)
chr8 (10-130)||(21919002-21919121)
chr8 (10-124)||(23406379-23406492)
chr8 (13-133)||(1484402-1484520)
chr8 (13-133)||(5853336-5853454)
chr8 (13-133)||(15203275-15203393)
chr8 (17-133)||(16413360-16413474)
chr8 (13-133)||(20403227-20403345)
chr8 (10-130)||(20536208-20536327)
chr8 (10-130)||(21923930-21924049)
chr8 (13-133)||(22001753-22001871)
chr8 (10-130)||(22626736-22626854)
chr8 (13-133)||(20046239-20046357)
chr8 (10-134)||(22875065-22875187)
chr8 (13-133)||(41598188-41598306)
chr8 (29-180)||(17439458-17439609)
chr8 (13-133)||(4483281-4483398)
chr8 (13-133)||(4542417-4542535)
chr8 (10-180)||(17612062-17612231)
chr8 (10-88)||(18879275-18879352)
chr8 (13-134)||(26219717-26219835)
chr8 (10-111)||(31971257-31971356)
chr8 (28-190)||(13508027-13508188)
chr8 (10-111)||(16199666-16199765)
chr8 (10-130)||(21395984-21396101)
chr8 (10-130)||(21790477-21790594)
chr8 (13-133)||(19896265-19896386)
chr8 (13-134)||(26225291-26225409)
chr8 (17-118)||(45290754-45290853)
chr8 (28-190)||(13597559-13597720)
chr8 (7-122)||(19937061-19937174)
chr8 (10-130)||(21389454-21389571)
chr8 (10-130)||(21778780-21778897)
chr8 (11-133)||(26223917-26224037)
chr8 (10-111)||(45131019-45131117)
chr8 (13-133)||(14823774-14823891)
chr8 (26-122)||(15070571-15070665)
chr8 (13-133)||(25484319-25484430)
chr8 (12-130)||(18678104-18678221)
chr8 (29-82)||(19154936-19154989)
chr8 (29-133)||(19801426-19801527)
chr8 (11-79)||(23648554-23648621)
chr8 (204-294)||(2418713-2418802)
chr8 (12-130)||(32121734-32121851)
chr8 (93-139)||(40492844-40492890)
chr8 (97-180)||(18862430-18862512)
chr8 (97-180)||(21383896-21383978)
chr8 (97-180)||(21387316-21387398)
chr8 (97-180)||(21411189-21411271)
chr8 (97-180)||(21805681-21805763)
chr8 (97-180)||(21827799-21827881)
chr8 (96-192)||(14103165-14103260)
chr8 (154-353)||(22419196-22419393)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-309)||(32538-32832)
scaffold0034 (29-111)||(51904-51985)
[»] chr6 (85 HSPs)
chr6 (10-305)||(23019408-23019699)
chr6 (25-353)||(19668386-19668713)
chr6 (25-353)||(9098305-9098620)
chr6 (29-353)||(23076749-23077072)
chr6 (10-353)||(20109140-20109481)
chr6 (29-353)||(35008167-35008490)
chr6 (14-304)||(19652199-19652485)
chr6 (10-353)||(28496254-28496592)
chr6 (10-353)||(29808665-29809003)
chr6 (10-353)||(22080518-22080846)
chr6 (10-304)||(1561303-1561593)
chr6 (25-190)||(25644335-25644500)
chr6 (180-307)||(27333111-27333238)
chr6 (10-109)||(27333241-27333339)
chr6 (180-307)||(27393851-27393978)
chr6 (10-109)||(27393981-27394079)
chr6 (10-133)||(29060540-29060662)
chr6 (11-133)||(30676754-30676874)
chr6 (13-173)||(22782227-22782385)
chr6 (10-130)||(16496244-16496363)
chr6 (10-130)||(17287798-17287917)
chr6 (11-138)||(18409821-18409947)
chr6 (10-133)||(25629354-25629476)
chr6 (13-133)||(12742317-12742435)
chr6 (13-133)||(18334636-18334754)
chr6 (13-133)||(19005046-19005164)
chr6 (13-133)||(19858963-19859081)
chr6 (13-133)||(24422547-24422665)
chr6 (13-133)||(25656629-25656747)
chr6 (13-133)||(33861794-33861912)
chr6 (13-133)||(33864278-33864396)
chr6 (10-133)||(20593773-20593895)
chr6 (10-124)||(20076700-20076812)
chr6 (13-133)||(2291224-2291342)
chr6 (13-133)||(8055029-8055147)
chr6 (13-133)||(25754809-25754927)
chr6 (13-133)||(26924684-26924802)
chr6 (10-133)||(19303540-19303661)
chr6 (11-133)||(34963371-34963491)
chr6 (13-133)||(1540955-1541073)
chr6 (13-133)||(1595549-1595667)
chr6 (10-130)||(20360962-20361081)
chr6 (13-133)||(20556936-20557054)
chr6 (13-133)||(25688502-25688620)
chr6 (24-309)||(4185648-4185928)
chr6 (10-111)||(20638304-20638404)
chr6 (29-287)||(18199261-18199519)
chr6 (10-130)||(22780229-22780348)
chr6 (16-122)||(16448582-16448686)
chr6 (10-190)||(8227453-8227632)
chr6 (13-133)||(3852061-3852179)
chr6 (29-287)||(18177517-18177775)
chr6 (29-287)||(18204096-18204354)
chr6 (10-72)||(25714417-25714478)
chr6 (10-82)||(16920679-16920751)
chr6 (29-133)||(18456735-18456837)
chr6 (29-133)||(18461895-18461997)
chr6 (10-82)||(35245586-35245658)
chr6 (219-353)||(23527886-23528020)
chr6 (10-78)||(22831503-22831571)
chr6 (14-309)||(31155223-31155514)
chr6 (154-236)||(28103795-28103877)
chr6 (65-309)||(4668038-4668277)
chr6 (65-309)||(4674885-4675124)
chr6 (24-114)||(4186381-4186470)
chr6 (29-111)||(18821866-18821946)
chr6 (209-287)||(23539165-23539243)
chr6 (29-73)||(11185524-11185568)
chr6 (12-63)||(19848063-19848114)
chr6 (204-287)||(17105925-17106007)
chr6 (93-192)||(18696570-18696667)
chr6 (62-190)||(18706356-18706483)
chr6 (12-63)||(23992429-23992480)
chr6 (31-82)||(33443068-33443118)
chr6 (7-51)||(19008799-19008843)
chr6 (97-180)||(22949384-22949466)
chr6 (97-180)||(22953340-22953422)
chr6 (97-180)||(23871828-23871910)
chr6 (97-180)||(23875784-23875866)
chr6 (97-180)||(27325388-27325470)
chr6 (260-309)||(4189203-4189252)
chr6 (14-63)||(18907111-18907160)
chr6 (14-63)||(19862978-19863027)
chr6 (14-63)||(19873120-19873169)
chr6 (14-79)||(21766695-21766759)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (25-353)||(12287989-12288316)
chr4 (29-353)||(53081930-53082254)
chr4 (10-304)||(39706118-39706409)
chr4 (29-350)||(46640239-46640558)
chr4 (29-353)||(13630-13953)
chr4 (14-353)||(12774011-12774339)
chr4 (10-304)||(15551817-15552105)
chr4 (48-353)||(16596686-16596986)
chr4 (25-308)||(43198380-43198661)
chr4 (14-300)||(8846360-8846660)
chr4 (119-304)||(15190424-15190607)
chr4 (25-190)||(52243136-52243302)
chr4 (119-304)||(15099457-15099640)
chr4 (13-134)||(54798752-54798872)
chr4 (10-130)||(7798774-7798893)
chr4 (10-130)||(52873369-52873488)
chr4 (13-134)||(14280316-14280435)
chr4 (13-133)||(16377522-16377639)
chr4 (10-130)||(7088877-7088996)
chr4 (10-130)||(12902757-12902876)
chr4 (13-133)||(18215318-18215436)
chr4 (13-133)||(44928923-44929042)
chr4 (13-133)||(12351-12469)
chr4 (10-130)||(7893703-7893822)
chr4 (13-133)||(15118396-15118514)
chr4 (13-133)||(44773131-44773249)
chr4 (13-133)||(52312510-52312628)
chr4 (7-133)||(19242693-19242817)
chr4 (11-133)||(19618216-19618336)
chr4 (13-133)||(1837553-1837671)
chr4 (13-133)||(3515007-3515125)
chr4 (10-130)||(16270238-16270356)
chr4 (13-133)||(18239463-18239581)
chr4 (13-133)||(44615288-44615406)
chr4 (13-133)||(50222383-50222501)
chr4 (13-133)||(51463912-51464030)
chr4 (15-133)||(14038653-14038770)
chr4 (10-103)||(3096293-3096385)
chr4 (13-126)||(23803316-23803427)
chr4 (10-130)||(6899891-6900009)
chr4 (10-130)||(16239972-16240090)
chr4 (10-130)||(44052829-44052948)
chr4 (12-130)||(22636437-22636554)
chr4 (13-134)||(8574867-8574985)
chr4 (17-122)||(15355380-15355483)
chr4 (17-130)||(23374361-23374473)
chr4 (13-133)||(44102214-44102332)
chr4 (11-133)||(14970751-14970871)
chr4 (10-82)||(17046487-17046559)
chr4 (29-111)||(6190481-6190563)
chr4 (13-72)||(7641286-7641344)
chr4 (13-72)||(12610950-12611008)
chr4 (10-111)||(14053323-14053422)
chr4 (10-122)||(15367690-15367800)
chr4 (10-122)||(15370018-15370128)
chr4 (10-122)||(15371202-15371312)
chr4 (10-122)||(15373483-15373593)
chr4 (10-122)||(15402703-15402813)
chr4 (10-122)||(16223532-16223642)
chr4 (29-133)||(21815629-21815731)
chr4 (91-137)||(15464926-15464972)
chr4 (219-353)||(16043219-16043353)
chr4 (16-122)||(20149832-20149936)
chr4 (12-133)||(22353835-22353955)
chr4 (261-353)||(22633993-22634086)
chr4 (261-353)||(13812589-13812682)
chr4 (261-353)||(13844786-13844879)
chr4 (261-353)||(24028989-24029082)
chr4 (97-180)||(630728-630810)
chr4 (97-180)||(3331970-3332052)
chr4 (97-180)||(13812763-13812845)
chr4 (97-180)||(14953915-14953997)
chr4 (97-180)||(25690146-25690228)
chr4 (202-291)||(14164739-14164827)
chr4 (11-63)||(20157527-20157579)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (25-309)||(10542-10824)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (29-353)||(6062-6386)
scaffold0420 (29-76)||(13793-13840)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (10-304)||(5952-6244)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (29-353)||(21861349-21861672)
chr1 (29-353)||(50686630-50686954)
chr1 (29-353)||(16368066-16368388)
chr1 (29-353)||(21896038-21896358)
chr1 (14-353)||(22921648-22921986)
chr1 (29-353)||(50613896-50614219)
chr1 (29-353)||(50621724-50622047)
chr1 (10-300)||(33681010-33681295)
chr1 (29-325)||(41049843-41050138)
chr1 (10-304)||(22237630-22237920)
chr1 (25-309)||(52927806-52928076)
chr1 (24-353)||(21754059-21754376)
chr1 (209-353)||(12271744-12271888)
chr1 (26-353)||(20918620-20918942)
chr1 (14-304)||(20248283-20248567)
chr1 (11-133)||(50210212-50210333)
chr1 (119-304)||(35981517-35981700)
chr1 (119-304)||(49261448-49261631)
chr1 (10-180)||(14295507-14295672)
chr1 (13-130)||(34509783-34509899)
chr1 (118-304)||(20636956-20637140)
chr1 (29-190)||(35261023-35261180)
chr1 (10-173)||(45574846-45575008)
chr1 (13-133)||(13988866-13988984)
chr1 (13-133)||(21923335-21923453)
chr1 (13-133)||(23593779-23593897)
chr1 (25-189)||(16758664-16758828)
chr1 (13-132)||(31612313-31612430)
chr1 (12-133)||(21840766-21840885)
chr1 (13-133)||(21475131-21475249)
chr1 (10-130)||(27250731-27250850)
chr1 (13-133)||(29298137-29298254)
chr1 (13-133)||(433012-433128)
chr1 (13-125)||(22123119-22123230)
chr1 (10-130)||(22532269-22532388)
chr1 (13-133)||(29776688-29776806)
chr1 (10-113)||(20847173-20847275)
chr1 (10-130)||(21026680-21026799)
chr1 (11-133)||(16361915-16362035)
chr1 (13-173)||(21707167-21707325)
chr1 (13-173)||(21711709-21711867)
chr1 (10-122)||(13212917-13213027)
chr1 (11-79)||(20454606-20454673)
chr1 (7-122)||(15860064-15860177)
chr1 (7-122)||(21342090-21342203)
chr1 (29-191)||(16093825-16093987)
chr1 (13-122)||(16275419-16275526)
chr1 (13-122)||(21346961-21347068)
chr1 (10-86)||(38801433-38801508)
chr1 (11-130)||(22468698-22468816)
chr1 (63-180)||(22130863-22130975)
chr1 (16-122)||(40389157-40389261)
chr1 (14-227)||(21161720-21161928)
chr1 (14-63)||(21714546-21714595)
chr1 (216-279)||(16381388-16381451)
chr1 (11-130)||(20135188-20135306)
chr1 (31-180)||(26064959-26065107)
chr1 (86-180)||(51130639-51130729)
chr1 (11-63)||(24783160-24783212)
chr1 (97-180)||(1924914-1924996)
chr1 (97-180)||(20923928-20924010)
chr1 (96-133)||(12271639-12271676)
chr1 (264-348)||(43697623-43697708)
[»] chr3 (102 HSPs)
chr3 (10-304)||(15470927-15471215)
chr3 (10-304)||(14234487-14234781)
chr3 (29-353)||(22110131-22110454)
chr3 (29-353)||(37250947-37251270)
chr3 (14-300)||(16097332-16097616)
chr3 (10-353)||(13210108-13210448)
chr3 (170-353)||(43927291-43927474)
chr3 (14-304)||(16103784-16104071)
chr3 (24-353)||(32307691-32308009)
chr3 (14-243)||(12174152-12174376)
chr3 (10-130)||(18438534-18438653)
chr3 (13-134)||(27165250-27165370)
chr3 (10-132)||(14972854-14972975)
chr3 (14-353)||(49667864-49668193)
chr3 (119-304)||(1465240-1465423)
chr3 (29-190)||(52523669-52523831)
chr3 (10-130)||(12399209-12399328)
chr3 (13-121)||(53301562-53301669)
chr3 (28-134)||(42386428-42386533)
chr3 (10-130)||(23083363-23083482)
chr3 (13-133)||(29172627-29172745)
chr3 (10-133)||(25476384-25476506)
chr3 (13-130)||(24153211-24153326)
chr3 (13-134)||(36166598-36166716)
chr3 (13-133)||(6469178-6469296)
chr3 (13-133)||(9707651-9707769)
chr3 (13-133)||(17463178-17463296)
chr3 (13-133)||(17672626-17672744)
chr3 (10-130)||(20698437-20698556)
chr3 (10-130)||(26686887-26687006)
chr3 (13-133)||(28848655-28848773)
chr3 (13-133)||(34159326-34159444)
chr3 (13-133)||(45606951-45607069)
chr3 (120-304)||(49389459-49389642)
chr3 (13-133)||(55476491-55476609)
chr3 (13-128)||(55500942-55501055)
chr3 (10-111)||(11424781-11424880)
chr3 (13-133)||(7781391-7781509)
chr3 (13-133)||(8899094-8899212)
chr3 (10-130)||(13442274-13442393)
chr3 (13-133)||(16454325-16454443)
chr3 (10-130)||(17487856-17487975)
chr3 (10-130)||(17499338-17499457)
chr3 (13-133)||(38961935-38962053)
chr3 (29-173)||(43925977-43926121)
chr3 (13-133)||(13151834-13151953)
chr3 (13-133)||(13154299-13154418)
chr3 (12-133)||(13544024-13544143)
chr3 (14-114)||(9512924-9513023)
chr3 (14-114)||(9520899-9520998)
chr3 (13-133)||(10247767-10247885)
chr3 (17-133)||(12567564-12567678)
chr3 (13-133)||(15977515-15977633)
chr3 (13-133)||(17446699-17446816)
chr3 (13-133)||(40213720-40213838)
chr3 (10-173)||(43550482-43550644)
chr3 (10-130)||(43840932-43841051)
chr3 (24-130)||(14572603-14572707)
chr3 (15-133)||(16282855-16282971)
chr3 (13-75)||(28194693-28194755)
chr3 (13-122)||(12119780-12119887)
chr3 (13-122)||(15412429-15412536)
chr3 (13-134)||(21618449-21618567)
chr3 (10-190)||(24340665-24340844)
chr3 (15-133)||(41123892-41124005)
chr3 (13-133)||(50242822-50242940)
chr3 (204-353)||(12934091-12934241)
chr3 (28-134)||(23274705-23274810)
chr3 (24-353)||(1644463-1644780)
chr3 (13-122)||(8499518-8499625)
chr3 (10-190)||(37642207-37642386)
chr3 (13-134)||(10556985-10557105)
chr3 (13-114)||(44494809-44494908)
chr3 (29-133)||(53070697-53070799)
chr3 (250-353)||(324472-324575)
chr3 (259-342)||(17672869-17672952)
chr3 (13-72)||(17737236-17737294)
chr3 (24-130)||(14576835-14576939)
chr3 (13-63)||(45577950-45578000)
chr3 (29-138)||(12377940-12378050)
chr3 (72-190)||(2051141-2051260)
chr3 (10-190)||(22147467-22147646)
chr3 (29-133)||(606324-606428)
chr3 (12-63)||(46822267-46822318)
chr3 (204-353)||(9513099-9513249)
chr3 (204-353)||(9521074-9521224)
chr3 (12-63)||(12511059-12511110)
chr3 (14-79)||(856140-856204)
chr3 (261-353)||(12340000-12340093)
chr3 (261-353)||(14665853-14665946)
chr3 (261-353)||(14735366-14735459)
chr3 (14-79)||(23077530-23077594)
chr3 (11-63)||(14665398-14665450)
chr3 (11-63)||(14668554-14668606)
chr3 (97-180)||(14501207-14501290)
chr3 (97-180)||(19776007-19776089)
chr3 (97-180)||(37439421-37439503)
chr3 (272-353)||(606148-606229)
chr3 (31-81)||(13919350-13919399)
chr3 (14-63)||(15878119-15878168)
chr3 (14-62)||(26196500-26196548)
chr3 (11-63)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (33-353)||(38339-38659)
scaffold0139 (14-63)||(19980-20029)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (10-309)||(12942-13236)
scaffold0138 (93-353)||(18017-18276)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (29-353)||(7512-7835)
chr2 (29-353)||(23791292-23791616)
chr2 (25-353)||(18786682-18787009)
chr2 (29-353)||(25108906-25109230)
chr2 (29-316)||(23207296-23207582)
chr2 (15-353)||(28405981-28406319)
chr2 (14-288)||(25175854-25176126)
chr2 (96-353)||(22459341-22459598)
chr2 (14-178)||(7679589-7679750)
chr2 (13-133)||(22105412-22105531)
chr2 (13-130)||(298816-298933)
chr2 (10-190)||(23708561-23708738)
chr2 (10-130)||(23060513-23060632)
chr2 (10-180)||(23071905-23072070)
chr2 (13-133)||(6725995-6726113)
chr2 (10-134)||(22337115-22337238)
chr2 (10-130)||(23076442-23076561)
chr2 (13-133)||(571397-571515)
chr2 (13-133)||(18808943-18809061)
chr2 (11-353)||(22133996-22134326)
chr2 (13-133)||(23130862-23130980)
chr2 (13-133)||(23133329-23133447)
chr2 (13-133)||(23135590-23135708)
chr2 (13-133)||(23709576-23709694)
chr2 (13-133)||(23712057-23712175)
chr2 (13-133)||(26505379-26505497)
chr2 (13-133)||(26507857-26507975)
chr2 (13-133)||(34402566-34402684)
chr2 (13-133)||(39682313-39682431)
chr2 (11-133)||(32214965-32215085)
chr2 (13-133)||(24367774-24367892)
chr2 (13-133)||(28577099-28577217)
chr2 (10-180)||(19671830-19671998)
chr2 (10-128)||(22731238-22731355)
chr2 (10-111)||(38136-38235)
chr2 (16-133)||(21155104-21155219)
chr2 (13-133)||(24898239-24898358)
chr2 (13-133)||(24900722-24900841)
chr2 (13-133)||(24903199-24903318)
chr2 (13-133)||(24905676-24905795)
chr2 (13-133)||(24908151-24908270)
chr2 (13-133)||(32039542-32039660)
chr2 (10-88)||(23285865-23285942)
chr2 (15-133)||(43137301-43137417)
chr2 (10-130)||(23660023-23660141)
chr2 (13-133)||(45029898-45030016)
chr2 (10-130)||(20309108-20309225)
chr2 (29-180)||(20520145-20520295)
chr2 (10-130)||(22738182-22738300)
chr2 (10-133)||(23103396-23103516)
chr2 (13-133)||(24529573-24529691)
chr2 (10-89)||(8946657-8946735)
chr2 (29-190)||(22413078-22413240)
chr2 (13-133)||(38967374-38967493)
chr2 (10-74)||(23040247-23040310)
chr2 (10-130)||(23654388-23654507)
chr2 (29-111)||(32451949-32452031)
chr2 (16-72)||(24643054-24643109)
chr2 (29-190)||(24697548-24697709)
chr2 (29-139)||(23004767-23004878)
chr2 (17-130)||(25616192-25616304)
chr2 (31-81)||(23287384-23287433)
chr2 (31-80)||(26392403-26392451)
chr2 (257-353)||(23071743-23071839)
chr2 (97-180)||(1283666-1283748)
chr2 (97-180)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (10-304)||(6611-6903)
scaffold0333 (10-304)||(13991-14283)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (25-353)||(8481-8810)
scaffold0621 (10-304)||(6535-6826)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-353)||(12766-13108)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (29-351)||(12587-12907)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (10-304)||(864-1155)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (60-353)||(54-347)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (33-338)||(78345-78648)
scaffold0022 (29-353)||(128750-129072)
scaffold0022 (13-134)||(116430-116548)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (14-309)||(1086-1379)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (29-353)||(97024-97346)
scaffold0006 (29-353)||(106302-106624)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (29-316)||(19701-19987)
scaffold0080 (10-130)||(39913-40031)
scaffold0080 (97-180)||(48939-49021)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (29-315)||(136185-136471)
scaffold0021 (29-315)||(144893-145179)
scaffold0021 (11-133)||(174767-174886)
scaffold0021 (10-80)||(121766-121835)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (90-307)||(8094-8310)
scaffold0556 (24-304)||(6826-7101)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (29-353)||(53328-53651)
scaffold0075 (261-353)||(8074-8167)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-300)||(19268-19552)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (14-300)||(100378-100662)
scaffold0023 (14-304)||(40003-40291)
scaffold0023 (13-133)||(94411-94529)
scaffold0023 (13-133)||(44454-44573)
scaffold0023 (17-133)||(17484-17598)
scaffold0023 (10-83)||(119875-119948)
scaffold0023 (14-87)||(101503-101576)
scaffold0023 (237-304)||(101618-101685)
scaffold0023 (14-63)||(38547-38596)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (25-309)||(10365-10647)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (25-309)||(7900-8180)
scaffold0218 (57-353)||(29060-29354)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-304)||(2474-2762)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (25-316)||(103455-103737)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (14-305)||(160688-160976)
scaffold0001 (17-133)||(501088-501202)
scaffold0001 (13-122)||(85635-85742)
scaffold0001 (259-340)||(85417-85498)
scaffold0001 (303-353)||(162880-162930)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (24-304)||(5657-5934)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (24-304)||(129919-130197)
scaffold0010 (29-137)||(60710-60818)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (14-353)||(2583-2923)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-304)||(14526-14814)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (14-304)||(45621-45909)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (68-353)||(1997-2281)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (25-298)||(22509-22776)
scaffold0037 (13-133)||(82072-82190)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (29-316)||(1614-1900)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (13-353)||(15664-15999)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-353)||(267679-267992)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (28-286)||(62216-62469)
scaffold0028 (14-353)||(132662-132993)
scaffold0028 (13-133)||(136680-136798)
scaffold0028 (13-133)||(139149-139267)
scaffold0028 (13-133)||(144087-144205)
scaffold0028 (13-133)||(134211-134329)
scaffold0028 (13-133)||(141618-141736)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (29-353)||(569-890)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (14-300)||(133-416)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (10-309)||(11292-11586)
