View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15918_high_7 (Length: 321)

Name: NF15918_high_7
Description: NF15918
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15918_high_7
NF15918_high_7
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (17-321)||(26803454-26803758)
chr6 (13-320)||(28787242-28787549)
chr6 (13-320)||(28793363-28793670)
chr6 (18-320)||(27603575-27603877)
chr6 (28-321)||(26647498-26647791)
chr6 (28-321)||(26753466-26753759)
chr6 (17-318)||(26824827-26825128)
chr6 (13-315)||(27717375-27717677)
chr6 (28-315)||(27336971-27337258)
chr6 (28-315)||(27397711-27397998)
chr6 (13-315)||(27609996-27610298)
chr6 (26-315)||(26624288-26624577)
chr6 (26-315)||(26730265-26730554)
chr6 (14-315)||(27679955-27680256)
chr6 (13-321)||(31285563-31285871)
chr6 (28-321)||(26885089-26885379)
chr6 (13-311)||(27426492-27426790)
chr6 (22-315)||(27697462-27697755)
chr6 (26-299)||(27591913-27592186)
chr6 (47-315)||(27705130-27705398)
chr6 (47-299)||(27676512-27676764)
chr6 (47-321)||(25492189-25492463)
chr6 (28-321)||(26656984-26657274)
chr6 (28-321)||(26762955-26763245)
chr6 (47-312)||(26862618-26862883)
chr6 (28-262)||(26143887-26144121)
chr6 (17-101)||(28782109-28782193)
chr6 (28-262)||(25484078-25484312)
chr6 (28-262)||(25539562-25539796)
chr6 (28-262)||(25580741-25580975)
chr6 (221-311)||(26849924-26850014)
chr6 (47-262)||(27530233-27530445)
chr6 (132-262)||(25512014-25512144)
chr6 (204-311)||(26636841-26636948)
chr6 (204-311)||(26742807-26742914)
chr6 (132-262)||(26057045-26057175)
chr6 (132-262)||(26077015-26077145)
chr6 (204-311)||(26960320-26960427)
chr6 (150-314)||(28186535-28186699)
chr6 (55-98)||(25074913-25074956)
chr6 (221-304)||(27664101-27664184)
chr6 (48-98)||(26950782-26950832)
chr6 (152-262)||(27215595-27215705)
chr6 (204-308)||(26812723-26812827)
chr6 (42-98)||(26938062-26938118)
chr6 (48-95)||(26975990-26976037)
chr6 (28-86)||(26056941-26056999)
chr6 (28-86)||(26076911-26076969)
chr6 (175-297)||(28140701-28140823)
chr6 (47-185)||(28235603-28235741)
chr6 (53-95)||(31289313-31289355)
chr6 (28-101)||(25511911-25511984)
chr6 (48-93)||(26849751-26849796)
chr6 (28-101)||(27215471-27215544)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (13-321)||(8491-8799)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (13-321)||(12545-12853)
scaffold0277 (17-321)||(3582-3886)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (14-321)||(29272708-29273015)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (28-321)||(28126545-28126838)
chr1 (47-263)||(28163304-28163520)
chr1 (25-321)||(267210-267506)
chr1 (266-321)||(28132371-28132426)
chr1 (154-297)||(26137033-26137176)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (13-315)||(2415-2717)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (13-311)||(60573-60871)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (13-311)||(18074765-18075063)
chr4 (19-298)||(18678449-18678728)
chr4 (25-299)||(18654365-18654639)
chr4 (14-299)||(18722973-18723258)
chr4 (19-299)||(18698288-18698568)
chr4 (19-299)||(18730392-18730672)
chr4 (157-299)||(18688514-18688656)
chr4 (14-95)||(5090046-5090127)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (241-321)||(1-81)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (47-314)||(16691905-16692172)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (150-314)||(57171-57335)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (48-98)||(17992308-17992358)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (47-185)||(35765-35903)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 26803454 - 26803758
Alignment:
Q  17 agcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26803454 agcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatat 26803553  T
Q  117 agaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaa 216  Q
    ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26803554 agaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaa 26803653  T
Q  217 gacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagg 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26803654 gacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttagttttagagatagtgggttccaacttgtttggaaagagcataaaagaatggaagg 26803753  T
Q  317 gtaca 321  Q
    |||||    
T  26803754 gtaca 26803758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Original strand, 28787242 - 28787549
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  28787242 atgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatg 28787341  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      |||||||| ||  ||  |||  ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28787342 ggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 28787441  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28787442 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatgg 28787541  T
Q  313 aagggtac 320  Q
    ||||||||    
T  28787542 aagggtac 28787549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Original strand, 28793363 - 28793670
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  28793363 atgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatg 28793462  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      |||||||| ||  ||  |||  ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28793463 ggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 28793562  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28793563 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatgg 28793662  T
Q  313 aagggtac 320  Q
    ||||||||    
T  28793663 aagggtac 28793670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27603877 - 27603575
Alignment:
Q  18 gcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatata 117  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27603877 gcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatata 27603778  T
Q  118 gaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaag 217  Q
    ||||||| ||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27603777 gaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaag 27603678  T
Q  218 acgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaaggg 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603677 acgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttttggaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatggaaggg 27603578  T
Q  318 tac 320  Q
    |||    
T  27603577 tac 27603575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 26647498 - 26647791
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||| |    
T  26647498 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 26647597  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||  |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26647598 atgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaa 26647697  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26647698 ccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtaca 26647791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 26753466 - 26753759