scaffold0046 (10-249)||(1997-2231)
scaffold0046 (10-130)||(28414-28533)
scaffold0046 (10-66)||(4552-4608)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (31-353)||(7838-8161)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (11-133)||(3185-3306)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (10-309)||(34123-34417)
scaffold0175 (60-130)||(13141-13211)
scaffold0175 (10-63)||(273-326)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (10-180)||(1025-1190)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (13-134)||(44705-44825)
scaffold0122 (17-133)||(26064-26179)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (13-134)||(38700-38820)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (10-134)||(3149-3271)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (25-137)||(27744-27855)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (10-146)||(15763-15898)
scaffold0020 (201-300)||(15665-15764)
scaffold0020 (14-63)||(178898-178947)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (11-133)||(17214-17337)
scaffold0056 (29-133)||(79328-79430)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (25-137)||(16095-16206)
scaffold0357 (29-135)||(13147-13252)
scaffold0357 (29-81)||(2680-2732)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (12-134)||(39479-39599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (12-134)||(75213-75333)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (29-134)||(1051-1155)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-130)||(4849-4968)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (10-130)||(51913-52032)
scaffold0011 (10-130)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (10-133)||(16113-16235)
scaffold0120 (10-130)||(32959-33077)
scaffold0120 (10-130)||(45928-46046)
scaffold0120 (10-72)||(17389-17450)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (25-180)||(25121-25275)
scaffold0123 (250-353)||(25344-25447)
scaffold0123 (93-190)||(620-715)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (13-130)||(22886-23001)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (14-266)||(32102-32345)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (13-133)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (13-133)||(20747-20865)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-130)||(13211-13330)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (13-133)||(37821-37939)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (13-133)||(158494-158612)
scaffold0003 (13-133)||(339949-340065)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (10-137)||(8479-8605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (10-133)||(16599-16721)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (12-133)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (13-133)||(4694-4812)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (10-130)||(3470-3589)
scaffold0292 (10-130)||(343-461)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-133)||(13947-14065)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (10-130)||(32942-33060)
scaffold0145 (8-133)||(9744-9867)
scaffold0145 (10-130)||(38761-38879)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (13-133)||(16784-16902)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (10-130)||(1851-1970)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (10-130)||(8535-8650)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (204-353)||(28590-28740)
scaffold0211 (14-87)||(28813-28887)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-114)||(23901-24001)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-133)||(11286-11406)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (10-190)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (10-190)||(38198-38377)
scaffold0124 (97-180)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (10-130)||(1050-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (10-134)||(4508-4630)
scaffold0228 (10-134)||(12090-12212)
scaffold0228 (10-134)||(22042-22164)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (13-133)||(40400-40518)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-134)||(25896-26018)
scaffold0026 (10-134)||(39858-39980)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (10-130)||(6123-6245)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (11-133)||(12293-12413)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (10-130)||(10427-10544)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (13-122)||(4214-4321)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (12-133)||(9241-9360)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (13-133)||(29931-30050)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (10-102)||(4712-4803)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (28-130)||(24304-24406)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (10-80)||(1289-1359)
scaffold0106 (10-82)||(7266-7338)
scaffold0106 (13-79)||(15291-15356)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (16-133)||(4300-4415)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (10-113)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (10-190)||(17969-18148)
scaffold0247 (13-122)||(2184-2291)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (13-133)||(106-224)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (10-130)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-130)||(20910-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (10-82)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (10-89)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (10-81)||(32067-32137)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (13-133)||(12064-12176)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (10-111)||(15485-15584)
scaffold0114 (14-79)||(7295-7359)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (13-133)||(161133-161252)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (225-347)||(2088-2211)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (31-130)||(4545-4643)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (16-122)||(1336-1440)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (10-80)||(46995-47065)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (10-111)||(11464-11564)
scaffold0235 (261-340)||(13811-13891)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (86-353)||(2225-2488)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (10-82)||(1098-1170)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (29-133)||(20423-20524)
scaffold0031 (10-130)||(128751-128869)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (13-76)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (10-77)||(4888-4954)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (65-309)||(9133-9372)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (29-114)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (68-190)||(225465-225585)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (154-287)||(165-297)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (14-63)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (14-63)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (74-133)||(3529-3588)
scaffold0327 (14-64)||(289-339)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (261-353)||(10158-10251)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (261-353)||(9614-9707)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (29-72)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (14-63)||(29558-29607)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (272-340)||(26847-26916)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (97-180)||(6-88)
scaffold0347 (273-353)||(288-369)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (92-134)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (31-81)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (14-79)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (14-63)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (14-79)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (14-63)||(21871-21920)
scaffold0210 (14-63)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-63)||(69794-69843)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (96-192)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073210
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagttccttacctgtaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaacaa 22073210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219541
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 16219641  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16219640 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 16219541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832099
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatc-atcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggc 47832004  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47832005 ttactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtccgacaaagatcacatttaacctaa 47832099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056624
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16056441 acatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaa 16056539  T
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16056540 catcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgctacaaagatcgcatttaacctaacaagg 16056624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 810910
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttac 811051  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgt 312  Q
    |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||  |    
T  811050 tgaaactacaacagcaagataaataacttagtttctaacttccaaggtcaactcacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacttaaacaaggcat 810951  T
Q  313 tctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | ||   || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  810950 tttgtaacataagtactcgcgaggcgagagcctctactcgc 810910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 67745 - 68036
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 67843  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcagg 208  Q
     |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 67940  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  67941 ctcactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaacctaa 68036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005922
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 18005846  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18005847 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcatatcaacttgtgcgacaaag 18005922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20219970
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaaca 20220096  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  20220095 gtaagataagcaacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaa-g 20219997  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  20219996 gctcgcaaggcgagaacctctactcgc 20219970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 313
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901629
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagttt----cttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgtt 313  Q
    |||  ||||||| |||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtttcctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaatgtcacatttaacctaacaaggtgtt 12901629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014464
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 212  Q
    | ||   | |||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggctta 44014375  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |   |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  44014376 ctgaaacaacaacagcaagataa-caacttagtttttaacctc--tgatcaactcacatcaattcgtgcgacaatgatcgcatttaacctaa 44014464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 353
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116821
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 195  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||| |  |    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataa-ctcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaact 15116663  T
Q  196 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 295  Q
     ||| |  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15116664 catatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 15116763  T
Q  296 ttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15116764 ttaacctaacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctctactcgc 15116821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 353
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113284
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataa-ctcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  196 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 295  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 15113226  T
Q  296 ttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15113227 ttaacctaacaaggcatcctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctctactcgc 15113284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754718
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 208  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    ||||     
T  15754909 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagt 15754814  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15754813 cttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 15754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505081
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
      || ||| ||| |||   |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  28505320 ggatataaatcagcaa---ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 28505225  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||   |||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  28505224 ttactggaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 28505125  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      |||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28505124 cattctgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 28505081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34201124
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 34200980  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||||||  |||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   ||||  | || |||||||||||| ||||    
T  34200981 ttactgggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacagggatcgcatttaacctaaaaagg 34201080  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      || ||   |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34201081 cattatgtaacacaaacgctcgcgaggcaagagcctctgctcgc 34201124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995816
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 11995954  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||||||  |||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  11995953 ttactgggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaagg 11995854  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 347  Q
      |||||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11995853 cattctgtaacacaaatgctcgcgaggcgagagcctct 11995816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 309
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324302
Alignment:
Q  182 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcatgc 16324274  T
Q  282 gacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16324275 gacaaggatcacatttaacctaacaagg 16324302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280117
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647447
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227599
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698951
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatat 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456415
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456439
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972614
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949166
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376757
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232638
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640390
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385167
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189639
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125609
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523035
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525497
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393331
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430830
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509308
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386249
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || ||||  ||| ||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702356
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27216978
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116627
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389526
Alignment:
Q  155 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttaccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  ||| |    |||||||||||| |||     
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacct 9389576  T
Q  255 ccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  9389575 ccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcttttaacctaa 9389526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  113 tgtaagtcaacaac 126  Q
    |  |||||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    || |||||| |||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867937
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386451
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  32 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  131 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044928
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14044858  T
Q  123 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044859 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354958
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14354888  T
Q  123 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354889 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212115
Alignment:
Q  10 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  125 acatctcaa 133  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704803
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| |||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486686
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898420
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  117 agtcaa-caacatctcaa 133  Q
    |||||| |||||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  131 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443490
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063816
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  128 tctcaaa 134  Q
    |||||||    
T  10063822 tctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 139
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  38 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 134  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  135 catca 139  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 139
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  38 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 134  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  135 catca 139  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9177548 - 9177445
Alignment:
Q  250 tacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 348  Q
    |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || ||   | ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9177548 taccccaaagatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaa-accctaaacaaggtgttctgtcttacaagagctcgcgaggcgagggcctcta 9177450  T
Q  349 ctcgc 353  Q
    |||||    
T  9177449 ctcgc 9177445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9751423 - 9751336
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 347  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9751423 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaactaaacaaggcattctgtaacacaagcgctcgcgaggcgagagcctct 9751336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  36 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39267519 - 39267426
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    || || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  39267519 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcccgaggcgagagcctctgctcgc 39267426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329326
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatc 21329520  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 21329421  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21329420 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 21329326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011861
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatc 26012058  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggc 26011959  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26011958 ttactgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacctaacaa 26011861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026720
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaac-agttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20026944 atcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactaca 20026847  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  20026846 acaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcgactcgtgcgacaacggtcacatttaagctaacaaggcattctgtctcacaagg 20026747  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  20026746 actcgcgaggcgagagcctctactcgc 20026720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21501935
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 208  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 21502080  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttag-tttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  21502079 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttttctaacttccaagatcaactaacatcaactcgtgcgacaaatatcgcatttaacccaacaa 21501980  T
Q  308 ggtgttctgactcacaagg--gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||  ||||||   ||  ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21501979 ggcattctga---actgggtaactcgcgaggcgagagcctctactcgc 21501935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22177999
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaaca 22178126  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22178125 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaaggtcaca-aaaccctaaacaaggtgttatgtctcacaag 22178027  T
Q  326 ggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22178026 ggctcgcggggcgagagcctctactcgc 22177999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 297
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565827
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 21565743  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattt 297  Q
    |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21565744 tagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattt 21565827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660618
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatc 19660858  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  19660857 gaatataaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 19660762  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||| ||||    
T  19660761 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagattgcattcaacctaaaaagg 19660662  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     ||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19660661 cgttctgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 19660618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959314
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 212  Q
    | || |||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| |||    |||| ||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacatt-gattcatatgcatcagtctta 22959456  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtg 311  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||| |||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||      
T  22959455 ctggaacaaaaacaacaagataaacaacttggtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcaacaagaatcgcatttaacctaaacaaggca 22959356  T
Q  312 ttctgactcacaag--ggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||  | || ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22959355 ttctg--taactagttagctcgcgaggcgagagcctctactcgc 22959314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669189
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat-tagatt-atacaattcag 207  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||    ||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcag 19669092  T
Q  208 gcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  19669093 tcttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttatcctaa 19669189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 353
Target Start/End: Original strand, 25743940 - 25744061
Alignment:
Q  232 ataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcg 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||| | | ||||||||||    
T  25743940 ataagcaacttagtttattacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacataaaccctaacaaggcagtctgtcactcaagggctcg 25744039  T
Q  332 cgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25744040 cgaggcgagagcctctactcgc 25744061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729066
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808391
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 179
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 179  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  110 aaatgtaagt 119  Q
    ||||| ||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412306
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264812
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732984
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909130
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493687
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421651
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363502
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096588
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctca 132  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286844
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025429
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095613
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390498
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330052
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245409
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154827
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581243
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||| ||| ||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431513
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346098
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348571
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351044
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21741492 - 21741374
Alignment:
Q  186 aacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 285  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741492 aacattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtaattaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 21741393  T
Q  286 aaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  21741392 aagatcgcttttaacctaa 21741374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075138
Alignment:
Q  10 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027511
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918028
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  114 gtaagtcaa 122  Q
    | |||||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726032
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  63 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 160  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  161 tatacaa 167  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724023
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  37724019 ctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 353
Target Start/End: Original strand, 15796566 - 15796762
Alignment:
Q  157 tgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttaccccc 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| | || ||  |  ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||  |||| ||||||     
T  15796566 tgtatatacaattatatcacattattagcaacatcaaatcatttatatcaggcttactgaaacagcagcagtagtataagcaacttcatttcctacccca 15796665  T
Q  257 aagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||||  | || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15796666 aggatcatctcacaacaactcgtgcgacaaa-atcacataaatcctaaacaaggtagtttgtctaacaggagctcgcgaggcgagggcctctactcgc 15796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27988845 - 27988770
Alignment:
Q  217 aacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 292  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988845 aacaacaacagatatataaacaacttagttccttaacctcatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 27988770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  24067208 aagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24767210 - 24767117
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24767210 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 24767117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  20 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  77 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22120066 - 22119973
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22120066 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 22119973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873336
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 97  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 180
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  149 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 130
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  63 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520662
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6520564  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  6520565 ttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcaacaaagatcgcatttaacctaacaa 6520662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 307
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285892
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttac 21285798  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  21285799 tgaaacaacaacaacaagataaagcacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgataaagatcgcatttaacctaacaa 21285892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266775
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||||||||| | ||||  || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataat-tcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtcacatttaacctaacaaggagttctgtctcacaaggg 17266798  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctact 350  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17266797 ctcgcgaggcgagagcctctact 17266775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855097
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 38855176  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38855175 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaatgtccaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaag 38855097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116689
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaaca 37116563  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||||    
T  37116564 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaagg 37116662  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37116663 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 37116689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498904
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| |||||     
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacat 20498778  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  20498779 caagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaaggtcacaataaacctaacaaggtgttctgtctctcatgag 20498878  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20498879 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 20498904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353365
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaaca---aca 223  Q
    ||||||||||||  | | ||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  24353137 atctcaaacatcgtatacaat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24353236 acagtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcaca 24353335  T
Q  324 agggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24353336 agggctcacgaggcgagggcctctactcgc 24353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 353
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22365003
Alignment:
Q  93 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  193 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 292  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttattatccccctgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 22364942  T
Q  293 catttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22364943 catttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagggctcgtgaggcgagagcctctactcgc 22365003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983182
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 983414  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  983413 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaac 983316  T
Q  223 aacagtaa---gataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgact 319  Q
    ||||  ||   ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||| || ||    
T  983315 aacaacaacatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcgtgcgacaaaagtcacgttagacctaacaaagtgttatgtct 983216  T
Q  320 cacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | |  | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  983215 ctcgtgagctcgtcaggcgagagcctctactcgc 983182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760665
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||     
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatc-atcatgatataacaatatt 23760867  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattataca-attcagg 208  Q
     |||  || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  23760866 gaattcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcagg 23760769  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaaga---taagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaac 305  Q
    ||||||||||||||||||  || |   ||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  23760768 cttactgaaacaacaacaacaacaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaac 23760669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866057
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 5866201  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  5866200 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 5866101  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      |||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5866100 cattctgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 5866057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141254
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 17141110  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  17141111 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 17141210  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     ||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17141211 cgttctgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 17141254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491333
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtc 21491189  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  21491190 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacattaactcgaactacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 21491289  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      |||||   |||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491290 cattctgtaacacaaacgctcgcgaggcaagagcctctactcgc 21491333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673995
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  21673817 aacatctcaaatatcaat-ataattt-atttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaac 21673914  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| | ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  21673915 aacaacaagataa-caacttagtttttaacctctaatatcaactcacattaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 21673995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355533
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || ||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 26355620  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    |  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26355619 tagaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaac 26355533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249722
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21249482  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcagg 208  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    ||||     
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagt 21249578  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 308  Q
    |||| ||| |||  ||||| | | ||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||| |||    
T  21249579 cttagtgagacattaacagcagggtaa-caacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaacttgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaag 21249677  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  |||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249678 gcattctgtaacacaaatgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 21249722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092340
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255560
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21255320  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcagg 208  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    ||||     
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagt 21255416  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 308  Q
    |||| ||| |||  ||||| | | ||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| |||    
T  21255417 cttagtgagacattaacagcagggtaa-caacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaag 21255515  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  |||||    ||||  |||||||||||||||||| || |||||    
T  21255516 gcattctgtaatacaaatgctcgcgaggcgagagccgctgctcgc 21255560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818411
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372897
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  107 atcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409488
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21919002
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  110 aaatgtaagtcaaca 124  Q
    || || |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484520
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853336
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203275
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413360
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403345