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||| |    
T  26753466 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 26753565  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||  |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26753566 atgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgttttaaa 26753665  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26753666 ccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttatatggaaagagcatagaagaatggaagggtaca 26753759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 26824827 - 26825128
Alignment:
Q  17 agcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatat 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||    
T  26824827 agcaactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgagat 26824926  T
Q  117 agaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaa 216  Q
    ||||  || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26824927 agaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaa 26825026  T
Q  217 gacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagg 316  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  26825027 cacattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtattagaaatagtgggttccaatttgtttggaaagagcatacaaatatggaagg 26825126  T
Q  317 gt 318  Q
    ||    
T  26825127 gt 26825128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27717677 - 27717375
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  27717677 atgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatg 27717578  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||| ||||    
T  27717577 ggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggtta 27717478  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
     |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  27717477 cgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatgg 27717378  T
Q  313 aag 315  Q
    |||    
T  27717377 aag 27717375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27337258 - 27336971
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||| |    
T  27337258 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 27337159  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27337158 atgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaa 27337059  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27337058 ccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatggaag 27336971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27397998 - 27397711
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||| |    
T  27397998 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacat 27397899  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27397898 atgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagatgttttaaa 27397799  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27397798 ccgtgcagtttcatatggttcgggcattcccttagttttagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagtatggaag 27397711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27610298 - 27609996
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || || ||| |||| |    
T  27610298 atgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatg 27610199  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| | | ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||| ||||    
T  27610198 ggataaaaagtatgcataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggtta 27610099  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
     |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  27610098 cgaagagattttaaaccgtgctgttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaggaatgg 27609999  T
Q  313 aag 315  Q
    |||    
T  27609998 aag 27609996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 26624288 - 26624577
Alignment:
Q  26 atgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaac 125  Q
    |||||||||| ||| | | | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | || ||| |  ||| |||| ||    
T  26624288 atgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcac 26624387  T
Q  126 gtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttta 225  Q
      ||  |||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26624388 acatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacatttta 26624487  T
Q  226 aatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26624488 aaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaag 26624577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Original strand, 26730265 - 26730554
Alignment:
Q  26 atgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaac 125  Q
    |||||||||| ||| | | | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | || ||| |  ||| |||| ||    
T  26730265 atgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcac 26730364  T
Q  126 gtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttta 225  Q
      ||  |||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26730365 acatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacatttta 26730464  T
Q  226 aatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26730465 aaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaag 26730554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 27679955 - 27680256
Alignment:
Q  14 tgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacga 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||| |     
T  27679955 tgaagcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatgg 27680054  T
Q  114 tatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttat 213  Q
     |||||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||| ||||     
T  27680055 catagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttac 27680154  T
Q  214 gaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgga 313  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  27680155 gaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttttggccttccgttagttttagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagattgga 27680254  T
Q  314 ag 315  Q
    ||    
T  27680255 ag 27680256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 31285563 - 31285871
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  31285563 atgaatcaactgcatgctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatg 31285662  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| ||  ||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||    
T  31285663 ggataaaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggtta 31285762  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
     |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  31285763 cgaagacattttaaaccgtgcagttgcatattcttctggccttccattagttatagaagtagtgggttcaaacttgtttggaaagagcatagaaaaatgg 31285862  T
Q  313 aagggtaca 321  Q
    ||| |||||    
T  31285863 aagagtaca 31285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 26885089 - 26885379