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536327
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923930
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001871
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626854
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046239
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875187
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598306
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483398
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542417
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612062
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879275
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219835
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971356
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  128 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199666
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896386
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225291
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaa 26225313  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  26225312 tacaagtcaacaacatctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290754
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 45290756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  128 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    || |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataag 19937077  T
Q  107 atcaaatgtaagtcaa 122  Q
    |||||||| |||||||    
T  19937076 atcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131019
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823891
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484319
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678104
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatct 130  Q
     || || ||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2418802 - 2418713
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcaca 294  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||| || ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2418802 tcaggcatactgaa-caacaacagtaatataaacaacttcatttcctaacccaaggatcaactcacagcgactcgtgcgacaaaggtcaca 2418713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121851
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatct 130  Q
     || || ||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  93 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22419393 - 22419196
Alignment:
Q  154 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacc 253  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||||||| || ||   | |||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  |||| ||||    
T  22419393 taatgcatatacaatcatatcacattattgacaacattaaatcatcttagtcaggcatactgaa-caacagcagtaatataa-caactttatttcctacc 22419296  T
Q  254 cccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcg 352  Q
    || | |||||||||  | | |||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||  |||| ||| || | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22419295 ccaaggatcaactcgtaacgactcgtgcgacaaaggccacaac-aacctaaacaaggtagtctgtctctcaggagctcgcgaggtgagggcctctactcg 22419197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32832
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 32634  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggc 32732  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  32733 ttactgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacccaacaagg 32832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 85)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019699
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 23019504  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggc 23019603  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaac 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  23019604 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgttcgacaaagatcgcatttaacctaac 23019699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668713
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19668485 caacatcacaa-catcatacgtaat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaac 19668582  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcac 322  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  19668583 aacagcaagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtaattg 19668682  T
Q  323 aagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19668683 gacagctcgcgaggcgagagcctctactcgc 19668713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098305
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||            || ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  9098520 aacttcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatataattatataacattaa------------atcatataattcaggcttactgaaacaata 9098435  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 323  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9098434 actgcaagataaacaaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtgacaataaacctaacaaggtgttctgtctctca 9098335  T
Q  324 agggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9098334 tgagctcgtgaggcgagagcctctactcgc 9098305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23077072
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
     || |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcaacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaaggg 23077046  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23077047 ctcgcaaggcgagagcctctactcgc 23077072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109481
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattca 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatca 20109335  T
Q  207 ggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaaca 306  Q
    | ||||||  ||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  20109336 gtcttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacaataaacttaaca 20109435  T
Q  307 aggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||| |||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20109436 agg-gttctgtctctcatgagctcgtgaggcgagagcctctactcgc 20109481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008490
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
     || |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataat-tcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  |    
T  35008366 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcaacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaacag 35008464  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35008465 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 35008490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652485
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 19652394  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  19652395 tggaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 19652485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496254
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtc 28496398  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaag 308  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  28496397 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaag 28496299  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  |||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28496298 gcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 28496254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808665
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtc 29808809  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaag 308  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  29808808 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaag 29808710  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  |||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  29808709 gcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 29808665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080518
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatc 22080761  T
Q  110 aaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcag 207  Q
     |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||    
T  22080760 gaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttag 22080665  T
Q  208 gcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aaca 306  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||| ||||    
T  22080664 gcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcattattcctaaaca 22080565  T
Q  307 aggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||| |  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22080564 aggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctctactcgc 22080518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561593
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 208  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    ||||     
T  1561402 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagt 1561497  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1561498 cttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 1561593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644500
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  125 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333111
Alignment:
Q  180 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 27333139  T
Q  280 gcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27333138 gcgacaaggatcacatttaacctaacaa 27333111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393851
Alignment:
Q  180 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgt 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 27393879  T
Q  280 gcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 307  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27393878 gcgacaaggatcacatttaacctaacaa 27393851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676754
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496363
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287798
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409821
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742435
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334636
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005164
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858963
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422665
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656747
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || |||| || ||| ||||||    
T  25656727 tgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861912
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864396
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  110 aaatgtaagtcaaca 124  Q
    ||||| || ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291224
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055147
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754927
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924684
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963491
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540955
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595667
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360962
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556936
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185648
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| || ||| |    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatc 4185830  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||| ||   | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| ||    
T  4185829 aacttc-atatcatc-aacataaa-tcatgcaatgtttatacatttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatca 4185734  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||  | | || |||||||||||  | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||    
T  4185733 acaacatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcgtgcggcaaggatcgcatttaacctagcaagg 4185648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638304
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  20638305 aa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199261
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  128 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18199322  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    | |  |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18199321 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18199261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780229
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227453
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852061
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177517
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  128 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18177578  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    | |  |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18177577 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18177517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204354
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  128 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttacatcagacttactgaaacaacaaca 18204293  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    | |  |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18204294 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18204354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920679
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245658
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23528020 - 23527886
Alignment:
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgac 318  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||  |||| |    
T  23528020 caacaacagtaacataaacaacttcatttcctaccccaaggatcaactcaccacaactcgtgcgacaaagatcacatgaaacctgacaaggtagtctgtc 23527921  T
Q  319 tcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    || || | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23527920 tctcaggagcttgcgaggcgagggcctctactcgc 23527886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155223
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  | | | ||||||||||||||| ||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtc-atcgtgatataacaatatcgaa 31155417  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggctta 212  Q
    || || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||| | |||| || || |    
T  31155416 tgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaacatcatcggattaaaaaatttagactca 31155320  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||| |||| |||||| ||| || |||||||||||  | ||  | || |||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  31155319 ctggaacatcaacagcaagctaggcaacttagttcttaacatctaaaatcatctcacaacaactcgtgcgacaaggaccgcatttaacctaacaagg 31155223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103795
Alignment:
Q  154 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 236  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataag 28103795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668038
Alignment:
Q  65 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 4668182  T
Q  165 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaa 264  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||| | | || |||||||||||  | ||  | ||||||||    
T  4668181 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 4668083  T
Q  265 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4668082 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 4668038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4674885
Alignment:
Q  65 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 4675029  T
Q  165 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaa 264  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||| | | || |||||||||||  | ||  | ||||||||    
T  4675028 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 4674930  T
Q  265 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4674929 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 4674885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186470
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 287
Target Start/End: Original strand, 23539165 - 23539243
Alignment:
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23539165 cttactgaaacaacaactgtaatataaacaactttatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 23539243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 287
Target Start/End: Original strand, 17105925 - 17106007
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||  || | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17105925 tcagggttactgaa-caacaacagtaatataaacaacttcattccctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 17106007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  93 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  62 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 159  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  160 atatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 51  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 4189203 - 4189252
Alignment:
Q  260 atcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4189203 atcaactcacaacaactcgtgcgacaacgatcgcatttaacctagcaagg 4189252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12287989
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288217 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 12288120  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcac 322  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| |    
T  12288119 aacagcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaacttatgcgacaaaagtcacattaaacctaacaaagtgttatgtctctc 12288020  T
Q  323 aagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12288019 ttgagctcgcgaggcgagagcttctactcgc 12287989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53081930
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 53082058  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttaccccc-aagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082057 gtaagataagcaacttagtttcttaccccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaag 53081958  T
Q  326 ggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53081957 ggctcgcgacgcgagagcctctactcgc 53081930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706118
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggc 39706213  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39706212 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttaattcctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 39706118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640239
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46640459 atctcaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataaca 46640362  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  46640361 gtaagataagcaacttagtttcttacccc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctgtctcacaagg 46640263  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctact 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  46640262 gctcgcaaggcgagagcctctact 46640239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13630
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  13854 ctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 13756  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  13755 aaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggacacaataaaccttacaaggtgttctgtctcacaagga 13656  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13655 ctcgcgaggcgagggcctctactcgc 13630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774339
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
      || |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 12774198  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgt 312  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||       