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | ||     |||| ||||| |    
T  26885089 gctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacat 26885188  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||  |   |||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  26885189 atgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaaga---caaagttcctttaggttatgaagagattttaaa 26885285  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  26885286 ccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcctttagttatagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagagcatagaaacatggaagagtaca 26885379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27426790 - 27426492
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || |||| |    
T  27426790 atgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatg 27426691  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
    | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  27426690 agatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 27426591  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatg 311  Q
    |||| |  |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  27426590 tgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatg 27426492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27697755 - 27697462
Alignment:
Q  22 ctacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact-gaccagtcacgatatagaa 120  Q
    ||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||    
T  27697755 ctacaggctttggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagacca-tcatgggatagaa 27697657  T
Q  121 agaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacg 220  Q
    | |||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| || || ||||| ||  ||||      
T  27697656 aaaacgtatgcagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagaga 27697557  T
Q  221 ttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  27697556 ttttaagtcgtgcagtttcatatgtttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatggaag 27697462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27592186 - 27591913
Alignment:
Q  26 atgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaac 125  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   | |||| |  ||||||| |||    
T  27592186 atgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaac 27592087  T
Q  126 gtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttta 225  Q
     |||  |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27592086 atatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacatttta 27591987  T
Q  226 aatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
    || |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  27591986 aagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagag 27591913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27705398 - 27705130
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||  ||  |||    ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |    
T  27705398 attggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggttgaa 27705299  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27705298 tgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgct 27705199  T
Q  247 tcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaag 315  Q
    || |||||||| ||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  27705198 tctggccttccgttagttttagaagtaatgggttctaacttgtttggcaagaacatagaagaatggaag 27705130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27676764 - 27676512
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   | |||| |  ||||||| ||| |||  |||||||| |||| |    
T  27676764 attggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaa 27676665  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  27676664 tgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacattttaaagcgtgcagttgtatatgct 27676565  T
Q  247 tcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
    || |||||||| ||||   ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  27676564 tctggccttccattagcgatagaagtagtgggttctaacttgtttggaaagag 27676512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25492463 - 25492189
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    ||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |  |||||||| | | ||  |||||||| |||| |    
T  25492463 attggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcagtagaagagttgca 25492364  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||  | |||| || | ||||||    
T  25492363 tggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacacttgcaattacctatgct 25492264  T
Q  247 tcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
    || |||||||| ||||  |||| |||| | || || || || |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  25492263 tctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaaatagcatagaagaatggaagtgtaca 25492189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 26656984 - 26657274
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || | | ||||||  ||||||| ||| |    
T  26656984 gctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacat 26657083  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||   ||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||| || |||||| ||||||||||  ||||||     
T  26657084 atgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggctttt-aga--gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaag 26657180  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  26657181 ccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtaca 26657274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 26762955 - 26763245
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || | | ||||||  ||||||| ||| |    
T  26762955 gctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacat 26763054  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||   ||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||| || |||||| ||||||||||  ||||||     
T  26763055 atgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggctttt-aga--gacaatgttccttcaggttatgaagaaattttaag 26763151  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  26763152 ccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttagttatagaagtagtggcttcaaacttgtttggaaagagcatcgaaaaatggaagagtaca 26763245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 312
Target Start/End: Original strand, 26862618 - 26862883
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || |  ||||||||||| |||   ||| | ||| |  |    
T  26862618 attggtttggtcatggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaacgggctaca 26862717  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26862718 tgagacagaagcttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttataacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgct 26862817  T
Q  247 tcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