T  12774199 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcag 12774298  T
Q  313 tctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  12774299 tctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 12774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15552105
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 208  Q
     || |||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||    ||||     
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatt-gattcataagcatcagt 15552010  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||  |||  ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||    
T  15552011 cttactgggacattaacagcagggtaa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattttacctaa 15552105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 353
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596986
Alignment:
Q  48 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  148 ctcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagttt 247  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||  ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 16596880  T
Q  248 cttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 347  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||  || |||| ||||||| |||||    
T  16596881 ctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcacattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaacgcccgcggggcgagaacctct 16596980  T
Q  348 actcgc 353  Q
    ||||||    
T  16596981 actcgc 16596986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198380
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  124 aacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    || |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |  | |||    | || ||||||| |||| |    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatc 43198463  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 308  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |    | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  43198462 aacaacaagataaacaacttagttttttacctc---tagcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacctaacaag 43198380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846660
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata-------------- 99  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                  
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  100 --taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatta 197  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattca 8846557  T
Q  198 tacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattt 297  Q
    ||    |||| ||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8846558 tatgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattt 8846657  T
Q  298 aac 300  Q
    |||    
T  8846658 aac 8846660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190607
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
      ||||||  ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 15190607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243136
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  123 caacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099640
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
      ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaa 15099640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798752
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798893
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280435
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902876
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215318
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928923
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12351
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893822
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118396
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773131
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312628
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242817
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  107 atcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837553
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515125
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270238
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239463
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615406
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222383
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463912
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  115 taagtcaacaacatctcaa 133  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096385
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  113 tgtaagtcaacaac 126  Q
    || || ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900009
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239972
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052948
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636554
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatct 130  Q
     || || ||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574867
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  117 agtcaa 122  Q
    ||||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374361
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || |    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  117 agtcaacaacatct 130  Q
    | ||||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102332
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053323
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16223629  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
     |||| |||||||    
T  16223630 taatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  91 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 353
Target Start/End: Original strand, 16043219 - 16043353
Alignment:
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgac 318  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||  |||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||  |||| |    
T  16043219 caacaacagtaacatacacaagttcatttcctaccccaaggatcaactcaccacaactcgtgcgacaaagatcgcatgaaccctaacaaggtagtctgtc 16043318  T
Q  319 tcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    || || | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16043319 tctcaggagctcgcgaggcgagggactctactcgc 16043353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  20149930 aagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353955
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| |||||||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
     |  || |||||||| ||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22634086 - 22633993
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22634086 tcaactcataacaaatcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 22633993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13812682 - 13812589
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13812682 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaagcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 13812589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 13844786 - 13844879
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13844786 tcaactcacatcaactcatgcaacataggtcacgttattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctctactcgc 13844879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 24028989 - 24029082
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24028989 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 24029082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 291
Target Start/End: Original strand, 14164739 - 14164827
Alignment:
Q  202 attcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtc 291  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||| | ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  14164739 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcccaacccctaggatcatctcacaac-actcttgcaacaaaggtc 14164827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10824
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 224  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 acatctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 10739  T
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  10740 cagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacagagatcgcatttaacctaacaagg 10824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6062
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 6189  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  6188 gtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctatctcactagg 6089  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6088 gctcgcgaggtgagagcctctactcgc 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 5952
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6146  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6047  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  6046 ttactgaaacaataacagcaagataaataacttagtttttaacctccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaa 5952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861349
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||     
T  21861474 caagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacctaacaaggcattctgtctcacaagga 21861375  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  21861374 cacgcgaggcgagggcctctactcgc 21861349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686954
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 50686827  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  50686828 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacgtcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaggg 50686927  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50686928 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 50686954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368066
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctcaa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16368191 taagataaacaacttaatttcttacccctatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaaggg 16368092  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  16368091 ctcgcgaggcgagagcctttactcgc 16368066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896038
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaaca- 21896162  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
      |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||     
T  21896161 --agataaacaacttagtttcttacatctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggcattttgtctcacaagga 21896064  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21896063 ctcgcgaggcgggggcctctactcgc 21896038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921648
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-ca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 22921790  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaa-cctaacaaggtg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||      
T  22921789 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacccaaacaaggca 22921690  T
Q  312 ttctgactcacaagg--gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||  | || |||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22921689 ttctg--taactaggcagttcgcgaggcgagagcctctactcgc 22921648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613896
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50614120 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50614022  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50614021 gtaagacaaacaacttagtttcttaccccct-gatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 50613923  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50613922 gctcgcggggcgagaacctctactcgc 50613896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621724
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50621948 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50621850  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50621849 gtaagacaaacaacttagtttcttaccccct-gatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 50621751  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50621750 gctcgcggggcgagaacctctactcgc 50621724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681295
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 33681105  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |    
T  33681106 gaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtc 33681204  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  33681205 ttactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaac 33681295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049843
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctcaa-catcatatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 41049942  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 325  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41049941 gtaagataagaaacctagttccttacccctatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatataacctaacaaggtattctgtctcacaag 41049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237920
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |  | |||    |||| |    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtc 22237824  T
Q  210 ttactgaaacaacaa-cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  22237825 tcgctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgaaaaagatcgcatttaacctaa 22237920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927806
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||               
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat----------- 52927989  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 224  Q
     ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  52927988 -catctcaaatatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 52927891  T
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
     || ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52927890 tagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 52927806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 353
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754376
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||      
T  21754157 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatg 21754246  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 323  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||    |||    
T  21754247 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctgagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaacaaggcagtctgtaaaaca 21754346  T
Q  324 agggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21754347 agtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 21754376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 209 - 353
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271888
Alignment:
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 308  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 12271843  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12271844 gcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctctactcgc 12271888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918942
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  126 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 225  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  | |||    | || ||||||| ||||  |||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaac 20918814  T
Q  226 agtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 325  Q
    |  ||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  ||||    ||||      
T  20918815 aacaaggtaaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaagtcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctttaacacaca 20918914  T
Q  326 ggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918915 agctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 20918942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248567
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 212  Q
    | || |||||||   || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||    |||| ||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaaca-tggattcatatgcatcagtctta 20248476  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||  |||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  20248477 ctg-gacaacaacatcaagataaataacttagtttctaacctctaagatcaatttacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaa 20248567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981517
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
      ||||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaattcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 35981517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261631
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaa 49261545  T
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
      ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 49261631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 304
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637140
Alignment:
Q  118 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 217  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactgga 20637053  T
Q  218 acaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |  ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  20637054 atgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaa 20637140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  129 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13988984
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923335
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593779
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758828
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 189  Q
    ||||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758763 caacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612430
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctca 132  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475131
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250731
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298254
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433128
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  113 tgtaagtcaacaa 125  Q
    || ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532388
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
     | || || ||||||||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776806
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  110 aaat 113  Q
    ||||    
T  20847176 aaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026799
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362035
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707325
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711867
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13212930  T
Q  110 aaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||| |||||||    
T  13212929 aaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 15860080  T
Q  107 atcaaatgtaagtcaa 122  Q
    || ||||| |||||||    
T  15860079 attaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  107 atcaaatgtaagtcaa 122  Q
    |||||||| |||||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 125  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  126 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 191  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 86  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  63 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  163 tacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  40389255 aagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161928
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| ||    
T  21161818 gcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcac 21161914  T
Q  214 tgaaacaacaacag 227  Q
    || |||| ||||||    
T  21161915 tggaacatcaacag 21161928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Original strand, 16381388 - 16381451
Alignment:
Q  216 aaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgt 279  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16381388 aaacaacaatagaaatataaacaacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaactcgt 16381451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | || ||||| |||| |||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatct 130  Q
      || || ||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  130 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 180
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  86 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 133
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 348
Target Start/End: Original strand, 43697623 - 43697708
Alignment:
Q  264 actcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 348  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   ||| |||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  43697623 actcacatcaactcgtgcaacataggtcacgttattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctcta 43697708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 102)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471215
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggc 15471120  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15471121 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcatctaacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 15471215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234781
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggc 14234684  T
Q  210 ttactga--aacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14234685 ttactgaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgttcgacaaagatcacatttaacctaa 14234781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110131
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 22110258  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |  |     
T  22110257 gtaagataagcaacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaattcgtgcgacaaaggtcacattaaacctaacaaggtgttctgtccctcttga 22110158  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22110157 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 22110131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37250947
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251171 atctcaa-catcataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaaca 37251074  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||  ||    
T  37251073 gtaagataaacaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacttttaacctaacaaggtgttctg--taactggg 37250976  T
Q  327 --gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
       ||||||||||||||||||||||||||    
T  37250975 caactcgcgaggcgagagcctctactcgc 37250947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097616
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 16097529  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaac 16097616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210108
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcagg 208  Q
     |||| || |||||||   || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| |||    ||||     
T  13210349 gaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagc 13210254  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaa 307  Q
    ||||||| ||    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13210253 cttactggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaa 13210154  T
Q  308 ggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13210153 ggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctactcgc 13210108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 170 - 353
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927474
Alignment:
Q  170 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcac 269  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcac 43927390  T
Q  270 atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43927391 atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 43927474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104071
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttac 16103980  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgtgcgacaaagagcgcatttaacctaa 16104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 353
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32308009
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||  |||||      
T  32307789 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatg 32307878  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcac 322  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  || ||   |||    
T  32307879 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacac 32307978  T
Q  323 aagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  32307979 aagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 32308009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 212  Q
    | ||   ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtctta 12174183  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaactta 243  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  12174182 ctggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165370
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972975
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctca 132  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49667864
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T
Q  114 gtaagtcaac-aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggct 210  Q
    | || ||||| |||||||||   ||| ||||||| | ||| ||| |||||||||  ||||||||     |||| |||| | |   ||| ||  |||| ||    
T  49668094 gcaa-tcaacaaacatctcatttatc-aacataatc-catttaaagtatatacagcattatata----caacatcaac-tca---tatgca--tcagtct 49668008  T
Q  211 tactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaagg 309  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  49668007 tactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgtatttaacctaaacaagg 49667908  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
       ||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  49667907 cagtctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 49667864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465240
Alignment:
Q  119 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactggaa 1465326  T
Q  219 caacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
      ||| ||  ||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  1465325 tgacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattacttttaacctaa 1465240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  127 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399328
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  113 tgtaagtca 121  Q
    || ||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  128 tctcaaa 134  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083363
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172627
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153211
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166716
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707651
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463296
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687006
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848655
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159444
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606951
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389459
Alignment:
Q  120 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 219  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  220 aacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaa 49389459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476609
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  113 tgtaagtcaacaacat 128  Q
    || |||||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424781
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781391
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899212
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442393
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454325
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487975
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499457
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961935
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151834
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154299
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544143
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513023
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520998
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247767
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567678
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446699
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| |||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841051
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 130
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572707
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  124 aacatct 130  Q
    |||||||    
T  14572701 aacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282855
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  115 taagtcaacaacatctcaa 133  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618567
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 21618545  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21618546 tgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340665
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124005
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  115 taagtcaacaacatctcaa 133  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242940
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12934241 - 12934091
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaaccta 303  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12934241 tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaccta 12934142  T
Q  304 a-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | |||||   ||||   ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12934141 aacaaggaagtctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagtctctgctcgc 12934091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  128 tctcaaa 134  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644463
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatc-atcattatataacaatatcgaatacaa-tcaac 1644684  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    || |||||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |    
T  1644683 aatatctcaattatcaa-cataatc-catttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaata 1644594  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcac 322  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||   | ||   |||    
T  1644593 acaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacttaaacaaggcagtttgtaacac 1644494  T
Q  323 aagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1644493 aagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 1644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642207
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaa 10557082  T
Q  113 tgtaagtcaa-caacatctcaaa 134  Q
    || ||| ||| ||||||||||||    
T  10557083 tgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaa 44494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Original strand, 324472 - 324575
Alignment:
Q  250 tacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg--gctcgcgaggcgagagcctct 347  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||   ||||||||||||||||||||    
T  324472 taccccaaggatcaactcacatcaacttgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg--taacttggtaactcgcgaggcgagagcctct 324569  T
Q  348 actcgc 353  Q
    ||||||    
T  324570 actcgc 324575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Original strand, 17672869 - 17672952
Alignment:
Q  259 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagag 342  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17672869 gatcaactcacaacgactcgtgcgacgaaggtcacttttaacctaacaagatattctgtctcataagggctcgcgaggcgagag 17672952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576835
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 14576842  T
Q  124 aacatct 130  Q
    |||||||    
T  14576841 aacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  127 atctcaaacatc 138  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  72 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 168  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  169 tatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  126 catctcaa 133  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Original strand, 9513099 - 9513249
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaaccta 303  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  9513099 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacata 9513198  T
Q  304 a-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | |||||  |||||   ||||||   || |||||||||||||||| |||||    
T  9513199 agcaaggcattctgtaacacaagtaatctcgaggcgagagcctctgctcgc 9513249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Original strand, 9521074 - 9521224
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaaccta 303  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  9521074 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacata 9521173  T
Q  304 a-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | |||||  |||||   ||||||   || |||||||||||||||| |||||    
T  9521174 agcaaggcattctgtaacacaagtaatctcgaggcgagagcctctgctcgc 9521224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 12340000 - 12340093
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12340000 tcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattatgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 12340093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 14665853 - 14665946
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14665853 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 14665946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 14735366 - 14735459
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14735366 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 14735459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 606229 - 606148
Alignment:
Q  272 caactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  606229 caactcgtgcgacaa-ggtcacatttatcctaaacaaggcgttctgtctaacactagctcgcgaggcgaggacctctactcgc 606148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 62  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 353
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38659
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  131 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 230  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38438 caaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 38536  T
Q  231 gataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38537 gataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtctcatttaacccaacaaggtattctgtctcacaagggctc 38636  T
Q  331 gcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38637 gcgaggcgagagcctctactcgc 38659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13236
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatc 13037  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggc 13136  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13137 ttactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaatctccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacctaacaagg 13236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18017
Alignment:
Q  93 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  193 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 292  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 18078  T
Q  293 catttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18077 catttaacctaacaaggtattctgtctcactagggctcgcgaggcgagagcctccactcgc 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7512
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaa 7638  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||| || | |    
T  7637 catgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattaaacctaaccaagtattctgtctctcatgag 7538  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  7537 ctcgtgaggcgagagcctctactcgc 7512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791616
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 23791489  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
      ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23791490 acaagataaacaacttagtttccaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 23791589  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23791590 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 23791616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786682
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    |||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18786910 caacgtcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaac 18786813  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcac 322  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |    
T  18786812 aacagcatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaagtcacattagacctaacaaagtgttctgtctctc 18786713  T
Q  323 aagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18786712 ttgagctcgcgaggcgagagcctctactcgc 18786682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109230
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 25109103  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25109104 gtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaacttacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttttgtctcacaagg 25109203  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  25109204 gctcacgaggcaagagcctctactcgc 25109230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207582
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaaca 23207492  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207493 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 23207582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 353
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406319
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  115 taagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttac 213  Q
     || |||||||||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaa--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttac 28406178  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgt 312  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||  |    
T  28406179 taaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcat 28406278  T
Q  313 tctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | ||   ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28406279 tatgtaacacaagtacttgcgaggcgagagcctctactcgc 28406319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176126
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 25176050  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25176051 ctgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacttacatcaattcgtgcgacaaag 25176126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459341
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 194  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattca-catataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  195 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcaca 294  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaaggtcaactcacatcaactcgtaggacaaaggtcaca 22459400  T
Q  295 tttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22459399 tttaacctaacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcaagagcctctactcgc 22459341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 178  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105531