    || |||||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26862818 tccggccttccgttagttctcgaaatagtgggttctaacttgtttggaaagagcatggaagaatgg 26862883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26143887 - 26144121
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  || |||| |  ||   ||| ||      
T  26143887 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 26143986  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  26143987 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaattttaaa 26144086  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
     |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26144087 ccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 26144121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 101
Target Start/End: Original strand, 28782109 - 28782193
Alignment:
Q  17 agcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28782109 agcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttact 28782193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 25484078 - 25484312
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || |||| |  ||   ||| ||      
T  25484078 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 25484177  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  25484178 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 25484277  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
     |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  25484278 ccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 25484312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 25539562 - 25539796
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |  || |||| |  ||   ||| ||      
T  25539562 gctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaagtacac 25539661  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    || ||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  25539662 atgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagattttaaa 25539761  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
     |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  25539762 ccgtgtagttacttatgcatctggcctacccttag 25539796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 25580741 - 25580975
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || |||| |  ||   ||| ||      
T  25580741 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 25580840  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||  ||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  25580841 atgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagagattttaaa 25580940  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
     |||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  25580941 ccgtgtagttacttatgcatctgggctgcccttag 25580975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 311
Target Start/End: Original strand, 26849924 - 26850014
Alignment:
Q  221 ttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatg 311  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26849924 ttttaaatcgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatagaagaatg 26850014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27530445 - 27530233
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    ||||||| |||| ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |  | ||| |  |||||||| ||  ||  ||||||||||||| |    
T  27530445 attggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaa 27530346  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    || || |||||||||  |||||||||||||||||||||| |  || || || || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || | ||||||    
T  27530345 tgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttca--aagaa-aatgttccttcaagtcatgaagacattttaaaccgtgcacttacttatgct 27530249  T
Q  247 tcgggccttcccttag 262  Q
    || |||||||| ||||    
T  27530248 tctggccttccattag 27530233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 25512014 - 25512144
Alignment:
Q  132 agtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgt 231  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  25512014 agtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgt 25512113  T
Q  232 gcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
    | |||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  25512114 gtagttacttatgcatctggccttccgttag 25512144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Original strand, 26636841 - 26636948
Alignment:
Q  204 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggata 303  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26636841 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtata 26636940  T
Q  304 gaagaatg 311  Q
    | ||||||    
T  26636941 gcagaatg 26636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Original strand, 26742807 - 26742914
Alignment:
Q  204 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggata 303  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26742807 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtata 26742906  T
Q  304 gaagaatg 311  Q
    | ||||||    
T  26742907 gcagaatg 26742914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 26057045 - 26057175
Alignment:
Q  132 agtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgt 231  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||  | |  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26057045 agtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgt 26057144  T
Q  232 gcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
    | |||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  26057145 gtagttacttatgcatctggccttccgttag 26057175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 26077015 - 26077145
Alignment:
Q  132 agtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgt 231  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||  | |  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26077015 agtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatattttaaaccgt 26077114  T
Q  232 gcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 262  Q
    | |||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  26077115 gtagttacttatgcatctggccttccgttag 26077145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Original strand, 26960320 - 26960427
Alignment:
Q  204 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggata 303  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  26960320 ttcaagctatgattacattttaaaccgtgcagttaaatatgcttctggccttccattagctttagaagtagtgggttccaacttgtttggcaagagtata 26960419  T
Q  304 gaagaatg 311  Q
    | ||||||    
T  26960420 gcagaatg 26960427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 28186535 - 28186699
Alignment:
Q  150 gaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcg 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||   | ||| ||  ||   ||||||| | | ||||||  | ||||||||     
T  28186535 gaaagaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagttgatacaaatttcgacagcgttttacaccatgcagtaacttatgcttct 28186634  T