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298816
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    || || || ||| | |||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060632
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 23071972  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
     ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071971 gaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726113
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337238
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076561
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||| ||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571515
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809061
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22133996
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||     
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 22134229  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggct 210  Q
    |||| || |||| |||||||||   ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||     ||||||| || |  | ||| ||  |||| ||    
T  22134228 aatgcaa-tcaataacatctcatttatc-aacataatc-catttaatgtatatacaacattata-----aacaacaccaattca-tatgca--tcagtct 22134140  T
Q  211 tactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaagg 309  Q
    ||||| || ||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  22134139 tactggaaaaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaagg 22134040  T
Q  310 tgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
       ||||   ||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  22134039 cagtctgtaacacaagtattcgcgaggcgagagcctctgctcgc 22133996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23130980
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133447
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135708
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709576
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712057
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505497
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26507975
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402566
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682431
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214965
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367892
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577217
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||| ||||||| ||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671998
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
     || | |||| |||||||||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731238
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    || || || ||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38136
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155104
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  116 aagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898239
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900722
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903199
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905676
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908151
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039542
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285942
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137417
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  115 taagtcaacaacatctcaa 133  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660141
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029898
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738182
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||  || ||| |||||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529573
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946735
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967493
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaa 38967471  T
Q  113 tgtaagtcaa-caacatctcaa 133  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  38967472 tgcaagtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654388
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  127 atctcaaacatca 139  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616304
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || |    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  117 agtcaacaacatct 130  Q
    | ||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23071839 - 23071743
Alignment:
Q  257 aagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||| ||||  || ||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071839 aagatcaactcacatcaactcgaacgaaaaagatctcattcaacctaaaaaggcattttgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 23071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6903
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 6709  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  6710 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 6808  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6809 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 6903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14283
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatc 14089  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||| | || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14090 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 14188  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14189 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 353
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8810
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  125 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat--tatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 221  Q
    |||||||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| |||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaa 8678  T
Q  222 caacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactca 321  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  8679 catcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggcattctgtctca 8778  T
Q  322 caagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8779 caaggactcgcgaggcgagggcctctactcgc 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6826
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 208  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcagg 6731  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  6732 cttactgaaacaacaacagcaagataa-caacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Original strand, 12766 - 13108
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 12864  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggc 12963  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caag 308  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  12964 ttactggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaaacaag 13063  T
Q  309 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |  || ||   ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13064 gcattttgtaacacaagtactcgtgaggcgagagcccctactcgc 13108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12907
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  129 ctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||| | |  | ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaata-cttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacag 12783  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  12784 caagataaacaacttagtttattacctctaagatcaactcacatccactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctctcatgag 12883  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 ctcgcgaggcgagagcctctactc 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 864
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggc 959  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  958 ttactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaa 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 353
Target Start/End: Original strand, 54 - 347
Alignment:
Q  60 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  158 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttaccccca 257  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttaccccca 251  T
Q  258 agatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  252 tgatcaactcacatcaacttgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctgtctcacaagggctcacgaggcgagagcctctactcgc 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 338
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78648
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  131 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 230  Q
    ||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78443 caa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 78540  T
Q  231 gataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctc 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  78541 gataagcaacttagttgcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagtgctc 78640  T
Q  331 gcgaggcg 338  Q
    ||||||||    
T  78641 gcgaggcg 78648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128750
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||||| || ||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |     
T  128874 taagataagcaacttagtttctta-ccccatgatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgca-acaacctaaacaaggtattctgtcttacagga 128777  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  128776 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 128750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116548
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1379
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
      | |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaaacatcaaacataat-tcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttac 1283  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    || ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1284 tggaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 1379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97346
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 97221  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| || |||||||||    
T  97222 gtaagaaaagcaacttagtttctta-ccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctagcaagcagtt-tgtctcacaagg 97319  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  97320 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 97346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106624
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 106499  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| || |||||||||    
T  106500 gtaagaaaagcaacttagtttctta-ccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctagcaagcagtt-tgtctcacaagg 106597  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  106598 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 106624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19701
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||  ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19888 atctcag-catcataaataa-ctcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaaca 19791  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcatatcaacccgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 19701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40031
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136185
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 225  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 136275  T
Q  226 agtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 315  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136274 agcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 136185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144893
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 225  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 144983  T
Q  226 agtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 315  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144982 agcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 144893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||  || |||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 90 - 307
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8310
Alignment:
Q  90 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  190 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagg 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgagacaaaga 8292  T
Q  290 tcacatttaacctaacaa 307  Q
    |||||||  |||||||||    
T  8293 tcacattatacctaacaa 8310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7101
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  6925 aa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 7020  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  7021 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaa 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53328
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    |||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  53552 ctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 53454  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 327  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  53453 aaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggacacaataaaccttacaaggtgttctgtctcacaagga 53354  T
Q  328 ctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53353 ctcgcgaggcgagggcctctactcgc 53328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 8074
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||   ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8167 tcaacccatatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 8074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19552
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggtta 19464  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  19465 ctgaaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaac 19552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100662
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggctta 100574  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  100575 ctgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagagcaagtcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaac 100662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40003
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggctta 40095  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  40094 ctgaaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacctaa 40003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94529
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17484
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 83  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 87  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 101618 - 101685
Alignment:
Q  237 caacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  101618 caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaa 101685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10365
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  10548 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 10450  T
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  10449 caacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacctaacaagg 10365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7900
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8081 caacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 7984  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    | ||   |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  7983 agca---agataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaccctaacaagg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29060
Alignment:
Q  57 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  157 tgtatatacaattatataacat---taacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  29259 tgtatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacc 29160  T
Q  254 cccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  |||||   |||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  29159 tctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaacgctcacgaggcgagagcctctgctcgc 29060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2474
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatc-atcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 2566  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  2565 ctgaaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103455
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aac 103641  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  103640 aaca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 103548  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 316  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103547 acaggaagataaagaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 103455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160976
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 160884  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaac 305  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  160885 cgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttatcctaac 160976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501202
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||||||| ||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 85498 - 85417
Alignment:
Q  259 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 340  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  85498 gatcaactcacaacaactcgtacgacgaaggtcacttttaacctaacaaggtattctgtcttataagggctcgcgaggcgag 85417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 162930 - 162880
Alignment:
Q  303 aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  162930 aacaaggttgtctgacacacaaaggctcgcgaggcgagcgcctctactcgc 162880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5934
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 222  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T
Q  223 aacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||  |||||||  |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  5854 aacaacaagataa-aaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttagcctaa 5934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 304
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130197
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  124 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 223  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  130018 aacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 130116  T
Q  224 acagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  130117 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 130197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  127 atctcaaacat 137  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2583
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata----caattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcagg 208  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    | || ||||  ||||||||||    ||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  || |||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagc--ttaattcataaaatgtatatatatacaattatac--cattaacaacaacaatagatcatattaaatcagg 2729  T
Q  209 cttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||    
T  2728 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttttcctaaacaa 2629  T
Q  308 ggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||  |||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628 ggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctactcgc 2583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14526
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggctta 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggctta 14618  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||    