Q  250 ggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaa 314  Q
    |||||||| || |  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  28186635 ggccttccattggctttagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagaatataggagaatggaa 28186699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 98
Target Start/End: Original strand, 25074913 - 25074956
Alignment:
Q  55 ggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 98  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074913 ggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacattt 25074956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27664184 - 27664101
Alignment:
Q  221 ttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatag 304  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27664184 ttttaaaccgtgcagttgaatatgcttctggccttccattagctttaaaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatag 27664101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Original strand, 26950782 - 26950832
Alignment:
Q  48 ttggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26950782 ttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtgacaaacattt 26950832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Original strand, 27215595 - 27215705
Alignment:
Q  152 aagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcggg 251  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||    |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| || | |||| ||| ||    
T  27215595 aagaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcatttttaatcgtgcacttacttatgtttctgg 27215694  T
Q  252 ccttcccttag 262  Q
    |||||| ||||    
T  27215695 ccttccattag 27215705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 308
Target Start/End: Original strand, 26812723 - 26812827
Alignment:
Q  204 ttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggata 303  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||   |||| |||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  26812723 ttcaagttatgattacattttaaatcgcgcagtaaaatatacttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagagtatt 26812822  T
Q  304 gaaga 308  Q
    |||||    
T  26812823 gaaga 26812827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Original strand, 26938062 - 26938118
Alignment:
Q  42 acctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 98  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26938062 acctaattggcttggtcatggaagcaaagtcattgttaccactcgagacaaacattt 26938118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 26975990 - 26976037
Alignment:
Q  48 ttggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaaca 95  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26975990 ttggcttggtcatggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 26056941 - 26056999
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 86  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26056941 gctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcg 26056999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 26076911 - 26076969
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcg 86  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26076911 gctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcg 26076969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 297
Target Start/End: Original strand, 28140701 - 28140823
Alignment:
Q  175 tggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatag 274  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||  || ||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || |  |||||| |||    
T  28140701 tggaaggcatttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggccttccattggctttagaagtag 28140800  T
Q  275 ttggttccaacttatttggaaag 297  Q
    ||||||| | ||| |||||||||    
T  28140801 ttggttctagcttgtttggaaag 28140823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 28235603 - 28235741
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |  || |||||||||||   | ||||   |||  |    
T  28235603 attggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaa 28235702  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttt 185  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28235703 tgagaacgaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttt 28235741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 31289313 - 31289355
Alignment:
Q  53 ttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaaca 95  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31289313 ttggtcctggaagcagagtcatcattaccacttgagacaaaca 31289355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 25511911 - 25511984
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact 101  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  25511911 gctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttact 25511984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 93
Target Start/End: Original strand, 26849751 - 26849796
Alignment:
Q  48 ttggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaa 93  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26849751 ttggcttggtcatggtagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 27215471 - 27215544
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact 101  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  27215471 gctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttact 27215544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 8491 - 8799
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  8491 atgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatg 8590  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| ||| ||  |||  ||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591 ggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 8690  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8691 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatgg 8790  T
Q  313 aagggtaca 321  Q
    |||||||||    
T  8791 aagggtaca 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12853 - 12545
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  12853 atgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatg 12754  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| ||| ||  |||  ||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753 ggataaaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 12654  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12653 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatgg 12554  T
Q  313 aagggtaca 321  Q
    |||||||||    
T  12553 aagggtaca 12545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3886 - 3582
Alignment:
Q  17 agcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatat 116  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||| |  ||    
T  3886 agcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggat 3787  T
Q  117 agaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaa 216  Q