T  14617 ctgaaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgaccaagatcgcatttatcctaa 14526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45621
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 45712  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 304  Q
    || |||||  |||| || |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  45711 tggaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 45621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 1997
Alignment:
Q  68 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 167  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  168 ttatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaact 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaact 2085  T
Q  267 cacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  2084 cacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagaccctctactcgc 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22509
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  125 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   | ||| ||  |||| ||||||| |||| |||    
T  22677 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat--caatatgca--tcagtcttactggaacagcaa 22583  T
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattta 298  Q
    ||  |||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22582 catcaagacaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattta 22509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82190
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1614
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | ||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  1801 atctcaa-catcatatataattt-atgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaata 1704  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1703 gtaagataggcaacttagtttcttaccctcaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatgtaacctaacaaggtgttctg 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15999
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggctta 212  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||  | |||| ||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtctta 15858  T
Q  213 ctgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgt 312  Q
    ||| | ||  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||| ||||  |    
T  15859 ctggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattccacctaaaaaggcat 15958  T
Q  313 tctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15959 tctgtaacacaaaagctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 15999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267992
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  267778 atctcaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaacagca 267875  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  | |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  267876 gtaagctaagcaacttagtttcttacccttatg----------atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 267965  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  267966 actcgcgaggcgagagcctctactcgc 267992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62469
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaac-atcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  128 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaaca 62409  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaa 286  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  62410 gcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcgaatcgggcgacaa 62469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132993
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    |||| ||| |||| ||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||      || |||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaa-cataatc-catttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 132852  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgt 312  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  132853 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcat 132952  T
Q  313 tctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    | ||    |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  132953 tatgtaagacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 132993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136798
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139267
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144205
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134329
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141736
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 569 - 890
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 666  T
Q  127 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 226  Q
    ||| ||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  667 atcccaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 764  T
Q  227 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 326  Q
    || |||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       
T  765 gttagataaacaacttagtttcttaccat-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtctcatttaacctaacaaggtgttctgtctaacacta 863  T
Q  327 gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  864 gctcgcgaggtgagggcctctactcgc 890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Original strand, 133 - 416
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |  | |||    |||| || ||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcac 330  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  331 tagaacaacaacagcaagataa-caactcagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaagatcgcatttaac 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11586
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 11486  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||  ||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  11487 ttacttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2231
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagac 2191  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttct 249  Q
    |||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  2192 ttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttct 2231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 66  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7838
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  129 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 227  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcag 7964  T
Q  228 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg- 326  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||    ||||||     
T  7963 caagataaacaacttagtttcatacctctaagatcaactcacatcaattcttgcgacaaagatcgcatttaacctagcaaggcattctg--gaacaaggt 7866  T
Q  327 -gctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
      ||||||||||||||||||||||||||    
T  7865 aactcgcgaggcgagagcctctactcgc 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 309
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34417
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 209  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtc 34317  T
Q  210 ttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| || |  ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |  | |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  34318 ttactggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactagaacaacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 34417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  60 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44705
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  117 agtcaacaacatctcaa 133  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38700
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3149
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27744
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  125 acatctcaaacat 137  Q
    |||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15763
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 146  Q
     |||| |||||| || ||||  | |||||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15665
Alignment:
Q  201 aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaac 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatat 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  109 caaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16095
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  125 acatctcaaacat 137  Q
    |||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  129 ctcaaac 135  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39599
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75213
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  129 ctcaaa 134  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52032
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167980
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32959
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46046
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25275
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  123 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25219 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Original strand, 25344 - 25447
Alignment:
Q  250 tacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctac 349  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25344 taccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattatgtctcacaagggctcgcgagacgagaacctctac 25443  T
Q  350 tcgc 353  Q
    ||||    
T  25444 tcgc 25447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  93 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23001
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |||||||||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32345
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  114 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 213  Q
    |||| ||| |||| ||||||  ||| ||||||| | ||| |||||||||      |||| |||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  32202 gtaa-tcatcaacgtctcaattatc-aacataatc-catttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 32292  T
Q  214 tgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaact 266  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  32293 tggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13510
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20865
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13330
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37939
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158494
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8605
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 137  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4812
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3589
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 343 - 461
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatc 440  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14065
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33060
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  8 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  108 tcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38879
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| || | ||||||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16902
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1970
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8535
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28740 - 28590
Alignment:
Q  204 tcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct- 302  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  28740 tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaccta 28641  T
Q  303 aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||  |||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28640 aacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctctgctcgc 28590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23901
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 23906  T
Q  110 aaatg 114  Q
     ||||    
T  23905 gaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1050
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4630
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12212
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22164
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40518
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26018
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 25993  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39980
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 39955  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6123
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  108 tcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    |||| || || ||| ||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || |||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  111 aatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30050
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 111  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  112 atgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4803
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 102  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  127 atct 130  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1359
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7338
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||     
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  116 aagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16382
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  110 aaat 113  Q
    ||||    
T  16379 aaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17969
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 190  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  113 tgtaagtcaa 122  Q
    || |||||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 106 - 224
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2071
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51654
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13575
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 89  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32137
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12176
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  113 tgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15485
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161133
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  113 tgtaagtcaa-caacatctcaa 133  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2211 - 2088
Alignment:
Q  225 cagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcaca 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||  |||||   ||||    
T  2211 cagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatccactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacaca 2112  T
Q  324 agggctcgcgaggcgagagcctct 347  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  2111 agtactcgcgaggcgagagcctct 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  116 aagtcaa 122  Q
    |||||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11464
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  11465 aa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 340
Target Start/End: Original strand, 13811 - 13891
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 340  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13811 tcaactcataacaactcgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaaccaggaattctgtcttacaagagctcgcgaggcgag 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2225
Alignment:
Q  86 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaac 185  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacattataagc 2393  T
Q  186 aacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 285  Q
    |||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  || || ||| |||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  2392 aacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactcacataaactcgaacggca 2293  T
Q  286 aaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    ||| || |||| ||||||| ||||  |||||   ||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2292 aagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacacacgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 2225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1098
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  129 ctcaa 133  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128869
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  |   |||| |||||||| |||| ||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatc 128848  T
Q  110 aaatgtaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5183
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 76  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9372
Alignment:
Q  65 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 9228  T
Q  165 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaa 264  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||| | | || |||||||||||  | ||  | ||||||||    
T  9229 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 9327  T
Q  265 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 309  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  9328 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 190
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  68 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 166  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  167 attatataacattaacaacaacat 190  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 165 - 297
Alignment:
Q  154 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacc 253  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  |||| ||||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaa-caacaatagtaatataaacaacttcatttcctacc 263  T
Q  254 cccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 287  Q
    || | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264 ccaaggatcgactcacaacaactcgtgcgacaaa 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  74 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 10158 - 10251
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||  |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10158 tcaactcataacaactcgtacgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 10251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9707 - 9614
Alignment:
Q  261 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9707 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 9614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 340
Target Start/End: Original strand, 26847 - 26916
Alignment:
Q  272 caactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 340  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26847 caactcgcgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgacttacaggagctcgcgaggcgag 26916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  97 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 180  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 353
Target Start/End: Original strand, 288 - 369
Alignment:
Q  273 aactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctctactcgc 353  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  288 aactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctctgctcgc 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 134
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  92 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 134  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  96 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 192  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University