    |||||| ||| ||  |||  ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786 agaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaa 3687  T
Q  217 gacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3686 gacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagg 3587  T
Q  317 gtaca 321  Q
    |||||    
T  3586 gtaca 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29273015 - 29272708
Alignment:
Q  14 tgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacga 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||  |||| |     
T  29273015 tgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgg 29272916  T
Q  114 tatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttat 213  Q
     ||| |||| | | ||  |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29272915 gataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttat 29272816  T
Q  214 gaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29272815 gaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagaggatagaagaatgga 29272716  T
Q  314 agggtaca 321  Q
    ||||||||    
T  29272715 agggtaca 29272708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28126838 - 28126545
Alignment:
Q  28 gctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgt 127  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |  |||||||| |||     
T  28126838 gctttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgc 28126739  T
Q  128 atatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 227  Q
    ||   ||| ||||||||||||  | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  28126738 atgcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatgatgatgttttaaa 28126639  T
Q  228 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28126638 ccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttagttatagaaatagtgggttccaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagggtaca 28126545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28163520 - 28163304
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||| | | ||   ||||||||||||||    
T  28163520 attggttcggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgta 28163421  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    |||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28163420 tgggacggaagcgcttgaattgttgacgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 28163321  T
Q  247 tcgggccttcccttagt 263  Q
    || ||||||||||||||    
T  28163320 tcaggccttcccttagt 28163304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 267506 - 267210
Alignment:
Q  25 catgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaa 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||   ||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |  |||||||| |    
T  267506 catgctttggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagta 267407  T
Q  125 cgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 224  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||| || |||| |||  | ||  ||||    
T  267406 cgcatgaagtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagatttt 267307  T
Q  225 aaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
    || |||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267306 aattcgtgcagttgcttatgcttctggccttccgttagttttagaaattgtgggttctaacttgtttggaaagagcatagaagaatggaagggtaca 267210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28132426 - 28132371
Alignment:
Q  266 tagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28132426 tagaaatagtgggttcaaacttatttggaaagagcatagaagaatggaagtgtaca 28132371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 26137033 - 26137176
Alignment:
Q  154 gaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaa-agtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggc 252  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| | | |  || ||||||||||  |  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||    
T  26137033 gaagctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaagtaaccacaatgact-caagttatgattatattttaaacagtgcagttaaatatgcttctggc 26137131  T
Q  253 cttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaag 297  Q
    ||||| ||||  |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26137132 cttccgttagctttagaagtagtgggttccagcttgtttggaaag 26137176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2717 - 2415
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  2717 atgaagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatg 2618  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
      ||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||| ||||    
T  2617 ggataaaaagtatgcatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggtta 2518  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatgg 312  Q
     |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  2517 cgaagagattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggccttccgttagttatagaaatagtgggttctaacttatctggaaagaacatagaggaatgg 2418  T
Q  313 aag 315  Q
    |||    
T  2417 aag 2415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60871
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || |||| |    
T  60573 atgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatg 60672  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
    | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  60673 agatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 60772  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatg 311  Q
    |||| |  |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  60773 tgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatg 60871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 18074765 - 18075063
Alignment:
Q  13 atgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacg 112  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||  | ||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || |||| |    
T  18074765 atgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatg 18074864  T
Q  113 atatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagtta 212  Q
    | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  18074865 agatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 18074964  T
Q  213 tgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatg 311  Q
    |||| |  |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  18074965 tgaaaagattttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggccttccggtagttatagaaatagtgggttctaacttgtttggaaagaacatagaagaatg 18075063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18678728 - 18678449
Alignment:
Q  19 caactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||| || ||||    
T  18678728 caactgcatgctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatag 18678629  T
Q  119 aaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 218  Q
    |||  | | ||  |||| ||||| ||| | || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18678628 aaattatgcatgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaaga 18678529  T
Q  219 cgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaaga 298  Q
      ||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18678528 gattttaaaacgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaaga 18678449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18654639 - 18654365
Alignment:
Q  25 catgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaa 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||| || |||||||  |    
T  18654639 catgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaatta 18654540  T
Q  125 cgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 224  Q
     | ||  |||| ||||| ||| |  | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  18654539 tgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 18654440  T
Q  225 aaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||   ||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  18654439 aaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtcgtgggttccaacttgtttggaaagag 18654365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18723258 - 18722973
Alignment:
Q  14 tgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacga 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  18723258 tgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatga 18723159  T
Q  114 tatagaaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttat 213  Q
      ||||||  | | ||  |||| ||||| ||| |  | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  18723158 ggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttat 18723059  T
Q  214 gaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
    |||||  ||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18723058 gaagagattttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 18722973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18698568 - 18698288
Alignment:
Q  19 caactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatag 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| || ||||    
T  18698568 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatag 18698469  T
Q  119 aaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 218  Q
    |||  |   ||  |||| ||||| ||| |  | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18698468 aaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaaga 18698369  T
Q  219 cgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
      |||| || | |||||||   |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18698368 gatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 18698288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18730672 - 18730392
Alignment:
Q  19 caactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatag 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| || ||||    
T  18730672 caactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatag 18730573  T
Q  119 aaagaacgtatatagtagaagggttgtatgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaaga 218  Q
    |||  |   ||  |||| ||||| ||| |  | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18730572 aaattatccatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaaga 18730473  T
Q  219 cgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
      |||| || | |||||||   |||||||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18730472 gatttttaaccatgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctctagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 18730392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688514
Alignment:
Q  157 gctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttc 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    |||||||| |||||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagtcgtgtatgcttctggccttc 18688557  T
Q  257 ccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagag 299  Q
    | ||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18688556 cattagctatagaagtagtgggttccaacttgtttggaaagag 18688514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 5090127 - 5090046
Alignment:
Q  14 tgaagcaactacatgctttggccggacgacctaattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaaca 95  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5090127 tgaaacaactacaggttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 5090046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 321
Target Start/End: Original strand, 1 - 81
Alignment:
Q  241 tatgcttcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaagggtaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1 tatgcttcgggccttcccttagttttagaaatagtgggttccaacttgtttggaaagacgatagaagaatggaagggtaca 81  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Original strand, 16691905 - 16692172
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||  |||  ||| || || ||  |    
T  16691905 attggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacaagtcatggtattgatagaatatatgaagtggatggtttaaa 16692004  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgct 246  Q
    |||  ||||||||||  || | |||||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||  ||  || |||||||   ||  ||  | ||||||    
T  16692005 tggagaagaagctctagaactattgaggtggaagacttttaaaaataacaaagtcgattcaagtttcgagtacattttaaaatatgttgtaacttatgct 16692104  T
Q  247 tcgggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaa 314  Q
    || |||||||| ||||  |||||| |||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  16692105 tctggccttccattagctttagaagtagtaggatctaacttgtttggaaagaatatagaagaatggaa 16692172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 57335 - 57171
Alignment:
Q  150 gaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||   | ||| ||  ||  |||||||| | | ||||||  | ||||||||     
T  57335 gaaagaagctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaaaaataacaaagtcaatccaaatttcgacaacgttttacaccttgcagtaacttatgcttca 57236  T
Q  250 ggccttcccttagtcttagaaatagttggttccaacttatttggaaagaggatagaagaatggaa 314  Q
    |||||||| || | ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  57235 ggccttccattggccttagaagtagtgggttcgaacttgtttggaaagaatataggagaatggaa 57171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17992358 - 17992308
Alignment:
Q  48 ttggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 98  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992358 ttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacattt 17992308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 35765 - 35903
Alignment:
Q  47 attggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcacgatatagaaagaacgtatatagtagaagggttgta 146  Q
    |||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| |  || |||||||||||   | ||||   |||  |    
T  35765 attggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaa 35864  T
Q  147 tgggaaagaagctcttcaattgttgaggtggatggcttt 185  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35865 tgagaacgaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttt 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University